Com o objetivo de realizar estratégias eficientes de manejo e conservação para a onça-pintada (Panthera onca), estudos ecológicos vêm sendo realizados em diferentes áreas ao longo de sua distribuição geográfica. No entanto, análises moleculares complementares a estas abordagens ecológicas são necessárias para garantir a viabilidade deste felídeo a longo prazo. Desta maneira, os estudos aqui apresentados tiveram por finalidade desenvolver metodologias para auxiliar estudos genéticos e ecológicos extremamente necessários para a conservação desta espécie, assim como embasar estudos populacionais com uma perspectiva genético-molecular. No primeiro capítulo, devido à enorme dificuldade de se obter amostras biológicas deste felídeo, foi desenvolvida uma abordagem baseada no sequenciamento de um segmento curto de um gene (ATP6) do DNA mitocondrial para identificar de maneira rigorosa amostras fecais de onça-pintada coletadas em campo. Os resultados indicaram a importância de se utilizar um método molecular para a identificação correta de amostras fecais coletadas em campo. No segundo capítulo foi demonstrado que é possível identificar a coloração de onças-pintadas a partir de DNA fecal, através da genotipagem molecular do polimorfismo envolvido no padrão de coloração desta espécie. Embora indivíduos melânicos de onça-pintada sejam relativamente comuns em algumas áreas da sua distribuição, até o momento, nenhum estudo científico envolvendo esta característica foi realizado com populações naturais desta espécie. O uso de amostragem não-invasiva possivelmente é uma das únicas maneiras para estudar diretamente populações de onça-pintada que apresentam esta característica. No terceiro capítulo foi realizado o primeiro estudo envolvendo estruturação e conectividade de populações naturais deste felídeo em uma escala regional. O estudo abrangeu as populações remanescentes de onça-pintada da Ecorregião do Alto Rio Paraná, contida na Mata Atlântica de Interior. Os resultados indicaram perda de variabilidade genética em populações recentemente isoladas e uma considerável diferenciação entre os fragmentos, sugerindo forte efeito da deriva genética, por sua vez induzida pelo pequeno tamanho efetivo em cada área e o crescente isolamento entre as mesmas. Ao mesmo tempo, análises genéticas identificaram evidência de conexão demográfica recente entre áreas, sugerindo que este processo natural de conectividade deve ser mantido para garantir a viabilidade destas populações em longo prazo. Os resultados serão integrados ao plano de manejo que vem sendo desenvolvido para este felídeo no Alto Rio Paraná, subsidiando a elaboração e efetivação de esforços urgentes para a conservação desta espécie nesta ecorregião. / Several ecological studies have been conducted aiming to aid in the design of effective management and conservation strategies for the jaguar (Panthera onca) in different areas throughout its geographic distribution. However, molecular analyses complementary to these ecological approaches are necessary to ensure that these strategies secure the long term viability of this felid. The studies presented here aimed to develop methodologies that aid in ecological and genetic studies focusing on the jaguar, which are essential to the conservation of this species, as well as to serve as a basis for in-depth populational analyses employing a molecular genetic perspective. In the first chapter, due to the enormous difficulty in obtaining biological samples of this felid, an approach based on the sequencing of a short segment of a mitochondrial DNA gene (ATP6) was developed to accurately identify jaguar faecal samples collected in the field. The results of this study indicated the importance of using a molecular method for the correct identification of faecal samples. In the second chapter, we demonstrated that it is possible to reliably identify the color of a jaguar from faecal DNA by genotyping the molecular polymorphism involved in this coloration variant. Although melanistic individuals are relatively common in some areas of their distribution, so far no scientific study has been conducted addressing this phenotype in the wild. The use of non-invasive sampling is likely one of the few approaches to study natural populations of jaguars exhibiting this characteristic. The third chapter contains the first study involving the structure and connectivity of natural jaguar populations on a regional scale. The study included remnant jaguar populations of the Upper Paraná Atlantic Forest Ecoregion. The results indicated loss of genetic variability in recently isolated populations and considerable genetic differentiation among fragments, suggesting strong effects of genetic drift induced by the small effective size in each area and increasing isolation among them. At the same time, genetic analyses identified clear evidence of recent demographic connectivity between areas, indicating that gene flow among them should be maintained to ensure the long term viability of these populations. The results will be integrated into the management plan that is being developed for this felid in the Upper Paraná Atlantic Forest, supplying data that is important for the development and implementation of urgent efforts to conserve this species in this ecoregion.

Com o objetivo de realizar estratégias eficientes de manejo e conservação para a onça-pintada (Panthera onca), estudos ecológicos vêm sendo realizados em diferentes áreas ao longo de sua distribuição geográfica. No entanto, análises moleculares complementares a estas abordagens ecológicas são necessárias para garantir a viabilidade deste felídeo a longo prazo. Desta maneira, os estudos aqui apresentados tiveram por finalidade desenvolver metodologias para auxiliar estudos genéticos e ecológicos extremamente necessários para a conservação desta espécie, assim como embasar estudos populacionais com uma perspectiva genético-molecular. No primeiro capítulo, devido à enorme dificuldade de se obter amostras biológicas deste felídeo, foi desenvolvida uma abordagem baseada no sequenciamento de um segmento curto de um gene (ATP6) do DNA mitocondrial para identificar de maneira rigorosa amostras fecais de onça-pintada coletadas em campo. Os resultados indicaram a importância de se utilizar um método molecular para a identificação correta de amostras fecais coletadas em campo. No segundo capítulo foi demonstrado que é possível identificar a coloração de onças-pintadas a partir de DNA fecal, através da genotipagem molecular do polimorfismo envolvido no padrão de coloração desta espécie. Embora indivíduos melânicos de onça-pintada sejam relativamente comuns em algumas áreas da sua distribuição, até o momento, nenhum estudo científico envolvendo esta característica foi realizado com populações naturais desta espécie. O uso de amostragem não-invasiva possivelmente é uma das únicas maneiras para estudar diretamente populações de onça-pintada que apresentam esta característica. No terceiro capítulo foi realizado o primeiro estudo envolvendo estruturação e conectividade de populações naturais deste felídeo em uma escala regional. O estudo abrangeu as populações remanescentes de onça-pintada da Ecorregião do Alto Rio Paraná, contida na Mata Atlântica de Interior. Os resultados indicaram perda de variabilidade genética em populações recentemente isoladas e uma considerável diferenciação entre os fragmentos, sugerindo forte efeito da deriva genética, por sua vez induzida pelo pequeno tamanho efetivo em cada área e o crescente isolamento entre as mesmas. Ao mesmo tempo, análises genéticas identificaram evidência de conexão demográfica recente entre áreas, sugerindo que este processo natural de conectividade deve ser mantido para garantir a viabilidade destas populações em longo prazo. Os resultados serão integrados ao plano de manejo que vem sendo desenvolvido para este felídeo no Alto Rio Paraná, subsidiando a elaboração e efetivação de esforços urgentes para a conservação desta espécie nesta ecorregião. / Several ecological studies have been conducted aiming to aid in the design of effective management and conservation strategies for the jaguar (Panthera onca) in different areas throughout its geographic distribution. However, molecular analyses complementary to these ecological approaches are necessary to ensure that these strategies secure the long term viability of this felid. The studies presented here aimed to develop methodologies that aid in ecological and genetic studies focusing on the jaguar, which are essential to the conservation of this species, as well as to serve as a basis for in-depth populational analyses employing a molecular genetic perspective. In the first chapter, due to the enormous difficulty in obtaining biological samples of this felid, an approach based on the sequencing of a short segment of a mitochondrial DNA gene (ATP6) was developed to accurately identify jaguar faecal samples collected in the field. The results of this study indicated the importance of using a molecular method for the correct identification of faecal samples. In the second chapter, we demonstrated that it is possible to reliably identify the color of a jaguar from faecal DNA by genotyping the molecular polymorphism involved in this coloration variant. Although melanistic individuals are relatively common in some areas of their distribution, so far no scientific study has been conducted addressing this phenotype in the wild. The use of non-invasive sampling is likely one of the few approaches to study natural populations of jaguars exhibiting this characteristic. The third chapter contains the first study involving the structure and connectivity of natural jaguar populations on a regional scale. The study included remnant jaguar populations of the Upper Paraná Atlantic Forest Ecoregion. The results indicated loss of genetic variability in recently isolated populations and considerable genetic differentiation among fragments, suggesting strong effects of genetic drift induced by the small effective size in each area and increasing isolation among them. At the same time, genetic analyses identified clear evidence of recent demographic connectivity between areas, indicating that gene flow among them should be maintained to ensure the long term viability of these populations. The results will be integrated into the management plan that is being developed for this felid in the Upper Paraná Atlantic Forest, supplying data that is important for the development and implementation of urgent efforts to conserve this species in this ecoregion.

Com o objetivo de realizar estratégias eficientes de manejo e conservação para a onça-pintada (Panthera onca), estudos ecológicos vêm sendo realizados em diferentes áreas ao longo de sua distribuição geográfica. No entanto, análises moleculares complementares a estas abordagens ecológicas são necessárias para garantir a viabilidade deste felídeo a longo prazo. Desta maneira, os estudos aqui apresentados tiveram por finalidade desenvolver metodologias para auxiliar estudos genéticos e ecológicos extremamente necessários para a conservação desta espécie, assim como embasar estudos populacionais com uma perspectiva genético-molecular. No primeiro capítulo, devido à enorme dificuldade de se obter amostras biológicas deste felídeo, foi desenvolvida uma abordagem baseada no sequenciamento de um segmento curto de um gene (ATP6) do DNA mitocondrial para identificar de maneira rigorosa amostras fecais de onça-pintada coletadas em campo. Os resultados indicaram a importância de se utilizar um método molecular para a identificação correta de amostras fecais coletadas em campo. No segundo capítulo foi demonstrado que é possível identificar a coloração de onças-pintadas a partir de DNA fecal, através da genotipagem molecular do polimorfismo envolvido no padrão de coloração desta espécie. Embora indivíduos melânicos de onça-pintada sejam relativamente comuns em algumas áreas da sua distribuição, até o momento, nenhum estudo científico envolvendo esta característica foi realizado com populações naturais desta espécie. O uso de amostragem não-invasiva possivelmente é uma das únicas maneiras para estudar diretamente populações de onça-pintada que apresentam esta característica. No terceiro capítulo foi realizado o primeiro estudo envolvendo estruturação e conectividade de populações naturais deste felídeo em uma escala regional. O estudo abrangeu as populações remanescentes de onça-pintada da Ecorregião do Alto Rio Paraná, contida na Mata Atlântica de Interior. Os resultados indicaram perda de variabilidade genética em populações recentemente isoladas e uma considerável diferenciação entre os fragmentos, sugerindo forte efeito da deriva genética, por sua vez induzida pelo pequeno tamanho efetivo em cada área e o crescente isolamento entre as mesmas. Ao mesmo tempo, análises genéticas identificaram evidência de conexão demográfica recente entre áreas, sugerindo que este processo natural de conectividade deve ser mantido para garantir a viabilidade destas populações em longo prazo. Os resultados serão integrados ao plano de manejo que vem sendo desenvolvido para este felídeo no Alto Rio Paraná, subsidiando a elaboração e efetivação de esforços urgentes para a conservação desta espécie nesta ecorregião. / Several ecological studies have been conducted aiming to aid in the design of effective management and conservation strategies for the jaguar (Panthera onca) in different areas throughout its geographic distribution. However, molecular analyses complementary to these ecological approaches are necessary to ensure that these strategies secure the long term viability of this felid. The studies presented here aimed to develop methodologies that aid in ecological and genetic studies focusing on the jaguar, which are essential to the conservation of this species, as well as to serve as a basis for in-depth populational analyses employing a molecular genetic perspective. In the first chapter, due to the enormous difficulty in obtaining biological samples of this felid, an approach based on the sequencing of a short segment of a mitochondrial DNA gene (ATP6) was developed to accurately identify jaguar faecal samples collected in the field. The results of this study indicated the importance of using a molecular method for the correct identification of faecal samples. In the second chapter, we demonstrated that it is possible to reliably identify the color of a jaguar from faecal DNA by genotyping the molecular polymorphism involved in this coloration variant. Although melanistic individuals are relatively common in some areas of their distribution, so far no scientific study has been conducted addressing this phenotype in the wild. The use of non-invasive sampling is likely one of the few approaches to study natural populations of jaguars exhibiting this characteristic. The third chapter contains the first study involving the structure and connectivity of natural jaguar populations on a regional scale. The study included remnant jaguar populations of the Upper Paraná Atlantic Forest Ecoregion. The results indicated loss of genetic variability in recently isolated populations and considerable genetic differentiation among fragments, suggesting strong effects of genetic drift induced by the small effective size in each area and increasing isolation among them. At the same time, genetic analyses identified clear evidence of recent demographic connectivity between areas, indicating that gene flow among them should be maintained to ensure the long term viability of these populations. The results will be integrated into the management plan that is being developed for this felid in the Upper Paraná Atlantic Forest, supplying data that is important for the development and implementation of urgent efforts to conserve this species in this ecoregion.

Submitted by Etelvina Domingos (etelvina.domingos@ufpe.br) on 2015-03-04T18:33:50Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Andrés Reyes.pdf: 1267152 bytes, checksum: e1237d8996425a606aaf6a31ede2001c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-04T18:33:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Andrés Reyes.pdf: 1267152 bytes, checksum: e1237d8996425a606aaf6a31ede2001c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / CAPES / O estudo da abundância, a atividade e o uso de habitat da onça-pintada e da onça-parda na região da Amazônia não tem sido amplo como acontece em outros biomas devido a fatores como a acessibilidade, as condições climáticas e ambientais, o que dificulta o desenvolvimento de pesquisas e assim ter uma visão mais abrangente de como as atividades humanas impactam estes aspectos biológicos destes predadores topo. Realizou-se uma pesquisa no assentamento Entre Rios (área antrópica) e na Reserva Biológica Uatumã (unidade de conservação) ao norte do rio Amazonas utilizando armadilhamento fotográfico visando levantar informação sobre a abundância da onça-pintada (Panthera onca), da onça-parda (Puma concolor), seus padrões de atividade e o uso que fazem do habitat. Durante 69 dias em Entre Rios e 76 dias na REBIO Uatumã registrou-se a presença da onça-pintada nas duas áreas e a presença da onça-parda só para a REBIO Uatumã. A abundância das onças foi mais alta na REBIO Uatumã no que em Entre rios. A onça-pintada em Entre rios esteve ativa no período diurno e na REBIO Uatumã esteve ativa nos períodos noturno e crepuscular-diurno, enquanto que a onça-parda esteve ativa ao longo do dia. A onça-pintada em Entre rios quanto na REBIO Uatumã ocorreu com maior frequência na baixada e a onça-parda na REBIO Uatumã no platô e na vertente, zonas montanhosas não alagáveis de pouca elevação. Os resultados aqui obtidos mostraram que a abundancia da onça-pintada e da onça-parda neste estudo foi uma das maiores já registradas na Amazônia, que seus ritmos de atividade esse sobrepuseram temporalmente e que houve segregação espacial como uma forma de evitar competição.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:47:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 829087 bytes, checksum: 53a595f1be1470ef16a089fa9a53d992 (MD5) Previous issue date: 2004-03-31 / The present work proposed evaluating the organization of the components of the testes, the seminiferous epithelium cycle, the intrinsic yield of each fase of spermatogenic process, the testicular sperm reserve, as well as the correlations of these items with corporal and testicular biometric parameters.The medium corporal weight of the jaguar in the present experiment was 78,5 kg, of which about 0,034% are located in the testicular mass, and 0,022% specifically in the seminiferous tubules, which represented about 77,7% of the testicular parenchyma. The average diameter of seminiferous tubules in jaguars was 257 µm, and the average thickness of the seminiferous epithelium was about 90m. Jaguars have about 12,2 meters of seminiferous tubules by testicle gram. The general spermatogenic yield of the jaguar was about 23,4 cells and each Sertoli cell was able to sustain and to keep about 19,2 germ cells, 11 of which were round spermatides. In each seminiferous epithelium cycle about 166 million of spermatozoids were produced by testicle gram. In the jaguar the Leydig cells occupy an average 0,0036% of the corporeal weight and its average number by testicle gram is within the scope for most mammals: between 20 and 40 million. The obtained data supplied pertinent information about the spermatogenic process of this feline of the brazilian fauna, for subsidy to projects of conservation and protection of the wild life that involve reproduction programs. / O presente trabalho propôs avaliar a organização dos componentes do testículo, o ciclo do epitélio seminífero, o rendimento intrínseco de cada fase do processo espermatogênico, a reserva espermática testicular, bem como as correlações destes itens com parâmetros biométricos corporais e testiculares. O peso corporal médio das onças-pintadas do presente experimento foi de 78,5 kg, dos quais cerca de 0,034% são alocados em massa testicular e 0,022% especificamente em túbulos seminíferos, que representaram cerca de 77,7% do parênquima testicular. O diâmetro médio dos túbulos seminíferos em onça-pintada foi de 257μm, e a espessura média do epitélio seminífero foi de aproximadamente 90μm. A onça-pintada apresenta cerca de 12,2 metros de túbulo seminífero por grama de testículo. O rendimento geral da espermatogênese da onça-pintada foi de aproximadamente 23,4 células, e cada célula de Sertoli foi capaz de sustentar e manter aproximadamente 19,2 células da linhagem germinativa, das quais cerca de 11 são espermátides arredondadas. A cada ciclo do epitélio seminífero, cerca de 166 milhões de espermatozóides são produzidos por grama de testículo. Em onças-pintadas as células de Leydig ocupam em média 0,0036% do peso corporal e seu número médio por grama de testículo apresentou-se dentro da amplitude descrita para a maioria dos mamíferos, entre 20 e 40 milhões. Os dados obtidos fornecem informações pertinentes sobre o processo espermatogênico deste felino da fauna brasileira, para subsídio a projetos de conservação e proteção da vida silvestre que envolvam programas de reprodução.

A fragmentação de habitats e o aumento da proximidade entre as comunidades humanas, animais domésticos e silvestres podem ser responsáveis pelo aparecimento de doenças emergentes, disseminação de patógenos e alterações nos padrões epidemiológicos das doenças. Declínios populacionais em felinos silvestres devido a doenças já foram relatados, porém, pouco se conhece sobre o potencial papel dos patógenos nas populações de onça-pintada. Este estudo teve por objetivo pesquisar a presença de patógenos nas populações de onça-pintada e animais domésticos das regiões do Parque Nacional das Emas-PNE, Parque Estadual do Cantão-PEC e Pantanal sul mato-grossense, e identificar possíveis associações nos diagnósticos encontrados. Entre fevereiro de 2000 e janeiro de 2010, foram coletadas amostras biológicas de 31 onças-pintadas, 1246 bovinos, 179 cães e 36 gatos. Foram realizados diagnósticos sorológicos para brucelas lisas (AAT), Leptospira spp. (SAM), Toxoplasma gondii (MAT; RIFI), vírus da raiva (RFFIT), vírus da cinomose (SN), FIV e FeLV (SnapTM); e diagnósticos moleculares para Babesia spp., Hepatozoon spp., Cytauxzoon spp., Mycoplasma haemofelis, 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' e 'Candidatus Mycoplasma turicensis'. Amostras de fezes de onças-pintadas foram analisadas para Giardia intestinalis, Cryptosporidium spp., protozoários da Família Sarcocystidae e Mycobacterium spp. O monitoramento das onças-pintadas, através do radiotransmissor, permitiu o mapeamento da ocorrência dos patógenos. As populações de bovinos das três áreas apresentaram alta exposição à B. abortus, mas apenas uma onça-pintada do PNE foi exposta à brucela lisa. Os sorovares mais prováveis de Leptospira spp. identificados em onças-pintadas do PNE e Pantanal foram distintos dos encontrados nos animais domésticos. As onças-pintadas, cães e gatos das três áreas foram altamente expostos ao T. gondii. Onças-pintadas do PNE e Pantanal foram expostas ao vírus da raiva, assim como as onças-pintadas do Pantanal e os cães das três áreas foram expostos ao vírus da cinomose. Dois gatos do entorno do PEC foram soropositivos para FeLV, mas nenhuma onça-pintada foi exposta ao agente ou ao FIV. Cães do entorno do PNE e do PEC foram positivos para Babesia spp., enquanto todas onças-pintadas foram negativas para o hemoparasita. Todas as onças-pintadas do Pantanal e PNE, e três de quatro onças do PEC foram positivas para Hepatozoon spp. e Cytauxzoon felis, sendo que cães e gatos também foram expostos ao Hepatozoon spp., mas não ao Cytauxzoon spp. As onças-pintadas das três áreas apresentaram alta exposição ao 'Candidatus Mycoplasma haemominutum', e alguns indivíduos do Pantanal e PEC foram positivos para o Mycoplasma haemofelis e 'Candidatus Mycoplasma turicensis'. Poucos gatos foram positivos para os hemoplasmas felinos. Não houve evidências de exposição ao Mycobacterium bovis, e a presença de Cryptosporidium spp. e Giardia intestinalis foi detectada em onças do PNE. De acordo com os resultados, a cinomose e a raiva podem ser consideradas potenciais ameaças às populações de onça-pintada; a brucelose e a leptospirose podem ter sido transmitidas por animais domésticos; e, provavelmente as onças-pintadas possuem papel importante na manutenção do T. gondii, Cytauxzoon felis, Hepatozoon spp. e 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' no ambiente. Esses dados são relevantes e devem ser considerados na elaboração de estratégias para a conservação de onça-pintada na natureza. / Habitat fragmentation and the increasing proximity between humans, domestic and wild animals can be responsible for emerging and re-emerging diseases, dissemination of pathogens and alterations in host-pathogen relationships. Declines in wild felids due to disease have recently been reported; however, little is known about their potential role in wild jaguar populations. This study aimed to investigate the presence of pathogens in jaguar populations and domestic animals in the regions of Emas National Park (ENP), Cantão State Park (CSP) and the Pantanal of Mato Grosso do Sul, and to identify possible associations in the obtained diagnoses. Between February 2000 and January 2010, biological samples were collected from 31 jaguars, 1246 cattle, 179 dogs and 36 cats. Serological surveys for smooth Brucella (RBT), Leptospira spp. (MAT), Toxoplasma gondii (MAT; IFAT), rabies virus (RFFIT), distemper virus (SN), FIV and FeLV (SnapTM), and molecular tests for Babesia spp., Hepatozoon spp., Cytauxzoon spp., Mycoplasma haemofelis, 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' and 'Candidatus Mycoplasma turicensis' were performed. Jaguar scats were analyzed for Giardia intestinalis, Cryptosporidium spp., protozoas of the Sarcocystidae Familiy and Mycobacterium spp. Monitoring of jaguars through radio-transmitter provided pathogen occurrence maps. Cattle populations from all sites were highly exposed to B. abortus, but only one jaguar from ENP was exposed to smooth Brucella. The most detectable serotypes of Leptospira spp. identified in jaguars from ENP and the Pantanal were distinct from those found in the domestic animals. Jaguars, dogs and cats in the three areas were highly exposed to T. gondii. Jaguars from ENP and the Pantantal were exposed to rabies, and jaguars from the Pantanal and dogs from the three areas were exposed to distemper virus. Two cats from the surroundings of CSP were seropositive for FeLV, but no jaguars were exposed to this agent or to FIV. Dogs from the surroundings of ENP and CSP were positive for Babesia spp., while all jaguars were negative for the hemoparasite. All jaguars from the Pantanal and ENP and three of four jaguars from the CSP were positive for Hepatozoon spp. and Cytauxzoon felis. Dogs and cats were also exposed to Hepatozoon spp., but not to Cytauxzoon spp. The jaguars from the three areas were highly exposed to 'Candidatus Mycoplasma haemominutum', and some individuals from the Pantanal and CSP were positive for Mycoplasma haemofelis and 'Candidatus Mycoplasma turicensis'. Few domestic cats were positive for feline hemoplasms. There were no evidences of exposure to Mycobacterium bovis, but Cryptosporidium spp. and Giardia intestinalis were detected in jaguars from ENP. According to the results, distemper and rabies should be considered potential threats to jaguar populations; brucellosis and leptospirosis could have been transmitted by domestic animals; and jaguars probably play an important role in the maintenance of T. gondii, Cytauxzoon felis, Hepatozoon spp. and 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' in nature. These data should be taken into account when elaborating conservation strategies for jaguars in the wild.

Submitted by Simone Souza (simonecgsouza@hotmail.com) on 2017-10-18T14:04:08Z No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Selma Samiko Miyazaki Onuma.pdf: 1498739 bytes, checksum: 80569040824ee0dd609c6d63ad7c4fa7 (MD5) / Approved for entry into archive by Jordan (jordanbiblio@gmail.com) on 2017-11-08T12:33:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Selma Samiko Miyazaki Onuma.pdf: 1498739 bytes, checksum: 80569040824ee0dd609c6d63ad7c4fa7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-08T12:33:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Selma Samiko Miyazaki Onuma.pdf: 1498739 bytes, checksum: 80569040824ee0dd609c6d63ad7c4fa7 (MD5) Previous issue date: 2014-02-27 / Amostras de sangue de 11 onças-pintadas de vida livre (Panthera onca) foram coletadas em duas unidades de conservação federal no Pantanal de Mato Grosso com objetivo de avaliar o perfil sanitário dessas populações. A presença de anticorpos séricos para Ehrlichia spp., Rickettsia spp., Toxoplasma gondii, Neospora caninum e Sarcocystis neurona foi investigada pela Reação de Imunofluorescência Indireta (RIFI); para Leptospira spp. pela Microtécnica de Soroaglutinação Microscópica (SAM) e para Brucella abortus pelo teste do Antígeno Acidificado Tamponado (Rosa Bengala). O DNA genômico em cada amostra de sangue total coletada foi analisada pela Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR) com intuito de identificar a presença de DNA de Ehrlichia spp., Rickettsia spp., Hepatozoon spp. e Cytauxzoon spp. Duas fêmeas de carrapato Amblyomma cajennense coletados em um animal foram também testadas pela PCR para detecção de DNA de Ehrlichia spp. e Rickettsia spp. Duas onças foram soropositivas para Ehrlichia spp., com títulos de anticorpos de 80 e 320, respectivamente. Nove animais reagiram positivamente a pelo menos quatro espécies de Rickettsia spp. Dez, 7 e 8 animais amostrados foram soropositivos para T. gondii, N. caninum e S. neurona, respectivamente. Duas onças apresentaram soros reagentes para Leptospira spp. , e o provável sorotipo infectante em ambos os animais foi um isolado brasileiro do sorovar Canicola (L01). Todas as amostras de soro foram negativas para B. abortus. Nenhum DNA da família Anaplasmataceae e do gênero Ehrlichia foi detectado pela PCR ou pela Heminested- PCR nas amostras de sangue, entretanto uma foi positiva na PCR para Rickettsia spp. segundo o gene citrate sintase (gltA), porém negativa para o gene ompA, comum entre riquétsias pertencentes ao grupo da Febre Maculosa. Um A. cajennense apresentou DNA riquetsial, cujo sequenciamento de nucleotídeos demonstrou 99% de similaridade a R. amblyommii. Sete amostras apresentaram DNA de Hepatozoon spp., com 99% de similaridade para H. felis e 10 das 11 amostras foram positivas para DNA de Cytauxzoon spp., com 99% de similaridade para C. felis. O presente estudo mostrou que as onças de vida livre na porção norte do Pantanal foram expostas a inúmeros agentes patogênicos, e que uma abordagem integrada para a conservação da vida selvagem e a integridade da saúde pública é uma questão eminente a fim de determinar intervenções de gestão em áreas protegidas. Este é o primeiro relato da exposição de onças-pintadas de vida livre a N. caninum e S. neurona. / Blood samples from 11 free-living jaguars (Panthera onca) were collected in two federal conservation units in the Pantanal of Mato Grosso state to determine the health profile of these populations . The presence of serum antibodies for Ehrlichia spp., Rickettsia spp., Toxoplasma gondii, Neospora caninum and Sarcocystis neurona was investigated by Immunofluorescence Assay (IFA); for Leptospira spp by the Microscopic Agglutination Test (MAT). and for Brucella abortus by rose Bengal test . Blood genomic DNA in each sample was tested by Polymerase Chain Reaction( PCR ) to identify Ehrlichia spp . , Rickettsia spp . , Hepatozoon spp . and Cytauxzoon spp. Two females of Amblyomma cajennense ticks collected from an animal were tested by PCR for DNA detection of Ehrlichia spp . and Rickettsia spp. Two jaguars were seropositive for Ehrlichia spp ., with antibody titres of 80 and 320, respectively. Nine animals were positive for at least four species of Rickettsia spp. Ten, 7 and 8 of the sampled animals were seropositive for T. gondii, N. caninum and S. neurona, respectively. Two jaguars were seroreactive for Leptospira spp. antigen and the most likely infecting serotype in both animals was a Brazilian isolate of serovar Canicola ( L01 ) . All serum samples were negative for B. abortus. No Anaplasmataceae and Ehrlichia DNA was detected by PCR or by Heminested-PCR. One sample was positive by PCR for Rickettsia spp. according to the citrate synthase gene (gltA), but it was negative for the ompA rickettsial gene of the spotted fever group. An A. cajennense collected showed riquetsial DNA whose sequence showed 99 % similarity to R. amblyommii . Seven samples presented DNA fragments of Hepatozoon spp., with 99% similarity to H. felis and 10 of the 11 samples were positive for DNA fragments of Cytauxzoon spp., with 99 % similarity to C. felis. The present study showed that free-living jaguars in northern Pantanal were exposed to numerous pathogens, and an integrated approach to wildlife conservation and integrity of public health is a prominent issue in order to determine management interventions in protected areas. This is the first report of exposure of free-living jaguars to N. caninum and S. neurona.

A fragmentação de habitats e o aumento da proximidade entre as comunidades humanas, animais domésticos e silvestres podem ser responsáveis pelo aparecimento de doenças emergentes, disseminação de patógenos e alterações nos padrões epidemiológicos das doenças. Declínios populacionais em felinos silvestres devido a doenças já foram relatados, porém, pouco se conhece sobre o potencial papel dos patógenos nas populações de onça-pintada. Este estudo teve por objetivo pesquisar a presença de patógenos nas populações de onça-pintada e animais domésticos das regiões do Parque Nacional das Emas-PNE, Parque Estadual do Cantão-PEC e Pantanal sul mato-grossense, e identificar possíveis associações nos diagnósticos encontrados. Entre fevereiro de 2000 e janeiro de 2010, foram coletadas amostras biológicas de 31 onças-pintadas, 1246 bovinos, 179 cães e 36 gatos. Foram realizados diagnósticos sorológicos para brucelas lisas (AAT), Leptospira spp. (SAM), Toxoplasma gondii (MAT; RIFI), vírus da raiva (RFFIT), vírus da cinomose (SN), FIV e FeLV (SnapTM); e diagnósticos moleculares para Babesia spp., Hepatozoon spp., Cytauxzoon spp., Mycoplasma haemofelis, 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' e 'Candidatus Mycoplasma turicensis'. Amostras de fezes de onças-pintadas foram analisadas para Giardia intestinalis, Cryptosporidium spp., protozoários da Família Sarcocystidae e Mycobacterium spp. O monitoramento das onças-pintadas, através do radiotransmissor, permitiu o mapeamento da ocorrência dos patógenos. As populações de bovinos das três áreas apresentaram alta exposição à B. abortus, mas apenas uma onça-pintada do PNE foi exposta à brucela lisa. Os sorovares mais prováveis de Leptospira spp. identificados em onças-pintadas do PNE e Pantanal foram distintos dos encontrados nos animais domésticos. As onças-pintadas, cães e gatos das três áreas foram altamente expostos ao T. gondii. Onças-pintadas do PNE e Pantanal foram expostas ao vírus da raiva, assim como as onças-pintadas do Pantanal e os cães das três áreas foram expostos ao vírus da cinomose. Dois gatos do entorno do PEC foram soropositivos para FeLV, mas nenhuma onça-pintada foi exposta ao agente ou ao FIV. Cães do entorno do PNE e do PEC foram positivos para Babesia spp., enquanto todas onças-pintadas foram negativas para o hemoparasita. Todas as onças-pintadas do Pantanal e PNE, e três de quatro onças do PEC foram positivas para Hepatozoon spp. e Cytauxzoon felis, sendo que cães e gatos também foram expostos ao Hepatozoon spp., mas não ao Cytauxzoon spp. As onças-pintadas das três áreas apresentaram alta exposição ao 'Candidatus Mycoplasma haemominutum', e alguns indivíduos do Pantanal e PEC foram positivos para o Mycoplasma haemofelis e 'Candidatus Mycoplasma turicensis'. Poucos gatos foram positivos para os hemoplasmas felinos. Não houve evidências de exposição ao Mycobacterium bovis, e a presença de Cryptosporidium spp. e Giardia intestinalis foi detectada em onças do PNE. De acordo com os resultados, a cinomose e a raiva podem ser consideradas potenciais ameaças às populações de onça-pintada; a brucelose e a leptospirose podem ter sido transmitidas por animais domésticos; e, provavelmente as onças-pintadas possuem papel importante na manutenção do T. gondii, Cytauxzoon felis, Hepatozoon spp. e 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' no ambiente. Esses dados são relevantes e devem ser considerados na elaboração de estratégias para a conservação de onça-pintada na natureza. / Habitat fragmentation and the increasing proximity between humans, domestic and wild animals can be responsible for emerging and re-emerging diseases, dissemination of pathogens and alterations in host-pathogen relationships. Declines in wild felids due to disease have recently been reported; however, little is known about their potential role in wild jaguar populations. This study aimed to investigate the presence of pathogens in jaguar populations and domestic animals in the regions of Emas National Park (ENP), Cantão State Park (CSP) and the Pantanal of Mato Grosso do Sul, and to identify possible associations in the obtained diagnoses. Between February 2000 and January 2010, biological samples were collected from 31 jaguars, 1246 cattle, 179 dogs and 36 cats. Serological surveys for smooth Brucella (RBT), Leptospira spp. (MAT), Toxoplasma gondii (MAT; IFAT), rabies virus (RFFIT), distemper virus (SN), FIV and FeLV (SnapTM), and molecular tests for Babesia spp., Hepatozoon spp., Cytauxzoon spp., Mycoplasma haemofelis, 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' and 'Candidatus Mycoplasma turicensis' were performed. Jaguar scats were analyzed for Giardia intestinalis, Cryptosporidium spp., protozoas of the Sarcocystidae Familiy and Mycobacterium spp. Monitoring of jaguars through radio-transmitter provided pathogen occurrence maps. Cattle populations from all sites were highly exposed to B. abortus, but only one jaguar from ENP was exposed to smooth Brucella. The most detectable serotypes of Leptospira spp. identified in jaguars from ENP and the Pantanal were distinct from those found in the domestic animals. Jaguars, dogs and cats in the three areas were highly exposed to T. gondii. Jaguars from ENP and the Pantantal were exposed to rabies, and jaguars from the Pantanal and dogs from the three areas were exposed to distemper virus. Two cats from the surroundings of CSP were seropositive for FeLV, but no jaguars were exposed to this agent or to FIV. Dogs from the surroundings of ENP and CSP were positive for Babesia spp., while all jaguars were negative for the hemoparasite. All jaguars from the Pantanal and ENP and three of four jaguars from the CSP were positive for Hepatozoon spp. and Cytauxzoon felis. Dogs and cats were also exposed to Hepatozoon spp., but not to Cytauxzoon spp. The jaguars from the three areas were highly exposed to 'Candidatus Mycoplasma haemominutum', and some individuals from the Pantanal and CSP were positive for Mycoplasma haemofelis and 'Candidatus Mycoplasma turicensis'. Few domestic cats were positive for feline hemoplasms. There were no evidences of exposure to Mycobacterium bovis, but Cryptosporidium spp. and Giardia intestinalis were detected in jaguars from ENP. According to the results, distemper and rabies should be considered potential threats to jaguar populations; brucellosis and leptospirosis could have been transmitted by domestic animals; and jaguars probably play an important role in the maintenance of T. gondii, Cytauxzoon felis, Hepatozoon spp. and 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' in nature. These data should be taken into account when elaborating conservation strategies for jaguars in the wild.

The jaguars (Panthera onca) of Tortuguero National Park, Costa Rica, sometimes kills and eats green sea turtles (Chelonia mydas), they also, though less often, kill and eat leatherback sea turtles (Dermochelys coriacea). The three species are considered endangered and are listed in CITES. It was the aim of this study to find out more about the jaguars behaviour in the area. To discern any patterns of jaguar and turtle activity on the beach the number of tracks per eighth of a mile was recorded on a daily basis for 26 days and then analyzed. It was also considered to be of interest to determine how many jaguars could be responsible for the predation of sea turtles. In addition to this average beach width was measured for each eighth of a mile. There was a noticeable difference in jaguar activity on the beach between days of recording. Analysis found that the beach width could possibly have a small positive effect on jaguar activity. No correlation was found between jaguar and turtle activity. It is believed that the reason that there was no correlation between jaguar activity and turtle activity was due to most of the tracks used to estimate turtle activity had originated from leatherback turtles, which are not as often predated by jaguars as the green turtle. An estimation of five or six jaguars was made using photographs of pugmarks and a method of track discrimination together with information from personnel from the Jalova station.

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