Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-12-18T09:46:49Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 926264 bytes, checksum: 416b10a79cd9725bb4a42f91379a81ee (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-18T09:46:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 926264 bytes, checksum: 416b10a79cd9725bb4a42f91379a81ee (MD5) Previous issue date: 2015-08-14 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superio / As duas espécies de Mycoplasma mais prevalentes na indústria suinícola são Mycoplasma hyopneumoniae e Mycoplasma hyorhinis. Estes patógenos podem causar perdas econômicas significativas para os produtores e para a indústria. Variabilidade genética tem sido observada em cepas de M. hyopneumoniae usando diferentes técnicas de tipificação. Já a diversidade genética de M. hyorhinis tem sido o foco de um número limitado de estudos nos últimos anos. Mycoplasma apresentam numerosas regiões repetitivas (VNTR) no seu genoma, e essas regiões repetitivas são conhecidos por serem sítios ativos para recombinação genética. Isso trouxe em evidencia a hipótese de que a análise em multilocus de repetições em Tandem de número variável (MLVA) seria uma técnica adequada para investigar a variação genética em Mycoplasma. Portanto, o objetivo principal desta dissertação foi investigar a distribuição não aleatória dos genótipos de diferentes localizações geográfica usando análise em multilocus de repetições em Tandem de número variável (MLVA) para tipificar M. hyopneumoniae e M. hyorhinis avançando o conhecimento sobre a diversidade genética e epidemiologia desses agentes. Quando o foco foi o estudo da diversidade genética de M. hyopneumoniae, um elevado número de tipos de MLVA parecem circular entre rebanhos de suínos com uma distribuição não aleatória dos tipos de MLVA entre regiões. Um único tipo comum não foi identificado entre as amostras obtidas a partir de todas as regiões em estudo. Do mesmo modo, foi observada a diversidade genética de M. hyorhinis, com uma variação limitada em um dos VNTRs alvo. Um ponto relevante observado neste estudo foi a identificação de diferentes tipos de MLVA no mesmo animal em diferentes tipos de amostras, o que sugere que o animal foi colonizado por diferentes cepas. Com foco na indústria de suínos do Brasil, uma das mais importantes do mundo, um estudo específico observou uma elevada diversidade de cepas de M. hyopneumoniae em circulação no país. A comparação entre o número de repetições em tandem (TR) no P97 RR1 e RR3 P146 mostrou uma correlação negativa significativa o que pode sugerir um possível mecanismo compensatório que permitiria a bactéria manter sua capacidade de aderência completa mesmo após a redução da TR em RR1-P97. Em conclusão, a identificação da heterogeneidade genética de M. hyopneumoniae e M. hyorhinis ajudará investigações epidemiológicas ou de surtos locais e ajudará conceber estratégias de controle futuras, bem como servir como uma ferramenta potencial para o estudo da biologia evolutiva da espécie. / The two most prevalent Mycoplasmas species present in the swine industry are Mycoplasma hyopneumoniae and Mycoplasma hyorhinis. These pathogens can cause significant economic losses for producers and for the industry. Genetic variability has been observed in M. hyopneumoniae using different techniques and heterogeneity of M. hyorhinis has been the focus of a limited number of studies in the past years. The fact that Mycoplasma genomes contain numerous repetitive regions (VNTR) within their DNA and that they are known to be active sites for genetic recombination has prompted the hypothesis that Multiple locus variable number tandem repeat analysis (MLVA) would be an appropriate technique to investigate genetic variation in Mycoplasma. Therefore, the main goal of this dissertation was to investigate the non random distribution of genotypes from different geographical location using multiple locus variable tandem repeat analysis (MLVA) to type M. hyopneumoniae and M. hyorhinis and advance the knowledge on the genetic diversity and the epidemiology of these pathogens.When the M. hyopneumoniae study was taken in account, a high number of M. hyopneumoniae MLVA types appear to circulate among swine herds with a non-random distribution of the MLVA types among regions, also a common type was not identified among samples obtained from all regions in this study. Likewise, heterogeneity of M. hyorhinis was observed, with limited variation in one of the target VNTR in the M. hyorhinis study. A relevant point observed in this study was that different MLVA types were identified in the same animal in different sample types, which suggests that the pig was colonized with different strains. With a focus on Brazil pig industry, one of the most important in the world, a specific study observed a high heterogeneity of M. hyopneumoniae strains circulating in the country, and the comparison between the number of tandem repeats (TR) in RR1 P97 and RR3 P146 showed a significant negative correlation that may suggest a possible compensatory mechanism that would allow the bacterium to keep its full adhesion capacity even after reduction of TR in RR1-P97. In conclusion, the identification of the genetic heterogeneity of M. hyopneumoniae and M. hyorhinis will assist local epidemiological or outbreak investigations, design future control strategies as well as serve as a potential tool to study the evolutionary biology of this species.

This study evaluated the prevalence and analysis of risk factors for Neospora spp. and Toxoplasma gondii in horses (horses, mules and ponies), within rural and urban areas of Uberlândia. Serum samples from 257 horses were evaluated for the presence of antibodies against Neospora spp.e T. gondii by the indirect immunofluorescence assay (IFA) and molecular diagnosis by the method of polymerase chain reaction (PCR). In addition, a survey was conducted to evaluate the possible risk factors (genetic group, age, gender, economic activity, history of miscarriage, contact with domestic and wild animals and ECC). Of 257 blood samples evaluated, 13.2% (34/257) had a positive by IIF for Neospora spp. PCR and the overall prevalence of 1.2% (3/257) was found. There was a significant difference when comparing the frequency of positive animals between techniques. Of the factors studied, age was considered a risk factor for Neospora spp. Compared to Toxoplasma gondii, 9.7% (25/257) had a positive by IIF, and PCR were 10.9% (28/257). When comparing rural and urban areas, only the PCR was no statistically significant difference. By IIF only gender and age were risk factors. On the PCR technique, the only significant risk factor was the genetic group. Therefore, it is concluded that there is a T. gondii and Neospora spp. distributed throughout the city of Uberlândia and its prevalence is independent of rural or urban area. Being the genetic group, age and gender considered risk factors for Toxoplasma gondii and Neospora spp age for. / Este estudo avaliou a prevalência e análise dos fatores de risco do Neospora spp. e Toxoplasma gondii em equídeos (cavalos, mulas e pôneis), dentro de áreas rurais e urbanas do Município de Uberlândia. Amostras de soro de 257 equídeos, foram avaliadas para a presença de anticorpos contra Neospora spp.e T. gondii por meio do teste de Imunofluorescência indireta (IFI) e diagnóstico molecular através do método de Reação em cadeia Polimerase (PCR). Além disso, um inquérito epidemiológico foi realizado para avaliar os possíveis fatores de risco (grupo genético, idade, gênero, atividade econômica, histórico de abortamento, contato com animais domésticos e silvestres e ECC). Das 257 amostras sanguíneas avaliadas, 13,2% (34/257) resultaram em positivas na IFI para Neospora spp. e na PCR foi encontrada a prevalência geral de 1,2% (3/257). Houve diferença significativa ao comparar a frequência de animais positivos entre as técnicas. Dos fatores pesquisados a idade foi considerada fator de risco para o Neospora spp. Em relação ao Toxoplasma gondii, 9,7% (25/257) resultaram em positivas na IFI, e na PCR foram 10,9% (28/257). Ao comparar zona rural e urbana, apenas na PCR houve diferença estatística significativa. Na IFI somente o gênero e a idade foram considerados fatores de risco. Na técnica da PCR, o único fator de risco significativo foi o grupo genético. Logo, concluiu-se que há a presença de Toxoplasma gondii e Neospora spp. distribuídos em todo o município de Uberlândia e sua prevalência independe de ser zona rural ou urbana. Sendo o grupo genético, idade e gênero considerados fatores de risco para o Toxoplasma gondii e a idade para o Neospora spp. / Mestre em Ciências Veterinárias

Fibropapilomatose (FP) é uma doença caracterizada por múltiplas massas de tumores cutâneos variando de 0,1 a mais de 30 cm em diâmetro. Afeta primariamente tartarugas-verdes (Chelonia mydas), mas também outras espécies de tartarugas marinhas ao redor do mundo. O objetivo deste estudo é, através de dados já sistematicamente coletados pelo Programa Brasileiro de Proteção, Pesquisa e manejo das Tartarugas Marinhas - Projeto TAMAR-IBAMA, caracterizar, no tempo e no espaço, a ocorrência desta doença em tartarugas marinhas na costa brasileira, entre os anos de 2000 a 2005. As tartarugas encontradas, vivas ou mortas, foram identificadas, medidas e examinadas quanto à presença ou ausência de tumores. Nesse período foram examinadas 10.170 tartarugas marinhas, sendo 1.243 tartarugas-de-pente, (Eretmochelys imbricata), das quais 2 apresentaram tumores; entre as 250 tartarugas- cabeçudas, (Caretta caretta), 5 apresentaram tumores; entre as 288 tartarugas-oliva (Lepidochelys olivacea), 3 apresentaram tumores; nenhuma das 30 tartarugas-gigantes, (Dermochelys coriacea) examinadas tinham tumores. A maior parte dos registros (82,20 %; 8.359 de 10.170) correspondeu a tartarugas-verdes (Chelonia mydas), das quais 1.288 apresentavam tumores. Foram coletadas amostras de tumores de 80 tartarugas para análise histopatológica; todas foram positivas para fibropapilomatose. A média da prevalência nacional geral para Chelonia mydas foi de 15.41%; apenas nas áreas costeiras a doença foi verificada. Nenhuma ocorrência foi registrada nas ilhas oceânicas do Atol das Rocas e do Arquipélago de Fernando de Noronha. Os resultados das freqüências de tumores por estado foram: Bahia, 15,81% (211/1335); Ceará, 36,94% (181/490); Espírito Santo, 27,43% (469/1710); Pernambuco-Arquipélago de Fernando de Noronha, 0,00% (0/501); Rio de Janeiro, 5,96% (9/151); Rio Grande do Norte-região costeira, 31,43% (33/105); Rio Grande do Norte-Atol das Rocas, 0,00% (0/486); Sergipe, 18,46% (12/65); São Paulo, 10,73 % (371/3456). Os animais afetados variaram de juvenis com comprimento curvilíneo de carapaça (CCC) mínimo de 30,0 cm, subadultos a adultos com máximo de 112 cm. A prevalência de tumores associado a fibropapilomatose aumentou com o CCC até 80,0 cm e decresceu abruptamente. A caracterização da doença foi realizada com um grupo de 202 tartarugas verdes afetadas em uma agregação no Estado do Espírito Santo. Nesse grupo, o número de tumores variou de 1 a 179 tumores em um único animal, tendo como média 21 tumores por tartaruga afetada. 72,5 % dos tumores estavam localizados na região anterior corpórea do animal, 25,2% na região posterior e 2,3% na carapaça e plastrão. Nenhuma tartaruga apresentou tumores na cavidade oral. Para análise de escore de tumor em tartarugas afetadas com FP, o escore de tumor 1 e 2 foi predominante, com 40,61% (80 de 197) e 51,27% (101 de 197) respectivamente. Apenas 8,12% (16 de 197) das tartarugas tiveram escore de tumor 3. / Fibropapilomatosis (FP) is a disease characterized by multiple masses of cutaneous tumors varying from 0,1 to more than 30 cm in diameter. It has affected primarily green turtles (Chelonia mydas), but also other species of sea turtles around the world. The aim of this study is, through the data already systematically collected by the Brazilian Sea Turtle Protection, Research and Management Program - Projeto TAMAR - IBAMA to characterize the occurrence of this disease in marine turtles along the Brazilian coast to within time and space, from 2000 to 2005. Turtles found alive or dead were identified as for the species, measured and examined as for the presence or absence of tumors. 10.170 sea turtles were examined: 1.243 of them were Hawksbills (Eretmochelys imbricata), two of which showed tumors; five of the 250 loggerhead turtles (Caretta caretta) and three of 288 olive ridley\'s turtles (Lepidochelys olivacea), showed tumors; none of the 30 leatherback (Dermochelys coriacea) carried tumors. Mostly of the records, (82,20%; 8.359/10170) corresponded to green turtles (Chelonia mydas), 1.288 of which had tumors. Samples of tumors were collected from 80 turtles for histopathologycal analysis; all examined samples were positive for fibropapillomatosis. The average nationwide tumor prevalence in Chelonia mydas was 15.41%; the disease was detected only in coastal areas: no occurrence was recorded for the oceanic islands of Atol das Rocas and Fernando de Noronha Archipelago. The tumor frequencies by state were: Bahia, 15,81% (211/1335); Ceará, 36,94% (181/490); Espírito Santo, 27,43% (469/1710); Pernambuco - Archipelago of Fernando de Noronha, 0,00% (0/501); Rio de Janeiro, 5,96% (9/151); Rio Grande do Norte- coastal area, 31,43% (33/105); Rio Grande do Norte - Atol das Rocas, 0,00% (0/486); Sergipe, 18,46% (12/65); São Paulo, 10,73% (371/3456). The affected animals varied from juvenile, with minimum curved carapace length (CCC) 30,0 cm to sub-adults, adults with a maximum 112 cm. The prevalence of tumours associated to fibropapillomatosis increased with CCC up to 80,0 cm and then decreased abruptly. The number of tumors in 202 affected green turtles from an aggregation in the state of Espírito Santo varied from 1 to 179 tumors in a single animal, with an average of 21 tumors per affected turtle. 72,5% of tumors were located in the anterior half of the animal\'s bodies, 25,2% in the posterior area, 2,3% on the shell and plastron. No turtle had tumors in the oral cavity. A predominance of turtles was registered with tumors score 1, 40,61% (80 of 197) and score 2, 51,27% (101/197). Only 8,12% (16/197) of the turtles that had score 3. For analysis of tumor score in affected turtles with FP, the tumors score 1 and 2 was predominant, with (40,61%; 80 of 197) and (51,27%; 101/197) respectively. Only 8,12 % (16/197) of the turtles attained tumors score 3.

Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Campylobacter sp is recognized as one of the main causes of human gastroenteritis of food origin. Among the foods that circulate these microorganism, chicken is the meat most involved. Existent studies about the vertical transmission of Campylobacter sp are scarce and inconclusive. The aim of this study was to verify the vertical transmission of Campylobacter sp from heavy matrixes to the progeny. With the use of the traditional culture method, cloacal swabs of 279 heavy matrix samples were analyzed from the follow sits: 6 bed, 4 nest, 11 ovary and oviduct, 11 liver, spleen and heart and 11 intestine. In 11 cloacal swab samples polymerase chain reaction (PCR) was also performed, using the automated BAX® system. In progeny samples, the following were analyzed: 78 and 44 fresh eggs, disinfected and not disinfected, respectively, 12 infertile eggs, 45 unhatched eggs, 13 hatching environment samples, 121 meconium samples and 36 organ samples (heart, liver, spleen) and 36 intestines from one-day old chickens. The analyses were performed by the traditional culture method. In another 10 meconium samples, analysis was performed by the BAX® method. The positivity in the cloacal swab samples by the traditional culture method was 13.97% and by the BAX® methodology it was 54.54%. The bed samples, positivity was 83.33% and in the nest samples it was 0.25%. In matrix organs, Campylobacter sp was only isolated in 27.27% of samples and only in the intestines. There was no positivity in any of the samples of fresh eggs, infertile eggs, embryonic eggs, chicken organs or from the hatching environment. By the traditional culture method there was no positivity in the meconium, but with the use of the BAX® system, positivity was 80%. Although the physiological characteristics of the matrixes, the eggs and Campylobacter sp are favorable to the entry and survival of bacteria in the eggs, and consequently in the one-day old chickens, in this study, positivity in the progeny was only found with the use of the BAX® system. These findings suggest that further studies with the use of molecular techniques should be conducted to verify vertical transmission. / Campylobacter sp é reconhecida como uma das principais causas de gastroenterite humana de origem alimentar e dentre os alimentos veiculadores desses microrganismos, a carne de frango é a mais implicada. As pesquisas existentes sobre a transmissão vertical da Campylobacter sp são escassas e não conclusivas. O objetivo desse estudo foi verificar a transmissão vertical da Campylobacter sp de matrizes pesadas para a progênie. Utilizando o método de cultura tradicional, foram analisados suabes cloacais de 279 amostras matrizes pesadas, 6 de cama, 4 de ninho, 11 de ovário e oviduto, 11 de fígado, baço e coração e 11 de intestino. Em 11 amostras de suabe cloacal, também foi realizada a reação da polimerase em cadeia (PCR) utilizando o sistema automatizado BAX®. Em amostras da progênie foram analisadas: 78 e 44 ovos frescos desinfetados e não desinfetados, respectivamente, 12 ovos inférteis, 45 ovos não eclodidos, 13 amostras ambientais de nascedouro, 121 de mecônio e 36 amostras de órgãos (coração, fígado, baço) e 36 intestinos de pintainhos de um dia. As análises foram realizadas pelo método de cultura tradicional e em outras 10 amostras de mecônio, pelo método BAX®. A positividade em amostras de suabe cloacal pelo método de cultura tradicional foi de 13,97% e pela metodologia BAX® 54,54%. Nas de cama, a positividade foi de 83,33% e nas de ninho, 25%. Em órgãos de matrizes, Campylobacter sp foi isolada em 27,27% das amostras e somente em intestinos. Não houve positividade em nenhuma das amostras de ovos frescos, inférteis, ovos embrionados, órgãos de pintainhos ou ambiente de nascedouro. Pelo método de cultura tradicional, não houve positividade em mecônio, embora com o uso do sistema BAX® a positividade foi de 80%. Apesar das características fisiológicas das matrizes, dos ovos e da Campylobacter sp serem favoráveis à entrada e sobrevivência da bactéria nos ovos, e conseqüentemente, nos pintainhos de 1 dia de idade, nesse estudo, as positividades na progênie foram apenas encontradas com a utilização do sistema BAX®. Esses achados sugerem que outros estudos com utilização de técnicas moleculares devem ser aplicados para verificação da transmissão vertical. / Mestre em Ciências Veterinárias

Fibropapilomatose (FP) é uma doença caracterizada por múltiplas massas de tumores cutâneos variando de 0,1 a mais de 30 cm em diâmetro. Afeta primariamente tartarugas-verdes (Chelonia mydas), mas também outras espécies de tartarugas marinhas ao redor do mundo. O objetivo deste estudo é, através de dados já sistematicamente coletados pelo Programa Brasileiro de Proteção, Pesquisa e manejo das Tartarugas Marinhas - Projeto TAMAR-IBAMA, caracterizar, no tempo e no espaço, a ocorrência desta doença em tartarugas marinhas na costa brasileira, entre os anos de 2000 a 2005. As tartarugas encontradas, vivas ou mortas, foram identificadas, medidas e examinadas quanto à presença ou ausência de tumores. Nesse período foram examinadas 10.170 tartarugas marinhas, sendo 1.243 tartarugas-de-pente, (Eretmochelys imbricata), das quais 2 apresentaram tumores; entre as 250 tartarugas- cabeçudas, (Caretta caretta), 5 apresentaram tumores; entre as 288 tartarugas-oliva (Lepidochelys olivacea), 3 apresentaram tumores; nenhuma das 30 tartarugas-gigantes, (Dermochelys coriacea) examinadas tinham tumores. A maior parte dos registros (82,20 %; 8.359 de 10.170) correspondeu a tartarugas-verdes (Chelonia mydas), das quais 1.288 apresentavam tumores. Foram coletadas amostras de tumores de 80 tartarugas para análise histopatológica; todas foram positivas para fibropapilomatose. A média da prevalência nacional geral para Chelonia mydas foi de 15.41%; apenas nas áreas costeiras a doença foi verificada. Nenhuma ocorrência foi registrada nas ilhas oceânicas do Atol das Rocas e do Arquipélago de Fernando de Noronha. Os resultados das freqüências de tumores por estado foram: Bahia, 15,81% (211/1335); Ceará, 36,94% (181/490); Espírito Santo, 27,43% (469/1710); Pernambuco-Arquipélago de Fernando de Noronha, 0,00% (0/501); Rio de Janeiro, 5,96% (9/151); Rio Grande do Norte-região costeira, 31,43% (33/105); Rio Grande do Norte-Atol das Rocas, 0,00% (0/486); Sergipe, 18,46% (12/65); São Paulo, 10,73 % (371/3456). Os animais afetados variaram de juvenis com comprimento curvilíneo de carapaça (CCC) mínimo de 30,0 cm, subadultos a adultos com máximo de 112 cm. A prevalência de tumores associado a fibropapilomatose aumentou com o CCC até 80,0 cm e decresceu abruptamente. A caracterização da doença foi realizada com um grupo de 202 tartarugas verdes afetadas em uma agregação no Estado do Espírito Santo. Nesse grupo, o número de tumores variou de 1 a 179 tumores em um único animal, tendo como média 21 tumores por tartaruga afetada. 72,5 % dos tumores estavam localizados na região anterior corpórea do animal, 25,2% na região posterior e 2,3% na carapaça e plastrão. Nenhuma tartaruga apresentou tumores na cavidade oral. Para análise de escore de tumor em tartarugas afetadas com FP, o escore de tumor 1 e 2 foi predominante, com 40,61% (80 de 197) e 51,27% (101 de 197) respectivamente. Apenas 8,12% (16 de 197) das tartarugas tiveram escore de tumor 3. / Fibropapilomatosis (FP) is a disease characterized by multiple masses of cutaneous tumors varying from 0,1 to more than 30 cm in diameter. It has affected primarily green turtles (Chelonia mydas), but also other species of sea turtles around the world. The aim of this study is, through the data already systematically collected by the Brazilian Sea Turtle Protection, Research and Management Program - Projeto TAMAR - IBAMA to characterize the occurrence of this disease in marine turtles along the Brazilian coast to within time and space, from 2000 to 2005. Turtles found alive or dead were identified as for the species, measured and examined as for the presence or absence of tumors. 10.170 sea turtles were examined: 1.243 of them were Hawksbills (Eretmochelys imbricata), two of which showed tumors; five of the 250 loggerhead turtles (Caretta caretta) and three of 288 olive ridley\'s turtles (Lepidochelys olivacea), showed tumors; none of the 30 leatherback (Dermochelys coriacea) carried tumors. Mostly of the records, (82,20%; 8.359/10170) corresponded to green turtles (Chelonia mydas), 1.288 of which had tumors. Samples of tumors were collected from 80 turtles for histopathologycal analysis; all examined samples were positive for fibropapillomatosis. The average nationwide tumor prevalence in Chelonia mydas was 15.41%; the disease was detected only in coastal areas: no occurrence was recorded for the oceanic islands of Atol das Rocas and Fernando de Noronha Archipelago. The tumor frequencies by state were: Bahia, 15,81% (211/1335); Ceará, 36,94% (181/490); Espírito Santo, 27,43% (469/1710); Pernambuco - Archipelago of Fernando de Noronha, 0,00% (0/501); Rio de Janeiro, 5,96% (9/151); Rio Grande do Norte- coastal area, 31,43% (33/105); Rio Grande do Norte - Atol das Rocas, 0,00% (0/486); Sergipe, 18,46% (12/65); São Paulo, 10,73% (371/3456). The affected animals varied from juvenile, with minimum curved carapace length (CCC) 30,0 cm to sub-adults, adults with a maximum 112 cm. The prevalence of tumours associated to fibropapillomatosis increased with CCC up to 80,0 cm and then decreased abruptly. The number of tumors in 202 affected green turtles from an aggregation in the state of Espírito Santo varied from 1 to 179 tumors in a single animal, with an average of 21 tumors per affected turtle. 72,5% of tumors were located in the anterior half of the animal\'s bodies, 25,2% in the posterior area, 2,3% on the shell and plastron. No turtle had tumors in the oral cavity. A predominance of turtles was registered with tumors score 1, 40,61% (80 of 197) and score 2, 51,27% (101/197). Only 8,12% (16/197) of the turtles that had score 3. For analysis of tumor score in affected turtles with FP, the tumors score 1 and 2 was predominant, with (40,61%; 80 of 197) and (51,27%; 101/197) respectively. Only 8,12 % (16/197) of the turtles attained tumors score 3.

Uma das grandes dificuldades para o controle do rebanho em áreas tão extensas como o território brasileiro é a resistência por parte dos pecuaristas/proprietários de fazendas em usar a tecnologia. O não uso de tecnologias acaba tornando inviável a rastreabilidade e consequente controle da cadeia produtiva. A proposta deste trabalho é a implementação de um sistema, aqui denominado SARE (Sistema de Alerta de Risco Epidemiológico), para gerenciar informações de diagnóstico, comunicando em tempo real aos órgãos competentes de maneira hierarquizada as ocorrências de testes positivos e doenças, agregando confiabilidade e segurança na transmissão dos dados. O foco primário é agilizar o processo de comunicação com intuito de assegurar que medidas preventivas possam ser tomadas em tempo hábil. Considerando que a situação atual no Instituto Biológico (IB) é bastante burocrática e não existem processos informatizados integrados, o sistema proposto SARE foi desenvolvido para ser utilizado via web, de modo a facilitar a comunicação imediata dos órgãos fiscalizadores envolvidos no processo, que imediatamente podem intervir e tomar decisões para o controle de doenças zoossanitárias. A informatização do sistema de sanidade animal para um Centro de Referência como o Instituto Biológico em São Paulo aliado a implantação de um programa especialmente desenvolvido para gerenciar os dados e transmiti-los em tempo real aos órgãos de defesa sanitária contribuirá para a modernização dos processos de diagnóstico, facilitando a identificação de amostras, agilizando a comunicação e gerando rastreabilidade de todas as operações diagnósticas. O sistema proposto contempla também um módulo desenvolvido para auxiliar especialistas (veterinários e especialistas de campo) na solicitação de exames conforme situação detectada em campo. Para o desenvolvimento desse módulo foi proposto o uso de ontologias para a representação do conhecimento dos especialistas da área a fim de criar um vocabulário com termos formais e informais para auxílio na solicitação adequada de exames conforme sintomas aferidos em campo. / One of the major challenges for herd control in areas as large as the Brazilian territory is resistance by breeders/ranch owners to using technology. Failure to use technologies makes tracking and subsequent control of the productive chain unviable. The proposal of this work is to implement a system, hereby named Epidemiologic Risk Alert System (SARE), to manage diagnosis information, reporting occurrences of positive tests and diseases in real time and in a hierarchical manner to the competent agencies, adding reliability and security in data transmission. The primary focus is to expedite the communication process aiming to ensure that preventive measures can be taken in a timely manner. Considering the fact that the current situation at the Biological Institute (BI) is very bureaucratic and that there are no integrated computerized processes, the proposed SARE system was developed to be used via the web in order to facilitate immediate communication with the inspecting agencies involved in the process, which can immediately intervene and make decisions to control zoosanitary diseases. Computerization of the animal health system for a reference center such as the Biological Institute of São Paulo, together with implementation of a specially developed program to manage data and transmit it in real time to the health defense agencies will contribute to modernization of the processes of diagnosis, facilitating identification of samples, speeding communication and ensuring traceability of all the diagnostic operations. The proposed system also contains a module developed to assist specialists (veterinarians and field specialists) request exams depending on the situation detected in the field. To develop this module the use of ontologies was proposed, to represent the knowledge of specialists in the area in order to create a vocabulary with formal and informal terms to assist in the adequate requesting of exams depending on the symptoms noted in the field.

Uma das grandes dificuldades para o controle do rebanho em áreas tão extensas como o território brasileiro é a resistência por parte dos pecuaristas/proprietários de fazendas em usar a tecnologia. O não uso de tecnologias acaba tornando inviável a rastreabilidade e consequente controle da cadeia produtiva. A proposta deste trabalho é a implementação de um sistema, aqui denominado SARE (Sistema de Alerta de Risco Epidemiológico), para gerenciar informações de diagnóstico, comunicando em tempo real aos órgãos competentes de maneira hierarquizada as ocorrências de testes positivos e doenças, agregando confiabilidade e segurança na transmissão dos dados. O foco primário é agilizar o processo de comunicação com intuito de assegurar que medidas preventivas possam ser tomadas em tempo hábil. Considerando que a situação atual no Instituto Biológico (IB) é bastante burocrática e não existem processos informatizados integrados, o sistema proposto SARE foi desenvolvido para ser utilizado via web, de modo a facilitar a comunicação imediata dos órgãos fiscalizadores envolvidos no processo, que imediatamente podem intervir e tomar decisões para o controle de doenças zoossanitárias. A informatização do sistema de sanidade animal para um Centro de Referência como o Instituto Biológico em São Paulo aliado a implantação de um programa especialmente desenvolvido para gerenciar os dados e transmiti-los em tempo real aos órgãos de defesa sanitária contribuirá para a modernização dos processos de diagnóstico, facilitando a identificação de amostras, agilizando a comunicação e gerando rastreabilidade de todas as operações diagnósticas. O sistema proposto contempla também um módulo desenvolvido para auxiliar especialistas (veterinários e especialistas de campo) na solicitação de exames conforme situação detectada em campo. Para o desenvolvimento desse módulo foi proposto o uso de ontologias para a representação do conhecimento dos especialistas da área a fim de criar um vocabulário com termos formais e informais para auxílio na solicitação adequada de exames conforme sintomas aferidos em campo. / One of the major challenges for herd control in areas as large as the Brazilian territory is resistance by breeders/ranch owners to using technology. Failure to use technologies makes tracking and subsequent control of the productive chain unviable. The proposal of this work is to implement a system, hereby named Epidemiologic Risk Alert System (SARE), to manage diagnosis information, reporting occurrences of positive tests and diseases in real time and in a hierarchical manner to the competent agencies, adding reliability and security in data transmission. The primary focus is to expedite the communication process aiming to ensure that preventive measures can be taken in a timely manner. Considering the fact that the current situation at the Biological Institute (BI) is very bureaucratic and that there are no integrated computerized processes, the proposed SARE system was developed to be used via the web in order to facilitate immediate communication with the inspecting agencies involved in the process, which can immediately intervene and make decisions to control zoosanitary diseases. Computerization of the animal health system for a reference center such as the Biological Institute of São Paulo, together with implementation of a specially developed program to manage data and transmit it in real time to the health defense agencies will contribute to modernization of the processes of diagnosis, facilitating identification of samples, speeding communication and ensuring traceability of all the diagnostic operations. The proposed system also contains a module developed to assist specialists (veterinarians and field specialists) request exams depending on the situation detected in the field. To develop this module the use of ontologies was proposed, to represent the knowledge of specialists in the area in order to create a vocabulary with formal and informal terms to assist in the adequate requesting of exams depending on the symptoms noted in the field.

Neste projeto, objetivou-se o diagnóstico de riquétsias, utilizando metodologia molecular, em material de humanos, carrapatos, pulgas, cães e equinos de áreas endêmicas dos estados de São Paulo (SP) e Rio de Janeiro (RJ). Diagnosticou-se Rickettsia rickettsii infectando Amblyomma cajennense e humanos no estado de SP, indicando ser esta a única espécie responsável pela doença. Rickettsia conorii foi diagnosticada em um paciente procedente de Portugal. No estado do RJ, Rickettsia felis foi detectada Ctenocephalides felis e em Am. cajennense enquanto que R. rickettsii em Amblyomma aureolatum, Am. cajennense, Anocentor nitens, Boophilus microplus, Ct. felis e Rhipicephalus sanguineus. As frequências mínimas de vetores infectados do estado do RJ apresentaram valores superiores àqueles registrados em outras regiões do país. Demonstrou-se, de forma inédita, o envolvimento de algumas destas espécies no ciclo da bactéria. R. rickettsii foi diagnosticada em cães e equinos indicando a importância dos animais domésticos na manutenção do ciclo da riquetsiose. / This project aimed to diagnose rickettsial diseases using molecular analysis methods on human, tick, flea, dog and horse samples from endemic areas in the States of São Paulo (SP) and Rio de Janeiro (RJ). A diagnosis of Rickettsia rickettsii infecting Amblyomma cajennense and humans in the State of SP was made, indicating that this is the only species responsible for the disease. Rickettsia conorii was diagnosed in a patient from Portugal. In RJ, Rickettsia felis was detected in Ctenocephalides felis and Am. cajennense, while R. rickettsii was detected in Amblyomma aureolatum, Am. cajennense, Anocentor nitens, Boophilus microplus, Ct. felis and Rhipicephalus sanguineus. In the State of RJ the minimum frequency of infected vectors presented higher values than those recorded in other regions of the country. The involvement of some of these species in the bacterium cycle has been demonstrated for the first time. R. rickettsii was diagnosed in dogs and horses indicating the importance of livestock in the maintenance cycle of rickettsial infection.

A fragmentação de habitats e o aumento da proximidade entre as comunidades humanas, animais domésticos e silvestres podem ser responsáveis pelo aparecimento de doenças emergentes, disseminação de patógenos e alterações nos padrões epidemiológicos das doenças. Declínios populacionais em felinos silvestres devido a doenças já foram relatados, porém, pouco se conhece sobre o potencial papel dos patógenos nas populações de onça-pintada. Este estudo teve por objetivo pesquisar a presença de patógenos nas populações de onça-pintada e animais domésticos das regiões do Parque Nacional das Emas-PNE, Parque Estadual do Cantão-PEC e Pantanal sul mato-grossense, e identificar possíveis associações nos diagnósticos encontrados. Entre fevereiro de 2000 e janeiro de 2010, foram coletadas amostras biológicas de 31 onças-pintadas, 1246 bovinos, 179 cães e 36 gatos. Foram realizados diagnósticos sorológicos para brucelas lisas (AAT), Leptospira spp. (SAM), Toxoplasma gondii (MAT; RIFI), vírus da raiva (RFFIT), vírus da cinomose (SN), FIV e FeLV (SnapTM); e diagnósticos moleculares para Babesia spp., Hepatozoon spp., Cytauxzoon spp., Mycoplasma haemofelis, 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' e 'Candidatus Mycoplasma turicensis'. Amostras de fezes de onças-pintadas foram analisadas para Giardia intestinalis, Cryptosporidium spp., protozoários da Família Sarcocystidae e Mycobacterium spp. O monitoramento das onças-pintadas, através do radiotransmissor, permitiu o mapeamento da ocorrência dos patógenos. As populações de bovinos das três áreas apresentaram alta exposição à B. abortus, mas apenas uma onça-pintada do PNE foi exposta à brucela lisa. Os sorovares mais prováveis de Leptospira spp. identificados em onças-pintadas do PNE e Pantanal foram distintos dos encontrados nos animais domésticos. As onças-pintadas, cães e gatos das três áreas foram altamente expostos ao T. gondii. Onças-pintadas do PNE e Pantanal foram expostas ao vírus da raiva, assim como as onças-pintadas do Pantanal e os cães das três áreas foram expostos ao vírus da cinomose. Dois gatos do entorno do PEC foram soropositivos para FeLV, mas nenhuma onça-pintada foi exposta ao agente ou ao FIV. Cães do entorno do PNE e do PEC foram positivos para Babesia spp., enquanto todas onças-pintadas foram negativas para o hemoparasita. Todas as onças-pintadas do Pantanal e PNE, e três de quatro onças do PEC foram positivas para Hepatozoon spp. e Cytauxzoon felis, sendo que cães e gatos também foram expostos ao Hepatozoon spp., mas não ao Cytauxzoon spp. As onças-pintadas das três áreas apresentaram alta exposição ao 'Candidatus Mycoplasma haemominutum', e alguns indivíduos do Pantanal e PEC foram positivos para o Mycoplasma haemofelis e 'Candidatus Mycoplasma turicensis'. Poucos gatos foram positivos para os hemoplasmas felinos. Não houve evidências de exposição ao Mycobacterium bovis, e a presença de Cryptosporidium spp. e Giardia intestinalis foi detectada em onças do PNE. De acordo com os resultados, a cinomose e a raiva podem ser consideradas potenciais ameaças às populações de onça-pintada; a brucelose e a leptospirose podem ter sido transmitidas por animais domésticos; e, provavelmente as onças-pintadas possuem papel importante na manutenção do T. gondii, Cytauxzoon felis, Hepatozoon spp. e 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' no ambiente. Esses dados são relevantes e devem ser considerados na elaboração de estratégias para a conservação de onça-pintada na natureza. / Habitat fragmentation and the increasing proximity between humans, domestic and wild animals can be responsible for emerging and re-emerging diseases, dissemination of pathogens and alterations in host-pathogen relationships. Declines in wild felids due to disease have recently been reported; however, little is known about their potential role in wild jaguar populations. This study aimed to investigate the presence of pathogens in jaguar populations and domestic animals in the regions of Emas National Park (ENP), Cantão State Park (CSP) and the Pantanal of Mato Grosso do Sul, and to identify possible associations in the obtained diagnoses. Between February 2000 and January 2010, biological samples were collected from 31 jaguars, 1246 cattle, 179 dogs and 36 cats. Serological surveys for smooth Brucella (RBT), Leptospira spp. (MAT), Toxoplasma gondii (MAT; IFAT), rabies virus (RFFIT), distemper virus (SN), FIV and FeLV (SnapTM), and molecular tests for Babesia spp., Hepatozoon spp., Cytauxzoon spp., Mycoplasma haemofelis, 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' and 'Candidatus Mycoplasma turicensis' were performed. Jaguar scats were analyzed for Giardia intestinalis, Cryptosporidium spp., protozoas of the Sarcocystidae Familiy and Mycobacterium spp. Monitoring of jaguars through radio-transmitter provided pathogen occurrence maps. Cattle populations from all sites were highly exposed to B. abortus, but only one jaguar from ENP was exposed to smooth Brucella. The most detectable serotypes of Leptospira spp. identified in jaguars from ENP and the Pantanal were distinct from those found in the domestic animals. Jaguars, dogs and cats in the three areas were highly exposed to T. gondii. Jaguars from ENP and the Pantantal were exposed to rabies, and jaguars from the Pantanal and dogs from the three areas were exposed to distemper virus. Two cats from the surroundings of CSP were seropositive for FeLV, but no jaguars were exposed to this agent or to FIV. Dogs from the surroundings of ENP and CSP were positive for Babesia spp., while all jaguars were negative for the hemoparasite. All jaguars from the Pantanal and ENP and three of four jaguars from the CSP were positive for Hepatozoon spp. and Cytauxzoon felis. Dogs and cats were also exposed to Hepatozoon spp., but not to Cytauxzoon spp. The jaguars from the three areas were highly exposed to 'Candidatus Mycoplasma haemominutum', and some individuals from the Pantanal and CSP were positive for Mycoplasma haemofelis and 'Candidatus Mycoplasma turicensis'. Few domestic cats were positive for feline hemoplasms. There were no evidences of exposure to Mycobacterium bovis, but Cryptosporidium spp. and Giardia intestinalis were detected in jaguars from ENP. According to the results, distemper and rabies should be considered potential threats to jaguar populations; brucellosis and leptospirosis could have been transmitted by domestic animals; and jaguars probably play an important role in the maintenance of T. gondii, Cytauxzoon felis, Hepatozoon spp. and 'Candidatus Mycoplasma haemominutum' in nature. These data should be taken into account when elaborating conservation strategies for jaguars in the wild.

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