Orientador: Ricardo Cardoso Benine / Banca: Flávio C. Theodoro de Lima / Banca: Fernando Jereep / Banca: Fernando Carvalho / Banca: William Ricardo Amancio Santana / Resumo: As espécies atualmente alocadas em Moenkhausia não formam um grupo monofilético. Estudos atuais buscam estabelecer novas relações e readequações destas espécies. No entanto, são verificados equívocos nas identificações que levam à relações não verdadeiras. O presente estudo reúne o conhecimento taxonômico sobre Moenkhausia, corrige, complementa e padroniza descrições das espécies. As espécies foram reunidas em grupos, com base em caracteres da morfologia externa e no conhecimento filogenético disponível para o gênero: Moenkhausia oligolepis - padrão de colorido reticulado e presença de banda escura no pedúnculo caudal; M. lepidura - mácula restrita ao lobo superior da nadadeira caudal; M. dichroura - mácula em ambos os lobos da nadadeira caudal; M. doceana - mácula umeral estendida horizontalmente ou duas máculas umerais, mácula no pedúnculo caudal ou nos raios medianos da nadadeira caudal; seis, ou mais, séries de escamas acima da linha lateral; M. xinguensis - maior altura do corpo na origem da nadadeira dorsal, mácula umeral ausente ou inconspícua e cinco series de escamas acima da linha lateral; M. eigenmanni - concentração de cromatóforos nas escamas, especialmente na região mediana dos flancos; corpo, geralmente, longo e caracteristicamente convexo na região pré-dorsal; M. ceros - baixa concentração de cromatóforos nas escamas, pequeno porte, faixa escura ou iridescente desde a região mediana do corpo ao pedúnculo caudal ou raios medianos da nadadeira caudal. Esses agrupamentos não são exclusivamente naturais e não devem ser tomados como relações filogenéticas. No entanto, são eficazes para a identificação das espécies e elaboração de futuras hipóteses de relações em Moenkhausia / Abstract: The species currently allocated in Moenkhausia are not a monophyletic group. Current studies try to establish new relationships and adequation these species. However, identifications mistakes are usualy verified. What show wrong relationships. This study gathers the taxonomic knowledge of Moenkhausia, fixe, standardizes and complements species descriptions. Most species were grouped into groups, based on characters from the external morphology and phylogenetic knowledge available to the genre: Moenkhausia oligolepis - reticulate patters, presence of dark colored band on the caudal peduncle; M. lepidura - dark spot restricted to the upper lobe of the caudal fin; M. dichroura - spot in both lobes of caudal fin; M. doceana - one horizontally extended humeral spot or two humeral spot, spot presence in the caudal peduncle or in the middle rays of the caudal fin, six or more series of scales above lateral line; M. xinguensis - deep body at origin of dorsal fin, absent or inconspicuous humeral spot, five series of scales above lateral line; M. eigenmanni - concentration of chromatophores on the scales, especially in the middle part of the flanks, usually long body and characteristically convex pre-dorsal region; M. ceros - low concentration of chromatophores on the scales, small, dark or iridescent line from the middle region of the body to the caudal peduncle or middle rays of the caudal fin. These groupings are not natural and should not be taken as phylogenetic relationships. However, they are effective for species identification and development of future hypotheses of relationships in Moenkhausia / Doutor

Made available in DSpace on 2015-05-14T16:53:27Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-17Bitstream added on 2015-05-14T16:58:48Z : No. of bitstreams: 1 000828973.pdf: 2813224 bytes, checksum: 52559505ada0f60a041cdd3e78ecc4d3 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação do Instituto de Biociências (FUNDIBIO) / As espécies atualmente alocadas em Moenkhausia não formam um grupo monofilético. Estudos atuais buscam estabelecer novas relações e readequações destas espécies. No entanto, são verificados equívocos nas identificações que levam à relações não verdadeiras. O presente estudo reúne o conhecimento taxonômico sobre Moenkhausia, corrige, complementa e padroniza descrições das espécies. As espécies foram reunidas em grupos, com base em caracteres da morfologia externa e no conhecimento filogenético disponível para o gênero: Moenkhausia oligolepis - padrão de colorido reticulado e presença de banda escura no pedúnculo caudal; M. lepidura - mácula restrita ao lobo superior da nadadeira caudal; M. dichroura - mácula em ambos os lobos da nadadeira caudal; M. doceana - mácula umeral estendida horizontalmente ou duas máculas umerais, mácula no pedúnculo caudal ou nos raios medianos da nadadeira caudal; seis, ou mais, séries de escamas acima da linha lateral; M. xinguensis - maior altura do corpo na origem da nadadeira dorsal, mácula umeral ausente ou inconspícua e cinco series de escamas acima da linha lateral; M. eigenmanni - concentração de cromatóforos nas escamas, especialmente na região mediana dos flancos; corpo, geralmente, longo e caracteristicamente convexo na região pré-dorsal; M. ceros - baixa concentração de cromatóforos nas escamas, pequeno porte, faixa escura ou iridescente desde a região mediana do corpo ao pedúnculo caudal ou raios medianos da nadadeira caudal. Esses agrupamentos não são exclusivamente naturais e não devem ser tomados como relações filogenéticas. No entanto, são eficazes para a identificação das espécies e elaboração de futuras hipóteses de relações em Moenkhausia / The species currently allocated in Moenkhausia are not a monophyletic group. Current studies try to establish new relationships and adequation these species. However, identifications mistakes are usualy verified. What show wrong relationships. This study gathers the taxonomic knowledge of Moenkhausia, fixe, standardizes and complements species descriptions. Most species were grouped into groups, based on characters from the external morphology and phylogenetic knowledge available to the genre: Moenkhausia oligolepis – reticulate patters, presence of dark colored band on the caudal peduncle; M. lepidura – dark spot restricted to the upper lobe of the caudal fin; M. dichroura - spot in both lobes of caudal fin; M. doceana – one horizontally extended humeral spot or two humeral spot, spot presence in the caudal peduncle or in the middle rays of the caudal fin, six or more series of scales above lateral line; M. xinguensis - deep body at origin of dorsal fin, absent or inconspicuous humeral spot, five series of scales above lateral line; M. eigenmanni - concentration of chromatophores on the scales, especially in the middle part of the flanks, usually long body and characteristically convex pre-dorsal region; M. ceros - low concentration of chromatophores on the scales, small, dark or iridescent line from the middle region of the body to the caudal peduncle or middle rays of the caudal fin. These groupings are not natural and should not be taken as phylogenetic relationships. However, they are effective for species identification and development of future hypotheses of relationships in Moenkhausia

Made available in DSpace on 2016-09-27T13:40:04Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-09-27T13:45:14Z : No. of bitstreams: 1 000868858_20170717.pdf: 1053203 bytes, checksum: 06ef83243052b7fc233d28afbabe6a97 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-07-24T11:34:12Z: 000868858_20170717.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-07-24T11:35:16Z : No. of bitstreams: 1 000868858.pdf: 21008300 bytes, checksum: 63397829c98a27cb343b18592af2285a (MD5) / Bolsa Estágio de Pesquisa no Exterior (BEPE) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Bolsa Estágio de Pesquisa no Exterior (BEPE): 2013/16436-2 / CNPq: 143365/2011-8 / FAPESP: 11/08274-1

Orientador: Claudio de Oliveira / Coorientador: Richard Peter Vari / Banca: Ricardo M. C. Castro / Banca: Francisco Langeani Neto / Banca: Ricardo C. Benine / Banca: José L. O. Birincell / Resumo:?? / Abstract: ?? / Doutor

Resumo: O gênero Moenkhausia, incertae sedis em Characidae, inclui 65 espécies nominais, e é provavelmente polifilético, embora possa conter agrupamentos naturais. O grupo Moenkhausia lepidura (sensu Géry, 1992) compreende as espécies que apresentam o lobo superior da nadadeira caudal negro ou escuro: M. gracilima, M. hasemani, M. hysterosticta, M. icae, M. inrai, M. lata, M. lepidura e M. loweae. A análise filogenética realizada contou com 44 táxons terminais e 87 caracteres osteológicos e de morfologia externa, e reconhece o grupo Moenkhausia lepidura como monofilético, sustentado por três sinapomorfias: vertical que passa pela extremidade anterior do sexto infra-orbital alinhada ou anterior ao limite do segundo e terceiro infra-orbitais; mácula na nadadeira caudal restrita ao lobo superior; mácula do lobo superior da nadadeira caudal no terço posterior do lobo, e raios medianos hialinos. As oito espécies já descritas para o grupo M. lepidura são revisadas, e são descritas mais oito novas espécies, distribuídas pelas bacias Amazônica, das Guianas e bacia do alto rio Paraná. Gymnotichtys hildae pertence ao grupo Moenkhausia lepidura e Moenkhausia lepidura ocoae não / Abstract: Moenkhausia is an incertae sedis genus in Characidae, consisting of 65 valid species, and is probably polyphyletic, although it may contain natural agroupments. The Moenkhausia lepidura group species (sensu Géry, 1992) comprisis those species with a gray or black spot on the upper caudal-fin lobe: M. gracilima, M. hasemani, M. hysterosticta, M. icae, M. inrai, M. lata, M. lepidura and M. loweae. The phylogenetic analysis with 44 taxa and 87 osteological and morphological characteres recognizes the Moenkhausia lepidura group as a monophyletic assemblage, supported by three sinapomorphies: vertical through anterior limit of sixth infraorbital alligned or anteriorly to limit between second and third infraorbitals; caudal-fin mark restricted to upper caudal-fin lobe; caudal-fin mark at posterior third of upper caudal-fin lobe and median caudal-fin rays hialine. Eight species recognized to Moenkhausia lepidura group are redescribed, and other eigth new species are described, widespread throughout Amazonas, Guianas and upper Paraná drainages. Gymnotichtys hildae belongs to Moenkhausia lepidura group, and Moenkhausia lepidura ocoae do not / Orientador: Francisco Langeani / Coorientador: Ricardo Cardoso Benine / Banca: Heraldo Antonio Britisk / Banca: Flávio César Thadeo de Lima / Mestre

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-22Bitstream added on 2014-08-13T18:00:39Z : No. of bitstreams: 1 000756870.pdf: 4401994 bytes, checksum: 3fa324e27d9b06c347fb1e60c3086526 (MD5) / Espécies invasoras são altamente eficientes na competição por recursos, tem alta capacidade reprodutiva e de dispersão, o gênero Cichla é exemplo dessas características. Os espécimes desse gênero são amplamente utilizados no controle de espécies exóticas com alta prolificidade, além de sua indiscutível importância na alimentação humana e na pesca esportiva. No presente trabalho foi estudada a diferenciação cromossômica e genética entre as espécies Cichla kelberi e Cichla piquiti e seus prováveis híbridos naturais. Foram utilizadas técnicas citogenéticas e moleculares de PCR multiplex e PCR-­‐RFLP com genes nucleares e mitocondriais e, posteriormente, tais marcadores foram aplicados em exemplares coletados em reservatórios dos rios Paraná e Tietê, SP. As técnicas citogenéticas foram realizadas para exemplares coletados no rio Tietê, município de Uru, enquanto que para o estabelecimento e aplicação dos marcadores moleculares foram utilizadas amostras de ambas localidades, rio Paraná (Uru) e rio Tietê (Rubineia, Pauliceia e Ilha Solteira). Os resultados citogenéticos indicam uma conservação cariotípica entre as espécies Cichla kelberi e Cichla piquiti, tais espécies apresentam numero diploide de 2n=48 cromossomos do tipo acrocêntrico, região organizadora de nucléolo localizado no par 2 e heterocromática constitutiva em regiões centroméricas. Além disso, os genes ribossomais estão localizados nos mesmos pares cromossômicos para ambas as espécies, sendo o 5S DNAr localizado no terceiro par cromossômico, em posição intersticial, e 18S DNAr corroborando com as marcações da NOR. Já nas análises moleculares, foram estabelecidas diferenças genômicas entre as espécies C. kelberi e C. piquiti, que permitiram o estabelecimento de marcadores de eficiente aplicabilidade para diferenciação das duas espécie, fato confirmado pela aplicação dos mesmos em exemplares de quatro localidades do ... / Some invasive species are highly efficient in resource competition, have high reproductive capacity and dispersal, the genus Cichla exemplifies these characteristics. The specimens of this genus are widely used to control exotic species with high prolificacy, beyond its undeniable importance in food and sport fishing. In the present study, the chromosomal and genetic differentiation between species Cichla kelberi and Cichla piquiti and its likely natural hybrids. We used cytogenetic techniques and molecular markers PCR multiplex and PCR-­‐RFLP with nuclear and mitochondrial genes and, subsequently, the markers were applied to specimens collected in rivers Parana and Tiete in São Paulo. The cytogenetic techniques were performed for samples collected from the river Tiete, Uru city, while for the establishment and application of molecular markers were used samples of both cities, river Parana (Uru) and river Tiete (Rubineia, Pauliceia e Ilha Solteira). The cytogenetic results indicate a karyotype conservation between species Cichla piquiti and Cichla kelberi such species have diploid number of 2n=48 chromosomes acrocentric type, located nucleolus organizer regions in the pair 2 and constitutive heterochromatic centromeric regions. Furthermore, ribosomal genes are located on the same chromosome pairs for both species, but the 5S rDNA located on the third chromosome pair in interstitial position, and 18S rDNA corroborating markings NOR. Already in the molecular analysis, genomic differences were established between the species C. kelberi and C. piquiti, which allowed the establishment of efficient applicability markers for differentiation of the two species and in different populations, a fact confirmed by applying the same samples from four locations in the state of São Paulo. Furthermore, such genetic markers indicate that the samples identified as hybrid individuals of the species C. kelberi and C. piquiti are actually ...

Resumo: As redes neurais artificiais têm sido aplicadas com sucesso em diversos problemas de análise exploratória de dados multivariados relacionados à ecologia. Todavia, poucos são os trabalhos utilizando a rede de Kohonen (mapas auto-organizáveis) para classificação de padrões de dados ecológicos. A dificuldade encontra-se na obtenção de um conjunto adequado de dados para o treinamento e validação da rede. Para o desenvolvimento deste trabalho foram utilizados dados obtidos no projeto "Estudos ictiológicos na área de influência do AHE Corumbá" pelo Núcleo de Pesquisas em Limnologia, Ictiologia e Aqüicultura (Nupélia), Universidade Estadual de Maringá (UEM) em convênio com FURNAS Centrais Elétricas S.A. Este trabalho utiliza a rede de Kohonen como uma metodologia para a classificação das espécies de peixes em categorias tróficas do reservatório de Corumbá - GO, de acordo com a dieta, envolvendo duas fases distintas: fase rio (anterior ao represamento), com a classificação de 1845 estômagos de 33 espécies de peixes, e a fase reservatório (posterior ao represamento), com a classificação de 5492 estômagos de 36 espécies de peixes. As classificações foram obtidas nas duas fases distintamente, resultando em ambas, em uma separação de dois grandes grupos: o dos generalistas e o dos especialistas. Os peixes especialistas foram divididos em quatro grupos: insetívoros, herbívoros, piscívoros e detritívoros. Os insetívoros apresentaram um grande número de espécies, sendo necessário modelar uma nova rede, visando a separação desta categoria, em quatro sub-grupos. A rede de Kohonen mostrou-se uma ferramenta robusta para a classificação dos dados, apresentando resultados rápidos, com uma clara visualização dos agrupamentos, facilitando sobremaneira a interpretação dos resultados.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-04-24Bitstream added on 2014-06-13T20:49:34Z : No. of bitstreams: 1 marinho_mmf_me_sjrp.pdf: 3133191 bytes, checksum: 7a51120394b1ba242ef0041ee624eba1 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O gênero Moenkhausia, incertae sedis em Characidae, inclui 65 espécies nominais, e é provavelmente polifilético, embora possa conter agrupamentos naturais. O grupo Moenkhausia lepidura (sensu Géry, 1992) compreende as espécies que apresentam o lobo superior da nadadeira caudal negro ou escuro: M. gracilima, M. hasemani, M. hysterosticta, M. icae, M. inrai, M. lata, M. lepidura e M. loweae. A análise filogenética realizada contou com 44 táxons terminais e 87 caracteres osteológicos e de morfologia externa, e reconhece o grupo Moenkhausia lepidura como monofilético, sustentado por três sinapomorfias: vertical que passa pela extremidade anterior do sexto infra-orbital alinhada ou anterior ao limite do segundo e terceiro infra-orbitais; mácula na nadadeira caudal restrita ao lobo superior; mácula do lobo superior da nadadeira caudal no terço posterior do lobo, e raios medianos hialinos. As oito espécies já descritas para o grupo M. lepidura são revisadas, e são descritas mais oito novas espécies, distribuídas pelas bacias Amazônica, das Guianas e bacia do alto rio Paraná. Gymnotichtys hildae pertence ao grupo Moenkhausia lepidura e Moenkhausia lepidura ocoae não / Moenkhausia is an incertae sedis genus in Characidae, consisting of 65 valid species, and is probably polyphyletic, although it may contain natural agroupments. The Moenkhausia lepidura group species (sensu Géry, 1992) comprisis those species with a gray or black spot on the upper caudal-fin lobe: M. gracilima, M. hasemani, M. hysterosticta, M. icae, M. inrai, M. lata, M. lepidura and M. loweae. The phylogenetic analysis with 44 taxa and 87 osteological and morphological characteres recognizes the Moenkhausia lepidura group as a monophyletic assemblage, supported by three sinapomorphies: vertical through anterior limit of sixth infraorbital alligned or anteriorly to limit between second and third infraorbitals; caudal-fin mark restricted to upper caudal-fin lobe; caudal-fin mark at posterior third of upper caudal-fin lobe and median caudal-fin rays hialine. Eight species recognized to Moenkhausia lepidura group are redescribed, and other eigth new species are described, widespread throughout Amazonas, Guianas and upper Paraná drainages. Gymnotichtys hildae belongs to Moenkhausia lepidura group, and Moenkhausia lepidura ocoae do not

Orientador: Fábio Porto Foresti / Coorientador: Daniela Cristina Ferreira / Banca: Diogo Teruo Hashimoto / Banca: Rosicleire Veríssimo Silveira / Resumo: Espécies invasoras são altamente eficientes na competição por recursos, tem alta capacidade reprodutiva e de dispersão, o gênero Cichla é exemplo dessas características. Os espécimes desse gênero são amplamente utilizados no controle de espécies exóticas com alta prolificidade, além de sua indiscutível importância na alimentação humana e na pesca esportiva. No presente trabalho foi estudada a diferenciação cromossômica e genética entre as espécies Cichla kelberi e Cichla piquiti e seus prováveis híbridos naturais. Foram utilizadas técnicas citogenéticas e moleculares de PCR multiplex e PCR-­‐RFLP com genes nucleares e mitocondriais e, posteriormente, tais marcadores foram aplicados em exemplares coletados em reservatórios dos rios Paraná e Tietê, SP. As técnicas citogenéticas foram realizadas para exemplares coletados no rio Tietê, município de Uru, enquanto que para o estabelecimento e aplicação dos marcadores moleculares foram utilizadas amostras de ambas localidades, rio Paraná (Uru) e rio Tietê (Rubineia, Pauliceia e Ilha Solteira). Os resultados citogenéticos indicam uma conservação cariotípica entre as espécies Cichla kelberi e Cichla piquiti, tais espécies apresentam numero diploide de 2n=48 cromossomos do tipo acrocêntrico, região organizadora de nucléolo localizado no par 2 e heterocromática constitutiva em regiões centroméricas. Além disso, os genes ribossomais estão localizados nos mesmos pares cromossômicos para ambas as espécies, sendo o 5S DNAr localizado no terceiro par cromossômico, em posição intersticial, e 18S DNAr corroborando com as marcações da NOR. Já nas análises moleculares, foram estabelecidas diferenças genômicas entre as espécies C. kelberi e C. piquiti, que permitiram o estabelecimento de marcadores de eficiente aplicabilidade para diferenciação das duas espécie, fato confirmado pela aplicação dos mesmos em exemplares de quatro localidades do ... / Abstract: Some invasive species are highly efficient in resource competition, have high reproductive capacity and dispersal, the genus Cichla exemplifies these characteristics. The specimens of this genus are widely used to control exotic species with high prolificacy, beyond its undeniable importance in food and sport fishing. In the present study, the chromosomal and genetic differentiation between species Cichla kelberi and Cichla piquiti and its likely natural hybrids. We used cytogenetic techniques and molecular markers PCR multiplex and PCR-­‐RFLP with nuclear and mitochondrial genes and, subsequently, the markers were applied to specimens collected in rivers Parana and Tiete in São Paulo. The cytogenetic techniques were performed for samples collected from the river Tiete, Uru city, while for the establishment and application of molecular markers were used samples of both cities, river Parana (Uru) and river Tiete (Rubineia, Pauliceia e Ilha Solteira). The cytogenetic results indicate a karyotype conservation between species Cichla piquiti and Cichla kelberi such species have diploid number of 2n=48 chromosomes acrocentric type, located nucleolus organizer regions in the pair 2 and constitutive heterochromatic centromeric regions. Furthermore, ribosomal genes are located on the same chromosome pairs for both species, but the 5S rDNA located on the third chromosome pair in interstitial position, and 18S rDNA corroborating markings NOR. Already in the molecular analysis, genomic differences were established between the species C. kelberi and C. piquiti, which allowed the establishment of efficient applicability markers for differentiation of the two species and in different populations, a fact confirmed by applying the same samples from four locations in the state of São Paulo. Furthermore, such genetic markers indicate that the samples identified as hybrid individuals of the species C. kelberi and C. piquiti are actually ... / Mestre

Orientador: Francisco Langeani / Banca: Valdener Garutti / Banca: Katiane Mara Ferreira / Resumo: O presente trabalho tem como objetivo geral um estudo taxonômico do gênero Astyanax Baird & Girard, no Sistema do Alto Paraná. Objetivos Específicos: 1) análise dos exemplares de Astyanax provenientes do alto Paraná e drenagens vizinhas; 2) diagnose das espécies identificadas; 3) redescrição das espécies do alto Paraná; 4) descrição de novas espécies. Foi realizada análise em exemplares das espécies Astyanax sp.1, Astyanax sp.2, A. altiparanae, A. biotae, A.bockmanni, A.sp. aff. fasciatus, A. paranae e A. schubarti, que estão depositados nas coleções do DZSJRP, MNRJ, MZUSP, MZUEL, MHNCI e NUPELIA. Dezoito contagens e quinze medidas foram analisadas, segundo Fink & Weitzman (1974), com algumas modificações. A comparação entre as espécies envolveu análise estatística básica das proporções corporais sobre o CP e CC, e contagens. Dados morfométricos com grande sobreposição foram submetidos à análise discriminante canônica livre do tamanho (MANOVA/CVA). Foram reconhecidas nove espécies existentes no Sistema do Alto rio Paraná, e estão sendo descritas as espécies Astyanax sp.1 e Astyanax sp.2. Astyanax sp.1 é diagnosticada por apresentar concentração de cromatóforos na margem da escama formando padrão "listrado" longitudinal regular, pelo diâmetro orbital 6,4-8,3% no CP, por possuir 16-20 raios ramificados na nadadeira anal, por possuir 5 séries longitudinais de escamas acima da linha lateral. Astyanax sp.2 é diagnosticada por possuir concentração de cromatóforos entre séries de escamas formando um padrão de "zigue-zague" longitudinal regular; por apresentar nos machos, ganchos em todos os raios da nadadeira anal; pelo comprimento da base da nadadeira anal 20,7-24,7% no CP; por possuir 11-12 séries de escamas ao redor do pedúnculo caudal; por possuir 4-5 séries de escamas longitudinais abaixo da linha lateral e diâmetro orbital 8,6-12,3% no CP. / Mestre