Orientadores: Carmen Silvia Passos Lima, Claudio Saddy Rodrigues Coy / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-12T04:46:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Angelo_SandroNunes_M.pdf: 2804773 bytes, checksum: b88b1fbf49effea5eae1bf248bc95389 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: A exposição das células do cólon e do reto a substâncias carcinogênicas está associada ao consumo de alimentos que constituam fonte de substratos, como aminas aromáticas e hidrocarbonetos aromáticos policiclícos. Enzimas como a mono-oxigenase do citocromo P450, codificada pelo gene CYP1A1 e a N-acetiltransferase, codificada pelo gene NAT1, estão relacionadas com o metabolismo dessas substâncias. Os polimorfismos T6235C e A4889G, do gene CYP1A1, e o haplótipo NAT1*10, do gene NAT1, foram associados ao risco do câncer colorretal (CC) em indivíduos do hemisfério norte. Não há descrições sobre as influências desses polimorfismos no risco do CC em nossa população, sendo este o objetivo do estudo. O DNA de 254 pacientes com adenocarcinoma colorretal esporádico (ACE) e 255 controles foi analisado por meio da reação em cadeia da polimerase e digestão enzimática. Foi avaliado também, o padrão dietético de pacientes e controles por meio do recordatório de freqüência alimentar. Houve risco maior de ocorrência do ACE em indivíduos com os genótipos variantes dos polimorfismos T6235C e A4889G do gene CYP1A1 e com consumo excessivo de carnes. A frequência do haplótipo NAT1*10 foi maior em pacientes do que em controles, havendo risco maior de ocorrência do ACE nesses indivíduos. Maior risco de ocorrência da doença foi também observado em indivíduos com os haplótipos NAT1*10 do gene NAT1 e consumo excessivo de carnes e escasso de verduras e frutas. Os resultados deste estudo sugerem que as vias herdadas do metabolismo de carcinógenos, CYP1A1 e NAT1, associadas ao padrão da dieta influenciam o risco de ocorrência do ACE em nosso meio. / Abstract: The exposure of the cells of the colon and rectum to carcinogenic substances is associated with the consumption of foods that are source of substrates, such as aromatic amines and polycyclic aromatic hydrocarbons. Enzymes such as cytochrome P450 monooxygenase, encoded by the CYP1A1 gene, and acetyltransferase, encoded by the NAT1 gene, are related to the metabolism of these substances. T6235C and A4889G polymorphisms, of the CYP1A1 gene, and NAT1*10 haplotype of the gene NAT1 were associated with incidence of colorectal cancer (CC). There are no descriptions about the influences of these polymorphisms on the risk for the CC in our population, which is the objective of the study. DNA from 254 sporadic colorectal adenocarcinoma (SCA) patients and 255 controls were analysed by polymerase chain reaction and restriction digestion. It was also assessed the dietary pattern pacients and controls through the recall of food frequency. There was a greater risk of the occurrence of SCA in individuals with the variant genotypes of the T6235C and A4889G polymorphisms, of the CYP1A1 gene, associated with high consumption of meat. The frequency of the NAT1*10 haplotype was greater in pacients than in controls, with increased risk of occurrence of SCA these individuals. Increased risk of occurrence of the disease was also observed in individuals with NAT1*10 haplotype of the gene NAT1 and excessive consumption of meat and little vegetables and fruits. The results of the study suggest that the pathaway inherited from the metabolism of carcinogens, CYP1A1 and NAT1, associated with the pattern of diet influences the risk of occurrence of SCA in our country. / Mestrado / Cirurgia / Mestre em Cirurgia

Orientador : Jose Francisco Hofling / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-03T10:51:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bernardo_WagnerLuisdeCarvalho_M.pdf: 2429332 bytes, checksum: a7ff41b9ee08009e5e89f77a870775ef (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Nos últimos anos, ocorreu um grande aumento na incidência de infecções hospital-associadas (nosocomiais). Dentre as espécies bacterianas, o Staphylococcus aureus tem merecido uma atenção especial, tanto pela importância da sua disseminação, quanto por sua resistência a diversos tipos de antimicrobianos. Por sua vez, o ambiente clínico odontológico possui um alto índice de contaminação bacteriana, incluindo o S. aureus, sendo assim, o objetivo dessa pesquisa foi detectar o polimorfismo genético de Staphylococcus aureus resistentes a antimicrobianos, obtidos na clínica odontológica. Para tanto, foram realizadas 24 coletas. As linhagens foram identificadas pelo Gram, catalase, coagulase e meio cromogênico. Após a identificação as mesmas foram submetidas ao teste de susceptibilidade antimicrobiana, a análise plasmidial e ao MLEE. Foram identificadas 44 linhagens de S. aureus, desses 80% foram resistentes ao antibiótico ampicilina e todas foram oxacilina sensíveis - OSSA. Na análise plasmidial foram detectados três agrupamentos de diferentes perfis plasmidiais. O estudo do perfil enzimático mostrou a presença de agrupamentos clonais entre os isolados. Os dados obtidos demonstraram a disseminação das linhagens de S. aureus resistentes no ambiente odontológico. A análise plasmidial sugere que essa resistência está relacionada ao cromossomo (DNA) e a análise dos perfis enzimáticos revelou o polimorfismo genético de S. aureus isolados dentro desse ambiente / Abstract: In the last years, an increase occurred in the incidence of hospital-associated infections. Among the bacterial species, Staphylococcus aureus has deserved a special attention, so much for the importance of spread, as for resistance to several antibiotics. For this time, the dental clinical possesses a high index of bacterial contamination, including the S. aureus. The objective of that research was to detect the genetic polymorphism of Staphylococcus aureus resistant, obtained in the dental clinic. Twenty-four collections were accomplished. The lineages were identified for Gram, catalase, coagulase and chromogenic medium. After the identification, the microorganisms were submitted to the test of antibiotic susceptibility, the plasmidial analysis and to MLEE. They were identified 44 lineages of S. aureus, 80% they were resistant to ampicillin and 100% oxacillin sensitive - OSSA. In the plasmidial analysis, three clusters were formed of different plasmidial profiles. The study of the enzymatic profile showed the formation of groupings of clones among the isolates. The spread of lineages of S. aureus resistant was observed in the dental clinic. The analysis plasmidial suggests that that resistance is related to the chromosome and analysis of the enzymatic profiles detected the genetic polymorphism of S. aureus isolated inside of that environment / Mestrado / Microbiologia e Imunologia / Mestre em Biologia Buco-Dental

Orientador : Louis Bernard Klaczko / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T11:39:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hatadani_LucianeMendes_M.pdf: 2798259 bytes, checksum: dada168e247352190d71ed17ddc04914 (MD5) Previous issue date: 2002 / Mestrado

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:05:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6275_1.pdf: 1470797 bytes, checksum: aa39f70d5f235c59d832a639818d2235 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / Microssatélites localizados na região não recombinante do cromossomo Y (NRY) são amplamente utilizados em estudos forenses e populacionais. Neste trabalho foi feita a análise do polimofismo e da taxa de mutação de 15 microssatélites do cromossomo Y (haplótipo mínimo mais DYS447, DYS458, DYS464) numa amostra da população de Alagoas constituída por 255 duplas pai/filho. Foi observado um total de 230 haplótipos diferentes dos quais 207 ocorreram apenas uma vez. Através da análise de pais e filhos foram detectadas mutações em oito das 3.825 transmissões alélicas analisadas, com uma taxa de mutação média estimada em 2,092 × 10-3. O haplótipo mínimo mais comum ocorreu 16 vezes e é também o haplótipo mais comum entre caucasianos das populações do Rio de Janeiro e São Paulo bem como nas populações européias do sul de Portugal, Madri (Espanha) e Ligúria (Itália). O haplótipo mínimo mais comum das populações Yanomami, Bantu e de Moçambique não foi encontrada nenhuma vez na amostra analisada

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:07:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6431_1.pdf: 2698215 bytes, checksum: a981aeedf0d1c3872e4acc49f107e686 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2003 / Paecilomyces variotii Bainier é um fungo sapróbio, isolado do solo de diversos substratos das regiões áridas e quentes, sendo um dos primeiros organismos a colonizar o solo e sua participação é observada em processos de compostagem. Atua na deterioração de vários substratos, na produção de ácidos e antibióticos, além de proteínas úteis na alimentação. Capaz de produzir doenças por ser oportunista, P. variotii vêm preocupando devido aos problemas que causa aos imunodeprimidos, apresentando resistência para alguns antibióticos. Pouco se conhece sobre a genética deste fungo. O emprego de marcadores moleculares constitui uma importante ferramenta no estudo da variabilidade genética de um fungo anamorfo, pois auxilia na caracterização e seleção de linhagens, permitindo a inclusão dessas em processos de melhoramento genético de espécies fúngicas. O objetivo deste trabalho foi submeter dez linhagens de P. variotii de regiões, décadas de preservação e substratos diferentes à técnica RAPD para análise de sua variabilidade genética

Orientador: Mohamed E. M. Habib / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-15T04:12:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paleari_LuciaMaria_M.pdf: 6962566 bytes, checksum: c6e4ce0036b429c6b4de1cc107053303 (MD5) Previous issue date: 1987 / Resumo: Agonosoma flavolineatum (Hemiptera, Scutellerinae), é uma espécie policromática e fitófaga, cujas fêmeas apresentam três fenótipos distintos, sendo um deles comum ao macho. Essas várias colorações dos indivíduos, são semelhantes às de outras espécies do gênero, o que tem levado a problemas na classificação e identificação das espécies. Uma revisão do gênero foi feita na tentativa de esclarecer as denominações das espécies, caracterizando-as através dos padrões de coloração, e de algumas estruturas como antenas e esternitos. No caso específico de A. flavolineatum, a caracterização foi reforçada com os estudos de biologia e do cariótipo da espécie, que possui 10 autossomos e um par de cromossomos sexuais, sendo o macho o sexo heterogamético XY. Como acontece com muitos pentatomídeos, esses cromossomos são do tipo que não apresenta centrômero localizado. De acordo com os critérios utilizados foram propostas 4 espécies para o gênero: A. flavolineatum, A. trillineatum, A. bicolor e A. dohrni. Os estudos de biologia de A. flavoloneatum demonstraram que os machos acasalam-se indistintamente com fêmeas dos diferentes padrões tendo em todos os casos, descendentes férteis. Sob médias mensais de temperatura e Umidade Relativa do ar que variaram de '18,6 GRAUS¿C a '27,4 GRAUS¿C e 57,7% a 70,8%, respectivamente, a duração média em dias, + o erro padrão, do ciclo de vida das fêmeas foi de 156,90¿+ OU ¿'10,74, e dos machos de 166,08¿+ OU ¿'10,62 dias, com intervalos de 59 a 392 e 91 a 354 dias, respectivamente. ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Agonossoma flavolineatum (Hemiptera, Scutellerinae), is a polychromatic and phytophagous specie, whose females show three distinct phenotypes, and only one of them is similar to that of the male. These differentiation on color among the individuaIs, are analogous to other species of the same genus resulting in problems for classification and identification. A revision of the genus was made in order to clarify the species denomination, characterizing them throw the coloration patterns, and throw some other structures like antennae and sternites. In the specific case of A. flavolineatum, the characterization was reforced by biological studies and species cariotype, which has 10 autosomes and a par of sexuaI chromosomes, being the male the heterogametic XY sex. How lt's usual to happen with several pentatomides, these chromosomes are of the type that doesn't present a localized centromer. According to the utilized criteria, 4 species were proposed for the genus: A. flavolineatum, A. trilineatum, A. bicolor, and A. dohrni. The biological studies of A. flavolineatum showed that males couple with the different female patterns, having in all cases, fertile offspring. Under monthly temperature and relative air humidity means that change between '18,6 DEGREES¿C and '27,4 DEGREES¿C, and 57,7% and 70,8% respectIvely, the medium duration, 10 days more or less the standard deviation of the female life cycles were found to be 156,9 '+ OU ¿' 10,74, and the males 166,08 '+ OU ¿' 10,62 days, with intervals of 59 to 392 days and 91 to 354 days, respectively. ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ciências Biológicas

Memoria para optar al título de Químico Farmacéutico / Ciclosporina (CsA) es un fármaco inmunosupresor utilizado para prevenir el rechazo de órganos en pacientes trasplantados. Sin embargo, esta droga se caracteriza por poseer un rango terapéutico estrecho y una alta variación farmacocinética inter- e intra-individual por lo cual se recomienda monitorear este medicamento constantemente para prevenir efectos adversos. Por lo tanto, entender la variabilidad farmacocinética de CsA es de crucial importancia para maximizar los resultados clínicos de los pacientes trasplantados de órganos. En este estudio se investigaron variantes genéticas involucradas en la metabolización y transporte de CsA que pueden afectar la farmacocinética de este fármaco. Para esto, pacientes trasplantados renales fueron genotipificados para CYP3A4*1B, CYP3A5*3, MDR1 3435 C>T y MDR1 2677 G>T/A mediante PCR-RFLP. Los genotipos obtenidos fueron relacionados con efectos adversos, episodios de rechazo y concentraciones C2 ajustadas de CsA. También se estudió la influencia de estos genotipos en la dosis administrada diaria de CsA y los niveles de creatinina. Los resultados mostraron una asociación entre el polimorfismo CYP3A5*3 y las concentraciones C2 ajustadas en los primeros días del tratamiento. Sin embargo, con el resto de los polimorfismos no se observaron asociaciones estadísticas significativas. Similarmente, al evaluar la influencia de los genotipos en la dosis diaria de CsA, sólo CYP3A5*3 demostró asociación. En cuanto a los episodios de rechazo se encontraron asociaciones en el gen MDR1, en el cual la variante alélica corresponde a un factor de riesgo ante estos episodios. Para los análisis de los efectos adversos y creatinina, no se encontraron asociaciones para ningún polimorfismo. En conclusión, en este estudio se encontró que posiblemente el polimorfismo CYP3A5*3 estaría relacionado a la respuesta farmacocinética de CsA, y el gen MDR1 estaría ligado al rechazo del órgano. Mientras tanto, como proyección se propone investigar polimorfismos adicionales que puedan clarificar el aporte de los otros genes. Además, aumentar el número de pacientes e incluir factores no genéticos y/o epigenéticos nos entregaría una respuesta más completa a la variabilidad farmacocinética de este inmunosupresor / Cyclosporine (CsA) is an immunosuppressive drug used to prevent allograft rejection. However, it is characterized by a narrow therapeutic index and high inter and intra individual pharmacokinetics variations. Thus, monitoring of this drug is highly recommended in order to prevent adverse effects. Therefore, understanding the pharmacokinetic variations of CsA is a crucial to maximize clinical outcomes in transplanted patients. In this study we investigated genetics variants involved in the metabolism and transport of CsA which could affect the pharmacokinetics of the drug. For this purpose, renal transplanted patients were genotyped for CYP3A4*1B, CYP3A5*3, MDR1 3435 C>T and MDR1 2677 G>T/A genes through PCR-RFLP. Afterwards, genotypes were correlated with adverse effects, rejection episodes and dose-adjusted C2 CsA levels in order to establish potential associations. Also, was studied the influence of this genotypes on the daily dose of CsA and creatinine levels. The results showed statistical association between CYP3A5*3 polymorphism and doseadjusted C2 CsA levels at the first post-transplant days, whereas no association were observed for CYP3A4*1B, MDR1 3435 C>T and MDR1 2677 G>T/A. Similarly, only CYP3A5*3 showed association with daily dose of CsA. Regarding to rejection episodes, the allelic variant of MDR1 gen was observed as a risk factor. On the other hand, when adverse effects and creatinine levels were analyzed no correlations were observed for any polymorphisms. In conclusion, in this study was found that CYP3A5*3 is possibly associated to CsA pharmacokinetics variation and MDR1 gen is related to rejection episodes. However, it is proposed to investigate additional polymorphisms which could clarify the contribution of other genes besides CYP3A5. Additionally, the number of patients needs to be increased to have higher statistical power. Finally, non- genetic and/or epigenetic factors must be incorporated to the study in order to have a more complete response on the variability of CsA

Orientador: Antonio Sergio Ramalho / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-24T04:22:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Silva_IaraDuchovni_D.pdf: 5750673 bytes, checksum: 67b0d413b6aafc2f92c4f2138b0f51d6 (MD5) Previous issue date: 1998 / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural

Tese (livre-docencia) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-07-16T11:30:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ramalho_AntonioSergio_LD.pdf: 2665179 bytes, checksum: 02b4274c0a48383e7bbe17550cb87f01 (MD5) Previous issue date: 1978 / Resumo: As preocupações primordiais dos geneticistas em relação aos polimorfismos genéticos da espécie humana têm sido, como comenta BEIGUELMAN (1977), a investigação dos mecanismos homeostáticos que os mantém, a análise da sua distribuição em diferentes populações e a sua utilização como marcadores genéticos, sendo muito pequena a ênfase que dão ao estudo daqueles cuja importância clínica é incontestável. Ao contrário do que ocorre em muitos países do Hemisfério Norte, esse menor interesse dos geneticistas pelos polimorfismos genéticos de importância clínica não é compensado, em nosso meio, pelas investigações de pesquisadores médicos dedicados ao assunto. Tendo em vista essa situação e as peculiaridades das populações do Estado de são Paulo, que permitem a coexistência em um mesmo território de polimorfismos genéticos limitados a grupos étnicos diversos, o autor julgou oportuno criar, no Departamento de Genética Médica da Faculdade de Ciências Médicas da Universidade Estadualde Campinas, uma Unidade de Hemoglobinopatias e Enzimopenias Hereditárias, integrada aos demais Serviços do Hospital de Clínicas da referida Faculdade. Essa Unidade, composta por um ambulatório e por um laboratório especializado. Foi estruturada com finalidades assistenciais, didáticas e de pesquisa, com o objetivo primordial de estudar, do ponto de vista médico, os polimorfismos genéticos importantes nas populações brasileiras. Para tanto, esse setor do Departamento de Genética Médica dirigiu as suas atenções para o estudo clínico de duas heredopatias reconhecidamente freqüentes em nossas populações, ou seja, do traço siclêmico e da Deficiência de G6-PD, e praticamente iniciou, no Brasil, o estudo do traço talassêmico beta e da deficiência de acetiltrasferase hepática. (continua...) / Abstract: Not informed / Tese (livre-docencia) - Univer / Professor Livre Docente

El gen TP53 codifica una proteína de 53 kDa con importante función reguladora en procesos celulares como la proliferación, muerte celular y preservación del material genético. Polimorfismos de este gen presentan una alta diversidad en la distribución de las frecuencias alélicas entre grupos étnicos y han sido relacionados con la susceptibilidad al cáncer. Utilizando la técnica de PCR-RFLP, se determinó las frecuencias alélicas de los polimorfismos intrón 3, intrón 6 y codón 72 en 58 estudiantes de la UNMSM (Lima) y 37 de la Universidad José Faustino Sánchez Carrión (Huacho). Se estimó la frecuencia génica y genotípica con el programa estadístico SPSS 11.5; y con el programa Arlequín versión 3.5, a través del índice de Nei, se estableció el grado de diferenciación genética entre ambas poblaciones al considerar el intrón 3, intrón 6 y codón 72, que resultó 1.793, 1.141 y 0.323 respectivamente. Ambas poblaciones están en equilibrio de Hardy-Weinberg (p>0.05) para los tres polimorfismos. En el codón 72, la frecuencia alélica para prolina resultó 30.1 % en la muestra de Lima y 29.7 % en la muestra de Huacho. La frecuencia del alelo para la arginina fue 69,8% para Lima y 70,2% en la de Huacho. Con relación al intrón 6, la frecuencia alélica para W en la de Lima fue 98.2 % y 81 % en la de Huacho. En contraste con el alelo M se obtuvo una frecuencia alélica de 1.7 % para la población estudiada de Lima y 18.9 % en la de Huacho. De otro lado, para el intrón 3 la frecuencia alélica W fue 94.6 % para Lima y 90 % para Huacho. En cambio la frecuencia alélica para M en los de Lima fue de 5.3 % y 10 % en los de Huacho. Se destaca el predominio del alelo Arg en el codón 72 para ambas poblaciones analizadas; así como el alelo W tanto en el intrón 6 como en el intrón 3. La comparación con las frecuencias alélicas de origen africano y asiático reveló diferencias estadísticamente significativas (p>0.001); sin embargo, se, observó una similitud con las poblaciones amerindias y caucásicas. PALABRAS CLAVE: gen TP53, polimorfismo Arg72Pro, intrón 6, intrón 3, poblaciones peruanas / --- The TP53 gene encodes a protein of 53 kDa with important regulatory role in cellular processes such as proliferation, cell death and preservation of genetic material. Polymorphisms of this gene have a high diversity in the distribution of allele frequencies between ethnic groups and have been linked to cancer susceptibility. By studying PCR-RFLP, was determined the allele frequencies of the polymorphisms, intron 3, intron 6 and codon 72 in 58 students of the University of UNMSM (Lima) and 37 at the University of Jose Faustino Sanchez Carrion. The Allelic and genotypic frequency was measured with the SPSS 11.5 statistical program; and with the Arlequin program ver. 3.5, through Nei index, was established the degree of genetic differentiation between the two populations by considering the intron 3, intron 6 and codon 72, which resulted in 1.793, 1.141 and 0.323 respectively. Both populations are in Hardy-Weinberg equilibrium (p> 0.05) for the three polymorphisms. At codon 72, the allele frequency for proline was 30.1 % in the sample of Lima and 29.7 % in the sample of Huacho. The allele frequency for arginine was 69.8 % for Lima and 70.2 % in Huacho. Regarding the intron 6, the allele frequency for W in Lima was 98.2 % and 81 % in Huacho. In contrast for the M was obtained an allelic frequency of 1.7 % for the studied population of Lima and 18.9 % in Huacho. On the other hand, for the intron 3 the allele frequency for W was 94.6 % for Lima and 90 % in Huacho. In contrast, the allele frequency for M in Lima was 5.3 % and 10 % in Huacho. The dominance of the Arg allele at codon 72 for both populations analyzed is highlighted; and the W allele both intron 6 and intron 3; and the W allele both intron 6 and intron 3. The comparison of allele frequencies of African and Asian descent revealed statistically significant differences (p <0.001); however, was observed a similarity with American and Caucasian populations. KEY WORDS: TP53 gene polymorphism Arg72Pro, intron 6, intron 3, Peruvian populations / Tesis