Made available in DSpace on 2014-06-12T15:03:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4377_1.pdf: 7022466 bytes, checksum: ddcd0ae8a9c48ea3d7bc2290ffa19a0c (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2000 / Quinze isolados de Fusarium oxysporum f.sp. passiflorae provenientes do nordeste do Brasil foram analisados quanto a sua variabilidade genética utilizando a técnica de RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) e em termos de características morfofisiológicas. Os isolados foram obtidos da Micoteca-URM do Departamento de Micologia/UFPE, Recife-PE. Na primeira etapa deste trabalho, foram observadas as características morfológicas (coloração e aspecto da colônia) e fisiológicas (crescimento e taxa de crescimento micelial dos isolados), utilizando-se dois meios de cultura, o BDA e o CZA. As características micromorfológicas também foram observadas, após microcultivos, utilizando o meio BDA. Os resultados obtidos, indicaram que houve maior variação no crescimento e também na expressão da coloração micelial dos isolados colonizados em meio BDA. As amostras apresentaram uma variação significativa em relação as taxas de crescimento entre os meios CZA e BDA. Para a investigação do polimorfismo de DNA dos isolados utilizando-se a técnica de RAPD, foram testados 57 primers dos quais quatro foram selecionados considerando-se a geração de bandas mais fortes, mais definidas e em maior número. Os primers selecionados geraram um total de 448 bandas, permitindo a construção de uma matriz de similaridade. Observou-se elevado polimorfismo genético, pois pelo menos uma banda não estava presente em todas as amostras não havendo presença de bandas monomórficas. O coeficiente médio de similaridade obtido para todas as amostras foi de 0.62 (62%). O dendrograma gerado a partir dos dados da matriz revelou uma alta variabilidade genética entre os isolados, pertencentes a mesma formae specialis. Aparentemente, não existe correlação entre a taxa de crescimento micelial e agrupamento dos isolados no dendrograma

Orientador: Carmen Silvia Passos Lima / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas. Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-16T03:51:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Scherr_MarcelaCustodio_M.pdf: 1746928 bytes, checksum: 1590f1bcf4c880aa0dbd063756c2c777 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: A habilidade de metabolizar xenobióticos é variável em humanos e em cães e está relacionada a genótipos distintos de genes polimórficos. Os portadores do genótipo CYP1A2 1117TT foram classificados como metabolizadores lentos de fármacos. Ainda, os alelos variantes T e C dos polimorfismos CYP1A2 C1117T e GSTA3 I71L foram descritos como menos eficazes na ativação e inativação de carcinógenos do que os selvagens, respectivamente. Assim, humanos e cães podem apresentar diferentes respostas a medicamentos e estar sob riscos distintos de ocorrência de tumores. As frequências dos genótipos dos polimorfismos CYP1A2 C1117T e GSTA3 I71L em cães de diferentes raças e sem raça definida (SRD) não foram ainda descritas. O objetivo deste estudo foi o de identificar as frequências dos genótipos em 105 cães da raça boxer, 84 cães da raça rottweiler, 110 cães da raça pastor alemão e 99 animais SRD, para verificar se ocorre distribuição distinta de genótipos em animais de diferentes grupos. O genótipos foram identificados por amplificação das regiões gênicas de interesse, em amostras de sangue periférico, por meio da reação em cadeia da polimerase seguida por sequenciamento ou digestão enzimática dos fragmentos amplificados. A frequência do genótipo homozigoto selvagem CC do polimorfismo CYP1A2 C1117T foi maior em cães de raça (96,4% versus 87,9%, P= 0,002) e boxers (98,0% versus 87,9%, P= 0,005) do que em cães SRD. Frequências genotípicas similares foram observadas em cães estratificados por aspectos clínicos. Apenas o genótipo variante CC do polimorfismo GSTA3 I71L foi identificado em nossos cães. Nossos resultados sugerem que cães de raça metabilizam fármacos e ativam carcinógenos de forma mais eficaz do que cães SRD e podem obter maior benefício medicamentoso e estar sob risco maior de tumores. Já o metabolismo de xenobióticos pela enzima GSTA3 parece similar em cães de diferentes raças e não influenciar diferentemente a resposta a medicamentos e o risco de tumores nesses animais / Abstract: The ability to metabolize xenobiotics is variable among humans and dogs, and is related to the distinct genotypes of polymorphic genes. Carriers of the CYP1A2 1117TT genotype were classified as poor metabolizers of drugs. In addition, the varying T and C alleles of CYP1A2 C1117T e GSTA3 I71L polymorphisms were described as less efficient in the activation and inactivation of carcinogens than the wild alleles, respectively. Thus, humans and dogs seem to obtain distinct benefits under drug treatments and also to be under different risks of tumours. The frequencies of genotypes of the refered genes in dogs of different breeds and mixed breed are yet not described. The objective of this study was to identify the frequencies of the genotypes in 105 boxers, 84 rottweilers, 110 german shepherds and 99 mixed breed dogs with the purpose of to verify if a distinct distribution of genotypes occurs in animals of different groups.The genotypes were evaluated by amplifying the area of interest of the genes, in peripheral blood samples, using a polymerase chain reaction followed by a sequencing or enzymatic digestion of the amplified fragments. The frequency of the homozygous wild CC genotype of the CYP1A2 C1117 polymorphism was higher in dogs of pure breed (96,4% versus 87,9%, P= 0.002) and boxers (98.0% versus 87,9%, P= 0.005) than in mixed breed dogs. Similar frequencies of the genotypes were seem in dogs stratified by clinical features. Just the CC varying genotype of the GSTA3 I71L polymorphism was identified in all dogs. The results of this study suggest that pure breed dogs might be more efficient in metabolizing drugs and in activating carcinogens than mixed breed dogs, and therefore, may obtain larger therapeutic benefits under treatment for diseases and may be under higher risk for tumors. In contrast, the metabolim of xenobiotics by the GSTA3 enzyme seems to be similar among dogs of different breeds and not to influence on a different way the drug metabolism or tumour risk in these animals / Mestrado / Biologia Estrutural, Celular, Molecular e do Desenvolvimento / Mestre em Fisiopatologia Médica

Orientador: Ronei Jesus Poppi / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química / Made available in DSpace on 2018-08-17T03:08:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rocha_WericksonFortunatodeCarvalho_D.pdf: 5817007 bytes, checksum: 4581b99bb9fbcd5d186656109eb68573 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: O estudo do fenômeno de polimorfismo em fármacos é muito importante na indústria farmacêutica. Dessa forma, tem sido extensivamente investigado, devido ao seu impacto sobre a qualidade e eficácia das formulações farmacêuticas. Neste trabalho, três novas metodologias para o controle de qualidade de polimorfismo em fármacos foram propostas. O desenvolvimento, desses métodos, visa tomar as análises de controle de qualidade na indústria farmacêutica mais prática, rápida e sem a necessidade de consumo de reagentes com alto grau de toxicidade. Na primeira metodologia foi proposta a caracterização da composição polimórfica do fármaco Piroxicam em formulações farmacêuticas utilizando cartas de controle multivariadas baseada no cálculo do sinal analítico líquido e da espectroscopia na região do infravermelho próximo. Nesse caso, foi possível a identificação da presença das diferentes formas polimórficas nas formulações farmacêuticas. Em uma segunda metodologia, no qual também foi utilizado o fármaco Piroxicam, procurou-se realizar a quantificação e a distribuição de duas formas polimórficas através da espectroscopia de imagem na região do infravermelho próximo aliado ao método quimiométrico PLS. Os resultados mostraram que para ambos os modelos desenvolvidos os valores de RMSEP (%(m/m)) estão abaixo de 4%. Também foi possível obter a informação da distribuição espacial dos diferentes polimorfos nas formulações farmacêuticas. Na última metodologia utilizou-se da espectroscopia Raman e das cartas de controle multivariadas para identificação no fármaco Carbamazepina de adulteração em excipiente, transformação de formas polimórficas por humidade e detecção de diferentes formas polimórficas. Foi possível identificar a presença e a transformação dos diferentes polimórficos presentes, além da sua correta identificação / Abstract: The study of the polymorphism phenomenon in drugs is very important in the pharmaceutical industry. Thus, it has been extensively investigated because of its impact on the pharmaceutical formulations quality and effectiveness. In this work, three new methods for quality control of polymorphism in drugs were proposed. The development of these methods, aims to make the analysis of quality control in the pharmaceutical industry more practical, faster and without the need of reagent consumptions with a high degree of toxicity. In the first method it was proposed the characterization of Piroxican polymorphic composition in pharmaceutical formulations using multivariate control charts based on the calculation of the net analytical signal and the near infrared spectroscopy. In that case, it was possible to identify the presence of different polymorphic forms of the drug in the pharmaceutical formulations. In a second method, in which it was also used Piroxicam, there was an attempt to carry out the quantification and distribution of two polymorphic forms through the near-infrared imaging spectroscopy technique and PLS chemometric method. The results showed that for both models developed the RMSEP values (% (m / m)) are below 4%. It was also possible to distinguish the information from local and global distributions of different polymorphics in pharmaceutical formulations. In the last method it was used Raman spectroscopy and multivariate control charts to identify adulteration in excipients, polymorphic forms change by humidity and the detection of different polymorphic forms in the Carbamazepine drug / Doutorado / Quimica Analitica / Doutor em Ciências

Orientador: Mario Jose Abdalla Saad / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-06T11:08:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bellinazzi_VeraRegina_M.pdf: 1059560 bytes, checksum: bdf226ffce821be677b9c8439cc32fdd (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: Apesar dos mecanismos da longevidade não serem totalmente conhecidos, sabe-se que mutações em genes que reduzem a sinalização intracelular de insulina/IGF-1 são capazes de aumentar a sobrevida de animais invertebrados e mamíferos Na mosca Drosophila Melanogaster, mutações no receptor de insulina (similar ao gene do receptor de insulina humano) e no gene chico (similar ao gene do IRS-1 humano) levam ao aumento da sobrevida do animal. Em roedores, estudos sobre restrição calórica e diversas mutações tem relacionado a via de sinalização insulina/IGF-1 com longevidade. Em humanos, a sensibilidade à insulina normalmente declina com o envelhecimento, porém existem evidências que idosos longevos apresentam ação da insulina preservada e nível de IGF-1 sérico reduzido, o que sugere que a resposta à insulina tem impacto na longevidade humana. Evidências recentes que reforçam esta teoria demonstram que polimorfismos de genes da via de sinalização de insulina/IGF-1( IGF-1R e PI3K), afetam o IGF-1 sérico e a longevidade humana, sugerindo que este mecanismo esteja conservado através da evolução das espécies. Baseada nestas evidências, nosso estudo investigou a prevalência do polimorfismo mais comum do IRS-1, a substituição de glicina por arginina no códon 972 (Gly972Arg), numa amostra da população longeva brasileira, e a sua associação com diversos fenótipos e com a longevidade. Foram incluídos no estudo 94 idosos, de ambos os sexos, com idades entre 80 e 100 anos. Como grupo controle foram incluídos 194 recém-nascidos da mesma região brasileira. A freqüência genotípica encontrada nos idosos foi: Gly/GIy 80,85%, Gly/Arg 19,15%, e Arg/Arg 0%. Não foi encontrada diferença estatística entre a prevalência do polimorfismo em longevos e em neonatos brasileiros. Também não houve associação deste polimorfismo com resistência à insulina, hipertensão, diabetes, ou com alterações no IMC, circunferência da cintura, e lípides nessa população. Nossos achados indicam que não há associação do polimorfismo Gly972Arg do IRS-1 com longevidade em humanos. E possível que esta falta de relação esteja relacionada ao seu efeito neutro tanto na sensibilidade à insulina quanto no nível de IGF-1. / Abstract: Although the underlying mechanisms of longevity are not fully understood, it is known that mutations in genes that decrease the insulin/IGF-1 signal response pathway are capable of extending life span in a variety of model systems from invertebrates to mammals. In Drosophila Melanogaster, mutations of either the insulin receptor gene (similar of human insulin receptor gene) or the Chico (similar of human IRS-1 gene) led to enhanced longevity. In humans, insulin sensitivity normally declines during aging. Although there are evidences that long-lived subjects have decreased plasma IGF-1 levels and preserved insulin action, thus indicating that insulin responsiveness impacts on human longevity. Recent findings also provide novel and intriguing indications for the involvement of insulin and IGF-1 in the control of aging and longevity in humans. In particular, it has been demonstrated that polymorphic variants of IGF-1 receptor (IGF-IR) and phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) genes affect IGF-1 plasma levels and human longevity, indicating that the impact of these genes on species longevity is an evolutionary conserved property. On the basis of the above-mentioned literature, we investigate the prevalence of a most common IRS-1 variant, a Gly --> Arg substitution at codon 972 (GIy972Arg) in a population-based sample of Brazilian elderly, its association with phenotypes and longevity. Ninety-four Brazilian subjects (men and women), from 80-100 yr. of age, volunteered for this study. As a control population we studied 194 newborn children from our University Hospital. Genotype frequencies were Gly/Gly 80,85%, Gly/Arg 19,15%, and Arg/Arg 0%, which are in Hardy-Weinberg equilibrium In addition, no significant differences among allele and genotype distribution were found between Brazilian elderly and Brazilian newborns Also, the Arg variant was not associated with insulin resistance, hypertension, diabetes, detrimental values for body mass index, waist circumference, and lipids in the Brazilian elderly. Our findings indicate that the IRS-1 Gly972Arg variant is not related with longevity. It is possible that the lack of this association might be related to its neutral effect on insulin sensitivity and on IGF-1 levels. / Mestrado / Clinica Medica / Mestre em Clinica Medica

Orientador: Anete Pereira de Souza / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-22T03:36:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sibov_SergioTadeu_M.pdf: 5824914 bytes, checksum: 8896a28962fac411d1c8fc12f2bcf7fb (MD5) Previous issue date: 1997 / Mestrado / Genetica / Mestre em Ciências Biológicas

Orientadores: Joyce M. Annichino-Bizzacchi, Christine Hackel / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-07-23T08:15:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mendes_ChristianePatriciadeOliveira_M.pdf: 3747507 bytes, checksum: 314473a43a2b60b23c30e4583bb31f97 (MD5) Previous issue date: 1997 / Resumo: A cascata da coagulação sanguínea humana, em condições normais, é regulada por vários mecanismos naturais de anticoagulação. Entre esses mecanismos está a chamada Via da Proteína c (PC) Anticoagulante. A PC é uma proteína hepática dependente da vitamina K, que, quando ativada, exerce uma potente atividade anticoagulante e pró-fibrinolítica. Os pacientes com deficiência de PC apresentam quadro clínico caracterizado por fenômenos tromboembólicos Apenas 2-5% dos pacientes com trombose venosa apresentam deficiência de Pc. Contudo, devido à importância desse anticoagulante natural, a diminuição de sua concentração, mesmo que ainda dentro dos limites da normalidade, talvez possa ser um fator de risco a mais, que contribua para a trombose nesses pacientes. Recentemente foram descritos três polimorfismos na região promotora do gene da PC; um polimorfismo C/T, na posição -1654 e um polimorfismo A/G, : um polimorfismo na posição 1641 A/T, na posição -1476 (REITSMA, 1993). A análise desses três polimorfismos, em 24 famílias normais da Holanda, demonstrou que os três haplótipos mais freqüentes eram CAA, CGT e T AA, e representavam 88% dos casos. Segundo os autores os polimorfismos CGT e T AA tinham relação com a concentração da atividade plasmática de PC, na qual o genótipo CGT está associado a um risco elevado de trombose venosa, uma vez que foi mais freqüente nos indivíduos com trombose (risco relativo associado a doença de 1.9 ou OR de 1.9) frente ao genótipo T AA (OR de 1.6). Neste trabalho determinamos a freqüência destes 3 polimorfismos em três grupos étnicos da população brasileira (caucasóide, negróide e indígena), e em pacientes com trombose venosa mas sem deficiência congênita de Pc. Analisamos se em nossa população havia uma correlação entre o genótipo e a concentração da atividade de PC, ou se algum dos genótipos estava associado ao risco de trombose. A população indígena foi constituída por 87 indivíduos. Observou-se uma maior freqüência de homozigotos nos três genótipos estudados (CC - 52,9%; GG - 54% e AA 70,1 %), que também se manteve na análise considerando os três genótipos, simultaneamente (CC/GG/ AA -21,8%). Tal resultado leva-nos crer que os índios brasileiros estudados no presente trabalho ainda não sofreram folie influência da miscigenação, bastante comum em nosso país. Esse grupo indígena tem sua tribo em localização razoavelmente isolada do convívio do homem civilizado, o que resulta na pouca variação genômica (baixo fluxo gênico). A população de doadores caucasóide e negróide foi constituída por 216 homens e 50 mulheres. A população caucasóide foi constituída por 188 indivíduos (147 homens e 41 mulheres) e a negróide por 78 indivíduos (69 homens e 9 mulheres). Quando esses grupos foram analisados em conjunto, observou-se uma maior freqüência de heterozigotos nos 3 polimorfismos (CT 59,4% e AG - 59,4%; AT-70,7%). A análise conjunta dos 3 polimorfismos revelou uma predominância do genótipo heterozigoto (CT/AG/AT - 27,4%). Isto sugere um elevado fluxo gênico, o que é esperado, visto a alta taxa de miscigenação em nossa população. A freqüência dos polimorfismos na raça caucasóide foi CT-57%, AG-59%; e AT-64%; e na raça negróide CT -65%, AG-60% e A T -77%. A conjugação dos 3 polimorfismos mostrou que na raça caucasóide houve predominância do genótipo CT/AG/AT (28,3%) assim como na raça negróide (30,1 %). Sendo que as populações caucasóide e negróide não apresentaram diferença significativa. A dosagem da atividade de PC na população de doadores variou de 70 a 150%, com uma média de 102%. Contudo, não se evidenciou nenhuma relação entre os níveis de PC e os genótipos, exceto para o polimorfismo A/T, conforme descrito na população holandesa. Também, o genótipo CC/GG/TT, associado a níveis diminuídos de PC naquela população foi praticamente nulo (menor que 1%) em nossa população de brasileira, não permitindo qualquer análise. A média da atividade de PC dos 2 genótipos mais freqüentes (CT/AG/AT e CC/AG/AT) na população de doadores caucasóide e holandesa foi semelhante (p=0,039). Verificou-se nos doadores uma diferença significativa nos níveis de PC no polimorfismo 3, entre AA e A T com uma concentração da atividade de 108% e 99% (p=O, 015), respectivamente, associada a homozigose CC, que também mostrou uma diferença significativa entre CC/ AA e CC/AT com uma concentração da atividade de 112.76% e 99.96% (p=0,004), respectivamente). Isto poderia sugerir que o polimorfismo AT em homozigose para o C influencia na diferença dos níveis de PC, em relação ao polimorfismo 3. Como os resultados na população holandesa são opostos aos nossos, pois aqueles indivíduos com o genótipo CC/ A T exibem níveis de PC mais elevados, não permitem que se faça qualquer afirmativa com segurança. Na população com trombose, houve predominância do sexo feminino, sendo 35 homens e 88 mulheres. Quanto à raça, também houve uma predominância de indivíduos caucasóides (n=108) sobre os negróides (n=15). Verificou-se uma maior freqüência de heterozigosidade dos 3 Polimorfismos (CT-65,5%; AG-54% e AT-55,5%), assim como do genótipo heterozigoto (CT/AG/AT-21,1%). Mesmo quando os pacientes foram separados por raça, também verificou-se um maior índice de heterozigozidade, sendo CT -64%;e AG-52,3% e A T -54% no caucasóides e, CT -75%; AG-66,7% e A T - 77,7% nos negróides. Sendo que as populações caucasóide e negróide não apresentaram diferença significativa. o polimorfismo 2 em homozigose para o A foi significativamente mais freqüente na população com trombose (46%), quando comparada à população de doadores (24.4%) (p=0.005). Tais dados sugerem que o genótipo AA é um fator de risco para trombose (aR 1.93, 95% CI, 1.11 a 3.24). Contudo, em nossa população esse genótipo não está associado a níveis Por outro lado, o haplótipo CGT, considerado um fator de risco para trombose nos pacientes holandeses, foi encontrado em apenas 1 % dos nossos pacientes. Apesar de serem 2 populações diferentes, caso esse genótipo fosse um fator de risco, esperaríamos uma maior freqüência em nossos pacientes, assim como verificamos um aumento da prevalência de outras alterações genéticas associadas à trombose, como o fator V de Leiden, a mutação da protrombina e a mutação no gene da metilenotetrahidrofolatoredutase. A freqüência dos genótipos com maior e menor concentração da atividade de PC não é diferente entre doadores e pacientes com trombose, sugerindo que esses polimorfismos parecem não estar diretamente ligados ao risco de trombose. Portanto, nossos resultados demostraram que em nossa população, tanto de doadores como de pacientes com trombose, esses 3 polimorfismos praticamente não estão associados com os níveis de atividade plasmática de PC. Esses resultados mais uma vez ilustram a grande diversidade genética, nas populações humanas, mesmo entre grupos étnicos semelhantes, apontando para a importância de se analisar individualmente cada população, para que as conclusões possam ser bem fundamentadas / Abstract: Protein C (PC) is one of the major inhibitors of blood coagulation. After activation by thrombin-thrombomodulin complex in the endothelium, PC inhibites activated factors V and VIII. It also exerts a profibrinolytic activity, trough neutralization of plasminogen activator inhibitor-l (PAI-I). PC deficiency is associated with clinical thromboembolic disease. The incidence of PC deficiency in patients with thrombosis is 2-5%. However, since the physiological significance of the PC anticoagulant activity, a decreased plasmatic concentration, even in the normal range, could be a factor contributing for thrombosis in patients without a congenital PC deficiency. Recently, Spek et aI (1993) described 3 polymorphisms in the promoter region of PC gene: AlT in the position 1476; C/T in the position 1654 and AlG in the position 1641. The genotypic variation of these polymorphisms were associated with plasma PC levels and thrombotic risk (Spek et aI 1995). We determined the frequency of these polymorphisms in 3 ethinic groups of the Brazilian population (caucasian, black and indian) and in patients with thrombosis disease, without PC deficieI1cy. We also verified ifthere is an association between genotype and PC concentration, and with thrombotic risk. The indian group comprised 87 individuais. Homozigosity was prevalent in all polymorphisms (CC-52.9%, GG-54% and AA-70.1%) and in the genotype (CC/GG/AA-21.8%). These results suggest that this group was not miscegeneous, a finding very common in Brazilian population, probably because the tribe of these indians is isolated from the civilization. Caucasian and black population comprised 216 men and 50 women; there was 188 Caucasians (147 men and 41 women) and 78 Blacks (69 men and 9 women). Heterozigous polymorphism was more frequent in caucasian and black, as well as complete heterozygote CT/AG/AT (26.1% and 30.1%, respectively). Although before blood collection the individuaIs were selected only if untill the third ancestry were from the same origin, our results favour a high genetic flow. Mean PC activity levels in caucasian and blacks was 102%. However there was no correlation between the genotypic variation and PC concentration. IndividuaIs with the 2 more frequent genotype (CT/AG/AT and CC/AG/AT) had mean PC levels similar to that described in the Dutch study. There was a difference in mean PC levels in A/T polymorphism, between AA and A T (p=0.015), that also was significative between CC/AA and CC/AT (p=0.004). This could suggest that the first polymorphism homozigous for C influence the difference in PC concentration related to A/T polymorphism. However, in the Dutch population the results are in opposite, since the individuaIs with CC/ A T genotype showed increased PC levels. Thrombotic population comprised 35 men and 88 women, 108 caucasian and 15 black. The complete heterozigous CT/AG/AT was the more frequent genotype (21-1%), and not differ from the black and caucasian population. Even when they were separated according to the race, there was no difference between the frequency in the groups. When the polymorphisms were analysed individually, the second polymorphism homozigous for A was significantly more frequent in caucasian patients with thrombosis related to the caucasian normal population (p=0.005). To ascertain whether this polymorphism genotype was associated with a higher risk for thrombosis, we compare the number of patients and control caucasian subjects with the AA and ATor TT genotypes. The results indicated that having the AA genotype yields an OR of 1.93 (95% CI, 1.11 to 3.24) compared to the other genotypes. However, AA genotype is not associated with decrease in PC levels. Indeed, this finding was not verified in Dutch population. On the other hand, in Dutch study a clear correlation between PC promoter genotype and PC plasma levels was found; individuaIs with CGT haplotype exibited a PC activity 22% lower than individuaIs with T AA haplotype. They also considered CGT haplotype a risk factor for thrombosis. Although Brazilian and Dutch populations, we should expected that CGT genotype being a risk factor for thrombosis was more prevalent in our population, like factor V Leiden, variant prothrombin gene and methylene tetrahydrofolate reductase mutation, wich were increased in our and in Europe thrombotic patients, In conclusion, our results demonstrated that in our population these polymorphisms were not related to PC concentration. It is also important to point out the great genetic variety in human populations, even in the same ethynic groups, rising the 'importance to analyse individually each population / Mestrado / Farmacologia / Mestre em Ciências / FAPESP

Orientador: Shirlei Maria Recco-Pimentel / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-27T05:52:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Medeiros_LilianRicco_M.pdf: 2806210 bytes, checksum: 5fcc0121fdf8339334ff0b102682d87f (MD5) Previous issue date: 2000 / Mestrado

Orientador : Christine Hackel / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-07-28T10:22:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ribeiro_MarceloLima_M.pdf: 25882676 bytes, checksum: 47051f9bf317354ef0825ee8d0068829 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: Dentre os fatores predisponentes ao câncer de próstata, existem evidências que suportam a hipótese de etiologia hormonal decorrente da ação dos andrógenos. A testosterona, sintetizada a partir do colesterol por uma série de reações envolvendo enzimas do citocromo P450, é convertida em dihidrotestosterona (DHT) sob ação enzimática da 5a-redutase (8RD5A2), em alguns tecidos andrógenos dependentes. A DHT liga-se ao receptor de andrógenos (AR), e o complexo DHT-AR promove a transcrição dos genes que contém elementos responsivos aos andrógenos. O objetivo desse trabalho foi avaliar a distribuição de polimorfismos nos genes AR (CAG, 81/82, GGN) e SRD5A2 (Ala49Thr, VaI89Leu), de considerada relevância no estabelecimento do risco de câncer de próstata, em 200 doadores de sangue de duas cidades do estado de São Paulo e 92 pacientes com câncer de próstata, por PCR, PCR-RFLP e A80H. Nossos dados indicam que as freqüências desses marcadores assemelham-se aos resultados ob servados em populações Norte Americanas e Européias. Dessa forma, pode-se concluir que os fatores genéticos relacionados ao risco de câncer de próstata, considerados relevantes na maioria das populações, também podem ser aplicados a essas populações urbanas brasileiras, onde contribuições significativas de "pools" gênicos de europeus e de africanos podem ser encontradas. Em relação aos pacientes, os resultados obtidos sugerem que o número de repetições GGN parece ser o melhor marcador molecular para o risco de câncer de próstata / Abstract: There is evidence to support the hypothesis of hormonal etiology of prostate cancer involving androgen action. Testosterone is synthesized from cholesterol by a series of reactions involving cytochrome P450 enzymes and is converted to dihydrotestosterone (DHT), a more potent androgen, by 5a-reductase type 2 (SRD5A2) in many androgen-dependent target tissues. DHT binds to androgen receptor (AR), and the DHT-AR complex transactivates a number of genes with AR-responsive elements. The aim of this study was to evaluate the distribution of polymorphisms for the AR (CAG, S1/S2, GGN), and SRD5A2 (Ala49Thr, Val89Leu) genes that are considered of relevance for prostate cancer risk, among 200 individuais from two cities of the Sao Paulo state, and in 92 prostate cancer patients by PCR, PCRRFLP and ASOH techniques. Our data shows that the allelic frequencies of these markers are very similar to those described in North American and European populations. Thus, the prostate cancer genetic risk factors that are considered of relevance in most populations can also be taken into account in Brazilian urban populations, where significant contributions from European and African gene pools can be found. Concerning the prostate cancer patients, our results suggest that the number of GGN repeats seems to be the most reliable marker for prostate cancer risk / Mestrado / Ciencias Biomedicas / Mestre em Ciências Médicas

Orientadores : Vanderlei Rodrigues, Luiz Candido de Souza Dias / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-28T23:40:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Melo_ClaudiaMourade_D.pdf: 21271243 bytes, checksum: e521441608321ceb6dde5db11e7107b2 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo / Resumo: Variações fenotípicas intra e inter-populacionais de Schistosoma mansoni ocorrem em várias áreas geográficas. A heterogeneidade genética do parasita contribui para a observada variação fenotípica na interação parasita-hospedeiro, desempenhando um importante papel na epidemiologia da doença. A diferença fenotípica mais estudada, no entanto, é a resposta a quimioterapia, visto que ela é bastante relevante para o controle da esquistossomose. Com o objetivo de observar e avaliar a variabilidade genética entre linhagens brasileiras com características distintas e inferir relações filogenéticas entre elas, o DNA foi isolado de um " pool " de vermes das linhagens BH, SJ1, SJ2, 000, LE e MAP. O RAPD foi processado com 5 iniciadores com seqüências de nucleotídeos aleatórias. O RAP-PCR , por sua vez, foi realizado com o intuito de observar a variabilidade em regiões codificadoras do genoma. Os dois métodos se mostraram capazes de distinguir linhagens gerando marcadores moleculares intra-específicos. Um desses marcadores foi seqüenciado e mostrou alta homologia de nucleotídeo (99%) com uma sequência humana e 89% com gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase humana, proteína já correlacionada com a indução de resistência a reinfecção com S. mansoni e S. haematobium. O marcador G400-9 mostrou alta homologia de nuc1eotídeo, confirmada pela alta homologia de aminoácido com transposase de TNIO. Outro marcador sequenciado foi o CBH300-IO que apresentou alta homologia de nucleotídeo com o gene do ribossomo 28S. Outros marcadores interessantes foram observados na linhagem tolerante 000: 0uh250-IO e 0uh200-II, com os iniciadores RdIO (GGGTAACGCC) e RdII (GTGACTGCAG). Não detectamos marcadores específicos para a linhagem MAP, resistente ao oxamniquine, e sim um perfil eletroforético distinto com o iniciador Rd7 (TGCCGAGCTG). Na construção de árvores filogenéticas Neighbor-joining, quando foram inferidas as áreas geográficas das linhagens, obteve-se um dendograma formado por dois grupos distintos, um de linhagens paulistas e outro de mineiras. O dendograma obtido quando inferiu-se o tipo de hospedeiro intermediário revelou a formação de 3 grupos. A linhagem LE, mantida em laboratório sem retro-alimentação, pertence a um grupo externo bastante diferente dos demais. As linhagens BH, SJ1 e SJ2 foram agrupadas entre si, possivelmente em função do fluxo gênico existente entre elas, e a linhagem 000 foi estabelecida em um terceiro grupo. Estes dois últimos grupos (um formado pelas linhagens BH, SJ1 e SJ2, e outro pela linhagem 000), com linhagens de manutenção recente em laboratório ou com retroalimentação, são mais relacionadas entre si que com a LE. Acreditamos que a maior distância genética desta linhagem em relação as outras se deva a sua longa manutenção em laboratório com fixação de determinados alelos. As relações filogenéticas observadas nas árvores Neighborjoining corroboram as características fenotípicas distintas das linhagens e estas podem ser distinguidas e diagnosticadas por marcadores moleculares obtidos por RAPD e RAP-PCR / Abstract: Phenotypical variation intra and inter-populational of Schistosoma mansoni ocurred in several geographic areas. The genetic heterogenicity of the parasite contributes for phenotypic variation in the parasite-host interaction, representing an important role in the disease epidemiology. The more studied phenotypic difference, however, is the response to chemotherapy, so that is very relevant in the schistosomiasis contro!. The DNA was isolated fiom a pool of worms of the strains: BH, SJ1, SJ2, 000, LE and MAP, with the finality to observe and evaluate the genetic variability among brazilian strains, with different characteristics, and infer phylogenetic relations among them. The RAPD was processed with 5 random primers. The RAPD-PCR was realized with the fmality to observe the variability in codificators regions of genome. The two methods showed to be able to distinguish, generating molecular markers of strains. One of this markers was sequenced and showed high homology of nucleotides (99%) comparing to a human sequence and 89% with human glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, protein already relationed to the induction of resistance to the reinfection with S. mansoni and S. haematobium. The marker G400-9 showed high homology of nucleotides confirmaded for high homology of amino acid with transposase of TNI0. Other marker (CBH300-l0) was sequenced and apresented high homology with ribosomal 28 S gene Other interesting markers were observed in tolerant strain 000: 000250-10 and 000200-11, with the primers RdlO (GGGTAACGCC) and Rdll (GTGACTGCAG). Specific markers were not detected by us for MAP strain, resistant to oxamniquine, and a distinct PCR product profile with the primer Rd7 (TGCCGAGCTG). In the construction of phylogenetic trees Neighbor-joining, afier the geographic areas of strains were infered, a dendogram was obtained formed by two differents groups, one of paulistas strains and another of mineiras. When the type of intermediate host was infered the obtained dendogram revealed the formation of three groups. The LE strain kept in laboratory without retro-feed, belong to a external group very different fiom the others. The BH, SJ1 and SJ2 strains were grouped among them, possibly, in fimction of the genic flux existent among them, and the strain 000 was established in other group. This last two groups, with recent laboratory maintenance strains or with retro-feed, are more related among them, than to LE strain. We believed that the major genetic distance from this strain in relation to the others should be because the long maintenance in laboratory with the establishment of the allels. The phylogenetic relations observed in trees Neighbor-joining corroborate the different phenotypic characteristics of strains and this should be distinguished and diagnosed by molecular markers obtained by RAPD and RAP-PCR / Doutorado / Doutor em Parasitologia

Submitted by Gábia Leite (gabya.leite@gmail.com) on 2016-07-04T13:49:17Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Agnelo Weber de O. Rocha.pdf: 804396 bytes, checksum: ab8a49ed46a108b738c5454b146f68bd (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-07-18T12:54:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Agnelo Weber de O. Rocha.pdf: 804396 bytes, checksum: ab8a49ed46a108b738c5454b146f68bd (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-07-18T12:58:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Agnelo Weber de O. Rocha.pdf: 804396 bytes, checksum: ab8a49ed46a108b738c5454b146f68bd (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-18T12:58:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Agnelo Weber de O. Rocha.pdf: 804396 bytes, checksum: ab8a49ed46a108b738c5454b146f68bd (MD5) Previous issue date: 2015-08-27 / Some studies show that the alpha-actinin 3 (ACTN3) and angiotensin-converting enzyme (ACE 1) polymorphisms are strong indicators of candidates for high power and performance in sports. However, in the north region, specifically on the Amazon state, this studies are very rare. Acoording to that, this study presents an evaluation of th polymorphism R577X of the gene ACTN3 and the polymosphism I/D of the gene ECA I in the sports performance of athletes in the Amazon state. For that, blood samples were extracted form 127 athletes of both sexes and divided in two groups: G1 for primaly aerobic sports and G2 for primaly anaerobic sports. The DNA extraction was made by the Kit QIAamp® QIAGEN. While the quantification of the extracted DNA was done by the Nanodrop® ND-1000 Thermo Scientific machine. Postpone, a second quantification was realized with agarose gel at 0,8% flushed with ethidium bromide. The identification of the polymorphisms was done by the PCR-RFLP (ACTN3) technique with the restriction enzyme Ddel and PCR (ACE I). After all the procedures, the gene amplification occurred in 96 samples of 127 that were collected. The results did not show any significantly difference of p<0,05 in the aerobic group (RR = 31%, RX = 31% e XX = 38%). However, the G2 group had a significant difference of p<0,05 to the RR group compared to the others (RR = 10%, RX = 53% e XX = 37%). Besides that, it was verified that both the G1 and G2 groups had a high presence of the alpha-actin 3 gene, and less homozygous mutations. The genotype incidence of the gene ECA I did not show any difference between the genotypes of G1 (II = 35%, ID = 61% e DD = 44%) and G2 (II = 47%, ID = 47% e DD = 6%). After the grouping of the genotypes (RR+RX+DD ou XX+ID+II), it was identified that from the 37 subjects that obtained one of both combinations and 3 subjects ( 8%), showed a variation RR+RX+DD which is considered the best for power/strength sports, while 34 subjects (92%) of the subjects presented a variation XX+II+ID classified as the most indicated for endurance sports. For that so, it can be concluded that the incidence of the polymorphism R577X of the ACTN3 gene, was found to be very different from other experiments. However, the genotype of the gene ECA I was very similar to some studies realized in the asian country, despite being different from other studies done in the south and southeast regions of Brazil, as in Europe. / Evidências indicam que os polimorfismos nos genes da alfa-actinina-3 (ACTN3) e da enzima conversora de angiotensina I (ECA I) são fortes candidatos para modalidades de altas performances e força muscular. No entanto, no estado do Amazonas, esses estudos ainda são escassos. Dessa maneira, esta pesquisa se propôs a investigar a influência do polimorfismo R577X do gene ACTN3 e o polimorfismo I/D do gene da ECA I no desempenho esportivo de atletas do estado do Amazonas. Para tal, amostras de sangue de 127 atletas de ambos os sexo foram coletadas e divididas em dois grupos: G1 de modalidades predominantemente aeróbias e G2 de modalidades predominantemente anaeróbias. A extração do DNA foi realizada com o Kit QIAamp® QIAGEN. Enquanto que a quantificação do DNA extraído foi realizada no equipamento Nanodrop® ND-1000 Thermo Scientific, e em seguida por meio de eletroforese em gel de agarose a 0,8% e com coloração por brometo de etídeo. A identificação dos polimorfismos foi feita através das técnicas de PCR-RFLP (ACTN3) com a enzima de restrição DdeI e PCR (ECA I). Após todos os procedimentos experimentais a amplificação dos genes ocorreu em 96 amostras das 127 coletadas. Os resultados não apontaram diferença significativa de p<0,05 quando avaliados os genótipos encontrados em modalidades aeróbias (RR = 31%, RX = 31% e XX = 38%). Porém, no G2 houve significância de p<0,05 do grupo RR em relação aos demais (RR = 10%, RX = 53% e XX = 37%). Além disso, foi verificado que tanto em G1, quanto em G2 houve maior frequência dos portadores da proteína alfa-actinina-3 em relação dos homozigotos com mutação. A frequência genotípica do gene da ECA I não apontou diferenças entre os genótipos do G1 (II = 35%, ID = 61% e DD = 44%) e nem nos do G2 (II = 47%, ID = 47% e DD = 6%). Após o agrupamento dos genótipos (RR+RX+DD ou XX+ID+II) identificou-se que 37 sujeitos que obtiveram uma das duas combinações, sendo que 3 (8%) apresentaram a variação RR+RX+DD que é considerada ótima para as modalidades de força/potência, enquanto que 34 (92%) sujeitos apresentaram a variação XX+II+ID classificada como a mais indicada para modalidades de endurance. Portanto, conclui-se que a frequência do polimorfismo R577X do gene ACTN3 neste estudo se apresentou bem diferente que em outros experimentos. Porám, a genotipagem do gene da ECA I se assemelhou bastante com investigações realizadas no continente asiático, apesar de diferir de outros estudos realizados no sul e sudeste do Brasil, bem como na Europa.