A thesis submitted to the Faculty of Medicine, University of the Witwatersrand, Johannesburg, in fulfilment of the requirements for the degree of Doctor of Philosophy. / The subject of this thesis is mitochondrial DNA (mtDNA) variation in southern African populations. The purpose of this study was twofold. Firstly, mtDNA variations were used to investigate the genetic affinities of Negroid, Khoisan, Caucasoid and "Coloured" populations in an attempt to refine theories on southern African population affinities and prehistory. MtDNA variations were detected using two different methods. The first method makes use of restriction fragment length polymorphisms (RFLPs) detected with the restriction enzymes Hpal, BamUI, Haell, Mspl, Avail and Hindi in 795 unrelated individuals from twenty ethnic groups within the Khoisan, Negroid, Caucasoid and "Coloured" populations from South Africa and Namibia. The combinations of the various restriction enzyme patterns (morphs) for the enzymes Hpal, Bam HI, Hae II, Mspl, Avail and Hindi (in this order), were used to derive the mtDNA type for each individual studied. This resulted in the discovery of 52 distinct mtDNA types: 30 of which had been previously reported, 28 out of 32 resulted from new combinations of enzyme morphs and 4/32 were due to the discovery of new enzyme morphs (MspI-17 in the Ashkenazi Jewish population and AvaII-31, AvaII-32 and AvaII-33 in the South African "Coloured" population). The second method involves sequencing approximately 750 base pairs of mtDNA contained within the two hypervariable segments within the non-coding control region of the mtDNA molecule in 144 individuals, most of whom where investigated for mtDNA RFLP variations. Pairwise comparisons of mtDNA sequences revealed 119 variant sites which gave rise to 129 unique mtDNA types. / WHSLYP2017

INTRODUÇÃO: a síndrome de Noonan apresenta herança autossômica dominante e é considerada uma doença relativamente frequente na população, com uma incidência estimada entre 1/1000 e 1/2500 nascidos vivos. Dentre os seus acometimentos destacam-se: dismorfismos faciais, baixa estatura, alterações cardíacas e criptorquia. A síndrome de Noonan é muito confundida com as síndromes Noonan-like devido à sobreposição dos achados clínicos. Estas, mais raras que a síndrome de Noonan, incluem as síndromes de LEOPARD, neurofibromatose-Noonan, cardiofaciocutânea e Costello. Atualmente sabe-se que tanto a síndrome de Noonan como as síndromes Noonan-like envolvem mutações em genes pertencentes à via de sinalização RAS-MAPK. Na síndrome de Noonan, pelo menos quatro genes desta via são responsáveis pelo fenótipo: PTPN11, SOS1, RAF1 e KRAS. Mutações no gene PTPN11, o primeiro gene descrito em associação com a síndrome, são encontradas em aproximadamente 40% dos casos. O segundo gene descrito, o gene KRAS, é responsável por cerca de 2% dos casos que não apresentam mutações no gene PTPN11. Mutações no gene KRAS estão presentes em pacientes com síndrome de Noonan com retardo mental e/ou atraso no desenvolvimento mais acentuados e em pacientes com a síndrome cardiofaciocutânea cujo envolvimento ectodérmico é mais sutil. OBJETIVO: devido à recente associação do gene KRAS com a síndrome de Noonan e outras síndromes Noonan-like é importante: (1) testar a frequência de mutação neste gene em pacientes que apresentam ou não mutações no gene PTPN11 e (2) tentar estabelecer uma correlação genótipo-fenótipo mais precisa, o que permitirá a realização de um aconselhamento genético mais adequado. MÉTODOS: foram avaliados 95 probandos com síndrome de Noonan e 30 com síndromes Noonan-like. O estudo molecular foi realizado através da reação em cadeia de polimerase, seguida das reações de purificação e sequenciamento bidirecional. RESULTADOS: foram encontradas mutações no gene PTPN11 em 20/46 (43%) pacientes com síndrome de Noonan, duas delas não descritas anteriormente. Relacionando o quadro clínico dos pacientes com síndrome de Noonan deste estudo, com e sem mutação no gene PTPN11, nota-se que os pacientes com mutação apresentam incidência significativamente maior de baixa estatura, de estenose pulmonar valvar e menor frequência de miocardiopatia hipertrófica. Uma mutação no gene KRAS foi encontrada em um paciente com síndrome de Costello, mutação esta ainda não relatada. Alterações gênicas em mais de um gene da via RAS-MAPK foram observadas em dois pacientes, sendo que uma delas em cada paciente não predizia um efeito fenotípico importante. Foram também encontrados três polimorfismos no gene KRAS, porém com mesma frequência no grupo controle. A fim de verificar a influência destes polimorfismos, as principais características da síndrome de Noonan foram relacionadas entre os pacientes com esta síndrome que apresentavam mutação no gene PTPN11 e comparadas quanto à presença ou ausência desses polimorfismos. Nenhuma diferença estatisticamente significante foi encontrada. CONCLUSÃO: Pacientes com síndrome de Noonan e mutações no gene PTPN11 apresentaram uma maior incidência de baixa estatura e de estenose pulmonar valvar e uma menor incidência de miocardiopatia hipertrófica. O gene KRAS, até então relacionado às síndromes de Noonan e cardiofaciocutânea, mostrou-se também responsável pela síndrome de Costello. Tanto as alterações gênicas consideradas não patogênicas como os polimorfismos encontrados no gene KRAS parecem não ter uma grande influência sobre a variabilidade fenotípica na síndrome de Noonan. Contudo, não é possível afastar totalmente que estas alterações apresentem um efeito sutil e que, em conjunto com outras variações genéticas e/ou ambientais, tenham um efeito modulador / INTRODUCTION: Noonan syndrome shows autosomal dominant inheritance, and is a relatively frequent disease in the population, with an estimated incidence between 1/1000 and 1/2500 live births. The main clinical features are: facial dysmorphisms, short stature, cryptorchidism and cardiac abnormalities. The differential diagnosis between Noonan syndrome and Noonan-like syndromes is not always easy, due to the overlap of the their clinicla findings. The Noonan-like syndromes, more rare that the Noonan syndrome, include the LEOPARD syndrome, neurofibromatosis-Noonan, cardiofaciocutaneous and Costello. Currently it is known that Noonan syndrome and Noonan-like syndromes involve mutations in genes belonging to the RAS-MAPK signaling pathway. In Noonan syndrome, at least four genes of this pathway are responsible for the phenotype: PTPN11, SOS1, RAF1 and KRAS. Mutations in PTPN11, the first gene described in association with this syndrome, are found in approximately 40% of cases. The second gene described, the KRAS gene, is responsible for about 2% of the cases that dont have mutations in the PTPN11 gene. Mutations in the KRAS gene are present in patients with Noonan syndrome with mental retardation and/or developmental delay more pronounced and in patients with cardiofaciocutaneous syndrome whose ectodermal involvement is more subtle. OBJECTIVE: Due to the recent association of the KRAS gene with Noonan and Noonan-like syndromes is important: (1) to test the frequency of mutation in this gene in patients with or without mutations in PTPN11 and (2) to estabilish a more precise genotype-phenotype correlation, allowing the realization of a more appropriate genetic counseling. METHODS: 95 probands with Noonan syndrome and 30 with Noonan-like syndromes were evaluated. The molecular analysis was performed by the polymerase chain reaction, followed by purification and bidirectional sequencing. RESULTS: PTPN11 gene mutation was found in 20/46 (43%) patients with Noonan syndrome, two of them not previously described. By correlating the clinical features of patients with Noonan syndrome in this study, with or without mutations in the PTPN11 gene, it was noted that patients with mutations have significantly higher incidence of short stature, pulmonary stenosis and lower incidence of hypertrophic cardiomyopathy. Mutations in KRAS gene were found in two patients a patient with Noonan syndrome ant the other with Costello syndrome. Gene alterations in more than one gene at the RASMAPK patway were observed in two patients, but one of the mutations in each patient didnt predict a significant phenotypic effect. Were also foud three polymorphisms in the KRAS gene, but with the same frequency in the control group. To check the influence of these polymorphisms, the main features of Noonan syndrome were related among patients with this syndrome who had mutations in the PTPN11 gene and compared of the presence or absence of these polymorphisms. No statistically significant difference was found. CONCLUSION: Patients with Noonan syndrome and PTPN11 gene mutation had a higher incidence of short stature and pulmonary valve stenosis and a lower incidence of hypertrophic cardiomyopathy. The KRAS gene, previously related to Noonan and cardiofaciocutaneous syndrome, was also responsible for Costello syndrome. Gene alterations considered as nonpathogenic and polymorphisms found in the KRAS gene seem to have a not great influence on the phenotypic variability in Noonan syndrome. However, it is not possible to completely rule out that these changes have a subtle effect and that, together with other genetic variations and/or environmental factors, may have a modulating effect

INTRODUÇÃO: O câncer de mama é a neoplasia maligna mais comum no sexo feminino e a segunda causa de óbito por câncer na mulher. Apesar dos avanços no conhecimento da patogênese e dos aspectos moleculares da doença, a exposição prolongada tanto ao estrogênio endógeno quanto exógeno constitui importante fator na carcinogênese mamária. Produtos da degradação e inativação do estrogênio podem ter ação proliferativa e causar danos ao DNA. Genes de baixa penetrância relacionados ao metabolismo hormonal, atuando em conjunto com fatores comportamentais e endógenos, podem ser responsáveis por parte dos casos de câncer de mama, atuando em conjunto a genes de alta penetrância. OBJETIVOS: Analisar polimorfismos no receptor de estrogênio e em genes relacionados ao seu metabolismo em mulheres com e sem câncer de mama, observando suas frequências em cada um dos grupos. CASUÍSTICA E MÉTODOS: Foram incluídas mulheres portadoras de carcinoma mamário recém-diagnosticado, com idade superior a 40 anos e sem histórico de outros tipos de neoplasia maligna (grupo estudo) e mulheres sem câncer de mama, apresentando exame mamográfico normal realizado há no máximo 12 meses, com mais de 40 anos de idade e sem histórico de câncer (grupo controle). Foi realizada coleta de sangue periférico para extração e análise de DNA genômico. Avaliaram-se os polimorfismos em CYP1A1 MspI, CYP3A4*1B, COMT L/L, ESR1 PvuII e XbaI e UGT1A1*28. RESULTADOS: Os polimorfismos em UGT1A1*28 e ESR1 PvuII foram mais frequentes no grupo de mulheres com câncer de mama, porém sem atingir significância estatística. As mutações em ESR1 XbaI, CYP3A4*1B e CYP1A1 MspI foram mais frequentes no grupo controle, também sem significância estatística. Já o genótipo L/L do gene COMT foi mais significativamente mais frequente no grupo controle. CONCLUSÕES: A frequência de polimorfismos em UGT1A1*28 e ESR1 PvuII foi de 16,8% e 39,4% nas mulheres com câncer de mama e 10,8% e 18,3% nas sem câncer. A frequência de mutações em ESR1 XbaI, CYP3A4*1B e CYP1A1 MspI foi de 15,1, 44,2 e 3,6% nas mulheres sem câncer de mama e de 25, 22,2% e 0 nas com câncer de mama. O genótipo L/L do gene COMT foi significantemente mais frequente no grupo controle (28,9 vs. 8,6%), sugerindo que este polimorfismo poderia ser um fator protetor ao câncer de mama na população estudada / INTRODUCTION: Breast cancer is the most common malignancy in women and second leading cause of cancer death in women. Despite advances in studies on the pathogenesis and molecular aspects of the disease, prolonged exposure to endogenous and exogenous estrogen is an important factor for mammary carcinogenesis. Products of degradation and inactivation of estrogen may have proliferative action and cause DNA damage. Low penetrance genes related to hormone metabolism, acting in conjunction with behavioral and endogenous factors may be responsible for most cases of breast cancer, and together with high penetrance genes. OBJECTIVES: To analyze polymorphisms in genes related to the estrogen receptor and metabolism in patients with and without breast cancer, observing the frequencies in each group. MATERIALS AND METHODS: We included women with newly diagnosed breast cancer, aged 40 years or more and without history of other types of malignancy (study group) and women without breast cancer, with a normal mammography performed for no more than 12 months, with more than 40 years old and no history of cancer (control group). A sample of peripheral was collected for genomic DNA extraction and analysis. The polymorphisms in CYP1A1 MspI, CYP3A4*1B, COMT L/L, ESR1 PvuII and XbaI and UGT1A1*28 were evaluated. RESULTS: The polymorphisms in UGT1A1*28 and ESR1 PvuII were more frequent in the group of women with breast cancer, without reaching statistical significance. The mutations in ESR1 XbaI, CYP3A4*1B and CYP1A1 MspI were more frequent in the control group, also not statistically significant. The COMT genotype L/L was significantly more frequent in control group. CONCLUSIONS: The frequency of polymorphisms in UGT1A1*28 and ESR1 PvuII was 16.8% and 39.4% in women with breast cancer and 10.8% and 18.3% in those without cancer. The frequency of mutations in ESR1 XbaI, CYP3A4*1B and CYP1A1 MspI was 15.1, 44.2 and 3.6% in women without breast cancer and 25, 22.2 and 0% in breast cancer. The L/L genotype of the COMT gene was significantly more frequent in the control group (28.9 vs. 8.6%), suggesting that this polymorphism could be a protective factor against breast cancer in this population

O processo de envelhecimento é marcado por diversos estilos de vivências e experiências e traz consigo alterações morfológicas e fisiológicas. Estas mudanças ocorrem devido a componentes celulares e moleculares, os quais são controladas por fatores genéticos e não genéticos. Por isso, é de grande importância investigar sobre as associações existentes entre as alterações genéticas, o envelhecimento e o ambiente para a compreensão das características próprias do processo de envelhecimento. O objetivo foi estudar a associação dos polimorfismos genéticos AKT1 G205T (rs1130214), AGTR1 A1166C (rs5186) e visfatina (rs4730153) com parâmetros de saúde (cognição, qualidade de vida, depressão, capacidade funcional, pressão arterial, perfil lipídico sanguíneo, glicemia e medidas antropométricas) em mulheres a partir de 50 anos de idade. A amostra foi composta por 97 mulheres (>= 50 anos) que tinham o interesse em se ingressar em programa de Educação Física na USP. Elas foram submetidas inicialmente a uma entrevista, na qual é aplicado o MEEM - critério de inclusão. Na sequência foram realizados testes físicos (sentar e levantar, FPMD e E, agilidade, caminhar 6 min, mãos nas contas e sentar e alcançar), aplicados questionários e houve coleta de sangue. Com relação ao polimorfismo da AKT1, o grupo GT/TT apresentou melhores resultados na massa corporal, índice de massa corporal e HDL-colesterol, e piores resultados em FPMD/E comparado com o genótipo GG. Em relação ao AGTR1, o genótipo AA exibiu melhores resultados comparado com o AC/CC nas variáveis de caminhada e atividade física moderada. Por fim, para a visfatina o grupo AA/AG apresentou melhores resultados em HDL e TG comparado com o genótipo GG. Dados desta natureza podem possibilitar a predição das variáveis de saúde de cada indivíduo que serão mais prejudicadas antes dele envelhecer e, consequentemente, planejar intervenções específicas que previnam estes declínios / The aging process is marked by many different experiences and experiences can bring their own morphological and physiological changes of aging. These changes occur because the arrangement of cellular and molecular components, which are controlled by genetic and nongenetic factors. So it is of great importance investigate the associations between the genetic changes, aging and the environment to understanding the very physical characteristics of the aging process. The objective was to study the association of polymorphisms AKT1 G205T (rs1130214), AGTR1 A1166C (rs5186) and visfatin (rs4730153) with health parameters (cognition, quality of life, depression, functional capacity, blood pressure, blood lipids, blood glucose and measures anthropometric) in women over 50 years of age. The sample consisted of 97 women (>= 50 years) who had an interest in joining the OFW - EEFERP - USP. These were initially submitted to an interview, in which the MMSE is applied - inclusion criteria after was carried out physical tests (sitting and standing, LDCF and E, agility, walk 6 min, hands on the bills and sit and reach), application questionnaires and blood collection. Regarding the polymorphism AKT1, the GT / TT genotype showed better results in body mass, body mass index and HDL-cholesterol and worst results LDCF / E compared to the GG genotype in AGTR1 AA genotype showed better results compared with the AC/CC to variables of walking and moderate physical activity, in order to visfatin AA/AG genotype showed better results in HDL and TG compared with the GG genotype. Through presented associations we observed existing relationships and new partnerships in health variables

Briefly, some findings in my research are as follows: (1) The genetic variants of the CA repeats in IGF1 promoter 1 can affect the activity of promoter 1, and the CA repeat showed a suppressive effect on the activity of the promoter 1 of IGF1 gene. EMSA results have shown that the CA repeats could bind to certain nuclear protein. (2) The SNPs T/C (rs5742612) and T/A (rs2288377) can also affect the activity of the promoter 1 in IGF1 gene, and the activity of C-A haplotype is significantly higher than that of T-T haplotype. EMSA results have shown that the SNP T/A (rs2288377) could bind to certain nuclear protein. (3) I developed the new dual reporter assay method to investigate the transactivation interaction between the SNP T/G (rs2071430) and C/A (rs17000900) in the MxA promorer. This new method can not only improve the detection limit for small difference between haplotypes, but also calculate the model of transactivation effect between these two SNPs. The results were better than those of traditional method, and it gave a clear-cut demonstration of the effect of interaction between these two SNPs on the activity of MxA promoter. / In addition, in the IGF1 study, the core promoter region of promoter 2 was identified through 5' deletion mutagenesis methods. Moreover, a cell-type specific mechanism of bidirectional activation of promoter was found. / Recently, more and more studies focus on gene function with the completion of the Human Genome Project. It is well known that polymorphism of human genome sequence is a common phenomenon in the human population. Specially, a lot of genetic polymorphisms, including single nucleotide polymorphisms (SNPs) and microsatellites, have been reported in the regulatory region of many genes. However, the effects of most of these genetic polymorphisms on gene expression are still unknown. The polymorphisms in the promoter can play an important role in the gene regulation. For example, some SNPs located in the transcription factor binding site (TFBS) can affect gene transcription. So, it is very necessary to directly study the effect of genetic variants on promoter transactivation activities. In this study, we studied the effect of genetic polymorphisms on gene expression through reporter gene assay, electrophoretic mobility shift assay (EMSA), and so on. And the candidate genes include insulin-like growth factor 1 (IGF1) and myxovirus resistence 1 (MxA). Some SNPs and microsatellites have been reported in the promoters of these genes. In our previous researches, we focused on the study of the association between these polymorphisms and some diseases, and it was found that a few SNPs significantly associated with relevant diseases. Based on the previous results, in my project, I developed new functional assays and also improved existing methods to analyse the functional effect of these genetic variants of promoters on transactivation activities. / by Huang, Wei. / "March 2008." / Adviser: Nelson Leung Sang Tang. / Source: Dissertation Abstracts International, Volume: 70-03, Section: B, page: 1483. / Thesis (Ph.D.)--Chinese University of Hong Kong, 2008. / Includes bibliographical references (p. 139-145). / Electronic reproduction. Hong Kong : Chinese University of Hong Kong, [2012] System requirements: Adobe Acrobat Reader. Available via World Wide Web. / Electronic reproduction. [Ann Arbor, MI] : ProQuest Information and Learning, [200-] System requirements: Adobe Acrobat Reader. Available via World Wide Web. / Abstracts in English and Chinese. / School code: 1307.

Submitted by Natalia Vieira (natalia.vieira@famerp.br) on 2016-05-19T19:07:09Z No. of bitstreams: 1 sabrinamayaracezario_dissert.pdf: 2283086 bytes, checksum: 130b0d9b52a17f23980c982605a0dad9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-19T19:07:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 sabrinamayaracezario_dissert.pdf: 2283086 bytes, checksum: 130b0d9b52a17f23980c982605a0dad9 (MD5) Previous issue date: 2015-05-27 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - FAPESP / Background - Age-related macular degeneration (AMD) is a complex disease. The identification of risk factors may contribute to the prognosis and treatment. Objectives – Evaluate the influence of genetic variants related to lipid metabolism, angiogenesis and inflammation and its relation with clinical and lipid profile and lifestyle beyond their gene expression in patients with AMD. Casuistic and Methods – We studied 333 individuals aged ≥50 years, 108 with AMD in exudative form (G1); 45 with AMD in dry form (G2), and 180 individuals without clinical and angiographic signs of the disease (G3). The polymorphisms of apolipoprotein E (APOE-rs429358/rs7412), triphosphate binding cassette sub -family A transport -member 4 (ABCA4-rs472908), complement factor H (CFH-rs1061170) and vascular endothelial growth factor (VEGF-rs3025039/rs1570360) were analyzed by PCR/RFLP (polymerase chain reaction/restriction fragments length polymorphism), while the respective gene expression in blood by PCR/RT (reverse transcription-PCR) and serum levels of apo E, ABCR, CFH, VEGF by ELISA (enzyme linked immuno sorbent assay). Clinical and lipid profile data in addition to lifestyle were obtained from medical records and questionnaire. Level of significance was accepted for P<0.05. Results – Systemic arterial hypertension (SAH) and smoking prevailed in patients with AMD exudative form (P<0.05). Genetic polymorphisms: APOE- rs429358/rs7412 - APOE*3/3 was noted in all groups, followed by APOE*3/4, as well APOE*4 (P>0.05). ABCA4-rs472908 - Genotype A/G was more frequent in G3 (68%) versus G2 (44%; P<0.0001), while A/A in G2 (36%) versus G1 (19%; P=0.04) and G3 (14%; P=0.003). The mutant genotype (G/G) prevailed in combination (G1+G2) versus G3 (P< 0.0001), and allele G in all groups (P>0.05). CFH-rs1061170 – The wild homozygous (TT) was in evidence in G3 (58%) versus G1 (39%, P=0.003); as well the homozygous mutant (CC) in G1 (27 %) versus G3 (14%; P=0.002) and allele T in G3 (0.72) versus G1 (0.56; P=0.0002). VEGF-rs3025039 – Genotypic and allelic distribution were similar between groups (P>0.05), highlighting the CC genotype and allele C. VEGF-rs1570360 – Mutant homozygote (A/A) prevailed in G2 (21%) versus G1 (5%; P=0.002) and G3 (8%; P=0.015) as well as the wild type allele (G) G1 (0.75) and G3 (0.71) versus G2 (0.57, P=0.004, P=0.020, respectively). Gene expression – Similar values between groups for all analyzed genes (P>0.05). Serum levels (median values in ng/mL) – ApoE– Increased level in G1 (270.6) versus G2 (196.5; P<0.0001) and G3 (242.8; P=0.035), and G3 versus G2 (P=0.0002). ABCR – High levels in G1 (0.30) versus G2 (0.25; P=0.003) and G3 (0.25, P<0.0001). CFH – Increase in G1 (1198.9) versus G2 (859.8; P=0.0069), both higher than in G3 (618.3; P<0.001, P=0.001, respectively). VEGF – Similar values between groups (P>0.05). Lipid profile – G3 showed the highest level of HDLc (median=71mg /dL), compared to G2 (60mg/dL), and G1 (45mg/dL; P=0.003, P=0.029, respectively). Conclusion – Genetic variants of ABCA4, VEGF and CFH, besides SAH, smoking and increased serum levels of apo E, ABCR and CFH are associated with AMD, whereas the expression of the respective genes not differentiate AMD exsudative and dry forms, in contrast CFH (homozygous wild-type) has a protective character, as well as serum levels of HDLc. / Introdução – Degeneração macular relacionada à idade (DMRI) é uma doença complexa. A identificação de fatores de risco poderá contribuir no seu prognóstico e tratamento. Objetivos – Avaliar a influência de variantes genéticas, relacionadas com o metabolismo de lipídios, angiogênese e inflamação e sua relação com perfil clínico e lipídico e hábitos de vida, além das respectivas expressões gênicas em pacientes com DMRI. Casuística e Métodos – Foram estudados 333 indivíduos com idade ≥50 anos, sendo 108 com DMRI na forma exsudativa (G1); 45 com DMRI na forma seca (G2) e 180 indivíduos sem sinais clínicos e angiográficos da doença (G3). Os polimorfismos de apolipoproteína E (APOE-rs429358/rs7412), triphosphate binding cassette transporte sub-family A-member 4 (ABCA4-rs472908), complemento do fator H (CFH-rs1061170) e fator de crescimento endotelial vascular (VEGF-rs3025039/rs1570360) foram analisados por PCR/RFLP (polymerase chain reaction/restriction fragments lengh polymorphism), enquanto as respectivas expressões gênicas no sangue por PCR/RT (reverse transcription-PCR) e níveis séricos de apo E, ABCR, CFH, VEGF por ELISA (enzyme linked immuno sorbent assay). Dados de perfil clínico e lipídico, além de hábitos de vida, foram obtidos em prontuário médico e questionário. Admitiu-se nível de significância para P<0,05. Resultados – Hipertensão arterial sistêmica (HAS) e tabagismo prevaleceram em pacientes com DMRI exsudativa (P<0,05). Polimorfismos genéticos: APOE-rs429358/rs7412–APOE*3/3 destacou-se em todos os grupos, seguido de APOE*3/4, assim como o alelo APOE*4 (P>0,05). ABCA4-rs472908–O genótipo A/G foi mais frequente em G3 (68%) versus G2 (44%; P<0,0001), enquanto A/A em G2 (36%) versus G1 (19%; P=0,043) e G3 (14%; P=0,003). O genótipo mutante (G/G) prevaleceu na combinação (G1+G2) versus G3 (P<0,0001), e o alelo G em todos os grupos (P>0,05). CFH-rs1061170–O homozigoto selvagem (TT) destacou-se em G3 (58%) versus G1 (39%, P=0,003); já o homozigoto mutante (CC) em G1 (27%) versus G3 (14%; P=0,002), e o alelo T em G3 (0,72) versus G1 (0,56; P=0,0002). VEGF-rs3025039–Distribuição genotípica e alélica semelhante entre os grupos (P>0,05), destacando-se o genótipo CC e alelo C. VEGF-rs1570360–Homozigoto mutante (A/A) prevaleceu em G2 (21%) versus G1 (5%; P=0,002) e G3 (8%; P=0,015), assim como o alelo selvagem (G) em G1 (0,75) e G3 (0,71) versus G2 (0,57; P=0,004; P=0,020, respectivamente). Expressão gênica–Valores semelhantes entre os grupos para todos os genes analisados (P>0,05). Níveis séricos (valores de mediana em ng/mL)–ApoE–Aumento em G1 (270,6) versus G2 (196,5; P<0,0001) e G3 (242,8; P=0,035), e G3 versus G2 (P=0,0002). ABCR–Níveis elevados em G1 (0,30) versus G2 (0,25; P=0,003) e G3 (0,25; P<0,0001). CFH–Aumento em G1 (1.198,9) versus G2 (859,8; P=0,0069), ambos com acréscimo em relação a G3 (618,3; P<0,001; P=0,001, respectivamente). VEGF–Valores semelhantes entre os grupos (P>0,05). Perfil lipídico–G3 mostrou valor mais elevado de HDLc (mediana=71mg/dL), comparado a G2 (60mg/dL) e G1 (45mg/dL) (P=0,003; P=0,029, respectivamente). Conclusão – Variantes genéticas de ABCA4, VEGF e CFH, além de HAS, tabagismo e nível sérico elevado de apoE, ABCR e CFH associam-se a DMRI, enquanto a expressão dos referidos genes não diferencia DMRI exsudativa e seca, em contrapartida CFH (homozigoto selvagem) tem caráter protetor, assim como nível sérico de HDLc.

INTRODUÇÃO: O câncer de mama é a neoplasia maligna mais comum no sexo feminino e a segunda causa de óbito por câncer na mulher. Apesar dos avanços no conhecimento da patogênese e dos aspectos moleculares da doença, a exposição prolongada tanto ao estrogênio endógeno quanto exógeno constitui importante fator na carcinogênese mamária. Produtos da degradação e inativação do estrogênio podem ter ação proliferativa e causar danos ao DNA. Genes de baixa penetrância relacionados ao metabolismo hormonal, atuando em conjunto com fatores comportamentais e endógenos, podem ser responsáveis por parte dos casos de câncer de mama, atuando em conjunto a genes de alta penetrância. OBJETIVOS: Analisar polimorfismos no receptor de estrogênio e em genes relacionados ao seu metabolismo em mulheres com e sem câncer de mama, observando suas frequências em cada um dos grupos. CASUÍSTICA E MÉTODOS: Foram incluídas mulheres portadoras de carcinoma mamário recém-diagnosticado, com idade superior a 40 anos e sem histórico de outros tipos de neoplasia maligna (grupo estudo) e mulheres sem câncer de mama, apresentando exame mamográfico normal realizado há no máximo 12 meses, com mais de 40 anos de idade e sem histórico de câncer (grupo controle). Foi realizada coleta de sangue periférico para extração e análise de DNA genômico. Avaliaram-se os polimorfismos em CYP1A1 MspI, CYP3A4*1B, COMT L/L, ESR1 PvuII e XbaI e UGT1A1*28. RESULTADOS: Os polimorfismos em UGT1A1*28 e ESR1 PvuII foram mais frequentes no grupo de mulheres com câncer de mama, porém sem atingir significância estatística. As mutações em ESR1 XbaI, CYP3A4*1B e CYP1A1 MspI foram mais frequentes no grupo controle, também sem significância estatística. Já o genótipo L/L do gene COMT foi mais significativamente mais frequente no grupo controle. CONCLUSÕES: A frequência de polimorfismos em UGT1A1*28 e ESR1 PvuII foi de 16,8% e 39,4% nas mulheres com câncer de mama e 10,8% e 18,3% nas sem câncer. A frequência de mutações em ESR1 XbaI, CYP3A4*1B e CYP1A1 MspI foi de 15,1, 44,2 e 3,6% nas mulheres sem câncer de mama e de 25, 22,2% e 0 nas com câncer de mama. O genótipo L/L do gene COMT foi significantemente mais frequente no grupo controle (28,9 vs. 8,6%), sugerindo que este polimorfismo poderia ser um fator protetor ao câncer de mama na população estudada / INTRODUCTION: Breast cancer is the most common malignancy in women and second leading cause of cancer death in women. Despite advances in studies on the pathogenesis and molecular aspects of the disease, prolonged exposure to endogenous and exogenous estrogen is an important factor for mammary carcinogenesis. Products of degradation and inactivation of estrogen may have proliferative action and cause DNA damage. Low penetrance genes related to hormone metabolism, acting in conjunction with behavioral and endogenous factors may be responsible for most cases of breast cancer, and together with high penetrance genes. OBJECTIVES: To analyze polymorphisms in genes related to the estrogen receptor and metabolism in patients with and without breast cancer, observing the frequencies in each group. MATERIALS AND METHODS: We included women with newly diagnosed breast cancer, aged 40 years or more and without history of other types of malignancy (study group) and women without breast cancer, with a normal mammography performed for no more than 12 months, with more than 40 years old and no history of cancer (control group). A sample of peripheral was collected for genomic DNA extraction and analysis. The polymorphisms in CYP1A1 MspI, CYP3A4*1B, COMT L/L, ESR1 PvuII and XbaI and UGT1A1*28 were evaluated. RESULTS: The polymorphisms in UGT1A1*28 and ESR1 PvuII were more frequent in the group of women with breast cancer, without reaching statistical significance. The mutations in ESR1 XbaI, CYP3A4*1B and CYP1A1 MspI were more frequent in the control group, also not statistically significant. The COMT genotype L/L was significantly more frequent in control group. CONCLUSIONS: The frequency of polymorphisms in UGT1A1*28 and ESR1 PvuII was 16.8% and 39.4% in women with breast cancer and 10.8% and 18.3% in those without cancer. The frequency of mutations in ESR1 XbaI, CYP3A4*1B and CYP1A1 MspI was 15.1, 44.2 and 3.6% in women without breast cancer and 25, 22.2 and 0% in breast cancer. The L/L genotype of the COMT gene was significantly more frequent in the control group (28.9 vs. 8.6%), suggesting that this polymorphism could be a protective factor against breast cancer in this population

O processo de envelhecimento é marcado por diversos estilos de vivências e experiências e traz consigo alterações morfológicas e fisiológicas. Estas mudanças ocorrem devido a componentes celulares e moleculares, os quais são controladas por fatores genéticos e não genéticos. Por isso, é de grande importância investigar sobre as associações existentes entre as alterações genéticas, o envelhecimento e o ambiente para a compreensão das características próprias do processo de envelhecimento. O objetivo foi estudar a associação dos polimorfismos genéticos AKT1 G205T (rs1130214), AGTR1 A1166C (rs5186) e visfatina (rs4730153) com parâmetros de saúde (cognição, qualidade de vida, depressão, capacidade funcional, pressão arterial, perfil lipídico sanguíneo, glicemia e medidas antropométricas) em mulheres a partir de 50 anos de idade. A amostra foi composta por 97 mulheres (>= 50 anos) que tinham o interesse em se ingressar em programa de Educação Física na USP. Elas foram submetidas inicialmente a uma entrevista, na qual é aplicado o MEEM - critério de inclusão. Na sequência foram realizados testes físicos (sentar e levantar, FPMD e E, agilidade, caminhar 6 min, mãos nas contas e sentar e alcançar), aplicados questionários e houve coleta de sangue. Com relação ao polimorfismo da AKT1, o grupo GT/TT apresentou melhores resultados na massa corporal, índice de massa corporal e HDL-colesterol, e piores resultados em FPMD/E comparado com o genótipo GG. Em relação ao AGTR1, o genótipo AA exibiu melhores resultados comparado com o AC/CC nas variáveis de caminhada e atividade física moderada. Por fim, para a visfatina o grupo AA/AG apresentou melhores resultados em HDL e TG comparado com o genótipo GG. Dados desta natureza podem possibilitar a predição das variáveis de saúde de cada indivíduo que serão mais prejudicadas antes dele envelhecer e, consequentemente, planejar intervenções específicas que previnam estes declínios / The aging process is marked by many different experiences and experiences can bring their own morphological and physiological changes of aging. These changes occur because the arrangement of cellular and molecular components, which are controlled by genetic and nongenetic factors. So it is of great importance investigate the associations between the genetic changes, aging and the environment to understanding the very physical characteristics of the aging process. The objective was to study the association of polymorphisms AKT1 G205T (rs1130214), AGTR1 A1166C (rs5186) and visfatin (rs4730153) with health parameters (cognition, quality of life, depression, functional capacity, blood pressure, blood lipids, blood glucose and measures anthropometric) in women over 50 years of age. The sample consisted of 97 women (>= 50 years) who had an interest in joining the OFW - EEFERP - USP. These were initially submitted to an interview, in which the MMSE is applied - inclusion criteria after was carried out physical tests (sitting and standing, LDCF and E, agility, walk 6 min, hands on the bills and sit and reach), application questionnaires and blood collection. Regarding the polymorphism AKT1, the GT / TT genotype showed better results in body mass, body mass index and HDL-cholesterol and worst results LDCF / E compared to the GG genotype in AGTR1 AA genotype showed better results compared with the AC/CC to variables of walking and moderate physical activity, in order to visfatin AA/AG genotype showed better results in HDL and TG compared with the GG genotype. Through presented associations we observed existing relationships and new partnerships in health variables

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 2001. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 75-83).

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 2003. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 105-118).