A expressão aumentada de GSK3b em pacientes da doença de Alzheimer (DA), aparentemente está relacionada com a formação de placas senis e emaranhados neurofibrilares. Utilizamos qPCR para avaliar os efeitos do lítio sobre os níveis do mRNA de GSK3a e GSK3b em culturas primárias de neurônios corticais e hipocampais de rato tratados com lítio. Nossos resultados, sugeriram que lítio é capaz de reduzir os níveis de mRNA de Gsk3b hipocampal de modo específico e dose-dependente. Estes dados foram subsequentemente comprovados in vivo em amostras cerebrais de ratos tratados com LiCl. Utilizamos hibridização subtrativa de cDNA e eletroforese bidimensional de culturas de neurônios hipocampais tratados com o lítio. Nossos estudos sugeriram a expressão diferencial de 88 genes, além de oito proteínas com cerca de 50% de alteração de expressão. Estas observações sugerem novos efeitos regulatórios do lítio sobre GSK3b e fornecem potenciais alvos da ação do lítio. / The increased systemic expression of active GSK3b in Alzheimers disease (AD) patients apparently is associated with the formation of senile plaques and neurofibrillary tangles, the hallmarks of this disease. In this study we used qPCR to evaluate the transcriptional regulation of GSK3a and GSK3b in lithium-treated primary cultures of rat cortical and hippocampal neurons. We found a significant and dose-dependent reduction in the mRNA levels of GSK3b, which was specific to hippocampus. This same effect was further confirmed in vivo by measuring GSK3 expression in different brain regions of adult rats treated with lithium. We used subtractive hybridizations and two-dimensional electrophoresis patterns of culture of hippocampus neurons treated with lithium. Our study suggested 88 genes differently expressed besides 8 proteins identified with variation expression. These observations suggest new regulatory effects of lithium over GSK3b and suggesting new potential lithium action targets.

O valor nutricional do milho é limitado devido ao seu alto conteúdo de proteínas de reserva (zeínas), que são deficientes em aminoácidos essenciais como lisina e triptofano. Por esse motivo, a Embrapa (Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária) desenvolveu a variedade de milho BR473, que tem um excelente valor energético e um maior conteúdo protéico quando comparado ao milho comum. Tal variedade possui 0,9 e 4,0 g/kg de grão de triptofano e lisina, respectivamente, contra 0,6 e 2,6 do milho comum. O alto conteúdo de lisina em algumas variedades de milho como a opaco-2 (o2), por exemplo, é relacionado à presença de proteínas não-zeínas. Para identificar essas proteínas, o que poderia explicar o alto conteúdo protéico da variedade BR473, foi analisado o proteoma dos corpos protéicos dos grãos desse milho. Para tal, foram usadas e avaliadas as cromatografias uni e bidimensional, acopladas a espectrometria de massas (LC-MS/MS e LC/LC-MS/MS), uma vez que tais técnicas se tornaram ferramentas poderosas para seqüenciamento e identificação de proteínas. Neste trabalho, foram identificadas seis proteínas por LC-MS/MS e dezesseis proteínas por LC/LC-MS/MS. / The nutritional value of maize seed is limited due to its high content of zeins (storage proteins), which are deficient in essential amino acids as lysine and tryptophan. Because of this, Embrapa (Brazilian Agricultural Research Corporation) developed the BR 473 maize variety, which has excellent energetic value and higher proteic content than the normal maize. BR 473 maize variety has 0.9 and 4.0 g/kg of grain of tryptophan and lysine, respectively, against the 0.6 and 2.6 from normal maize. The high lysine content in some maize varieties as opaque-2 (o2), for example, has been related to the presence of non-zein proteins. In order to identify them, which could explain the high proteic content of BR 473 maize variety, the protein bodies proteome of these grains were analyzed. For this purpose, one and two-dimensional liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (LC-MS/MS and LC/LC-MS/MS) were used and evaluated, since these techniques have become a powerful tool for protein sequencing and identification. We have identified six proteins by LC-MS/MS and sixteen proteins by LC/LC-MS/MS.

Submitted by PPG Zoologia (zoologia-pg@pucrs.br) on 2017-12-15T11:05:20Z No. of bitstreams: 1 Versao Final Tese Oso?rio, Joana.pdf: 10763697 bytes, checksum: 9f6c3be8f4dc2a159d6a919f99d8d23f (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-12-19T19:10:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Versao Final Tese Oso?rio, Joana.pdf: 10763697 bytes, checksum: 9f6c3be8f4dc2a159d6a919f99d8d23f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-19T19:16:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Versao Final Tese Oso?rio, Joana.pdf: 10763697 bytes, checksum: 9f6c3be8f4dc2a159d6a919f99d8d23f (MD5) Previous issue date: 2017-08-18 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Angiostrongylus cantonensis and A. costaricensis can accidentally infect humans causing eosinophilic meningitis and abdominal angiostrongyliasis, respectively. Both species have several mollusks as intermediate hosts. Diagnosing the infection requires killing the mollusks, interfering in conservational and population dynamics studies. This work had the objective to demonstrate possible biological markers in infected intermediate hosts, as well as to investigate specific factors related to the parasite-host relationship of mollusks and Angiostrongylus parasites. Mollusks of the Veronicellidae family were infected with A. cantonensis L1. Mucus and feces from these infected and uninfected animals were used for differential expression analysis of proteins using mass spectrometry and the microbiome profile analysis was performed through the 16S gene sequencing, respectively. LC-MS/MS spectrometry analysis showed an increase in F-BAR proteins subfamily and a decrease in the elongation factor of Mycoplasma spp. Microbiome of feces from infected slugs presented a decrease of the Bacteroidetes phylum. We have also analyzed the microbiome profile of Biomphalaria glabrata feces infected with A. cantonensis and Schistosoma mansoni. We could observe a decrease of Vogesella genus. When infected with S. mansoni, a reduction of Mycoplasma and Nitrospira genera and an increase in Niabella genus could be demonstrated. In both infections, decrease of Fluviicola genus and increase of organisms of the Weeksellaceae family were significant. Our results showed that proteins and microorganisms could be promising biomarkers of A. cantonensis infection in intermediate hosts in vivo. During the collection of the mollusks, the invasive species Meghimatium pictum infected with A. costaricensis was found, associated to a case of abdominal angiostrongyliasis, reported in this thesis. Parallel to this study, the postures of Limax sp. and Phyllocaulis sp. were registered to investigate the embryogenesis of these animals. In postures and in decomposing mollusks, mites of the species Caloglyphus berlesei were also identified and this association was observed for the first time. / Angiostrongylus cantonensis e A. costaricensis podem infectar o ser humano acidentalmente causando a meningite eosinof?lica e a angiostrongil?ase abdominal, respectivamente. Ambos possuem diversas esp?cies de moluscos como hospedeiros intermedi?rios. O diagn?stico da infec??o requer a morte destes moluscos, interferindo em estudos de conserva??o e din?mica populacional. Este trabalho teve como objetivo principal encontrar poss?veis marcadores biol?gicos para a infec??o de hospedeiros intermedi?rios, bem como investigar fatores relacionados a rela??o parasito-hospedeiro entre moluscos e Angiostrongylus cantonensis. Exemplares de Phyllocaulis sp. foram infectados com larva de primeiro est?dio de A. cantonensis. O muco e fezes destes animais infectados e n?o infectados foram utilizados para an?lise de express?o diferencial de prote?nas por espectrometria de massas e an?lise do perfil do microbioma por sequenciamento do gene ribossomal 16S, respectivamente. As an?lises de espectrometria por LC-MS/MS mostraram um aumento das prote?nas da subfam?lia F-BAR e diminui??o do fator de alongamento de Mycoplasma spp. O microbioma das fezes de lesmas infectadas apresentou uma diminui??o do filo Bacteroidetes. Tamb?m foram analisados o perfil do microbioma de fezes de Biomphalaria glabrata infectadas com A. cantonensis e Schistosoma mansoni. Nas fezes de caramujos infectados com A. cantonensis foram observados uma diminui??o do g?nero Vogesella; J? quando infectados com S. mansoni, houve redu??o dos g?neros Mycoplasma e Nitrospira e aumento de Niabella. Em ambas as infec??es, a diminui??o de Fluviicola e o aumento de organismos da fam?lia Weeksellaceae foram significativos. Estes resultados mostram que prote?nas e microorganismos s?o promissores biomarcadores da infec??o de A. cantonensis em hospedeiros intermedi?rios, objetivando o desenvolvimento de m?todos diagn?sticos in vivo. Durante as coletas de moluscos, foi encontrada, pela primeira vez, a esp?cie invasora Meghimatium pictum infectada com A. costaricensis associada a um caso de Angiostrongil?ase abdominal, relato que comp?e essa tese. Paralelamente a este estudo, foram acompanhadas as posturas de Limax sp. e Phyllocaulis sp. durante o desenvolvimento embrion?rio, com o objetivo de registrar e investigar a embriog?nese destes hospedeiros. Nas posturas e em moluscos em decomposi??o, foram identificados ?caros da esp?cie Caloglyphus berlesei, em associa??o observada pela primeira vez.

As interações entre as plantas cultivadas e os outros organismos do agroecossistema podem afetar as características dos alimentos, trazendo implicações que abrangem desde as condições socioeconômicas dos produtores até a qualidade nutricional e sensorial dos produtos agrícolas. No caso de agroecossistemas equilibrados, a conservação da biodiversidade na propriedade contribui para diminuir a dependência de insumos externos, principalmente para o controle de pragas e doenças. Nesse sentido a produção de bananas no Vale do Ribeira constitui um mosaico de agroecossistemas, que pressionam os maiores e mais conservados remanescentes florestais de Mata Atlântica. A banana é um fruto climatérico típico, que mostrou grande potencial para o presente estudo, primeiro por ter boa parte de seus processos bioquímicos parcialmente elucidados, segundo, por apresentar seu genoma sequenciado e, terceiro, por ser um cultivo que permeia as áreas de Mata Atlântica do Vale do Ribeira. A perspectiva de análise do Proteoma label-free do fruto foi escolhida por sua ampla capacidade de compreensão de respostas biológicas, especialmente em delineamentos experimentais inéditos como esse, onde não é possível fazer grandes especulações acerca da resposta esperada. Dessa forma, inserido a um projeto de objetivo mais amplo, o objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da biodiversidade atlântica no entorno do agroecossistema sobre a expressão de proteínas das bananas, considerando os aspectos físico-químicos, fisiológicos e bioquímicos, de modo a estimar as vias metabólicas influenciadas por esta condição ambiental. O projeto foi desenvolvido a partir da comparação de duas áreas comerciais de bananicultura que possuem idade e tratos culturais idênticos, sendo que a única diferença é que uma delas encontra-se cercada exclusivamente pelo monocultivo de bananeiras (parcela Controle) e a outra possui 60% do perímetro adjacente a um fragmento de Mata Atlântica (parcela Biodiversidade). Foi utilizada uma estratégia holística, contemplando diversos fatores do ambiente (fertilidade do solo e aspectos climáticos), da fisiologia da bananeira (diagnose foliar e infestação por doenças) e da banana (aspectos de qualidade, comportamento pós-colheita e proteoma da polpa). Os resultados mostram que as plantas da parcela biodiversidade apresentaram menor Índice de Severidade de Sigatoka Negra e produziram frutos com maior vida verde. Em relação ao Proteoma, as vias do Ciclo do ácido cítrico, do Metabolismo do piruvato e da Alanina, aspartato e glutamato foram as mais alteradas entre os frutos das duas parcelas, sinalizando uma maior tendência na síntese de ácidos graxos nos frutos da parcela Biodiversidade, que parece ter sido desviada para a síntese de aminoácidos nos frutos da parcela Controle. Algumas evidências reunidas sugerem que a presença da biodiversidade da Mata Atlântica no entorno do agroecossistema favorece o restabelecimento da homeostase vegetal, trazendo efeitos benéficos para o cultivo e para o fruto. / Food quality is affected by crop and other agroecosystem organism interaction. These are a broad and diverse field of study, with unclear central issues, implying since socioeconomic condition of the producer, up to food quality, in terms of nutritional and sensorial issues. In this sense, banana production on Vale do Ribeira represents an agroecosystem mosaic, among the hugest and most conserved remaining Atlantic forest. Banana is a climacteric fruit with great potential for this study, firstly because its biochemical processes has been partially clarified, secondly, because its genome is already sequenced and, finally, because its cultivation area is surrounded by Atlantic forest areas from Vale do Ribeira. Proteomic label-free has been chosen, because of its great capability to understand biological response, especially in unprecedented experimental approaches, in which expectations cannot be done. Thereby, inserted on a broader project, the aim of this work was to evaluate the influence of Atlantic forest biodiversity surrounding the agroecosystem on protein expression of banana fruit, considering physic-chemical, physiological and biochemical aspects, in order to highlight metabolic pathways influenced by this environmental condition. The development of this project is based on the comparison of two banana commercial plots, with similar age and cultural practices, being the only difference between plots the presence of an Atlantic forest remanant on 60% of the Biodiversity plot, while the Control plot is exclusively surrounded by banana crop. It has been adopted an holistic approach, including several environmental factors (soil fertility and climatic factors), crop physiology factors (foliar diagnosis and disease severity) and banana fruit (quality attributes, post-harvest behavior and pulp proteome). Results revealed a reduction on disease severity and a longer fruit greenlife, which represents the time available to transport and marketing, for plants of the Biodiversity plot. The Proteome has shown alterations on metabolic pathways, as Citric acid cycle, Piruvate metabolism and Alanine, aspartate and glutamate metabolism, suggesting a greater tendency on fatty acid biosynthesis on fruits from Biodiversity plots, whereas fruits from Control plot seems to enhance amino acid biosynthesis. Some evidence suggest that the Atlantic forest surrounding the agroecosystem can be helpful to plant homeostasis, with benefits to the crop and fruit.

A evolução do veneno, uma das misturas mais complexas da natureza, tem sustentado o sucesso da diversificação de inúmeras linhagens de animais. Serpentes deslizantes ou medusas flutuantes utilizam o veneno, um coquetel de peptídeos farmacologicamente ativos, sais e moléculas orgânicas. Esses animais surpreendentes têm provocado grande fascínio ao longo da história humana. Nesta dissertação propomos um estudo da evolução dos venenos no filo Cnidaria, englobando dados proteômicos e genômicos. Este projeto teve como objetivos: (1) caracterizar e elucidar a evolução da composição do veneno em Cnidaria por meio da comparação de listas de proteínas; (2) testar a hipótese de que a variação na família de toxinas específica de cnidários tem sido o resultado de um regime de seleção positiva; e (3) determinar a extensão em que a duplicação de genes pode ser considerada como a principal razão para a diversificação de toxinas em Cnidaria. O capítulo \"Comparative proteomics reveals common components of a powerful arsenal in the earliest animal venomous lineage, the cnidarians\" propõe o estudo comparado mais completo sobre a composição do veneno de cnidários e uma hipótese sobre a montagem evolutiva do complexo arsenal bioquímico de cnidários e do veneno ancestral desse grupo basal. Vinte e oito famílias de proteínas foram identificadas. Destas, 13 famílias foram registradas pela primeira vez no proteoma de Cnidaria. Pelo menos 15 famílias de toxinas foram recrutadas no proteoma de veneno de cnidários antes da diversificação dos grupos Anthozoa e Medusozoa. Nos capítulos \"Evidence of episodic positive selection in the evolution of jellyfish toxins of the cnidarian venom\" e \"Gene duplications are extensive and contribute significantly to the toxic proteome of nematocysts isolated from Acropora digitifera (Cnidaria: Anthozoa: Scleractinia)\", nossas análises demonstram que as famílias de toxinas nos cnidários se diversificam amplamente mediante a duplicação de genes. Além disso, em contraste com as famílias de toxinas do veneno na maioria das linhagens animais; nós identificamos um padrão diferente na família de toxinas específica de cnidários, em que há uma seleção purificadora por longos períodos seguindo longos tempos de diversificação ou vice-versa / The evolution of venom, nature\'s most complex concoction, has underpinned the success and diversification of numerous animal lineages. Slithering serpents or buoyant jellyfishes employ venom, a cocktail of pharmacologically active peptides, salts, and organic molecules. These astonishing animals have generated a great fascination throughout human history. In this dissertation, we propose a study of the evolution of venoms in the phylum Cnidaria, encompassing proteomic and genomic data. This project aimed: (1) to characterize and elucidate the evolution of venom composition in Cnidaria by comparing protein lists; (2) to test the hypothesis that the variation in specific family of cnidarians toxins has been the result of a positive selection regime; and (3) to determine the extent to which the genes duplication may be regarded as the main reason for the diversity of toxins in Cnidaria. The chapter \"Comparative proteomics reveals common components of a powerful arsenal in the earliest animal venomous lineage, the cnidarians\" presents the most comprehensive comparative study on the cnidarians venom composition and a hypothesis about the evolutionary assembly of the complex biochemical arsenal of cnidarians and of the ancestral venom of this basal group. Twenty eight protein families were identified. Of these, 13 families were described for the first time in the proteome of Cnidaria. At least 15 types of toxin families were recruited in cnidarians venom proteome before the diversification of Anthozoa and Medusozoa groups. In the chapters \"Evidence of episodic positive selection in the evolution of jellyfish toxins of the cnidarian venom\" and \"Gene duplications are extensive and contribute significantly to the toxic proteome of nematocysts isolated from Acropora digitifera (Cnidaria: Anthozoa: Scleractinia)\", our analyses indicate that the families of toxins in cnidarians diversify broadly through gene duplication. Besides, in contrast to the families of venom toxins in most animals lineages, we identified a different pattern in the specific family of cnidarians toxins, where there is a purifying selection for periods long, followed by long periods of diversification or vice versa

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-26T11:14:58Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Paulo Henrique Rosa Martins - 2014.pdf: 1886835 bytes, checksum: cf3cb1538605c45883b5362030c74911 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-26T11:15:49Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Paulo Henrique Rosa Martins - 2014.pdf: 1886835 bytes, checksum: cf3cb1538605c45883b5362030c74911 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-26T11:15:49Z (GMT). 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Fungemia corresponds to isolation of fungi in the bloodstream and occurs mainly in immunocompromised patients. Yeasts have been increasingly present as etiological agents fungemia including Candida albicans and other species such as Candida non- albicans. In this study, Paracoccidioides spp. was isolated from a case of fungemia. So far this is the first molecular study of a case of fungemia caused by this fungus. In order to identify the molecular factors associated with this specific phenotype, a comparative proteomic analysis was performed. The samples were analyzed by nanoscale liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (nanoUPLC - EPM), where the soluble proteins of fungemia were compared with strain Pb01 -like proteins. 206 proteins regulated positively and negatively regulated 183 were identified. Among the positively regulated protein, 22 % were related to cellular metabolism, 15 % related to protein synthesis and 12% energy. Of phenotypic characterization tests, which showed a better adaptation of isolated Pb9840 blood were also conducted. With this work we propose that the isolated Pb9840 developed mechanisms to better installing the bloodstream and causing the fungemia. The study of the proteomic profile of this isolate may elucidate the virulence mechanisms used by this fungus during fungemia and / or hematogenous spread. / Paracoccidioides spp. são agentes etiológicos da Paracoccidioidomicose uma micose sistêmica que afeta cerca de 10 milhões de pessoas nas regiões endêmicas. A incidência da doença é restrita à América Latina e a maioria dos casos são encontrados no Brasil. A doença é caracterizada por uma inflamação granulomatosa crônica, e os pacientes podem apresentar um amplo espectro de manifestações clínicas. Após a inalação de conídios, ocorre a instalação do fungo nos pulmões, que posteriormente através de rota hematogenica pode causar uma infecção disseminada. Infecções fúngicas hematogênicas representam um grave problema de saúde, envolvendo pacientes hospitalizados com condições predisponentes que levam a uma alta taxa de mortalidade. Fungemia corresponde ao isolamento de fungos na corrente sanguínea e ocorre principalmente em pacientes imunossuprimidos. As leveduras têm sido cada vez mais presente como agentes etiológicos de fungemia, incluindo Candida albicans e outras espécies, como Candida não-albicans. No presente estudo, Paracoccidioides spp. foi isolado de um caso de fungemia. Até o momento esse é o primeiro estudo molecular de um caso de fungemia causado por este fungo. A fim de identificar os fatores moleculares associados a este fenótipo específico, uma análise proteômica comparativa foi realizada. As amostras foram analisadas por cromatografia líquida de nanoescala acoplada a espectrometria de massa em tandem (nanoUPLC - EPM), onde as proteínas solúveis da estirpe fungemia foram comparadas com proteínas do Pb01. Foram identificadas 206 proteinas reguladas positivamente e 183 reguladas negativamente. Dentre as proteínas reguladas positivamente 22% estavam relacionadas com o metabolismo celular, 15% relacionadas com síntese proteica e 12% produção de energia. Foram realizados também testes de caracterização fenotípica, que demonstraram uma melhor adaptação do isolado Pb9840 ao sangue. Com o presente trabalho podemos propor que o isolado Pb9840 desenvolveu mecanismos para melhor de instalar na corrente sanguínea e assim causar o quadro de fungemia. O estudo do perfil proteômico deste isolado poderá elucidar os mecanismos de virulência utilizados por este fungo durante fungemia e / ou disseminação hematogênica.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-09T13:39:32Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - André Luís Elias Moreira - 2014.pdf: 2397469 bytes, checksum: 4a631b1ca63986a489d7e4bec3dfe90c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-09T13:41:32Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - André Luís Elias Moreira - 2014.pdf: 2397469 bytes, checksum: 4a631b1ca63986a489d7e4bec3dfe90c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-09T13:41:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - André Luís Elias Moreira - 2014.pdf: 2397469 bytes, checksum: 4a631b1ca63986a489d7e4bec3dfe90c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-08-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The paracoccidioidomycosis (PCM) is a systemic disease caused by the thermo dimorphic fungus Paracoccidioides spp.. The route of infection of the PCM occurs by the inhalation of conidia or mycelia fragments. Until now, no proteomic studies were performed with conidia of Paracoccidioides sp. In this sense, characterize the proteome of the conidia, may contribute to the detailed knowledge of the proteins expressed during the propagation phase and their potential roles in virulence and pathogenicity, providing possible targets for antifungal strategies. For the conidia production, the mycelia of isolate Pb01 (ATCC MYA-826) were cultured in potato agar medium during 90 days at 18 ºC. After production, the conidias were collected and purified. The proteins were extracted and subjected to tryptic digestion with subsequent identification by NanoUPLC-MSE. We identified a total of 242 proteins of conidia of Paracoccidioides. The in silico analysis were used to characterize the proteins present in Paracoccidioides conidia. Proteins as GAPDH, enolase, triosephosphate isomerase, and some glycoproteins like ECM33 and β-1,3-glucanosyltransferase gel2 were identified during analysis. Some of these have been described as adhesins in Paracoccidioides and in other pathogenic fungi. Were also identified proteins related to signal transduction pathways, such as: Ras GTPase, RhoA GTPase and calmodulin, described in other fungi involved in morphologic changes. Proteins related to evasion, defense and virulence of the fungus, such as HSP90, catalase, mitochondrial peroxiredoxin Prx1, have been described with functions related to temperature shifts or oxidative stress provided by the host environment, were also identified. These results highlight that Paracoccidioides conidia contain proteins that can contribute to its maintenance in the environment and have molecules related to important processes necessary for the initial steps of infection in the host. / A paracoccidioidomicose (PCM) é uma micose sistêmica causada pelo fungo termodimórfico Paracoccidioides spp.. A principal rota de infecção da PCM ocorre por inalação de conídios ou fragmentos de micélio. Até o momento, estudos proteômicos não foram realizados com conídios de Paracoccidoides sp. Neste sentido, caracterizar o proteoma do conídio poderá contribuir para o conhecimento detalhado das proteínas expressas durante a fase de propagação e seus potenciais papéis na virulência e patogenicidade, fornecendo prováveis alvos para estratégias antifúngicas. Para a produção de conídios, o micélio do isolado Pb01 (ATCC MYA-826) foi cultivado em meio ágar batata durante 90 dias a 18 ºC. Após a produção, os conídios foram coletados e purificados. As proteínas foram extraídas e submetidas a digestão tríptica com subsequente identificação por NanoUPLC-MSE. Foram identificados um total de 242 proteínas de conídios de Paracoccidioides. As análises in silico foram utilizadas para caracterizar as proteínas presentes em conídios de Paracoccidioides. Proteínas como a GAPDH, enolase, triosefosfato isomerase e algumas glicoproteínas como ECM33 e β-1,3-glicanosiltransferase Gel2 foram identificadas durante as análises. Algumas destas já foram descritas como adesinas em Paracoccidioides e em outros fungos patogênicos. Também foram identificadas proteínas relacionadas as vias de transdução de sinais, tais como: Ras GTPase, RhoA GTPase e calmodulina, descritas em outros fungos envolvidas em alterações morfológicas. Proteínas relacionadas à evasão, defesa e virulência do fungo, tais como HSP90, catalase B, peroxiredoxina mitocondrial Prx1, foram descritos com funções relacionadas a mudanças de temperatura ou estresse oxidativo proporcionado pelo ambiente hospedeiro, também foram identificados. Esses resultados demonstram que o conídio de Paracoccidioides contem proteínas que podem contribuir para sua manutenção no meio ambiente e possuem moléculas relacionadas a processos importantes necessários para os passos iniciais da infecção no hospedeiro.

As toxinas de veneno de serpentes têm como principal função alterar a homeostase das presas para fins de alimentação ou defesa. O estudo aprofundado da composição do veneno de serpentes é importante para a produção de soros antiofídicos mais eficientes, para a descoberta de novos fármacos e na compreensão de processos biológicos, ecológicos e evolutivos. As pesquisas com toxinas têm mostrado uma versatilidade natural, refinada pela evolução, na diversificação de funções em famílias de proteínas recrutadas de suas funções endógenas, por meio de sucessivas duplicações e acumulo de mutações levando a uma evolução acelerada. A miríade de toxinas disponíveis e sua diversidade de funções ainda não foram completamente descritas. A combinação das análises em larga escala do transcriptoma de novo da glândula de veneno e do proteoma do veneno permite elaborar um perfil mais completo do toxinoma do veneno, permitindo inclusive um aumento na sensibilidade da detecção de toxinas pouco representadas e inesperadas nos venenos. O objetivo geral deste estudo foi analisar o toxinoma do veneno de uma das mais perigosas espécies australianas, a Pseudonaja textilis (Elapidae). Foi possível identificar no veneno as toxinas: fatores de coagulação de veneno do complexo protrombinase, subunidades de fosfolipases A2 (PLA2) da neurotoxina textilotoxin e PLA2 de atividade procoagulante, neurotoxinas tipo three-finger toxin (3FTx), inibidores de protease do tipo-kunitz textilinin, e pela primeira vez, uma nova variante de 3FTx, lectinas tipo C, CRiSP além de indícios de toxinas de lagarto Heloderma e outras proteínas candidatas a toxinas como calreticulin e dipeptidase 2. Metaloproteinases, pouco estudadas em Elapidae, foram clonadas e detectadas no veneno por ensaios de fracionamento e imunoreatividade. A análise do transcriptoma identificou novas isoformas e variantes de toxinas, principalmente das 3FTx e dos inibidores de serinoproteases, assim como transcritos de toxinas que não foram detectadas no veneno e que merecem mais investigações. O quadro de sintomas com acidentes em humanos é bem explicado pelas toxinas identificadas, porém, em seu habitat natural, as toxinas pouco conhecidas e até então não descritas devem ter funções importantes e específicas na predação. Identificar esta diversidade de variantes é importante para entender o modo de ação das toxinas. / Snake venom toxins alter prey homeostasis for feeding or defense. In depth studies of venom composition are important for better antivenom production, for new drugs lead and discovery and for better understanding of biological, ecological and evolutionary processes. Research on toxins have shown the natures way of innovating, refined by evolution, diversifying functions of protein families recruited from their endogenous function to the venom gland by successive gene duplication and mutation accumulation, leading to an accelerated evolution. A myriad of available toxins and diversity of functions is still available for discovery. Combining high throughput techniques such as venom gland de novo transcriptomics and venom proteomics, one can assess and observe a more complete profile of the snake toxinome, additionally allowing an upscale in low represented and unexpected toxin detection. The aim of this project was to investigate the venom toxinome of one of the most dangerous Australian species, Pseudonaja textilis (Elapidae). The toxins identified in it venom was: protrombinase complex coagulation factors, neurotoxic textilotoxin phospholipase A2 (PLA2) subunits and procoagulant PLA2, neurotoxic three-finger toxins (3FTx), Kunitz-type protease inhibitor textilinin, and for the first time, a new long 3FTx, C-type lectins, CRiSPs, as well as evidences of lizard toxins from Heloderma genus and other toxin candidates calreticulin and dipeptidase 2. Metalloproteinases, little investigated in Elapidae, was cloned and detected in the venom after fractionation and immunoassay. The transcriptome revealed new toxin variants and isoforms, specially 3FTx and serine protease inhibitors, as well as transcripts from toxins not detected in the venom that deserves further investigation. Human accident symptoms are well explained by the identified toxins, however, in its natural environment, little known and undescribed toxins must have specific and important role in predation. Identifying this diversity is important to better understand toxins ways of action.

As toxinas de veneno de serpentes têm como principal função alterar a homeostase das presas para fins de alimentação ou defesa. O estudo aprofundado da composição do veneno de serpentes é importante para a produção de soros antiofídicos mais eficientes, para a descoberta de novos fármacos e na compreensão de processos biológicos, ecológicos e evolutivos. As pesquisas com toxinas têm mostrado uma versatilidade natural, refinada pela evolução, na diversificação de funções em famílias de proteínas recrutadas de suas funções endógenas, por meio de sucessivas duplicações e acumulo de mutações levando a uma evolução acelerada. A miríade de toxinas disponíveis e sua diversidade de funções ainda não foram completamente descritas. A combinação das análises em larga escala do transcriptoma de novo da glândula de veneno e do proteoma do veneno permite elaborar um perfil mais completo do toxinoma do veneno, permitindo inclusive um aumento na sensibilidade da detecção de toxinas pouco representadas e inesperadas nos venenos. O objetivo geral deste estudo foi analisar o toxinoma do veneno de uma das mais perigosas espécies australianas, a Pseudonaja textilis (Elapidae). Foi possível identificar no veneno as toxinas: fatores de coagulação de veneno do complexo protrombinase, subunidades de fosfolipases A2 (PLA2) da neurotoxina textilotoxin e PLA2 de atividade procoagulante, neurotoxinas tipo three-finger toxin (3FTx), inibidores de protease do tipo-kunitz textilinin, e pela primeira vez, uma nova variante de 3FTx, lectinas tipo C, CRiSP além de indícios de toxinas de lagarto Heloderma e outras proteínas candidatas a toxinas como calreticulin e dipeptidase 2. Metaloproteinases, pouco estudadas em Elapidae, foram clonadas e detectadas no veneno por ensaios de fracionamento e imunoreatividade. A análise do transcriptoma identificou novas isoformas e variantes de toxinas, principalmente das 3FTx e dos inibidores de serinoproteases, assim como transcritos de toxinas que não foram detectadas no veneno e que merecem mais investigações. O quadro de sintomas com acidentes em humanos é bem explicado pelas toxinas identificadas, porém, em seu habitat natural, as toxinas pouco conhecidas e até então não descritas devem ter funções importantes e específicas na predação. Identificar esta diversidade de variantes é importante para entender o modo de ação das toxinas. / Snake venom toxins alter prey homeostasis for feeding or defense. In depth studies of venom composition are important for better antivenom production, for new drugs lead and discovery and for better understanding of biological, ecological and evolutionary processes. Research on toxins have shown the natures way of innovating, refined by evolution, diversifying functions of protein families recruited from their endogenous function to the venom gland by successive gene duplication and mutation accumulation, leading to an accelerated evolution. A myriad of available toxins and diversity of functions is still available for discovery. Combining high throughput techniques such as venom gland de novo transcriptomics and venom proteomics, one can assess and observe a more complete profile of the snake toxinome, additionally allowing an upscale in low represented and unexpected toxin detection. The aim of this project was to investigate the venom toxinome of one of the most dangerous Australian species, Pseudonaja textilis (Elapidae). The toxins identified in it venom was: protrombinase complex coagulation factors, neurotoxic textilotoxin phospholipase A2 (PLA2) subunits and procoagulant PLA2, neurotoxic three-finger toxins (3FTx), Kunitz-type protease inhibitor textilinin, and for the first time, a new long 3FTx, C-type lectins, CRiSPs, as well as evidences of lizard toxins from Heloderma genus and other toxin candidates calreticulin and dipeptidase 2. Metalloproteinases, little investigated in Elapidae, was cloned and detected in the venom after fractionation and immunoassay. The transcriptome revealed new toxin variants and isoforms, specially 3FTx and serine protease inhibitors, as well as transcripts from toxins not detected in the venom that deserves further investigation. Human accident symptoms are well explained by the identified toxins, however, in its natural environment, little known and undescribed toxins must have specific and important role in predation. Identifying this diversity is important to better understand toxins ways of action.

O chumbo (Pb) é um metal pesado que pode ocasionar alterações em todos os sistemas. Porém os maiores danos à saúde ocorrem quando este acomete o sistema nervoso central (SNC). Muitos estudos demonstram as alterações clinicas/comportamentais causadas pela ação do Pb no SNC. Entretanto, ainda são necessários estudos que demonstrem as alterações bioquímicas causadas pelo Pb neste sistema. Por outro lado, tem sido relatado que o ferro (Fe) parece ter um efeito protetor na toxicidade cerebral causada pelo Pb. Assim, o objetivo deste estudo foi analisar a concentração de Pb no tecido cerebral, bem como realizar análise proteômica em cérebro de ratos intoxicados por Pb, submetidos à suplementação com Fe ou não. O experimento foi realizado com 30 ratos recém-desmamados (Rattus norvegicus, variedade Wistar) divididos em 6 grupos (n=5/grupo), de acordo com o tratamento recebido por 6 semanas, a saber: Controle (não exposto ao Pb ou Fe), Controle Fe (exposto à administração de 20 mg/Kg p.c. de FeSO4 a cada 2 dias, por gavagem gástrica), Pb 100 (exposto à água contendo 100 mg/L de Pb), Pb 400 (exposto à água contendo 400 mg/L de Pb) Pb100 + Fe (exposto à água contendo 100 mg/L de Pb e à gavagem com FeSO4) e Pb400 + Fe (exposto à água contendo 400 mg/L de Pb e à gavagem com FeSO4). Decorrido o período experimental, os animais foram eutanasiados e o cérebro dos animais foi removido, sendo descartados o cerebelo e o tronco encefálico. O restante foi submetido à concentração de Pb e à análise proteômica. Foi observada uma dose-resposta em relação à concentração de Pb no cérebro. A administração de FeSO4 reduziu os níveis de Pb no cérebro, embora sem significância estatística. A análise dos géis com os spots proteicos demonstrou uma redução na quantidade destes de acordo com o tratamento recebido pelos grupos. O grupo controle mostrou a maior quantidade de spots, ao passo que os grupos que receberam a maior concentração de Pb (400 mg/L) apresentaram as menores quantidade de spots. Também houve uma diminuição na quantidade de spots detectados quando administrado FeSO4. Dos spots que apresentaram diferença de expressão nas comparações entre o grupo controle e os grupos experimentais e os grupos experimentais comparados aos seus pares suplementados ou não com FeSO4, 75 proteínas foram identificadas por espectrometria de massas, sendo 20 proteínas (26,0%) relacionadas à função de metabolismo, 21 proteínas (28,0%) relacionadas a estrutura e organização das estruturas, 22 proteínas (30,0%) relacionadas à função de processos celulares, nove proteínas (12,0%) relacionadas às vias de informação e três proteínas (4,0%) pertencentes à categoria miscelânea. A expressão das proteínas dimunuiu na maioria das vezes, para todas as classificações funcionais. O presente estudo, associado a achados anteriores, aponta para um papel deletério do Pb no córtex cerebral dos animais expostos a este metal, independente da concentração utilizada, não sendo possível observar um efeito protetor do FeSO4. Este processo parece ser mediado por proteínas como Gamma-enolase, Alpha-internexin, várias isoformas de 14-3-3 e Homer protein homolog 1. / Lead (Pb) is a heavy metal that may yield changes in all body systems, yet the greatest health damages occur when it affects the central nervous system (CNS). Many studies demonstrate the clinical/behavioral changes caused by the action of Pb on the CNS. However, studies are necessary to demonstrate the biochemical changes caused by Pb in this system. Conversely, it has been reported that iron (Fe) seems to play a protective role on the brain toxicity caused by Pb. Therefore, this study analyzed the concentration of Pb in the brain tissue, and conducted proteomic analysis in the brain of rats intoxicated by Pb, submitted or not to Fe supplementation. The study was conducted on 30 weaning rats (Rattus norvegicus, Wistar type) divided in 6 groups (n=5/group), according to the treatment established for 6 weeks, as follows: Control (not exposed to Pb or Fe), Control Fe (exposed to administration of 20 mg/Kg p.c. of FeSO4 at every 2 days, by gastric gavage), Pb 100 exposed to water containing 100 mg/L of Pb), Pb 400 (exposed to water containing 400 mg/L of Pb) Pb100 + Fe (exposed to water containing 100 mg/L of Pb and gavage with FeSO4) and Pb400 + Fe (exposed to water containing 400 mg/L of Pb and gavage with FeSO4). After the experimental period, the animals were killed and the brains of animals were removed, discarding the cerebellum and brainstem. The remaining structure was submitted to analysis of Pb concentration and proteomic analysis. A dose-response relationship was observed in Pb concentration in the brain. The administration of FeSO4 reduced the levels of Pb in the brain, though without statistical significance. The analysis of gels with proteic spots demonstrated reduction in their quantity according to the treatment performed in the groups. The control group exhibited greater concentration of spots, while groups receiving higher Pb concentration (400 mg/L) presented the lowest quantity of spots. There was also reduction in the quantity of spots detected when FeSO4 was administered. Among the spots presented different expression in the comparisons between the control group and experimental groups and between the experimental groups and their counterparts supplemented or not with FeSO4, 75 proteins were identified by mass spectrometry, being 20 proteins (26.0%) related to metabolic functions, 21 proteins (28.0%) related to structure and organization of structures, 22 proteins (30.0%) related to cell functions and processes, nine proteins (12.0%) related to information pathways and three proteins (4.0%) from the miscellaneous category. The expression of proteins was reduced in most cases, for all functional classifications. The present study, combined to previous findings, indicates a harmful effect of Pb in the cerebral cortex of animals exposed to this metal, regardless of the concentration employed, without observation of a protective effect of FeSO4. This process seems to be mediated by proteins as Gamma-enolase, Alpha-internexin, several isoforms of 14-3-3 and Homer protein homolog 1.