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Diversidade, estrutura e relação genética de porta-enxertos de Prunus avaliados pela análise de caracteres morfológicos e de loci SSR / Diversity, structure and genetic relationship of Prunus rootstocks evaluated by analysis of morphological characters and SSR loci

Arge, Luis Willian Pacheco 31 August 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_luis_willian_pacheco_arge.pdf: 2893589 bytes, checksum: d2e275d77781d5e9508058a77fa20f96 (MD5) Previous issue date: 2012-08-31 / This study aimed to assess the diversity, structure and the genetic relationship, evaluated by phenotypic and molecular of 75 Prunus rootstocks collection belonging to EMBRAPA Clima Temperado. The phenotypic analyzes were conducted by the evaluation of 21 qualitative and 26 quantitative traits of different plant organs and molecular analyzes were based on evaluation of 17 SSR loci. The data of quantitative traits were categorized by Scott & Knott method and submitted along with the qualitative data to statistical analysis (hierarchical by Jaccard coefficient) and clustering of phenotypic relationship. Molecular data were first converted to different formats and subjected to various statistical analyzes. The UPGMA dendogram obtained by genetic distance matrix calculated by Li & Nei coefficient, using the data of SSR loci evaluated was not able to distinguish between Tsukuba-1, Tsukuba-2 and Tsukuba-3 accesses, however, showed phenotypic effective to distinguish them. The dendograms of both analyzes together with the results of Bayesian approaches allowed the identification of three pools with high relation with the different groups that make up the collection. It was found that principal coordinates analysis based on phenotypic data, proved most effective for the detection of three pools detected with the hierarchical and the Bayesian approach. With the molecular data, the principal coordinates analysis corroborated with results obtained by the dendogram and the Bayesian approach. The access of group South Brazilian originating from samples collected in orchards in the region of Pelotas, which have no known pedigree, had largely down genetic and phenotypic distance, low 0.49 per both analyzes, with Aldrighi and Capdeboscq, and other known access. These accesses were traditionally used in the past as rootstocks in the state of Rio Grande do Sul. For both phenotypic and molecular analyzes, the group access of other species contributed more to genetic and phenotypic diversity, as expected, because are different species and with low similarity of features. Phenotypic and genetic characterization proved effective for elucidating the diversity, structure and genetic, and phenotypic relationship of the rootstocks of Prunus collection. / O presente trabalho objetivou avaliar a diversidade, estrutura e relação genética, por avaliação molecular, e fenotípica de uma coleção de 75 acessos de porta-enxertos de Prunus da EMBRAPA Clima Temperado. As análises fenotípicas foram conduzidas com a avaliação de 21 caracteres qualitativos e 26 quantitativos de diferentes órgãos das plantas, e as análises moleculares foram baseadas na avaliação de 17 loci SSR. Os dados dos caracteres quantitativos foram categorizados pelo método de agrupamento Scott & Knott e submetidos juntamente com os dados qualitativos às análises estatísticas de agrupamento (hierárquica pelo coeficiente de Jaccard) e de relação fenotípica. Os dados moleculares foram convertidos primeiramente para diferentes formatos e submetidos às diferentes análises estatísticas. O dendograma UPGMA obtido a partir da matriz de distância genética calculada pelo coeficiente Nei & Li, utilizando os dados dos loci SSR, não foi capaz de distinguir os acessos Tsukuba-1, Tsukuba-2 e Tsukuba-3, no entanto, os dados fenotípicos mostraram-se eficazes para distingui-los. Os dendograma de ambas as análises, juntamente com a abordagem Bayesiana, possibilitaram a identificação de três pools, com alta relação com os diferentes grupos que compõem a coleção. Verificou-se que análise de coordenadas principais, baseada em dados fenotípicos, mostrou-se mais eficaz para a detecção dos três pools detectados com as abordagens hierárquica e Bayesiana. Com os dados moleculares, a análise de coordenadas principais corroborou parcialmente com os resultados obtidos pelo dendograma e pela análise Bayesiana. Os acessos do grupo sul-brasileiro originários de coletas realizadas em pomares da região de Pelotas, os quais não possuem genealogia conhecida, apresentaram em grande parte baixa distância genética e fenotípica, abaixo de 0,49 por ambas as análises, em relação aos acessos Aldrighi e Capdeboscq. Estes acessos foram tradicionalmente usados no passado como porta-enxertos no estado do Rio Grande do Sul. Por ambas as análises, fenotípicas e moleculares, o grupo de acessos de outras espécies foi nalmente quem mais contribuiu para a diversidade genética e fenotípica, como já era esperado, pois são espécies distintas e com baixa similaridade de características. A caracterização genética por ambas as técnicas de análise mostrou-se efetiva para a elucidação da diversidade, estrutura e relação genética e fenotípica da coleção de porta-enxertos de Prunus avaliada.
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Propagação in vitro de portaenxertos de pessegueiro Flordaguard e GxN-9 / In vitro propagation of peach rootstock Flordaguard and GxN-9

Ritterbusch, Cristina Weiser 28 March 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:59:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_cristina_weiser_ritterbusch.pdf: 604233 bytes, checksum: 5374bd6e31ea3d7edf5bc18907609c55 (MD5) Previous issue date: 2013-03-28 / The fruitful lump such as peaches, has shown annual growth of both production and consumption in Brazil and Rio Grande do Sul (RS) the leading national producer. However compared to other Brazilian states productivity in RS is considered low and one of the factors is the lack of genetic quality and health of propagation material. This is due in part to the means of acquiring rootstocks, which are derived from discarded lumps by canning industries, among other factors causing imbalance between plants in the orchard. Thus vegetative propagation from the micropropagation constitutes an alternative multiplication of rootstocks, obtaining a large number of plants in a short period of time compared with the traditional method used. Thus developing protocols for vegetative propagation may contribute to the process of producing seedlings prunaceas in southern Brazil. Therefore, the aim of this study was to optimize the in vitro multiplication rootstocks' Flordaguard 'and' GxN-9 'and in vitro rooting and acclimatization of shoots from the rooting medium with the rootstock' GxN-9 '. To this end, the work was divided into two chapters, one on the in vitro multiplication of rootstock "Flordaguard 'and the second concerning the multiplication, rooting and acclimatization of the rootstock' GxN-9 '. In the first chapter means were tested MS (1/2N) and Himedia, type and orientation of the explant and the concentration of BA. In the second chapter aimed to evaluate the effect of the concentration of cytokinins (BA and KIN) and the source and amount of carbohydrate in the multiplication phase, the influence of IBA concentration on rooting and acclimatization of plants. To rootstock 'Flordaguard' MS medium (1/2N) was superior to Himedia both to number of shoots per explant for growth as these. The growth of the sprout was highest in semi-solid medium with a liquid medium in comparison with semi-solid medium without liquid medium. However the type and orientation of the explant did not influence the number and length of shoots formed. For BA concentration, 3 mg L-1 induces greater number of shoots (4.02) but the greatest growth (1.85) of shoots occurred until the concentration of 0.5 mg L-1 BA. In the multiplication of 'GxN-9' explants cultured in medium containing 0.4 mg L-1 BA have the highest number of shoots the largest growth was achieved at concentrations of 0.2 mg L-1 BA + 0.2 mg L-1 KIN (0.72). Now, as to the source and concentration of carbohydrate, 30 g L-1 sucrose is sufficient for the greatest number of shoots. As regards à rooting phase in vitro and acclimatization induction, shoots cultivated in culture medium with 1.2 mg L-1 IBA, they had 100% rooting, well as of plants survivors in the phase of acclimatization. / As frutíferas de caroço, como o pessegueiro, vem apresentando expansão anual tanto da produção quanto do consumo no Brasil, sendo o Rio Grande do Sul (RS) o principal produtor nacional. No entanto, comparando com outros Estados brasileiros, a produtividade no RS é considerada baixa, sendo que um dos fatores é a falta de qualidade genética e sanitária do material propagativo. Isso deve-se em parte a forma de obtenção dos portaenxertos, os quais são oriundos de caroços descartados pelas indústrias de conserva, gerando entre outros fatores desuniformidade entre plantas no pomar. Sendo assim a propagação vegetativa a partir da micropropagação constitui-se em uma alternativa de multiplicação dos portaenxertos, obtendo uma grande quantidade de plantas num período curto de tempo em comparação com o método tradicional utilizado. Assim, desenvolver protocolos de propagação vegetativa poderá contribuir no processo de produção de mudas de prunaceas na região Sul do Brasil. O objetivo do presente trabalho foi otimizar a propagação in vitro dos portaenxertos Flordaguard e GxN-9 . Para tal, o trabalho foi dividido em dois capítulos, um sobre a multiplicação in vitro do portaenxerto Flordaguard e o segundo referente a multiplicação, enraizamento in vitro e aclimatização do portaenxerto GxN-9 . No primeiro capítulo foram testados os meios MS (1/2N) e Himedia, o tipo e a orientação do explante, bem como a concentração de BAP (Benzilaminopurina). No segundo capítulo, objetivou-se avaliar o efeito da concentração das citocininas (BAP e CIN), a fonte e a concentração de carboidrato na fase de multiplicação, e a influência da concentração de AIB no enraizamento e na aclimatização das plantas. Para o portaenxerto Flordaguard , o meio MS (1/2N) foi superior ao Himedia tanto para o número de brotações por explante quanto para o crescimento destas. O crescimento das brotações foi maior em meio semi-sólido com meio líquido em comparação ao meio semi-sólido sem meio líquido. Entretanto, o tipo e a orientação do explante não influenciou o número e o comprimento das brotações formadas. Considerando a concentração de BAP, 3 mg L-1 induz maior número de brotações (4,02), porém o maior crescimento (1,85) das brotações ocorreu até a concentração de 0,5 mg L-1 de BAP. Na multiplicação de GxN-9 , explantes cultivados em meio contendo 0,4 mg L-1 de BAP apresentam o maior número de brotações (2,88), porém o maior crescimento foi obtido nas concentrações de 0,2 mg L-1 de BAP+ 0,2 mg L-1 de CIN (0,72). Já, com relação a fonte e a concentração de carboidrato, 30 g L-1 de sacarose é suficiente para a multiplicação deste portaenxerto. No que diz respeito à fase de enraizamento in vitro e de aclimatização, brotações cultivadas em meio de cultura com 1,2 mg L-1 de AIB, tiveram 100% enraizamento, bem como de plantas sobreviventes na fase de aclimatização.

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