Orientador: Katia Denise Saraiva Bresciani / Banca: Luiz Eduardo Corrêa Fonseca / Banca: Alex Akira Nakamura / Banca: Luiz da Silveira Neto / Banca: Jancarlo Ferreira Gomes / Resumo: Este estudo foi elaborado com o objetivo de investigar a ocorrência de Cryptosporidium spp. em quirópteros da região sul do Brasil. Cento e quarenta e sete amostras fecais de morcegos foram colhidas na cidade de Maringá (PR) e submetidas aos processos de purificação para a microscopia e extração de DNA genômico. A microscopia óptica de luz convencional foi utilizada com o uso da coloração negativa de verde malaquita para pesquisa de oocistos de Cryptosporidium spp. e a PCR foi utilizada para a amplificação de fragmentos do gene da subunidade 18S do rRNA na detecção de Cryptosporidium spp. A presença de Cryptosporidium spp. não foi constatada nas amostras fecais dos morcegos. Esse resultado pode ser considerado bom no aspecto que os morcegos são possíveis reservatórios e consequentemente, dispersores deste patógeno, sendo estes parques visitados diariamente por um grande número de pessoas. Esta é a primeira investigação do referido protozoário em morcegos nesta região. / Abstract: This study was elaborated with the objective to investigate the occurrence of Cryptosporidium spp. in chiroptera of southern Brazil. One hundred and forty-seven fecal samples of bats were collected in the city of Maringá (PR) and submitted to purification processes for microscopy and extraction of genomic DNA. Optical microscopy of conventional light with negative malachite green staining was performed to investigate oocysts of Cryptosporidium spp. and PCR for the amplification of fragments of the 18S rRNA subunit gene in the detection of Cryptosporidium spp. This coccidium was not found in faecal samples of bats. This result can be considered good in the aspect that bats are possible reservoirs and consequently dispersers of this pathogen, being these parks visited daily by a large number of people. It is the first investigation of this protozoan into bats in this region / Doutor

Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2017-02-23T14:21:01Z No. of bitstreams: 1 TeseCC.pdf: 1297646 bytes, checksum: 942d46e754719f629c7f26843a723767 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-03-13T18:50:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseCC.pdf: 1297646 bytes, checksum: 942d46e754719f629c7f26843a723767 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-03-13T18:50:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseCC.pdf: 1297646 bytes, checksum: 942d46e754719f629c7f26843a723767 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-13T19:05:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseCC.pdf: 1297646 bytes, checksum: 942d46e754719f629c7f26843a723767 (MD5) Previous issue date: 2016-06-17 / Não recebi financiamento / The bat community of the Jatai Ecologic Station region, Northeast of São Paulo State, was studied by comparing bat species surveys, in three forest fragments, to investigate the two components of species diversity, richness and abundance. Twentytwo bat species were recorded, with the sum of the species from the three fragments. Three phyllostomid species were dominant in two forest fragments, and two Molossidae species were dominant in other. Many bat species were rare. Species diversity obtained, measured by the Shannon index (He '), was similar in the three fragments, and close to the values of most studies of brazilian Southeastern bat communities (He’close to 2.0). This suggests constancy in the pattern of species diversity of bats in this region, and also in Southeastern Brazil. Of the 22 species recorded, four can be considered highly sensitive to the habitat fragmentation. The diversity achieved was significant, highlighting the value of these protected areas for the maintenance of local and regional biodiversity. The Red List of IUCN (The IUCN Red List) has been used to provide information about the conservation status of the species worldwide, and the same subsidize jobs assigned to this issue, with special focus on endangered species. At the national level, ICMBio (Chico Mendes Institute for Biodiversity Conservation) has the same goal, to discuss the conservation status of the Brazilian species, developing lists that guide actions to protect them. Using the information provided by IUCN and ICMBio, and bats records in the cerrado, considering the Brazilian territory, here are discussed aspects of ecology and conservation of bat species, in order to clarify some aspects of interest in this topic. Using the spatial interpolation method (IDW) to estimate the possible value of species richness in places not sampled species, was evaluated knowledge about the species richness of occurrence of bats in the cerrado of Brazil. / A presente tese é subdividida em dois artigos, o primeiro versando sobre a estrutura da comunidade de morcegos da região da Estação Ecológica do Jataí, nordeste do Estado de São Paulo, enfocando a diversidade de espécies e a vulnerabilidade das mesmas com relação aos processos de fragmentação de habitats. O segundo artigo discute aspectos da ecologia e conservação de morcegos do bioma cerrado, em território brasileiro, através de dados extraídos dos sítios eletrônicos da IUCN, do ICMBio e de registros de distribuição geográfica das espécies disponíveis na literatura específica de Chiroptera. O segundo artigo utiliza do método de interpolação (IDW) para a estimativa da diversidade de espécies segundo os dados apresentados em levantamentos de espécies de morcegos de cerrado, discutindo a importância da utilização desse método. Os resumos de ambos os artigos estão transcritos abaixo. Resumo do 1º artigo A comunidade de morcegos da região da Estação Ecológica do Jataí, Nordeste do Estado de São Paulo, foi estudada através da comparação de dados de capturas em três fragmentos florestais de cerrado, cerradão semidecidual. Investigou-se a diversidade de espécies em seus dois componentes, a riqueza e a abundância. Vinte e duas espécies de morcegos foram registradas, somadas as espécies dos três fragmentos. Três espécies de Phyllostomidae dominaram numericamente dois dos fragmentos, e duas espécies de Molossidae foram dominantes em outro. Muitas espécies de morcegos apresentaram baixa frequência nas capturas. A diversidade de espécies obtida, medida pelo índice de Shannon (He’), foi semelhante nos três fragmentos e próxima dos valores da maioria dos estudos de comunidades de morcegos do Sudeste brasileiro (He’ próximo de 2,0). Estes dados sugerem constância no padrão de diversidade de espécies de morcegos nessa região, e também no Sudeste brasileiro. Das 22 espécies registradas, quatro podem ser consideradas altamente sensíveis à fragmentação. A diversidade obtida foi significativa, destacando o valor destas unidades de conservação para a manutenção da biodiversidade local e regional. Resumo do 2º artigo A Lista Vermelha da IUCN (The IUCN Red List) tem sido utilizada para fornecer informações sobre o status de conservação das espécies, em nível mundial, e as mesmas subsidiam trabalhos endereçados a essa questão, com foco especial nas espécies ameaçadas de extinção. Em nível nacional, o ICMBio (Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade) tem o mesmo objetivo, ao discutir o status de conservação das espécies brasileiras, elaborando listas que orientam ações visando a proteção das mesmas. Utilizando as informações disponibilizadas pela IUCN e ICMBio, e os registros de morcegos no bioma cerrado, do território brasileiro, são discutidos aqui aspectos ligados à ecologia e conservação das espécies de morcegos, com vistas a elucidar alguns aspectos de interesse nesse tema, e à detecção de possíveis padrões. Utilizando o método de interpolação espacial (IDW) para a estimativa do valor possível da riqueza em locais não amostrados de espécies, foi avaliado o conhecimento sobre a riqueza em espécies de morcegos de ocorrência nos cerrados do Brasil.

Submitted by Ubirajara Cruz (ubirajara.cruz@gmail.com) on 2017-06-09T14:44:44Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Roberta Silva Silveira da Mota.pdf: 5877448 bytes, checksum: e1775066c7225b12cb1987370c762960 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-06-09T14:56:22Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Roberta Silva Silveira da Mota.pdf: 5877448 bytes, checksum: e1775066c7225b12cb1987370c762960 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-09T14:56:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Roberta Silva Silveira da Mota.pdf: 5877448 bytes, checksum: e1775066c7225b12cb1987370c762960 (MD5) Previous issue date: 2016-01-20 / Sem bolsa / As ações do Programa Nacional de Profilaxia da Raiva (PNPR) levaram a uma importante redução de casos humanos e a um controle do ciclo urbano em cães e gatos, nas diferentes regiões do país, contudo a raiva continua sendo um grave problema de Saúde Pública no Brasil e no mundo. O Rio Grande do Sul (RS) apresenta status de área controlada para o ciclo urbano há cerca de 20 anos, sem circulação de variantes caninas e sem o registro de casos humanos. Entretanto, verifica-se a manutenção de ciclos silvestres representados por quirópteros, inclusive em áreas urbanas. Este estudo foi organizado em dois sub-projetos. O primeiro teve por objetivo conhecer o comportamento do ciclo aéreo da doença na área urbana do município de Pelotas, RS, utilizando técnicas de diagnóstico padrão ouro, sorológicas e de biologia molecular, e desta forma, caracterizar a infecção pelo vírus da raiva em morcegos. O segundo subprojeto, a partir do entendimento de que um importante pilar da prevenção da doença em humanos consiste na profilaxia pré-exposição dos grupos de risco, buscou descrever o perfil dos atendimentos para profilaxia antirrábica pré-exposição (PArPE) humana realizados pelas Secretarias Municipais de Saúde, conforme metodologia do PNPR do Ministério da Saúde (MS), no Estado, através de um estudo descritivo a partir de dados coletados no Sistema Nacional de Agravos de Notificação (SINAN Net) do MS. Foram coletados 238 morcegos e submetidos a diagnóstico rábico padrão e técnicas complementares. Daqueles em que se pode recuperar sangue, foi realizada sorologia. A prevalência de vírus rábico foi de 3,60%, confirmados por IFD, RT-PCR do cérebro e da glândula salivar. A prevalência de anticorpos através do teste rápido de inibição de foco da fluorescência (RFFIT) foi 23,27% enquanto que no microteste simplificado de inibição da fluorescência (SFIMT) foi de 51,5%. Por outro lado, foi demonstrado que há diversas inconsistências no uso da PArPE no RS, com uso de tratamento em muitas situações em que não haveria a indicação e, ao mesmo tempo, mantendo pessoas em situação de risco não protegidas. A implicação destes achados é discutida nos dois artigos. / The National Rabies Prophylaxis Program (PNPR) actions led to an important reduction of human cases and certain control of urban cycle in cats and dogs, in different regions of the country. However, rabies still is a serious Public Health issue in Brazil and in the world. The state of Rio Grande do Sul (RS) is an area where the urban rabies cycle is considered controlled for about 20 years, having no canine virus variants circulation and no human cases registered. However, the maintenance of chiropters wild cycles still is detected, including among urban areas. The research was divided in two sub-projects. The first one aimed studying the disease's aerial cycle in the city of Pelotas, RS, through gold standard diagnosis, molecular biology and serological techniques, and then establishing the rabies virus infection in bats. The second subproject, based on the understanding that the pre-exposure prophylaxis in risk groups is the cornerstone of human rabies prevention, sought describing the human anti-rabies pre-exposure prophylaxis intervention (PArPE) profile, performed in State public health secretariats, according the methodology presented in the Ministry of Health's National Human Rabies Prophylaxis Program, through a descriptive study using data collected by the Ministry of Health's National Notification of Diseases System (SINAN Net). To that end, 238 bats were collected and put through standard rabies diagnosis and complementary techniques. Serology was performed in those which blood was found. Rabies virus prevalence was 3.60%, confirmed through DFA test, and brain and salivary gland RT-PCR. Antibodies prevalence through Rapid fluorescent focus inhibition test (RFFIT) was 23.27%, and 51.5% through Simplified fluorescent inhibition microtest (SFIMT). On the other hand, it was shown that the PArPE application in RS is inconsistent, where the treatment has been used in many situations in which it wouldn't be indicated, and, at the same time, leaving people in risk situations unprotected. These results implications are discussed in both articles.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-09-28T14:29:18Z No. of bitstreams: 1 juliana_h_s_barros_ipec_pesquisaclinicadi_0006_2009.pdf: 1430332 bytes, checksum: 636da38d82df84b03291443dfdf250b2 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-09-28T14:29:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 juliana_h_s_barros_ipec_pesquisaclinicadi_0006_2009.pdf: 1430332 bytes, checksum: 636da38d82df84b03291443dfdf250b2 (MD5) Previous issue date: 2009 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Os morcegos são mamíferos pertencentes à ordem dos Quirópteros. São animais que possuem hábitos alimentares bastante diversificados, apresentando espécies importantes no equilíbrio e diversidade biológica das espécies vegetais, como também atuantes na transmissão de doenças para o homem e para os animais. No município do Rio de Janei- ro, pouco se conhece sobre a ocorrência de tripanosomatídeos, nem tampouco sobre a possibilidade da participação desses animais no ciclo de transmissão de certos tripano- somas. Este trabalho objetivou avaliar, por hemocultura, a infecção natural por flagela- dos tripanosomatídeos em morcegos capturados em diferentes municípios do Estado do Rio de Janeiro e caracterizar os isolados obtidos quanto à sensibilidade ao sistema com- plemento; potencial infectivo para macrófagos murinos “in vitro”; potencial infectivo para Triatoma infestans e análise do perfil isoenzimático (MLEE). Durante o estudo, flagelados tripanosomatídeos foram encontrados em 29 (30,2%) dos 96 morcegos avali- ados, dos quais 28 possuíam hábitos hematófagos (D. rotundus) e 1 hábito insetívoro (Lonchorhina aurita), capturados em diferentes municípios do estado do Rio de Janeiro. Das amostras isoladas, 12 foram selecionadas para estudos de caracterização, todas, apresentando padrões biológicos semelhantes, todas sendo sensíveis ao sistema com- plemento, apresentando 100% de lise das formas epimastigotas; não foram capazes de infectar macrófagos murinos “in vitro” nem tampouco puderam infectar e colonizar glândulas salivares, hemolinfa e o trato intestinal de Triatoma infestans. Na análise iso- enzimática, avaliado por 9 loci, três zimodemas foram observados, todos, diferentes das amostras de referências Trypanosoma cruzi, Trypansoma rangeli e Trypanosoma des- terrrensis, empregadas nesta análise. Os resultados obtidos neste estudo demonstraram que flagelados do gênero Trypanosoma podem ser isolados de morcegos com diferentes hábitos alimentares no estado do Rio de Janeiro e embora nenhuma amostra tenha sido identificada como Trypanosoma cruzi, Trypanosoma rangeli ou Trypanosoma dester- rensis, observou-se três padrões fenotípicos distintos entre as doze amostras estudadas. Espera-se, dessa forma, contribuir para as ações de vigilância a partir do conhecimento das espécies de tripanosomatideos circulantes em morcegos do Estado do Rio de Janei- ro. / Bats are mammals belonging to the order Chiroptera. These animals have very different alimentary habits, several species being important in the balance and biological diver- sity of plant species, as well as being active in the transmission of diseases to man and to animals. In the state of Rio de Janeiro, little is known about the occurrence of try- panosomatids, neither the possibility of participation of these animals in the cycle of transmission of certain trypanosomes. This study aimed at the evaluation of the natural infection by flagellates trypanosomatids in bats captured in different municipalities in the state of Rio de Janeiro, by blood culture, and characterizing the obtained isolates in relation to their sensitivity to the complement system; their infecting potential to in vitro murine macrophages; their infecting potencial to Triatoma infestans and the analysis of the isoenzymatic profile (MLEE). During the study, flagellated tripanosomatids were identified in 29 (30,2%) of the 96 specimens examined, being 28 of the samples origi- nated from bats of hematophagous habits (Desmdus rotundus) and 1 insectivorous habit (Lonchorhina aurita), caught in different municipalities of the state of Rio de Janeiro. From the isolated samples, 12 were selected for studies of characterization, all present- ing similar biological standards, all were sensitive to complement, presenting 100% lysis of epimastigote forms; they neither were capable of infecting murine macrophages in vitro neither being able to infect and colonize salivary glands, hemolymph and the intestinal tract of Triatoma infestans. In isoenzyme analyses, assessed for 9 loci, three zimodemes were observed, all different of the samples of reference Trypanosoma cruzi, Trypansoma rangeli and Trypanosoma desterrrensis, used in this study. The results of this study showed that flagellates of the genus Trypanosoma can be isolated from bats with different alimentary habits in the state of Rio de Janeiro and although no samples was identified as Trypanosoma cruzi, Trypanosoma rangeli or Trypanosoma desterren- sis, three distinct phenotypic pattern among the twelve samples were observed. It is ex- pected that these results contribute to the surveillance activities towards the knowledge of the occurrence of trypanosomatids in bats in the state of Rio de Janeiro.