Shell Shock, described as the ‘emblematic psychiatric disorder’ of the First World War has long been synonymous with its soldiers. Its association with close proximity to exploding shells and thus the front lines, leading to the various symptoms of ‘shock’, has both facilitated and ensured its existence throughout the twentieth and twenty first centuries as a masculine affliction. Of the many shell shock studies that have been produced over the last few decades all have focused purely on the experience of the male combatant, predominantly because of this long held preoccupation with ‘front-line’ warfare and its consequences apparently being the preserve of men. Despite the prolonged interest and analysis of shell shock by medical and social historians along with a significant amount of work by feminist and, more recently, revisionist historians, detailing the involvement of women in the First World War, there is stHl no comprehensive study of the psychological problems encountered and suffered by the women who served alongside the British Expeditionary Forces (BEE). However, this study of the roles and duties of a specific group of women, namely nurses, voluntary aid detachments, and ambulance drivers, reveals they frequently endured a variety of traumatic experiences, involving injuries and fatalities, through the vicarious witnessing and dealing with horrific sights and sounds, all compounded by extremes of conditions and privations. Many, if not all, of these factors were given as antecedents for war neurosis in soldiers. Yet, while the nurse has been idolised for her role in the Great War, her experience of psychological ‘breakdown’ has not been examined. This thesis, through the analysis of professional medical literature, of medical case notes, personal testimonies, diaries and autobiographies, is a contribution to the areas of women’s history, medical history and, more specifically, to the history of psychological war trauma. Following a review of the literature in chapter one, chapter two is a re-examination of the proximity of nurses to the fighting zones and therefore of their exposure to danger. Chapter three analyses the nurses’ experience and subsequent symptoms of war trauma, including, importantly, how contemporary medical authorities understood the disorder, and then cared for and managed their female sufferers. These two chapters fundamentally argue that the notion of war-induced traumatic neurosis being the preserve of men is essentially pretence, and that this ‘focus’ on male sufferers means the history of the condition is incomplete. Chapter four essentially examines the issues of repatriation faced by these nurses, specifically examining the evolution of war disability pensions process of which they were excluded until 1920. It also looks at how the nurse, as female war veteran, coped with the consequences of her war experience. In conclusion, this thesis asserts that these nurses did indeed suffer psychologically for their involvement in this war and not because their symptoms and disorders ‘resembled’ those experienced by men, but were in fact, indistinguishable to the extent that some nurses were classed as ‘shellshocked’

Using drugs such as alcohol and morphine among others can be addictive in some individuals, and progress into a substance abuse disorder. The mesolimbic dopaminergic system (MD-system) is involved in the reward process during the development of drug addiction. The MD-system is critical for survival and affects different behaviors in both man and animal. Neurochemical pathways drive for instance physical activity, food intake, love and reproduction and are part of the natural reward process involved partly in the release of dopamine (DA) into frontal lobes. Within the MD-system opioid receptors throughout the brain are affected by drug intake, and activation of these receptors modulate DA-release in brain regions involved in reward-behavior. The aim of this study was to evaluate gene expression of MOR and DOR within the endogenous opioid system (EO-system) in relation to voluntary physical activity, a natural reinforcer. Further on investigations of the drug alcohol was compared to the natural reinforcer sucrose using voluntary consumption. For both experiments qRT-PCR was used to measure mRNA levels of MOR and DOR from brain areas of interest. We found a small significant up regulation in NAc, PFC and VTA but for DOR in VTA a down regulation in gene expression of physical exercising mice. Additionally these two different genes OPRM1- and the OPRD1- gene are down regulated in VTA and NAc due to alcohol- and sugar-intake. This implicate that the natural reward system and their ORs point in the direction of earlier findings; the opioid receptors have a key role in regulate alcohol intake and the natural rewarding stimuli as food intake.

In tomato (Solanum lycopersicum), race-specific resistance against the fungal wilt pathogen Verticillium dahliae race 1 (Vd1) is established in the stem. However, the molecular factors and mechanisms leading to this resistance response are still unknown. In this study, Craigella resistant (CR) and susceptible (CS) tomato plants were successfully infected with Vd1 and this was verified by fungal quantification and symptom score assays. Previous microarray results showed interesting patterns of defence gene expression that correlated with biological phenomena. Plant defence genes code for proteins that are responsible for or associated with the plant resistance response. Through RT-PCR, this thesis set out to confirm these microarray observations and also to generate expression data for genes in which sensitivity was an issue in the microarray. The standard RT-PCR data confirmed a number of the microarray results, but some conflicts remained. From the defence genes investigated, there was agreement between the microarray data and the RT-PCR data for pre-mRNA processing factor 8, class IV chitinase, cyclin-dependent kinase inhibitor and IMP dehydrogenase/GMP reductase. Partial agreement was observed for genes coding for ethylene response factor 2, phenylalanine ammonia lyase and P6 protein. However, there was total disagreement for 14-3-3, beta-glucanase, P1a, RNA-binding protein, calcium-binding protein and S-Adenosyl-L-methionine: hydroxide adenosyltransferase. Real-time RT-PCR was attempted to clarify the remaining issues but further discrepancies arose, particularly in the Ve resistance genes. To resolve these discrepancies, two approaches were designed: (1) one based on the use of a universal internal control and (2) another based on restriction enzyme digestion. In general, the results were more consistent with standard RT-PCR. Overall, this study showed that standardization of a system involving vascular pathogens, leading to reproducible analysis, was possible but only with proper controls and additional validation. Standard RT-PCR appeared to offer a more accurate picture of the expression of defence genes in the tomato-Verticillium pathosystem. The defence gene expression results confirmed in this study remain as potential insights into the molecular mechanisms for Verticillium resistance in tomato plants.

La recherche de sources d’énergie fiables ayant un faible coût environnemental est en plein essor. L’hydrogène, étant un transporteur d’énergie propre et simple, pourrait servir comme moyen de transport de l’énergie de l’avenir. Une solution idéale pour les besoins énergétiques implique une production renouvelable de l’hydrogène. Parmi les possibilités pour un tel processus, la production biologique de l’hydrogène, aussi appelée biohydrogène, est une excellente alternative. L’hydrogène est le produit de plusieurs voies métaboliques bactériennes mais le rendement de la conversion de substrat en hydrogène est généralement faible, empêchant ainsi le développement d’un processus pratique de production d’hydrogène. Par exemple, lorsque l’hydrogène est produit par la nitrogénase sous des conditions de photofermentation, chaque molécule d’hydrogène constituée requiert 4 ATP, ce qui rend le processus inefficace. Les bactéries photosynthétiques non sulfureuses ont la capacité de croître sous différentes conditions. Selon des études génomiques, Rhodospirillum rubrum et Rhodopseudomonas palustris possèdent une hydrogénase FeFe qui leur permettrait de produire de l’hydrogène par fermentation anaérobie de manière très efficace. Il existe cependant très peu d’information sur la régulation de la synthèse de cette hydrogénase ainsi que sur les voies de fermentation dont elle fait partie. Une surexpression de cette enzyme permettrait potentiellement d’améliorer le rendement de production d’hydrogène. Cette étude vise à en apprendre davantage sur cette enzyme en tentant la surexpression de cette dernière dans les conditions favorisant la production d’hydrogène. L’utilisation de résidus organiques comme substrat pour la production d’hydrogène sera aussi étudiée. / The search for alternative energy sources with low environmental impact is in great expansion. Hydrogen, an elegant and simple energy transporter, could serve as means of transporting energy in the future. An ideal solution to the increasing energy needs would imply a renewable production of hydrogen. Out of all the existing possibilities for such a process, the biological production of hydrogen, also called biohydrogen, is an excellent alternative. Hydrogen is the end result or co-product of many pathways in bacterial metabolism. However, such pathways usually show low yields of substrate to hydrogen conversion, which prevents the development of efficient production processes. For example, when hydrogen is produced via nitrogenase under photofermentation conditions, each hydrogen molecule produced requires 4 molecules of ATP, rendering the process very energetically inefficient. Purple non-sulfur bacteria are highly adaptive organisms that can grow under various conditions. According to recent genomic analyses, Rhodospirillum rubrum and Rhodopseudomonas palustris possess, within their genome, an FeFe hydrogenase that would allow them to produce hydrogen via dark fermentation quite efficiently. Unfortunately, very little information is known on the regulation of the synthesis of this enzyme or the various pathways that require it. An overexpression of this hydrogenase could potentially increase the yields of substrate to hydrogen conversion. This study aims to increase our knowledge about this FeFe hydrogenase by overexpressing it in conditions that facilitate the production of hydrogen. The use of organic waste as substrate for hydrogen production will also be studied.

<p>Diss. (sammanfattning) Umeå : Umeå universitet, 2002</p> / digitalisering@umu

La qPCR est actuellement la technique de référence en matière de quantification d'ADN. Elle peut être définie comme une amplification exponentielle, cyclique et ciblée de la séquence d'ADN cible. Le caractère exponentiel de la qPCR est à la fois à l'origine de la sensibilité de la méthode mais aussi d'une potentielle variabilité inter-échantillons. Cette variabilité est compensée par le caractère cyclique de la méthode qui entraine une synchronisation de la réaction pour tous les échantillons à chaque cycle. L'amplification ciblée de la séquence choisie traduit quand à elle la spécificité de la méthode. Néanmoins, cette dernière propriété de la PCR reste la moins vérifiée. La spécificité de la qPCR est indiscutable lorsque la cible à détecter se trouve en quantité suffisante (>100 copies environ). En revanche, pour des quantités plus faibles ou en présence d'inhibiteurs, la spécificité diminue ou disparaît (limites de détection et de quantification). Cette perte de spécificité retentit de façon significative sur la précision et la reproductibilité du dosage à réaliser. Cependant, si l'hybridation non spécifique est inéluctable dans ces conditions, l'amplification non spécifique consécutive peut être limitée, voire supprimée au moyen d'amorces de PCR soit plus spécifiques, soit moins susceptibles de générer des différences inter-échantillons. La RT-qPCR, grâce à une étape initiale de transcription inverse (conversion d'un ARN en un ADN complémentaire) permet la quantification des ARN. Cependant, la transcription inverse reste moins reproductible que la PCR, générant des différences inter-échantillons délétères en diagnostic comme en recherche. Au cours de ces travaux, je propose des méthodes originales améliorant de façon significative différentes étapes de ces techniques. Premièrement, je propose une amélioration de la standardisation de l'étape de transcription inverse capable de diminuer de façon significative la variabilité inter-échantillons ; l'utilisation d'un volume constant d'extrait d'ARN pour chaque échantillon améliore considérablement la précision de la quantification d'ARN messagers. Deuxièmement, je propose une modification des amorces par incorporation de résidus d'acides nucléiques bloqués (LNA) ; cette modification permet d'augmenter la spécificité des amorces aux limites de la détection. Enfin, je propose une méthode simple et économique permettant la mesure directe de la température de fusion (Tm) dans les conditions réelles de la PCR. Ce paramètre, considéré comme capital pour la réalisation des dosages par qPCR, est généralement obtenu par des méthodes prédictives peu précises. De plus, cette méthode doit permettre de déterminer précisément les paramètres thermodynamiques des amorces (∆G, ∆H et ∆S) et ainsi avoir accès d'une part au pourcentage réel d'amorces hybridées en fonction de la température et d'autre part d'identifier la susceptibilité des amorces aux inhibiteurs.

Dans le contexte de la menace pandémique liée au virus influenza A(H5N1), un projet "GRIPPE AVIAIRE ET GRIPPE PANDÉMIQUE " a émergé au sein de LyonBioPôle avec comme objectif le développement d'outils de caractérisation des virus influenza pour la production de vaccins. Pour étudier le réassortiment génétique entre virus influenza, nous avons développé 3 systèmes de génétique inverse : virus humain A(H3N2) et aviaires A(H5N2) et A(H5N1) et produit des virus réassortants de composition déterminée. Leurs capacités réplicatives ont été évaluées par cinétiques de croissance virale sur MDCK avec quantification de la production virale par qRT-PCR temps réel. L'émergence du virus influenza A(H1N1)2009 pose deux questions sur l'acquisition par réassortiment génétique, d'une résistance à l'oseltamivir d'une part ou de facteurs de virulence d'autre part. Nous avons donc développé un protocole de co-infection virale de cellules MDCK pour étudier les constellations de gènes des réassortants entre différents virus: A(H1N1)2009-A(H1N1) H275Y et A(H1N1)2009-A(H5N1). Nous montrons par deux approches différentes, génétique inverse et co-infections virales, que le réassortiment génétique entre souches aviaires et humaines et surtout aviaires et porcines est possible, en privilégiant certaines constellations. Nous rapportons que le virus pandémique peut acquérir la NA H275Y des virus A(H1N1) Brisbane-like résistants à l'oseltamivir sans que ses capacités de réplication ne soient altérées. De même nous montrons que son réassortiment avec un virus hautement pathogène A(H5N1) est possible. Ces observations renforcent la nécessité de promouvoir la vaccination afin de limiter les risques de co-infection virale chez un même individu.

Objective: The aim of this study was to develop an immunomagnetic/real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) assay and assess its clinical value for the molecular detection of circulating tumor cells (CTCs) in peripheral blood of pancreatic cancer patients. Methods: The presence of CTCs was evaluated in 34 pancreatic cancer patients before systemic therapy and in 40 healthy controls, through immunomagnetic enrichment, using the antibodies BM7 and VU1D9 [targeting mucin 1 and epithelial cell adhesion molecule (EpCAM), respectively], followed by real-time RT-PCR analysis of the genes KRT19, MUC1, EPCAM, CEACAM5 and BIRC5. Results: The developed assay showed high specificity, as none of the healthy controls were found to be positive for the multimarker gene panel. CTCs were detected in 47.1% of the pancreatic cancer patients before the beginning of systemic treatment. Shorter median progression-free survival (PFS) was observed for patients who had at least one detectable tumor-associated transcript, compared with patients who were CTC negative. Median PFS time was 66.0 days [95% confidence interval (CI) 44.8–87.2] for patients with baseline CTC positivity and 138.0 days (95% CI 124.1–151.9) for CTC-negative patients (p = 0.01, log-rank test). Conclusion: Our results suggest that in addition to the current prognostic methods, CTC analysis represents a potential complementary tool for prediction of outcome in pancreatic cancer patients. / Dieser Beitrag ist mit Zustimmung des Rechteinhabers aufgrund einer (DFG-geförderten) Allianz- bzw. Nationallizenz frei zugänglich.

Selon plusieurs évidences, la présence de cellules tumorales occultes dans la circulation sanguine aux premières étapes du cancer du sein pourrait être à l’origine des lésions métastasiques. Plusieurs études de recherche ont montré que l’utilisation de la RT-PCR en temps réel pour la détection des cellules tumorales circulantes CTC offre la meilleure sensibilité dans la quantification des marqueurs tumoraux. Présentement de routine, le suivi du cancer du sein est réalisé par le dosage immunologique des marqueurs sériques CA15-3 et CEA. Cependant, la faible sensibilité de ces marqueurs aux stades précoces de la maladie et leur manque de spécificité tissulaire ne permet pas leur utilisation pour le diagnostic et le pronostic du cancer du sein. Le diagnostic de la maladie est plutôt basé sur l’analyse d’une biopsie de la tumeur ou des ganglions lymphatiques, des méthodes invasives, coûteuses et peu adaptées pour un suivi de routine dans l’évaluation du risque de rechute et de la réponse au traitement. Malgré les études, la détection de ces cellules dans les laboratoires hospitaliers est rare. Nous avons envisagé de mettre en place un nouveau test RT-PCR pour la détection de cellules malignes du cancer du sein dans la circulation. La spécificité et la sensibilité de plusieurs marqueurs potentiels ont été comparées. Le but ultime de ce projet est d’offrir la détection d’un ou d’une combinaison de ces marqueurs de routine aux patientes. Nos résultats montrent une corrélation positive entre l’expression des ARNm des marqueurs CK19 et de HER2 avec les données cliniques des patientes. De plus, la sensibilité et la spécificité des tests RT-PCR sont comparables à la littérature récente. Finalement, la comparaison de notre test avec le dosage immunologique des marqueurs tumoraux sériques CA15.3 et CEA a montré que la détection de la CK19 et de HER2 par RT-PCR est plus sensible chez les patientes de cancer du sein métastatique. / According to several evidences, the presence of occult tumor cells in blood circulation in the early stages of breast cancer could be the origin of metastatic lesions. Recent research studies have shown that the use of qRT-PCR for the detection of circulating tumor cells CTC offers the best sensitivity in the quantification of tumor markers. Currently routine monitoring of breast cancer is performed by immunoassay of serum markers CA15.3 and CEA. However, the low sensitivity of these markers in the early stages of the disease and the lack of tissue specificity does not allow their use in diagnosis and prognosis of breast cancer. The diagnosis of the disease is rather based on the analysis of biopsies of the tumor or lymph nodes. This is an invasive procedure, expensive and not suitable for routine monitoring of the risk of relapse and response to treatment. Despite these studies, detection of these cells in hospital laboratories is rare. Our objective is to set up a new RT-PCR assay for the detection of malignant breast cancer cells in the circulation. The specificity and sensitivity of some potential markers will be compared. The ultimate goal of this project is to routinely offer the detection of one or of a combination of these markers routinely to patients with breast cancer. Our results show a positive correlation between the expression of CK19 and HER2 mRNA with clinical data of patients. Furthermore, the sensitivity and specificity of our RT-PCR tests are similar to the recent literature. Finally, the comparison of our test with the immunoassay of serum tumor markers CEA and CA15.3 showed that the detection of HER2 and CK19 by RT-PCR is more sensitive in patients with metastatic breast cancer

Depuis l'apparition de la vie sur terre, les pressions de sélection liées aux interactions biotiques et abiotiques ont généré une forte diversité des formes de vie. Ainsi, chaque espèce eucaryote coévolue avec sa communauté microbienne associée. Dans le cas des plantes, la diversité génétique se traduit au niveau de multiples traits phénotypiques (exsudation de substrats carbonés, architecture racinaire, densité et aération du sol, acidification, etc.) susceptibles d'influer sur les interactions avec les populations microbiennes du sol, et donc sur la composition et le fonctionnement de la communauté microbienne rhizosphérique. Notre hypothèse est que les différences entre communautés bactériennes rhizosphériques sont proportionnelles aux distances évolutives entre partenaires végétaux. L'objectif de cette thèse était donc de déterminer l'importance, dans le cas des Poacées et notamment du maïs, de l'histoire évolutive de la plante dans la capacité de sélection des communautés bactériennes de la rhizosphère. Les analyses faites à l'aide d'une puce à ADN taxonomique 16S indiquent que la composition de la communauté rhizobactérienne dépend du groupe génétique de maïs mais n'est pas liée aux marqueurs microsatellites de diversité du maïs. Par contre, à l'échelle des Poacées, une corrélation a été trouvée entre la phylogénie végétale et la composition de la communauté bactérienne (voire la prévalence de taxons bactériens particuliers). Cette corrélation n'était pas significative quand l'étude était limitée à l'effectif, le niveau de transcription de nifH ou la diversité du groupe fonctionnel des bactéries fixatrices d'azote. En conclusion, l'histoire évolutive du partenaire végétal à l'échelle des Poacées (mais pas à celle du maïs) est un facteur conditionnant les interactions avec les groupes bactériens taxonomiques (mais pas nécessairement fonctionnels) de la rhizosphère