Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2007. / Submitted by Luis Felipe Souza (luis_felas@globo.com) on 2008-11-25T19:05:36Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_2007_CesarLeguiza.pdf: 549428 bytes, checksum: 669413d56afa5a2d8687e32ee7c0f8f2 (MD5) / Approved for entry into archive by Georgia Fernandes(georgia@bce.unb.br) on 2009-01-15T13:15:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao_2007_CesarLeguiza.pdf: 549428 bytes, checksum: 669413d56afa5a2d8687e32ee7c0f8f2 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-01-15T13:15:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_2007_CesarLeguiza.pdf: 549428 bytes, checksum: 669413d56afa5a2d8687e32ee7c0f8f2 (MD5) / O objetivo deste trabalho foi verificar a existência de associações significativas entre alelos de locos pertencentes ao MHC (Major Histocompatibility Complex) de ovinos (OLA - ovine leucocyte antigen) com características de desempenho, carcaça e resistência às parasitas gastrintestinais em ovelhas puras e cruzadas das raças Santa Inês, Bergamácia, Texel e Ile de France oriundas de diferentes localidades. Também foi avaliada a diversidade genética desta região genômica em populações de ovinos da raça Sana Inês pertencente a três localidades diferentes do Centro-Oeste Brasileiro e no rebanho da UnB num período de três anos. Foram utilizados 13 locos microssatélites localizados no cromossomo 20 de ovinos. Os marcadores utilizados demonstraram ter uma alta variabilidade genética entre os indivíduos. Foi observada uma associação significativa (p<0,05) entre características de carcaça e OPG nestes marcadores presentes no MHC ovino. Foi observada uma diminuição da variabilidade genética nas populações analisadas, de maneira que algumas estavam significativamente estruturadas. Estes resultados necessitam de maior amostragem e confirmação em outras populações para os estudos de associação, mas demonstraram o poder do uso da região do MHC para estudos de manejo de rebanhos. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The objective of this study was to verify the existence of significant associations between alleles of the ovine MHC (OLA - ovine leucocyte antigen) with characteristics of performance, carcass and resistance to gastrointestinal parasites in purebred Santa Inês sheep and their crosses with Bergamasca, Texel and Ile de France sires from different localities. The genetic diversity of this genomic region in populations of Santa Inês sheep from three different farms in the Brazilian Center-West and that of the University of Brasilia. Thirteen microsatellite loci, located on chromosome 20, were used. The markers studied showed high genetic variability between individuals. A significant association (p<0,05) between carcass characteristics and OPG was observed in the ovine MHC. The studied genomic region was shown to be highly polymorphic, coinciding with the consulted bibliography. The populations analysed showed a reduction in genetic variability, causing subdivision of the same. The association results should be verified by larger sampling and confirmation in other populations, as well the MHC region was suitable to studies of herd management.

Dois estudos foram realizados com o objetivo de analisar a distribuição espacial de diferentes raças bovinas e dos valores genéticos de animais Brangus no Brasil, relacionando sua ocorrência com variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas. O objetivo do primeiro estudo foi analisar a relação das variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas com a distribuição de raças bovinas. Neste estudo utilizou-se as informações município e estado das raças Aberdeen Angus, Ayrshire, Braford, Brangus, Charolês, Devon, Flamenga, Hereford, Pinzgauer, Shorthorn e Simental. As raças foram classificadas conforme sua finalidade: carne, dupla aptidão e leite e posteriormente espacializadas no programa ArcGis 10.2. As raças leiteiras estudadas estavam localizadas nos estados do Rio Grande do Sul e Santa Catarina, as raças de duplo propósito em Minas Gerais e no Rio Grande do Sul e as raças de carne estão concentradas na região sul do país. As regressões logísticas demonstraram que as raças de corte e dupla aptidão tendem a ser criadas em regiões com menor temperatura máxima e média, menor amplitude térmica e ITU, porém em municípios com alta umidade e altitude, menor produto interno bruto, pouca orientação técnica, baixo controle de doenças e parasitas e pouca rotação de pastagens A análise de variância mostrou que as raças de carne, leite e dupla aptidão não variaram para as características climáticas, físicas e socioeconômicas. No segundo estudo objetivou-se analisar a associação das variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas com a distribuição dos valores genéticos para características de crescimento e perímetro escrotal de animais da raça Brangus. Foram utilizados registros de 84.703 animais da raça Brangus, nascidos entre 2000 e 2010 distribuídos em 65 fazendas do Brasil. Os animais localizaram-se nos estados RS, PR, SP, MG, GO, MG e MS. Á desmama, as maiores médias dos valores genéticos por fazenda estão agrupadas no cluster 1 e ao sobreano agruparam-se no cluster 2. Os maiores valores genéticos ficaram fortemente relacionadas com amplitude térmica e área municipal. Ter conhecimento da distribuição espacial de raças bovinas e dos valores genéticos de animais Brangus pode auxiliar no desenvolvimento de índices ambientais, avaliações genéticas e escolha de animais para determinados ambientes. / Two studies were conducted in order to analyze the spatial distribution of different breeds and breeding values of Brangus animals in Brazil, relating their occurrence to climatic, physical and socioeconomic variables. The aim of the first study was to analyze the relationship of climatic, physical and socioeconomic variables with the distribution of bovine breeds. In this study we used the municipality and state information of the Aberdeen Angus, Ayrshire, Braford, Brangus, Charolais, Devon, Flemish, Hereford, Pinzgauer, Shorthorn and Simmental breeds. Breeds were classified according to their purpose: beef, dual purpose and milk and spatialized using ArcGis 10.2. The dairy breeds studied were located in the states of Rio Grande do Sul and Santa Catarina, the dual purpose breeds in Minas Gerais and Rio Grande do Sul and the beef breeds are concentrated in the southern region of the country. Logistic regression showed that both beef and dual purpose cattle are more likely to be raised in municipalities with lower maximum and average temperatures, lower thermic amplitude and THI, although, with high humidity and altitude, with lower gross domestic product, where technical guidance, rotation of pastures and control of diseases and parasites were low Analysis of variance showed that beef, dairy and dual purpose breeds did not ranged for climatic, physical and socio-economic characteristics. The second study aimed to analyze the association of climate, physical and socio-economic characteristics with the distribution of breeding values of growths traits and scrotal perimeter of Brangus animals. Records of 84.703 Brangus animals, born between 2000 and 2010 distributed in 65 farms in Brazil were used. Cluster analysis formed three clusters of average breeding values per farm. Animals were located in the Brazilian states of RS, PR, SP, MG, GO, MG and MS. At weaning, the highest averages of breeding values per farm were grouped in cluster 1 and to yearling in cluster 2. The highest breeding values were strongly related to thermal amplitude and municipal area. knowledge the spatial distribution of cattle breeds and breeding values of Brangus animals can help in the development of environmental indices, genetic evaluations and in the choice of animals for certain environments.

Dois estudos foram realizados com o objetivo de analisar a distribuição espacial de diferentes raças bovinas e dos valores genéticos de animais Brangus no Brasil, relacionando sua ocorrência com variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas. O objetivo do primeiro estudo foi analisar a relação das variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas com a distribuição de raças bovinas. Neste estudo utilizou-se as informações município e estado das raças Aberdeen Angus, Ayrshire, Braford, Brangus, Charolês, Devon, Flamenga, Hereford, Pinzgauer, Shorthorn e Simental. As raças foram classificadas conforme sua finalidade: carne, dupla aptidão e leite e posteriormente espacializadas no programa ArcGis 10.2. As raças leiteiras estudadas estavam localizadas nos estados do Rio Grande do Sul e Santa Catarina, as raças de duplo propósito em Minas Gerais e no Rio Grande do Sul e as raças de carne estão concentradas na região sul do país. As regressões logísticas demonstraram que as raças de corte e dupla aptidão tendem a ser criadas em regiões com menor temperatura máxima e média, menor amplitude térmica e ITU, porém em municípios com alta umidade e altitude, menor produto interno bruto, pouca orientação técnica, baixo controle de doenças e parasitas e pouca rotação de pastagens A análise de variância mostrou que as raças de carne, leite e dupla aptidão não variaram para as características climáticas, físicas e socioeconômicas. No segundo estudo objetivou-se analisar a associação das variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas com a distribuição dos valores genéticos para características de crescimento e perímetro escrotal de animais da raça Brangus. Foram utilizados registros de 84.703 animais da raça Brangus, nascidos entre 2000 e 2010 distribuídos em 65 fazendas do Brasil. Os animais localizaram-se nos estados RS, PR, SP, MG, GO, MG e MS. Á desmama, as maiores médias dos valores genéticos por fazenda estão agrupadas no cluster 1 e ao sobreano agruparam-se no cluster 2. Os maiores valores genéticos ficaram fortemente relacionadas com amplitude térmica e área municipal. Ter conhecimento da distribuição espacial de raças bovinas e dos valores genéticos de animais Brangus pode auxiliar no desenvolvimento de índices ambientais, avaliações genéticas e escolha de animais para determinados ambientes. / Two studies were conducted in order to analyze the spatial distribution of different breeds and breeding values of Brangus animals in Brazil, relating their occurrence to climatic, physical and socioeconomic variables. The aim of the first study was to analyze the relationship of climatic, physical and socioeconomic variables with the distribution of bovine breeds. In this study we used the municipality and state information of the Aberdeen Angus, Ayrshire, Braford, Brangus, Charolais, Devon, Flemish, Hereford, Pinzgauer, Shorthorn and Simmental breeds. Breeds were classified according to their purpose: beef, dual purpose and milk and spatialized using ArcGis 10.2. The dairy breeds studied were located in the states of Rio Grande do Sul and Santa Catarina, the dual purpose breeds in Minas Gerais and Rio Grande do Sul and the beef breeds are concentrated in the southern region of the country. Logistic regression showed that both beef and dual purpose cattle are more likely to be raised in municipalities with lower maximum and average temperatures, lower thermic amplitude and THI, although, with high humidity and altitude, with lower gross domestic product, where technical guidance, rotation of pastures and control of diseases and parasites were low Analysis of variance showed that beef, dairy and dual purpose breeds did not ranged for climatic, physical and socio-economic characteristics. The second study aimed to analyze the association of climate, physical and socio-economic characteristics with the distribution of breeding values of growths traits and scrotal perimeter of Brangus animals. Records of 84.703 Brangus animals, born between 2000 and 2010 distributed in 65 farms in Brazil were used. Cluster analysis formed three clusters of average breeding values per farm. Animals were located in the Brazilian states of RS, PR, SP, MG, GO, MG and MS. At weaning, the highest averages of breeding values per farm were grouped in cluster 1 and to yearling in cluster 2. The highest breeding values were strongly related to thermal amplitude and municipal area. knowledge the spatial distribution of cattle breeds and breeding values of Brangus animals can help in the development of environmental indices, genetic evaluations and in the choice of animals for certain environments.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-04-10T15:04:57Z No. of bitstreams: 1 Eulalia Alves Barros.pdf: 223041 bytes, checksum: 40e55d9d4006393aa969756a6bf6835a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-10T15:04:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eulalia Alves Barros.pdf: 223041 bytes, checksum: 40e55d9d4006393aa969756a6bf6835a (MD5) Previous issue date: 2009-02-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Marota breed goats is part of the Brazilian genetic patrimony, consisting by animals highly adapted to semi-arid region. This study evaluated genetic structure of Marota breed from Embrapa Meio Norte nucleus for conservation. Pedigree records of 663 animals, which were born from 1995 to 2003, were used for population parameters estimation. Inbreeding coefficient ( F ) and average relationship coefficient (AR) of the population was 0.11% and 0.84% respectively. Generation interval (IEG) was 5.28 years and average effective size ( e N ) per generation was 222 animals; the effective number of founder animals ( e f ) and ancestral ( a f ) was the sam (48). Among 214 ancestors evaluated, just 22 of them were responsible for 50% of the population genetic variability,which indicate loss of original genes. This study shows low contribution of the founder animals among the generations. Wright inbreeding coefficient indicates population subdivision in lineages. Inbreeding and average relationship coefficients (AR) were low. / A raça caprina Marota é parte do patrimônio genético do Brasil, formada por animais altamente adaptados ao semi-árido nordestino. Neste estudo avaliouse a estrutura genética do núcleo de conservação da raça Marota, mantida pela Embrapa Meio Norte. Foram estimados os parâmetros populacionais com dados genealógicos de 663 animais nascidos entre os anos de 1995 a 2003. O coeficiente de parentesco médio (AR) e de consanguinidade ( F ) para a população foram de 0,11% e de 0,84%, respectivamente. O intervalo de gerações (IEG) foi de 5,28 anos e o tamanho efetivo médio ( e N ) por geração foi de 222 animais, sendo que o número efetivo de animais fundadores ( e f ) e de ancestrais ( a f ) foi igual (48). Dentre os 214 ancestrais, apenas 22 foram responsáveis por 50% da variabilidade genética da população, o que indica perda de genes de origem. Observa-se baixa contribuição dos animais fundadores ao longo das gerações. Os valores do coeficiente de endogamia de Wright indicam subdivisão da população em linhagens. Em geral, a consangüinidade e os valores médios do coeficiente de parentesco foram baixos.

Dois estudos foram realizados com o objetivo de analisar a distribuição espacial de diferentes raças bovinas e dos valores genéticos de animais Brangus no Brasil, relacionando sua ocorrência com variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas. O objetivo do primeiro estudo foi analisar a relação das variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas com a distribuição de raças bovinas. Neste estudo utilizou-se as informações município e estado das raças Aberdeen Angus, Ayrshire, Braford, Brangus, Charolês, Devon, Flamenga, Hereford, Pinzgauer, Shorthorn e Simental. As raças foram classificadas conforme sua finalidade: carne, dupla aptidão e leite e posteriormente espacializadas no programa ArcGis 10.2. As raças leiteiras estudadas estavam localizadas nos estados do Rio Grande do Sul e Santa Catarina, as raças de duplo propósito em Minas Gerais e no Rio Grande do Sul e as raças de carne estão concentradas na região sul do país. As regressões logísticas demonstraram que as raças de corte e dupla aptidão tendem a ser criadas em regiões com menor temperatura máxima e média, menor amplitude térmica e ITU, porém em municípios com alta umidade e altitude, menor produto interno bruto, pouca orientação técnica, baixo controle de doenças e parasitas e pouca rotação de pastagens A análise de variância mostrou que as raças de carne, leite e dupla aptidão não variaram para as características climáticas, físicas e socioeconômicas. No segundo estudo objetivou-se analisar a associação das variáveis climáticas, físicas e socioeconômicas com a distribuição dos valores genéticos para características de crescimento e perímetro escrotal de animais da raça Brangus. Foram utilizados registros de 84.703 animais da raça Brangus, nascidos entre 2000 e 2010 distribuídos em 65 fazendas do Brasil. Os animais localizaram-se nos estados RS, PR, SP, MG, GO, MG e MS. Á desmama, as maiores médias dos valores genéticos por fazenda estão agrupadas no cluster 1 e ao sobreano agruparam-se no cluster 2. Os maiores valores genéticos ficaram fortemente relacionadas com amplitude térmica e área municipal. Ter conhecimento da distribuição espacial de raças bovinas e dos valores genéticos de animais Brangus pode auxiliar no desenvolvimento de índices ambientais, avaliações genéticas e escolha de animais para determinados ambientes. / Two studies were conducted in order to analyze the spatial distribution of different breeds and breeding values of Brangus animals in Brazil, relating their occurrence to climatic, physical and socioeconomic variables. The aim of the first study was to analyze the relationship of climatic, physical and socioeconomic variables with the distribution of bovine breeds. In this study we used the municipality and state information of the Aberdeen Angus, Ayrshire, Braford, Brangus, Charolais, Devon, Flemish, Hereford, Pinzgauer, Shorthorn and Simmental breeds. Breeds were classified according to their purpose: beef, dual purpose and milk and spatialized using ArcGis 10.2. The dairy breeds studied were located in the states of Rio Grande do Sul and Santa Catarina, the dual purpose breeds in Minas Gerais and Rio Grande do Sul and the beef breeds are concentrated in the southern region of the country. Logistic regression showed that both beef and dual purpose cattle are more likely to be raised in municipalities with lower maximum and average temperatures, lower thermic amplitude and THI, although, with high humidity and altitude, with lower gross domestic product, where technical guidance, rotation of pastures and control of diseases and parasites were low Analysis of variance showed that beef, dairy and dual purpose breeds did not ranged for climatic, physical and socio-economic characteristics. The second study aimed to analyze the association of climate, physical and socio-economic characteristics with the distribution of breeding values of growths traits and scrotal perimeter of Brangus animals. Records of 84.703 Brangus animals, born between 2000 and 2010 distributed in 65 farms in Brazil were used. Cluster analysis formed three clusters of average breeding values per farm. Animals were located in the Brazilian states of RS, PR, SP, MG, GO, MG and MS. At weaning, the highest averages of breeding values per farm were grouped in cluster 1 and to yearling in cluster 2. The highest breeding values were strongly related to thermal amplitude and municipal area. knowledge the spatial distribution of cattle breeds and breeding values of Brangus animals can help in the development of environmental indices, genetic evaluations and in the choice of animals for certain environments.

O objetivo deste estudo foi avaliar o crescimento e desenvolvimento de brotações de progênies de Eucalyptus grandis in vitro. Brotações oriundas de explantes de hipocótilos distais de 10 progênies foram utilizadas no meio de cultura JADS (CORREIA et al., 1995). Utilizou-se o delineamento experimental inteiramente casualizado, com 10 tratamentos (10 progênies). No meio de cultura suplementado com 0,5 mg L-1 de BAP e 0,1 mg L-1 de AIA, efetuaram-se 3 subcultivos e aos 63 dias foram avaliadas as massas fresca e seca. O meio de cultura com 0,1 mgL-1 de BAP foi utilizado no alongamento das brotações e em brotações individualizadas. No alongamento de brotações, procederam-se 3 subcultivos, e aos 63 dias foram avaliadas as massas fresca e seca e número de brotações. No alongamento de brotações individualizadas, aos 21 dias foram avaliadas a altura e a ocorrência de raízes. Existiram respostas diferenciadas das progênies; algumas progênies mostraram maior produção de massa fresca e seca e outras se destacaram no alongamento e enraizamento in vitro. / The aim of this work was to evaluate the growth and development of eucalyptus grandis progeny shoots in vitro. Shoots from distal hypocotyl explants of 10 progenies were cultivated in the JADS (CORREIA et al., 1995) tissue culture medium. The culture medium was suplemented with 0,5 mg L-1 de BAP e 0,1 mg L-1 de IAA. Three subcultures where made and at 63rd day of culture, the fresh and oven dry weight and number of shoots were evaluated. At the elongation phase, using the culture medium suplemented with 0,1 mg L-1 de BAP, three subcultures were made and at the 63rd day of culture, fresh and oven dry weight, shoot height and rooting percentage were evaluated. There were differentiated progeny responses. Some showed higher fresh and oven dry weight production and others showed higher elongation rates and rooting percentage.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-05-08T16:37:29Z No. of bitstreams: 1 Laura Leandro da Rocha.pdf: 1419772 bytes, checksum: 81999c16deb201b3630158eccfcb1ddf (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-08T16:37:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Laura Leandro da Rocha.pdf: 1419772 bytes, checksum: 81999c16deb201b3630158eccfcb1ddf (MD5) Previous issue date: 2009-11-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The aim of the present study was develop a panel of microsatellites for testing paternity in goats as an aid for conservation and improvement programs for local breeds. A total of 381 animals from 10 goat populations [six local Brazilian ecotypes/breeds (Azul, Canindé, Graúna, Marota, Moxotó and Repartida) and four exotic breeds currently used in Brazil (Alpine, Anglo-Nubian, Boer and Saanen) were genotyped. Nine multiplex systems were performed, totaling 27 microsatellites.Polymorphism information content (PIC), probability of exclusion (PE) of the markers and Hardy- Weinberg (HW) equilibrium were estimated for the populations and the probability of identity was determined. For the system with 27 microsatellites, the combined PE was 0.999991 and 0.999999 (PE1 and PE2) and the 21 microsatellites exhibited PIC > 0.60; four microsatellites were monomorphic in some populations. Significant deviations from HW equilibrium (P< 0.05) were found for the markers; CSSM66 was deviated from HW equilibrium in the greatest number of populations (8). Nine markers were selected to make up the panel, eight of which were common to both groups (local and exotic goats); the BM1818 marker was the most informative in the local populations and the BM6506 marker was the most informative in the exotic populations. Combined PE with the group of eight microsatellites was 0.9943 and 0.9997 (PE1 and PE2). Based on the calculation of the probabilities of exclusion within the populations, it was possible to discriminate one individual from among a million (106). The results indicate the possibility of employing few microsatellites in the investigation of paternity in goats with a satisfactory degree of reliability and minimal cost. / O presente trabalho teve como objetivo desenvolver um painel de microssatélites para teste de paternidade em caprinos como auxílio a programas de conservação e melhoramento das raças locais.Foram genotipados 381 animais de 10 populações caprinas sendo seis raças ou ecotipos locais brasileiros (Azul, Canindé, Graúna, Marota, Moxotó e Repartida) e quatro raças exóticas utilizadas atualmente no Brasil (Alpina, Anglo-Nubiana, Boer e Saanen). Realizou-se nove sistemas multiplex,totalizando 27 microssatélites. Foram estimados o PIC, as probabilidades de exclusão dos marcadores e o equilíbrio de Hardy-Weinberg nas populações e, em seguida, determinada a probabilidade de identidade. Para o sistema de 27 microssatélites a probabilidade de exclusão combinada foi de 0,999991 e 0,999999 (PE1 e PE2) e, 21 microssatélites apresentaram PIC > 0,60, onde quatro apresentaram-se monomórficos em algumas populações. Verificaram-se desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg significativos (P< 0,05) para os marcadores, sendo o CSSM66, o que apresentou maior número de populações (8) com desvio. Para compor o painel foram escolhidos 9 marcadores dos quais oito foram comuns aos dois grupos estudados (caprinos locais e exóticos), sendo o BM1818 mais informativo nas populações locais e, o marcador BM6506 nas populações exóticas. A probabilidade de exclusão combinada com o grupo dos oito microssatélites foi de 0,9943 e 0,9997 (PE1 e PE2). Baseado no cálculo das probabilidades de identidade dentro das populações foi possível discriminar um indivíduo entre um milhão (106). Os resultados indicaram a possibilidade de empregar poucos microssatélites na investigação de paternidade em caprinos, com grau de confiabilidade considerado bom, minimizando custos.

O objetivo deste estudo foi avaliar o crescimento e desenvolvimento de brotações de progênies de Eucalyptus grandis in vitro. Brotações oriundas de explantes de hipocótilos distais de 10 progênies foram utilizadas no meio de cultura JADS (CORREIA et al., 1995). Utilizou-se o delineamento experimental inteiramente casualizado, com 10 tratamentos (10 progênies). No meio de cultura suplementado com 0,5 mg L-1 de BAP e 0,1 mg L-1 de AIA, efetuaram-se 3 subcultivos e aos 63 dias foram avaliadas as massas fresca e seca. O meio de cultura com 0,1 mgL-1 de BAP foi utilizado no alongamento das brotações e em brotações individualizadas. No alongamento de brotações, procederam-se 3 subcultivos, e aos 63 dias foram avaliadas as massas fresca e seca e número de brotações. No alongamento de brotações individualizadas, aos 21 dias foram avaliadas a altura e a ocorrência de raízes. Existiram respostas diferenciadas das progênies; algumas progênies mostraram maior produção de massa fresca e seca e outras se destacaram no alongamento e enraizamento in vitro. / The aim of this work was to evaluate the growth and development of eucalyptus grandis progeny shoots in vitro. Shoots from distal hypocotyl explants of 10 progenies were cultivated in the JADS (CORREIA et al., 1995) tissue culture medium. The culture medium was suplemented with 0,5 mg L-1 de BAP e 0,1 mg L-1 de IAA. Three subcultures where made and at 63rd day of culture, the fresh and oven dry weight and number of shoots were evaluated. At the elongation phase, using the culture medium suplemented with 0,1 mg L-1 de BAP, three subcultures were made and at the 63rd day of culture, fresh and oven dry weight, shoot height and rooting percentage were evaluated. There were differentiated progeny responses. Some showed higher fresh and oven dry weight production and others showed higher elongation rates and rooting percentage.

Estudos em genética de paisagem, das espécies zootécnicas, podem impulsionar o entendimento dos processos adaptativos, bem como, a maneira que o ambiente afeta o sucesso destas populações. O objetivo principal do projeto foi identificar assinaturas de seleção no genoma populações de suínos naturalizados brasileiros. Procurando obter a maior representatividade da variabilidade genética e ambiental dos suínos dentro do território brasileiros, amostras de DNA de pelo menos um animal e de pelo menos um grupo genético foram obtidas dentro do Banco de Germopalsma da EMBRAPA, totalizando 191 animais de 18 grupos genéticos suínos brasileiras que foram genotipadas, e classificadas de acordo com sua origem dentro de raça ou grupo genético, estado bioma, bacia hidrográfica, tipo de solo, ecoregião e tipo de vegetação. Após um controle de qualidade os genótipos resultantes foram utilizados no calculo das estatísticas F de Wright, equilíbrio de Hardy-Weinberg. Análise de componentes principais, coeficiente de endogamia, analise da variância molecular, testes de Mantel, e a determinação do número ideal de populações. Os dados ambientais foram convertidos em layers através do Qgis e utilizados na detecção de assinaturas de seleção através do BayeScan v2.1 (Foll & Gaggiotti 2008) e do Samβada (Stucki et al. 2014) Os resultados obtidos mostram que as populações estudadas têm uma estrutura variada entre e dentre si. A maior parte da variabilidade genética esta presente nos indivíduos dentro de grupos genéticos, e indivíduos dentro de estados. Existe diferenciação genética dos suínos dentro das variáveis ambientais classificatórias. As raças Monteiro e Marajó foram as que mostraram maiores níveis de estruturação. Os componentes principais mostram proximidade entre as raças comerciais, assim como o elevado grau de variação na composição genéticas das demais raças, com marcante separação dos animais Monteiro e Marajó. Níveis elevados de endogamia foram encontrados. Foram encontrados pelo menos 8 assinaturas de seleção no genoma das raças suínas localmente adaptadas. A freqüência dos genótipos destes marcadores divide o território brasileiro em duas regiões latitudinais distintas. Os níveis de estruturação das populações demonstram uma grande variabilidade genética entre e dentre as raças. As marcas de seleção encontradas demonstram a influência do meio ambiente no sucesso adaptativo destes animais ao território brasileiro. / Study of landscape genetics in livestock species can help understand the adaptive processes and the way that the environment affects the success of these populations. The main objective was the identification of genetic signatures of selection in the Brazilian autochthone swine breeds. We aim the higher representation of genetic and environmental variability from Brazilian territory sampling at least one animal from one genetic group per sampling point. The samples were obtained on CENARGEN-EMBRAPA Germplasm Bank in a total of 191 DNA samples from 19 Brazilian locally adapted swine genetic groups, classified into state, region, biome, hydrological basins, soil type, ecoregion and vegetation type. These samples were genotyped and after a quality control, we calculated Wright’ F-statistics, individual inbreeding coefficient, Hardy-Weinberg equilibrium, Principal components, IBD, Mantel test, an ideal number of subpopulations and an analysis of molecular variance. Environmental data was converted in layers through Qgis and used to detect signatures of selection by BayeScan v2.1 (Foll & Gaggiotti 2008) and Samβada ((Stucki et al. 2014) Population studied had genetic structure among different subpopulations, in a same category. The biggest part of genetic variability is the individual within breed and in individual within state. We found different intensity of population structure in the categories studied, been the he Monteiro and Marajó breeds that ones with highest values from population genetic structure. Principal component analyses showed proximity between commercial breeds, as well as the high degree of genetic variation among other breeds, with great detachment of Monteiro and Marajó animals from others. High inbreeding levels were found. Signatures of selection were found on the genome of Brazilian locally adapted swine pig. The genotypic frequency of these signatures of selection divides the Brazilian territory into two distinct latitudinal regions. The population structure levels demonstrate a wide genetic variability inside and among races. The signatures of natural selection found demonstrate the influence of the environment to successful adaptation of swine in Brazil.

Estudos em genética de paisagem, das espécies zootécnicas, podem impulsionar o entendimento dos processos adaptativos, bem como, a maneira que o ambiente afeta o sucesso destas populações. O objetivo principal do projeto foi identificar assinaturas de seleção no genoma populações de suínos naturalizados brasileiros. Procurando obter a maior representatividade da variabilidade genética e ambiental dos suínos dentro do território brasileiros, amostras de DNA de pelo menos um animal e de pelo menos um grupo genético foram obtidas dentro do Banco de Germopalsma da EMBRAPA, totalizando 191 animais de 18 grupos genéticos suínos brasileiras que foram genotipadas, e classificadas de acordo com sua origem dentro de raça ou grupo genético, estado bioma, bacia hidrográfica, tipo de solo, ecoregião e tipo de vegetação. Após um controle de qualidade os genótipos resultantes foram utilizados no calculo das estatísticas F de Wright, equilíbrio de Hardy-Weinberg. Análise de componentes principais, coeficiente de endogamia, analise da variância molecular, testes de Mantel, e a determinação do número ideal de populações. Os dados ambientais foram convertidos em layers através do Qgis e utilizados na detecção de assinaturas de seleção através do BayeScan v2.1 (Foll & Gaggiotti 2008) e do Samβada (Stucki et al. 2014) Os resultados obtidos mostram que as populações estudadas têm uma estrutura variada entre e dentre si. A maior parte da variabilidade genética esta presente nos indivíduos dentro de grupos genéticos, e indivíduos dentro de estados. Existe diferenciação genética dos suínos dentro das variáveis ambientais classificatórias. As raças Monteiro e Marajó foram as que mostraram maiores níveis de estruturação. Os componentes principais mostram proximidade entre as raças comerciais, assim como o elevado grau de variação na composição genéticas das demais raças, com marcante separação dos animais Monteiro e Marajó. Níveis elevados de endogamia foram encontrados. Foram encontrados pelo menos 8 assinaturas de seleção no genoma das raças suínas localmente adaptadas. A freqüência dos genótipos destes marcadores divide o território brasileiro em duas regiões latitudinais distintas. Os níveis de estruturação das populações demonstram uma grande variabilidade genética entre e dentre as raças. As marcas de seleção encontradas demonstram a influência do meio ambiente no sucesso adaptativo destes animais ao território brasileiro. / Study of landscape genetics in livestock species can help understand the adaptive processes and the way that the environment affects the success of these populations. The main objective was the identification of genetic signatures of selection in the Brazilian autochthone swine breeds. We aim the higher representation of genetic and environmental variability from Brazilian territory sampling at least one animal from one genetic group per sampling point. The samples were obtained on CENARGEN-EMBRAPA Germplasm Bank in a total of 191 DNA samples from 19 Brazilian locally adapted swine genetic groups, classified into state, region, biome, hydrological basins, soil type, ecoregion and vegetation type. These samples were genotyped and after a quality control, we calculated Wright’ F-statistics, individual inbreeding coefficient, Hardy-Weinberg equilibrium, Principal components, IBD, Mantel test, an ideal number of subpopulations and an analysis of molecular variance. Environmental data was converted in layers through Qgis and used to detect signatures of selection by BayeScan v2.1 (Foll & Gaggiotti 2008) and Samβada ((Stucki et al. 2014) Population studied had genetic structure among different subpopulations, in a same category. The biggest part of genetic variability is the individual within breed and in individual within state. We found different intensity of population structure in the categories studied, been the he Monteiro and Marajó breeds that ones with highest values from population genetic structure. Principal component analyses showed proximity between commercial breeds, as well as the high degree of genetic variation among other breeds, with great detachment of Monteiro and Marajó animals from others. High inbreeding levels were found. Signatures of selection were found on the genome of Brazilian locally adapted swine pig. The genotypic frequency of these signatures of selection divides the Brazilian territory into two distinct latitudinal regions. The population structure levels demonstrate a wide genetic variability inside and among races. The signatures of natural selection found demonstrate the influence of the environment to successful adaptation of swine in Brazil.