Este trabalho refere-se ao estabelecimento de populações humanas em tempos pretéritos e aos processos de interação que podem se desenvolver entre elas, visualisados pela arqueologia. Buscamos desvendar como ocorreu a ocupação humana (anterior a colonização) no Vale do Rio Soturno, região central do estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Os sítios arqueológicos estudados espalhados por esta micro-região foram: Várzea dos Bugres; Cerro dos Bugres; Cerro do Tope; Moacir Rossato, com remanescentes culturais atribuídos aos Guarani. Tentamos entender quais as escolhas que estes grupos fizeram em relação aos recursos ambientais locais, suas estratégias de exploração, as relações entre si e as escolhas na elaboração de seus utensílios remanescentes de uso cotidiano. Percebemos que os grupos atuantes neste espaço optaram por adotar algumas características técnicas específicas, mas no geral seguem o padrão clássico de ocupação Guarani. Realizamos ainda um trabalho com a comunidade que vive no local atualmente, utilizando a metodologia da educação patrimonial, a fim de que esse patrimônio cultural estudado se tornasse conhecido e aceito junto àqueles que serão seus guardiões. Apesar de não contarmos com um número de sítios relevante para um estudo de caráter regional, acreditamos ter contribuído para a arqueologia Guarani apresentando especificidades culturais de grupos que ocuparam um local que até então não fora estudado. / This search refers to the establishment of human populations in past times and the interaction process that can develop between them, shown by archaeology. We seek to discover how human occupation occurred (before colonization) in Sortuno river valley, in central Rio Grande do Sul, Brazil. The archaeological sites studied in this micro-region were: Várzea dos Bugres; Cerro dos Bugres; Cerro do Tope; Moacir Rossato, with the remaining cultures attributed mostly to the Guarani. We try to understand what choices these groups have in relation to local environmental resources, their exploration strategies, relations between themselves and the choices in the development of their remaining fixtures of everyday use. We realize that groups working in this area have chosen to adopt some specific technical features, but in general follow the classic pattern Guarani occupation. We also worked with the community that lives on site using the heritage education methodology, so that the cultural heritage studied could become known and accepted between those who will be their guardians. Although we could not count with a certain number of sites that study regional character, we believe to have contributed it to archaeological Guarani, showing specific cultural groups that occupied a place that until then had not been studied.

O avental cirúrgico, um dos principais componentes de barreira antimicrobiana, é confeccionado com materiais de tecido e não-tecido. A Sociedade Norte-Americana de Enfermeiros do Centro Cirúrgico - AORN e a Norma Européia - EN 13795-3 recomendam que os aventais cirúrgicos devam prover uma barreira apropriada contra microrganismos, sangue e outros fluidos corpóreos (seco ou molhado). Tais recomendações, no entanto, não definem o que consideram como \"barreira apropriada\". O que ainda não foi comprovado, porém, é se o uso de materiais de não-tecido realmente interfere, isoladamente, tanto na contaminação da ferida operatória, quanto na ocorrência de ISC. O presente estudo teve como objetivo verificar se há evidências científicas, pela revisão sistemática de literatura, que fundamentem a prática do uso de aventais em cirurgias, conforme seu material de confecção. Foram considerados para a revisão sistemática apenas estudos básicos de intervenção, que investigaram a contaminação e ou a infecção do sítio cirúrgico com uso de aventais cirúrgicos reutilizáveis e ou de uso-único, utilizando como população pessoas submetidas a cirurgias, em situações reais ou simuladas, em qualquer período, sem limitação de idioma. Para localizar os estudos, utilizou-se a estratégia: P (pacientes) = pacientes cirúrgicos - surgical patients, I (intervenção) = roupa hospitalar ou roupa de proteção – clothing / protective clothing, C (comparação) = uso-único ou reutilizável - single-use or reusable, O (desfecho) = contaminação ou infecção da ferida operatória – surgical wound infection/contamination. A busca dos estudos orientou-se pelas bases de dados eletrônicas: LILACS, CINAHL, EMBASE, COCHRANE, PubMed/MEDLINE, pesquisa manual na revista da Sociedade Brasileira de Enfermeiros de Centro Cirúrgico (SOBECC) e referências dos estudos incluídos. Os dados analisados foram apresentados em três fases: Fase 1: Caracterização do processo de seleção dos estudos; Fase 2: Caracterização dos estudos incluídos; Fase 3: Avaliação da evidência dos estudos incluídos, a partir de duas escalas de qualidade, sendo uma delas a de Jadad e outra a de Controle de Infecção Cirúrgica (EQCIC), adaptada de Nobre e Bernardo. A amostra desta revisão sistemática constituiu-se de 12 estudos, sendo que apenas um deles investigou o avental isoladamente. Os demais investigaram principalmente os campos cirúrgicos juntamente com os aventais. Constata-se, com isso, dificuldade de isolar o objeto de intervenção de outros inúmeros fatores que podem interferir nos desfechos, em estudos desta natureza. Dois estudos (E1, E2) obtiveram forte evidência de recomendação, concluindo pela não diferença de contaminação e infecção do sítio cirúrgico entre aventais e campos de tecido e não-tecido. Devido à ausência de estudos semelhantes não houve a possibilidade de realizar a metanálise. A verificação isolada de aventais cirúrgicos depende de mais pesquisas bem controladas e delineadas. A contribuição desta investigação para a implementação de prática baseada em evidências mostrou-se relevante não somente para responder especificamente à questão da pesquisa, mas também para identificar qualidade, lacunas, falhas e recomendar aspectos a serem considerados nas próximas pesquisas desta natureza / The surgical gown, one of the main components of the antimicrobial barrier, is confectioned with woven and non-woven materials. The American Operating Room Nursing - AORN and The European Norm - EN 13795-3 recommend that the surgical gowns should provide an appropriate barrier against microorganisms, blood and other organic fluids (dry or wet). These recommendations, however, do not define, yet, what to consider an \"appropriate barrier\".. What has not been proved yet is if the use of non-woven materials influence, in an isolated way, both the contamination of an operation wound, and the occurrence of ISC. It was the objective of this present study to investigate if there is scientific evidence, by means of systematic revision, that founded the practice of use of gowns in surgery, according to its material of confections. Only basic studies of intervention that investigated the contamination and or surgical site infection with the use of surgical gowns reusable or single-use were considered in the systematic revision, which used as population people who underwent surgery, in real or simulated situations, in any period, without idiom limitation. To locate the studies, we used the PICO strategy: P (patients): surgical patients, I (intervention) = clothing/protective clothing, C (comparison) = single-use or reusable, O (outcome) = contamination or surgical wound infection. The search of studies was guided by the following electronic data bases: LILACS, PubMed/MEDLINE, EMBASE, COCHRANE, CINAHL, manual research in the magazine of Brazilian Society Operating Room Nursing (SOBECC) and references of included studies. The data analyses were shown in three phases: Phase 1: characterization of process of select studies; Phase 2: characterization of included studies; Phase 3: evaluation of the evidence found in the included studies, using two quality scales, being one this The Jadad and other Surgical Infection Control (EQCIC), adapted from Nobre and Bernardo. The sample of this systematic revision comprises 12 studies, being only one of them analyzed only gowns. The remainder investigated mainly the surgical fields together with the gowns. We can see thereby the difficulty in isolating the object of intervention from other countless factors that can influence outcomes, in studies of this nature. Two studies (E1, E2) found strong evidence of recommendation, concluding that there is no difference in terms of contamination and surgical wound infection between woven and non-woven gowns and drapes. Due to the absence of similar studies it is not possible to do some metanalysis. The isolated verification of surgical gowns needs more well controlled and delineated research. The contribution of this investigation to the implementation of practices based on evidences in showed relevant not only to answer specifically the question of research, but also to identify quality, gaps and flaws and recommend aspects to be considered in future research of this nature

O aprovisionamento ou obtenção das rochas e minerais aptos para lascamento ou polimento constitui um dos temas mais abordados pela arqueologia de caçadores-coletores ao redor do mundo. O aprovisionamento lítico é um fenômeno cultural cujo estudo não está limitado à determinação da proveniência de tais materiais, integrando aspectos geomorfológicos e geológicos como disponibilidade, abundância e localização de afloramentos e clastos, com aspectos humanos da seleção como qualidade para as tarefas requeridas, cor, forma de remoção ou escavação e gestão tecnológica. A presente dissertação aborda o problema do aprovisionamento lítico em Dourado, região de cuestas basálticas no centro do estado de São Paulo, onde se insere o sítio Bastos, que apresenta datas entre ca. 7,650 e 12,640 anos cal a.P. e artefatos líticos manufaturados em arenito silicificado. Tendo como base uma relação conceitual entre tecnologia e suas consequências na paisagem lítica e uma perspectiva geoarqueológica sobre os recursos líticos, é proposto um protocolo de pesquisa que integra: a) prospecção de fontes potenciais e utilizadas de matéria-prima lítica num setor central e sul respeito do sítio; b) análise macroscópica mediante classificação paradigmática das amostras coletadas; c) análise petrográfico microscópico; d) e análise tecnológica dos artefatos recuperados em fontes, ocorrências e sítios. Os resultados indicam: 1) uma paisagem lítica caracterizada por extrações em afloramentos e clastos de arenito silicificado de muito boa a excelente qualidade para lascamento num raio mínimo de aprovisionamento diário de 3 km desde o sítio Bastos; 2) uma tendência a uma maior representação de poucas variedades específicas de arenito silicificado nos níveis antigos (ca. 12,500 cal a.P.) do sítio respeito dos mais tardios (<9000 cal a.P.), o que teria relação com a disponibilidade imediata; 3) uma tecnologia fora das fontes diferenciada entre o reverso das cuestas (setor central) e o frente da mesma (setor sul), com destaque no primeiro caso, do segundo registro de produção de lâminas (lascas alongadas especializadas) no Brasil. Concluiu-se com a ênfase na necessidade de se ampliar as escalas e métodos de análise da presente 5 pesquisa e de se realizar propostas semelhantes em outras partes do país, para um estudo comparativo sistemático do aprovisionamento lítico em diferentes períodos e lugares. / The procurement of rocks and minerals suitable for knapping and grinding constitutes one of the main topics of hunter-gratherer archaeology all around the world. As a cultural phenomenom, from the perspective of its study, lithic procurement is not restricted to sourcing materials, but integrates geomorfological and geological aspects such as availability, abundance and location of outcrops and clasts, with human aspects of lithic selection, such as quality, color, extraction or excavation mode and technological processing. The present Master thesis focuses on the problem of lithic procurement in the Dourado region, in the basaltic cuestas landscape of central São Paulo state, where the Bastos site is located, which exhibits dates between ca. 7,650 and 12,640 cal years BP and lithic artifacts manufactured in silicified sandstone. Using a conceptual approach that relies on the relationship between technology and its consequences in the lithic landscape with a geoarchaeological perspective on lithic resources, the research protocol integrates: a) potential and utilized raw material sources survey in a central and southern sector from the site; b) a paradigmatic macroscopic classification of the samples; c) a petrographic microscopic analysis; d) and technological analysis of artifacts recovered in sources, isolated spots and sites. Results indicate: 1) a lithic landscape characterized by extractions on very good-to-excellent knapping quality silicified sandstone outcrops and clasts in a 3-km minimum foraging radius around the Bastos site; 2) a trend towards a higher representation of few specific silicified sandstone varieties in the older levels (ca. 12,500 cal a.P.) as compared to the later ones (<9000 cal a.P.), which would be the effect of an inmediate availability; 3) an out-of-the-sources technology differentiated between the backside of the cuestas (central sector) and the front (southern sector), with the remarkable finding in the former,of the second record of blade production (specialized long flakes) in Brazil. An emphasis on the need of widening the scale and methods of this research is concluded, together with the need of making similar approaches in other parts of the country that will allow a systematic comparative study of lithic procurement in different periods and places.

O objeto de estudo desta pesquisa é o sítio arqueológico Capelinha 1, situado nas proximidades da cidade de Cajati-SP. Tanto sua implantação na paisagem quanto suas características estruturais - particularmente sua composição conchífera - sugerem, em princípio, sua inclusão na categoria dos \"sambaquis fluviais\", encontrados no médio vale do Ribeira. A presença, porém, de uma indústria lítica associada à Tradição Umbu, inserida em uma estratigrafia em que predomina a matriz conchífera, contribui para a indefinição da natureza cultural do sítio e uma conseqüente dificuldade em relacioná-lo ao contexto arqueológico regional. Assim, o objetivo precípuo desta pesquisa é investigar os processos de formação do sítio Capelinha, procurando solucionar as questões por ele apresentadas e inseri-lo no contexto arqueológico do médio vale do Ribeira, com reflexos na arqueologia do Brasil meridional. Esta pesquisa é integrada ao projeto temático Investigações Arqueológicas e Geofísicas nos Sambaquis Fluviais do Vale do Ribeira de Iguape, Estado de São Paulo, apoiado pela FAPESP / The study object of this research is the Capelinha 1 archaeological site, located in the outskirts of Cajati-SP. Both its placement in the landscape and its structural characteristics - particularly its conchiferous composition - suggest, initially, its inclusion among the \"fluvial shellmounds\", very common in the Ribeira de Iguape valley. However, the presence of a lithic industry associated to the Umbu Tradition, inserted in a stratigraphy in which the conchiferous matrix is predominant, contributes to the lack of definition of the cultural nature of the site and, consequently, makes it difficult to relate to the regional archaeological context. Therefore, the main objective of this research is to investigate the formation processes of the Capelinha 1 site, aiming to solve the many questions presented and incorporating it to the archaeological context of the Ribeira de Iguape valley; this has further consequences in the archaeology of southern Brazil. This research is integrated to the thematic project Investigações Arqueológicas e Geofísicas nos Sambaquis Fluviais do Vale do Ribeira de Iguape, Estado de São Paulo.

A presente pesquisa analisa a geomorfologia do Sítio Urbano de Cuiabá (MT) e arredores. Para tanto, apresenta-se uma carta geomorfológica detalhada dessa área na escala de 1:50.000, elaborada a partir de pesquisa documental, trabalho de campo, análise e tratamento de dados em laboratório e, principalmente, análise e interpretação de fotografias aéreas. O estudo, desenvolvido conforme a abordagem da Antropogeomorfologia ou Geomorfologia Antropogênica, enfatiza a aplicação da cartografia geomorfológica retrospectiva. Essa abordagem cartográfica lida com o estágio pré-perturbação, correspondente a morfologia original, buscando reconstruir os sistemas geomorfológicos anteriores às distintas intervenções antrópicas. O mapeamento pautou-se em uma abordagem multiescalar e sistêmica, o qual transitou entre os diversos elementos da vertente, atingindo o nível até o interflúvio, assim como os subsistemas de canal fluvial e planície de inundação e suas respectivas morfologias. O trabalho de cartografação constituiu-se de dois momentos, a cartografia morfológica preliminar, seguida da verificação e validação das correlações entre as unidades morfológicas aferidas em campo, incluindo as informações dos materiais integrantes do modelado. Dados pontuais resultantes da descrição de afloramentos no interior da cidade e suas imediações foram associados à informação bibliográfica disponível e às análises laboratoriais realizadas. Esse conjunto permitiu a caracterização dos materiais das unidades morfológicas, assim como a correlação entre a carta morfológica e as informações dos materiais permitiu interpretar a morfodinâmica desses sistemas, orientada para possíveis tendências espaciais de processos hidrogeomorfológicos atuais. Com isso, alcançou-se o segundo momento, o da cartografia final, a carta geomorfológica. A carta geomorfológica e sua análise permitiram reconstruir e caracterizar o modelado do Sítio Urbano de Cuiabá, assim como o resgate dos sistemas geomorfológicos no estágio pré-perturbação antrópica. Como resultado da pesquisa, produziu-se o mapa da morfologia original do sítio urbano de Cuiabá (MT) e arredores, assim como o seu mapa geomorfológico. Entre as morfologias mapeadas e descritas foi possível, por exemplo, identificar morfologias de fundo vale em berço com prováveis níveis de exfiltração. Essa forma, possivelmente, correlaciona-se com descontinuidades litológicas e texturais intraformacionais que, por sua vez, podem fazer parte de um comando de circulação hídrica interna. Conclui-se que a cartografia geomorfológica retrospectiva constitui um importante instrumento auxiliar para a avaliação dos efeitos derivados da ação antrópica, principalmente nas modalidades de intervenção de elevada magnitude, ao exemplo da urbanização. Portanto, torna-se indispensável para compreensão da morfodinâmica dos sistemas não perturbados e para base de pesquisas aplicadas. / This research analyzes the geomorphology of Cuiabá (MT) Urban Site and its surroundings. For that, a detailed geomorphological map of this area is presented in the 1: 50,000 scale, elaborated from documentary research, fieldwork, data analysis and laboratory treatment and, mainly, analysis and interpretation of aerial photographs. The study, developed according to the Anthropogeomorphology approach or Anthropogenic Geomorphology, emphasizes the application of retrospective geomorphological mapping. This cartographic approach deals with the pre-perturbation stage, corresponding to the original morphology, pretending to reconstruct the geomorphological systems prior to the different anthropic interventions. The mapping was based on a multiscale and systemic approach, which transited between the various elements of the slope, reaching the level up to the interflow, as well as the river channel and floodplain subsystems and their respective morphologies. The cartographic work consisted of two moments, the preliminary morphological cartography, followed by the verification and validation of the correlations between the morphological units ascertained in the field, including the integrate landforms materials. Punctual data resulting from the description of outcrops within the city and its surroundings were associated with available bibliographic information and laboratory analyzes. This set allowed the materials characterization the of the morphological units, as well as the correlation between the morphological map and the material information allowed to interpret the morphodynamics of these systems, oriented to possible spatial tendencies of current hydrogeomorphologic processes. With this, the second moment was reached, that of the final cartography, the geomorphological map. The geomorphological map and its analysis allowed to reconstruct and characterize the landforms of Cuiabá Urban Site, as well as the rescue of geomorphological systems in the antropic pre-perturbation stage. As a result of the research, the map of the original morphology of Cuiabá the urban site and its surroundings was produced, as well as its geomorphological map. Among the morphologies mapped and described, it was possible, for example, to identify basal morphologies in a crib with probable levels of exfiltration. This form possibly correlates with intra-formational lithologic and textural discontinuities which, in turn, may form part of an internal water circulation command. It is concluded that the retrospective geomorphological mapping is an important auxiliary instrument for the evaluation of the effects derived from anthropic action, mainly in the intervention modalities of high magnitude, to the example of urbanization. Therefore, it becomes indispensable for understanding the morphodynamics of undisturbed systems and for the basis of applied research.

Nesta pesquisa de doutorado foi desenvolvida uma metodologia de análise e interpretação de dados GPR (Ground Penetrating Radar) empregando a tomografia de micro-ondas. Esta ferramenta foi empregada com o objetivo de detectar e estimar a geometria de alvos que simulam artefatos comumente encontrados em sítios arqueológicos brasileiros e de um alvo orgânico que simula um corpo humano em decomposição visando estudos forenses sob condições controladas. Os dados de interesse arqueológico foram adquiridos sobre o Sítio Controlado de Geofísica Rasa (SCGR) do IAG/USP. Os dados de interesse forense foram adquiridos sobre um experimento controlado conduzido no campus da USP em Pirassununga (SP), onde um porco de aproximadamente 80 kg foi enterrado e a sua decomposição foi monitorada com o método GPR ao longo de 18 meses. Os cálculos necessários para a execução da inversão dos dados GPR através da tomografia foram implementados em linguagem Matlab, juntamente com ferramentas de remoção de background que se mostraram úteis para auxiliar a interpretação dos resultados. O programa de imageamento tomográfico foi validado a partir de dados sintéticos gerados no software GprMax a partir de modelos que simulam os alvos de interesse arqueológico instalados no SCGR. A geometria dos alvos do SCGR pôde ser bem estimada, exceto pelo alvo representado pelo muro de tijolos. Feições no solo associadas às escavações para instalação dos alvos puderam ser observadas com clareza nas imagens tomográficas. A geometria do porco, bem como o processo de decomposição foram mapeados através da tomografia mesmo em condições de baixo contraste entre as suas propriedades elétricas e as do solo. Em ambos os casos estudados as imagens tomográficas de dados GPR de 270 MHz, 400 MHz e 900 MHz permitiram extrair mais informações acerca dos alvos do que pelo uso do processamento convencional. Os resultados mostram que a tomografia de micro-ondas possui um grande potencial para aplicação em sítios arqueológicos brasileiros, bem como para aplicações forenses. / In this research a methodology for analysis and interpretation of GPR (Ground Penetrating Radar) data using microwave tomography was developed. This tool was used for detection and geometry evaluation of targets which simulate artifacts usually found at Brazilian archaeological sites and also of one organic target which simulates a decomposing human body for forensic studies under controlled conditions. The data of archaeological interest were acquired on the Geophysical Test Site (SCGR) at IAG/USP. The data of forensic interest were acquired on an experiment developed at the USP campus in Pirassununga (SP) city. In this experiment a pig with about 80 kg was buried and its decomposition was monitored through GPR profiles during 18 months. The calculations required for the GPR data inversion through microwave tomography were implemented in Matlab language, with background removal tools which were helpful for the interpretation of resulting images. The tomographic imaging program was validated using synthetic data generated by the software GprMax. The models simulate targets of archaeological interest buried at the SCGR. The geometry was well estimated for all the targets, except for the brick wall. Ground features associated to excavations done for the installation of the targets were clearly observed in the tomographic images. The pig geometry and its decomposition process were mapped through microwave tomography even under conditions of low contrast between its electric properties and those from the soil. In both studied cases the tomographic images from GPR data of 270 MHz, 400 MHz and 900 MHz allowed to extract more information about the targets than just using the conventional processing. The results show that microwave tomography has a great potential to be applied at Brazilian archaeological sites, as well as for forensic applications.

Submitted by Mariana Dornelles Vargas (marianadv) on 2015-05-12T11:51:57Z No. of bitstreams: 1 discutindo_tradicao.pdf: 4329616 bytes, checksum: be762c9d1ae4487e355bae46cecfd97b (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-12T11:51:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 discutindo_tradicao.pdf: 4329616 bytes, checksum: be762c9d1ae4487e355bae46cecfd97b (MD5) Previous issue date: 2012 / Milton Valente / A presente dissertação objetiva retomar discussões a respeito da tradição ceramista Aratu, buscando avançar na compreensão dos modelos de origem e dispersão, contribuir para o entendimento do ambiente de implantação dos sítios, bem como trazer um estudo de caso inédito através da análise e publicação dos dados do sítio GO-RV-06. O projeto foi dividido em três momentos distintos: o primeiro, onde através de uma intensa revisão bibliográfica e cruzamento de dados foi possível inferir sobre o papel da possível zona central e das zonas periféricas de dispersão da tradição; o segundo que buscou verificar a hipótese da implantação dos sítios Aratu em áreas de ecótono e entender o ambiente no centro e periferia e o terceiro, onde foi realizada a análise do sítio GO-RV-06, abordado na década de 70 durante o Programa Arqueológico de Goiás e até então não publicado integralmente. Os três eixos-temáticos dialogam entre si fornecendo um quadro geral que deve auxiliar no entendimento desta tradição ceramista. / The present dissertation intends to resume the discussions about the Aratu Ceramist Tradition, seeking to advance the understanding of the origin and dispersion models, to contribute to the understanding of the deployment environment of the sites, as well as bring an unprecedented case study by analysing and publishing the data GO-RV-06 site. The project was divided into three distinct periods: the first, where through an intense literature review and crossing data was possible to infer about the role of the possible central and peripheral dispersion zones of tradition. The second aimed to verify the hypothesis of deployment of Aratu sites in ecotone areas and understand the environment in the center and periphery and the third one, where an analysis in the GO-RV-06 site was carried out, discussed in the 70?s during the Programa Arqueológico de Goiás and not published in full until the present moment. The three thematic axes dialogue with each other providing a general framework that should help in understanding this ceramist tradition.

A Terra Preta Antropogênica (TPA) ocorre somente em sítios arqueológicos na região amazônica. Estes solos de origem antrópica foram enriquecidos em nutrientes, provavelmente pelo manejo de restos orgânicos e do fogo pelas populações pré-colombianas. Em TPA, a presença de material orgânico estável e a grande atividade biológica indicam que este tipo de solo pode ser um local de alta diversidade microbiana, constituindo numa fonte de germoplasma microbiano. Contudo, atualmente não se tem conhecimento da biologia e, sobretudo da estrutura e diversidade das comunidades microbianas deste solo. O conhecimento sobre a diversidade microbiana trará compreensão das funções exercidas pelas comunidades microbianas no solo e o conhecimento das suas interações com outros componentes da biodiversidade, além de benefícios econômicos e estratégicos, como a descoberta de microrganismos potencialmente exploráveis nos processos biotecnológicos. Metabólitos secundários, como antibióticos e toxinas microbianas, podem ser considerados como produtos naturais de importância ecológica. Muitos metabólitos secundários produzidos por fungos e bactérias desenvolvem atividades multifuncionais através da via não-ribossomal, pelas enzimas peptídeo sintetase e policetídeo sintase, que são enzimas multidomínio e podem estar envolvidas na produção de sideróforos e antibióticos. Este estudo teve como objetivo a busca por peptídeos não-ribossômicos produzidos por bactérias isoladas de TPA e suas caracterizações bioquímica e molecular. Através de cultivo, 150 isolados foram selecionados de TPA para análise taxonômica por amplificação e seqüenciamento do gene 16S rRNA, após análise de restrição por enzima de restrição para se conhecer o polimorfismo genético dos isolados. De acordo com o seqüenciamento pôde-se agrupar esses isolados em 17 grupos. Os resultados indicaram a presença dos gêneros Pseudomonas, Bacillus, Arthrobacter, Janthinobacterium, Staphylococcus e Massili. Metabólitos extracelulares foram extraídos dos cultivos bacterianos, usando acetato de etila e clorofórmio, seguidos pela concentração dos extratos, para determinação da capacidade antimicrobiana e a produção de sideróforo foi avaliada usando-se cromoazurol S (CAS). Os resultados mostraram que treze dos 17 isolados apresentaram genes NRPS ou PKS, ou para ambos os genes, associados à produção de peptídeos não-ribossômicos. De todos os isolados estudados, 97% apresentaram produção de sideróforos e algumas espécies dos gêneros Bacillus, Pseudomonas, Arthrobacter e Janthinobacterium mostraram positivas em inibir o crescimento de cinco bactérias testes. A produção de sideróforos do tipo hidroxamato foi positiva para 8 isolados e 7 isolados para o tipo catecol, sendo que 2 isolados não apresentaram reação. Os resultados obtidos em espectrometria de massas Q-TOF indicaram a presença do antibiótico fenazina para o isolado Pseudomonas putida BCM 20, considerado de importância no controle biológico de diversas bactérias patogênicas. / The Anthropogenic Dark Earth (ADE) occurs mainly in archeological sites in the Amazon region. These soils from anthropic origin were enriched with nutrients, probably by the management of organic residues and fire produced by pre-Colombian populations. In ADE, the presence of stable organic matter and high biological activity indicate that this type of soil can be a site of a highly microbial diversity, appointing as a source of microbial germplasm. However, at the present time there is little knowledge about its biology, and especially the structure and diversity of the microbial communities from these soils. The knowledge about microbial diversity will promote a better understanding of the function promoted by the soil microbial community and the knowledge of its interaction with components from biodiversity, likewise the economical and strategic benefits, as for example the discovery of potential microorganisms for exploring biotechnological processes. Secondary metabolites, like antibiotics and microbial toxins, may be considered as natural products of ecological importance. Many of the secondary metabolites produced by fungi and bacteria develop multifunctional activities via non-ribosomal for peptide enzymes and polypeptide synthesis, that are multi-domain enzymes and can be involved in the production of siderophore and antibiotics. This study had the objective of searching for non-ribosomal peptides produced by bacteria isolated from ADE and its biochemical and molecular characterization. Through cultivation in selective media, 150 strains were isolated from ADE for taxonomic analysis by amplification and sequencing of the 16S rRNA gene, after the restriction analysis by restriction enzyme for knowing the genetic strains polymorphism. From the sequencing, it was possible to select these strains in 17 groups, with predominant genera - Pseudomonas, Bacillus, Arthrobacter, Janthinobacterium, Staphylococcus and Massili. Extracellular metabolites were extracted from the cultivated bacteria, using ethylacetate and chloroform, followed by detection of antimicrobial metabolites from bacterial supernatants. Siderophore production was evaluated using ChromoBlue S (CAS). The results from the strains representing the 17 groups showed that at least thirteen strains presented NRPS or PKS gene, or for both genes, associated to the production of non-ribosomal peptides. From all the studied strains, it was found that 97% presented the production of siderophore and that several species from the genera Bacillus, Pseudomonas, Arthrobacter and Janthinobacterium proved to be positive on bacterial growth inhibition. The production of hydroxamate-type siderophore was positive to eight strains and seven strains for the cathecol type, and two strains did not present any reaction. The results obtained from the Q-TOF mass spectrometry confirmed the production of 6-hydroxyphenazine-1-carboxylic acid from the isolated identified as Pseudomonas putida BCM 20. This compound belongs to a fully studied group of antibiotics for biological control against several pathogenic bacteria.

Nesta pesquisa de doutorado foi desenvolvida uma metodologia de análise e interpretação de dados GPR (Ground Penetrating Radar) empregando a tomografia de micro-ondas. Esta ferramenta foi empregada com o objetivo de detectar e estimar a geometria de alvos que simulam artefatos comumente encontrados em sítios arqueológicos brasileiros e de um alvo orgânico que simula um corpo humano em decomposição visando estudos forenses sob condições controladas. Os dados de interesse arqueológico foram adquiridos sobre o Sítio Controlado de Geofísica Rasa (SCGR) do IAG/USP. Os dados de interesse forense foram adquiridos sobre um experimento controlado conduzido no campus da USP em Pirassununga (SP), onde um porco de aproximadamente 80 kg foi enterrado e a sua decomposição foi monitorada com o método GPR ao longo de 18 meses. Os cálculos necessários para a execução da inversão dos dados GPR através da tomografia foram implementados em linguagem Matlab, juntamente com ferramentas de remoção de background que se mostraram úteis para auxiliar a interpretação dos resultados. O programa de imageamento tomográfico foi validado a partir de dados sintéticos gerados no software GprMax a partir de modelos que simulam os alvos de interesse arqueológico instalados no SCGR. A geometria dos alvos do SCGR pôde ser bem estimada, exceto pelo alvo representado pelo muro de tijolos. Feições no solo associadas às escavações para instalação dos alvos puderam ser observadas com clareza nas imagens tomográficas. A geometria do porco, bem como o processo de decomposição foram mapeados através da tomografia mesmo em condições de baixo contraste entre as suas propriedades elétricas e as do solo. Em ambos os casos estudados as imagens tomográficas de dados GPR de 270 MHz, 400 MHz e 900 MHz permitiram extrair mais informações acerca dos alvos do que pelo uso do processamento convencional. Os resultados mostram que a tomografia de micro-ondas possui um grande potencial para aplicação em sítios arqueológicos brasileiros, bem como para aplicações forenses. / In this research a methodology for analysis and interpretation of GPR (Ground Penetrating Radar) data using microwave tomography was developed. This tool was used for detection and geometry evaluation of targets which simulate artifacts usually found at Brazilian archaeological sites and also of one organic target which simulates a decomposing human body for forensic studies under controlled conditions. The data of archaeological interest were acquired on the Geophysical Test Site (SCGR) at IAG/USP. The data of forensic interest were acquired on an experiment developed at the USP campus in Pirassununga (SP) city. In this experiment a pig with about 80 kg was buried and its decomposition was monitored through GPR profiles during 18 months. The calculations required for the GPR data inversion through microwave tomography were implemented in Matlab language, with background removal tools which were helpful for the interpretation of resulting images. The tomographic imaging program was validated using synthetic data generated by the software GprMax. The models simulate targets of archaeological interest buried at the SCGR. The geometry was well estimated for all the targets, except for the brick wall. Ground features associated to excavations done for the installation of the targets were clearly observed in the tomographic images. The pig geometry and its decomposition process were mapped through microwave tomography even under conditions of low contrast between its electric properties and those from the soil. In both studied cases the tomographic images from GPR data of 270 MHz, 400 MHz and 900 MHz allowed to extract more information about the targets than just using the conventional processing. The results show that microwave tomography has a great potential to be applied at Brazilian archaeological sites, as well as for forensic applications.

O trabalho ora apresentado foi concebido como tendo dois objetivos. O primeiro, mais geral, foi implementar uma nova metodologia para o estudo de mudanças conformacionais em proteínas, ou seja, de sua dinâmica estrutural. A técnica de marcação de spin sítio dirigida aliada à ressonância paramagnética eletrônica (SDSL-RPE) são os pilares desse novo método que faz, agora, parte do conjunto de técnicas disponíveis no Grupo de Biofísica Molecular Sérgio Mascarenhas do Instituto de Física de São Carlos (USP). O segundo objetivo, mais específico, representou o caminho efetivamente tomado para que se alcançasse o objetivo geral. Para isso, foi proposto o estudo da correlação estrutura e função de dois sistemas biológicos muito interessantes. O primeiro deles envolveu o estudo do movimento das hélices que compõem a estrutura da proteína ligante de cálcio S100A12 humana (HS100A12) induzido pelos íons cálcio e zinco. Sabendo que a proteína S100A12 humana além de ligar íons Ca+2, apresenta afinidade por outros metais divalentes, como os íons Zn+2 e Cu+2, e que a formação de diferentes oligômeros da proteína é governada pela concentração dos íons Ca+2 e Zn+2, realizamos estudos espectroscópicos utilizando a técnica de dicroísmo circular a fim de investigarmos a estabilidade térmica da proteína HS100A12 na presença e ausência dos íons cálcio e zinco. Mudanças conformacionais na estrutura da HS100A12 foram monitoradas através da construção de uma série de mutantes (simples e duplos) em que resíduos nas hélices B, C e D foram trocados por cisteínas, subsequentemente marcadas com a sonda magnética MTSSL e submetidas às análises de SDSL-RPE. Estas consistiram na medida do espectro de RPE dos vários mutantes em temperatura ambiente para estudarmos os efeitos da presença dos íons sobre a dinâmica experimentada pela sonda nas diversas posições. Além disso, efetuamos medidas de distância entre duas sondas seletivamente inseridas na estrutura protéica, procurando assim complementar o entendimento acerca do efeito da presença dos íons sobre a proteína. Por fim, devido ao fato da proteína HS100A12 estar envolvida em alguns eventos de sinalização celular e interação com o receptor para produtos de glicosilação (RAGE), decidimos também, estudar a interação da proteína com modelos de biomembranas, utilizando monocamadas de Langmuir. O outro problema de interesse utilizou a lizosima do fago T4, uma proteína padrão, da qual uma variedade de mutantes é produzida rotineiramente a fim de obtermos mais detalhes a respeito da sua correlação estrutura e função e tornar mais sólido o entendimento da técnica SDSL. Inicialmente, realizamos um estudo com a suposta criação de uma cavidade no \"core\" hidrofóbico da porção C-terminal da enzima, quando mutamos a Leu 133 por Ala e/ou Gly, ou seja, quando trocamos um resíduo grande por um de menor volume, pois se acredita que a proteína sofra um reajuste estrutural com o intuito de preencher o espaço vazio criado por essa substituição. Para isso, propusemos estudar por SDSL o movimento da &alpha;-hélice H inserindo o marcador de spin na posição vizinha ao resíduo mutado. Adicionalmente, realizamos um experimento de \"transmutação\" com a enzima T4L, a fim de investigar a natureza das contribuições para os diferentes modos dinâmicos experimentados pelo marcador de spin quando introduzido em sítios topologicamente semelhantes. / The work presented here was conceived with two main objectives. The first one, more general, involved the implementation of a new methodology for the study of conformational changes in proteins, i.e., its structural dynamics. The technique of Site-directed Spin Labeling combined with Electronic Paramagnetic Resonance (SDSL-EPR) are the pillars of this new method, which is now part of the set of techniques available at the Grupo de Biofísica Molecular Sérgio Mascarenhas, Instituto de Física de São Carlos (USP). The second objective, more specific, represented the path actually taken to achieve the overall goal. Therefore, it was proposed to study the structure-function correlation in two interesting biological systems. The first involved the study of the movement of the helices that form the structure of the human calcium binding protein S100A12 (HS100A12) induced by calcium and zinc ions. Knowing that, besides Ca+2, human S100A12 has also affinity for other divalent metals, such as Zn+2 and Cu+2 ions, and that the formation of different protein oligomers is governed by the concentration of Ca+2 and Zn+2, we performed spectroscopic studies using circular dichroism (CD) to investigate the thermal stability of protein HS100A12 in the presence and absence of calcium and zinc. Conformational changes in the structure of HS100A12 were monitored by producing a series of mutants (singles and doubles) in which residues in helices B, C and D were replaced by cysteine and subsequently labeled with a magnetic probe MTSSL and then analyzed via SDSL-EPR. The latter consisted of the EPR spectra measurement of many mutants at room temperature to study the effects of the presence of ions on the dynamics experienced by the probe in different positions. In addition, we performed measurements of the distance between two probes inserted in the protein structure, thereby, seeking to improve the understanding of the effect of the ions presence on the protein. Finally, due to the fact that HS100A12 is involved in some events of cell signaling and interaction with the Receptor for Advanced Glycation End Products (RAGE), we also decided to study the interaction of protein with models of biomembranes using Langmuir monolayers. In the other problem of interest, we used a variety of mutants of the enzyme T4 lysozyme, a protein standard, in order to obtain more details about its structure-function correlation and make more solid the understanding of SDSL technique. Initially, we conducted a study about the alleged creation of a cavity in the hydrophobic C-terminal portion of the enzyme, when we replaced the Leu 133 by Ala and/or Gly, or when we changed a large residue for a smaller one, because it is believed that the protein undergoes a structural adjustment in order to fill the gap created by this substitution. For this, we studied by SDSL the &alpha;-helix H motion, inserting the spin label in a neighbor position of the mutated residue. Additionally, we performed an experiment of \"transmutation\" with the enzyme T4L in order to investigate the nature of contributions for different dynamic modes experienced by the spin label when it is introduced in topologically similar sites.