Les larves de mouches soldat noires (Hermetiaillucens, HI) sont une source alternative de protéines et d’énergie pour l’alimentation du bétail. De nombreux aspects liés à l’optimisation des procédés de transformation pour assurer l’innocuité, la conservation et la qualité nutritionnelle de ce nouvel ingrédient sont cependant encore peu connus. Cette étude vise à optimiser les techniques de conditionnement et de séchage des larves pour réduire efficacement leur contenu en eau et leur charge microbienne, afin d’établir les paramètres de transformation en une farine de larves respectant les exigences de l’Agence canadienne d’inspection des aliments, tout en minimisant les impacts négatifs sur la qualité nutritionnelle. Après 10 jours d’alimentation sur une diète de contrôle Gainesville à 27°C et 70% d’humidité, les larves de mouches HI ont été récoltées par immersion, rincées à l’eau stérile, emballées sous vide pour être congelées, et ainsi euthanasiées, à -40°C (n=3 productions). Après décongélation, des aliquotes de 30g/traitement (n= 3) ont été prétraitées, ou non, par blanchiment (100°C/40s), ébouillantage (100°C/2, 4, 6 et 8min) ou perforées mécaniquement avant d’être séchées à air chaud (60°C) ou lyophilisées (40°C) jusqu’à une activité de l’eau finale ≤ 0,3 pour la farine de larve. La qualité microbiologique des larves a été évaluée par dénombrement incluant les aérobes mésophiles totaux (AMT), Pseudomonasspp., Listeriaspp., les bactéries lactiques présomptives, les entérobactéries et les coliformes. L’impact des techniques de séchage sur les propriétés physicochimiques et nutritionnelles a été déterminé par la couleur (L*, a*, b*, ∆E), le pH des larves avant et après transformation, l’oxydation des lipides (TBARS, Xylénol Orange) ainsi quela teneur en lipides et en protéines. Nos analyses ont montré que la contamination initiale des larves en AMT (9 log ufc/g de larves fraîches sur base sèche) pouvait être réduite de l’ordre de 3 à 4 log ufc/g après prétraitement suivi d’un séchage à air chaud (60°C). L’ébouillantage pendant 4min à 100 °C suivi d’un séchage à l’air chaud à 60 °C pendant 6h se sont avérés être les paramètres à suivre pour un traitement optimal. La présence d’une cuticule recouverte de cires, qui réduit la déshydratation chez les larves vivantes, pourrait bien constituer un frein notable à l’évaporation lors du séchage. / Black soldier fly larvae (Hermetia illucens; BSFL) are an alternative source of protein and energy for livestock feeding. Many aspects related to process optimization to ensure the safety, conservation and nutritional quality of this new ingredient are still unknown. The presence of a wax-coated cuticle, to reduce drying of the larvae, constitutes a barrierto evaporation. The purpose of this study was to optimize larval conditioning and drying techniques to effectively reduce their water content and microbial load in order to establish the processing parameters into larval meal required by the Canadian Food Inspection Agency while minimizing negative impacts on nutritional quality. After 10 days of feeding on a Gainesville control diet at 27°Cand 70% moisture, BSFL were collected by sieving, they were rinsed with sterile water, packaged under vacuum, frozen at -40°C (n=3 replicates). After thawing, aliquots of 30g/treatment (n=3) were pretreated, or not, by blanching (100°C for 40s), boiling (100°C for 2, 4, 6 or 8 min) or mechanically perforated before being hot-air dried (60°C) or freeze-dried (40°C) until a final water activity ≤0.3 was obtained for the larval meal. The microbiological quality of the larvae was assessed by enumeration of total aerobic mesophilic (AMT), Pseudomonasspp., Listeriaspp., presumptive lactic acid bacteria, Enterobacteriaceae and coliforms. The impact of drying techniques on physicochemical and nutritional properties have been evaluated using colour (L*, a*, b*), larval pH before and after processing, lipid oxidation (xylenol orange, TBARS) and proximal composition including lipid and protein levels. The results demonstrate that the initial larvae contamination (9logCFU/g AMT of fresh larvae on dry basis) was reduced by 3 to 4 log CFU/gafter a pre-treatment followed by hot air drying (60°C); 4min boiling at 100°C followed by hot air drying at 60°C for 6h was found to be the optimal treatment parameter.

Le Rwanda, un petit pays d’Afrique de l’est, est cité comme un modèle de développement dans plusieurs domaines en Afrique, et ce seulement 25 ans après avoir connu le dernier génocide du XXIe siècle. Ce pays dépend beaucoup de l’agriculture qui a contribué à hauteur de 35% de son PIB en 2015. Après avoir constaté une situation alimentaire et nutritionnelle alarmante au début des années 2000, le gouvernement rwandais s’est engagé dans un programme ambitieux d’intensification agricole pour résoudre ce problème. En dépit d’importants investissements en développement agricole, les problèmes alimentaires et nutritionnels demeurent importants. Certes, la situation s’améliore mais elle ne reste pas moins problématique. En 2015, le taux national de malnutrition chronique des enfants de moins de 5 ans s’élevait à 37%. Les régions agricoles du pays sont parmi les plus affectées. Dans le district de Musanze par exemple, région du nord du pays connue pour la grande fertilité de ses terres ainsi que pour la richesse et la diversité de ses cultures, le taux de malnutrition chronique atteint 46% des enfants de moins de cinq ans. Ce mémoire vise à étudier les facteurs qui sont à l’origine du décalage entre les potentialités et les ressources agricoles importantes de cette région et les taux élevés de malnutrition chronique chez les enfants de moins de cinq ans. Les résultats de ce travail indiquent que le type d’emploi des mères, le problème d’accès des mères et enfants aux soins de santé dû à la distance entre le domicile et le centre de santé, le niveau d’éducation des mères ainsi que l’hygiène et la salubrité des ménages sont les facteurs expliquant le niveau élevé de la malnutrition chronique des enfants de moins de cinq ans à Musanze. / Rwanda, a small country in East Africa, is cited as a model of development in several areas in Africa only 25 years after the last genocide of the twenty-first century. The country is very dependent on agriculture, which contributed 35% of its GDP in 2015. After seeing an alarming food and nutrition situation in the early 2000s, the Rwandan government embarked on an ambitious program of agricultural intensification to solve this problem. Despite significant investments in agricultural development, food and nutrition issues remain serious. While the situation is improving, it is no less problematic. In 2015, the national rate of chronic malnutrition among children under five was 37%. The country's agricultural regions are among the most affected. In the district of Musanze, for example, in the northern region of the country known for the high fertility of its lands as well as for the richness and diversity of its crops, the rate of chronic malnutrition reaches 46% of children under five. This dissertation aims to study the factors which are at the origin of the important gap between the potentials as well as the important agricultural resources of this region and the high rates of chronic malnutrition in children under five. The results of this study indicate that the type of employment of mothers, the problem of access for mothers and children to health care due to distance between the house and the health care centre, the mother’s level of education as well as household hygiene and sanitation are the factors explaining the high level of chronic malnutrition of children under five in Musanze.

Dans cette thèse nous avons exploré trois questions de recherche sur le commerce international dans le sector agricole. Dans le premier chapitre, nous avons regardé l’implication des coûts marginaux croissants sur la durée des flux d’exportation. Les récentes études empiriques suggèrent que les firmes ont des coûts marginaux croissants. Par conséquent, les ventes d’une firme sur un marché influent sur ses coûts et sa compétitivité sur tous les marchés, et donc sur sa survie sur divers marchés d’exportation. L’objectif de mon premier essai est la mise au point d’un cadre théorique permettant d’étudier l’incidence des coûts marginaux croissants et des contraintes de capacité sur les marges extensives et intensives des échanges commerciaux et sur la durée des exportations. Contrairement au cas avec coûts marginaux constants, avec une structure convexes des coûts, une augmentation de la productivité des firmes n’induit pas obligatoirement une augmentation des destinations. Nos résultats empiriques attestent que que les exportations perdues suite aux flux terminés accroissent les exportations vers les "marchés de repli" et réduisent la probabilité d’un échec d’exportation. À l’instar des autres études sur la survie des exportations, les tarifs réduisent la probabilité de l’échec d’exportation, mais nous montrons qu’ils ont l’effet opposés lorsque l’endogénéité est résolue. Le deuxième essai s’intéresse à l’effet des maladies animales sur les flux commerciaux bilatéraux et la fermeture des frontières. Le commerce international des animaux vivants et des produits d’origine animal est très souvent entravé par les épidémies animales qui se propagent très vite entre pays. Nous nous appuyons sur un cadre empirique fondé sur le modèle de sélection multivariés pour examiner l’impact des maladies spécifiques aux animaux sur les marges extensives et intensives des flux commerciaux dans le temps. Les résultats montrent que la fièvre aphteuse et la ’encéphalopathie spongiforme bovine (ESB) ont un impact négatif sur les marges extensives et intensives du commerce des bovins et du boeuf et ce, pendant approximativement sept années. Nos résultats suggèrent que les effets des maladies animales sur la marge extensive sont plus grands que leur effets correspondants sur la marge intensive. En ce qui concerne les effets inter-espèces, la grippe aviaire et la peste porcine réduisent la probabilité et le niveau des échanges de bovins et de boeufs. Dans le troisième chapitre, nous estimons l’effet d’une élimination hypothétique des maladies animales sur les flux commerciaux. Plus spécifiquement, nous examinons comment ESB et la fièvre aphteuse impactent les flux commerciaux de viande bovine. Le modèle de gravité structurelle sectorielle est utilisé pour mésurer les effets directs, conditionnels et globaux, en permettant ainsi aux indices de résistance multilatéraux entrants et sortants et aux prix à la production de s’ajuster à l’éradication des maladies animales. Les canaux indirects par lesquels l’ESB et la fièvre aphteuse influent sur le commerce sont importants. Notre expérience contrefactuelle suggère que le Canada serait l’un des pays tirant le meilleur parti de l’éradication de l’ESB et de la fièvre aphteuse. / In standard trade models with constant average cost, the firm’s sales in any given market is related to other markets only through price indices which are treated as exogenous in the firm’s optimization. With cost convexity, the firm’s decision in any given market is directly tied to sales in other markets through an index aggregating the trade cost-adjusted market size of the destinations supplied by the firm. The difference made by increasing costs is that the firm is cognizant that by changing its sales in a given destination it changes its unit cost for all destinations. This in turn triggers extensive and intensive margins adjustments. In the first essay, we develop a theoretical framework to address the incidence of increasing marginal costs and capacity constraints on trade at the extensive and the intensive margins and on export duration. Under convex costs, an increase in productivity may not increase the number of destinations supplied by a firm, making "ins and outs", not just new entries. We generated empirical evidence in support of the aforementioned trade adjustments by assessing the incidence of lagged foregone exports on exports to "fallback markets" and on export survival. Exports to the fallback markets systematically increase in response to foregone sales from terminated trade flows. Similarly, the sum of foregone sales from terminated trade flows make existing trade flows more resilient, less prone to an export failure. A distinguishing feature of our survival models is that they test and correct for the endogeneity of tariffs. Previous studies reported peculiar results about the incidence of tariff on export survival. We too find wrong signs when tariff is treated as an exogenous variable, but we find that higher tariffs increase the likelihood of export failures when tariff endogeneity is addressed. The second essay investigates the dynamic impacts of animal disease outbreak on cattle and beef trade accounting for vertical linkage between cattle and beef. The empirical framework features a multi-sample selection model (MSSM) to investigate how animal-specific diseases affect aggregate trade flows at the extensive and intensive margins of trade in livestock and meat products over time, accounting for constraints imposed by the technological linkages between livestock and meat productions. The spontaneous emergence of foot and mouth disease adversely impacts the extensive and intensive margins of trade in cattle and beef for seven years. Our results show that the extensive margin effects of the disease outbreak are larger than its corresponding intensive margin effects. Regarding cross-species effects, the avian flu and swine fever reduce the probability and the level of trade in cattle and beef. The third essay studies a counterfactual experiment about the elimination of bovine spongiform encephalopathy (BSE) and the foot and mouth diseases (FMD) on beef trade flows. Disease outbreak alerts typically prompt importing countries to impose trade bans. The bans vary a lot across importing countries in terms of product coverage and duration. We rely on a unique balanced panel dataset that covers 4-digit disaggregated beef product over the 1996-2013 period. Previous gravity studies reported only partial trade flow effects. However, a large shock like the complete elimination of BSE and FMD diseases must affect the inward and outward multilateral resistance indices (i.e., the importing countries’ barriers on beef imports from all sources and the trade barriers faced by exporting countries in all destinations), factory-gate prices, consumer expenditures and the value of beef production in exporting countries. Our results confirm that the indirect channels through which BSE and FMD impact trade are important when it comes to measuring welfare gains. Interestingly, our counterfactual experiment suggests that Canada would be one of the countries gaining the most from BSE and FMD eradication.

Depuis plusieurs années, la production de yogourts grecs, de caséines et de fromage frais est en forte croissance. En résulte une production de plus en plus conséquente d’un co-produit: le lactosérum acide. Si ce co-produit possède des qualités nutritives et même des applications pharmaceutiques bien connues de certains de ses composants, son utilisation est freinée par la difficulté que représente son séchage. En effet, la présence importante d’acide lactique et de calcium donne au lactosérum acide des propriétés hygroscopiques provoquant son agglutination lors de séchages conventionnels. Industriellement, ce lactosérum est donc préalablement traité par une série de procédés comme la nanofiltration, les résines échangeuses d’ions et l’électrodialyse (ED) afin d’en retirer les éléments problématiques. Cet ensemble de traitements représente néanmoins un investissement ainsi qu’un coût de fonctionnement très important, en plus de générer de grandes quantités d’effluents polluants. L’utilisation d’un procédé unique d’ED permettrait de réduire ces coûts tant économiques, qu’écologiques. Cependant, l’application de l’ED est limitée par les problèmes de colmatages membranaires venant diminuer les performances du procédé ainsi qu’accentuer les nettoyages et accélérer la dégradation des membranes, rendant alors une application industrielle non viable. Au cours de ces travaux, l’ED du lactosérum acide a été réalisée en utilisant différents agencements membranaires ainsi que différents types de membranes. De plus, une configuration utilisant des membranes bipolaires a été testée pour la première fois sur du lactosérum acide. Ces premiers essais ont permis de mesurer la faisabilité du procédé d’ED en termes de déminéralisation et de retrait de l’acide lactique dans le cadre du traitement du lactosérum acide. Pour plusieurs configurations, dont celle utilisant des membranes bipolaires, les taux atteints de 70 % et 45 % respectivement, permettraient un séchage correct du lactosérum. Cependant, un fort colmatage minéral fut observé. Celui-ci fut identifié et caractérisé pour deux configurations d’ED différente afin d’en étudier les mécanismes de formation tout au long du procédé. Suite à ces premiers résultats, de nouveaux essais ont été conduits dans le but de réduire voire de supprimer le colmatage membranaire obtenu par l’application de champs électriques pulsés (CEP). Les présents résultats ont démontré que l’emploi d’une combinaison adéquate d’un temps de pulsation et d’un temps de pause permettait de réduire considérablement le colmatage membranaire lors du traitement de lactosérum acide par ED en plus d’améliorer les performances de séparation du procédé. Cette thèse apporte également de nouveaux éléments de compréhension quant aux mécanismes impliqués dans les améliorations apportées par l’utilisation des CEP grâce au test de neuf conditions différentes. Parmi ces mécanismes, un phénomène de migration sélective de cations divalents a pu être mis en évidence et pourra faire l’objet d’études ultérieures dans le cadre de l’élargissement des applications du procédé d’ED. Enfin, l’optimisation des conditions de CEP a permis de sélectionner des paramètres électrodialytiques permettant le traitement du lactosérum acide tout en minimisant le colmatage membranaire. / Since several years, the increasing production of Greek-style yogurt, caseins and fresh cheese results in the co-production of increasing amounts of acid whey. If this co-product has nutritional qualities and even well-known pharmaceutical applications of some of its components, its use is hindered by drying issues. Indeed, acid whey high lactic acid and calcium contents are responsible for the powder hygroscopic character causing its agglutination during conventional spray-drying. Industrially, this whey is therefore treated by a series of processes such as nanofiltration, ion exchange resins and electrodialysis (ED) before hand in order to remove the problematic elements. However, this treatment represents a high investment and operating cost, in addition to generating large amounts of polluting effluents. The use of a single ED process would reduce these economical and ecological costs. However, the application of ED is limited by membrane fouling issues decreasing the process performance while increasing membrane’s cleaning and degradation, thus rendering an industrial application unsustainable. During this work, acid whey ED was performed using different membrane configurations and types of membranes. For the first time on acid whey, a configuration using bipolar membranes was tested. These first tests made it possible to measure the feasibility of an ED process for acid whey treatment in terms of demineralization and lactic acid removal. For several configurations, including the one using bipolar membranes, demineralization rate of 70% and lactic acid removal rate of 45% were achieved, allowing proper potential drying of the whey. However, a strong membrane scaling was observed. The scaling was identified and characterized for two different ED configurations in order to study the mechanisms involved in its formation throughout the process. Following these initial results, new tests were conducted aiming for the mitigation of the membrane scaling by means of pulsed electric fields (PEF). The present study demonstrated that the use of an adequate combination of pulse time and pause time can significantly reduce membrane scaling during acid whey treatment by ED, in addition to enhancing separation performance. This thesis also brings new elements of understanding regarding the mechanisms involved in the improvements brought by the use of the CEP through the test of nine different conditions. Among these mechanisms, a phenomenon of selective migration of divalent cations has been demonstrated and may be the subject of further studies aiming for the widening of ED process applications. Finally, the optimization of the CEP conditions made it possible to select electrodialytic parameters allowing the treatment of acid whey by ED while minimizing membrane scaling

Tableau d'honneur de la FÉSP / En se nourrissant de l’hémolymphe et des corps gras de l’abeille domestique (Apis mellifera L.) et en lui transmettant de nombreux virus, l’acarien parasite Varroa destructor (Acari : varroidae) constitue la principale cause de mortalité des colonies d’abeilles. Les traitements chimiques présentement utilisés pour lutter contre le varroa comportent plusieurs désavantages, tels que le développement de résistance de l’acarien aux acaricides de synthèse et une toxicité variable pour l’abeille. Via l’utilisation d’ennemis naturels du parasite, la lutte biologique pourrait représenter une avenue durable et sécuritaire pour la santé des colonies. L’objectif principal de cette étude était de tester l’efficacité de l’acarien prédateur Stratiolaelaps scimitus (Acari : Lealapidae) comme moyen de lutte biologique contre le varroa. Une étude du comportement alimentaire du prédateur a d’abord été réalisée afin d’évaluer le risque de prédation du couvain d’abeille (oeufs, larves et pupes) par S. scimitus, ainsi que son potentiel de prédation envers les varroas phorétiques (se trouvant sur le corps des abeilles adultes). Des essais in vivo ont ensuite permis d’évaluer l’efficacité de deux doses d’introduction du prédateur (6 250 ou 12 500 acariens/colonie) à contrôler les populations de varroa dans les colonies d’abeilles en septembre (en comparaison avec l’acaricide biologique Thymovar®) et en novembre (en comparaison avec l’acide oxalique). Bien que S. scimitus soit capable de s’alimenter sur tous les stades de développement de l’abeille en laboratoire, nos résultats suggèrent que le prédateur ne représente pas une menace pour le couvain lorsqu’il est introduit dans la colonie. Par contre, nos résultats démontrent que le prédateur n’est pas en mesure de contrôler les populations de varroas dans les colonies d’abeilles sous les conditions testées, c’est-à-dire lorsqu’il est introduit à l’automne selon la dose actuellement recommandée par certains distributeurs. Cette inefficacité est probablement liée à l’incapacité du prédateur à s’attaquer aux varroas phorétiques. / By feeding on the hemolymph and fat bodies of the honey bee (Apis mellifera L.) and transmitting many viruses, the parasitic mite Varroa destructor (Acari: varroidae) is considered as the main cause of honey bee colony losses. The use of chemicals in varroa control shows many disadvantages, such as the development of mite resistance to synthetic acaricides and a variable toxicity for bees. Through the use of natural enemies, the biological control of varroa mites could represent a sustainable and safe avenue for colony health. The main objective of this study was to test the effectiveness of the predatory mite Stratiolaelaps scimitus (Acari: Lealapidae) as a means of biological control against varroa mites. A study of the predator’s feeding behaviour was first performed to evaluate the risk of predation of bee brood (eggs, larvae and pupae) by S. scimitus, as well as its predation potential upon phoretic varroa mites (varroa parasitizing adult bees). In vivo trials were then carried out to evaluate the effectiveness of two predator introduction rates (6,250 or 12,500 mites / colony) to control varroa populations in honey bee colonies in September (compared to the organic acaricide Thymovar®) and in November (compared to oxalic acid). Although S. scimitus is able to feed on all bee developmental stages in the laboratory, our results suggest that the predator does not pose a threat to the bee brood when introduced into the colony. On the other hand, our results demonstrate that the predator is not able to control varroa populations in bee colonies under the tested conditions, that is, when it is introduced in fall according to the rate currently recommended by some biocontrol suppliers. This ineffectiveness is probably related to the inability of the predator to attack phoretic varroa mites.

La vigne Vitis vinifera, appelée aussi «vigne européenne», est l’espèce la plus cultivée mondialement pour la production de vin. Dans les régions froides comme le Québec, les vins sont majoritairement produits à partir de cépages hybrides interspécifiques (CHI) qui offrent une plus grande tolérance au froid et aux maladies. Les vins rouges issus des CHI sont généralement décrits comme étant moins astringents et plus colorés que les vins rouges européens issus de V. vinifera, ce qui ne répond pas toujours aux goûts des consommateurs. Ces caractéristiques sont attribuables à des différences de composition entre les baies de CHI et de V. vinifera. Une meilleure compréhension des molécules affectant la rétention et la composition en tanins des vins de CHI rouges et des procédés de vinification affectant leurs profils pourrait permettre de modifier leur astringence et contribuer à augmenter la compétitivité des vins rouges issus de CHI sur le marché.Trois études ont été conduites sur ce thème dans le cadre de cette thèse. La première étude avait pour but d’étudier l’impact de l’utilisation de marc de raisin blanc (MRB) en co-fermentation avec du marc de raisin rouge (MRR) sur la teneur en tanins des vins, en utilisant les CHI Frontenac et Vidal. Les résultats ont montré que les vins produits avec du MRB présentaient plus de flavan-3-ols monomériques et oligomériques et davantagede terpènes. La manipulation du ratio MRR/MRB a permis de modifier le profil en anthocyanes des vins finis, résultant dans certains cas en des vins plus clairs. L’utilisation d’un ratio MRR/MRB approprié (30% MRR/6% MRB) a permis une meilleure stabilisation de la couleur des vins sans affecter significativement la couleur. L’utilisation de MRB en co-fermentation avec du MRR s’est avérée un outil intéressant pour moduler la couleur des vins ainsi que leur composition phénolique et volatile. La seconde étude avait pour objectif d’étudier l’impact de différents traitements seuls ou en combinaison (traitements pré-fermentaire du moût, fermentation en présence et absence de marc, addition de tanins œnologiques) sur la teneur en tanins, en protéines et en pigments des vins de Frontenac. L’élimination des protéines par chauffage du moût ou ajout de bentonite n’a pas permis une meilleure rétention des tanins dans le vin. Néanmoins, fermenter le moût sans marc de raisin a amélioré significativement leur rétention dans le vin, notamment celle des flavan-3-ols polymériques (jusqu’à 27,8%). L’addition de 3 g/L de tanins œnologiques dans les vins, fermentés en présence et absence de marc, s’est montrée nécessaire pour augmenter significativement la concentration en tanins des vins de Frontenac. La troisième étude consistait en une étude exploratoire et comparative de la teneur et de la nature des polysaccharides des vins de CHI Frontenac et Frontenac blanc avec celles du V.vinifera Cabernet Sauvignon. Les vins de Frontenac ont montré une concentration plus élevée en polysaccharides totaux et des polysaccharides plus ramifiés que les vins de Cabernet Sauvignon. Ces différences pourraient contribuer à la faible astringence des vins rouges issus de CHI par rapport à celle des vins rouges de variété V. vinifera. Ce projet a permis d’apporter de nouvelles connaissances sur le profil d’extraction et la rétention des tanins dans les vins de CHI cultivés au Québec. Une meilleure compréhension des facteurs impliqués dans la rétention des tanins dans ces vins a permis de fournir des pistes à envisager pour élaborer des procédés de vinification adaptés à la composition physico-chimique atypique des CHI rouges afin de produire des vins plus riches en tanins, ayant un potentiel accru de répondre aux goûts des consommateurs. / Vitis vinifera is the most cultivated grapevine species for wine production, worldwide. But in cold areas such as Quebec, Canada, most wine is produced from interspecific hybrid grape varieties (CHI) that better respond to harsh growing conditions such as cold temperature and high disease pressure. Red CHI wines are generally described as less astringent and more colourful than European V. viniferared wines, but those characteristics do not fully align with consumers taste and preferences. The low astringency of red CHI wine is largely attributable to differences between the respective chemical composition of CHI and V. vinifera berries. A better understanding of the molecules affecting tannin retention and composition of red CHI wines, and of the winemaking processes that affect their tannin profiles could provide solutions to impact their astringency and improve their competitiveness on the market. Three studies conducted on this topic as part of this thesis are presentedin this manuscript.The first study aimed at investigating the impact of the co-fermentation of white (WP) and red (RP) grape pomace on the tannin content of red wine, using the CHI varieties Frontenac and Vidal. The results showed that wines produced with WPcontained higher levels of monomeric and oligomeric flavan-3-ols and terpenes than wines issued from the RP treatment. Modifying the ratio of RP to WP during alcoholic fermentation modified the anthocyanin profile of the wines, sometimes resulting in lighter coloured wines. A ratio of 30% RP to 6% WP improved colour stabilisation without significantly affecting wine colour. The use of WP in co-fermentation with RP proved to be an interesting tool to modulate wine colour as well as its phenolic and volatile composition.The second study aimed at exploring the impact of different wine making treatments (pre-fermentative treatment of the must, fermentation with andwithout pomace, additionof enological tannins), alone or in combination, on the tannin, protein and pigment content of Frontenac wines. Wine protein removal by heat or bentonite addition did not improve tannin retention in wine. In contrast, fermenting the must without pomace significantly improved tannin retention, especially for polymeric flavan-3-ols (up to 27.8%). With or without pomace, the addition of enological tannins at a minimal rate of 3 g/L, was necessary to increase tannin concentration in Frontenac wine significantly.The third study explored the content and, to some extent, the molecular weight and structure of the polysaccharides from the CHI Frontenac and Frontenac Blanc, in comparison with wines from theV. vinifera variety Cabernet Sauvignon. Frontenac wines showed a higher concentration of total polysaccharides with more branched polysaccharides than wines from Cabernet Sauvignon. Results showed that significant differences exist between the polysaccharides content and structure of the studied CHI varieties and Cabernet Sauvignon variety. Those differences could contribute to the low astringency of CHI wines when compared with red wines from V. vinifera varieties. This project has brought new knowledge on the tannin, protein and polysaccharide content of red CHI varieties grown in Quebec and how they impact tannin retention in CHI wines. Understanding the chemistry of phenolic compounds and macromolecules in CHI wines made possible the development of new wine making processes adapted to the atypical biochemical composition of red CHI wine. As such, results from this study provide new venues to vary and improve the style and the quality of CHI wines and better meet consumers taste and preferences.

Ce travail visait à quantifier monétairement l’incitatif qui pousserait les producteurs d’arachides du département du Nord d’Haïti à mettre en oeuvre un ensemble de pratiques post-récoltes visant à réduire le risque de contamination aux aflatoxines. Par conséquent, à l’aide d’un mécanisme BDM inversé, le consentement à recevoir des producteurs a été déterminé. De plus, l’effet de l’utilisation d’une bâche de séchage sur la teneur en aflatoxines des arachides produites a été mesuré ainsi que l’influence d’un accès à un marché conditionné sur le consentement à recevoir des producteurs et sur la qualité des arachides produites. Les résultats ont révélé que l’accès au marché a eu un effet significatif sur la prime demandée par les producteurs cependant, il n’a pas eu un impact significatif sur la qualité des arachides alors que c’était le cas pour l’accès à une bâche de séchage. Parallèlement, le consentement à payer des consommateurs de beurre d’arachides du secteur formel a été aussi évalué pour un produit attesté de qualité. La détermination du consentement à payer supplémentaire des consommateurs pour du beurre d’arachides attesté de qualité a montré que cette prime suffirait amplement pour inciter les producteurs à agir. Donc, une solution de marché est plausible pour le contrôle des aflatoxines sur ce segment précis du marché. / This work aimed at quantifying monetarily the incentive that would urge peanut producers in the Northern department of Haiti to implement a set of post-harvest practices to reduce the risk of aflatoxin contamination. Therefore, using an individual inverted BDM mechanism, the willingness to accept of producers has been determined. In addition, the effect of the use of a drying tarpaulin on the aflatoxin content of the peanuts produced was measured as well as the influence of access to a market conditioned by the willingness to accept of producers and the quality of the peanuts produced. The results revealed that market access had a significant effect on the premium demanded by producers, however, it did not have a significant impact on the quality of peanuts while this was the case for the access to a drying tarpaulin. At the same time, consumers' willingness to pay for peanut butter in the formal sector has also been assessed for a certified quality product. The determination of consumers' additional willingness to pay for quality certified peanut butter has shown that this premium would be enough to encourage producers to act. So, a market solution is plausible for aflatoxin control in this segment of the market.

La culture du soja (Glycine max (L.) Merr.) a connu une forte expansion au Canada surtout grâce au développement de lignées à maturité hâtive facilitant sa culture plus au nord. En parallèle le nématode à kyste du soja (NKS ; Heterodera glycines Ichinohe), parasite du soja, est devenu le premier ravageur du soja mondialement et il s’installe progressivement au Canada. L’utilisation de cultivars résistants demeure le moyen le plus efficace pour réduire les pertes associées au NKS. Cependant une seule source de résistance a été largement exploitée en Amérique, soit l’accession PI 88788. Son utilisation intensive a exercé une forte pression de sélection sur le NKS pouvant maintenant surmonter cette résistance presque partout aux États-Unis. De plus PI 88788 présente une maturité très tardive la rendant mal adaptée aux régions canadiennes. Cette étude visait à déterminer les régions génomiques conférant la résistance au NKS chez la variété de soja Suzuhime (PI 494182) laquelle affiche une grande résistance au NKS et la maturité la plus hâtive parmi les accessions résistantes. Pour ce faire 149 lignées issues d’un croisement entre la variété Costaud (haut rendement, maturité hâtive, mais sensible au NKS) et Suzuhime ont été génotypées et évaluées pour leur résistance au NKS permettant de réaliser une analyse QTL (« quantitive trait loci ») et ainsi identifier les locus de résistance. Ces lignées ont aussi été évaluées pour certains caractères agronomiques dans le but de déterminer l’impact de la sélection des allèles de résistance sur les performances agronomiques. Finalement, grâce au reséquençage de PI 494182 et Costaud, nous avons identifié les allèles en présence pour certains gènes de résistance connus. Ce travail permettra d’identifier des marqueurs génétiques de résistance au NKS et ainsi faciliter le développement de cultivars combinant maturité hâtive, rendement élevé et résistance au NKS.

Une mauvaise alimentation est un facteur de risque important contribuant au fardeau des maladies chroniques. La littéracie alimentaire contribue à l’adoption de saines habitudes alimentaires et aide les consommateurs à développer de la résilience envers les effets négatifs de l’environnement alimentaire malsain qui offre une grande variété d’aliments à petits prix, souvent riches en énergie et de pauvre qualité nutritionnelle. Un besoin de réaliser de la recherche au Canada sur les déterminants de la littéracie alimentaire et leur association à la qualité de l’alimentation a déjà été identifié. La campagne « Bien manger » est une initiative portant sur la saine alimentation développée par Santé Canada pour sensibiliser les parents canadiens à la saine alimentation et augmenter leurs connaissances ainsi que leur participation à la planification des repas familiaux – une composante de la littéracie alimentaire. Les partenariats multisectoriels avec les détaillants alimentaires, les médias et les organisations de santé ont facilité la diffusion de la campagne et ont contribué à l’accroissement de sa portée et de son efficacité auprès des parents canadiens. La planification de repas n’est pas une composante de la littéracie alimentaire qui a été bien documentée dans la littérature, et jamais aucune intervention populationnelle sur ce sujet n’a fait objet d’une évaluation. De telles évaluations sont nécessaires pour fournir de la rétroaction aux parties prenantes concernant des pistes d’améliorations d’initiatives en santé et pour identifier des stratégies optimales visant à soutenir les progrès en santé publique. L’objectif principal de cette thèse est de mener des évaluations de processus et d’impacts de la campagne « Bien manger », explorer les associations entre la littéracie alimentaire et la qualité de l’alimentation des parents canadiens et de transférer les connaissances auprès des décideurs et des parties prenantes. Pour réaliser les objectifs, un échantillon composé de partenaires multisectoriels de Santé Canada a été interrogé et une enquête a été réalisée auprès de parents canadiens. Dans un premier temps, une évaluation qualitative du processus d’implantation a été effectuée avec 21 partenaires pour déterminer quels facteurs ont influencé leur décision d’adopter la campagne « Bien manger » et pour identifier les iv facteurs facilitants et les obstacles reliés à l’implantation de la campagne. Dans un deuxième temps, une évaluation quantitative a été effectuée auprès de 964 parents canadiens pour caractériser la portée de la campagne et déterminer les effets sur les attitudes reliés à la planification des repas familiaux. Dans un troisième temps, des associations entre la littéracie alimentaire, le statut d’emploi et la qualité de l’alimentation ont été examinés au sein de 767 parents. L’évaluation de processus a mis au jour de nombreux éléments clés à prendre en considération lors de futures collaborations. Notamment, indépendamment de la mission de chaque organisation, celles partageant des valeurs compatibles ont de bonnes chances d’être de bons partenaires. En revanche, la planification collaborative et la communication sont nécessaires pour maintenir l’engagement de l’organisation et pour soutenir l’implantation des activités. L’évaluation d’impact a dévoilé que le rappel de la campagne était plus important chez les francophones, les personnes sans éducation universitaire et les personnes à faibles revenus. Les taux de rappels ont largement varié à travers le pays, avec les taux les moins élevés à Vancouver, Winnipeg et Toronto et les taux les plus élevés à Québec et dans les régions rurales du Québec. De plus, le rappel de la campagne était associé à des attitudes plus favorables envers la planification de repas. Finalement, les analyses exploratoires ont dévoilé que le statut d’emploi n’est pas associé à la littéracie alimentaire, que le temps était un obstacle important à la préparation de repas, et que les dimensions de connaissances en nutrition et conceptualisation d’aliments étaient associées à une meilleure qualité alimentaire. En conclusion, les futures initiatives de santé publique en matière de nutrition peuvent être renforcées par l’implication de partenaires avec des valeurs semblables dès l’étape de planification de l’intervention. Les initiatives futures devraient être élaborées en ciblant les dimensions de littéracie alimentaire qui ont la plus grande chance d’influencer des facteurs nutritionnels positives telles que les dimensions de connaissances alimentaires ou conceptualisation alimentaire, et prendre en considération des stratégies permettant aux parents de surmonter les obstacles reliés au manque de temps. / Poor diet is a major risk factor for non-communicable chronic diseases such as obesity, cardiovascular disease and certain cancers. Food literacy supports healthy eating practices and can help individuals build resilience to food environments that provide consumers with a large variety of energy-dense nutrient poor foods in abundance at low-costs. A need for further research in Canada on the determinants of food literacy and their relationship to diet quality has previously been identified. The Eat Well Campaign (Food Skills) (EWC) is a healthy eating initiative developed by Health Canada to increase parents’ awareness, knowledge of and engagement in meal planning – a component of food literacy. Cross-sector partnerships with the retail food industry, media and health organizations facilitated the diffusion of the EWC and were pivotal to extend its reach and effectiveness. Meal planning is not well described in the literature and no population-wide communication interventions targeting meal planning have been evaluated to date. Evaluations are essential to provide feedback to stakeholders on improving health initiatives, identify optimal strategies to support advances in public health and ensure government accountability. The main objective of this thesis was to conduct process and impact evaluations of the EWC, explore associations between food literacy and diet quality of Canadian parents and put this information into context for decision makers and stakeholders. To achieve these objectives, a purposeful sample of Health Canada’s cross-sector partners were interviewed and a cross-section of Canadian parents were surveyed. First, a qualitative process evaluation was conducted with 21 cross-sector partners to determine which factors influenced their decision to adopt the EWC and identify facilitators and barriers that they experienced during the EWC implementation. Second, a quantitative impact evaluation was conducted with 964 parents from across Canada to characterise the reach (i.e., awareness) of the EWC and determine whether the campaign’s awareness influenced meal planning attitudes, behaviors and self-efficacy. Third, associations between different food literacy dimensions, employment status and diet quality were investigated in a subsample of 767 parents. The process evaluation revealed several key considerations for future collaborations with partners from multiple sectors. Of note, regardless of mission, organizations with similar values are likely to make stronger partnerships; however, advanced collaborative planning and consistent communication are necessary to maintain organizational engagement and activity implementation. The impact evaluation revealed that the highest rates of campaign awareness were among French-speakers, parents without university education and those from low-income households. Awareness varied greatly across the country with the lowest rates in Vancouver, Winnipeg and Toronto, and the highest rates in Quebec City and rural Quebec. Additionally, campaign awareness was associated with more positive attitudes towards meal planning. Finally, exploratory analyses of different food literacy dimensions revealed that employment status was not associated with food literacy, time was a major limitation for home-based meal preparation and nutrition knowledge and food conceptualisation are significantly associated with diet quality. In conclusion, future public health nutrition initiatives can be strengthened by involving partners with similar values during the intervention planning stage. Future interventions should target dimensions of food literacy that are most likely to influence dietary outcomes such as nutrition knowledge or food conceptualisation and need to consider strategies to overcome time barriers to healthy eating.

Le puceron de la digitale Aulacorthum solani (Kaltenbach) et le puceron du melon Aphis gossypii (Glover) sont parmi les pucerons les plus nuisibles pour les cultures en serre. La lutte biologique microbienne pourrait constituer une voie efficace contre ces insectes. La combinaison de différents agents microbiens peut augmenter leur efficacité. Ce travail évalue l’efficacité de Beauveria bassiana ANT-03, Bacilluspumilus PTB180 et B. subtilis PTB185, utilisés individuellement ou mélangés, pour contrôler A. gossypii et A. solani sur concombre et tomate, respectivement. En laboratoire, dix larves L2 de chaque puceron ont été placées dans des plats de Petri contenant une feuille de tomate ou une rondelle de feuille de concombre fixée dans la gélose. Ces larves ont été pulvérisées avec 1 mL de suspensions préparées selon le traitement (Témoin , B.pumilus, B. subtilis, B. bassiana, B. pumilus + B. subtilis, B. bassiana + B. pumilus, B. bassiana +B. subtilis, B. bassiana + B. pumilus + B. subtilis). Les mêmes traitements utilisés en laboratoire ont été appliqués en serre, mais des pucerons adultes ont été utilisés. Les résultats des essais en laboratoire et en serre ont révélé qu’en causant la mortalité de A. solani et en affectant la reproductionde A. gossypii, les deux bactéries (B. pumilus PTB180 et B. subtilis PTB185) ont pu démontrer un effet aphicide comparable à celui du produit commercial (Bioceres) contenant le champignon. Lorsqu’utilisé en mélange, aucun effet additif entre les trois microorganismes étudiés n’a été observé. Les essais de suivi de la survie des spores de deux bactéries et du champignon conduits en serre ont démontré qu’ils gardent un niveau de population de 106 CFU/g de feuilles fraîche jusqu’à neuf jours après leur application, même quand ils ont été mélangés. Ainsi, sur plantes, les deux Bacillus n’exposent pas un effet antifongique envers B. bassiana ANT-03 / The foxglove aphid Aulacorthum solani (Kaltenbach) and the melon aphid Aphis gossypii (Glover) are among the most harmful aphids for greenhouse crops. Microbial biological control may be an effective method against these insects. The combination of different microbial agents can increase their efficiency. This work evaluates the efficacy of Beauveria bassiana ANT-03, Bacillus pumilus PTB180 and B. subtilis PTB185, used individually or in combination, to control A. gossypii and A. solani on cucumber and tomato, respectively. In the laboratory, ten L2 larvae of each aphid were placed in Petri dishes containing a tomato leaf or a cucumber leaf disc fixed in the agar plate. These larvae were sprayed with 1 mL of suspensions prepared according to the treatment (Control, B. pumilus, B. subtilis, B. bassiana, B. pumilus+ B. subtilis, B. bassiana+ B. pumilus, B bassiana+B. subtilis, B. bassiana+ B. pumilus+ B. subtilis). The same treatments used in the laboratory were applied in the greenhouse, but adult aphids were used. Laboratory and greenhouse test results revealed that by causing A. solani mortality and by affecting A. gossypii reproduction, both bacteria (B. pumilus PTB180 and B. subtilis PTB185) were able to demonstrate aphicide effect equivalent to that of the commercial product (Bioceres) containing the fungus. When used as a mixture, no additive effect between the three microorganisms studied was observed. Spore survival tests of the two bacteria and the fungus conducted in a greenhouse have shown that they retain a high level of population 106CF U/g fresh leaves up to nine days after the application when used alone or as a mixture. Thus, on plants, the two bacilli do not exhibit antifungal effect against B. bassiana ANT-03. / puceron de la digitale, puceron tacheté de la pomme de terre, puceron du melon, puceron du cotonnier