Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000379490-Texto+Completo-0.pdf: 2432240 bytes, checksum: 754b0e0f479a79dbcde2d66ac779b3da (MD5) Previous issue date: 2006 / The present study deals with composition and natural history of a snake community at primary forest reserve ( 150 ha) in the selective logging area of the Continental Farm (11° 24’49,9” S e 55° 19’ 45,1” W), in the Matas Secas de Mato Grosso ecorregion, southwest of Claudia, Mato Grosso state, focusing on: species richness, relative abundance, habitat use, diel and seasonal activity, diet and reproduction. The data are based on 250 non consecutive days of fieldwork, from April 2002 to June 2004, encompassing 18 field trips to the locality. Fieldwork included four sampling methods: pitfall traps with drift fences (AIQ), time constrained search (PVLT), incidental encounters (EO), and local collectors (CT). The AIQ effort was 4200 h/pitfall (=117600 hours to 28 pitfall), and captured 123 snakes (0,001 snake/pitfall/hour or 0,72 snake/pitfall/month). The PVLT were effectuated from June 2003 to June 2004, the mean rate of the search was five hour-man/day, totalizing 945,2 hour-man (805,3 during day and 139,9 during the night), and captured 41 snakes (13 species) (0,04 snake/hour-man; night = 0,05 and day = 0,007; or 1,04 snake/day/observer). The EO was measured to workfield per day (250 non consecutive days), the effort was 6000 hour-field, and captured 108 snakes (33 species) (0,043 snake/day-field/man). The CT included the snakes captured at three local collectors. This method captured 43 snakes (18 species) during 775 days (0,0007 snake/hour/collector). We recorded 315 specimens of the 39 species, distributed in five families (Typhlopidade, Boidae, Colubridae, Elapidae e Viperidae). The composition of the snake community is more related to those from Amazonian habitats forest, principally the oriental area. Considering areas that were studied at Amazônia region, Claudia is the most related to the Cerrado. Oxyrhopus melanogenys was the dominant specie (9,8%).The distribution abundance was equilibrated and was statistically adjusted to three models: geometric series, lognormal, and Broken Stick. The activity is mainly nocturnal and the soil and litter exploration is the most frequent pattern. The relative abundance is related to monthly precipitation and averages of minimum temperatures. The AIQ and PVLT mean rate of snake capture, and the number of female and male captured also showed quantitative variation, although only female capture rate can be related with the precipitation (positively) and with the difference between the maximum and minimum temperature (negatively); these show that there is more female movement in humid and more stable thermal period. The most frequent food items consumed by the snakes were lizards, anurans, and mammals (in this order). They also eat invertebrates (18%), being centipedes the principal (11%). Reproduction is aseasonal. In the Claudia region the number of females involved in reproductive events and juveniles captured did not change between dryness and rainy periods. However, the analysis of the reproductive cycle of particular species showed a clear seasonality, indicating that the general aseasonal pattern of the community results from the superposition of asynchronic seasonal cycles of different species, each one variable in its extension. / O presente estudo teve como objetivos básicos conhecer a composição, estrutura e história natural de uma comunidade de serpentes de uma reserva de floresta primária (≈150 ha) localizada em área de corte seletivo de madeira da Fazenda Continental (11° 24’49,9” S e 55° 19’ 45,1” W), ecorregião Florestas Secas de Mato Grosso, no sudoeste do município de Claudia, centro-norte de Mato Grosso. Enfocou a riqueza e a abundância relativa das espécies, a utilização do ambiente (hábitat e microhábitat), os padrões de atividade diária e sazonal, a dieta e a reprodução das serpentes. Entre abril de 2002 e junho de 2004, foram realizadas 18 campanhas, totalizando 250 dias não consecutivos de trabalho de campo. Foram utilizados quatro métodos de amostragem: armadilhas de interceptação e queda (AIQ), procura visual limitada por tempo (PVLT), encontros ocasionais (EO) e coletas por terceiros (CT). As AIQ permaneceram abertas por 175 dias; resultaram em um esforço de 4200 h (= 117600 horas-tambor) e no registro de 123 indivíduos (0,001 serpente/hora/tambor) de 27 espécies. A PVLT, efetuada ao longo de 136 dias, de junho de 2003 a junho de 2004, correspondeu em média a cinco horas-homem de procura diária, totalizou 945,2 horas-homem (805,3 no período noturno e 139,9 no diurno) e registrou 41 indivíduos de 13 espécies (0,04 serpente/hora/homem; noite = 0,05 e dia = 0,007). Os EO foram quantificados por dia de trabalho de campo (250 dias-campo), e resultaram no registro de 108 indivíduos de 33 espécies (0,43 serpente/dia-campo). A CT incluiu as serpentes coletadas por três colaboradores residentes na área e registrou 43 indivíduos de 18 espécies em 775 dias (0,017 serpente/dia/colaborador). No total foram registrados 315 indivíduos de 39 espécies, distribuídas em cinco famílias (Typhlopidade, Boidae, Colubridae, Elapidae e Viperidae).A composição de espécies da comunidade é mais assemelhada às de outras áreas florestadas da Amazônia, principalmente da porção oriental, que às áreas de Cerrado. Entretanto, dentre as demais áreas amazônicas estudadas, a comunidade de Claudia é a que mais se assemelha às de áreas de Cerrado. A espécie dominante foi Oxyrhopus melanogenys, com 9,8% dos registros. A distribuição de abundância da comunidade mostrou-se equilibrada e se ajustou estatisticamente a três modelos: série geométrica, lognormal e Brocken Stick. Predominaram serpentes de atividade noturna que exploram o solo e a serapilheira. A abundância relativa variou sazonalmente e apresentou correlação positiva com a precipitação mensal e as médias mensais da temperatura mínima. Também houve variação sazonal na taxa de captura de AIQ e PVLT e nas capturas de machos e fêmeas. A movimentação de fêmeas foi correlacionada diretamente com a precipitação pluviométrica e inversamente com a variação da diferença entre médias mínimas e máximas mensais, indicando maior movimentação no período mais úmido e de maior estabilidade térmica. A utilização de recursos pelas espécies da comunidade foi diversificada, sendo que os itens alimentares mais consumidos foram lagartos, anuros e mamíferos, nessa ordem. Invertebrados estiveram presentes em cerca de 18% das amostras; dentre eles, a categoria mais recorrente foi representada por quilópodes (11%). O número de fêmeas em eventos reprodutivos e a captura de juvenis não diferiu significativamente entre a estação seca e a chuvosa, e a distribuição temporal dos eventos reprodutivos indicou a ocorrência de um padrão reprodutivo assazonal para a comunidade como um todo. Contudo, foram identificadas espécies com ciclos sazonais bem definidos, o que indica que a assazonalidade registrada resulta da sobreposição de ciclos reprodutivos de diferentes espécies e extensões (sazonais e assazonais).

Orientadores: Marcio Martins, Otavio Augusto Vuolo Marques / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T21:29:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sawaya_RicardoJannini_D.pdf: 1555163 bytes, checksum: 2187a71d06f84ebd2830746982355536 (MD5) Previous issue date: 2003 / Doutorado

Orientador: Sergio Marangoni / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-04T01:48:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Toyama_DanieladeOliveira_D.pdf: 11046039 bytes, checksum: b59847c8c17a448c14ff005914cccd57 (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: Nesta tese foram apresentados os resultados da purificação de várias proteínas biologicamente ativas do veneno de serpentes crotálicas (CrotaJus durissus temfjcus, Crotalus durissus cascavel Ia, Crotalus durissus ruruima e CrotaJus durissus colliJineatus); botrópica (Bothrops pirajal) e coral (Mícrurus dumerilíi carínícauda). Muitas destas frações foram purificadas e caracterizadas do ponto de vista biológico, bioquímico e farmacológico. FraçOes como: crotamina, fosfolipase A2 (PLA2), crotapotinas e outras mostraram uma significativa atividade antibacteriana contra bactérias frtopatogênicas e patogênicas. As análises ultraestruturais e outros dados bioquímicos indicam que estas frações exercem essa atividade de formas diferenciadas. Foram observados quatro mecanismos de ação: 1.interação das frações com a membrana bacteriana, induzindo a ruptura e desorganização da mesma com posterior lise celular, 2. desorganização citoplasmática através da entrada das frações por poros na membrana causando lise celular, 3. digestão da membrana com posterior extravasamento do conteúdo interno bacteriano com lise celular, 4.1ise da membrana através dos radicais livres gerados pela reação enzimática do veneno com a membrana bacteriana. Durante o desenvolvimento da tese foram publicados e submetidos à publicação os seguintes artigos: 1.0liveira et aI., 2002 apresentaram o fracionamento do veneno de CrotaJus durissus terrificus em HPLC de fase reversa, com obtenção das frações: crotapotinas (F5 e F7) e PLA2 (F15, F16 e F17). As frações apresentaram atividade antibacteriana contra Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae. A fração F17 apresentou atividade anticoagulante e foi seqüenciada apresentando uma homologia estrutural com outras PLA2 em tomo de 60-90%. Sua massa molecular de 14,6kDa foi determinada através de tricina SDS-PAGE, eletroforese de duas dimensões e MALDI TOFF. 2. T oyama at aI., 2003 verificaram a atividade enzimática, neurotóxica e antibacteriana da fração PLA2 (F15) isolada do veneno de CrotaJus dirissus teTTificus. 3.0liveira et aI., 2003 isolaram, purificaram, seqüenciaram a fração crotapotina, um componente ácido da crotoxina do veneno de Crotalus duríssus cascavel Ia, e realizaram testes para verificar a atividade antibacteriana em bactérias fitopatogênicas Gram-positivas e Gram-negativas, além de testes inflamatórios e nefrotóxicos. 4.Havt et aI., 2005 isolaram uma nova lectina tipo C (BPL) de Bothrops pirajai que foi caracterizada biológica e bioquimicamente. Esta fração também mostrou um efeito nefrotóxico em perfusão em rins isolados de ratos. 5. Toyama et al.,2004 isolaram, purificaram e caracterizaram bioquimicamente uma nova crotamina símile do veneno de Crotalus durissus cascavel/a. Foram identificados os peptídeos biologicamente ativos da crotamina, os quais foram responsáveis pela estimulação de secreção de insulina. . 6.Gandhi et aI., 2004 purificaram uma nova lectina tipo C (crotacetin), obtida do veneno de Crotalus durissus cascavel/a. Esta nova lectina induziu a agregação plaquetária, a aglutinação eritrocitária e também mostrou uma atividade antibacteriana. 7. Cavada et aI., 2004 purificaram e caracterizaram uma nova lectina da semente de Lonchocarpus sericeus, com alta especificidade por N-acetilglicosamina. 8. Cháriston et ai, 2004 isolaram e determinaram a estrutura primária de uma nova PLA2 de Micrurus dumerilli carinicauda. 9.Toyama et aI., 2004 isolaram, purificaram e caracterizaram uma nova isoforma da crotamina do veneno de Crotalus durissus ruruima e mostraram seu efeito antibacteriano. 10.Toyama et aI., 2004 isolaram, purificaram e caracterizaram uma nova PLA2 do veneno de Crotalus durissus collilineatus. Nestes trabalhos foram determinadas as regiões moleculares responsáveis pela atividade antibacteriana. 11. Toyama et a/., 2004 purificaram e caracterizaram uma nova L-amino oxidase do veneno de Crotalus durissus cascavel Ia (Casca LAO) através de exclusão molecular e HPLC de troca iônica. Casca LAO apresentou uma grande inibição bacteriana em bactérias Gram-negativas (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) e Gram-positivas (Streptococcus mutans). Os estudos destas frações apresentam perspectivas futuras na aplicação terapêutica, como agentes antibacterianos, de novos peptídeos sintéticos ou naturais / Abstract: In this dissertation we present the results of purification of several biologically active protein from the crotalic rattlesnake venom (Crotalus durissus terrificus, Crotalus durissus cascavel/a, Crotalus durissus ruruima e Crotalus durissus collilineatus); from bothropic (Bothrops piraja) and coral (Micrurus dumerilli camicauda). Many of these fractions were purified and biochemical, biologically and pharmacologically characterized, some were reported and other submitted for publication in specialized joumals. Some fraction as crotamine, phospholipase A2 (PLA2), crotapotins and other showed a significant antibacterial activity against phytopatogenical and pathogenic bacterium. Ultra structural and biochemical analyses suggest that this fraction exert this antibacterial activity by different ways, which are grouped according to the mode action into four different mechanisms: 1.interaction of some fractions with the bacterial membrane inducing cellular Iyses by membrane rupture and disorganization. 2. Bacterial cell Iyses by action of fraction from the venom that form pore on the membrane and consequently cytoplasmatic disorganization and membrane rupture. 3. Membrane cell digestion induced by protein from the venom and consequently lost of cytoplasmatic content and cellular Iyses. 4. Membrane cel! Iyses induced by free radical generated by enzymatic action of protein form the venom. During the development of this thesis we reported and submitted some articles listed below: 1. Oliveira et aI., 2002 presents the purification of crotapotins (F5 and F7) and PLA2 (F15, F16 and F17)from the Crotalus durissus terrificus venom by reverse phase HPLC. These fraction showed significant antibacterial activity against Xanthomonas axonopodis pv. Passiflorae. Fraction F17 also showed an anticoagulant activity and its amino acid sequence showed high amino acid sequence identity with.60-90% with other PLA2 from different sources. Its molecular mass was 14,6kDa determined by Tricine PAGE-SDS, two dimensional electrophoresis and MALDI TOFF. 2. Toyama et aI., 2003 showed the enzymatic, neurotoxic and antibacterial activities of PLA2 isoform (F15) from the Crotalus durissus terrificus venom. 3. Oliveira et aI., 2003 isolated, purified and determined the amino acid sequence of crotapotin fraction, an acid compound of crotoxin from the Crotalus durissus cascavel/a, and detennined its antibacterial activity against Gram-positive and Gram-negative phytopathogenic baderium, intlammatory and nephrotoxicity. 4. Havt et aI., 2005 isolated a new type C-Iectin (SPL) trom the Bothrops pirajaithat was biologically and biochemical characterized. This fraction also showed a nephrotoxic effect on the isolated perfused kidney. 5. Toyama et aI., 2004 isolated, purified and characterized biochemical a new crotamine like from Crotalus durissus cascavella venom. In this work we identified the biologically active peptide from this crotamine, which were responsible for increasing insulin secretion. 6. Gandhi et aI., 2004 purified a new lectin type C (crotocetin) trom the Crotalus durissus cascavella venom. This lectin induced platelet aggregation, erythrocyte agglutination and also showed an antibacterial activity. 7. Cavada et aI., 2004 purified and characterized a new lectin from the Lonchocarpus serieus seed that showed high specific binding against N-acetyl glucosamine. 8. Cháriston et aI., 2004 isolated and determined the amino acid sequence of new PLA2 from Micrurus dumerilli carinicauda. 9. Toyama et aI., 2004 isolated, purified and characterized a new crotamine isofonn from the Crotalus durissus ruruima venom and showed its antibacterial activity. 10. Toyama et aI., 2004 isolated, purified and charaderized a new PLA2 trom the Crotalus durissus collilineatus venom. In this work we determined the molecular region of the PLA2 responsible for the antibacterial activity. 11. Toyama et aI., 2004 purified and characterized a new L-amino acid oxidase from the Crotalus durissus cascavella whole venom (Casca LAAO) by molecular exdusion and cation exchange HPLC. Casca LAAO inhibited strongly the bacterial growth rate of Gram-negative (Xanthomonas axonopodis pv passiflorae) and Gram-positive (Streptococcus mutans). These studies presented here showed a future perspective to therapeutic application of these peptides, synthetical/y or natural/y obtained as potential antibacterial substances / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Biologia Funcional e Molecular

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 379490.pdf: 2432240 bytes, checksum: 754b0e0f479a79dbcde2d66ac779b3da (MD5) Previous issue date: 2006-05-02 / O presente estudo teve como objetivos b?sicos conhecer a composi??o, estrutura e hist?ria natural de uma comunidade de serpentes de uma reserva de floresta prim?ria (≈150 ha) localizada em ?rea de corte seletivo de madeira da Fazenda Continental (11? 24 49,9 S e 55? 19 45,1 W), ecorregi?o Florestas Secas de Mato Grosso, no sudoeste do munic?pio de Claudia, centro-norte de Mato Grosso. Enfocou a riqueza e a abund?ncia relativa das esp?cies, a utiliza??o do ambiente (h?bitat e microh?bitat), os padr?es de atividade di?ria e sazonal, a dieta e a reprodu??o das serpentes. Entre abril de 2002 e junho de 2004, foram realizadas 18 campanhas, totalizando 250 dias n?o consecutivos de trabalho de campo. Foram utilizados quatro m?todos de amostragem: armadilhas de intercepta??o e queda (AIQ), procura visual limitada por tempo (PVLT), encontros ocasionais (EO) e coletas por terceiros (CT). As AIQ permaneceram abertas por 175 dias; resultaram em um esfor?o de 4200 h (= 117600 horas-tambor) e no registro de 123 indiv?duos (0,001 serpente/hora/tambor) de 27 esp?cies. A PVLT, efetuada ao longo de 136 dias, de junho de 2003 a junho de 2004, correspondeu em m?dia a cinco horas-homem de procura di?ria, totalizou 945,2 horas-homem (805,3 no per?odo noturno e 139,9 no diurno) e registrou 41 indiv?duos de 13 esp?cies (0,04 serpente/hora/homem; noite = 0,05 e dia = 0,007). Os EO foram quantificados por dia de trabalho de campo (250 dias-campo), e resultaram no registro de 108 indiv?duos de 33 esp?cies (0,43 serpente/dia-campo). A CT incluiu as serpentes coletadas por tr?s colaboradores residentes na ?rea e registrou 43 indiv?duos de 18 esp?cies em 775 dias (0,017 serpente/dia/colaborador). No total foram registrados 315 indiv?duos de 39 esp?cies, distribu?das em cinco fam?lias (Typhlopidade, Boidae, Colubridae, Elapidae e Viperidae). A composi??o de esp?cies da comunidade ? mais assemelhada ?s de outras ?reas florestadas da Amaz?nia, principalmente da por??o oriental, que ?s ?reas de Cerrado. Entretanto, dentre as demais ?reas amaz?nicas estudadas, a comunidade de Claudia ? a que mais se assemelha ?s de ?reas de Cerrado. A esp?cie dominante foi Oxyrhopus melanogenys, com 9,8% dos registros. A distribui??o de abund?ncia da comunidade mostrou-se equilibrada e se ajustou estatisticamente a tr?s modelos: s?rie geom?trica, lognormal e Brocken Stick. Predominaram serpentes de atividade noturna que exploram o solo e a serapilheira. A abund?ncia relativa variou sazonalmente e apresentou correla??o positiva com a precipita??o mensal e as m?dias mensais da temperatura m?nima. Tamb?m houve varia??o sazonal na taxa de captura de AIQ e PVLT e nas capturas de machos e f?meas. A movimenta??o de f?meas foi correlacionada diretamente com a precipita??o pluviom?trica e inversamente com a varia??o da diferen?a entre m?dias m?nimas e m?ximas mensais, indicando maior movimenta??o no per?odo mais ?mido e de maior estabilidade t?rmica. A utiliza??o de recursos pelas esp?cies da comunidade foi diversificada, sendo que os itens alimentares mais consumidos foram lagartos, anuros e mam?feros, nessa ordem. Invertebrados estiveram presentes em cerca de 18% das amostras; dentre eles, a categoria mais recorrente foi representada por quil?podes (11%). O n?mero de f?meas em eventos reprodutivos e a captura de juvenis n?o diferiu significativamente entre a esta??o seca e a chuvosa, e a distribui??o temporal dos eventos reprodutivos indicou a ocorr?ncia de um padr?o reprodutivo assazonal para a comunidade como um todo. Contudo, foram identificadas esp?cies com ciclos sazonais bem definidos, o que indica que a assazonalidade registrada resulta da sobreposi??o de ciclos reprodutivos de diferentes esp?cies e extens?es (sazonais e assazonais).

Orientador: Otavio Augusto Vuolo Marques / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T17:18:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Prado_LigiaPizzattodo_M.pdf: 5995494 bytes, checksum: b089a94ad3e332090eb62124620d5fb5 (MD5) Previous issue date: 2003 / Resumo: A reprodução de Liophis miliaris no Brasil foi estudada em quatro populações: Mata Atlântica do sul da Bahia, Mata Atlântica do litoral de São Paulo e Par_ Domínio Atlântico do interior de São Paulo e Domínio Atlântico do interior do Paraná. Em todas as localidades as fêmeas são maiores que os machos. Adultos e recém-nascidos da Mata Atlântica do sul da Bahia são menores que os das demais localidades. Nessa região, onde existe pouca variação climática ao longo do ano, as fêmeas apresentaram ciclo reprodutivo contínuo, ao passo que nas demais localidades ele é sazonal e relacionado ao aumento de temperatura e precipitação. O ciclo espermatogênico parece ser contínuo em todas as regiões. Nas populações onde o ciclo é sazonal, a cópula parece ocorrer antes da época de vitelogênese e, portanto, as fêmeas devem estocar os espermatozóides. A fecundidade é semelhante em todas as áreas e aumenta com o tamanho corporal da fêmea. A freqüência reprodutiva é menor na Mata Atlântica do sul da Bahia e, ao contrário das demais regiões, tende a ser maior em indivíduos de maior tamanho corporal. Os tipos de presas ingeridos são semelhantes nas quatro populações e fêmeas grávidas não se alimentam. Machos e fêmeas são parasitados (por nematóide Ophidiascaris sp. E cistacantos Oligacanthorynchus spira) em iguais proporções e os indivíduos da Mata Atlântica do sul da Bahia são menos parasitados. O parasitismo aparentemente não impede a reprodução da espécie. Entretanto, fêmeas parasitadas pelo nematóide, no Domínio Atlântico do interior do Paraná, apresentam menor fecundidade. A atividade das serpentes está relacionada ao ciclo reprodutivo e às variações climáticas nas quatro áreas estudadas. Liophis miliaris apresenta o ciclo reprodutivo diferente de outros membros da tribo Xenodontini, que tendem a se reproduzir continuamente mesmo em áreas onde a sazonalidade climática é acentuada. Assim, L. miliaris parece ser mais sensível a certos parâmetros ambientais do que outras espécies de Xenodontini já estudadas / Abstract: This work reports different aspects on reproduction of the colubrid snake Liophis miliaris in four different regions of Brazil: Atlantic forest in south Bahia state, coastal Atlantic forest in São Paulo Paraná states, inland Atlantic forest in São Paulo and inland Atlantic forest in Paraná. Females have larger snout-vent length (SVL) than males in all these regions. In south Bahia, where there is little climate variation, the reproductive cycle is continuous whereas in the other regions it is seasonal, related to warmer and more rainy season. Sperm production seems to occur all through the year in all these regions. Where reproductive cycle is seasonal, mating seems to be dissociated from vitellogenesis, thus, females must store sperm overwinter. Clutch size is similar in all populations increasing with maternal length. In the Atlantic forest in south Bahia newborn snakes had a smaller SVL than in the other regions studied. Reproductive frequency is lower in Atlantic forest in south Bahia, different from the other regions, tends to increase with female length. Prey items are similar in all populations and gravid females do not feed. Ophidiascaris sp. (Nematoda) and cystacanths of Oligacanthorynchus spira (Acanthocephala) were found equally in both females and males, fewer in snakes from Atlantic forest in Bahia. Apparently, these parasites do not impede reproduction, but females attacked by nematodes in the inland Atlantic forest in Paraná show a smaller clutch size than non-attacked ones. The activity pattern of adults snakes is associated with reproductive cycle and climate variation in all sites. The reproductive pattern of L. miliaris differs from other Xenodontini species which tend to reproduce continuously even in areas with seasonal climate. Thus, L. miliaris seems to be more sensitive to some climate variables than other studied species of Xenodontini / Mestrado / Mestre em Ecologia