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Physiological and molecular studies during acquisition of longevity in soybean (Glycine max (L.) Merrill) seeds /

Lima, Juliana Joice Pereira, 1987. January 2016 (has links)
Orientador: Edvaldo Aparecido Amaral da Silva / Coorientador: Olivier Leprince / Banca : Henk W.M Hilhorst / Banca: José Márcio Rocha Faria / Banca: Julia Buitink / Banca: Olivier H.L.Leprince / Resumo: Soja é uma das mais culturas oleaginosas usadas para alimentação animal e humana bem como para uma larga aplicação industrial. Dada a sua capacidade de fixar nitrogênio atmsférico, é fundamental para o desenvolvimento de uma agricultura sustentável. Produzir sementes altamente vigorosas é a chave para aumentar a eficiência da produção da cultura. Longevidade de semente é a capacidade de sobreviver no estado seco por períodos prolongados e representa uma importante característica de qualidade da semente. Nesta pesquisa o objetivo foi obter insights sobre processos moleculares que regulam a aquisição de longevidade em sementes de soja. Com o sequenciamento de nova geração da Illumina, o RNA foi sequenciado a partir de sete estágios diferentes durante a aquisição de longevidade, gerando entre 14 e 38 milhões de reads. Estes reads foram alinhados com os modelos de genes de Glycine max Wm82.a2.v1 preditos no genoma de soja. Transcritos diferencialmente expressos (DET) foram correlacionados com o aumento da longevidade. Análise de enriquecimento da ontologia do gene daqueles DET revelaram uma siginificante sobre representação de termos associados com resposta a estresse e processamento e modificação de RNA. Processo biológico fotossíntese foi relacionado à baixa longevidade. Heat Shock Factors (HSF) e vários fatores de transcrição associados com resposta a estresse biótico (WRKY e NFXL1) são genes candidatos com possíveis papéis na longevidade de semente e merecem uma caracterizaçã... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Soybean is one of the most important oil crop species used for food and feed as well as a range of industrial applications. However, producing highly vigorous seeds is a key lever to increase crop production efficiency. Low physiological seed quality, which is more prone to occur under tropical environment, leads to poor stand establishment and decreased in yields. Seed longevity is the ability to survive the dry state for prolonged periods of time and represents an important trait for seed quality. Here, the objective was to obtain insights into the mechanisms regulating the progressive acquisition of longevity. Using Illumina high-throughput sequencing, RNA was sequenced from seven different stages during the acquisition of longevity, generating between 14 and 38 million of reads. These reads were aligned to the Glycine max Wm82.a2.v1 gene model. Differentially expressed transcripts (DET) were correlated with the increase in seed longevity. Transcriptome and GO enrichment analyses of these DET revealed a significant over-representation of terms associated with response to stress and RNA processing and modification. Photosynthesis biological process was related to low seed longevity. HSF and several TF associated with biotic defense (WRKY3 and NLFX1) are candidate genes whose putative role in seed longevity deserve further characterization. We also performed the determination of the content of non-reducing soluble sugars, and we observed that the accumulation of non-reducin... (Complete abstract click electronic access below) / Résumé: Le soja est l'une des plus importantes espèces de cultures d'huile utilisée aussi bien en nourriture que dans diverses gammes d'applications industrielles. C'est pourquoi produire des graines vigoureuses est un levier essentiel pour augmenter efficacement de la production de la récolte. La qualité de graine physiologiquement faible, qui est plus à même de se produire sous un environnement tropical, mène à un pauvre établissement des plantes ainsi qu'à une diminution du rendement. La longévité d'une graine est la capacité de celle-ci à survivre à la sécheresse durant de longues périodes et représente une caractéristique importante sur la qualité d'une graine. Ici, l'objectif était d'obtenir une idée sur les mécanismes en régulant l'acquisition progressive de la longévité. En utilisant le séquençage à haut-débit, ARN a été séquencé en sept différentes étapes durant l'acquisition de longévité, générant entre 14 et 38 millions de reads. Ces reads ont été alignés sur les modeles de gene de Glycine max Wm82.a2.v1. Les transcripts différentiellement exprimés (DET) sont corrélée avec l'augmentation de la longévité de la graine. L'analise d'enrichissement via GO de ces DET ont révélé une importante surreprésentation des termes associés à la réponse au stress et traitement et modification de l'ARN. Le processu biologique Photosynthèse était liée à une faible longévité des semences. HSF (heat shock factor) et plusieurs facteurs de transcription associés à la défense biotique (WRKY 3 et ... (Résumé complet accès életronique ci-dessous) / Doutor
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QUALIDADE FISIOLÓGICA DE SEMENTES DE PAINEIRA EM FUNÇÃO DO ESTÁDIO DE MATURAÇÃO, TEMPERATURAS CARDINAIS E ESTRESSE SALINO

LEMES, E. Q. 11 July 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:36:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_4934_.pdf: 793178 bytes, checksum: cafcf44a20ef1eaf84c872e150c832a1 (MD5) Previous issue date: 2011-07-11 / LEMES, Eliane de Queiroz. Qualidade fisiológica de sementes de paineira em função do estádio de maturação, temperaturas cardinais e estresse salino. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências Florestais) Universidade Federal do Espírito Santo, Alegre-ES. Orientador: Prof. Dr. José Carlos Lopes. Objetivou-se com este trabalho estudar a maturação fisiológica de sementes de paineira (Ceiba speciosa St. Hil.) na região serrana do Caparaó, estudar a germinação dessas sementes sob diferentes temperaturas e avaliar o comportamento germinativo das sementes de paineira e o desenvolvimento de plântulas normais e anormais sob diferentes condições de estresse salino simulado com NaCl. Os estudos foram conduzidos na região Serrana do Caparaó, município de Guaçui - ES, onde as arvores foram etiquetadas na antese floral e acompanhado o enchimento dos frutos e desenvolvimento das sementes até que atingisse a completa maturação, a coleta dos frutos foi feita semanalmente e conduzidos ao Laboratório de Tecnologia e Análise de Sementes do Centro de Ciências Agrárias da UFES onde foram avaliadas as características biométricas dos frutos e das sementes, coloração do fruto e das sementes; umidade, massa fresca, massa seca e germinação das sementes. Para o estudo das temperaturas cardinais os testes de germinação foram realizados com quatro sub-amostras de 25 sementes, colocadas em placas de Petri forradas com papel germitest, mantidas em câmaras tipo BOD, onde foram testadas as seguintes temperaturas constantes: 05, 07, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40 e 45 ºC. Para avaliar a germinação e o desenvolvimento das plântulas em diferentes concentrações de NaCl os tratamentos foram constituídos pelos potenciais osmóticos: 0,0 (controle); -0,2; -0,4; -0,6 e -0,8 MPa. A germinação e o vigor das sementes foram avaliados pela germinação, primeira contagem, índice de velocidade de germinação tempo médio de germinação, freqüência relativa de germinação, comprimento parte aérea e comprimento de raiz, massa fresca e massa seca das plântulas e caracterização morfológica das plântulas normais e anormais. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, com quatro repetições de 25 sementes. Foram ajustadas equações de regressão para as principais características avaliadas, os dados expressos em porcentagem foram transformados em arc-sen e as médias comparadas pelo teste de Scott Knott e Tukey em nível de 5% de probabilidade. A colheita de sementes de Ceiba speciosa pode ser iniciada aos 163 dias (22 semanas) após a antese, nesta fase as sementes se apresentavam com a coloração marrom escuro e com teor de umidade de aproximadamente 37% e porcentagem de germinação de 87%. As sementes coletadas na região do Serrana do Caparaó apresentou ampla faixa de germinação entre as temperaturas, sendo a temperatura ótima para essa espécie a de 25 e 30 °C. A salinidade causou decréscimos nos valores das variáveis analisadas no teste de germinação. A Paineira é considerada glicófita, com limite máximo de tolerância ao NaCl até -0,6 MPa. Palavras-chave: Ceiba speciosa, sementes, germinação, plântulas, salinidade.
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Depressão endogâmica em uma população de pepino japonês (Cucumis sativus L.)

Santacruz Oviedo, Victoria Rossmary [UNESP] 28 January 2004 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2004-01-28Bitstream added on 2014-06-13T18:54:59Z : No. of bitstreams: 1 santacruzoviedo_vr_me_botfca.pdf: 253923 bytes, checksum: d788e43f5154fa351b3082b8b6f18339 (MD5) / Foram conduzidos dois experimentos na FCA/UNESP, objetivando avaliar a depressão causada por endogamia com sucessivas gerações de autofecundação em uma população de pepino do tipo japonês. No primeiro experimento foram avaliadas características de produção de frutos imaturos no período de 21/08/2002 à 29/11/2002 em ambiente protegido. No segundo experimento foram avaliadas características de produção e qualidade de sementes no período de 12/03/2003 à 13/06/2003 em condições de campo. A partir do intercruzamento entre plantas do híbrido Natsu suzumi foi obtida a geração F2, considerada como população S0. Obtiveram-se progênies S1, S2, S3, S4 e S5, através de autofecundações sucessivas pelo método do SSD ('Single Seed Descent'). Ao partir da mistura ao acaso de sementes de progênies com igual número de autofecundações sucessivas foram obtidas cinco populações denominadas de população S1 a população S5. Foram sete tratamentos (híbrido Natsu suzumi, populações S0 a S5) e o delineamento experimental foi em blocos ao acaso, com seis e quatro repetições no primeiro e segundo experimento, respectivamente e cinco plantas por parcela nos dois experimentos. No primeiro experimento (frutos imaturos) foram avaliados, número de folhas, comprimento da haste principal, número e massa de frutos, total e comercial, número de nós e porcentagem de brotações. No segundo experimento (frutos maduros) avaliaram-se características relacionadas com produção (número e massa de sementes por planta e por fruto) e qualidade de sementes (teste padrão de germinação, primeira contagem de sementes, índice de velocidade de germinação, massa de 100 sementes). Foram realizadas as análises de variância para cada característica, e as médias dos tratamentos foram comparadas pelo teste de Tukey (%). Também foram realizados análises de variância apenas com as seis... / Two experiments were set up at FCA/UNESP. The objective of this work was to evaluate the inbreeding depression with successive generations of self pollination in a cucumber Japanese population. It was studied one population F2 obtained from a commercial hybrid (Natsu suzumi) considered as S0 population. In the first experiment were appraised characteristics of production of immature fruits in the period of 21/08/2002 to 29/11/2002 in protected cultivation. In the second experiment were appraised seed production and quality in the period of 12/03/2003 to 13/06/2003 in open field conditions. It was obtained progenies S1, S2, S3, S4 and S5 through the 'Single Seed Descent' methodology. It was used randomized blocks with seven treatments (different generations of self pollination - S0 to S5 and the hybrid Natsu suzumi) six and four replicates in the first and second experiment and five plants per plot in both. In the first experiment (immature fruits) were evaluated number of leaves, length of the main stem, number and weight of fruits, total and commercial, number of nodes and vines percentage. In the second experiment (mature fruit) characteristic related with production were evaluated (number and weight of seeds per plant and per fruit) and quality of seeds (germination test, first counted of seeds, index of germination speed and weight of 100 seeds). The variance analyses were accomplished each characteristic and the averages of the treatments were compared by the test of Tukey (%). Also accomplished just with the six inbreed generations to evaluate the possible inbreeding depression (without including the commercial hybrid). In the comparison among the population differences were not observed for the characteristics appraised showing there were not production loss for inbreeding in this population. However, for the characteristics length of the main stem, number of total fruit, weight of seeds per fruit and seed number per fruit the commercial.
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Determinação da pureza varietal em lotes de sementes de milho através de marcadores morfológicos e microssatélites. / Determination of varietal purity in maize seed lots using morphological and microsatellites markers.

Ramos, Nilza Patricia 13 December 2004 (has links)
A presença de cultivares indesejáveis em lotes de linhagens de milho não é tolerada, pois compromete a eficiência da multiplicação subsequente para a produção comercial de sementes. A detecção das sementes contaminantes é realizada através de testes para determinação da pureza varietal e/ou genética, os quais, geralmente, são baseados em marcadores morfológicos e bioquímicos. Devido à importância dessa determinação, métodos alternativos eficientes vêm sendo avaliados e, entre esses merecem destaque os baseados em polimorfismo de DNA, visando a obtenção de informações mais consistentes. Nesse sentido, esta pesquisa teve como objetivo principal a comparação da eficiência de marcadores morfológicos e microssatélites para avaliação de pureza varietal de linhagens de milho e a determinação do grau de sensibilidade da técnica de microssatélites para detectar a ocorrência de genótipos contaminantes em lotes de sementes. Utilizaram-se quatro linhagens (L1, L2, L3 e L4) fornecidas pela Dow AgroSciences Ltda., misturadas duas a duas, para a obtenção de níveis de contaminação de 0, 1, 2, 5, 10 e 100%. L1 e L3 foram consideradas linhagens puras, enquanto L2 e L4 foram tratadas como genótipos contaminantes. A avaliação mediante o uso de marcadores morfológicos foi realizada utilizando-se descritores para sementes, plântulas e plantas em diferentes estádios de desenvolvimento. Na técnica de microssatélites utilizaram-se iniciadores específicos para amplificar DNA isolado a partir de amostras constituídas por 100 sementes ou 100 pares de folhas de plântulas. As reações de amplificação foram conduzidas via reação da polimerase em cadeia e o programa de amplificação utilizado foi específico para microssatélites. Para a resolução dos fragmentos utilizaram-se os géis de agarose (3,5%) e poliacrilamida (6%). Com a finalidade de verificar a sensibilidade dos microssatélites em detectar a ocorrência de contaminantes, foram realizadas misturas sucessivas do DNA da linhagem denominada contaminante em DNA da linhagem pura, simulando níveis de contaminação de 0%, 0,01%, 0,013%, 0,02%, 0,04%, 0,1%, 0,2%, 1%, 2%, 5%, 10% e 100%. Foi observado que as características morfológicas de sementes, plântulas ou mesmo plantas, não ofereceram segurança suficiente para a detecção de contaminação em amostras de linhagens de milho. Por outro lado, a técnica de microssatélites apresentou maior eficiência e precisão, permitindo a detecção de níveis de contaminação de até 1%, como o uso de amostras constituídas por sementes e também folhas de plântulas. No experimento simulando misturas com DNA de diferentes genótipos (L1 - L2 e L3 - L4), a técnica de microssatélites foi eficiente em detectar de maneira consistente concentrações de 0,1% da amostra contaminante. Assim, a determinação da pureza varietal em lotes de sementes de linhagens de milho é mais eficiente pela utilização de marcadores microssatélites em comparação aos marcadores morfológicos. / Maize inbred lines seed production has been conducted to avoid the presence of varietal contamination since it compromises the subsequent multiplication phases within the commercial seed program. Contaminant seeds are detected through varietal and/or genetic purity determination tests which are usually based on morphological and biochemical markers, depending on the desired effectiveness. Thus, more efficient alternative approaches have been tested, with special emphasis on those based on DNA polymorphism. In that context, the main objective of this research was to compare the efficiency of morphological and microsatellite markers to evaluate varietal purity of maize inbred lines and to determine the sensitiveness of the microsatellite technique to detect the occurrence of contaminant genotypes in seed lots. There were used four inbred lines (L1, L2, L3 and L4) supplied by Dow AgroSciences Ltd., mixed to attain contamination levels of 0, 1, 2, 5, 10 and 100%. L1 and L3 were considered pure strains while L2 and L4 were treated as contaminant genotypes. For the morphological marker evaluation seed, seedling and plant descriptors at different development stages were used. Specific maize primers were used in the microsatellite technique and the DNA was isolated from samples of 100 seeds or 100 pairs of seedling leaves. The DNA amplification reactions were conducted through polymerase chain reaction, with amplification program especially designed for microsatellites, and for fragments resolution, 3.5% agarose and 6% polyacrilamyde gels were used. Successive mixtures among DNA of contaminant line and pure line (0%, 0.01%, 0.013%, 0.02%, 0.04%, 0.1%, 0.2%, 1%, 2%, 5%, 10%, and 100%) were performed to simulate contamination levels with the objective of verify the microssatellite sensitiveness in detecting the occurrence of contaminants. Morphological characteristics of the seeds, seedlings or plants were less reliable to detect contamination in maize inbred lines than the microsatellite technique; this provides more efficient and accurate evaluation of varietal purity of seed lots. Levels with 1% of contamination were detected by the use of seed and seedling leaf samples. The experiment with mixtures of DNA (L1 - L2 and L3 - L4) using microsatellite technique allowed the consistent detection of 0.1% contaminant DNA concentration. Thus, the determination of varietal purity in maize seed lots is more efficient by using microsatellite markers than morphological markers.
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Depressão endogâmica em uma população de pepino japonês (Cucumis sativus L.) /

Santacruz Oviedo, Victoria Rossmary, 1968- January 2004 (has links)
Orientador: Antonio Ismael Inácio Cardoso / Banca: Noberto da Silva / Banca: Keigo Minami / Resumo: Foram conduzidos dois experimentos na FCA/UNESP, objetivando avaliar a depressão causada por endogamia com sucessivas gerações de autofecundação em uma população de pepino do tipo japonês. No primeiro experimento foram avaliadas características de produção de frutos imaturos no período de 21/08/2002 à 29/11/2002 em ambiente protegido. No segundo experimento foram avaliadas características de produção e qualidade de sementes no período de 12/03/2003 à 13/06/2003 em condições de campo. A partir do intercruzamento entre plantas do híbrido Natsu suzumi foi obtida a geração F2, considerada como população S0. Obtiveram-se progênies S1, S2, S3, S4 e S5, através de autofecundações sucessivas pelo método do SSD ('Single Seed Descent'). Ao partir da mistura ao acaso de sementes de progênies com igual número de autofecundações sucessivas foram obtidas cinco populações denominadas de população S1 a população S5. Foram sete tratamentos (híbrido Natsu suzumi, populações S0 a S5) e o delineamento experimental foi em blocos ao acaso, com seis e quatro repetições no primeiro e segundo experimento, respectivamente e cinco plantas por parcela nos dois experimentos. No primeiro experimento (frutos imaturos) foram avaliados, número de folhas, comprimento da haste principal, número e massa de frutos, total e comercial, número de nós e porcentagem de brotações. No segundo experimento (frutos maduros) avaliaram-se características relacionadas com produção (número e massa de sementes por planta e por fruto) e qualidade de sementes (teste padrão de germinação, primeira contagem de sementes, índice de velocidade de germinação, massa de 100 sementes). Foram realizadas as análises de variância para cada característica, e as médias dos tratamentos foram comparadas pelo teste de Tukey (%). Também foram realizados análises de variância apenas com as seis... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Two experiments were set up at FCA/UNESP. The objective of this work was to evaluate the inbreeding depression with successive generations of self pollination in a cucumber Japanese population. It was studied one population F2 obtained from a commercial hybrid (Natsu suzumi) considered as S0 population. In the first experiment were appraised characteristics of production of immature fruits in the period of 21/08/2002 to 29/11/2002 in protected cultivation. In the second experiment were appraised seed production and quality in the period of 12/03/2003 to 13/06/2003 in open field conditions. It was obtained progenies S1, S2, S3, S4 and S5 through the 'Single Seed Descent' methodology. It was used randomized blocks with seven treatments (different generations of self pollination - S0 to S5 and the hybrid Natsu suzumi) six and four replicates in the first and second experiment and five plants per plot in both. In the first experiment (immature fruits) were evaluated number of leaves, length of the main stem, number and weight of fruits, total and commercial, number of nodes and vines percentage. In the second experiment (mature fruit) characteristic related with production were evaluated (number and weight of seeds per plant and per fruit) and quality of seeds (germination test, first counted of seeds, index of germination speed and weight of 100 seeds). The variance analyses were accomplished each characteristic and the averages of the treatments were compared by the test of Tukey (%). Also accomplished just with the six inbreed generations to evaluate the possible inbreeding depression (without including the commercial hybrid). In the comparison among the population differences were not observed for the characteristics appraised showing there were not production loss for inbreeding in this population. However, for the characteristics length of the main stem, number of total fruit, weight of seeds per fruit and seed number per fruit the commercial. / Mestre
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Determinação da pureza varietal em lotes de sementes de milho através de marcadores morfológicos e microssatélites. / Determination of varietal purity in maize seed lots using morphological and microsatellites markers.

Nilza Patricia Ramos 13 December 2004 (has links)
A presença de cultivares indesejáveis em lotes de linhagens de milho não é tolerada, pois compromete a eficiência da multiplicação subsequente para a produção comercial de sementes. A detecção das sementes contaminantes é realizada através de testes para determinação da pureza varietal e/ou genética, os quais, geralmente, são baseados em marcadores morfológicos e bioquímicos. Devido à importância dessa determinação, métodos alternativos eficientes vêm sendo avaliados e, entre esses merecem destaque os baseados em polimorfismo de DNA, visando a obtenção de informações mais consistentes. Nesse sentido, esta pesquisa teve como objetivo principal a comparação da eficiência de marcadores morfológicos e microssatélites para avaliação de pureza varietal de linhagens de milho e a determinação do grau de sensibilidade da técnica de microssatélites para detectar a ocorrência de genótipos contaminantes em lotes de sementes. Utilizaram-se quatro linhagens (L1, L2, L3 e L4) fornecidas pela Dow AgroSciences Ltda., misturadas duas a duas, para a obtenção de níveis de contaminação de 0, 1, 2, 5, 10 e 100%. L1 e L3 foram consideradas linhagens puras, enquanto L2 e L4 foram tratadas como genótipos contaminantes. A avaliação mediante o uso de marcadores morfológicos foi realizada utilizando-se descritores para sementes, plântulas e plantas em diferentes estádios de desenvolvimento. Na técnica de microssatélites utilizaram-se iniciadores específicos para amplificar DNA isolado a partir de amostras constituídas por 100 sementes ou 100 pares de folhas de plântulas. As reações de amplificação foram conduzidas via reação da polimerase em cadeia e o programa de amplificação utilizado foi específico para microssatélites. Para a resolução dos fragmentos utilizaram-se os géis de agarose (3,5%) e poliacrilamida (6%). Com a finalidade de verificar a sensibilidade dos microssatélites em detectar a ocorrência de contaminantes, foram realizadas misturas sucessivas do DNA da linhagem denominada contaminante em DNA da linhagem pura, simulando níveis de contaminação de 0%, 0,01%, 0,013%, 0,02%, 0,04%, 0,1%, 0,2%, 1%, 2%, 5%, 10% e 100%. Foi observado que as características morfológicas de sementes, plântulas ou mesmo plantas, não ofereceram segurança suficiente para a detecção de contaminação em amostras de linhagens de milho. Por outro lado, a técnica de microssatélites apresentou maior eficiência e precisão, permitindo a detecção de níveis de contaminação de até 1%, como o uso de amostras constituídas por sementes e também folhas de plântulas. No experimento simulando misturas com DNA de diferentes genótipos (L1 - L2 e L3 - L4), a técnica de microssatélites foi eficiente em detectar de maneira consistente concentrações de 0,1% da amostra contaminante. Assim, a determinação da pureza varietal em lotes de sementes de linhagens de milho é mais eficiente pela utilização de marcadores microssatélites em comparação aos marcadores morfológicos. / Maize inbred lines seed production has been conducted to avoid the presence of varietal contamination since it compromises the subsequent multiplication phases within the commercial seed program. Contaminant seeds are detected through varietal and/or genetic purity determination tests which are usually based on morphological and biochemical markers, depending on the desired effectiveness. Thus, more efficient alternative approaches have been tested, with special emphasis on those based on DNA polymorphism. In that context, the main objective of this research was to compare the efficiency of morphological and microsatellite markers to evaluate varietal purity of maize inbred lines and to determine the sensitiveness of the microsatellite technique to detect the occurrence of contaminant genotypes in seed lots. There were used four inbred lines (L1, L2, L3 and L4) supplied by Dow AgroSciences Ltd., mixed to attain contamination levels of 0, 1, 2, 5, 10 and 100%. L1 and L3 were considered pure strains while L2 and L4 were treated as contaminant genotypes. For the morphological marker evaluation seed, seedling and plant descriptors at different development stages were used. Specific maize primers were used in the microsatellite technique and the DNA was isolated from samples of 100 seeds or 100 pairs of seedling leaves. The DNA amplification reactions were conducted through polymerase chain reaction, with amplification program especially designed for microsatellites, and for fragments resolution, 3.5% agarose and 6% polyacrilamyde gels were used. Successive mixtures among DNA of contaminant line and pure line (0%, 0.01%, 0.013%, 0.02%, 0.04%, 0.1%, 0.2%, 1%, 2%, 5%, 10%, and 100%) were performed to simulate contamination levels with the objective of verify the microssatellite sensitiveness in detecting the occurrence of contaminants. Morphological characteristics of the seeds, seedlings or plants were less reliable to detect contamination in maize inbred lines than the microsatellite technique; this provides more efficient and accurate evaluation of varietal purity of seed lots. Levels with 1% of contamination were detected by the use of seed and seedling leaf samples. The experiment with mixtures of DNA (L1 - L2 and L3 - L4) using microsatellite technique allowed the consistent detection of 0.1% contaminant DNA concentration. Thus, the determination of varietal purity in maize seed lots is more efficient by using microsatellite markers than morphological markers.
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Insetos predadores de sementes e suas relações com a qualidade e a morfologia de frutos e sementes

Rodrigues, Ligia Maria da Silva [UNESP] 24 January 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-01-24Bitstream added on 2014-06-13T19:43:48Z : No. of bitstreams: 1 000738102.pdf: 3260971 bytes, checksum: a1247f6fe649b23fdfe36cebbab2c317 (MD5) / Este estudo teve como objetivos conhecer a comunidade de insetos consumidores de sementes na fase de pré-dispersão e suas plantas hospedeiras em áreas de floresta estacional semidecidual, quantificar os níveis de danos causados por estes insetos, e também verificar se caracteres qualitativos (compostos fenólicos, proteína total e dureza das sementes) e morfológicos (forma e biomassa) das sementes interferem no tamanho corporal das principais ordens de insetos encontradas predando as sementes e nas taxas de emergência destes insetos. Em áreas da Fazenda Experimental Edgárdia, foram selecionadas 89 plantas de 30 espécies, pertencentes a seis famílias. Foram realizadas coletas mensais de frutos e acompanhamento da fenologia reprodutiva por dois anos. Após as coletas os frutos foram armazenados para aguardar a emergência dos insetos e após emergência, os insetos, frutos e sementes foram medidos. As sementes também foram testadas para determinar sua dureza e foram analisadas quanto à biomassa, teor de água, nitrogênio total e compostos fenólicos totais. Houve emergência de insetos provenientes de três ordens, Coleoptera, Lepidoptera e Hymenoptera em 21 espécies de plantas. Coleoptera foi a que apresentou maior número de indivíduos emergindo dos frutos, seguida por Hymenoptera e por último Lepidoptera. Nos coleópteros foram observadas cinco famílias predando as sementes, Anobiidae, Anthribidae, Cerambycidae, Curculionidae e Chrysomelidae. A subfamília Bruchinae (Chrysomelidae) foi a que teve o maior número de insetos emergindo dos frutos de 14 espécies de plantas, com o total de sete gêneros identificados. Hymenaea courbaril foi a espécie mais intensamente predada (53,99%) e o maior consumo se deu por insetos da ordem Lepidoptera (35,14%). Já a espécie Luehea divaricata apresentou a menor taxa de predação (0,07%). A qualidade das sementes exerceu influência significativa apenas no que diz... / This study aimed to identify the insect community of pre-dispersal seed consumers and their host plants in semi-deciduous forest areas, quantify the levels of damage caused by these insects in their seeds, exam whether qualitative characters (phenolic compounds, total protein and hardness of seeds) and morphological characters (form and biomass) of seeds interfere with body size and rates of emergency of the main insect pre-dispersal seed predators orders feeding on these seeds. 89 plants of 30 species belonging to six families were selected in five areas at the Experimental Farm Edgárdia. Fruit collections and reproductive phenology monitoring were made every month during two years. After collection, fruits were stored to await the emergence of insects and after emergence, the insects, fruits and seeds were measured. Then the hardness, biomass and water content, total nitrogen and total phenolics were estimated in seeds. Insects emerged from 21 plant species and from three orders: Coleoptera, Lepidoptera and Hymenoptera. Coleoptera showed the highest number of individuals emerging from fruits, followed by Hymenoptera and Lepidoptera, respectively. Coleoptera showed five families preying on seeds, Anobiidae, Anthribidae, Cerambycidae, Curculionidae and Chrysomelidae. The subfamily Bruchinae (Chrysomelidae) was the one with the greatest number of insects emerging from the fruits of 14 plant species, with a total of seven genera identified. Hymenaea courbaril was the most heavily predated plant (53.99%) and the highest consumption occurred by insects of the order Lepidoptera (35.14%); on the other hand Luehea divaricata showed the lowest predation rate (0.07%). Seed quality had significant effect only in relation to body size of beetles and butterflies, since larger insects were observed in tougher seeds. For the morphological data and biomass of seeds was observed that the species with higher biomass ...
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Desenvolvimento de método para quantificação de resíduos de paraquat em grão e vagem de feijão e qualidade fisiológica das sementes após a dessecação / Method development for paraquat residues quantification in the bean grain and pod and physiological quality of seeds after desiccation

Rosado, Cecília Brustolini 15 July 2016 (has links)
Submitted by Gustavo Caixeta (gucaixeta@gmail.com) on 2017-02-23T16:25:59Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1220275 bytes, checksum: 307c8b50b1433ca9e1f078c0ffb8ceb9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-23T16:25:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1220275 bytes, checksum: 307c8b50b1433ca9e1f078c0ffb8ceb9 (MD5) Previous issue date: 2016-07-15 / Acredita-se que a dessecação química da cultura do feijão para antecipar a colheita e garantir a qualidade fisiológica das sementes possa contaminar os grãos com resíduos de herbicidas e afetar as características fisiológicas das sementes. Para confirmar essas hipóteses nesse trabalho foram desenvolvidos métodos para análise de resíduos de paraquat na vagem e no grão do feijão e avaliados os efeitos da dessecação da cultura com paraquat e com a mistura (paraquat + diuron), aplicadas em três estádios de desenvolvimento da cultura: R8 (antes da maturação fisiológica), R8/R9 (na maturação fisiológica) e R9 (após a maturação fisiológica das sementes). Os métodos desenvolvidos para extração e quantificação do paraquat na vagem e grão no feijão basearam-se na extração sólido-líquido assistida por ultrassom fazendo-se a quantificação do herbicida por cromatografia líquida de alta eficiência com detector de ultravioleta (HPLC-UV). A otimização do método foi feita avaliando-se os parâmetros de “clean up” da amostra e da extração como concentração de ácido clorídrico, natureza do solvente orgânico (metanol e acetonitrila), temperatura e tempo de aquecimento. Os métodos desenvolvidos foram validados, tanto para a vagem quanto para o grão do feijão, e aplicados às amostras. Os métodos foram lineares (r = 0, 99), apresentaram LOD e LOQ na vagem de 0,26 e 0,86 mg kg -1 e no grão de 0,04 e 0,15 mg kg -1 , respectivamente; com boa exatidão e repetitividade (recuperação >83% e DPR <13%). Foram encontradas altas concentrações de paraquat na vagem independente do estádio de aplicação. Todavia, nos grãos, resíduos do paraquat apenas foram encontrados quando foi aplicada a mistura dos herbicidas (paraquat + diuron) nas plantas no estádio R8/R9. Quanto aos efeitos dos herbicidas sobre a qualidade fisiológica das sementes de feijão constatou-se que a dessecação das plantas nos estádios R8 com o paraquat e no estádio R8/R9 com a mistura de herbicidas resultaram em menor percentagem de germinação, vigor das sementes e produtividade de grãos. A qualidade fisiológica das sementes de feijão foi preservada quando a dessecação foi realizada nos estádios R8/R9 e R9 para o paraquat e R9 para a mistura de herbicidas. Conclui-se que a aplicação do paraquat isolado como dessecante não deixa resíduo do herbicida nos grãos e que a dessecação deve ser feita nos estádios R8/R9 e R9 para antecipar a colheita em 8 e 6 dias, respectivamente, e garantir a qualidade fisiológica das sementes e a produtividade de grãos da cultura. / It is believed that the chemistry of the bean crop desiccation to anticipate the harvest and ensure the physiological quality of seeds may contaminate grain with residues of herbicides and affect the physiological characteristics of seed. To confirm these assumptions in this work were developed methods for analysis of paraquat residues on green beans and bean grain and evaluated the effects of desiccation of culture with paraquat and the mixture (paraquat + diuron), applied in three stages of development of culture: R8 (before the physiological maturation), R8/R9 (on physiological maturation) and R9 (after physiological maturation of seeds). The methods developed for extraction and quantification of paraquat in pods and grain in the beans were based on solid-liquid extraction by quantification of the herbicide by high performance liquid chromatography with ultraviolet detector (HPLC-UV). Optimization of the method was made by evaluating the parameters of "clean up" of the sample and the concentration of hydrochloric acid extraction, nature of the organic solvent (methanol and acetonitrile), temperature and heating time. The methods developed have been validated for both the pod and the bean grain, and applied to the samples. The methods were linear (r = 0, 99), LOD and LOQ in 0.26 pod and 0.86 mg kg -1 and in the grain of 0.04 and 0.15 mg kg -1 , respectively; with good accuracy and repeatability (recovery > 83% and DPR < 13%). Were found high concentrations of paraquat in pod regardless of the stage of implementation. However, in the grains, paraquat residues were only found when it was applied to a mixture of the herbicides (paraquat + diuron) in plants at the stadium R8/R9. About the effects of herbicides on the physiological quality of seeds found to bean desiccation of plants in stadiums R8 with paraquat and at the stadium R8/R9 with the mixture of herbicides resulted in lower percentage germination, vigor of seeds and grain productivity. The physiological quality of seeds of beans was preserved when desiccation was held in stadiums R8/R9 and R9 to paraquat and R9 for the mixture of herbicides. It was concluded that the application of paraquat isolated as desiccant leaves no residue of herbicide in the grain and the drying must be done in stadiums R8/R9 and R9 to anticipate the harvest in 8 and 6 days, respectively, and ensure the physiological quality of seeds and grain productivity of culture.
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Produção e qualidade de sementes de tomate em função do estádio de maturação do fruto e da ordem de frutificação na planta. / Production and quality of tomato seeds as a function of the fruit maturation stage and of the fructification order in the plant.

Ribeiro, Frederico Pereira 09 February 2004 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-06-06T14:52:47Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2030475 bytes, checksum: c7b984fd7e4e819600cfffe98e8cabc8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-06T14:52:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2030475 bytes, checksum: c7b984fd7e4e819600cfffe98e8cabc8 (MD5) Previous issue date: 2004-02-09 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A pesquisa teve por objetivos, estudar o processo de maturação de sementes de tomate (Lycopersicon esculentum Mill.), variedade Santa Clara do Grupo Santa Cruz, buscando determinar e caracterizar a maturidade fisiológica das sementes e avaliar a qualidade das obtidas de frutos colhidos nos diferentes racimos e em diferentes estádios de maturação. Para tanto, foi conduzido um experimento em campo, no delineamento inteiramente casualizado (DIC), em que cada planta continha uma única haste com seis racimos. Em cada racimo foram colhidos frutos na posição proximal (frutos 1, 2 e 3) e distal (frutos 5, 6 e 7), aos 30, 40, 50, 60, 70, 80 e 90 dias após a antese (DAA), determinando-se também o acúmulo térmico, em graus dias (GD), nos respectivos intervalos de tempo. Em cada posição, foram colhidos frutos em três diferentes estádios de maturação: IA - frutos com o ápice em início de amadurecimento; CM - frutos completamente maduros; e A - frutos colhidos em IA e deixados em repouso até completarem o amadurecimento (CM). Os frutos foram avaliados em relação ao: i) estádio de desenvolvimento (E); ii) peso; iii) diâmetro; iv) peso de sementes por fruto (PSF); e v) número de sementes por fruto (NSF). As sementes, extraídas dos frutos, foram submetidas aos seguintes testes e determinações: i) grau de umidade (GU); ii) massa da matéria seca por semente (MSS); iii) peso de mil sementes (PMS); iv) germinação (GERM); v) primeira contagem do teste de germinação (PC); vi) porcentagem de emergência de plântulas fortes em substrato comercial (EMERG); vii) índice de velocidade de emergência (IVE); viii) deterioração controlada (DC); e ix) condutividade elétrica (CE). Complementando as análises, determinou-se o acúmulo térmico para o desenvolvimento dos frutos da antese à colheita. Utilizou-se a análise de regressão para relacionar o acúmulo térmico às variáveis, determinando-se, assim, a ocorrência da maturação dos frutos e sementes em todos os doze pontos de colheita (posição proximal e distal de cada um dos 6 racimos). Em seguida, fez-se uso da análise de variância e teste de Tukey, para estudo do comportamento da qualidade de frutos e sementes em relação aos fatores racimo, posição e colheita dos frutos nos estádios IA, CM e A, bem como suas interações. Verificou-se que a maturação das sementes ocorreu quando os frutos apresentavam-se com cerca de 90% do pericarpo avermelhado até completamente maduros, com o pericarpo consistente. A capacidade máxima de germinação ocorreu antes do acúmulo máximo de matéria seca (maturidade de massa) na semente, estando os frutos com cerca de 90% do pericarpo avermelhado. O vigor máximo foi verificado após a capacidade máxima de germinação, ocorrendo, em geral, antes da maturidade de massa. A ocorrência, em GD, do máximo acúmulo de matéria seca e máxima germinação e vigor, variou entre as posições, sendo mais evidente entre os racimos da posição proximal, com destaque para o racimo 1 e 6, mais tardio e mais precoce, respectivamente. De modo geral, para as variáveis estudadas, a maturação das sementes de frutos da posição distal foi mais tardia que da posição proximal. O indexador “graus dias acumulados após a antese” foi mais adequado para a determinação da ocorrência da maturidade fisiológica das sementes. Aos 70 DAA, as sementes apresentaram máxima qualidade, na qual o máximo acúmulo de matéria seca das sementes ocorreu na faixa de 756 a 763 GD acumulados após antese, enquanto que a máxima germinação e vigor ocorreram na faixa de 676 a 727 GD acumulados, na ocasião em que a maioria dos frutos se encontrava com 90% do pericarpo avermelhado, com as sementes apresentando 45% de umidade. Também, observou-se que os frutos de melhor qualidade comercial (maior tamanho), se encontram nos racimos inferiores, posição proximal, colhidos no estádio IA. No entanto, sementes de melhor qualidade foram obtidas de frutos da posição distal, após estes terem sido submetidos ao armazenamento, até estarem completamente maduros (A). / This work aimed to study the maturation process of tomato seeds (Lycopersicon esculentum Mill.), Santa Clara s variety, in order to determine and characterize the physiological maturity of seeds and to evaluate the seed quality obtained from fruits harvested at different trusses and maturity stages. An experiment was conducted in the field, using a completely randomized design, in which each plant contained 1 stripe with six trusses. In each truss, fruits were harvested in the proximal (fruits 1, 2 and 3) and distal (fruits 5, 6 and 7) positions, at 30, 40, 50, 60, 70, 80 and 90 days after the anthesis (DAA). For the same period the thermal accumulation, in heat units (GD), was also determined. In each position, fruits were harvested at three maturity stages: IA - fruits with the apex at the beginning of the ripening; CM - Completely ripe fruits; and A - fruits harvested at IA and stored until ripe completely (CM). Fruits were evaluated in relation to: i) development stage (E); ii) weigh; iii) diameter; iv) seed weight per fruit (PSF); v) number of seeds per fruit (NSF). Seeds were extracted from the fruits and then submitted to the following tests and determinations: i) moisture content (GU); ii) dry matter content per seed (MSS); iii) weight of thousand seeds (PMS); iv) germination (GERM); v) first germination test counting (PC); vi) seedling emergence percentage (EMERG); vii) speed emergence index (IVE); (viii) controlled deterioration (DC); ix) electrical conductivity (CE). Complementing the analyses, the thermal accumulation for the fruits development from the anthesis until the harvest was determined. The regression analysis was used to correlate the thermal accumulation to the variables, determining the maturation of fruits and seeds in all harvest points (proximal and distal positions in each one of the six trusses). Following, the variance analysis and Tukey s test were used to study the behavior of the quality of fruits and seeds in relation to harvest and position of fruits at the maturity stages IA, CM and A, as well as their interactions. It was verified that the maturation of seeds occurred when fruits were at the CM maturity stage (with about 90% red or completely ripe, but firm). The maximum germination was verified before the maximum accumulation of dry matter (mass maturity) in the seed, with fruits showing around 90% of reddish skin. The maximum vigor was verified after the maximum germination; which, in general, was observed before mass maturity. The occurrence, in GD, of the maximum dry matter and maximum germination and vigor varied among the positions, being more evident among the trusses of the proximal position, especially for the first and six trusses, the latest and earliest precocious, respectively. In a general way, the maturation of fruits and seeds from the distal position took longer when compared to those from the proximal position. The degrees days (GD) accumulated after anthesis was more sensitive in the determination of the occurrence of physiological maturity of seeds. At 70 DAA seeds showed maximum quality, when seeds maximum accumulation of dry matter occurred from 756 to 763 GD accumulated after anthesis, while the maximum germination and vigor was attained from 676 to 727 GD, with the most of the fruits was at the CM stage and the seeds were 45% of moisture content. It was also observed, that fruits with better commercial quality (larger size) were harvested at inferior trusses, in the proximal position, at the IA stage. However, seeds with better quality were obtained in fruits from the distal position submitted to the storage after harvesting until completely ripenning (A). / Não foi localizado o currículo lattes do autor.
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Qualidade fisiológica de sementes de pimentão (Capsicum annuum L.) associada à poda, cobertura morta e localização do fruto na planta / Quality physiological of bell pepper (Capsicum annuum L.) seeds related to pruning, mulching and fruit position on plant

Sales, Nadja Santos de 16 February 1996 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-10-06T13:11:46Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 11335658 bytes, checksum: 5bf27aa47bdafb5ca6c93b5be81e7359 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-06T13:11:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 11335658 bytes, checksum: 5bf27aa47bdafb5ca6c93b5be81e7359 (MD5) Previous issue date: 1996-02-16 / Com o objetivo de verificar o efeito da poda, cobertura morta e localização do fruto na planta sobre a qualidade fisiológica de sementes de pimentão (Capsicum annuum L.), cultivar Magda, foi conduzido, em condições de campo, um ensaio experimental constando dos fatores poda (sem poda, poda deixando-se dois ramos produtivos e poda deixando-se três ramos produtivos), cobertura morta com bagaço de cana-de-açúcar (ausência e presença) e localização do fruto na planta (do 1º ao 12º nó). Estes tratamentos foram dispostos em delineamento inteiramente casualizado, no esquema fatorial 3 x 2 x 12, com quatro repetições. Inicialmente foram realizadas determinações de diâmetro, comprimento e peso dos frutos, número e peso de sementes por fruto e peso de mil sementes. Em seguida, as sementes foram submetidas a testes de germinação e vigor (primeira contagem do teste de germinação, teste de envelhecimento acelerado e determinação do comprimento de radicula). De posse dos valores médios obtidos, observou-se uma tendência geral de nós subsequentes apresentarem características semelhantes para a maioria das variáveis estudadas. Dessa forma, os dados oram agrupados nos terços inferior (1º ao 4º nó), médio (Sº ao 8º nó) e superior (9ª ao 12º nó). De modo geral, a utilização da cobertura morta levou à redução na qualidade fisiológica de sementes obtidas de frutos localizados no terço inferior da planta. O vigor das sementes apresentou-se mais elevado nos tratamentos sem poda em relação aos podados. Com relação à localização dos frutos na planta, observou-se decréscimo na qualidade fisiológica das sementes do terço inferior ao terço superior da planta. / An experimental study was carried out, under field conditions, with the objective to investigate the effect of pruning, mulching and fruit position on the plant on the physiological quality of bell pepper (Capsicum annuum L.) seeds, Magda cultivar. The following treatments were applied: 1) pruning (no pruning; pruning leaving two productive branches and pruning leaving three productive branches); 2) mulching with and without mulching and 3) fruit position on the plant (from 1rst and 12th node). The experiment was designed in a completely randomized block design, following a factorial 3 x 2 x 12 with four replications. Fruit diameter, length and weight; seed number and weight of 1.000 seeds were initially determined. At a second stage, the seeds were submitted to germination and vigor tests (first estimation of the germination test, accelerated aging test and root length determination). Based on the data obtained, an overall tendency of subsequent nodes to present similar characteristics for most of the variables was observed. Hence, data were grouped as such: bottom part (1rst to 4th node) medium part (5th to 8th node) and upper part (9th to 12th node). The utilization of mulching led to a reduction of the physiological quality of the seeds obtained from fruits located on the bottom part of the plant. Seeds vigor was highest under the treatments “no pruning ”as compared to "pruning”. As to fruit position on the plant, a reduction on the physiological quality of seeds both at the bottom and upper part of the plant was observed.

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