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Efeito das interações peptídeo-peptídeo e peptídeo-membrana nas atividades funcionais de toxinas peptídicas do veneno da vespa social Agelaia pallipes pallipes (Hymenoptera, Vespidae)

Baptista-Saidemberg, Nicoli Barão [UNESP] 23 March 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-03-23Bitstream added on 2014-06-13T18:08:57Z : No. of bitstreams: 1 baptistasaidemberg_nb_me_rcla.pdf: 816123 bytes, checksum: 16394528574d49791508070d14ff8e82 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Os venenos de Vespidae são importantes ferramentas para a defesa dos ninhos. Acidentes com ferroadas de vespas sociais são muito comuns e podem causar diversos sintomas nas vitimas. Esses venenos são ricos em peptídeos policatiônicos, geralmente envolvidos em processos inflamatórios. Os peptídeos mais abundantes encontrados nos venenos das vespas são os peptídeos quimiotáticos e mastoparanos, porém dentre os diversos componentes encontrados no veneno da vespa social A. p. pallipes ainda existem algumas toxinas pouco caracterizadas farmacologicamente. Entre elas encontrou-se os peptídeos Protonectina e Protonectina (1-6) com massas moleculares de 1209 Da (I-L-G-T-I-L-G-L-L-K-G-L-NH2) e 628 Da (I-L-G-T-I-L-NH2), respectivamente. Ao nível molecular, esses peptídeos interagem entre si, resultando na potenciação das atividades funcionais da Protonectina. Considerando-se a importância deste tipo de interação molecular para a indução de processos inflamatórios, os objetivos deste estudo foram: caracterizar a estrutura secundária desses peptídeos individualmente e também a estrutura supramolecular resultante de suas interações, observando os efeitos da mesma sobre as ações de degranulação de mastócitos, quimiotaxia e hemólise. Ambos os peptídeos foram sintetizados manualmente em fase sólida por química Fmoc. A Protonectina é um peptídeo anfifílico, enquanto que a Protonectina (1-6) é muito pequena para assumir estrutura secundária anfifílica. Análises de Dicroísmo Circular, revelaram que na presença de TFE, a Protonectina e Protonectina (1-6) tendem a apresentar estrutura secundária constituída de 36.7% e 17.6% na forma de hélicea, respectivamente. Entretanto, a mistura de ambos peptídeos na proporção de 1:1 resultou em uma estrutura supramolecular que apresentou 48.3% de hélice-a sugerindo, assim, uma possível interação entre esses dois peptídeos...
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Visualização de dados genômicos do fungo Paracoccidioides brasiliensis

Ferreira, Marcos Francisco Ribeiro January 2006 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2006. / Submitted by Alexandre Marinho Pimenta (alexmpsin@hotmail.com) on 2009-11-17T09:33:26Z No. of bitstreams: 1 2006_MarcosFranciscoRibeiroFerreira.pdf: 9587389 bytes, checksum: c5b7bbce352a72fe039d6258cccc3edc (MD5) / Approved for entry into archive by Carolina Campos(carolinacamposmaia@gmail.com) on 2009-12-07T17:30:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_MarcosFranciscoRibeiroFerreira.pdf: 9587389 bytes, checksum: c5b7bbce352a72fe039d6258cccc3edc (MD5) / Made available in DSpace on 2009-12-07T17:30:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_MarcosFranciscoRibeiroFerreira.pdf: 9587389 bytes, checksum: c5b7bbce352a72fe039d6258cccc3edc (MD5) Previous issue date: 2006 / Os projetos de seqüenciamento genômico desenvolvidos em todo o mundo geram uma enorme crescente quantidade de informações. Estas informações estão normalmente descritas nos formatos texto, HTML (Linguagem de Marcação de Hipertexto) ou XML (Linguagem de Marcação Extensível) e seu volume total pode chegar a centenas ou milhares de páginas. Assim, o armazenamento e análise destas informações requerem o uso de ferramentas e métodos computacionais que facilitem e apóiem as pesquisas biológicas. Além das informações de ESTs (Etiquetas de Seqüências Expressas) ou DNAs genômicos geradas pelos projetos de seqüenciamento, outros dados como comparações genômicas e genes diferencialmente expressos, obtidos por comparações usando BLAST (Ferramenta para Busca de Alinhamentos) e experimentos de macroarranjo de cDNA também são fornecidos em saídas textuais e exigem uma análise biológica. Estes conjuntos de dados são melhor analisados pelos biólogos quando representados graficamente ou através de tabelas. Neste contexto, este trabalho propõe dois métodos para visualização de dados gerados pelos projetos de seqüenciamento genoma realizados pelo Laboratório de Biologia Molecular da Universidade de Brasília - UnB. Comparações obtidas pelo BLAST entre as ESTs do fungo Paracoccidioides brasiliensis com os DNAs genômicos de dois outros fungos próximos filogeneticamente, o Aspergillus fumigatus e o Aspergillus nidulans, utilizando a ferramenta para visualização de dados genômicos GBrowse, permitirão inferir a organização dos genes do P. brasiliensis dentro dos seus cromossomos. Particularmente, a partir do modelo A. fumigatus, sintenias entre os genes do P. brasiliensis poderão ser identificadas. A partir destas inferências, experimentos biológicos poderão ser elaborados para confirmação da organização dos genes do P. brasiliensis. Por outro lado, visando contribuir para a análise do conjunto de genes diferenciais indicados por experimentos de macroarranjo de cDNA, implementamos a ferramenta PathwayView para localização destes genes nos mapas de vias metabólicas do KEGG (Enciclopédia de Genes e Genomas da Universidade de Kioto). A PathwayView contribuirá para processar um grande volume de dados, facilitando a localização das vias metabólicas e das enzimas diferenciais dentro destas vias. No caso específico do P. brasiliensis, esta ferramenta permitirá aprofundar, por exemplo, o conhecimento de como ocorre a adaptação biológica deste patógeno nos seres humanos, o que poderá indicar direções novas para o desenvolvimento de drogas ou fungicidas. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Genome sequencing projects developed worldwide produce an enormous and growing volume of information. These informations are usually described in text, HTML (Hypertext Markup Language) or XML (Extensible Markup Language) format, and they can be stored on hundreds or even thousands of pages. The storage and analysis of these information require computational tools and methods to facilitate and support the biological research. Besides the EST (Expressed Sequence Tags) information or genomic DNAs generated from the sequencing projects, other data such as genomic comparisons or differential gene expression, obtained from BLAST (Basic Alignment Search Tool) and cDNA macroarray experiments are available on text format which requires biological analysis. The work of the biologists can be supported if the available data is presented using graphics or tables. So, this work proposes two methods for visualizing data generated by the sequencing genome projects developed on the molecular biology of the University of Brasilia. Comparisons obtained by BLAST among the Paracoccidioides brasiliensis ESTs and the genomics DNAs of two others phylogenetic related fungi, Aspergillus fumigatus and Aspergillus nidulans, using a genomic visualization tool - GBrowse, allow to infer the organization of the P. brasiliensis genes inside its chromosomes. Particularly, from the model A. fumigatus, synteny among the P. brasiliensis genes could be identified. The inferences obtained by these comparisons can greatly help to develop biological experiments to confirm the organization of the P. brasiliensis genes. Besides, to contribute for the analysis of the set of differentially expressed genes indicated by cDNA macroarray experiments, a tool named PathwayView was built, to locate the differential genes into the KEGG metabolic pathways maps. PathwayView contribute to process a great volume of data, making easier to find the pathways and the enzymes inside these pathways. In the particular case of the P. brasiliensis fungus, for example, this tool could be used to increase the knowledge of how biological adaptation of this pathogen occurs in humans, which in turn, could indicate new directions for the development of new drugs or fungicides.
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Avaliação de marcadores aplicáveis à diversidade genética de Jatropha curcas e espécies relacionadas (Euphorbiaceae)

Felix, Ana Maria Souza 31 January 2013 (has links)
Submitted by Luiz Felipe Barbosa (luiz.fbabreu2@ufpe.br) on 2015-04-17T12:48:21Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Ana Maria Felix.pdf: 1967506 bytes, checksum: 7df7f0db723450048879e801b4b93d80 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-17T12:48:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Ana Maria Felix.pdf: 1967506 bytes, checksum: 7df7f0db723450048879e801b4b93d80 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / FACEPE / Entre as plantas não comestíveis o pinhão-manso (Jatropha curcas L.) se apresenta como expressiva opção para a obtenção de óleo vegetal, muito demandado para finalidades industriais ou ainda como biocombustível. Apesar da importância de bancos genéticos eficientemente caracterizados para o estabelecimento de programas de melhoramento, os recursos disponíveis para o pinhão-manso ainda se encontram escassamente caracterizados. No presente trabalho foram testados e desenvolvidos marcadores moleculares para esta cultura, aplicados experimentalmente a acessos de pinhão-manso em comparação com espécies relacionadas. Os marcadores testados incluíram sete primers ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) e treze iniciadores DAF (DNA Amplification Fingerprinting), além do sequenciamento de parte da região ITS-1 (Internal Transcribed Spacer 1). Após avaliação de uma subamostra com seis acessos de três espécies de Jatropha foram selecionados marcadores para aplicação a um número maior de acesso, sendo obtidos resultados para 12 deles. Os marcadores selecionados envolveram dois ISSR (UBC 808, UBC 809; polimorfismo médio de 78%)e dois DAF (OPL07, OPL11, com média de 44% polimórficos). Por sua vez, as regiões parcialmente sequenciadas de ITS-1 revelaram níveis de polimorfismo escassos entre 10 acessos de pinhão-manso, além de moderado polimorfismo interespecífico considerando outras espécies de Jatropha, indicando que tais marcadores são úteis apenas para comparações interespecíficas ou supragenéricas. Os marcadores desenvolvidos certamente serão úteis para análises de J. curcas envolvendo uma maior amostragem, podendo colaborar para a seleção de parentais contrastantes para análises de mapeamento genético, entre outras aplicações.
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CARACTERIZAÇÃO de Mutações da Osteogênese imperfeita em Pacientes do Espírito Santo: Estudo Dos genes Ifitm5, Col1a1 e Col1a2

SILVA, D. A. 27 February 2018 (has links)
Made available in DSpace on 2018-08-01T21:35:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_12057_Dissertação_Dalila Avila Silva.pdf: 1086948 bytes, checksum: 30b541bd3051003faada33f9146bf6e5 (MD5) Previous issue date: 2018-02-27 / A Osteogênese Imperfeita (OI) é uma doença que ocorre devido à desordem generalizada do tecido conjuntivo causando principalmente fragilidade óssea. Essa desordem, na maioria das vezes, é causada por mutações nos genes produtores das cadeias do colágeno tipo I, COL1A1 ou COL1A2, embora mutações em novos genes envolvidos na via do metabolismo ósseo têm sido constantemente descobertas. Atualmente, existem 17 genes relacionados com esta doença. Um deles é o gene IFITM5, ainda pouco caracterizado na maioria das populações. Por possuir vários genes causadores de OI, o Next Generation Sequencing (NGS), uma técnica de sequenciamento em larga escala, tem sido amplamente utilizada. Contudo, as mutações identificadas por NGS precisam ser validadas para dar confiabilidade aos resultados. Assim, este trabalhou visou identificar mutações no gene IFITM5 e validar mutações identificadas por NGS nos genes COL1A1 e COL1A2 para caracterizar o padrão de mutações nestes genes em pacientes do Espírito Santo. Este estudo contou com uma amostra inicial de 31 pacientes que foram previamente analisados para outros genes. Desta amostra, 8 indivíduos que apresentaram resultados moleculares inconclusivos foram estudados para o gene IFITM5. Foi detectada a presença da mutação c.-14C>T em um paciente. Esta mutação ocorre na região 5-UTR do gene e é recorrente em várias populações do mundo. A validação de mutações foi realizada em 16 indivíduos que apresentaram alterações genéticas nos genes COL1A1 ou COL1A2 detectadas por NGS. Apenas uma das sequências identificadas por NGS não foi validada. Este estudo confirmou que mutações no gene COL1A1 e COL1A2 são encontradas, em aproximadamente 75% dos pacientes, enquanto que no gene IFITM5 são encontradas mutações em, aproximadamente, 3% dos pacientes com OI do Espírito Santo. Esses resultados poderão auxiliar no desenvolvimento de estratégias de diagnóstico molecular mais eficientes para esta doença.
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Sequenciamento de plantas multiproposito com tempos de preparação dependentes da sequencia utilizando a representação STN

Rodrigues, Luiz Carlos de Abreu 21 November 1996 (has links)
Orientador: Lluis Gimeno Latre / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica e de Computação / Made available in DSpace on 2018-07-21T20:46:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodrigues_LuizCarlosdeAbreu_M.pdf: 6827263 bytes, checksum: d519ff6cfea29829b5a8873ff900583a (MD5) Previous issue date: 1996 / Resumo: Com a crescente necessidade de reduzir custos e prazos, as indústrias têm procurado aperfeiçoar os seus métodos de produção, bem como o seu planejamento da produção. Diante da necessidade de gerenciar melhor a produção, aproveitando melhor a capacidade instalada das indústrias, reduzindo os custos com estoque de matérias primas e com capital de giro, vários autores têm apresentado trabalhos relacionados ao planejamento e seqüenciamento da produção. Dentre estes trabalhos há o de Egli e Rippin (1986) que apresenta um problema, relacionado à indústria química, que foi solucionado pelos autores através de um método heuristico. Este problema foi abordado recentemente em uma dissertação de mestrado (Medeiros, 1995) na Faculdade de Engenharia Química da Unicamp, e é novamente abordado nesta dissertação de mestrado. Kondili et aI.(1993) apresentaram a Representação Estado-Tarefa (STN), aperfeiçoada por Shah et al.(1993), que permite tratar simultaneamente o planejamento e seqüenciamento da produção de plantas multipropósito, e que toma possível tratar muitas das situações complexas encontradas na prática nas indústrias químicas. Esta formulação baseia-se na representação discreta do tempo, no qual o horizonte de planejamento é dividido em um número de intervalos de igual duração, resultando em um problema linear inteiro misto (MILP). A principal deficiência desta formulação está na dimensão do problema MILP resultante, especialmente se houver a necessidade de alocação de operações de preparação com tempos de preparação dependentes da seqüência. Neste caso, o problema normalmente toma-se intratável, já que o número de equações geradas é proporcional ao quadrado do horizonte de planejamento. O objetivo desta dissertação é o de apresentar uma nova formulação para as operações de preparação dependentes da seqüência, que permita resolver o problema proposto por Egli e Rippin (1986), utilizando a representação Estado-Tarefa (STN). Com isto é reapresentada a formulação STN para que, posteriormente, seja apresentada uma nova formulação para tratar a preparação dependente da seqüência. Esta nova formulação é, então, utilizada para resolver o problema proposto por Egli e Rippin (1986), solucionado anteriormente apenas por métodos heurísticos / Abstract: Not informed. / Mestrado / Engenharia de Computação / Mestre em Engenharia Elétrica
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Sequenciamento e análise do genoma cloroplastidial de cana-de-açúcar (Saccharum officinarum L.) / not available

Tercilio Calsa Junior 05 December 2001 (has links)
Os cloroplastos são organelas exclusivas de plantas e algas fotossintetizantes, e desempenham funções essenciais na fisiologia e metabolismo vegetal, principalmente a fotossíntese e outras rotas biossintéticas. Além do núcleo e das mitocôndrias, os plastídios possuem seu próprio genoma (plastoma), envolvido na coordenação destes três distintos mas interdependentes sistemas genéticos das células vegetais. O DNA cloroplastidial existe como moléculas circulares fechadas de aproximadamente 150 kb (±30), geralmente apresentando sequências repetidas invertidas, separando duas regiões de cópia única. Através da construção de bibliotecas shot-gun a partir do DNA cloroplastidial e do sequenciamento automático de 6266 clones, o plastoma de cana-de-açúcar (híbrido SP 80-3280) foi completamente sequenciado e as regiões codificadoras anotadas por homologia a outros sistemas vegetais. Por análises comparativas entre o plastoma de cana-de-açúcar e os de outras espécies, observou-se que todos os grupos funcionais de genes cloroplastidiais de milho foram localizados no plastoma de cana-de-açúcar, como também ycf's deste plastoma e de outras espécies, embora estas sequências não tenham função conhecida. Verificou-se, ainda, maior identidade entre os plastomas de cana-de-açúcar e milho do que entre cana- de-açúcar e arroz com base na organização estrutural e na regulação da expressão gênica (edição de mRNA). Os resultados sugerem uma evolução comum entre os plastomas das gramíneas C4, gerando novos elementos para a pesquisa deste tipo de fotossíntese e metabolismo dos plastídeos, assim como para a tecnologia de transformação de cloroplastos de cana-de-açúcar. / not available
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Clonagem, identificação e sequenciamento de um gene de resistência a nistatina de Saccharomyces cerevisiae / not available

Juan Lucas Argüeso Gomes de Almeida 11 August 1997 (has links)
O híbrido de Saccharomyces cerevisiae M606 é uma levedura de aplicação industrial que alia alta capacidade de produção de etanol a resistência ao antibiótico poliênico nistatina. Com o objetivo de isolar o gene que confere a esse organismo a capacidade de se multiplicar na presença dessa substância, tóxica a leveduras e à maioria dos fungos, foi construída uma biblioteca genômica com o DNA de uma linhagem segregante de M606, M606.1c. Um plasmídio epissomal de levedura contendo um fragmento genômico da biblioteca de 5900 pares de bases foi capaz de conferir resistência a linhagens sensíveis quando introduzido por transformação. A determinação da sequência de nucleotídeos desse fragmento de DNA, designado NYS1, permitiu a sua localização no braço longo do cromossomo XIV de Saccharomyces cerevisiae. A subclonagem do fragmento NYS1 revelou que o gene responsável pela resistência é o quadro de leitura aberta (ORF) conhecido como YNL231C, que passa a ser denominado NYS, gene de resistência a nistatina de Saccharomyces cerevisiae. O gene NYS foi subclonado em um fragmento de 1337 pares de bases, que foi nomeado NYS3. Esse plamídio foi utilizado para transformar linhagens sensíveis, conferindo-lhes resistência. Sua sequência de nucleotídeos foi integralmente determinada e comparada com o Banco de Dados de Genoma de Saccharomyces cerevisiae para a identificação das diferenças ao nível do DNA entre os mutantes NYS e o tipo selvagem sensível a nistatina. Não foram identificadas diferenças de sequência entre o tipo selvagem e o gene clonado. Esse dado sugere que o gene clonado não é o mesmo que é responsável pela resistência de M606.1c. M606.1c apresentou o derivado de ergosterol cholesta-5,7,22,24-tetraenol, que parece estar ligado à resistência. As leveduras transformadas com o gene NYS não apresentaram a formação desse composto, sendo este mais um dado que sugere a clonagem de um segundo gene de resistência. A provável explicação para a resistência conferida por um gene selvagem seria o alto número de cópias em que ele se apresenta nos transformantes. O desequilíbrio na dosagem do produto gênico de NYS, possivelmente teria tido como efeito alguma alteração na membrana plasmática que levou à resistência a nistatina / not available
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Identificação Molecular da diversidade microbiana em reator UASb de estação de tratamento de esgoto

LUCENA, Rodrigo Mendonça de 31 January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:02:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3678_1.pdf: 1377857 bytes, checksum: 7d15f520b2b07e3bad5591816c1345df (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A água, depois de utilizada para o abastecimento público e nos processos produtivos, retorna com sua composição alterada, constituindo o esgoto. Os esgotos quando lançados aos corpos d água sem tratamento adequado podem causar graves problemas de saúde pública e ambientais como a eutrofização. Reatores biológicos anaeróbios tipo UASB (Reator Anaeróbio de Fluxo Ascendente e Manta de Lodo) são uma alternativa interessante para o tratamento dos esgotos domésticos, combinando baixos custos de implantação e simplicidade operacional. No entanto, o sucesso do processo depende do tipo, adaptação e atividade da população microbiana presente em seu interior. Diante disto, este trabalho vem contribuir para o melhor entendimento do consorcio microbiano em reator tipo UASB para tratamento de esgoto, realizando a identificação dos microrganismos pertencentes aos domínios Bactéria e Archaea por meio da análise das seqüências dos genes rRNA 16S. Neste sentido, foram coletadas amostras de lodo dos cinco níveis do reator UASB localizado na ETE Mangueira, Recife/PE, para posterior extração de DNA. Em seguida foi realizada a clonagem e sequenciamento dos produtos de PCR provenientes dos genes rRNA 16S heterogêneos. A comparação das seqüências com os bancos de dados de rRNA 16S, NCBI e RDP, indicaram a ocorrência de representantes dos filos Actinobacteria (42%), Proteobacteria (13%), Chloroflexi (9%), Firmicutes (6%) e Bacteroidetes (4%) para o domínio Bacteria, e representantes das ordens Methanomicrobiales (43%), Methanobacteriales (17%) e Methanosarcinales (12%) para Archaea, distribuídos distintamente ao longo dos cinco níveis do reator. Do total das seqüências, 26% das de Bacteria e 17% das de Archaea não apresentaram similaridade com seqüências já conhecidas, levando a crer que possivelmente sejam pertencentes a microrganismos ainda não descritos
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Analise dos tempos de estabelecimento e ordem de manufatura no sequenciamento de tarefas em processos batelada

Santos, Edilson de Jesus 24 March 1994 (has links)
Orientador: João Alexandre Ferreira Rocha Pereira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-19T19:51:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos_EdilsondeJesus_M.pdf: 5145061 bytes, checksum: add098d00d33a90d26ff82ad72a8f9b2 (MD5) Previous issue date: 1994 / Resumo: A programação de produção deve ser vista como um conjunto de funções para a qual convergem informações que serão transformadas convenientemente em instruções para os diversos departamentos de uma indústria. A interação entre o setor de programação e os setores produtivos deve ser bastante dinâmica, intensificando o fluxo de informações dentro da organização e fazendo com que os setores de produção desenvolvam com mais eficiência os objetivos pré-estabelecidos. O objetivo de qualquer empresa é fornecer aos seus clientes o melhor produto possível, e com menor custo. Para tanto, faz-se necessário adotar uma política de conduta organizacional para obtenção das metas estabelecidas. Neste ponto, o Planejamento e Programação de Produção deve determinar "o que fazer", "onde fazer", como fazer" e "quando fazer", assim que os recursos necessários e os projetos dos produtos a serem manufaturados estejam definidos. A programação de produção é o instrumento que possibilita a conduta racional, e não aleatória, dos procedimentos ou operações que vão conduzir a matéria prima ao produto final. É inegável que sem a coordenação das tarefas e sem a busca de um roteiro de fabricação ótimo, que venha minimizar custos e aumento da produtividade (minimização de tempo de execução do plano de produção) é praticamente impossível alcançar as metas estabelecidas. A proposta da presente tese enfoca o escalonamento de produção, mais precisamente o seqüenciamento de tarefas, dentro dos setores produtivos em plantas batelada multiproduto. Dado um conjunto de N tarefas e os diversos fatores de processamento que influenciam na execução das operações, o setor responsável pela programação de produção deve fornecer aos setores produtivos qual o melhor roteiro de manufatura dos produtos que venha a minimizar uma determinada função objetivo conveniente com as metas determinadas pela organização. Em nossa abordagem para a solução dos problemas envolvendo o seqüenciamento de tarefas utilizaremos a metodologia de busca controlada em árvore, mais conhecida como metodologia "Branch and Bound"("BAB"), tendo em vista a sua eficiência na busca de um roteiro ótimo, principalmente quando o valor do menor limitante da função objetivo tomada como critério para o seqüenciamento das tarefas é calculado com garantia / Abstract: Not informed. / Mestrado / Mestre em Engenharia Química
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Relações na tribo Bocageeae Endlicher baseadas em fitoquímica e sequências de DNA / Relationships in tribe Bocageeae Endlicher based on phytochemistry and DNA sequences

Cintia Rocini 23 March 2009 (has links)
Existem vários sistemas de classificação para Annonaceae. No entanto, estudos recentes sugerem que esse grande número de classificações pode ser reduzido a um. O sistema elaborado por Fries (1959), por exemplo, apresenta vários grupos apoiados por revisões modernas. Um deles é o Grupo Trigynaea, sinonimizado como tribo Bocageeae Endlicher (Johnson e Murray, 1995). A análise cladística com dados morfológicos sugeriu uma hipótese sobre as relações intergenéricas na tribo (Johnson e Murray, 1995). A confiabilidade dessas relações foi verificada com o uso de dados fitoquímicos e sequências de DNA. Em ((Bocagea, Hornschuchia) (Trigynaea)), o clado (Bocagea, Hornschuchia, Trigynaea) foi detectado na análise Bayesiana do RPB2 e apoiado pela presença de apigenia (exceto em Bocagea) e síntese de quercetina via dihidrocampferol. No clado (((Cardiopetalum, Cymbopetalum) (Porcelia)) (Froesiodendron)) a relação (Cardiopetalum, Cymbopetalum, Porcelia) foi detectado nas análises de Máxima Parcimônia das regiões coxI, RPB2 e trnK-matK e nas análises Bayesianas das regiões coxI, trnL-trnL-F e trnK-matK. Esse clado foi apoiado pela presença de luteolina (exceto em Cardiopetalum e Porcelia) e síntese de quercetina pelas vias di-hidrocampferol e eriodictiol (exceto em Cymbopetalum que produziu luteolina). A presença, até o momento exclusiva em Annonaceae, de alcaloides pirrolizidínicos em Bocageeae e Annona foi congruente com as informações sobre a estreita relação desses grupos. A distribuição dos componentes das ceras delimitou grupos químicos em Bocageeae que não foram congruentes com as relações estabelecidas com os dados morfológicos. / There are several classification systems for Annonaceae. However, recent studies have suggested this high number of classifications can be reduced to one. The system of Fries (1959), for example, presents many groups supported by modern revisions. One of them is Trigynaea-Gruppe, synonym of tribe Bocageeae Endlicher (Johnson and Murray, 1995). The morphological cladistic analysis suggested one hypothesis of intergeneric relationships among the Bocageeae (Johnson and Murray, 1995). The consistency of these relationships was evaluated by the use of phytochemical data and DNA sequences. Within ((Bocagea, Hornschuchia) (Trigynaea)), the (Bocagea, Hornschuchia, Trigynaea) was detected in the Bayesian analysis of RPB2 and supported by presence of apigenin (except in Bocagea) and synthesis of quercetin via dihydrokaempferol. In the clade (((Cardiopetalum, Cymbopetalum) (Porcelia)) (Froesiodendron)), the relationship (Cardiopetalum, Cymbopetalum, Porcelia) was detected in the Maximum Parsimony analyses of coxI, RPB2 and trnK-matK regions, and Bayesian analyses of coxI, trnL-trnL-F e trnK-matK regions. This clade was supported by occurrence of luteolin (except in Cardiopetalum and Porcelia) and synthesis of quercetin via both dihydrokaempferol and eriodictyol (except in Cymbopetalum that produced luteolin). The presence of pyrrolizidine alkaloids in Bocageeae and Annona, unique in Annonaceae until now, was in agreement with information about the closest relationship of these two groups. The distribution of cuticular waxes components circumscribed chemical groups in Bocageeae that were not congruent with the relationships based in morphological data

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