Made available in DSpace on 2016-05-17T16:51:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-22. Added 1 bitstream(s) on 2016-05-17T16:55:01Z : No. of bitstreams: 1 000864107.pdf: 1967063 bytes, checksum: b6a04d735d1964d6dfeb7d1495b12ed3 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os Problemas de Corte de Estoque (PCE) são frequentemente encontrados em indústrias moveleiras, onde deseja-se cortar objetos maiores (placas de madeira) em objetos menores (itens), cada qual com uma quantidade pré-estabelecida (demanda), a fim de que seja possível a construção de diversos produtos finais demandados. O foco deste trabalho é a solução dos PCE bidimensionais, em que duas dimensões são relevantes durante o processo de corte, utilizando diferentes métodos para elaborar maneiras distintas de se cortar um único objeto em estoque (elaboração de padrões de corte). Devido às diferentes prioridades que se tem dentro de uma indústria moveleira, pode ser que seja necessário cortar placas de madeira mais rapidamente para que os produtos sejam fabricados com maior agilidade. No entanto, esta rapidez na produção pode gerar maior perda de matéria-prima, ocasionando maiores gastos no processo produtivo. Para possibilitar a solução computacional desse problema foi desenvolvido um código computacional e alguns resultados são apresentados. É realizado um estudo comparativo entre a solução encontrada na prática de uma fábrica real de móveis com a solução encontrada neste trabalho. Os dados utilizados foram extraídos de uma empresa localizada na cidade de Jaci, no interior do estado de São Paulo, considerada de médio porte e que atende o mercado moveleiro a nível nacional / The Cutting Stock Problems (CSP) are generally found in furniture industry, where is need to cut larger objects (wooden boards) into smaller objects (items), each one with a specific amount (demand), in order to produce several final products. The focus of this work is to solve the two-dimensional CSP, where two dimensions are relevant during the cutting process, using different methods to create different ways to cut a single object in stock (development of cutting patterns). Due to the different priorities that have in a furniture industry, sometimes could be necessary to cut wooden boards more quickly to make products as fast as possible. However, this agility in production process may generate greater loss of raw materials, making the manufacturing process more expensive. In order to present a computational solution to the problem, was developed a computational code and some computational results are presented. A comparative study is carried out with a solution found in the practice of real furniture factory and a solution found at this work. The data was obtained from a company located in Jaci, in the state of Sao Paulo, considered medium-sized and deal with furniture market at national level

Orientador: Silvio Alexandre de Araujo / Banca: Maria do Socorro Nogueira Rangel / Banca: Adriana Cristina Cherri / Resumo: Os Problemas de Corte de Estoque (PCE) são frequentemente encontrados em indústrias moveleiras, onde deseja-se cortar objetos maiores (placas de madeira) em objetos menores (itens), cada qual com uma quantidade pré-estabelecida (demanda), a fim de que seja possível a construção de diversos produtos finais demandados. O foco deste trabalho é a solução dos PCE bidimensionais, em que duas dimensões são relevantes durante o processo de corte, utilizando diferentes métodos para elaborar maneiras distintas de se cortar um único objeto em estoque (elaboração de padrões de corte). Devido às diferentes prioridades que se tem dentro de uma indústria moveleira, pode ser que seja necessário cortar placas de madeira mais rapidamente para que os produtos sejam fabricados com maior agilidade. No entanto, esta rapidez na produção pode gerar maior perda de matéria-prima, ocasionando maiores gastos no processo produtivo. Para possibilitar a solução computacional desse problema foi desenvolvido um código computacional e alguns resultados são apresentados. É realizado um estudo comparativo entre a solução encontrada na prática de uma fábrica real de móveis com a solução encontrada neste trabalho. Os dados utilizados foram extraídos de uma empresa localizada na cidade de Jaci, no interior do estado de São Paulo, considerada de médio porte e que atende o mercado moveleiro a nível nacional / Abstract: The Cutting Stock Problems (CSP) are generally found in furniture industry, where is need to cut larger objects (wooden boards) into smaller objects (items), each one with a specific amount (demand), in order to produce several final products. The focus of this work is to solve the two-dimensional CSP, where two dimensions are relevant during the cutting process, using different methods to create different ways to cut a single object in stock (development of cutting patterns). Due to the different priorities that have in a furniture industry, sometimes could be necessary to cut wooden boards more quickly to make products as fast as possible. However, this agility in production process may generate greater loss of raw materials, making the manufacturing process more expensive. In order to present a computational solution to the problem, was developed a computational code and some computational results are presented. A comparative study is carried out with a solution found in the practice of real furniture factory and a solution found at this work. The data was obtained from a company located in Jaci, in the state of Sao Paulo, considered medium-sized and deal with furniture market at national level / Mestre

Orientador: Rubén Augusto Romero Lázaro / Resumo: Neste trabalho, consideram-se a análise teórica e a implementação computacional dos algoritmos Primal Simplex Canalizado (PSC) e Dual Simplex Canalizado (DSC) especializados. Esses algoritmos foram incorporados em um algoritmo Branch and Bound (B&B) de modo a resolver o problema de Planejamento da Expansão de Sistemas de Transmissão (PEST). Neste caso, o problema PEST foi modelado usando os chamados modelo de Transportes e modelo Linear Disjuntivo (LD), o que produz um problema de Programação Linear Inteiro Misto (PLIM). O algoritmo PSC é utilizado na resolução do problema de Programação Linear (PL) inicial após desconsiderar a restrição de integralidade do problema PLIM original. Juntamente com o algoritmo PSC, foi implementada uma estratégia para reduzir o número de variáveis artificiais adicionadas ao PL, consequentemente reduzindo o número de iterações do algoritmo PSC. O algoritmo DSC é utilizado na reotimização eficiente dos subproblemas gerados pelo algoritmo B&B, através do quadro ótimo do PL inicial, excluindo, assim, a necessidade da resolução completa de cada subproblema e, consequentemente, reduzindo o consumo de processamento e memória. Nesta pesquisa, é apresentada uma nova proposta de otimização, e, consequentemente, a implementação computacional usando a linguagem de programação FORTRAN que opera independentemente de qualquer solver. / Doutor

Orientador: Sônia Cristina Poltroniere Silva / Banca: Vanessa Rolnik Artioli / Banca: Fabiano Borges da Silva / Resumo: A resolução de problemas está sempre presente na vida das pessoas. Na área de exatas, a modelagem matemática é uma ferramenta eficaz na tomada de decisão, pois permite uma melhor visualização do problema. Essa dissertação, num primeiro momento, aborda a teoria básica de Otimização Linear e o método simplex e, posteriormente, sua aplicação na modelagem e resolução de problemas matemáticos voltados ao Ensino Médio. É proposto um material sobre este tema, direcionado especialmente aos professores da Educação Básica que lecionam na última série do Ensino Médio. Elencam-se alguns problemas que podem ser trabalhadas com os alunos em sala de aula ou em atividades extracurriculares. Alguns desses problemas são resolvidos graficamente e, para os que possuem maiores dimensões, é utilizada uma planilha de cálculo. Foi aplicado, em forma de oficina, um dos problemas propostos nesse texto em uma Escola Técnica da cidade de Bauru/SP. A descrição e a análise dessa aplicação são apresentadas e discutidas / Abstract: Solving problems is something present in people's lives. In the area of exact, the mathematical modeling is an effective tool in the decision making, because it allows a better visualization of the problem. This dissertation, in a first moment, approaches the theory of Linear Optimization and the simplex method and, later, its application in the modeling and resolution of Mathematical problems directed to High School. It is proposed a material on this subject, directed especially to the teachers of Basic Education who teach in the last grade of High School. We list some problems that can be worked out with students in the classroom or in extracurricular activities. Some of these problems are solved graphically and, for those of larger dimensions, a spreadsheet is used. One of the problems proposed in this text was applied as a workshop in a Technical School in the city of Bauru / SP. The description and analysis of this application are presented and discussed / Mestre

Herpes simplex virus type 1 (HSV-1) and herpes simplex virus type 2 (HSV-2) are closely related viruses that establish lifelong infection in their hosts and can periodically reactivate to cause painful lesions. Approximately 50 million Americans are infected with HSV-2, the primary cause of genital ulcerative disease. In addition to the pain of the physical symptoms, genital herpes is highly stigmatized and can cause significant reductions in quality of life. HSV-2 has been demonstrated to have a synergistic relationship with HIV, where it enhances the transmissibility, susceptibility and severity of disease. In addition, potentially life-threatening neonatal herpes occurs in about 1 in 10,000 live births. While there are known means of reducing the risk of transmission, the overwhelming majority of infected persons are unaware of their status, and they remain the driving force behind new infections. Virological tests, such as PCR, are ill suited for asymptomatic infections since the detectable virus is only shed on <10% of days. Currently available type-specific serological tests based on glycoprotein G are prone to false-positive results, lack the sensitivity to detect new infections and may be affected by cross-reactivity between HSV-1 and HSV-2. Due to the known limitations of HSV serological testing, it is not recommended for the general population or pregnant women. In the first half of my thesis, I evaluate a new flow-cytometry-based method that measures serum antibody-binding to virus-infected cells (ABVIC). We obtained a panel of human control sera from Westover Heights Clinic (WHC) and determined if the ABVIC could measure HSV-specific antibody binding to test-cells. We found that the assay was sensitive, semi-quantitative, and could be made type-specific with the addition of a pre-adsorption step. The ABVIC offers an advantage over the standard of care single-antigen tests as the result measuring antibody binding to all viral proteins fixed in their native conformation. In the second half of my thesis, I used the ABVIC assay test n=34 blinded test-sera. Of these, n=17 had previously tested as “indeterminate” by bother Herpeselect ELISA as well as Western Blot. Following unblinding, we found that the ABVIC properly identified all n=17 patient sera of an unambiguous serostatus. Of the indeterminate sera, all were found to be seronegative for HSV-2. Based on these surprising results, we requested an additional n=11 indeterminate samples, which were also found to be HSV-2 seronegative. Most of the "Indeterminate" serum samples exhibited high background, which produced weak reactivity in HerpeSelect and Western blot assays, but did not confound the internally controlled ABVIC test.

Submitted by JEFERSON BACK VANDERLINDE null (jefersonbv@yahoo.com.br) on 2017-11-01T16:38:25Z No. of bitstreams: 1 jeferson_tese_final_20171101.pdf: 4860852 bytes, checksum: 2f99c37969be3815f82b1b4455a40230 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-11-13T15:38:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 vanderlinde_jb_dr_ilha.pdf: 4860852 bytes, checksum: 2f99c37969be3815f82b1b4455a40230 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-13T15:38:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 vanderlinde_jb_dr_ilha.pdf: 4860852 bytes, checksum: 2f99c37969be3815f82b1b4455a40230 (MD5) Previous issue date: 2017-09-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Neste trabalho, consideram-se a análise teórica e a implementação computacional dos algoritmos Primal Simplex Canalizado (PSC) e Dual Simplex Canalizado (DSC) especializados. Esses algoritmos foram incorporados em um algoritmo Branch and Bound (B&B) de modo a resolver o problema de Planejamento da Expansão de Sistemas de Transmissão (PEST). Neste caso, o problema PEST foi modelado usando os chamados modelo de Transportes e modelo Linear Disjuntivo (LD), o que produz um problema de Programação Linear Inteiro Misto (PLIM). O algoritmo PSC é utilizado na resolução do problema de Programação Linear (PL) inicial após desconsiderar a restrição de integralidade do problema PLIM original. Juntamente com o algoritmo PSC, foi implementada uma estratégia para reduzir o número de variáveis artificiais adicionadas ao PL, consequentemente reduzindo o número de iterações do algoritmo PSC. O algoritmo DSC é utilizado na reotimização eficiente dos subproblemas gerados pelo algoritmo B&B, através do quadro ótimo do PL inicial, excluindo, assim, a necessidade da resolução completa de cada subproblema e, consequentemente, reduzindo o consumo de processamento e memória. Nesta pesquisa, é apresentada uma nova proposta de otimização, e, consequentemente, a implementação computacional usando a linguagem de programação FORTRAN que opera independentemente de qualquer solver. / In this research, the theoretical analysis and computational implementation of the specialized dual simplex algorithm (DSA) and primal simplex algorithm (PSA) for bounded variables is considered. These algorithms have been incorporated in a Branch and Bound (B&B) algorithm to solve the Transmission Network Expansion Planning (TNEP) problem. In this case, the TNEP problem is modeled using transportation model and linear disjunctive model (DM), which produces a mixed-integer linear programming (MILP) problem. After relaxing the integrality of investment variables of the original MILP problem, the PSA is used to solve the initial linear programming (LP) problem. Also, it has been implemented a strategy in PSA to reduce the number of artificial variables which are added into the LP problem, and consequently reduces the number of iterations of PSA. Through optimal solution of the initial LP, the DSA is used in efficient reoptimization of subproblems, resulting from the B&B algorithm, thus excludes the need for complete resolution of each subproblems, which results reducing the CPU time and memory consumption. This research presents the implementation of the proposed approach using the FORTRAN programming language which operates independently and does not use any commercial solver.

abstract: In order to analyze data from an instrument administered at multiple time points it is a common practice to form composites of the items at each wave and to fit a longitudinal model to the composites. The advantage of using composites of items is that smaller sample sizes are required in contrast to second order models that include the measurement and the structural relationships among the variables. However, the use of composites assumes that longitudinal measurement invariance holds; that is, it is assumed that that the relationships among the items and the latent variables remain constant over time. Previous studies conducted on latent growth models (LGM) have shown that when longitudinal metric invariance is violated, the parameter estimates are biased and that mistaken conclusions about growth can be made. The purpose of the current study was to examine the impact of non-invariant loadings and non-invariant intercepts on two longitudinal models: the LGM and the autoregressive quasi-simplex model (AR quasi-simplex). A second purpose was to determine if there are conditions in which researchers can reach adequate conclusions about stability and growth even in the presence of violations of invariance. A Monte Carlo simulation study was conducted to achieve the purposes. The method consisted of generating items under a linear curve of factors model (COFM) or under the AR quasi-simplex. Composites of the items were formed at each time point and analyzed with a linear LGM or an AR quasi-simplex model. The results showed that AR quasi-simplex model yielded biased path coefficients only in the conditions with large violations of invariance. The fit of the AR quasi-simplex was not affected by violations of invariance. In general, the growth parameter estimates of the LGM were biased under violations of invariance. Further, in the presence of non-invariant loadings the rejection rates of the hypothesis of linear growth increased as the proportion of non-invariant items and as the magnitude of violations of invariance increased. A discussion of the results and limitations of the study are provided as well as general recommendations. / Dissertation/Thesis / Ph.D. Psychology 2013

Submitted by MARCIA ROVADOSCHI (marciar@unifra.br) on 2018-08-16T17:48:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao_LarissaDaianeWillrichDeMelo.pdf: 1512214 bytes, checksum: b264a462161b24ec3ce2aacf05afea14 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-16T17:48:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_LarissaDaianeWillrichDeMelo.pdf: 1512214 bytes, checksum: b264a462161b24ec3ce2aacf05afea14 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2013-03-25 / Efforts to develop an effective vaccine against Herpes Simplex Virus-1 (HSV-1) has been intense enough, however, there is no effective vaccine yet. The using of nanocapsules (Ncs) for production of viral vaccines may contribute to the enhancement and effectiveness of the already developed vaccines models. The main properties of the nanostructured system, which may contribute to the improvement of the immune response generated by vaccine is the slow and gradual release of the encapsulated content, protection of the encapsulated molecule or protein and adjuvanticity, inherent in every Ncs. The objective of this study was to produce and characterize nanocapsules with aqueous core to encapsulate the SSIEFARL peptide from HSV-1. This peptide has hydrophilic characteristics which impossibility the encapsulation in conventional nanocapsules with oil core. For the standardization of the tunnel several adaptations where modified in the system previously developed by Lambert et al. Among these, the stirring of the suspension, temperature, amount of surfactant, amount of peptide and settling time were adapted. All protocols two aqueous suspensions were tested, one with the organic solvent ethanol in the aqueous phase or only water. The results showed that the production with magnetic stirring in the presence of ethanol in the aqueous phase lead to Ncs with better physicochemical characteristics. Empty Ncs presented an average of particle size of 285 nm (+ 19,4) and zeta potential of -40.1 mV (+ 1,7) and the Ncs containing SSIEFARL peptide presented the size of 315 nm (+ 20,7) and zeta potential of -35,5 mV (+ 2,4). Other condition of production tested was the water temperature added during the production. When water was used at 40 °C the physico-chemical parameters were better than when room temperature water was used. Additionally, we tested the stability of the suspensions after storage at room temperature or 4 °C. The Ncs were stable for longer periods of time under refrigeration. For the characterization of morphostructure, Ncs were analyzed by transmission electron microscopy (TEM). This analysis revealed that Ncs present as spherical structures, homogeneous and uniform as standards in nanostructure for biological application. The analysis of Ncs by confocal microscopy was applied to investigate the encapsulation. Three amounts of SSIEFARL-6 FAM peptide were used (20, 30 or 50 μL), and the 20 μL showed better encapsulation. The analysis of the release profile of the peptide from Ncs showed that of the suspension produced with 20 μL was more linear, demonstrating slow release for at least 24 h. These data indicate that the method of production under magnetic stirring with ethanol and 20 μL of peptide in the aqueous phase is more suitable for production of aqueous core Ncs. Furthermore, empty Ncs at low concentrations showed no cytotoxicity to lymphoid cells from BALB-c in cell culture. Thus, we suggest that this approach has promising potential for developing a vaccine against HSV-1. / Os esforços para o desenvolvimento de uma vacina eficaz contra o Herpes Simplex Vírus-1 (HSV-1) tem sido bastante intensos, entretanto, ainda não existe uma vacina eficaz. A utilização de nanocápsulas (Ncs) para a produção de vacinas anti-virais pode contribuir para o aprimoramento e eficácia dos modelos vacinas já desenvolvidos. As principais propriedades desse sistema nanoestruturado, que podem contribuir para a melhora da resposta imune gerada por uma vacina são liberação lenta e gradual do conteúdo encapsulado, a proteção da molécula ou proteína encapsulada e a adjuvanticidade, inerente a cada Ncs. Assim, o objetivo deste estudo foi produzir e caracterizar nanocápsulas de núcleo aquoso, capazes de encapsular o peptídeo SSIEFARL do HSV-1. Este peptídeo possui características hidrofílicas sendo impossível a encapsulação em nanocápsulas convencionais de núcleo oleoso. Para a padronização do encapsulamento, foram combinadas diversas adaptações ao sistema previamente desenvolvido por Lambert e colaboradores. Dentre essas, foram adaptados o modo de agitação das suspensões, temperatura, quantidade de tensoativo, quantidade de peptídeo e tempo de sedimentação. Em todos os métodos foram testados duas alterações na fase aquosa das suspensões, foram produzidas Ncs com solvente etanol, na fase aquosa e/ou sem. Como resultados foram observados que a produção com agitação magnética em presença de etanol na fase aquosa foi a que produziu NCs com melhores características físico-químicas. Foram obtidas Ncs brancas com tamanho de partícula médio de 285 nm (+ 19,4) e potencial zeta de -40,1 mV (+ 1,7) e Ncs contendo o peptídeo SSIEFARL com tamanho de 315 nm (+ 20,7) e potencial zeta de -35,5 mV (+2,4). Outra condição alterada foi a temperatura da água adicionada durante os processos de produção. Quando foi utilizada água na temperatura de 40 oC os parâmetros físico-químicos foram melhores do que quando foi utilizada água na temperatura ambiente (T.A). Além disso, foi testada a estabilidade das suspensões após armazenamento em temperatura ambiente e geladeira (4oC). As nanocápsulas se mantiveram estáveis por mais tempo em sob refrigeração. Para a caracterização morfoestrutural das Ncs produzidas, foi utilizada a microscopia eletrônica de transmissão (MET). Essa análise revelou que as Ncs apresentam-se como estruturas esféricas, homogêneas e uniformes, conforme padrões estabelecidos para esse tipo de nanoestrutura. A análise das Ncs por microscopia confocal foi utilizada para comprovação do encapsulamento do peptídeo SSIEFARL-6-Fam, assim como a melhor quantidade. Foram utilizadas três quantidades de peptídeo (20, 30 ou 50 L), sendo que a quantidade de 20 L foi a que apresentou melhores resultados. O gráfico do perfil de liberação da suspensão produzida com 20 μL mostrou-se mais linear, demonstrando liberação lenta por pelo menos 24 h. Estes dados apontam que a metodologia de produção sob agitação magnética com etanol e 20 μL de peptídeo na fase aquosa apresentaram os melhores resultados para produção de nanocápsulas de núcleo aquoso. Além disso, as nanocápsulas brancas em baixas concentrações não apresentaram citotoxicidade para células de órgãos linfóides de camundongos BALB-c em cultura de células. Com isso, podemos sugerir que esta metodologia possui potencial promissor para desenvolvimento de vacina contra o HSV-1.

Orientador: Valeria Abrão de Podesta / Dissertação (mestrado profissional) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica / Made available in DSpace on 2018-08-14T16:33:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Passos_AdaoNascimentodos_M.pdf: 1173380 bytes, checksum: 9650e6a87755fbc73407fcb71aed15c1 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Neste trabalho é feito um estudo sobre Programação Linear e um texto sobre alguns de seus assuntos básicos, construído com uma linguagem didática, visando sua utilização em sala de aula. São apresentados alguns problemas lineares, os fundamentos matemáticos da Programação Linear e o método Simplex, finalizando com um estudo do princípio da decomposição de Dantzig-Wolfe, que é um procedimento para a resolução de problemas lineares de grande porte e com estrutura especial. / Abstract: In this work we have done a study on Linear Programming and a text with some basic issues, using a didactic language, and aiming its utilization in the classroom. Some linear problems are shown here, the mathematical background of Linear Programming and the Simplex method. Finaly, we have also presented a study on the principle of Dantzig-Wolfe's decomposition, which is a procedure for solving large linear problems with special structure. / Mestrado / Programação Linear / Mestre em Matemática

A floating island was generated using two height maps, one for the bottom of the island and one for the top. Vertices of the island was displaced in the Y axis using an algorithm called Simplex noise. To avoid texture stretching that appears when displacing the vertices an algorithm called “tri planar projection” was implemented. After the vertices had been displaced the normal was smoothed using “normal smoothing”. An algorithm here called “the AVG algorithm” is created to smooth jig sawed edges around the island that appears after the island has been generated. The results of the AVG algorithm is judged by a group of 26 participants to see if any jig sawed edges are perceived. They answered a survey containing seven pictures, with each picture having one more iteration of the AVG algorithm then the last, starting from 0 iterations. Five iterations proved to be the best.