La tuberculose est due à un groupe d’agents infectieux phylogénétiquement proches formant le complexe Mycobacterium tuberculosis, formé de dix espèces. M. tuberculosis est un bacille à croissance lente qui forme des colonies rugueuses. Le complexe M. tuberculosis comporte également des bacilles tuberculeux formant des colonies lisses à croissance rapide, isolées qu’à partir de prélèvements cliniques chez l’homme. Notre revue des articles sur ces souches a montré que les trois premiers isolats ont été obtenus chez des patients en France, à Madagascar et en Polynésie Française par Georges Canetti entre 1968 et 1970. Suite à l'isolement d'une souche lisse à partir d’un ganglion cervical chez un enfant Somali de 2 ans en 1997, ces bacilles tuberculeux ont été nommés "Mycobacterium canettii". Aujourd'hui, moins d'une centaine de ces souches ont été isolées à partir de patients exposés aux pays formant la Corne de l’Afrique, principalement la République de Djibouti, qui présente la plus forte prévalence. Nous avons procédé à l’analyse génotypique de 34 isolats de M. tuberculosis et de 87 isolats de mycobactéries non-tuberculeuses de la Polynésie Française pour voir si des telles souches persistaient.Nous avons pu décrire deux nouvelles lignées de M. tuberculosis et une nouvelle espèce de mycobactérie non-tuberculeuse. Nous avons envisagé une transmission par voie digestive de "M. canettii" et nous avons testé la résistance de "M. canettii" à la chaleur. Nous avons observé la croissance de cette dernière entre 25°C et 45°C. Les données que nous avons obtenues ici pourraient former une base en vue d'élucider les réservoirs et les sources de souches lisses. / Tuberculosis is caused by a group of phylogenetically close infectious agents forming the Mycobacterium tuberculosis complex, consisting of ten species. M. tuberculosis is a slow growing bacterium which form rough colonies. The complex also includes M. tuberculosis tubercle bacilli forming smooth rapidly-growing colonies isolated from clinical specimens in humans. Our review of articles on these strains showed that the first three isolates were obtained from patients in France, Madagascar and French Polynesia by Georges Canetti between 1968 and 1970. Following the isolation of a smooth strain from cervical ganglion of a Somali 2 year-old child in 1997, the tubercle bacilli were named "Mycobacterium canettii". Today, less than a hundred of these strains were isolated from patients exposed to countries forming the Horn of Africa, especially the Republic of Djibouti, which has the highest prevalence. As showed in our revue, one smooth tubercle bacilli was isolated in Frenche Polynesia. To see if such strains persist there, we performed the genotyping of 34 isolates of M. tuberculosis and 87 isolates of non-tuberculous mycobacteria from French Polynesia. We have described two new strains of M. tuberculosis and a new species of mycobacterium tuberculosis not. We considered, on the basis of our data, a transmission through the digestive tract for "M. canettii" and we tested the resistance "Mr. canettii" to heat. We observed the growth of the latter between 25°C and 45°C. The data we got here could form a basis to elucidate the reservoirs and sources of smooth strains.

La tuberculose est l’une des maladies infectieuses mortelles les plus fréquentes, causée par des mycobactéries tuberculeuses dont principalement M. tuberculosis. Notre thèse a porté sur Mycobacterium canettii caractérisée par un morphotype lisse et un temps de génération plus court que M. tuberculosis. Notre revue de la littérature a montré que moins d'une centaine de cas d’infection à M. canettii ont été rapportés majoritairement à Djibouti située dans la Corne de l’Afrique. Ensuite, notre étude prospective de la tuberculose pulmonaire à Djibouti a mesuré une prévalence d’infections à M. canettii de 4%. A travers un modèle murin d’infection par gavage, nous avons observé la translocation de M. canettii des intestins vers la circulation lymphatique et sanguine ; suivie par une dissémination principalement vers les poumons et les ganglions lymphatiques. Cette étude a alors démontré que M. canettii peut infecter les individus par voie orale et a révélé que M. canettii peut interagir avec le tissu adipeux brun. Ensuite, à travers des modèles cellulaires d’infection, nous avons montré que les pré-adipocytes bruns pourraient constituer une cible potentielle des mycobactéries tuberculeuses et que M. canettii ne persiste pas dans les adipocytes matures contrairement à M. tuberculosis. En conclusion, nous avons apporté des connaissances nouvelles sur l’infection à M. canettii : sa prévalence, son mode de transmission ainsi que de nouvelles pistes sur de possibles réservoirs environnementaux. L’ensemble de ces données suggèrent que l’infection à M. canettii doit être considérée comme une entité clinique distincte de la tuberculose que nous proposons de nommer « Canettose ». / Tuberculosis is one of the most frequent deadly infectious diseases worldwide, caused by tuberculous mycobacteria including mainly M. tuberculosis. Our thesis focused on Mycobacterium canettii characterized by a smooth morphotype and a shorter generation time than M. tuberculosis. Our review of the literature showed that less than one hundred cases of M. canettii infection have been reported in Djibouti situated in the Horn of Africa. Then, our prospective microbiological study of pulmonary tuberculosis in Djibouti measured a prevalence of M. canettii lung infections of 4%. Through a mouse model by gavage, we observed the translocation of M. canettii from the intestines to the lymphatic and blood circulation; followed by dissemination mainly to the lungs and lymph nodes. In conclusion, this study demonstrated that M. canettii can follow the digestive tract to infect individuals and revealed also that M. canettii can interact with brown adipose tissue. Then, through cell infection models, we have shown that brown pre-adipocytes may be a potential target for tuberculous mycobacteria and that M. does not persist in mature adipocytes contrary to M. tuberculosis. In conclusion, this work allowed to bring new knowledge about M. canettii infection: its prevalence, its mode of transmission as well as new avenues on possible environmental reservoirs. All of these data suggest that M. canettii infection should be considered as a distinct clinical entity from tuberculosis. We propose to name "Canettosis" the M. canettii infection.