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Herdabilidades e correlações entre concentrações de proteína em soja avaliadas por diferentes metodologias / Heritabilities and correlations between protein contents of soybean seeds evaluated by different methodologies

Teixeira, Arlindo Inês 31 July 2003 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-10-05T13:01:01Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 536516 bytes, checksum: 656e6db3a8753023875fec7cfacba77a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-05T13:01:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 536516 bytes, checksum: 656e6db3a8753023875fec7cfacba77a (MD5) Previous issue date: 2003-07-31 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os principais objetivos deste trabalho foram estimar a herdabilidade no sentido amplo e restrito da concentração de proteína em soja, avaliada pelas metodologias do ácido bicinconínico (BCA) e pelo método de Kjeldahl, estimar a herdabilidade da concentração das proteínas de reserva da soja (frações 7S e 11S), avaliadas por eletroforese em gel de poliacrilamida em condição desnaturante (SDS- PAGE) seguida de densitometria e estimar as correlações entre as concentrações de proteína obtidas pelas diferentes metodologias. Para isso, cortou-se com o auxílio de uma lâmina uma parte do cotilédone das sementes originadas da população F 2 derivada do cruzamento entre uma linhagem de alto teor protéico com a variedade comercial Elite, e dos dois progenitores, tomando-se o cuidado para não danificar o embrião, o que prejudicaria o poder germinativo da semente. Esta parte da semente foi utilizada nas análises para determinação da concentração de proteínas totais pelos métodos de Kjeldahl, adaptado para pequenas quantidades de semente (15 mg), e do Ácido Bicinconínico; e também na análise da concentração das proteínas de reserva por SDS-PAGE/densitometria. A outra parte da semente foi cultivada em casa de vegetação, obtendo-se por auto-fecundação a população F 3 . Após a colheita, 10 sementes de cada planta obtida foram moídas e utilizadas na análise da concentração de proteínas totais pelo método de Kjeldahl e na análise da concentração das subunidades das proteínas de reserva por SDS-PAGE/densitometria. A análise dos resultados permitiu concluir que a maior estimativa de herdabilidade no sentido amplo para teor de proteínas na geração F 2 foi obtida pelo método de Kjeldahl (56,2%). Para as concentrações das proteínas de reserva estes valores foram de 62,1% para a concentração de 7S, 43,4% para a concentração de 11S e 50,5% para a soma da concentração das duas frações, indicando que a quantificação da concentração das proteínas de reserva por SDS- PAGE/densitometria pode ser útil em programas de melhoramento para qualidade protéica em soja. As herdabilidades no sentido restrito apresentaram baixos valores para todas metodologias, variando de 1,87 a 7,14%. Os efeitos do ambiente e da interação genótipo x ambiente sobre o teor de proteína das populações foram significativos. Os coeficientes de correlação de Spearman entre as concentrações das proteínas de reserva 7S e 11S com a concentração de proteínas totais determinada pelo método de Kjeldahl e entre as concentrações de 7S e 11S foram positivos e significativos nas duas gerações, F 2 e F 3 . Os coeficientes de correlação de Pearson e de Spearman entre as concentrações de proteína na população F 2 determinadas pelos métodos BCA e Kjeldahl foi de 0,131 e 0,385 respectivamente, indicando baixa correlação e baixa coincidência entre os métodos. Os coeficientes de correlação de Spearman entre as concentrações das proteínas 7S e 11S da população F 2 com as concentrações destas proteínas na população F 3 foram pequenos e negativos. O coeficiente de correlação de Spearman entre as concentrações de proteínas totais na população F 2 e na população F 3 determinada pelo método de Kjeldahl foi de 0,16, indicando também que aqueles indivíduos que apresentaram altas concentrações de proteína em F 2 não geraram indivíduos com o mesmo desempenho em F 3 , indicando que a seleção precoce não seria eficiente no cruzamento estudado. / Heritabilities and correlations between protein contents of soybean seeds evaluated by different methodologies. Adiviser: Maurilio Alves Moreira. Committee members: Everaldo Gonçalves de Barros and Sebastião Tavares de Rezende. The main objectives of this work were to stimate the broad and narrow sense heritabilities of soybean seed protein content evaluated by the Bincinchoninic Acid method (BCA), by the Kjeldahl method, and through the content of soybean seed storage proteins (7S and 11S) evaluated by SDS-PAGE followed by densitometry, and stimate the correlations between protein contents evaluated by the different methodologies. For that, a small fraction of the soybean seed cotyledones was cut with the aid of a blade from the F 2 population from the cross between a line with high protein content and the commercial cultivar Elite, from the two progenitors, without damaging the seed embryo, which would affect the seed germination. This seed fraction was used for the analyses of protein content by the Kjeldahl method, adapted to small amount of seeds (15 mg), Bicinchoninic Acid method, and also for the analyses of protein content through seed storage proteins determined by SDS-PAGE and densitometry. The other part of the seed was sown in the green house, obtaining the F 3 seed population. After harvesting, part of the seeds from each plant was grinded and used to mesasure the protein content by the Kjeldahl method and by SDS-PAGE/densitometry of the seed storage proteins. The results permitted to conclude that the greatest value stimated for broad sense heritability for protein content in the F 2 generation was obtained by the Kjeldahl method (56.2%). For protein content determined through seed storage proteins stimates these values were 62.1% for 7S content, 43.4% for 11S content and 50.5% for the sum of both protein fractions, indicating that the quantitation of total protein content through the amount of seed storage proteins by SDS-PAGE/densitometry can be useful in breeding programs for protein quality in soybean. The narrow sense heritabilities presented low values for all methodology used, varying from 1.87 to 7.14%. The environment effects and the genotype x environment interaction upon the populations were highly significant. Spearman correlation coefficient values between protein content stimated by the content of seed storage protein 7S and 11S with total seed protein content determined by the Kjeldahl method and between 7S and 11S contents were high and positive in the two generations, F 2 and F 3 . Pearson and Spearman correlation coefficients between protein content in the F 2 population determined by BCA and Kjeldahl methods were 0.131 and 0.385 respectively, indicating low relationship and low coincidence between these two methods. Spearman correlation coefficient values between 7S and 11S protein content in the F 2 population with content of these proteins in the F 3 population were small and negative. Spearman correlation coefficient between total protein content in F 2 and F 3 populations determined by the Kjeldahl method was 0.16. This low value point out that F2 seeds selected for high protein content did not hold the trait in the F 3 generation, indicating that selection for high protein content in early generations would not be efficient for this cross. / Dissertação importada do Alexandria
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Análise de variabilidade genética em populações segregantes de soja

Muniz, Franco Romero Silva [UNESP] 28 September 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-09-28Bitstream added on 2014-06-13T18:43:25Z : No. of bitstreams: 1 muniz_frs_dr_jabo.pdf: 1182648 bytes, checksum: 94ba816afe15c07503cde37414bc5a99 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A variabilidade entre progênies é criada pela segregação cromossômica independente dos genes e pela recombinação genética intracromossomal durante a meiose. O objetivo deste estudo foi analisar a variabilidade derivada de crossing-overs em cruzamentos biparentais (G2 e J2), quádruplos (G4 e J4) e óctuplos (G8 e J8), avaliados em populações segregantes derivadas de parentais contrastantes para resistência ao nematóide de cisto da soja (raça 3) – NCS – e ao oídio - O. A análise foi realizada em populações F2, através de marcadores SSR (single sequence repeat) concentrados em uma região de 55 cM ao redor do gene rmd (resistência ao oídio) e rhg1 (resistência ao NCS). Após o teste dos marcadores, quanto ao polimorfismo, apenas marcadores polimórficos foram utilizados para detectar crossing-over. Todos os marcadores analisados foram não significativos pelo teste de qui-quadrado (P > 0,05), indicando que os valores observados se ajustam à proporção genotípica esperada em F2 (1:2:1). As maiores médias de crossing-over por genótipo foram obtidas para G4 (4,00), no grupo G, e J8 (2,91), no grupo J. Por outro lado, as maiores médias de crossing-over considerando o número de gerações para formar cada população, foram para G2 (2,02) e J8 (0,97). A recombinação entre alelos ocorreu em algumas populações, entretanto para G4 e J8 em 1,89% dos genótipos não ocorreram. Em geral, nos cruzamentos com maior número de parentais envolvidos a ocorrência de crossingover foi maior, sendo satisfatórios na criação de variabilidade. O progresso no melhoramento de soja tem sido alcançado em partes pela criação de novas combinações alélicas dentro dos cromossomos. / The variability among the progenies is created by chromosome segregation, independent assortment of genes, and intra-chromosomal genetic recombination during meiosis. The objective of this study was to analyze the variability derived from crossovers in soybean biparental (G2 and J2), quadruple (G4 and J4) and octuple (G8 and J8) crosses, measured in segregant population derived from contrasting parental regarding their resistance to cist nematode (race 3) – SCN and powdery mildew – PM. The analyses were made in F2 population through SSR (single sequence repeat) markers located in a 55CM region around Rmd (powdery mildew) and Rhg1 (cist nematode) resistance genes. After screening makers for their polymorphism, only polymorphic markers were used to detect crossovers. All markers were not significant by chi-square test (P > 0.05), showing that observed values corroborates to genotypic inheritance ratio expected in F2 population (1:2:1). Thus, the higher average of crossovers for some populations were observed for G4 (4.00), at linkage group G and J8 (2.91), at linkage group J. On the other hand, the higher average of crossovers considering the generation number to form each population, was found for G2 (2.02) and J8 (0.97). The recombination between alleles occurred in some populations, however, to G4 and J8, in 1.89% of the genotypes not showing crossover. In general, the crosses with larger numbers of parents showed higher number of crossovers, being very satisfactory for the creation of genetic variability. Soybean breeding progress has been accomplished in part by creating on new within_chromossome allele combinations.
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Seleção fenotípica em soja para estabilidade e tolerância ao excesso hídrico

Cavalcante, Anaisa Kato 08 October 2012 (has links)
Soybean [Glycine max (L.) Merrill] is considered one of the most economically important crops. In Brazil, it is grown in considerable diversity of environments. Climate changes have influenced significantly agricultural production. This study aims to evaluate adaptability and stability of soybean genotypes and to select those tolerant to excess water in the shoot in mid northern state of Mato Grosso, Brazil as well to verify check its influence on yield and physiological quality of grains. So that, the study was divided into two chapters: in the first one, the experiment was carried out in Porto Alegre do Norte MT, in a randomized block design involving 25 genotypes and four commercial cultivars evaluated in three replications. Assays were performed in harvests of 2008/2009, 2009/2010 and 2010/2011. In order to evaluate adaptability and stability, we used the following methods: Eberhart & Russell (1966), Lin & Binns modified by Carneiro (1998), centroid (ROCHA et al., 2005) and Wricke (1965). In the second chapter, the experiment was carried out in Sygenta Seeds Research Center, in the city of Lucas do Rio Verde MT in a randomized block design in three replications with 15 treatments: 10 lineages of Sygenta soybean and six control ones (Pintado, MSOY8866, FTS4188, P98Y51, TMG131 e MSOY8888). We conducted a factorial design with seven harvest times (control group: five days first crop; 10 days second crop; 15 days third crop; 20 days - fourth crop; 25 days fifth crop and 30 days sixth crop after R8), one period of rain simulation (T1 - 3h of rain simulation) and three replications. We evaluated the performance of each genotype by measuring the following characteristics: number of days to flowering (NDF); number of days to maturity (NDM), plant height (cm) on flowering (PHF), plant height (cm) on maturity (PHM), height on the first pod (FPH), total weight (TW) and weight of 100 grains (GW). We used germination test to evaluate it. The vigor, viability, damage from moisture and mechanical damages were assessed by the tetrazolium test. We used Nuclear Magnetic Resonance (NMR) method to evaluate the protein and oil content. The results of the first chapter allowed us to verify that all methodologies agreed in detaching UFU-16 as the one with most productive performance and adaptability to favorable environment, but it showed low stability. By the method of Eberhart & Russel and Lin & Binns modified by Carneiro (1998) UFU-1 and UFU-14 lineages showed high average in grain productivity, high stability and were considered as adapted to favorable environment. However, both methods Lin Binns Lin Binns modified by Carneiro (1998 and Eberhart & Russel (1966) agreed on classifying the cultivars concerning to adaptability and stability. In the second chapter, we verified superiority in BRS Pintado cultivar concerning to total grain weight and the 100 grain weight. It was considered tolerant to excess water. Lineage 2 stands out to seed quality, with higher germination and vigor. / A soja [Glycine max (L.) Merrill] é considerada uma das culturas de maior importância econômica. No Brasil, ela é cultivada em considerável diversidade de ambientes. As mudanças climáticas têm influenciado a produção agrícola significativamente. O trabalho foi dividido em dois capítulos, com o objetivo de avaliar a adaptabilidade e a estabilidade de genótipos de soja e selecionar genótipos tolerantes ao excesso hídrico na parte aérea no médio Norte do Estado do Mato Grosso, bem como a sua influência no rendimento e na qualidade fisiológica dos grãos. No primeiro capítulo, o experimento foi conduzido em Porto Alegre do Norte MT, em delineamento de blocos casualizados, envolvendo 25 genótipos e quatro cultivares comerciais avaliados em três repetições. Os ensaios foram realizados nas safras de 2008/2009, 2009/2010 e 2010/2011. Para avaliação da adaptabilidade e da estabilidade, utilizaram-se os métodos Eberhart e Russell (1966), Lin e Binns modificado por Carneiro (1998), centroide (ROCHA et al., 2005) e Wricke (1965). No segundo capítulo, o experimento foi conduzido na Estação de Pesquisa da Syngenta Seeds, no município de Lucas do Rio Verde MT, em delineamento experimental de blocos completos casualizados e três repetições com quinze tratamentos: dez linhagens de soja da Empresa Syngenta e seis testemunhas (Pintado, MSOY8866, FTS4188, P98Y51, TMG131 e MSOY8888). Foi realizado o esquema fatorial com sete épocas de colheita (Testemunha, cinco dias (primeira colheita), dez dias (segunda colheita), quinze dias (terceira colheita), vinte dias (quarta colheita), 25 dias (quinta colheita) e 30 dias (sexta colheita) após R8) um tempo de simulação de chuva (T1 3h de simulação de chuva) e três repetições. O desempenho de cada genótipo foi avaliado por meio da mensuração das seguintes características: número de dias para a floração (NDF), número de dias para a maturidade (NDM), altura da planta (cm) na floração (APF), altura da planta (cm) na maturidade (APM), altura da inserção da primeira vagem (AIV), peso total (PT) e o peso de 100 grãos (PG). A germinação foi avaliada pelo teste de germinação. O vigor, a viabilidade, os danos de umidade e os danos mecânicos foram avaliados pelo teste de tetrazólio e os teores de proteína e de óleo, pelo método de Ressonância Nuclear Magnética (RMN). Os resultados do primeiro capítulo permitiram verificar que todas as metodologias avaliadas, Eberhart e Russell, Lin e Binns modificada por Carneiro (1998), Centroide e de Wricke (1965), foram concordantes ao se destacar a UFU- 16, apresentando-se o maior desempenho produtivo e adaptação a ambiente favorável, mas sendo considerado com baixa estabilidade. Pelo método de Eberhart e Russel e Lin Binns modificado por Carneiro (1998), as linhagens UFU-1 e UFU-14 apresentaram elevadas médias de produtividade de grãos, alta estabilidade e foram classificadas como de adaptabilidade a ambiente favorável. Contudo, as metodologias de Lin Binns modificada por Carneiro (1998) e Eberhart e Russel (1966) foram coerentes na classificação das cultivares quanto à adaptabilidade e estabilidade. No segundo capítulo, foi verificada a superioridade na cultivar BRS Pintado quanto à massa total de grãos e à massa de 100 grãos, sendo considerada tolerante ao excesso hídrico. A linhagem 2 destaca-se quanto à qualidade das sementes, apresentando germinação e vigor superiores. / Mestre em Agronomia
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Caracterização molecular de cultivares de soja por meio de um sistema de genotipagem fluorescente utilizando marcadores microssatélites com cauda estendida universal / Molecular characterization of soybean cultivars by a fluorescent genotyping system using microsatellite markers with a universal tail extension

Ribeiro, Carlos Alexandre Gomes 04 July 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 820068 bytes, checksum: d168e3825b15e5ad2fd3ea75fc70307b (MD5) Previous issue date: 2011-07-04 / Identification of soybean cultivars in Brazil is currently based on 30 morphological descriptors. Microsatellite markers are widely used for determination of genetic diversity, paternity tests, varietal purity and genetic mapping. Some variations of the conventional technique for microsatellite genotyping have been developed in order to match the speed and automation of current techniques with quality and low cost. Among them, there is a multiplex genotyping system in semi-automatic DNA sequencers, using universal tail extended primers (UTEP). This study aimed to standardize a robust system of semi-automatic molecular genotyping based on the UTEP methodology for soybean identification, to evaluate differences between this method and the conventional genotyping system using polyacrylamide gel electrophoresis and to characterize 30 soybean cultivars with a set of selected markers, estimating their allelic frequencies. These descriptors can be used as genotypic tool for cultivar identification and provide subsidies for the protection of intellectual property, determination and testing of varietal purity. Thirty commercial soybean cultivars were evaluated with a group of 22 microsatellite markers described in the literature. Genotyping was performed in a semi-automatic sequencer (UTEP) or by polyacrylamide gel electrophoresis (conventional). Among the loci analyzed, 13 were selected because they presented good amplification profiles, with few stutter products, and a large number of alleles. The allelic profile of each cultivar was first defined by the genotyping conventional system, and then by the semi- automated sequencer. For the UTEP genotyping methodology, the total number of alleles found was 50, ranging from 2 (Satt045) to 7 (Satt005). The polymorphic information content (PIC) ranged from 0.40 (Satt045) to 0.74 (Satt005) with an average of 0.62. For the conventional method the number of alleles found was 38 with a range of 2 (Satt045, Satt070 and AF162283) to 5 (Satt005) alleles. The PIC had a range 0.39 (Satt045) to 0.67 (Satt079), with an average of 0.56. The values of probability for random identity differed between the methods being <10-5 (UTEP) and <10-4 (conventional). Despite slight differences, there was a high correlation between genetic dissimilarity matrices obtained by the two methods (0.8026), and the groups formed also showed high similarity among them and they were coherent with the phenotypic data used for varietal registration and with the genealogies of the cultivars. In addition to the high sensitivity for detection of alleles of very close sizes, the UTEP method allowed a more accurate identification of amplification artifacts. The marker selected for both methods allowed the distinction of all cultivars analyzed. The UTEP method has a low cost when compared to common techniques of fluorescence tagging, in addition, its high accuracy makes this an advantageous method for cultivar characterization and determination of genetic purity. The set of markers tested in this work can be used as a set of genotype descriptors complementary to the phenotypic descriptors already used for cultivar protection in distinctness tests. / O desenvolvimento de sistemas de identificação molecular para determinar e rastrear a identidade genética de um cultivar representa um grande desafio ao sistema de proteção utilizado no país, até então fundamentado em descritores fenotípicos. A identificação de cultivares de soja é feita atualmente no Brasil com base em 30 descritores morfológicos. Marcadores moleculares do tipo microssatélite são largamente utilizados para fins de determinação da diversidade genética, paternidade, análises de pureza varietal e mapeamento genético. Algumas variações da técnica de genotipagem convencional por microssatélite vêm sendo desenvolvidas com o objetivo de adequar a velocidade e automatização de técnicas atuais, com qualidade de análise e baixo custo. Dentre elas, destaca-se um sistema multiplex de genotipagem em sequenciador semi-automático de DNA, que utiliza primers com cauda estendida universal (PCEU). O presente trabalho teve como objetivos padronizar um sistema reprodutível de genotipagem molecular semi-automatizado baseado na metodologia PCEU para a cultura da soja, avaliar diferenças em relação ao sistema de genotipagem convencional, em gel de poliacrilamida e caracterizar com o conjunto de marcadores selecionados, 30 cultivares de soja estimando suas frequências alélicas. Estes descritores genotípicos poderão ser utilizados como ferramenta para a identificação de cultivares e fornecer subsídios para a proteção da propriedade intelectual, determinação e comprovação de pureza varietal. Foram utilizados 30 cultivares comerciais de soja avaliados com um grupo de 22 marcadores microssatélites já descritos na literatura. A genotipagem foi realizada em sequenciador semi- automático (PCEU) e em gel de poliacrilamida (convencional). Dentre os locos analisados, 13 foram selecionados por apresentarem melhor perfil de amplificação, menos produtos stutter, e maior número de alelos. O perfil alélico de cada cultivar foi definido primeiramente em sistema tradicional de genotipagem por eletroforese em gel de poliacrilamida, e depois no sequenciador semi-automatizado. Para a metodologia de genotipagem PCEU, o número total de alelos encontrados foi de 50, variando de 2 (Satt045) a 7 (Satt005). O conteúdo de informação polimórfica (PIC) variou de 0,40 (Satt045) a 0,74 (Satt005) com média de 0,62. Para a metodologia convencional o número de alelos encontrados foi de 38 com uma variação de 2 (Satt045, Satt070 e AF162283) a 5 (Satt005) alelos. O PIC apresentou uma faixa 0,39 (Satt045) a 0,67 (Satt079), com média de 0,56. Os valores de probabilidade de identidade ao acaso diferiram entre os métodos, sendo <10-5 (PCEU) e <10-4 (Convencional). Apesar de diferenças pontuais, observou-se alta correlação entre as matrizes de dissimilaridade genética entre os métodos (0,8026), e os grupos formados apresentaram também alta similaridade e foram concordantes com dados fenotípicos de registro varietal e de genealogia. Além da alta sensibilidade na detecção de alelos de tamanhos muito próximos, o método PCEU permitiu uma identificação mais criteriosa dos artefatos de amplificação. Os grupos de marcadores selecionados em ambas as metodologias permitiram distinguir todas as cultivares analisadas. O método PCEU possui baixo custo quando comparado a técnicas comuns de marcação por fluorescência, além disso, sua alta precisão faz deste um método vantajoso para a caracterização de cultivares e determinação da pureza genética. O grupo de marcadores analisados pode ser usado como um conjunto de descritores genotípicos complementar aos descritores fenotípicos obrigatórios utilizados para fim de proteção de cultivares em testes de distinguibilidade.
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Marcadores morfológicos e moleculares na identificação e distinção de off-type em campos de produção de sementes de soja / Morphological and molecular markers in off-type identification and distinction in soybean seeds fields production

Andrade, Vinicius de 30 March 2012 (has links)
Morphological markers are useful tools for identifying off-type (atypical plants) in seed production fields. However, environmental factors can cause changes in certain individuals phenotype, turning molecular markers into useful tools for verification of possible genotypic differences between these individuals and the variety studied. The aim of this study was to evaluate the efficiency of SNP markers in identifying off-type based on genotypic and phenotypic (false positive) discrimination in soybean field production. Ten lines developed by Syngenta Breeding Program located in Cascavel-PR, Uberlândia-MG and Lucas do Rio Verde-MT were used. Each line was planted in its adaptation environment in the summer season / 2009-10. Data was collected from 22 morphological features for each line. After properly describing each line, field increases of these ten lines were carried out in Planura-MG, in the winter season / 2010. In the growth stages R6 and R7 the plants phenotypically atypical for each line were collected and evaluated, to which were considered only characteristics controlled by complex genetics. The DNA of the collected plants was analyzed using SNP markers. Twenty SNP assays were used, where each marker represented one soybean chromosome in order to cover the entire genome. Among the plants considered phenotypic off-type using visual morphological traits analyses, only 27.64% were confirmed by molecular tool as genetically distinct from the standard population, with a confidence interval between 19.7% and 35.5%. The use of molecular tools is effective for the discrimination of off-type genotypic and phenotypic (false positive) process due to environmental factors, preventing the write-off of seed lots that may meet the high genetic standards. / Os marcadores morfológicos são ferramentas úteis no processo de identificação de off-type (plantas atípicas) em campos de produção de sementes, mas fatores ambientais podem gerar alteração no fenótipo de determinados indivíduos, sendo os marcadores moleculares ferramentas úteis no processo de validação da real diferença genotípica entre esses indivíduos e a cultivar em estudo. Objetivou-se nesse trabalho avaliar a eficiência do uso de marcadores moleculares SNP s na discriminação de off-type genotípicos e fenotípicos (falso positivos) em campos de produção de sementes de soja. Foram utilizadas dez linhagens desenvolvidas pelos programas de melhoramento genético da Syngenta Seeds Ltda., situados em Cascavel-PR, Uberlândia-MG e Lucas do Rio Verde-MT. Cada linhagem foi semeada em seu ambiente de adaptação na safra de verão do ano 2009/10. Foram então coletados dados de 22 características morfológicas para cada linhagem. Após devidamente descrita cada linhagem, na safra de inverno do ano 2010 foram implantados campos de multiplicação das dez linhagens, na cidade de Planura-MG. Nos estádios fenológicos R6 e R7 foram coletadas as plantas fenotipicamente avaliadas como atípicas para cada linhagem, para qual foram consideradas características de controle genético complexo. As plantas foram encaminhadas para o Laboratório de Genética Molecular da Syngenta, em Uberlândia-MG, onde suas sementes foram germinadas e o DNA das plântulas analisado com o uso de marcadores moleculares SNP. Foram utilizados 20 SNP assays, sendo que cada marcador representou um cromossomo da soja, visando cobrir todo o genoma. Entre as plantas consideradas off-type fenotípicos por meio da análise visual dos descritores morfológicos, apenas 27,64% foram confirmados pela ferramenta molecular como geneticamente distintos da população padrão, com um intervalo de confiança entre 19,7% e 35,5%. O uso de ferramentas moleculares é útil no processo de distinção de off-type genotípicos e fenotípicos (falso positivos) devido a fatores ambientais, evitando o descarte de lotes de sementes com alto padrão genético. / Mestre em Agronomia
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Estratificação de ambientes na seleção de genótipos de soja (Glycine max (L.) Merrill) no Mato Grosso do Sul

Zuffo, Nilsso Luiz 22 July 1987 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-10-23T18:01:50Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 15820854 bytes, checksum: 05a1d316d60a8fce289637e8e8a312b2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-23T18:01:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 15820854 bytes, checksum: 05a1d316d60a8fce289637e8e8a312b2 (MD5) Previous issue date: 1987-07-22 / Foram conduzidos 18 ensaios em diferentes localidades e épocas, no ano agrícola I984/85, no Mato Grosso do Sul, com o objetivo de avaliar a representatividade de locais e/ou épocas de semeadura, a inclusão de épocas de semeadura para melhorar a eficiência da seleção de cultivares e linhagens para diferentes regiões e estimar a adaptabilidade e estabilidade fenotípica de II genótipos de soja. Os ensaios conduzidos em diferentes localidades e/ou épocas de semeadura apresentaram uma tendência a alterar significativamente a ordem de classificação dos cultivares e linhagens, sendo maior para o carater produção de grãos do que para outros caracteres. Verificou-se maior possibilidade de substituir um ensaio por outro com relação aos caracteres altura de planta e número de dias para maturação do que para produção de grãos. A seleção de genótipos pode ser feita de maneira mais eficiente por meio da escolha de ambientes a serem agrupados, envolvendo localidades e épocas de semeadura. A combinação de IO localidades na época em que tradicionalmente são conduzidos os ensaios finais, não se mostrou eficiente para a seleção de cultivares e linhagens para todo o Estado do Mato Grosso do Sul. O agrupamento das cinco localidades da regiao Centro-Norte do Estado e o plantio na época tradicional não representaram bem esta região. Apenas o agrupamento região Sul (Grande Dourados) parece estar sendo eficiente com respeito à seleção de cultivares mais bem adaptados as condições desta região. / Lattes e CPF não encontrado. Dissertação antiga.
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Métodos multivariados no estudo da diversidade genética e adaptabilidade e estabilidade em soja convencional

Felici, Paulo Henrique Nardon 22 February 2017 (has links)
O estudo da diversidade genética e o conhecimento das relações entre cultivares melhoradas é fundamental para os programas de melhoramento de soja, pois auxiliam na seleção de genitores e recomendação de cultivares. Esta tese está subdividida em três capítulos, sendo que o primeiro traz o referencial teórico relacionado à cultura, à importância econômica e ao melhoramento da soja. O segundo capítulo, por sua vez, foi desenvolvido com os objetivos de: avaliar a diversidade genética a partir de caracteres fenotípicos de genótipos de soja convencional de ciclo precoce em ambientes distintos; determinar a importância de caracteres na divergência genética de soja; e selecionar genitores de ampla diversidade genética para programa de melhoramento, utilizando diferentes métodos de agrupamento multivariados. O experimento foi conduzido em dois locais distintos, Campo Novo dos Parecis - MT, safra 2010/2011 e Urutaí - GO, safra 2012/2013. Foram avaliados dez genótipos de soja convencional de ciclo precoce, em delineamento de blocos completos casualizados, nos quais foram mensurados oito caracteres agronômicos. Por meio de análises uni e multivariadas, foi possível concluir que os agrupamentos formados por todos os métodos multivariados, aliados às médias dos valores fenotípicos dos genótipos, permitiram inferir sobre as combinações promissoras para hibridações artificiais. Ao considerar os dois ambientes de cultivo, o número de dias para a floração, a altura da planta na maturidade e altura de inserção da primeira vagem foram os caracteres que mais contribuíram para a divergência genética em soja. As linhagens UFU 106 e UFU 108 são as mais recomendadas como parte das hibridações com genótipos divergentes, pois são complementares em produtividade de grãos e menor fase vegetativa. Recomenda-se hibridações entre os seguintes pares de genótipos: UFU 106 x UFU 112; UFU 106 x Emgopa 316; UFU 108 x Emgopa 316; UFU 112 x Emgopa 316, para a obtenção de populações segregantes com variabilidade genética superior. O terceiro capítulo foi elaborado para avaliar a interação genótipos por ambientes para o caráter produtividade de grãos em genótipos de soja convencional, de ciclo precoce. Assim, os genótipos foram cultivados em 15 ambientes, distribuídos em cinco estados brasileiros, para determinar sua adaptabilidade e estabilidade por intermédio de métodos paramétricos, não paramétricos e multivariados. O método Wricke (1965), Eberhart e Russel (1966) e AMMI identificaram as linhagens UFU 21 e UFU 22 como as mais estáveis, sendo que ambas apresentaram produtividade de grãos superior a 3800,00 kg ha-1. A linhagem UFU 06 obteve média de produtividade de grãos superior a 4000,00 kg ha-1 e apresentou adaptação ampla pelos métodos Annicchiarico (1992) e Lin e Binns (1988) modificado por Carneiro (1998) e Centróide. / The study of genetic diversity and the knowledge of the relationships among improved cultivars are fundamental for soybean breeding programs, since they help the selection of breeders and recommendation of cultivars. This thesis is subdivided into three chapters, the first one deals with a theoretical reference regarding the culture, the economic importance and the improvement of soybean. The second chapter was developed with the objective of evaluating the genetic diversity from phenotypic traits, of conventional early maturity soybean genotypes in different environments, determining the importance of traits in soybean genetic divergence and selecting parents of broad genetic diversity for breeding programs, using different multivariate clustering methods. The experiment was conducted in two distinct locations, Campo Novo dos Parecis - MT, season 2010/2011 and Urutaí - GO, season 2012/2013. Ten genotypes of conventional early maturity soybean were evaluated in a randomized complete block design, in which eight agronomic characters were measured. By univariate and multivariate analyzes it was possible to conclude that the groupings formed by all the multivariate methods, with the means of the phenotypic values of the genotypes, allowed to infer about the promising combinations for artificial hybridizations. Number of days for flowering, plant height at maturity and height of insertion of the first pod were the characters that contributed the most to the genetic divergence in soybean when considering the two crop environments. UFU 106 and UFU 108 lines are the most recommended as part of the hybridizations with divergent genotypes, since they are complementary in grain yield and lower vegetative phase. Hybridizations between the following pairs of genotypes are recommended to obtain segregating populations with superior genetic variability: UFU 106 x UFU 112; UFU 106 x Emgopa 316; UFU 108 x Emgopa 316; UFU 112 x Emgopa 316. The third chapter was elaborated to evaluate the genotype interaction by environments for grain yield characteristics in conventional soybean genotypes of early maturity, grown in 15 environments distributed in five Brazilian states, to determine the adaptability and stability of the genotypes by parametric, non-parametric and multivariate methods. Wricke (1965), Eberhart and Russel (1966) and AMMI methods identified UFU 21 and UFU 22 lines as the most stable, both with grain yields higher than 3800,00 kg ha-1. The strain UFU 06 obtained an average grain yield of more than 4000,00 kg ha-1 and presented wide adaptation by Annicchiarico (1992), Lin and Binns (1988) modified by Carneiro (1998) and Centroid methods. / Tese (Doutorado)

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