Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-12-16Bitstream added on 2014-06-13T20:01:47Z : No. of bitstreams: 1 masson_gcih_dr_jabo.pdf: 739097 bytes, checksum: 2fef2cb4d684c81bde182928eafa28f3 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / S. aureus é responsabilizado por diversos problemas clínicos em suinocultura e em humanos. Estudos epidemiológicos comprovam o potencial deste microrganismo em adquirir resistência a antibióticos. Atualmente estirpes resistentes a meticilina (MRSA), responsabilizados por casos de infecções nosocomiais, são as mais estudadas uma vez que o MRSA encontra-se disseminado em ambientes extra-hospitalares e frenquentemente tem sido isolado de vários animais domésticos inclusive suínos. O objetivo desde trabalho foi determinar a presença de S. aureus em granjas de suínos, identificar a ocorrência dos genes mecA, icaA e icaD e o perfil de resistência a antimicrobianos. Ao todo foram colhidas 458 amostras de cinco granjas e dois frigoríficos. As amostras foram semeadas em ágar Braid - Parker e ágar sangue seguido de provas bioquímicas. As amostras sugestivas, foram submetidas a PCR para confirmação de espécie, detecção do gene coa, mecA para avaliar a resistência a meticilina além dos genes de virulência icaA e icaD que expressam capacidade para formação de biofilmes. Na sequência, realizou-se o antibiograma para a avaliação de 11 antimicrobianos. Ao todo foram identificados 81 (79%) S. aureus isolados de todas as granjas e frigoríficos incluindo, três amostras isoladas de funcionários das granjas. Nenhuma amostra foi positiva para o gene mecA. Em relação aos genes icaA e icaD, observou predomínio do gene icaD e que 41% das amostras foram positivas para os dois genes. O antibiograma demonstrou grande resistência às penicilinas e tetraciclinas, além de grande quantidade de S aureus multirresistentes / Staphylococcus aureus are involved in a wide range of clinical problems to swine industry as son in humans. Epidemiological researchs prove his potential to acquire resistantence to antibiotics. Nowadays, methicillin-resistant S. aureus (MRSA) are responsabilized for nosocomial infections and many studies are done because MRSA are spread to extra hospitalar enrivonment and frequentely isolated from domestic animals including pigs. The aim of this study was to determine the presence o S. aureus at swine farms and identify the mecA, icaA and icaD genes and the resistant proflife to antibiotics. Overal, 458 swabs were taked from five pigeris and two slautherhouses. All the samples were placed on Braid – Parker and blood agar follow by biochemical analyses. The suspect colonies were submitted to PCR to confirm the S. aureus species, by the detection of the coa gene, mecA to avaible meticillin-resistant as son to the virulence gens icaA and icaD that can determine slime production. Antibiogram were done to evaluate the response to 11 antibiotics. All pigeris and slautherhouse were positive and 81 (79%) samples were S. aureus positive including three isolates from pigs employeers. The mecA gene was not detected. The icaD gene was most frequent and 41% were positive to both genes. The antibiogram show a lot of samples penicillin and tetraciclin resistant. Most of the samples were multirestant

Orientador: Luiz Fernando de Oliveira e Silva Carvalho / Banca: Everlon Cid Rigobelo / Banca: Aníbal de Sant'Anna Moretti / Banca: Luiz Carlos Marques / Banca: Mario Roberto Hatayde / Resumo: S. aureus é responsabilizado por diversos problemas clínicos em suinocultura e em humanos. Estudos epidemiológicos comprovam o potencial deste microrganismo em adquirir resistência a antibióticos. Atualmente estirpes resistentes a meticilina (MRSA), responsabilizados por casos de infecções nosocomiais, são as mais estudadas uma vez que o MRSA encontra-se disseminado em ambientes extra-hospitalares e frenquentemente tem sido isolado de vários animais domésticos inclusive suínos. O objetivo desde trabalho foi determinar a presença de S. aureus em granjas de suínos, identificar a ocorrência dos genes mecA, icaA e icaD e o perfil de resistência a antimicrobianos. Ao todo foram colhidas 458 amostras de cinco granjas e dois frigoríficos. As amostras foram semeadas em ágar Braid - Parker e ágar sangue seguido de provas bioquímicas. As amostras sugestivas, foram submetidas a PCR para confirmação de espécie, detecção do gene coa, mecA para avaliar a resistência a meticilina além dos genes de virulência icaA e icaD que expressam capacidade para formação de biofilmes. Na sequência, realizou-se o antibiograma para a avaliação de 11 antimicrobianos. Ao todo foram identificados 81 (79%) S. aureus isolados de todas as granjas e frigoríficos incluindo, três amostras isoladas de funcionários das granjas. Nenhuma amostra foi positiva para o gene mecA. Em relação aos genes icaA e icaD, observou predomínio do gene icaD e que 41% das amostras foram positivas para os dois genes. O antibiograma demonstrou grande resistência às penicilinas e tetraciclinas, além de grande quantidade de S aureus multirresistentes / Abstract: Staphylococcus aureus are involved in a wide range of clinical problems to swine industry as son in humans. Epidemiological researchs prove his potential to acquire resistantence to antibiotics. Nowadays, methicillin-resistant S. aureus (MRSA) are responsabilized for nosocomial infections and many studies are done because MRSA are spread to extra hospitalar enrivonment and frequentely isolated from domestic animals including pigs. The aim of this study was to determine the presence o S. aureus at swine farms and identify the mecA, icaA and icaD genes and the resistant proflife to antibiotics. Overal, 458 swabs were taked from five pigeris and two slautherhouses. All the samples were placed on Braid - Parker and blood agar follow by biochemical analyses. The suspect colonies were submitted to PCR to confirm the S. aureus species, by the detection of the coa gene, mecA to avaible meticillin-resistant as son to the virulence gens icaA and icaD that can determine slime production. Antibiogram were done to evaluate the response to 11 antibiotics. All pigeris and slautherhouse were positive and 81 (79%) samples were S. aureus positive including three isolates from pigs employeers. The mecA gene was not detected. The icaD gene was most frequent and 41% were positive to both genes. The antibiogram show a lot of samples penicillin and tetraciclin resistant. Most of the samples were multirestant / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-07-31Bitstream added on 2014-06-13T20:56:04Z : No. of bitstreams: 1 cruz_tf_me_botfmvz.pdf: 332026 bytes, checksum: b36d32d75d346e3063434cff130d4fa5 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Vários estudos têm demonstrado a associação entre a maior concentração viral do circovírus suíno tipo 2 (PCV2) detectado por PCR quantitativa com o desenvolvimento de lesões microscópicas típicas da Síndrome da circovirose suína (SCS). Clinicamente, a SCS é caracterizada principalmente pelo emagrecimento progressivo, acompanhado de dispnéia, aumento de tamanho dos linfonodos, palidez e/ou icterícia das mucosas. A diminuição na taxa de crescimento dos leitões acometidos com a síndrome provoca grave prejuízo econômico para o produtor, o que torna a SCS uma das doenças mais importantes para a suinocultura. Assim, com o objetivo de comparar a concentração viral relativa do circovírus suíno (PCV) com o ganho de peso de leitões provenientes de uma granja comercial com SCS, amostras de sangue total, soro e swab nasal foram analisadas por PCR em tempo real com SYBR® Green I e PCR para o circovírus suíno tipo 1 (PCV1), sendo posteriormente, comparadas entre si para determinação de qual amostra seria mais apropriada para a utilização na PCR em tempo real com SYBR® Green I. Foram colhidas 128 amostras de sangue total, 128 de soro e 128 de swab nasal, as quais foram obtidas de 32 leitões acompanhados na maternidade, creche, recria e crescimento. Através da comparação das concentrações virais relativas do PCV entre as amostras, o sangue total mostrou-se mais apropriado para a PCR em tempo real, seguido do soro. Os swabs nasais não foram considerados apropriados para detecção do PCV pela técnica aplicada, pois o PCV detectado pode representar o vírus sendo eliminado nas secreções nasais e/ou uma contaminação do ambiente. Todas as amostras (n = 107) positivas para PCV por PCR em tempo real foram testadas para PCV1 e resultaram negativas. / Several studies have shown the association among the largest viral concentration of Porcine circovirus type 2 (PCV2) detected by quantitative PCR with the development of typical microscopic lesions of Postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS). Clinically, PMWS is characterized by the progressive weigh loss, accompanied of dyspnea, enlargement of limph nodes, paleness and/or jaundice of the mucous membranes. The reduce growth rate of the pigs affected with the PMWS cause serious economical damage, making this disease as one of the most important for swine producing area. Like this, with the objective of comparing the relative viral concentration of the PCV with the weight gain of piglets of a commercial farm with PMWS, samples of total blood, serum and nasal swab were analyzed by real time PCR using SYBR® Green I and PCR for the PCV1, and were compared later amongst themselves for determination of which sample would be more appropriate for quantitative PCR. A total of 128 samples of total blood, 128 of serum and 128 of nasal swab were collected, which were obtained of 32 piglets accompanied at the nursery, grower, and finisher stage. After analyses, total blood was shown more appropriate for real time PCR, following by the serum. The nasal swabs were not considered appropriate for quantifications of PCV because detected PCV can represent the virus being eliminated in the nasal secretions and/or an environment contamination. All of the samples (n = 107) positive for PCV in real time PCR were also tested in PCR for PCV1 with negative results. The comparison between viral concentrations in blood or serum samples and the weights of the piglets, a negative correlation was observed.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-06-25Bitstream added on 2014-06-13T19:17:49Z : No. of bitstreams: 1 guazzelli_a_me_botfmvz.pdf: 415224 bytes, checksum: 21f876feebee52f17c73bdef5ce2ef0c (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A rodococose suína compreende doença infecciosa caracterizada por linfadenites piogranulomatosas. Diferentes fatores de virulência são reconhecidos na patogenicidade de Rhodococcus equi. A estrutura da parede celular bacteriana, a viabilidade no interior de fagócitos e na ausência de ferro, a produção de citotoxinas, a resistência aos antimicrobianos convencionais e, recentemente, a presença de proteínas associadas à virulência (Vap) reguladas por plasmídios, são considerados os principais mecanismos de virulência do microrganismo. Diferentes fatores de virulência foram avaliados em 23 (6,1%) linhagens de R. equi isoladas de 378 linfonodos submandibulares e mesentéricos de suínos e javalis (Sus scrofa). Foram realizados exames microbiológicos em 129 linfonodos apresentando lesões (linfadenite) e 129 sem lesões (controle) de suínos, e 60 linfonodos com lesões e 60 sem lesões de javalis. Dentre as 23 linhagens de R. equi, 19 (7,4%) foram isoladas de suínos, das quais 17 obtidas de linfonodos com lesões e duas sem lesões. Das 19 linhagens de suínos, 18 (94,7%) foram obtidos de linfonodos submandibulares e um (5,3%) de mesentérico. As quatro (3.3%) linhagens de R. equi isoladas de javalis foram obtidas exclusivamente de linfonodos com lesões. Destes, três foram obtidos de linfonodos submandibulares e um de mesentérico. Dentre nove antimicrobianos testados, azitromicina (100,0%), gentamicina (100,0%), levofloxacina (100,0%), vancomicina (100,0%), amoxicillina/ácido clavulânico (94,7%), eritromicina (94,7%) e rifampicina (94,7%) foram os fármacos mais efetivos. Baixa ocorrência de resistência aos antimicrobianos nos isolados de suínos foi observada contra os fármacos testados. A concentração inibitória mínima (MIC90) da azitromicina, eritromicina e rifampicina foi observada, respectivamente, em ≤2 µg/mL, ≤0,5 µg/mL and ≤1 µg/mL... / The rhodococcosis in swine comprise an infectious disease characterized by pyogranulomatous lymphadenitis. Different virulence factors are recognized in pathogenicity of the Rhodococcus equi. The structure of bacterial cell wall, the viability inside of phagocytes and in absence of iron, the production of cytotoxins, the resistance to conventional antimicrobials and recently, the presence of proteins associated to virulence (Vap) regulated by plasmids, are considered the most important virulence mechanisms of microorganism. Different virulence factors were evaluated in 23 (6.1%) R. equi strains isolated from 378 submandibular and mesenteric lymph nodes of swine and wild boars (Sus scrofa). Microbiological exams were performed in 129 lymph nodes presenting lesions (lymphadenitis) and 129 without lesions (controls) from swine, and 60 lymph nodes with lesions and 60 without lesions from wild boars. Among 23 R. equi strains, 19 (7.4%) were isolated from swine and, from these, 17 were obtained from lymph nodes with lesions and two without lesions. From 19 strains isolated from swine, 18 (94.7%) were obtained of submandibular lymph nodes and one (5.3%) from mesenteric. The four (3.3%) R. equi strains isolated from wild boars were obtained exclusively of lymph nodes presenting lesions. From these, three were obtained from submandibular lymph nodes and one of mesenteric. Among nine antimicrobials tested, azithromycin (100.0%), gentamicin (100.0%), levofloxacin (100.0%), vancomycin (100.0%), amoxicillin/clavulanic acid (94.7%), erythromycin (94.7%) and rifampin (94.7%) were the most–effective drugs. Low rates of resistance to antimicrobials in swine isolates were observed against drugs tested. The inhibitory minimal concentration of 90% of isolates (MIC90) with use of azithromycin, erythromycin and rifampin were observed respectively in 2 μg/mL, 0.5 μg/mL and 1 μg /mL... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Jane Megid / Banca: Adriana Cortez / Banca: Júlio Cesar de Freitas / Resumo: A carne suína é a fonte de proteína de origem animal mais consumida no mundo, tendo o Brasil como o quarto maior produtor e exportador. A brucelose é uma das mais importantes e amplamente distribuidas zoonoses mundial. A prevenção da brucelose humana depende do controle da doença nos animais. O diagnóstico definitivo é o isolamento da bactéria, porém técnicas de biologia molecular permitem a detecção do agente e diferenciação em espécies e biótipos reduzindo o tempo necessário para o diagnóstico final. Os programas de controle e erradicação utilizam os testes sorológicos para o diagnóstico da doença existindo, no entanto, variação quanto ao tipo de teste utilizado de acordo com diferentes países e pesquisadores. No Brasil relatos de soropositividade para brucelose em suínos variam de zero a 100% de acordo com a região, amostragem e metodologia utilizada, porém estudos da enfermidade em suideos com lesões de linfadenite não são encontrados. Este trabalho pretende descrever a situação epidemiológica da brucelose em suínos no Brasil, avaliar os meios de cultura ágar Brucella, CITA e Farrell para isolamento desta bactéria e detectar a presença do agente em linfonodos de suínos e javalis, com linfadenite, abatidos em frigoríficos no estado de São Paulo, e destinados ao consumo humano / Abstract: Pork is the most consumed source of animal protein in worldwide. Brucellosis is one of the most important and worldwide distributed zoonosis. The prevention of human brucellosis depends on controlling the disease in animals. The bacteria isolation is the standard technique but new molecular methods allow the detection and differentiation the agent in species and biotypes reducing the time required for the final diagnosis. The control and eradication programs are based in serological tests for the diagnosis, however, variation in these tests according to different countries and researchers are common. In Brazil reports for seropositivity in swine range from zero to 100% depending on region, sampling and methodology, but studies of the disease in suidae with lymphadenitis are not found. This study aims to describe the epidemiological situation of brucellosis in pigs in Brazil and evaluate Brucella agar, CITA and Farrell culture media for isolation of the bacteria and to detect the presence of the agent in lymph nodes of pigs and boars with lymphadenitis slaughtered in the state of São Paulo and sent for human consumption / Mestre

Orientador: Luís Guilherme de Oliveira / Coorientador: Samir Issa Samara / Banca: Hélio José Montassier / Banca: José Carlos Figueiredo Pantoja / Resumo: Os membros do gênero Pestivirus apresentam grande semelhança antigênica entre si. A reação sorológica cruzada entre o Vírus da Peste Suína Clássica (CSFV) e o Vírus da Diarreia Viral Bovina (BVDV) é de grande importância, e interfere em programas de erradicação da Peste Suína Clássica (PSC). Este trabalho teve como objetivos determinar a prevalência de anticorpos anti-BVDV em suínos de criações não tecnificadas, associar fatores de risco e buscar vínculos epidemiológicos entre rebanhos através do geoprocessaemento. Para tal, 360 amostras de soro de suínos provenientes de 56 propriedades rurais da região nordeste do Estado de São Paulo foram submetidas ao teste de virusneutralização (VN) utilizando os genótipos BVDV-1 estirpe Singer e BVDV-2 estirpe VS253. Foram detectados 4,72% (17) de amostras reagentes na VN, e 26,79% (15) rebanhos apresentaram pelo menos um animal reagente. Não foi possível associar fatores de risco. O estimador de intensidade de Kernel indicou áreas de alto risco de ocorrência da enfermidade e, juntamente com a análise de correspondência múltipla apontou associação com a presença de rebanhos de bovinos, quantidade mediana de leitões e rebanho suíno mediano nas propriedades da região. Ressalta-se a importância dos bovinos na ocorrência de infecções pelo BVDV em suínos, assim como a problemática no diagnóstico e levantamento epidemiológico para vigilância de PSC devido a presença de anticorpos anti-BVDV nos animais / Abstract: The members of the Pestivirus gender have great antigenic similarity. The serological cross-reaction between the Classical Swine Fever Virus (CSFV) and the Bovine Viral Diarrhea Virus (BVDV) usually interferes with Classical Swine Fever (CSF) eradications programs. This study focused on establishing the prevalence of antibodies for the BVDV in pigs of non-technified rearing farms, associate risk factors and use geospatial analysis tools to correlate positive herds. A set of 360 serum samples from 56 herds located in the northeastern region of the state of São Paulo were analyzed by the virusneutralization test (VN), using the genotypes BVDV-1 strain Singer and BVDV-2 strain VS253. During the sample collection, a questionnaire was applied to the farmers in order to obtain epidemiological information of the herd. 4,72% (17) of the samples were positive in the VN and 26,79% (15) of the herds had at least one positive animal. It was not possible to associate risk factors; however, the variable "use of milk serum in the feed" showed a tendency to be associated with the occurence of the disease. The Kernel intensity estimator showed three high risk of occurence areas, which were associated with the presence of bovine herds, medium quantity of piglets in the herd and medium size of total swine herd. The results highlight the importance of bovines in the prevalence of swine BVDV infections and the difficulties in diagnostic tests and CSF surveillance actions due to the serological cross-reaction between BVDV and CSFV antibodies / Mestre

Orientador: João Pessoa Araújo Junior / Banca: Hélio José Montassier / Banca: Alessandra Marnie M. G. Castro / Resumo: Vários estudos têm demonstrado a associação entre a maior concentração viral do circovírus suíno tipo 2 (PCV2) detectado por PCR quantitativa com o desenvolvimento de lesões microscópicas típicas da Síndrome da circovirose suína (SCS). Clinicamente, a SCS é caracterizada principalmente pelo emagrecimento progressivo, acompanhado de dispnéia, aumento de tamanho dos linfonodos, palidez e/ou icterícia das mucosas. A diminuição na taxa de crescimento dos leitões acometidos com a síndrome provoca grave prejuízo econômico para o produtor, o que torna a SCS uma das doenças mais importantes para a suinocultura. Assim, com o objetivo de comparar a concentração viral relativa do circovírus suíno (PCV) com o ganho de peso de leitões provenientes de uma granja comercial com SCS, amostras de sangue total, soro e "swab" nasal foram analisadas por PCR em tempo real com SYBR® Green I e PCR para o circovírus suíno tipo 1 (PCV1), sendo posteriormente, comparadas entre si para determinação de qual amostra seria mais apropriada para a utilização na PCR em tempo real com SYBR® Green I. Foram colhidas 128 amostras de sangue total, 128 de soro e 128 de "swab" nasal, as quais foram obtidas de 32 leitões acompanhados na maternidade, creche, recria e crescimento. Através da comparação das concentrações virais relativas do PCV entre as amostras, o sangue total mostrou-se mais apropriado para a PCR em tempo real, seguido do soro. Os "swabs" nasais não foram considerados apropriados para detecção do PCV pela técnica aplicada, pois o PCV detectado pode representar o vírus sendo eliminado nas secreções nasais e/ou uma contaminação do ambiente. Todas as amostras (n = 107) positivas para PCV por PCR em tempo real foram testadas para PCV1 e resultaram negativas. / Abstract: Several studies have shown the association among the largest viral concentration of Porcine circovirus type 2 (PCV2) detected by quantitative PCR with the development of typical microscopic lesions of Postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS). Clinically, PMWS is characterized by the progressive weigh loss, accompanied of dyspnea, enlargement of limph nodes, paleness and/or jaundice of the mucous membranes. The reduce growth rate of the pigs affected with the PMWS cause serious economical damage, making this disease as one of the most important for swine producing area. Like this, with the objective of comparing the relative viral concentration of the PCV with the weight gain of piglets of a commercial farm with PMWS, samples of total blood, serum and nasal swab were analyzed by real time PCR using SYBR® Green I and PCR for the PCV1, and were compared later amongst themselves for determination of which sample would be more appropriate for quantitative PCR. A total of 128 samples of total blood, 128 of serum and 128 of nasal swab were collected, which were obtained of 32 piglets accompanied at the nursery, grower, and finisher stage. After analyses, total blood was shown more appropriate for real time PCR, following by the serum. The nasal swabs were not considered appropriate for quantifications of PCV because detected PCV can represent the virus being eliminated in the nasal secretions and/or an environment contamination. All of the samples (n = 107) positive for PCV in real time PCR were also tested in PCR for PCV1 with negative results. The comparison between viral concentrations in blood or serum samples and the weights of the piglets, a negative correlation was observed. / Mestre