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Diversidade de genes catabólicos em solos de \"Terra Preta de Índio\" da Amazônia sob diferentes coberturas vegetais / Catabolic genes diversity in \"Amazon Dark Earth\" under different land usesMaria Julia de Lima Brossi 28 November 2012 (has links)
\"Terra Preta de Índio\" (TPI) é um termo utilizado para designar horizontes antrópicos A em solos Amazônicos. Estes solos se destacam pela alta concentração de nutrientes, matéria orgânica e carvão pirogênico. Do ponto de vista microbiológico, a importância destes solos reside no fato de que constituem um habitat de alta diversidade microbiana, sendo também um ambiente propício para a realização de processos de biodegradação, amplamente dependente de enzimas microbianas, como as dioxigenases, que podem utilizar hidrocarbonetos aromáticos como fonte de carbono e energia. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivo o estudo da diversidade funcional de genes catabólicos e também de bactérias potencialmente degradadoras de hidrocarbonetos, com base em métodos de isolamento e cultivo, seguidos de abordagens moleculares (sequenciamento e quantificação de genes que codificam para a enzima dioxigenase), além do estudo da influência da incubação desses solos com hidrocarbonetos aromáticos, na diversidade e quantidade de cópias de genes catabólicos. Este trabalho pretende aprimorar a compreensão da relação entre a abundância, riqueza, diversidade e funcionalidade destes genes em bactérias presentes em amostras de solo de TPI, comparativamente à amostras de seus solos originais, também chamados de adjacentes (ADJ) e sob diferentes cultivos (floresta secundária - FS e cultívo agrícola - CULT). Os resultados gerados a partir do isolamento e bioensaio mostraram grande diversidade de gêneros e espécies descritas como degradadores de compostos aromáticos e foi possível observar a predominância de gêneros bacterianos estreitamente relacionados a processos de biodegradação, como por exemplo, Pseudomonas, Burkholderia, Sphingomonas além de representantes dos gêneros Bacillus, Enterobacter, Serratia, entre outros. Com esses resultados foi possível observar diferenças nas comunidades bacterianas quando comparados os diferentes sítios analisados. Alguns gêneros foram exclusivos de cada sítio, o que mostra uma diferença na comunidade bacteriana de acordo com o tipo de solo (TPI e ADJ) e seu uso (FS e CULT), sendo que os solos de TPI apresentaram maior quantidade e número de filotipos potencialmente degradadores do que os sítios ADJ o que demonstra o imenso potencial das bactérias dos solos de TPI para processos de importância biotecnológica. As bibliotecas de clones e o pirosequenciamento do gene catabólico bph mostraram maior diversidade e riqueza de espécies nos sítios de TPI quando comparados com os sítios ADJ. A abundância deste gene determinada por PCR quantitativa mostrou uma maior quantidade de cópias em solos de TPI comparados aos solos ADJ. Os resultados dos microcosmos permitiram observar uma mudança na estrutura da comunidade em relação aos genes de degradação, após a incubação dos solos com compostos aromáticos, além de mostrar um aumento do número de cópias do gene catabólico após a incubação dos solos. De maneira geral este trabalho demonstrou o potencial dos solos de Terra Preta para estudo da diversidade funcional de genes catabólicos e permitiu observar que a diversidade deste gene é mais influênciada pelo tipo de solo (TPI ou ADJ) do que pela cobertura vegetal (floresta secundária ou cultivo agrícola) / \"Amazon Dark Earths\" (ADE) is a term used to describe the anthropic horizons in Amazon soils. These soils are characterized by high concentrations of nutrients, organic matter and black carbon. From the microbiological point of view, the importance of these soils mainly resides in the fact that they constitute a highly diverse microbial habitat, and also an environment for performing various biodegradation processes largely dependent of microbial enzymes, as dioxygenases, that can transform organic compounds in source of carbon and energy. In this context, this study aimed to analyze the functional diversity of bacteria catabolic genes and also analyze potentially hydrocarbons degrader bacteria, based on methods of isolation and culture, followed by molecular approaches (sequencing and quantification of genes encoding the dioxygenase enzyme) additionally to a study of aromatic hydrocarbons incubation of soils and its influence in the diversity and quantity of the catabolic gene. This study aims to understand the relationship between the abundance, richness, diversity and functionality of these genes in ADE soil samples compared to their original soil samples, also called adjacent soils (ADJ), under different land uses (secondary forest - SF and agricultural cultivation - CULT). The results generated from the isolation and bioassay showed wide variety of genera and species described as degrading aromatic compounds and it was possible to observe the predominance of bacterial genera closely related to biodegradation processes, e.g., Pseudomonas, Burkholderia, Sphingomonas and representatives the genera Bacillus, Enterobacter, Serratia, among others. With these results was also observed differences in bacterial communities compared the different sites analyzed. Some genera were unique to each site, which shows a difference in bacterial community according to the soil type (ADE and ADJ) and its use (FS and CULT), and the ADE soils showed a higher amount and number of phylotypes potentially degrading than the ADJ sites which demonstrates the immense potential of ADE soils in bacteria processes with biotechnological importance. The clone libraries and pyrosequencing of catabolic bph gene showed greater diversity and species richness at TPI sites when compared to ADJ sites. The abundance of this gene determined by quantitative PCR showed a greater number of copies of this gene in TPI soils compared to ADJ soils. The results of the microcosms allowed observing changes in the community structure of bph gene after incubation of soil. In this study it was observed a rise in the number of catabolic gene copies after the incubation. Generally this work demonstrated the potential of ADE soils for functional diversity study of catabolic genes and allowed to observe that the diversity of this gene is more influenced by soil type (ADE or ADJ) than by land uses (secondary forest or agricultural cultivation)
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Estruturas das comunidades e caracterizações metabólicas de leveduras em solos de Terra Preta Antropogênica / The communities structures and metabolic characterizations of yeasts in Anthropogenic Dark Earth soilsAdemir Durrer Bigaton 30 August 2010 (has links)
A Terra Preta Antropogênica (TPA) é considerada um dos solos mais férteis do mundo, constituída de pequenas faixas e distribuídos aleatoriamente pela região Amazônica. Sua denominação é decorrente da presença de grupos pré-históricos que viveram nestes sítios arqueológicos ao longo dos rios da Amazônia, principalmente Central e Oriental. A grande quantidade de material deixado por esses grupos indígenas como fragmentos cerâmicos, carvão, artefatos líticos, restos de animais e vegetais promoveu uma elevada concentração de matéria orgânica, fósforo, cálcio, magnésio, manganês e zinco. Contudo, pouco se conhece sobre a diversidade e funcionalidade microbiana na TPA sendo; tal conhecimento fundamental para auxiliar na formação e manutenção destes solos, levando ao desenvolvimento de práticas sustentáveis de agricultura que conservem a biodiversidade. Dentre os microrganismos, as leveduras apresentam um papel de destaque na indústria e mesmo no ambiente. Este grupo esta correlacionado a processos fermentativos de diversos tipos de açúcares, produção de vitaminas, enzimas, lipídeos e polissacarídeos. Além disso, sua presença em solos é diversificada e variável quanto à abundância e espécies presentes. O objetivo deste trabalho foi avaliar as estruturas das comunidades de leveduras presentes nos solos de TPA, compará-las com as suas adjacências e correlacionar a possíveis diferenças apresentadas com os atributos químicos do solo. Além disso, testes metabólicos para o consumo de carboidratos e produção de micotoxinas foram efetuados buscando uma melhor compreensão da funcionalidade das leveduras nos ambientes estudados. No isolamento foram identificadas 13 espécies na TPA, 9 nos solos adjacentes e seis comuns ao dois ambientes. As leveduras dos solos adjacentes demonstraram-se capazes de consumir um maior número de carboidratos distintos, especialmente: amido, celobiose e L-arabinose. Na análise de DGGE as comunidades de TPAs apresentaram-se distintas e com maiores índices de diversidade e riqueza, quando comparadas aos seus solos adjacentes. Atributos químicos do solo como: P, matéria orgânica (MO), soma de bases (SB), Al, K, Fe e Mg foram determinantes para a diferenciar as comunidades de leveduras dos solos adjacentes e da Terra Preta. Os resultados permitiram concluir que a comunidade de leveduras presentes nos diferentes sítios de TPA e adjacência são diferentes na sua estrutura e diversidade de espécies, estando isto correlacionado as distintas propriedades químicas dos solos estudados / Anthropogenic Dark Earth (ADE) is considered one of the most fertile soils of the world, consisting in small areas and randomly distributed throughout the Amazonian region. Its name derives from the presence of prehistoric groups who lived in these archaeological sites along the Amazonian rivers, mainly Central and Eastern. The large amount of material left by these indigenous groups as pottery fragments, charcoal, lithic artifacts, the remains of animals and vegetables promoted a high concentration of organic matter, phosphorus, calcium, magnesium, manganese and zinc. However, little is known about the microbial diversity and functionality in ADE being this, fundamental to the knowledge of the formation and maintenance of these soils, leading to the development of sustainable farming practices that conserve the biodiversity. Among the microorganisms, the yeasts have interesting functionalities in the industry and even the environment. This group is correlated with fermentation processes of the several kinds of sugars, production of vitamins, enzymes, lipids and polysaccharides. Furthermore, its presence in soil is diverse and variable in abundance and species presence. The aim of this study was to evaluate the structures of the yeast communities present in the soil of ADE, to compare them with their surroundings and to correlate possible differences presented with the soil chemical properties. In addition, tests for metabolic consumption of carbohydrates and mycotoxin production were performed, seeking a better understanding of the yeast functionality in this study. In isolation were identified 13 species in the ADE , 9 in adjacent soil and six were common to both environments. Yeasts presents in adjacent soils shown are able to consume more distinct carbohydrates, especially: starch, cellobiose and L-arabinose. In DGGE analysis, the communities of ADE presented distinct and with higher levels of diversity and richness when compared to their adjacent soils. Soil chemical attributes as: P, organic matter (OM), total bases (SB), Al, K, Fe and Mg were determinates to differentiate yeast communities of adjacent soils and ADE. The results showed that yeast community in the different sites of ADE and adjacency are different in structure and diversity of the species, being this correlated to the different chemical properties found in these soils
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Comunidades bacterianas e metanotróficas da Terra Preta da Amazônia sob atmosfera enriquecida com metano / Bacterial and methanotrophic communities of Amazonian Dark Earth under methane enriched atmosphereMarília Hauck Reichert 20 March 2015 (has links)
Os microrganismos são responsáveis por diversos processos biológicos essenciais ao ambiente, sendo estes intimamente relacionados com as taxas de decomposição da matéria orgânica e com a persistência da fertilidade nos solos. Apesar da importância e grande diversidade, a identificação de táxons envolvidos em processos específicos está geralmente restrita a uma pequena fração da microbiota que pode ser isolada e cultivada. Sendo assim, pouco se sabe sobre os microrganismos que atuam no ciclo do carbono no solo, como, aqueles que participam da oxidação do metano (CH4), por exemplo. Estes, chamados metanotróficos exercem papel importante no controle da emissão desse gás de efeito estufa para a atmosfera podendo servir como um filtro de metano e mitigar suas emissões. A Terra Preta Antropogênica (TPA) é um importante ecossistema na região amazônica e contém fragmentos cerâmicos e frações orgânicas, como o carvão (biocarvão), que foram incorporados em períodos pré-colombianos. Isso resultou em solos sustentáveis com elevada fertilidade, apresentando cerca de três vezes mais matéria orgânica, setenta vezes mais biocarvão e diversidade microbiana maior quando comparados com os solos adjacentes. Com o presente trabalho, objetivou-se avaliar o efeito do enriquecimento atmosférico com metano sobre a abundância da comunidade bacteriana total e de metanotróficas nos solos de Terra Preta da Amazônia sob floresta e cultivo (TPA Floresta e TPA Cultivada) e seus respectivos solos adjacentes (ADJ Floresta e ADJ Cultivado), coletados Estação Experimental do Caldeirão (Iranduba, AM). Para tanto, foi realizado um experimento de microcosmo no qual os solos foram incubados com atmosfera contendo 10% de metano e meio de cultura NMS (do inglês, Nitrate mineral salts), utilizado para crescimento de metanotróficas, a fim de avaliar a resposta dessas comunidades ao longo de 21 dias. A variação da concentração de metano na atmosfera dos frascos foi monitorada através de cromatografia gasosa e o DNA do solo recuperado nos tempos de coleta durante o experimento foi extraído para utilização na técnica de PCR quantitativo (qPCR), a qual possibilitou a quantificar o número de cópias dos genes 16S rRNA Bacteria e pmoA nas amostras. O solo de Terra Preta da Amazônia se mostrou um potencial dreno de CH4 atmosférico Comparando as respostas dos solos com floresta (TPA Floresta e ADJ Floresta) e cultivados (TPA Cultivada e ADJ Cultivado), notou-se uma menor variação da abundância da comunidade metanotrófica presente nestes últimos, o que indica que alteração do uso do solo afeta a capacidade do mesmo em retirar metano da atmosfera. Os solos Adjacentes apresentaram resposta diferente dos solos de TPA, indicando que a história de formação, ocupação e uso do solo também influenciam na capacidade do solo em drenar o metano da atmosfera. / Microorganisms are responsible for several biological processes essential to the environment, which are closely related to the rates of decomposition of organic matter and with the persistence of fertility in soils. Despite the importance and high diversity, identification of taxa involved in specific processes is usually restricted to a small fraction of the microbiota that can be isolated and cultivated. Thus, little is known about the microorganisms that act on the carbon cycle in the soil, such as those participating in the oxidation of methane (CH4), for example. These, known as methanotrophs play an important role in controlling the emission of greenhouse gas into the atmosphere and may serve as a methane filter and mitigate their emissions. Amazonian Dark Earth (ADE) is an important ecosystem in the Amazonian region and contains ceramic fragments and organic amendments, such as charcoal (biochar), which were incorporated in Pre-Columbian periods. This resulted in sustainable soils with high fertility, presenting about three times more organic matter, seventy times more biochar and higher microbial diversity when compared to adjacent soils. The present work aimed to evaluate the effect of atmospheric methane enrichment on the abundance of the bacterial and methanotrophic community in ADE soils under forest and cultivation (ADE Forest and ADE Cultivated) and their respective adjacent soils (ADJ Forest and ADJ Cultivated), sampled at Caldeirão Experimental Station (Iranduba, AM). For this purpose, a microcosm experiment was performed in which the soils were incubated under an atmosphere containing 10% of methane and NMS (Nitrate mineral salts) culture medium used for methanotrophic growth in order to evaluate the response of these communities over 21 days. The variation of methane concentrations in the atmosphere of the vials was measured by gas chromatography and the soil DNA recovered in the collection time during the experiment was extracted for use in the technique of quantitative PCR (qPCR), which made it possible to quantify the number of copies of 16S rRNA Bacteria and pmoA on samples. The Amazonian Dark Earth soil showed a potential sink for atmospheric CH4. Comparing atmospheric responses of forest soils (ADE Forest and ADJ Forest) and cultivated soils (ADE Cultivated and ADJ Cultivated), noted a minor variation in the abundance of methatroph community in these last, indicating that land use change affects the ability of it to sink the methane atmosphere. Adjacent soils had different responses of ADE soils, indicating that the history formation, occupation and land use also influence the capacity of the soil to drain methane from the atmosphere.
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Uso de técnicas de extração de fósforo em solos antrópicos da AmazôniaPessoa Júnior, Erasmo Sérgio Ferreira 19 August 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-08-19 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The presence of the nutrient phosphorus in the soil can be used as indicators of daily activities or even the ancient fertility evaluation. Found throughout the Amazon basin, the Indian Black Earth or simply Black Earth (BE), a Antrosolo rich in nutrients, particularly phosphorus, has its origin attributed to the deposition of waste materials produced by the ancient peoples of the Amazon. Thus, phosphorus bound to organic matter (Po), iron (PFe), aluminum (PAL), calcium (PCa) and weakly bound (PFL), and consequences of this association on the Mehlich-1, Mehlich-3, Olsen and Bray-1 were studied in eight sites of BE in the State of Amazonas. The influence of extraction time on the four methods was also evaluated. Soil samples were collected at a depth of 0-20 cm, in eight sites of BE, distributed in the municipalities of Barreirinha, Itacoatiara, Parintins and Manaus. The soil characterization was done by physical, chemical (pH, organic matter, Na, K, Ca, Mg, Al, Fe, Zn, Mn, Cu), texture (sand, silt and clay) and mineralogical (X-ray diffraction X). The total phosphorus, extracted and fractionated, and the kinetic study were determined by the ascorbic acid. The data were subjected to multivariate statistical analysis by hierarchical clustering (HCA), principal components (PCA) and analysis of variance. Despite the high variability of chemical attributes in all BE, the results show that concentrations of total phosphorus were similar to each other, except to the site Barreirinha. In terms of extracting it was observed that most of
the BE sites obeys the following order: Mehlich-1>> Mehlich-3> Bray-1> Olsen. The sequence observed is directly related to the amount of PCa, although the high levels of Po prevails in almost all the BE. This fact was confirmed by PCA whose main components are PCa and Po and corroborated with the HCA with the formation of three distinct groups. The settings of the equation of desorption kinetics were best for Olsen and Mehlich-1 sites in Manaus and Barreirinha, clearly indicating that both methods depend directly on the extraction time. Finally, the results of this study suggest that the Mehlich-3 and / or Bray-1 are more suitable for studies of fertility, however, the Mehlich-1 to be able to differentiate between the BE itself is more suitable for the archaeological study match. / A presença do nutriente fósforo em solo pode ser usada como indicadoras de atividades cotidianas antigas ou mesmo na avaliação de fertilidade. Encontrada em toda a bacia Amazônica, as Terras Pretas de Índio ou simplesmente Terras Pretas (TP), um Antrosolo rico em nutrientes, principalmente fósforo, tem sua origem atribuída à deposição de restos de materiais produzidos por povos antigos da Amazônia. Dessa forma, o fósforo ligado a matéria orgânica (Po), ferro (PFe), alumínio (PAl), cálcio (PCa) e fracamente ligado (PFL), bem como conseqüências dessa associação sobre os extratores Mehlich-1, Mehlich-3, Bray-1 e Olsen foram estudados em oitos sítios de TP do Estado do Amazonas. A influência do tempo de extração sobre os quatro métodos também foi avaliada. As amostras de solo foram coletadas na profundidade de 0-20 cm, em oito sítios de TP, distribuídos nos Municípios de Barreirinha, Itacoatiara, Manaus e Parintins. A caracterização do solo foi feita por análises físicas, químicas (pH, matéria orgânica, Na, K, Ca, Mg, Al, Fe, Zn, Mn, Cu), textural (areia, silte e argila) e mineralógicas (difração de raios X). O fósforo total, fracionado e extraído, bem como o estudo cinético foram determinados pelo método do ácido ascórbico. Os dados obtidos foram submetidos a análises estatísticas multivariadas por agrupamento hierárquico (HCA), componentes principais (PCA) e análise de variância. Apesar da alta variabilidade dos atributos químicos em todas as TP, os resultados mostram que as concentrações de fósforo
total foram similares entre si, com exceção ao sítio em Barreirinha. Em termos de extratores observou-se que a maioria dos sítios de TP obedece à seguinte ordem: Mehlich-1>> Mehlich-3 > Bray-1 > Olsen. A seqüência observada está diretamente relacionada à quantidade de PCa, muito embora o teor elevado de Po prevaleça em praticamente todas as TP. Esse fato foi comprovado pelo PCA cujas componentes principias são PCa e Po e corroborado com o HCA com a formação de três grupos distintos. Os ajustes da equação de cinética de dessorção foram melhores para Mehlich-1 e Olsen nos sítios de Barreirinha e Manaus, indicando claramente que os dois métodos dependem diretamente do tempo de extração. Por fim, os resultados deste trabalho sugerem que os métodos Mehlich-3 e/ou Bray-1 são mais adequados para os estudos de fertilidade, entretanto o Mehlich-1 por ser capaz de diferenciar as TP entre si é mais adequado para o estudo arqueológico do fósforo.
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Caracterização de fragmentos cerâmicos de Terra Preta de índio.Menezes, Jorge Almeida de 25 July 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-07-25 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The combination of spectroscopy and Fourier transform infrared (FT-IR), XRD and Mössbauer spectroscopy has considerable potential in studying the chemical and physical transformation that occur in ceramic bodies during firing. Ceramic fragment samples from archaeological sites in the Amazon region were collected and submitted to analysis by Mössbauer spectroscopy, X-ray diffraction, infrared spectroscopy and Ramam Fourier transform. The analysis results of X-ray diffraction indicated the presence in extracts magnetic, hematite, iron oxides and quartz, and also detected the presence of a mixture formed by isomorphous titanium oxides. The magnetic spectra of the extracts at room temperature were fitted to two sextets and a doublet. The doublets indicate the presence of hematite or maghemite in superparamagnetic state or the presence of Fe3+ in silicate structure. Mössbauer parameters obtained for Clean Water, Costa Conceicao, Oriximiná Parintins and revealed the existence of maghemite (inner sextet) and hematite (outer sextet). A sextet of procedure for the fragments collected in Iranduba present values of field distribution typical of magnetite. In all spectra the parameters of the doublets are characteristic of paramagnetic Fe3+.The curves of probability distribution of the magnetic field of the ceramic samples are characterized by different profiles, the distribution of hyperfine field shows up between 490 and 512 T in the Mössbauer spectra. The maximum probability hyperfine field distribution existing in the spectra is present in the region of 512 Tesla associated with isomer shift and quadrupole. The distribution of hyperfine field varied considerably in the range 330-520 T. Depending on the piece of archaeological pottery are seen various maximum likelihood. / A combinação da espectroscopia no infravermelho com transformada de Fourier (FT-IR), DRX e Espectroscopia Mössbauer tem um potencial considerável no estudo da química e transformação física que ocorrem nos artefatos cerâmicos, durante a queima. Amostras de fragmentos cerâmicos arqueológicos de sítios da região Amazônica foram coletados e submetidos a análises por Espectroscopia Mössbauer, Difratometria de Raios X, Espectroscopia Ramam e Infravermelho com Transformada de Fourier (IR-FT). Os resultados das análises da difração de raios X indicaram a presença nos extratos magnéticos, hematita, óxidos de ferro magnéticos e quartzo, sendo ainda detectada a presença de uma mistura isomórfica formada por óxidos de titânio. Os espectros dos extratos magnéticos a temperatura ambiente foram ajustados para dois sextetos e um dubleto. Os dubletos indicam a presença de hematita ou maghemita em estado superparamagnético ou a presença de Fe3+ em estrutura de silicatos. Os parâmetros Mössbauer obtidos para Água Limpa, Costa Conceição, Oriximina e Parintins revelaram a existência de maghemita (sexteto interno) e hematita (sexteto externo). Um sexteto interno para os fragmentos coletados em Iranduba apresentam valores de distribuição de campo típico de magnetita. Em todos os espectros os parâmetros relativos a dubletos são característicos de Fe3+ paramagnético. As curvas de distribuição de probabilidade de campo magnético das amostras de cerâmicas caracterizam-se por diferentes perfis, sendo que a distribuição de campo hiperfino apresenta máximo entre 490 e 512 T nos espectros Mössbauer. O máximo de probalidade da distribuição de campo hiperfino existente nos espectros está presente na região de 512 Tesla associada a isômeros e a deslocamento quadrupolar. A distribuição do campo hiperfino variou consideravelmente na faixa 330-520 T. Dependendo do fragmento de cerâmica arqueológica são observados vários máximos de probabilidade.
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Diversidade microbiana e atividade enzimática de fungos provenientes de terra preta antropogênica do Baixo AmazonasCid, Wenderson dos Santos 30 July 2015 (has links)
Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-12-01T21:31:41Z
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Previous issue date: 2015-07-30 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The Anthropogenic Dark Earth (TPA) is presented in the form of small spots randomly distributed, especially in central and eastern Amazon. Denominations, as well as its unique characteristics, are due to human action of indigenous civilizations that lived in these archaeological sites. The large amount of stable organic matter present in these archaeological sites comes from the indigenous dumps where remains of animals, vegetables, fecal waste, human bodies, ceramic fragments, lithic artifacts and pyrogenic carbon were deposited. Among the microorganisms present in this soil, yeasts play a key role in the industry and the environment. This group is correlated with fermentation processes of various types of sugars, production of vitamins, enzymes, extracellular factors micocinogênicos. The objective of this study is to evaluate the diversity of microorganisms in TPA using electrophoresis on denaturing gradient gel (PCR-DGGE), relating the results with the physico-chemical characteristics of the soil. In addition, tolerance test at high temperatures, glucose and ethanol production enzymes and mycotoxins were conducted to select strains with possible biotechnological potential. We obtained 88 (eighty eight) isolated yeast. Of these, none bore the temperature was 50 ° C or tolerant to 50% glucose medium, and five (5) isolates (5.7%) 30% ethanol tolerated in the middle. Of the 88 isolates, thirteen (13) isolates (14.8%) had great activity for the production of amylase activity, 25 (twenty five) isolates (22%) were strongly positive for production caseinase and thirteen (13) isolates (14.8%) had great activity for the production of gelatinase. Still, 66 (sixty-six) isolates (75%) were positive for production of the enzyme cellobiase and (55.7%) were positive for esterase enzyme. To evaluate the mycocinogenic activity, 88 isolates were tested against strains of Candida krusei and Candida albicans. No isolate showed activity against C. krusei and 22 (twenty two) isolates (25%) showed activity against C. albicans. A 16S rRNA region (V6-V8 region) was sequenced for identification of prokaryotic and 18S rRNA region and the internal transcribed spacer (ITS) for identifying eukaryotes. The PCR-DGGE profiles of 18S rRNA region and ITS identified genera of yeast and filamentous fungi. The genera found for bacteria were Bacillus, Klebsiella, Pantoea, Enterobacter, Lactobacillus, Escherichia, Leuconostoc and actinomycetes, as Streptomyces and Mycobacterium. In fungal community, we observed the presence of Zygosaccharomyces, Lachancea, Saccharomyces, Cladosporium, Candida, Penicillium and Zygomycetes ascomycetes and uncultured. The pH value of the soil was 6.2. The soil had high levels of minerals, sodium except for (not detected) and aluminum (~ 0.1 cmol / dm3). The organic matter was found at a concentration of 3.84 dag / kg. Some groups of microorganisms had not been previously associated with soil TPA. Microbial diversity observed associated with chemical results demonstrate that high fertility of the soil, suggest that the same can be a source of microorganisms of interest. / A Terra Preta Antropogênica (TPA) apresenta-se na forma de pequenas manchas distribuídas aleatoriamente, sobretudo na Amazônia Central e Oriental. Sua denominação, bem como suas características únicas são decorrentes de ação antrópica de civilizações indígenas que viveram nestes sítios arqueológicos. A grande quantidade de matéria orgânica estável presente nestes sítios arqueológicos é oriunda das lixeiras indígenas onde restos de animais, vegetais, dejetos fecais, corpos humanos, fragmentos cerâmicos, artefatos líticos e carvão pirogênico foram depositados. Dentre os microrganismos presentes neste solo, as leveduras desempenham papel fundamental na indústria bem como no ambiente. Este grupo está correlacionado a processos fermentativos de diversos tipos de açúcares, produção de vitaminas, enzimas, e fatores extracelulares micocinogênicos. O objetivo deste trabalho é avaliar a diversidade de microrganismos presentes na TPA através de eletroforese em gel de gradiente desnaturante (PCR-DGGE), relacionando os resultados com as características físico-químicas do solo. Além disso, testes de tolerância a altas temperaturas, glicose e etanol, produção de enzimas e de micotoxinas foram realizados buscando selecionar isolados com possível potencial biotecnológico. Foram obtidos 88 (oitenta e oito) isolados leveduriformes. Destes, nenhum suportou a temperatura de 50ºC ou foi tolerante a 50% de glicose no meio, e 5 (cinco) isolados (5,7%) toleraram 30% de etanol no meio.Dos 88 isolados, 13 (treze) isolados (14,8%) apresentaram atividade amilolítica, 25 (vinte e cinco) isolados (22%) foram fortemente positivos para produção de caseinase e 13 (treze) isolados (14,8%) apresentaram atividade ótima para a produção de gelatinase. Ainda, 66 (sessenta e seis) isolados (75%) foram positivos para a produção da enzima celobiase e 49 (quarenta e nove) isolados (55,7 %)foram positivos para enzima esterase. Para avaliar a atividade micocinogênica, os 88 isolados foram testados frente a cepas de Candida krusei e Candida albicans. Nenhum isolado apresentou atividade frente a C. krusei e 22 (vinte e dois) isolados (25%) apresentaram atividade frente a C. albicans. A região 16S do rRNA (região V6-V8) foi sequenciada para a identificação de procariotos e a região 18S do rRNA e do espaçador interno transcrito (ITS) para a identificação de eucariotos. Os perfis de PCR-DGGE da região 18S do rRNA e ITS identificaram gêneros de leveduras e fungos filamentosos. Os gêneros encontrados para bactérias foram: Bacillus, Klebsiella, Pantoea, Enterobacter, Lactobacillus, Escherichia, Leuconostoc e actinobactérias, como Streptomyces e Microbacterium. Na comunidade fúngica, foi observada a presença de Zygosaccharomyces, Lachancea, Saccharomyces, Cladosporium, Candida, Penicillium e ascomicetos e zigomicetos não cultiváveis. O valor de pH do solo foi de 6,2. O solo apresentou importantes níveis de minerais, com exceção de sódio (não detectado) e alumínio (~0,1 cmol/dm3). A matéria orgânica foi encontrada na concentração de 3,84 dag/kg. Alguns grupos de microrganismos ainda não haviam sido previamente associados com solo de TPA. A diversidade microbiana observada associada aos resultados químicos que demonstram fertilidade elevada deste solo indicam que o mesmo pode ser fonte de microrganismos de interesse.
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Avaliação da Fertilidade de Solos Antrópicos (Terra Preta de Índio) com ênfase na Biodisponibilidade do Fósforo.Silva, Ana Cristina Souza da 30 August 2006 (has links)
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Previous issue date: 2006-08-30 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Upland soils in the humid tropics such as in the Amazon are highly weathered and therefore possess low plant available nutrient content. However, Amazonian Dark Earths
(ADE) of prehistoric origin are differentiated from Oxisol and Ultisol by their darker color, higher organic matter content, higher pH, greater total phosphorus (P) content, greater
exchangeable calcium (Ca) and magnesium (Mg), and increased minor element concentrations.
A greenhouse experiment was carry out at the National Institute for Amazon Research, Manaus, AM, Brasil, to evaluate the fertility variability and the phosphorus
bioavailability of the Amazon Dark Earth and surrounding soils. Corn (Zea mays L.) and Cowpea (Vigna unguiculata L. (Walp) were planted in continnuos crops in pots with four kg
of soils collected from three sites (Açutuba Cost (Lat. 3º 30 S e Long. 60º 20 WGr.); Laranjal Cost (Lat. 3º 30 S e Long. 60º 40 WGr.); and Rio Preto da Eva (Lat 3º S e Long.
59º WGr.) farmers), two soils per sites (Amazon dark earth and Surrounding soil), and watered with minus phosphorus nutrient solution and watered with distilled water to field
capacity, following a randomized factorial design (3x2x2) with 12 treatment and four replication, totaling 48 pots. The nutrient solution was applied to supply the nutrient minus P,
giving a bioassay of P bioavailability for the different soil location and depths. Entire plants were harvested at the end of 45 days and total dry matter of shoots, roots and total nutrients uptake by plants were measured. Additionally soil fertility variability and phosphorus fractionation was done after Corn and Cowpea harvested.
The results showed that Amazon Dark Earth soils are inherently more fertile by contrasting the growth and nutrient accumulation in the water only pots. However, The
treatment Amazon Dark earth watered with only distilled water presented some limitation concerning the potassium, and zinc, in some cases affecting the plant growing, and also the soil fertility analysis presented nutritional desequilibrium. In on another hand, those treatment that received nutrient solution minus phosphorus showed increased on growth and nutrient uptake by Corn only. The results also showed that part of P available in the soil was, probably, immobilized by some minor elements such as zinc, iron of the nutrient solution.
Regarding the phosphorus soil pool was observed high amounts of aluminium phosphate in all treatment studied, this results suggested that the higher sources of p available
and ca exchangeable would be the calcium phosphate. / Os solos de terra firme do trópico úmido, tais como os solos da Amazônia são altamente intemperizados e conseqüentemente apresentam baixo conteúdo de nutrientes
disponíveis para as plantas. Entretanto, as Terras Pretas de índio da Amazônia , de origem pré-histórica, são diferentes dos Latossolos e Argissolos, por apresentarem coloração muito
escura , alto teor de matéria orgânica, elevado pH e alto teor de cálcio, magnésio trocáveis e alguns micronutrientes. Um experimento em casa de vegetação foi conduzido no Instituto
Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus-Am-Brasil, com o objetivo de avaliar a variabilidade na fertilidade e a biodisponibilidade do fósforo em amostras de Terra Preta e
Solos Adjacentes. Milho e caupi, foram plantados em cultivos contínuos, em vasos com 4 kg de solo coletados de 3 sítios (Costa do Açutuba (Lat. 3º 30 S e Long. 60º 20 WGr.); Costa
do Laranjal (Lat. 3º 30 S e Long. 60º 40 WGr.); e Rio Preto da Eva (Lat 3º S e Long. 59º WGr.), dois solos por sítio (Terra Preta e Solo Adjacente) e irrigados com solução nutritiva
menos fósforo e irrigado com água até atingir a capacidade de campo, seguindo um delineamento inteiramente casualizado em esquema fatorial 3x2x2 com 12 tratamentos e 4
repetições totalizando 48 unidades experimentais. A solução nutritiva foi aplicada para todos os nutrientes menos fósforo, possibilitando uma bioanálise da biodisponibilidade do fósforo
dos solos coletados nos diferentes sítios e profundidades. As plantas foram colhidas quando completaram 45 dias de idade, a matéria seca total da parte aérea e do sistema radicular e o
total de nutrientes absorvido pelas plantas foram medidos, adicionalmente a variabilidade na fertilidade do solo e o fracionamento do fósforo foram avaliados após a colheita do milho e do caupi. Os resultados mostraram que as Terras Pretas, são mais férteis quando se comparou o
crescimento e acumulo de nutrientes dos tratamentos que receberam somente água. No entanto os tratamentos com Terra Preta que foram irrigados somente com água apresentaram limitações com relação a nutrientes como o potássio e o zinco, o que em alguns casos afetou o
desenvolvimento das plantas e causou um desbalanço nutricional. Por outro lado, nos tratamentos que foram irrigados com solução nutritiva menos fósforo o crescimento das plantas de milho e a absorção de nutrientes pelas mesmas foi maior. Os resultados também mostraram que parte do fósforo disponível nos solos, provavelmente, foram imobilizados por alguns elementos menores como o Zn e o Fe, presentes na solução nutritiva. Com relação ao
estoque de fósforo nos solos, foi observado um predomínio do fosfato de alumínio em todos os tratamentos estudados, o que sugere que a fonte primária dos elevados níveis de fósforo e cálcio nas Terras Pretas seja o fosfato de cálcio.
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Área de interface ceramista pretérita: a coleção arqueológica José Alberto NevesSilva, Carlos Augusto da 04 March 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-03-04 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This work deals with the analysis of the Archaeological Collection José Alberto Neves, which
is unprecedented and composed of about twenty-five to thirty-five thousand pieces. The
collection is headquartered in Urucurituba-AM; it is private, and the collector keeps the pieces
in an area of his residence. The objective was to inventory it and make it available in a digital
database and publication reference book to be approved by the governing body of the
Brazilian archaeological heritage. The Amazon, for its territorial area and by being in the
largest rainforest in the world and also for having the largest river basin and the major
navigable rivers, enabled that the preterit human societies could be able to create alternatives
to cultivate large numbers of products to the their feed. In addition, environmental conditions
allowed that in the last two millennia there could be huge human settlements in the Amazon.
Among the various alternatives to adapt to the environment, hot and humid, the ceramic
industry was perhaps a useful tool for the sustainability of settlements. For the analysis of the
collection, we used the systemic method of spiral, because the ceramic had certain functions
within societies that interacted on the banks of rivers. From the analysis, we deduced that the
colors of the ceramics could be associated with the tattoos or paintings on the bodies of the
natives. They are descriptions that were made by naturalists who have been in the area during
the nineteenth century. Moreover, those paintings are present in the fauna of the region.
Finally, the ceramics was used in daily life and for the funeral events during a long period, in
the area of the Middle Amazonas River and its tributaries. Therefore the archaeological
researches and the ethnographic literatures have been discovering gradually the way of life of
the indigenous pre-Columbian societies. / Este trabalho versa sobre a análise da Coleção Arqueológica José Alberto Neves, a qual é
inédita, composta de cerca de vinte e cinco a trinta e cinco mil peças. A coleção está sediada
na cidade de Urucurituba-AM; é particular, e o colecionador acondiciona as peças numa área
de sua residência. O objetivo foi inventariá-la e disponibilizá-la em banco de dados digital e
em publicação de catálogo de referência para que seja chancelada pelo órgão gestor do
patrimônio arqueológico brasileiro. A Amazônia, pela sua área territorial e pelo fato de estar
na maior floresta tropical do planeta, além de possuir a maior a bacia hidrográfica e os
maiores rios navegáveis, possibilitou que as sociedades humanas pretéritas criassem
alternativas para cultivar elevados números de produtos para a dieta alimentar. Ademais, as
condições ambientais proporcionaram que nos dois últimos milênios houvesse enormes
assentamentos humanos por toda parte da Amazônia. Dentre as várias alternativas para se
adaptarem ao ambiente, quente e úmido, a indústria cerâmica foi talvez uma ferramenta útil
para a sustentabilidade dos assentamentos. Para a análise da coleção, utilizou-se o método
espiralado sistêmico, pelo fato de que as cerâmicas tinham determinadas funções dentro das
sociedades que interagiam às margens dos rios da região. Da análise, chegou-se a inferir que
as cores encravadas nas cerâmicas poderiam estar associadas às estampas nas tatuagens ou nas
pinturas dos corpos dos indígenas. Trata-se de descrições que foram realizadas pelos
naturalistas que estiveram na região, durante o século XIX. Outrossim, essas pinturas estão
presentes na fauna da região. Por fim, a cerâmica era utilizada no cotidiano e para os eventos
fúnebres, por longo período, na área do médio rio Amazonas e seus tributários. Com isso, as
pesquisas arqueológicas e a literatura etnográfica vêm desvendando paulatinamente o modo
de vida das sociedades indígenas pré-colombianas.
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Na direção das periferias extremas da Amazônia: arqueologia na bacia do rio Jiparaná, Rondônia / On the direction of the Amazonian southwest periphery: archaeology in the Jiparaná basin, RondoniaCarlos Augusto Zimpel Neto 07 April 2009 (has links)
O trabalho intitulado Na direção das periferias extremas da Amazônia: arqueologia na bacia do rio Jiparaná-RO tem como objetivo debater tópicos específicos da arqueologia no estado de Rondônia, as evidências cerâmicas e a Terra Preta Arqueológica. Isto para podermos ter uma melhor compreensão da ocupação do Sítio Encontro, objeto de estudo desta dissertação. O sítio litocerâmico Encontro (RO-MA-05) localiza-se na direção das áreas periféricas do sudoeste amazônico. Situado no município de Ministro Andreazza, está inserido na serrania da Providência, adjacente a planície de inundação do rio Jiparaná, Rondônia. Trata-se de um assentamento pequeno, considerando os padrões amazônicos que até o momento atesta a mais antiga manifestação de terra preta arqueológica associada a vestígios cerâmicos na Amazônia. Buscando trazer dados antes pouco debatidos (principalmente a produção do arqueólogo Eurico Miller) é que propomos a retomada dos estudos na região, com auxilio de informações e dados somente agora disponíveis e que podem remeter a área do sudoeste amazônico como importante ponto de averiguação de questões que abarcam as primeiras expansões dos grupos Tupi e as origens da agricultura / This dissertation, On the direction of the Amazonian southwest periphery: archaeology in the Jiparaná basin, Rondonia, has as aim objective discuss some aspects found in the archeology of Rondonia State: pottery production and the Archaeological dark earth. Made this, we can have a better comprehension of the occupation of the Encontro archaeological site, object of study in our research. The Encontro site has evidence of litic and pottery sherds, and is located in the direction of the Amazonian southwest periphery, in Ministro Andreazza city, Rondonia State. Comparing to other samples of Amazonian archeological sites, this is a small place, but has the oldest evidence of archeological dark earth associated with ceramic known until now in Amazon. In pursuit of take again in the discussion the data available for the area(until now not too much discussed, mainly the papers of the archeologist Eurico Miller) is that we propose bring back the study of this region, aided by data just now available that refer the Amazonian southwest as an important point of discussion on questions that involve the firsts Tupi expansions and the origins of agriculture
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A coisa ficou preta: estudo do processo de formação da Terra Preta do sítio arqueológico Jabuticabeira II / Formation process of black earth in shellmound Jabuticabeira IIPaula Nishida Barbosa 02 July 2007 (has links)
Por volta de 1900 BP houve uma brusca mudança na composição das camadas do sambaqui Jabuticabeira II. As camadas até então compostas por uma predominância de conchas passam a apresentar uma ausência quase total de material conchífero, tornando-se mais terroso e muito escuro (Terra Preta). O objetivo deste trabalho é fornecer dados para a compreensão deste processo de formação da Terra Preta no sítio Jabuticabeira II e investigar os motivos de tais mudanças. A nossa análise será realizada a partir do ponto de vista zooarqueológico, tentando observar, em detalhes, os componentes faunísticos das camadas. / These research has as objetive the comprehension of the changes in the formation process of a shellmound Jabuticabeira II, Santa Catarina South-coast Brazil. The layers built with shells start to change, in 1900 BP, and the constrution becomes composed by black earth. Our aim is provide datas to understand this process by zooarchaeological point of view.
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