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Caractérisation d'antiviraux contre divers Bunyaviridae, criblage, validation et étude du cap-snatching et les mécanismes d'initiation de la transcription du phlebovirus Toscana / Characterization of antivirals against various Bunyaviridae, screening, validation and study of cap-snatching and transcription initiation mechanisms of phlebovirus Toscana

Amroun, Abdennour 21 December 2017 (has links)
Lors d’un crible d’une chimiothèque de ChemBridge (28 500 composés), nous avons identifié deux molécules (T10 et T13), chimiquement très proches, capables d’inhiber la réplication du phlebovirus Toscana (TOSV) (Phenuiviridae) dans des cellules de singe Vero E6. Une recherche d’analogues disponibles commercialement a permis d’identifier le (T101) capable d’inhiber divers virus appartenant à l’ordre des Bunyavirales, mais aussi des flavivirus et des alphavirus. Le large spectre d’activité du T101 suggérait une cible cellulaire que nous avons pu identifier avec son mécanisme d’action potentiel (confidentiel avant dépôt de brevet). En collaboration avec un groupe de chimistes de l’Institut de Virologie de Hambourg (Allemagne), nous avons synthétisé et testé environ 300 analogues structuraux (2D et 3D) de ces molécules en vue d’optimiser l’activité antivirale par une étude SAR (relation structure-activité). Les meilleures molécules (index de sélectivité CC50/IC50> 400) suivant les virus et l’origine de l’espèce cellulaire (humaine, singe et souris), ont été sélectionnées pour des études de leurs propriétés de solubilité, d’absorption, et de stabilité métabolique (ADME-TOX). La molécule la plus active sur cellules murines sera testée lors d’infections expérimentales de souris.En parallèle, j’ai écrit une revue sur la RdRp des Bunyavirales en décrivant sa structure, ses motifs et les différents mécanismes de synthèse des ARN viraux. J’ai également fait une étude sur le mécanisme de vol de coiffe du TOSV. J’ai essayé de construire un système de génétique inverse pour TOSV. Enfin j’ai aussi participé à l’étude de l’évolution du CHIKV dans les cellules d’insectes et de mammifères / We have screened a subset of the ChemBridge chemical library (28,500 compounds) for compounds inhibiting the replication of Toscana phlebovirus (TOSV) (Phenuiviridae family) in Vero E6 primate cell cultures. Tow molecules chemically very close (T10, T13) have been validated as good inhibitors of TOSV replication. The search for commercially available analogs allowed the identification of (T101). This compound is found active against viruses from highly divergent families such as Bunyavirales order, Flavivirus and Alphavirus. We have determined that the target of this compound family is a cellular enzyme (the cellular target and the mechanism of action are confidential). The inhibitors family was further explored through the synthesis, by a group of chemists (Hambourg University, Germany), of about 300 structural analogs in order to optimize the antiviral activity using SAR studies (structure-activity relationship). The most active molecules (selectivity index CC50 / IC50> 400) depending on virus species and origin of cell species (human, monkey and mouse) were selected for studies of solubility, absorption, metabolic stability (ADME-TOX) and pharmacodynamics. The most promising compound that is active in murine cells will be tested in experimentally infected mice.I wrote a review on the RdRp of bunyaviruses describing its structure, motifs and the various mechanisms of viral RNA synthesis. I also made a study on the cap-snatching mechanism and the initiation of transcription of TOSV and tried to develop a reverse genetics system for TOSV. In parallel I also participated in the study of the evolution of Chikungunya virus (CHIKV) in insect and mammalian cells.
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Etude génomique et structurale de virus Toscana (TOSV) / Genomic and structural study of Toscana virus

Baklouti, Amal 12 December 2016 (has links)
La première partie de mon travail a consisté (i) en une étude génomique des souches de TOSV avec séquençage de 10 nouvelles souches afin i) d’enrichir les données disponibles dans Genbank (au début de ce travail, 6 séquences complètes); (ii) d’utiliser les 16 séquences complètes pour définir et évaluer le premier système de typage par technique de RT-q PCR en temps réel afin de discriminer les souches de LA et de LB. Dans la deuxième partie de ce projet, on s’est intéressée à des études structurales et fonctionnelles de la nucléoproteine (N) de TOSV afin d’élucider le mécanisme d’encapsidation d’ARN virale. La N est une protéine de 28 KD, sont rôle majeur est l’encapsidation de l’ARN génomique et sert en tant que co-facteur de la transciption/replication de TOSV. Les études crystallographique de la protéine N , du complexe protéique (N-ARN) ont été déterminé par Olal D et al 2014 au moment que nous avons obtenu la diffraction de crystal de la N sans ARN à 3,7 Å (code PDB: 5FVA). Ces études montrent la protéine N ainsi le complexe (N-ARN) en forme d’un anneau hexamèrique fermé alors encapside l'ARN dans une organisation filamenteux. Nous avons donc décidé de combiner ces résultats avec des études structurales complémentaires en solution , telles que la microscopie électronique (EM) et des études de « Diffusion des rayons X aux petits angles »(SAXS) pour de proposer un modèle décrivant correctement le mécanisme d'encapsidation en solution . Le protéine N se comporte principalement en pentamère déformé et ouvert, qui met en lumière la façon dont nucléoprotéine peut être organisée en filaments. / The first part of my work consisted (i) of genomic sequencing of 10 TOSV strains to increase the total number of complete sequences (at the outset, 6 complete sequences were accessible in Genbank). (ii) to use the 16 sequences to design and evaluated the first lineage-specific real-time RT-PCR assay (Lisp-TOSV) to discriminate between strains of lineages A and B Complete sequencing of the 10 strains was achieved. The second part of this project was dedicated for structural and functional studies of the TOSV N protein in order to decipher viral RNA encapsidation. TOSV Nucleoprotein (N) is a protein of 28 KD, is encapsidating the viral RNA genome and serves as a co-factor the RNA trancription/replication. The crystal structures of TOSV N protein , and the complex N-RNA were already determined (Olal D and al; 2014) while we just obtained diffracting crystal of the N free RNA at 3,7 Å (PDB code : 5FVA ). Crystallographic structures show an hexameric rings whereas N encapsidates the RNA in a filamentous organization. We therefore decided to combine these results with complementary studies, such as electron microscopy (EM) and samll angle X-ray scattering to build a low resolution structure model in solution describing properly the encapsidation mechanism. The N behaves mainly as an opened, deformed pentamer that shed light on how the N can be organized in filaments.
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Le virus Toscana : épidémiologie en région PACA-Corse et interaction avec la réponse immunitaire innée

Brisbarre, Nadège 21 February 2012 (has links)
Le virus Toscana : épidémiologie en région PACA-Corse et interaction avec la réponse immunitaire innée Le Toscana Virus (TOSV) est un arbovirus (arthropod-borne virus) qui appartient au genre Phlebovirus (famille des Bunyaviridae). Il est transmis par la piqûre d'un insecte hématophage, le phlébotome (Phlebotomus perniciosus et P. perfiliewi), piquant notamment l'homme. Le vecteur P. perniciosus est présent en France en forte densité sur le littoral méditerranéen. TOSV est endémique en France (isolé à partir de phlébotomes ou de sujets contaminés) et dans de nombreux pays frontaliers. TOSV est associé à des infections humaines généralement bénignes spontanément résolutives, la plupart des infections étant asymptomatiques ou pauci-symptomatiques. Toutefois, dans certains cas, le virus est à l'origine d'inflammations graves du système nerveux central (méningites ou méningo-encéphalites), nécessitant une hospitalisation. TOSV est ainsi l'un des agents viraux les plus fréquemment associés aux infections neuroméningées chez l'homme d'avril à octobre, lorsque les conditions météorologiques sont les plus favorables à l'activité du vecteur. Ce travail aborde deux aspects de l'infection à TOSV : un aspect épidémiologique et un aspect fondamental sur la relation entre l'immunité innée cellulaire et TOSV. L'étude épidémiologique est la première réalisée dans les régions PACA-Corse chez les donneurs de sang. Celle-ci a mis en évidence une prévalence IgM/IgG de 14% (allant de 7,8 % dans la Hautes Alpes à 18,8% dans les Alpes Maritimes). La prévalence des IgM est de 3,3% pour l'ensemble des départements, avec la valeur la plus élevée pour la Corse (8,7%). / Toscana Virus (TOSV) is an arbovirus (arthropod-borne virus) which belongs to the genus Phlebovirus (family Bunyaviridae). It is transmitted to humans by the bite of a blood sucking sandfly (Phlebotomus perniciosus and P. perfiliewi). The vector P. perniciosus is present in high densities in France on the Mediterranean coast. TOSV is endemic in France (isolated from sandflies or contaminated patients) and in neighbouring countries. When weather conditions are most favorable to the vector activity (April-October), TOSV causes asymptomatic or mild (flu-like symptoms) infections in humans. However, in some cases, the virus can be can be responsible for a severe inflammation of the central nervous system (CNS) resulting in meningitis or meningoencephalitis, requiring hospitalization. This work focused on two aspects of TOSV infection: the epidemiology of the virus in the south area of France and the relationship between innate immunity and TOSV. The epidemiological study was the first conducted in the PACA-Corse area among blood donors. Our results showed a mean seroprevalence of 14% IgM / IgG ranging from 7.8% in the Hautes Alpes to 18.8% in the Alpes Maritimes. The mean IgM seroprevalence was 3.3%, with the highest value for Corsica (8.7%). The results demonstrated that a large population of blood donors was once infected with TOSV, suggesting a potential transfusion risk. The second study focused on a more fundamental aspect of TOSV infection: the interaction between the virus and the interferon-β response (IFN-β). We demonstrated that TOSV replication is sensitive to IFN-β treatment but the virus is able to inhibit the induction of IFN-β.
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Emerging phleboviruses around Mediterranean : epidemiology, virus discovery, and human transmission aspect

Bichaud, Laurence 23 January 2013 (has links)
Les phlébotomes sont les vecteurs reconnus de plusieurs arbovirus, en particulier du genre Phlebovirus, ainsi que de parasites du genre Leishmania. Les infections par les phlébovirus sont responsables chez l’homme de maladies décrites depuis longtemps, pourtant ils demeurent méconnus, avec en particulier un manque de données épidémiologiques et d’outils de diagnostic.Dans une première partie, des études de séroprévalence nous ont permis d’aborder l’impact en santé publique, dans le sud-est de la France, de deux phlébovirus connus pour leur pouvoir pathogène chez l’homme, Toscana virus (TOSV) et Sandfly fever Sicilian virus (SFSV). Pour ce dernier, des anticorps spécifiques (IgG) ont été détectés dans moins de 1% des sérums testés, ce qui suggère que SFSV joue un rôle mineur dans les pathologies humaines de cette région ; ces résultats sont corroborés par l’absence, durant ces dernières décennies, de cas documentés d’infection aigüe due à SFSV en Europe occidentale. Nous avons donc pu concentrer notre travail sur le deuxième groupe de phlébovirus d’intérêt chez l’homme, le groupe des Sandfly fever Naples virus, qui inclut notamment TOSV. Nous avons démontré l’existence d’un lien épidémiologique entre les infections à Leishmania infantum et celles à TOSV, certainement dû au fait que ces pathogènes sont transmis par un vecteur commun (Phlebotomus perniciosus). Les analyses statistiques ont montré que les personnes exposées aux infections à TOSV ont plus de chance d’être aussi infectées par les parasites leishmanies (et vice versa). En admettant que ce lien épidémiologique entre leishmanioses et infections à TOSV est représenté par l’exposition à la piqûre d’un vecteur commun, cette étude confirme l’implication de Phlebotomus perniciosus en tant que vecteur principal de TOSV dans le sud de la France. Cette étude suggère également que certaines données épidémiologiques disponibles pour la leishmaniose pourraient être utilisées pour décrypter l’épidémiologie des infections à TOSV.La deuxième partie de cette thèse est consacrée à la détection, l’isolement et la caractérisation de virus, déjà connus ou inconnus, dans les populations de phlébotomes en France et en Afrique du Nord. Pour atteindre cet objectif, nous avons dû développer une plateforme d’analyse à au débit, adaptée pour la découverte de virus dans les phlébotomes, qui permette de traiter un grand nombre d’échantillons à faible coût. Cette plateforme a récemment été complétée par un outil de Next Generation Sequencing, afin de réaliser la caractérisation génétique complète des virus isolés et découverts. Au total, 12 576 phlébotomes ont été capturés au cours de 12 campagnes de capture menées en France, en Tunisie et en Algérie. Au sein d’une même zone géographique, la découverte de plusieurs nouveaux phlébovirus, ainsi que leur taux d’infection observé dans les populations de phlébotomes, ont démontré que la diversité de phlebovirus est bien plus importante qu’attendue.Dans la troisième partie de cette thèse, une étude de séroprévalence a été menée sur des sérums humains en utilisant des tests comparatifs de neutralisation de virus. Cette étude nous a permis d’exclure le virus Punique, récemment découvert, de la liste des principales menaces en santé publique au nord de la Tunisie, et de confirmer que TOSV est le principal phlebovirus pathogène ayant un impact en santé publique dans cette région du pays. Cette méthode de neutralisation est capable d’identifier précisément, parmi des virus génétiquement proches, le virus contre lequel les anticorps présents dans le sang ont été produits, ce qui permet de déterminer la capacité de chacun de ces virus à jouer un rôle en santé publique. / Sandflies are vectors of various arthropod-borne viruses, in particular viruses within the genus Phlebovirus, family Bunyaviridae, and of parasites in the genus Leishmania. Human diseases caused by infection with sandfly-borne phleboviruses are known for a long time, but they remain neglected due to the lack of epidemiological knowledge and of diagnostic tools.The first part consisted of seroprevalence studies in human sera to address the public health impact in south-eastern France of two recognized sandfly-borne phleboviruses, namely Toscana virus (TOSV) and Sandfly fever Sicilian virus (SFSV). Concerning the latter, specific IgG were detected in less than 1% of tested sera, suggesting that SFSV play a minor role in human disease in the region; this finding was corroborated with the lack of documented case of acute infection due to SFSV in Western Europe during the last decade. This pleaded for focusing on the other group of sandfly fever viruses known for their human interest, namely the group of Sandfly fever Naples virus that includes TOSV. We demonstrated an existing epidemiological relationship between Leishmania infantum and TOSV infections, presumably through the transmission by the common arthropod vector (Phlebotomus perniciosus). Statistical analysis showed that persons exposed to TOSV infection are at greater risk of being infected with Leishmania parasite (and vice versa). Assuming that epidemiological link between leishmaniasis and TOSV infection may be represented by the exposure to the bite of a common vector, this study confirms the involvement of Phlebotomus perniciosus as the major vector of TOSV in the South of France. This study also suggests that some of the epidemiological data available on Leishmaniasis may be used to decipher the epidemiology of TOSV infections..The second part of this thesis was dedicated to detection, isolation and characterization of existing and/or new phleboviruses in sandfly populations in France and in North Africa. To achieve this aim, we had to set up a high-throughput cost-effective platform amenable to virus discovery in sandflies; this sandfly-processing platform has been recently docked to a Next Generation Sequencing platform for full genetic characterization of newly isolated and discovered viruses. A total of 12,576 sandflies were trapped during 12 campaigns conducted in France, Tunisia and Algeria. The discovery of several new phleboviruses and their observed frequency in sandfly populations has clearly demonstrated that within a given geographic area, virus diversity is much higher than previously believed.In the third part of this thesis, a seroprevalence study based on comparative virus neutralization tests was performed on human sera and allowed to exclude the newly described Punique virus from the list of major public health threats in northern Tunisia, and to confirm that TOSV is the dominant phleboviral pathogen with an impact on public health in this part of the country. This neutralization method is suitable to identify precisely the virus against which antibodues were elicited, allowing to discriminate among closely related phleboviruses, and to determine their propensity to play a role in public health.
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Seroepidemiology of emerging sandly-borne phleboviruses : technical optimization and seroprevalence studies in the Mediterranean basin / Séroépidémiologie des phlebovirus émergents : technique d'optimisation et études de séroprévalence dans le bassin méditerranéen

Alwassouf, Sulaf 01 July 2015 (has links)
Parmi les phlébovirus (famille des Bunyaviridae, genre Phlebovirus), ceux qui sont transmis par les phlébotomes de l'Ancien Monde sont largement distribués dans le bassin méditerranéen. Les infections humaines causées certains de ces phlébovirus sont connues depuis longtemps, mais elles restent tout de même négligées en médecine en raison de l'absence de données épidémiologiques solides (problème des réactions croisées) et d'outils de diagnostic rapides et fiables.La première partie de cette thèse a été consacrée à l'optimisation d'un test de neutralisation du virus pour étudier la séroprévalence de 5 virus, et leur capacité respective à infecter les humains et les animaux.La deuxième partie visait à mesurer la séroprévalence de phlébovirus appartenant aux 3 complexes antigéniques transmis par les phlébotomes dans le bassin méditerranéen (Sandfly fever Naples, Sandfly fever Sicilian et Salehabad). Ces études ont été menées sur des sérums de chiens et de chats en Tunisie, Portugal, Grèce/Chypre.La troisième partie a montré la capacité de virus récemment découverts dans le serocomplexe Salehabad (Adana et Medjerda valley virus) à infecter l'homme et les animaux traduisant un potentiel pathogène à explorer par des études spécifiques.La dernière partie a démontré la présence du virus Toscana en Kabylie (Algérie du Nord), et l'exposition extrêmement élevée des populations humaines vivant dans la région, avec des prévalence 10 fois plus élevées que dans les régions les plus à risque du sud-est de la France. / Sandfly-borne phleboviruses, transmitted by phlebotomine sandflies and belonging to the genus Phlebovirus within the Bunyaviridae family are widely distributed in Mediterranean basin. Human diseases caused by infection with phleboviruses are known for a long time, but they are still neglected due to the lack of epidemiological knowledge and of diagnostic tools.The first part of this thesis was dedicated to optimize a comparative virus neutralisation test to study the seroprevalence of selected phleboviruses and to assess the capacity of each virus to infect humans and animals. The second part aimed to estimate the epidemiology of phlebovirus serocomplexes (Naples, Sicilian and Salehabad) in Mediterranean basin. In order to update the presence of these viruses and their capacity to infect animals, several serologic studies were carried out on animal blood samples in Tunisia, Portugal, Greece and Cyprus. The results demonstrated that the phleboviruses belonging to 3 distinct groups are widely circulating and capable to infect non human vertebrate at different rates in studied countries.The third part showed the capacity of newly discovered viruses (Adana and Medjerda valley viruses) belonging to Salehabad serocomplex to infect human and animal at low and high rates, respectively. These findings suggest the medical and veterinary importance of these viruses. The last part of this thesis, confirm the circulation of Toscana virus by seroprevelance study which was carried out in local population in north Algeria where Toscana virus was isolated recently. The high rate of circulate suggests that Toscana virus is heavily affecting sandfly-exposed people in Algeria.
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La búsqueda de los valores perdidos en el cuento latinoamericano contemporáneo

Smith, Genesis. Garcia-Corales, Guillermo. January 2008 (has links)
Thesis (M.A.)--Baylor University, 2008. / Includes bibliographical references (p. 95-101).
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L’eredità di Giambologna in Tirolo: Hans Reichle, scultore tra Firenze e la Baviera

Padovani, Francesca 17 November 2021 (has links)
La tesi consiste in uno studio monografico aggiornato, il primo in lingua italiana, dedicato allo scultore bavarese Hans Reichle, che fu un abile interprete della Maniera fiorentina al di là e al di qua delle Alpi. Il bavarese frequentò la bottega di Giambologna dal 1587 c. al 1594, anni di intenso studio durante i quali gettò le basi sulle quali costruì il successo di una vita: la memoria degli anni fiorentini e l’influenza del maestro si percepiscono in tutte le opere del catalogo del bavarese, dagli esordi fino alla piena maturità. La tesi è dedicata interamente all’esame della vita e dell’attività dello scultore. Inizialmente si ripercorre la biografia di Reichle, esaminando le opere realizzate nel corso della vita e il prestigio che queste guadagnarono. In questa prima parte emerge l’evoluzione del linguaggio dello scultore e, in particolare, il suo cimentarsi con tecniche che finora gli studi non avevano ammesso nel catalogo: si tratta di importanti novità che gettano luce su aspetti del tutto inediti della carriera dello scultore. Invece nella seconda parte della tesi si discutono alcuni casi-studio relativi alle imprese principali di Reichle. Un capitolo è poi dedicato all’eredità lasciata dallo scultore in Tirolo e agli allievi e collaboratori che affiancarono Reichle nel corso della sua vita. Le ultime due parti della tesi sono dedicate all’esame dell’inventario inedito del bavarese - che ha portato alla luce significative novità relative tanto alla biografia quanto alla sua attività - al catalogo delle opere di Reichle e dei suoi allievi, e infine all'appendice documentaria.
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Emerging sandfly-borne Phleboviruses in Balkan countries : virus isolation, characterization, evolution and seroepidemiology / Les Phlebovirus transmis par les phlébotomes dans les Balkans : isolement du virus, caractérisation, évolution et séroépidémiologie

Ayhan, Nazli 26 September 2017 (has links)
Les phlébovirus présentent sont présents dans toutes les régions du globe. Certains phlébovirus transmis par phlébotomes provoquent une maladie fébrile et des infections du système nerveux central. Depuis, de plus en plus de données montrent que la péninsule des Balkans joue un rôle majeur dans l'émergence de maladies à transmission vectorielle. Au début de ce travail, on comptait un nombre très limité de phlébovirus identifiés et isolés dans cette région. Une étude intégrée et transdisciplinaire en vue d'un inventaire des virus circulant dans pays des Balkans. (i) Un total de 3,850 phlébotomes sont été recueillis dans sept pays des Balkans en 2014 et 2015. Ils ont été testés pour la présence d'ARN viral et inoculé sur des cellules VERO afin d'isoler le virus détecté; (ii) des études de séroprévalence utilisant des tests de neutralisation ont été effectuées sur des échantillons de bovins et de moutons pour évaluer à deux agents pathogènes humains : le virus Toscana (TOSV) et le virus Sandfly fever Sicilian virus (SFSV). Nos résultats se composent de (i) la découverte et le séquençage de 3 nouveaux phlébovirus appartenant à 2 espèces différentes, (ii) la première identification du genotype B de TOSV en Croatie, (iii) la preuve de la co-circulation de deux genotypes (B et C) de TOSV, (iv) des taux d'anticorps neutralisants qui sont beaucoup plus élevés chez les bovins et les moutons pour le SFSV que pour TOSV. En conclusion, les résultats obtenus au cours de ce travail démontrent qu’es les Balkans représentent une zone de très importante activité pour les phlebovirus et donc mérite une surveillance particulière à cause du risque d’émergence et de dissémination. / Phleboviruses have a worldwide distribution. In the areas where sand flies are present, some of the sandfly-borne phleboviruses cause febrile illness and central nervous system infections. Sandfly fever was first reported in the Balkan Peninsula at the end of the 19th century. Since there is accumulating data showing that the Balkan peninsula plays a major role in the emergence of vector-borne diseases. At the outset of this work, a very limited number of phleboviruses had been identified and isolated in this region. To fill this gap, an integrated and transdisciplinary study was designed aiming at an inventory of viruses circulating in Balkans and associated seroprevalence studies using domestic animals: (i) a total of 3,850 sandflies were collected in seven Balkan countries (Albania, Bosnia-Herzegovina, Croatia, Kosovo, Montenegro, Republic of Macedonia and Serbia) in 2014 and 2015. They were tested for the presence of viral RNA and inoculated on VERO cell for virus isolation; (ii) seroprevalence studies using neutralisation tests were performed on cattle and sheep samples to assess the level of exposure to two human pathogens, Toscana virus (TOSV) and Sandfly fever Sicilian virus (SFSV). Our results consist of (i) the discovery and sequencing of 3 novel phleboviruses belonging to 2 different species, (ii) the identification for the first time of TOSV lineage B in Croatia, (iii) evidence of co-circulation of two lineages (Lineage B and C) of TOSV, (iv) rates of neutralising antibodies that are much higher in cattle and sheep for SFSV than for TOSV. Together the findings obtained during this work demonstrate that the Balkan area is a hot spot for phleboviruses.
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ATIVIDADE ANTIOXIDANTE DE EXTRATOS DE PRÓPOLIS COMERCIALIZADOS EM SANTA MARIA - RS E APLICAÇÃO EM LINGÜIÇA TOSCANA REFRIGERADA / ANTIOXIDANT ACTIVITY OF EXTRACTS OF PROPOLIS MARKETED IN SANTA MARIA RS AND YOUR APPLICATION IN CHILLED TUSCANY SAUSAGES

Alves, Elizângela 13 November 2009 (has links)
This study aimed to characterize commercial extracts of propolis and apply it in different concentrations in Tuscany sausage. The characterization of propolis in the first experiment was carried out by their compositions and phenolic flavonoids, by colorimetry techniques. The extracts were also characterized as the antioxidant activity through the techniques of metal chelating and sequestering DPPH free radical. After the extracts were compared, which showed the best result was used in the second experiment, the concentrations of 0.1%, 0.2%, 0.3% and 0.4% in the manufacture of sausages, which were analyzed under cold storage. The physicochemical properties of the sausages were made up of moisture, protein, ash, fat, pH and TBARS. The acceptability of these tests was determinated with sensory analysis within 1 week after production, propolis compared to green tea as the standard 0.03%. Were performed the same experiment, on days zero, 5, 10, 15, 20 and 27 days of storage, analysis of pH, TBARS and microbiological growth. The microbiological aspects evaluated were higher at day zero: the total count of mesophilic and / or psicotrophic, Salmonella, coliforms, sulfite reducer clostridia and Staphylococcus aureus, the other days of analysis was only the total count of mesophilic and / or psychrotrophic. The physicochemical parameters of the propolis extracts were all in accordance with the standards required by safety standards. With respect to sensory characteristics, the Tuscan sausages were accepted as the taste and appearance, and the use of propolis have decreased lipid oxidation and microbial growth, promoting quality during the days of storage. / Este trabalho teve como objetivo caracterizar extratos de própolis comerciais e aplicá-lo em diferentes concentrações em lingüiça Toscana. A caracterização da própolis no primeiro experimento realizou-se pelas suas composições de fenólicos e flavonóides totais, por técnicas colorimétricas. Os extratos também foram caracterizados quanto a atividade antioxidante através das técnicas quelante de metal e sequestrante de radicais livre DPPH. Após os extratos serem comparados, o que obteve melhor resultado foi utilizado, no segundo experimento, nas concentrações de 0,1%, 0,2%, 0,3% e 0,4% na fabricação de lingüiças que foram analisadas sob armazenamento refrigerado. As análises físico-químicas das lingüiças foram compostas por umidade, proteínas, cinzas, gordura, pH e TBARS. Os testes de aceitabilidade das lingüiças foram determinados através da análise sensorial na 1ª semana após a produção, compararam a própolis ao chá-verde como padrão a 0,03%. Foram realizados no mesmo experimento, nos dias zero, 5º, 10º, 15º, 20º e 27º dias de armazenamento, análises de pH, TBARS e crescimento microbiológico. Os aspectos microbiológicos avaliados foram maiores no dia zero: contagem total de mesofílicos e/ou psicotróficos, Salmonella, Coliformes, Clostrídio sulfito redutores e Staphylococcus aureus; nos demais dias de análises apenas ocorreu a contagem total de mesofílicos e/ou psicrotróficos. Os parâmetros físicoquímicos dos extratos de própolis estavam todos de acordo com os padrões exigidos nas normas de segurança. Com relação às características sensoriais, as lingüiças Toscanas foram aceitas quanto ao gosto e aparência e o uso da própolis diminuiu a oxidação lipídica e o crescimento de microrganismos, promovendo a qualidade durante os dias de armazenamento.
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Emerging sandfly-borne phleboviruses in Turkey, Iran, and Algeria : Virus isolation, characterization, evolution, and epidemiology / Circulation des Phlébovirus en Turquie, Iran et Algérie : Isolement de virus, caracterisation génomique, évolution and épidémiologie

Alkan Yirci, Çiğdem 01 June 2015 (has links)
Circulation des Phlébovirus en Turquie, l'Iran et l'Algérie a été étudiée. L'isolement, la caractérisation génomique, les relations phylogénétiques de six virus ont été présentées: le virus Adana (ADAV), deux souches de virus Toros (TORV), le virus Zerdali (ZERV) de la Turquie; le virus Dashli (DASHV) de l'Iran; le virus Toscana (TOSV) d'Algérie. Cette étude a commencé avec la collection de 38,131 phlébotomes de la nature. La méthode de séquençage de nouvelle génération (NGS) à haut débit nous à été utilisée pour l’analyse des génomes complet des virus isoles. En conclusion, cette étude a d'importantes contributions sur phlébovirus négligées. Voici quelques-unes des contributions significatives; (i) ZERV et TORV qui sont étroitement apparentés au virus Tehran (THEV) et le virus Corfou (CFUV), respectivement, ont été isolés depuis 56 et 30 ans des premiers isolements de THEV et CFUV, respectivement, (ii) Détection du virus ADAV un animal domestique et sur quelques sérums humain par test de neutralisation. Ce virus ADAV constitue avec le virus le virus (SALV), le virus Arbia (ARBV), et le virus (ADRV) le groupe Salehabad. Seul le virus ADRV a été détectée dans le liquide cérébro-spinal auparavant landais que avec les autres, aucune preuve pathogène n’a été détectée, (iii) Nous avons découvert la plus récente circulation phlébovirus en Iran après 56 années, (iv) TOSV a été isolé en Algérie pour la première fois et la circulation a été confirmée par séropositivités dans le sérum humain. / Sandfly-borne phlebovirus circulation in Turkey, Iran, and Algeria was investigated. The isolation, genomic characterization, phylogenetic relationships of 6 viruses was presented: Adana virus (ADAV), two strains of Toros virus (TORV), Zerdali virus (ZERV) from Turkey; Dashli virus (DASHV) from Iran; Toscana virus (TOSV) from Algeria. This study has begun with the collection of 38,131 sandflies from nature. The well established, high-throughput methodology was applied for the discovery of viruses including PCR tools and cell culture methods. Next generation sequencing (NGS) technology facilitated to perform complete genome analysis of the isolated viruses. In conclusion, this study has contributions to the neglected sandfly-borne phlebovirus group and filled some gaps about the circulation of these agents in Turkey, Iran, and Algeria. Following are some significant contributions; (i) ZERV and TORV which are closely related to Tehran virus (THEV) and Corfou virus (CFUV), respectively were isolated after 56 and 30 years of the first isolations of THEV and CFUV, respectively, (ii) There was no evidence of the pathogenicity of Salehabad virus (SALV) and Arbia virus (ARBV) except the detection of Adria virus (ADRV) in CSF until ADAV which belongs to the Salehabad serocomplex was detected in domestic animal and very few human sera by neutralization assay, (iii) We have discovered the most recent sandfly-borne phlebovirus circulation in Iran after 56 years, (iv) TOSV was isolated in Algeria for the first time and circulation was confirmed by seropositivities in human sera.

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