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Contributions à la modélisation et la conception des systèmes de gestion de provenance à large échelle / [Contributions to the modelling and conception of large-scale provenance management systems]

Sakka, Mohamed Amin 28 September 2012 (has links)
Les avancées dans le monde des réseaux et des services informatiques ont révolutionné les modes d’échange, de partage et de stockage de l’information. Nous migrons de plus en plus vers des échanges numériques ce qui implique un gain en terme de rapidité de transfert, facilité de partage et d’accès ainsi qu’une efficacité d’organisation et de recherche de l’information. Malgré ses avantages, l’information numérique a l’inconvénient d’être volatile et modifiable ce qui introduit des problèmes liés à sa provenance, son intégrité et sa valeur probante. Dans ce contexte, la provenance apparait comme une méta-donnée cléqui peut servir pour juger la qualité de l’information et pour vérifier si elle répond à un ensemble d’exigences métier, techniques et légales. Aujourd’hui, une grande partie des applications et des services qui traitent, échangent et gèrent des documents électroniques sur le web ou dans des environnements Cloud génèrent des données de provenance hétérogènes, décentralisées et non interopérables. L’objectif principal de cette thèse est de proposer des solutions génériques et interopérables pour la modélisation de l’information de provenance et de concevoir des architectures de systèmes de gestion de provenance passant à l'échelle tant au niveau du stockage et que de l’exploitation(interrogation). Dans la première partie de la thèse, nous nous intéressons à la modélisation de la provenance. Afin de pallier à l’hétérogénéité syntaxique et sémantique qui existe entre les différents modèles de provenance, nous proposons une approche globale et cohérente pour la modélisation de la provenance basée sur les technologies du web sémantique. Notre approche repose sur un modèle de domaine minimal assurant un niveau d’interprétation minimal et commun pour n’importe quelle source de provenance. Ce modèle peut ensuite être spécialisé en plusieurs modèles de domaine pour modéliser des concepts et des propriétés métier différentes. Cette spécialisation assure l’interopérabilité sémantique souhaitée et permet par la suite de générer des vues métiers différentes sur les mêmes données de provenance. Dans la deuxième partie de la thèse, nous nous focalisons sur la conception des systèmes de gestion de provenance (ou PMS). Nous proposons tout d’abord une architecture logique de PMS indépendante des choix technologiques d’implémentation et de déploiement. Cette architecture détaille les modules assurant les fonctionnalités requises par notre approche de modélisation et sert comme architecture de référence pour la conception d’un PMS. Par la suite, et afin de préserver l’autonomie des sources de provenance, nous proposons une architecture distribuée de PMS à base de médiateur. Ce médiateur a une vision globale sur l’ensemble des sources et possède des capacités de distribution et de traitement de requêtes. Finalement la troisième partie de la thèse valide nos propositions. La validation de notre approche de modélisation a été réalisée dans un cadre industriel chez Novapost, une entreprise proposant des services SaaS pour l’archivage de documents à valeur probante. Ensuite, l’aspect passage à l’ échelle de notre architecture a été testé par l’implémentation de deux prototypes de PMS sur deux technologies de stockage différentes : un système RDF (Sesame) et un SGBD NoSQL (CouchDB). Les tests de montée en charge effectués sur les données de provenance Novapost ont montré les limites de Sesame tant pour le stockage que pour l’interrogation en utilisant le langage de requêtes SPARQL, alors que la version CouchDB associée à un langage de requêtes basé sur map/reduce a démontré sa capacité à suivre la charge de manière linéaire en augmentant le nombre de serveurs / Provenance is a key metadata for assessing electronic documents trustworthiness. It allows to prove the quality and the reliability of its content. With the maturation of service oriented technologies and Cloud computing, more and more data is exchanged electronically and dematerialization becomes one of the key concepts to cost reduction and efficiency improvement. Although most of the applications exchanging and processing documents on the Web or in the Cloud become provenance aware and provide heterogeneous, decentralized and not interoperable provenance data, most of Provenance Management Systems (PMSs) are either dedicated to a specific application (workflow, database, ...) or a specific data type. Those systems were not conceived to support provenance over distributed and heterogeneous sources. This implies that end-users are faced with different provenance models and different query languages. For these reasons, modeling, collecting and querying provenance across heterogeneous distributed sources is considered today as a challenging task. This is also the case for designing scalable PMSs providing these features. In the fist part of our thesis, we focus on provenance modelling. We present a new provenance modelling approach based on semantic Web technologies. Our approach allows to import provenance data from heterogeneous sources, to enrich it semantically to obtain high level representation of provenance. It provides syntactic interoperability between those sources based on a minimal domain model (MDM), supports the construction of rich domain models what allows high level representations of provenance while keeping the semantic interoperability. Our modelling approch supports also semantic correlation between different provenance sources and allows the use of a high level semantic query language. In the second part of our thesis, we focus on the design, implementation and scalability issues of provenance management systems. Based on our modelling approach, we propose a centralized logical architecture for PMSs. Then, we present a mediator based architecture for PMSs aiming to preserve provenance sources distribution. Within this architecture, the mediator has a global vision on all provenance sources and possesses query processing and distribution capabilities. The validation of our modelling approach was performed in a document archival context within Novapost, a company offering SaaS services for documents archiving. Also, we propose a non-functional validation aiming to test the scalability of our architecture. This validation is based on two implementation of our PMS : he first uses an RDF triple store (Sesame) and the second a NoSQL DBMS coupled with the map-reduce parallel model (CouchDB). The tests we performed show the limits of Sesame in storing and querying large amounts of provenance data. However, the PMS based on CouchDB showed a good performance and a linear scalability
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Contributions à la modélisation et la conception des systèmes de gestion de provenance à large échelle

SAKKA, Mohamed Amin 28 September 2012 (has links) (PDF)
Les avancées dans le monde des réseaux et des services informatiques ont révolutionné les modes d'échange, de partage et de stockage de l'information. Nous migrons de plus en plus vers des échanges numériques ce qui implique un gain en terme de rapidité de transfert, facilité de partage et d'accès ainsi qu'une efficacité d'organisation et de recherche de l'information. Malgré ses avantages, l'information numérique a l'inconvénient d'être volatile et modifiable ce qui introduit des problèmes liés à sa provenance, son intégrité et sa valeur probante. Dans ce contexte, la provenance apparait comme une méta-donnée cléqui peut servir pour juger la qualité de l'information et pour vérifier si elle répond à un ensemble d'exigences métier, techniques et légales. Aujourd'hui, une grande partie des applications et des services qui traitent, échangent et gèrent des documents électroniques sur le web ou dans des environnements Cloud génèrent des données de provenance hétérogènes, décentralisées et non interopérables. L'objectif principal de cette thèse est de proposer des solutions génériques et interopérables pour la modélisation de l'information de provenance et de concevoir des architectures de systèmes de gestion de provenance passant à l'échelle tant au niveau du stockage et que de l'exploitation(interrogation). Dans la première partie de la thèse, nous nous intéressons à la modélisation de la provenance. Afin de pallier à l'hétérogénéité syntaxique et sémantique qui existe entre les différents modèles de provenance, nous proposons une approche globale et cohérente pour la modélisation de la provenance basée sur les technologies du web sémantique. Notre approche repose sur un modèle de domaine minimal assurant un niveau d'interprétation minimal et commun pour n'importe quelle source de provenance. Ce modèle peut ensuite être spécialisé en plusieurs modèles de domaine pour modéliser des concepts et des propriétés métier différentes. Cette spécialisation assure l'interopérabilité sémantique souhaitée et permet par la suite de générer des vues métiers différentes sur les mêmes données de provenance. Dans la deuxième partie de la thèse, nous nous focalisons sur la conception des systèmes de gestion de provenance (ou PMS). Nous proposons tout d'abord une architecture logique de PMS indépendante des choix technologiques d'implémentation et de déploiement. Cette architecture détaille les modules assurant les fonctionnalités requises par notre approche de modélisation et sert comme architecture de référence pour la conception d'un PMS. Par la suite, et afin de préserver l'autonomie des sources de provenance, nous proposons une architecture distribuée de PMS à base de médiateur. Ce médiateur a une vision globale sur l'ensemble des sources et possède des capacités de distribution et de traitement de requêtes. Finalement la troisième partie de la thèse valide nos propositions. La validation de notre approche de modélisation a été réalisée dans un cadre industriel chez Novapost, une entreprise proposant des services SaaS pour l'archivage de documents à valeur probante. Ensuite, l'aspect passage à l' échelle de notre architecture a été testé par l'implémentation de deux prototypes de PMS sur deux technologies de stockage différentes : un système RDF (Sesame) et un SGBD NoSQL (CouchDB). Les tests de montée en charge effectués sur les données de provenance Novapost ont montré les limites de Sesame tant pour le stockage que pour l'interrogation en utilisant le langage de requêtes SPARQL, alors que la version CouchDB associée à un langage de requêtes basé sur map/reduce a démontré sa capacité à suivre la charge de manière linéaire en augmentant le nombre de serveurs
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Méthodes d'optimisation pour le traitement de requêtes réparties à grande échelle sur des données liées / Optimization methods for large-scale distributed query processing on linked data

Oğuz, Damla 28 June 2017 (has links)
Données Liées est un terme pour définir un ensemble de meilleures pratiques pour la publication et l'interconnexion des données structurées sur le Web. A mesure que le nombre de fournisseurs de Données Liées augmente, le Web devient un vaste espace de données global. La fédération de requêtes est l'une des approches permettant d'interroger efficacement cet espace de données distribué. Il est utilisé via un moteur de requêtes fédéré qui vise à minimiser le temps de réponse du premier tuple du résultat et le temps d'exécution pour obtenir tous les tuples du résultat. Il existe trois principales étapes dans un moteur de requêtes fédéré qui sont la sélection de sources de données, l'optimisation de requêtes et l'exécution de requêtes. La plupart des études sur l'optimisation de requêtes dans ce contexte se concentrent sur l'optimisation de requêtes statique qui génère des plans d'exécution de requêtes avant l'exécution et nécessite des statistiques. Cependant, l'environnement des Données Liées a plusieurs caractéristiques spécifiques telles que les taux d'arrivée de données imprévisibles et les statistiques peu fiables. En conséquence, l'optimisation de requêtes statique peut provoquer des plans d'exécution inefficaces. Ces contraintes montrent que l'optimisation de requêtes adaptative est une nécessité pour le traitement de requêtes fédéré sur les données liées. Dans cette thèse, nous proposons d'abord un opérateur de jointure adaptatif qui vise à minimiser le temps de réponse et le temps d'exécution pour les requêtes fédérées sur les endpoints SPARQL. Deuxièmement, nous étendons la première proposition afin de réduire encore le temps d'exécution. Les deux propositions peuvent changer la méthode de jointure et l'ordre de jointures pendant l'exécution en utilisant une optimisation de requêtes adaptative. Les opérateurs adaptatifs proposés peuvent gérer différents taux d'arrivée des données et le manque de statistiques sur des relations. L'évaluation de performances dans cette thèse montre l'efficacité des opérateurs adaptatifs proposés. Ils offrent des temps d'exécution plus rapides et presque les mêmes temps de réponse, comparé avec une jointure par hachage symétrique. Par rapport à bind join, les opérateurs proposés se comportent beaucoup mieux en ce qui concerne le temps de réponse et peuvent également offrir des temps d'exécution plus rapides. En outre, le deuxième opérateur proposé obtient un temps de réponse considérablement plus rapide que la bind-bloom join et peut également améliorer le temps d'exécution. Comparant les deux propositions, la deuxième offre des temps d'exécution plus rapides que la première dans toutes les conditions. En résumé, les opérateurs de jointure adaptatifs proposés présentent le meilleur compromis entre le temps de réponse et le temps d'exécution. Même si notre objectif principal est de gérer différents taux d'arrivée des données, l'évaluation de performance révèle qu'ils réussissent à la fois avec des taux d'arrivée de données fixes et variés. / Linked Data is a term to define a set of best practices for publishing and interlinking structured data on the Web. As the number of data providers of Linked Data increases, the Web becomes a huge global data space. Query federation is one of the approaches for efficiently querying this distributed data space. It is employed via a federated query engine which aims to minimize the response time and the completion time. Response time is the time to generate the first result tuple, whereas completion time refers to the time to provide all result tuples. There are three basic steps in a federated query engine which are data source selection, query optimization, and query execution. This thesis contributes to the subject of query optimization for query federation. Most of the studies focus on static query optimization which generates the query plans before the execution and needs statistics. However, the environment of Linked Data has several difficulties such as unpredictable data arrival rates and unreliable statistics. As a consequence, static query optimization can cause inefficient execution plans. These constraints show that adaptive query optimization should be used for federated query processing on Linked Data. In this thesis, we first propose an adaptive join operator which aims to minimize the response time and the completion time for federated queries over SPARQL endpoints. Second, we extend the first proposal to further reduce the completion time. Both proposals can change the join method and the join order during the execution by using adaptive query optimization. The proposed operators can handle different data arrival rates of relations and the lack of statistics about them. The performance evaluation of this thesis shows the efficiency of the proposed adaptive operators. They provide faster completion times and almost the same response times, compared to symmetric hash join. Compared to bind join, the proposed operators perform substantially better with respect to the response time and can also provide faster completion times. In addition, the second proposed operator provides considerably faster response time than bind-bloom join and can improve the completion time as well. The second proposal also provides faster completion times than the first proposal in all conditions. In conclusion, the proposed adaptive join operators provide the best trade-off between the response time and the completion time. Even though our main objective is to manage different data arrival rates of relations, the performance evaluation reveals that they are successful in both fixed and different data arrival rates.
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Optimizing Communication Cost in Distributed Query Processing / Optimisation du coût de communication des données dans le traitement des requêtes distribuées

Belghoul, Abdeslem 07 July 2017 (has links)
Dans cette thèse, nous étudions le problème d’optimisation du temps de transfert de données dans les systèmes de gestion de données distribuées, en nous focalisant sur la relation entre le temps de communication de données et la configuration du middleware. En réalité, le middleware détermine, entre autres, comment les données sont divisées en lots de F tuples et messages de M octets avant d’être communiqués à travers le réseau. Concrètement, nous nous concentrons sur la question de recherche suivante : étant donnée requête Q et l’environnement réseau, quelle est la meilleure configuration de F et M qui minimisent le temps de communication du résultat de la requête à travers le réseau?A notre connaissance, ce problème n’a jamais été étudié par la communauté de recherche en base de données.Premièrement, nous présentons une étude expérimentale qui met en évidence l’impact de la configuration du middleware sur le temps de transfert de données. Nous explorons deux paramètres du middleware que nous avons empiriquement identifiés comme ayant une influence importante sur le temps de transfert de données: (i) la taille du lot F (c’est-à-dire le nombre de tuples dans un lot qui est communiqué à la fois vers une application consommant des données) et (ii) la taille du message M (c’est-à-dire la taille en octets du tampon du middleware qui correspond à la quantité de données à transférer à partir du middleware vers la couche réseau). Ensuite, nous décrivons un modèle de coût permettant d’estimer le temps de transfert de données. Ce modèle de coût est basé sur la manière dont les données sont transférées entre les noeuds de traitement de données. Notre modèle de coût est basé sur deux observations cruciales: (i) les lots et les messages de données sont communiqués différemment sur le réseau : les lots sont communiqués de façon synchrone et les messages dans un lot sont communiqués en pipeline (asynchrone) et (ii) en raison de la latence réseau, le coût de transfert du premier message d’un lot est plus élevé que le coût de transfert des autres messages du même lot. Nous proposons une stratégie pour calibrer les poids du premier et non premier messages dans un lot. Ces poids sont des paramètres dépendant de l’environnement réseau et sont utilisés par la fonction d’estimation du temps de communication de données. Enfin, nous développons un algorithme d’optimisation permettant de calculer les valeurs des paramètres F et M qui fournissent un bon compromis entre un temps optimisé de communication de données et une consommation minimale de ressources. L’approche proposée dans cette thèse a été validée expérimentalement en utilisant des données issues d’une application en Astronomie. / In this thesis, we take a complementary look to the problem of optimizing the time for communicating query results in distributed query processing, by investigating the relationship between the communication time and the middleware configuration. Indeed, the middleware determines, among others, how data is divided into batches and messages before being communicated over the network. Concretely, we focus on the research question: given a query Q and a network environment, what is the best middleware configuration that minimizes the time for transferring the query result over the network? To the best of our knowledge, the database research community does not have well-established strategies for middleware tuning. We present first an intensive experimental study that emphasizes the crucial impact of middleware configuration on the time for communicating query results. We focus on two middleware parameters that we empirically identified as having an important influence on the communication time: (i) the fetch size F (i.e., the number of tuples in a batch that is communicated at once to an application consuming the data) and (ii) the message size M (i.e., the size in bytes of the middleware buffer, which corresponds to the amount of data that can be communicated at once from the middleware to the network layer; a batch of F tuples can be communicated via one or several messages of M bytes). Then, we describe a cost model for estimating the communication time, which is based on how data is communicated between computation nodes. Precisely, our cost model is based on two crucial observations: (i) batches and messages are communicated differently over the network: batches are communicated synchronously, whereas messages in a batch are communicated in pipeline (asynchronously), and (ii) due to network latency, it is more expensive to communicate the first message in a batch compared to any other message that is not the first in its batch. We propose an effective strategy for calibrating the network-dependent parameters of the communication time estimation function i.e, the costs of first message and non first message in their batch. Finally, we develop an optimization algorithm to effectively compute the values of the middleware parameters F and M that minimize the communication time. The proposed algorithm allows to quickly find (in small fraction of a second) the values of the middleware parameters F and M that translate a good trade-off between low resource consumption and low communication time. The proposed approach has been evaluated using a dataset issued from application in Astronomy.
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Traitement de requêtes SPARQL sur des données liées / SPARQL distributed query processing over linked data

Macina, Abdoul 17 December 2018 (has links)
De plus en plus de sources de données liées sont publiées à travers le Web en s'appuyant sur les technologies du Web sémantique, formant ainsi un large réseau de données distribuées. Cependant il est difficile pour les consommateurs de données de profiter de la richesse de ces données, compte tenu de leur distribution, de l'augmentation de leur volume et de l'autonomie des sources de données. Les moteurs fédérateurs de données permettent d'interroger ces sources de données en utilisant des techniques de traitement de requêtes distribuées. Cependant, une mise en œuvre naïve de ces techniques peut générer un nombre considérable de requêtes distantes et de nombreux résultats intermédiaires entraînant ainsi un long temps de traitement des requêtes et des communications réseau coûteuse. Par ailleurs, la sémantique des requêtes distribuées est souvent ignorée. L'expressivité des requêtes, le partitionnement des données et leur réplication sont d'autres défis auxquels doivent faire face les moteurs de requêtes. Pour répondre à ces défis, nous avons d'abord proposé une sémantique des requêtes distribuées compatible avec les standards SPARQL et RDF qui préserve l’expressivité de SPARQL. Nous avons ensuite présenté plusieurs stratégies d'optimisation pour un moteur de requêtes fédérées qui interroge de manière transparente des sources de données distribuées. La performance de ces optimisations est évaluée sur une implémentation d’un moteur de requêtes distribuées SPARQL / Driven by the Semantic Web standards, an increasing number of RDF data sources are published and connected over the Web by data providers, leading to a large distributed linked data network. However, exploiting the wealth of these data sources is very challenging for data consumers considering the data distribution, their volume growth and data sources autonomy. In the Linked Data context, federation engines allow querying these distributed data sources by relying on Distributed Query Processing (DQP) techniques. Nevertheless, a naive implementation of the DQP approach may generate a tremendous number of remote requests towards data sources and numerous intermediate results, thus leading to costly network communications. Furthermore, the distributed query semantics is often overlooked. Query expressiveness, data partitioning, and data replication are other challenges to be taken into account. To address these challenges, we first proposed in this thesis a SPARQL and RDF compliant Distributed Query Processing semantics which preserves the SPARQL language expressiveness. Afterwards, we presented several strategies for a federated query engine that transparently addresses distributed data sources, while managing data partitioning, query results completeness, data replication, and query processing performance. We implemented and evaluated our approach and optimization strategies in a federated query engine to prove their effectiveness.

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