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Evidências moleculares dos padrões evolutivos e filogeográficos de populações de Astyanax paranae (Pisces : Characidae) com base em caracteres do DNA mitocondrial /

Marreta, Maria Eduarda. January 2011 (has links)
Orientador: Anderson Luis Alves / Banca: Claudio de Oliveira / Banca: Claudio Henrique Zawadzki / Resumo: Astyanax paranae é uma espécie de peixe de pequeno porte que habita cabeceiras de riachos, resultando no isolamento geográfico entre as populações. Sendo considerada endêmica da bacia do Alto rio Paraná, recentemente foi elevada a espécie, deixando de ser considerada uma subespécie de A. scabripinnis, sendo a única espécie do "complexo scabripinnis" presente nessa bacia. Os raros relatos de dados moleculares populacionais e a ausência de uma análise filogeográfica consistente para populações de A. paranae, aliado as evidências citogenéticas e morfológicas de que essa espécie não represente uma unidade monofilética, reforçam a necessidade de um amplo estudo evolutivo e biogeográfico na bacia do Alto rio Paraná, reconhecidamente uma área de endemismo ictiológico. Nesse sentido, caracterizou-se a variabilidade genética em populações de A. paranae a fim de se estabelecer as relações filogenéticas e filogeográficas entre as linhagens de DNA na bacia do Alto rio Paraná, através da identificação dos haplótipos do mtDNA a partir da sequência completa do gene da ATP sintetase 6 e 8 (ATPase 6/8), num total de 842pb, bem como a caracterização das quatro espécies mais abundantes dessa bacia por PCR-RFLP. As análises filogenéticas foram realizadas com 88 exemplares de A. paranae além de 70 exemplares de espécies relacionadas do gênero, num total de 158 indivíduos analisados. Como grupo externo foram incluídos exemplares de Serrapinnus e Bryconamericus. As topologias foram geradas a partir dos métodos de Neighbor Joining, Máxima Parcimônia, no programa PAUP 4.0b10, e Inferência Bayesiana, no programa Mr. Bayes, enquanto a rede de haplótipo foi gerada no programa TCS. O relógio molecular foi utilizado para estimar o tempo de divergência entre as espécies/linhagens adotando a taxa de 1.3%/Ma para o gene ATPase 6/8. Tanto as análises filogenéticas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Astyanax paranae is small sized species of fish that inhabit small headwater streams, resulting in geographical isolation between populations. Being considered endemic to the Upper Paraná River basin it was considered a species and no longer a subspecies of A. scabripinnis, being the only one species of the "scabripinnis complex" present in this basin. The few reports of molecular population data and the absence of a consistent phylogeographic analysis for populations of A. paranae, combined to cytogenetic and morphological evidences that this species does not represent a monophyletic unit, reinforce the need of a wide study of evolution and biogeography in the Upper Paraná River basin, a known area of ichthyological endemism. The genetic variability in populations of A. paranae was characterized in order to establish phylogenetic and phylogeographic relationships between mtDNA lineages in the Upper Paraná River basin, through the identification of mtDNA haplotypes from the complete sequence of the gene ATP synthase 6 and 8 (ATPase 6/8), a total of 842bp, and the characterization of the four most abundant species in this basin by PCR-RFLP. Phylogenetic analyses were made in 88 specimens of A. paranae and also in 70 of related species of the genus, resulting in 158 individuals analyzed. As outgroup, were included samples of Serrapinnus and Bryconamericus. The topologies were generated from the methods of Neighbor Joining, Maximum Parsimony and Bayesian Inference in the program PAUP 4.0b10, while the haplotype network was generated in the program TCS. The molecular clock was used to estimate time of divergence between species/lineage using the rate of 1.3%/Ma for the ATPase 6/8 gene. Both phylogenetic and phylogeographic analysis support the hypothesis that A. paranae does not form a monophyletic unit in the Upper Paraná River basin, being possible to identify seven... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Evidências moleculares dos padrões evolutivos e filogeográficos de populações de Astyanax paranae (Pisces : Characidae) com base em caracteres do DNA mitocondrial

Marreta, Maria Eduarda [UNESP] 24 February 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-24Bitstream added on 2014-06-13T19:28:35Z : No. of bitstreams: 1 marreta_me_me_rcla.pdf: 773882 bytes, checksum: fb2183d5b02055be19ff645c0b0edf5d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Astyanax paranae é uma espécie de peixe de pequeno porte que habita cabeceiras de riachos, resultando no isolamento geográfico entre as populações. Sendo considerada endêmica da bacia do Alto rio Paraná, recentemente foi elevada a espécie, deixando de ser considerada uma subespécie de A. scabripinnis, sendo a única espécie do “complexo scabripinnis” presente nessa bacia. Os raros relatos de dados moleculares populacionais e a ausência de uma análise filogeográfica consistente para populações de A. paranae, aliado as evidências citogenéticas e morfológicas de que essa espécie não represente uma unidade monofilética, reforçam a necessidade de um amplo estudo evolutivo e biogeográfico na bacia do Alto rio Paraná, reconhecidamente uma área de endemismo ictiológico. Nesse sentido, caracterizou-se a variabilidade genética em populações de A. paranae a fim de se estabelecer as relações filogenéticas e filogeográficas entre as linhagens de DNA na bacia do Alto rio Paraná, através da identificação dos haplótipos do mtDNA a partir da sequência completa do gene da ATP sintetase 6 e 8 (ATPase 6/8), num total de 842pb, bem como a caracterização das quatro espécies mais abundantes dessa bacia por PCR-RFLP. As análises filogenéticas foram realizadas com 88 exemplares de A. paranae além de 70 exemplares de espécies relacionadas do gênero, num total de 158 indivíduos analisados. Como grupo externo foram incluídos exemplares de Serrapinnus e Bryconamericus. As topologias foram geradas a partir dos métodos de Neighbor Joining, Máxima Parcimônia, no programa PAUP 4.0b10, e Inferência Bayesiana, no programa Mr. Bayes, enquanto a rede de haplótipo foi gerada no programa TCS. O relógio molecular foi utilizado para estimar o tempo de divergência entre as espécies/linhagens adotando a taxa de 1.3%/Ma para o gene ATPase 6/8. Tanto as análises filogenéticas... / Astyanax paranae is small sized species of fish that inhabit small headwater streams, resulting in geographical isolation between populations. Being considered endemic to the Upper Paraná River basin it was considered a species and no longer a subspecies of A. scabripinnis, being the only one species of the “scabripinnis complex” present in this basin. The few reports of molecular population data and the absence of a consistent phylogeographic analysis for populations of A. paranae, combined to cytogenetic and morphological evidences that this species does not represent a monophyletic unit, reinforce the need of a wide study of evolution and biogeography in the Upper Paraná River basin, a known area of ichthyological endemism. The genetic variability in populations of A. paranae was characterized in order to establish phylogenetic and phylogeographic relationships between mtDNA lineages in the Upper Paraná River basin, through the identification of mtDNA haplotypes from the complete sequence of the gene ATP synthase 6 and 8 (ATPase 6/8), a total of 842bp, and the characterization of the four most abundant species in this basin by PCR-RFLP. Phylogenetic analyses were made in 88 specimens of A. paranae and also in 70 of related species of the genus, resulting in 158 individuals analyzed. As outgroup, were included samples of Serrapinnus and Bryconamericus. The topologies were generated from the methods of Neighbor Joining, Maximum Parsimony and Bayesian Inference in the program PAUP 4.0b10, while the haplotype network was generated in the program TCS. The molecular clock was used to estimate time of divergence between species/lineage using the rate of 1.3%/Ma for the ATPase 6/8 gene. Both phylogenetic and phylogeographic analysis support the hypothesis that A. paranae does not form a monophyletic unit in the Upper Paraná River basin, being possible to identify seven... (Complete abstract click electronic access below)
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Ecologia trófica da comunidade de peixes do reservatório de Cachoeira Dourada, rio Paranaíba, Bacia do Alto Rio Paraná, Brasil

Velludo, Marcela Roquetti 28 June 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5321.pdf: 1686054 bytes, checksum: 8981c0335246dc3aa2d6f05304ecfbbc (MD5) Previous issue date: 2011-06-28 / Universidade Federal de Sao Carlos / The knowledge of the fish s diet and species abundance of a particular community allows us to identify the community s different trophic categories, as well as to infer about its structure. This knowledge may also permit to evaluate the degree of importance of trophic levels and to understand the interrelationships among the components of that community. In order to generate data for a better understanding of the relationships between the ichthyofauna components and other aquatic organisms in the community, this study aimed to characterize the trophic structure of the fish community of the Cachoeira Dourada reservoir - MG/GO, Upper Parana River basin (18° 30' 11.47"S, 49° 29' 18.78"W). The fish sampling occurred monthly from February 2007 to January 2008 and the fishes were captured using gill nets of 2 to 6.5 inches between adjacent knots placed at three sampling points of the reservoir. The biometric analyses was performed by the gauging of the total and standard length and total weight of the collected specimens. The fish stomachs were removed, weighed and fixed in 4% formaldehyde for further analysis in stereomicroscope. The data obtained during the stomach contents analysis was quantified though the Alimentary Index of Kawakami and Vazzoler, which combines the frequency of occurrence and volume of the alimentary items. The description of the species diet allowed the identification of six feeding guilds: (1) Iliophagous, (2) Carnivores-insectivores, (3) Carnivores-piscivores, (4) herbivores, (5) Omnivores, (6) Invertivores. The dietary overlap trophic web built showed interspecific interactions with 20% connectance. Eleven sub-groups or clicks were observed. The iliophagous sub-group showed no interactions with other species guilds. The bipartite network showed the generality of the food items intake of Pimelodus maculatus, the most abundant species in gill nets catches. The prey relative biomass appeared to be larger than that of the predators, this factor may be responsible for maintaining the large amount of piscivorous species found in the community. The ecosystem analyses describe and evaluate the functioning of biological systems considering productivity, interaction between communities and their functional processes. The knowledge of trophic ecology and key species connectivity indicates the paths through which the greater part of the system energy flows. This can help to identify regulatory elements of the community s structure and functioning, since it summarizes the dynamics of environmental energy transfer. / A partir do conhecimento da dieta dos peixes de uma comunidade e da abundância específica, podem ser identificadas as diferentes categorias tróficas, inferir acerca da estrutura, avaliar o grau de importância dos distintos níveis tróficos e entender as interrelações entre os componentes da referida comunidade. Com a finalidade de gerar subsídios para um melhor entendimento das relações entre os componentes da ictiofauna e os demais organismos da comunidade aquática, este estudo visou caracterizar a estrutura trófica da comunidade de peixes do reservatório de Cachoeira Dourada MG/GO, na bacia do Alto Rio Paraná (18°30'11.47"S, 49°29'18.78"O). Foram realizadas coletas mensais de fevereiro de 2007 a janeiro de 2008, utilizando redes de espera de 2 a 6,5 centímetros entre nós adjacentes em três pontos do reservatório. Após realizada a biometria, anotando-se o comprimento total e padrão e o peso total dos indivíduos coletados, os estômagos eram retirados pesados e fixados em formol 4% para posterior análise em esteriomicroscópio. As informações obtidas através da análise de conteúdo estomacal eram quantificadas através do índice alimentar de Kawakami e Vazzoler, combinando a freqüência de ocorrência e o volume dos itens. A descrição da dieta das espécies permitiu identificar seis guildas tróficas: (1) Iliófagos; (2) Carnívoros-insetívoros; (3) Carnívoros-piscívoros; (4) Herbívoros; (5) Onívoros; (6) Invertívoros. A teia trófica construída com base na sobreposição alimentar apresentou interações interespecíficas com conectância de 20%. São observados 11 sub-grupos ou cliques, sendo que o sub-grupo formado pelos iliófagos não apresentou interações com as espécies de outras guildas. A rede bipartida mostrou a generalidade na ingestão de itens alimentares por Pimelodus maculatus, espécie mais abundante nas capturas com as redes. A biomassa relativa de presas se apresentou maior que a dos predadores, fator que pode ser responsável pela manutenção da grande quantidade de piscívoros encontrados. As análises ecossistêmicas descrevem e avaliam o funcionamento de sistemas biológicos considerando a produtividade, interação entre as comunidades e seus processos funcionais. O conhecimento da ecologia trófica e da conectividade das espécies-chave indicam os caminhos por onde flui a maior parte da energia do sistema. Isso pode auxiliar na identificação de elementos reguladores da estrutura e funcionamento das comunidades, já que sumariza a dinâmica da transferência de energia no ambiente.
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Dieta, aspectos bromatológicos e parasitológicos em uma espécie de peixe não-nativa no reservatório de Jupiá, alto rio Paraná

Garves, José Daniel Soler. January 2020 (has links)
Orientador: Igor Paiva Ramos / Resumo: Empreendimentos hidroelétricos podem desencadear alterações no ciclo hidrológico, desequilíbrio dos ecossistemas aquáticos e facilitar a introdução de espécies de peixes não-nativas. Contudo, essas espécies também podem apresentar grande representatividade na pesca artesanal e esportiva, tornando-se uma importante fonte de renda local. Dessa forma, o estudo de espécies não-nativas, suas origens, hábitos e posições tróficas, além de suas habilidades que garantem a permanência e o sucesso no estabelecimento em novos ambientes, são relevantes. Dentre tais espécies não-nativas, Geophagus sveni destaca-se como uma das espécies mais importantes para pesca artesanal na região Noroeste do estado de São Paulo. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar e correlacionar a composição alimentar, composição bromatológica do tecido muscular, perfil de ácidos graxos do tecido muscular e hepático, além de identificar possíveis parasitos musculares em G. sveni nos períodos chuvoso e seco, no reservatório de Jupiá, alto rio Paraná, Brasil. Foram realizadas duas coletas, uma ao final do período chuvoso (março/2018) e outra ao final do período seco (agosto/2018), no reservatório de Jupiá (20°30'33.4"S 51°27'19.7"W). Os espécimes coletados foram eutanasiados e, em seguida, tiveram mensuradas massa total, comprimento padrão e o sexo determinado visualmente. Geophagus sveni apresentou hábito alimentar detritívoro, além de plasticidade e oportunismo trófico. Sua composição alimentar foi sign... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Hydroelectric developments can trigger changes in the hydrological cycle, imbalance in aquatic ecosystems and facilitate the introduction of non-native fish species. However, these species can also be highly representative in artisanal and sport fishing, becoming an important source of local income. Thus, the study of non-native species, their origins, habits and trophic positions, in addition to their skills that guarantee permanence and success in the establishment of new environments, are relevant. Among these non-native species, Geophagus sveni is provided as one of the most important species for artisanal fisheries in the Northwest region of the state of São Paulo. This study aimed to characterize and correlate the food composition, the bromatological composition of muscle tissue, the fatty acid profile of the muscle and liver tissue, in addition to identifying possible muscle parasites of Geophagus sveni in the rainy and dry periods, in the Jupiá reservoir, on the Paraná River, Brazil. Two collections were made, one at the end of the rainy period (March/2018) and another at the end of the dry period (August/2018), at the Jupiá reservoir (20°30'33.4"S 51°27'19.7"W). The collected specimens were euthanized and, afterwards, total mass and standard length were measured, as well as sex determined visually. Geophagus sveni presented detritivorous eating habits, in addition to plasticity and trophic opportunism. Their food composition was significantly different only between t... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

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