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Traços de história de vida de três espécies de peixes em riachos da bacia do rio Corumbataí-SPLourenço, Luzia da Silva [UNESP] 11 January 2013 (has links) (PDF)
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lourenco_ls_dr_rcla.pdf: 3423515 bytes, checksum: 653f54040e876c3fe9e06e80e1465194 (MD5) / O presente trabalho tem como objetivo avaliar traços de história de vida reprodutivos e relações biométricas de três espécies de peixes de riachos, assim como a variação espacial no crescimento de uma das espécies. As amostragens foram realizadas mensalmente de abril de 2010 a março de 2011 em riachos pertencentes a quatro sub-bacias do rio Corumbataí (Cabeça, Corumbataí, Passa Cinco e Ribeirão Claro), localizadas na região sudeste do Brasil. Baseado no índice gonadossomático, a época de maturação gonadal de Geophagus brasiliensis e Astyanax altiparanae variou entre as estações (seca e cheia), enquanto para Piabina argentea, houve variação espacial (entre sub-bacias) e temporal. Parte da variação do índice gonadossomático de A. altiparanae está relacionada a alterações na profundidade, turbidez e pluviosidade, e para G. brasiliensis na pluviosidade, condutividade e turbidez. Entretanto para P. argentea apenas o oxigênio e a condutividade explicaram parte desta. O comprimento de primeira maturação apresentou variação espacial para todas as espécies. Quanto às relações biométricas a estimativa do peso específico com base nos dados de peso e volume, foi acima do peso específico da água 1,00 g/cm3 para G. brasiliensis e A. altiparanae, porém para P. argentea foi abaixo. O peso e o volume aumentam de forma similar em função do aumento em tamanho corporal, portanto a dispersão dos pontos da relação volume e comprimento e peso e comprimento são similares. Os resultados da análise de dados de crescimento somático de G. brasiliensis fornecem evidências de que o crescimento é um traço de história de vida que pode variar mesmo quando uma escala espacial pequena é utilizada. Modelos com indivíduos aninhados em local e em loca e subbacias ajustaram melhor aos dados de comprimento na respectiva idade do que o modelo ao nível de indivíduo... / The present study has as aim to assess the reproductive traits of the life history and biometrics relationships of the three fish species of the streams, as well as the spatial variation on growth one of the species. The samplings were performed monthly from April 2010 to March 2011 in streams belonging to four sub-basins in the Corumbataí river basin (Cabeça, Corumbataí, Passa Cinco e Ribeirão Claro), located in the south-eastern Brazil. Based on gonadosomatic index, the maturation time of the Geophagus brasiliensis and Astyanax altiparanae varied between seasons (dry and rainy), while for Piabina argentea there was spatial variation (among sub-basins), and temporal. Part of the variation in the gonadosomatic index of the A. altiparanae is related to the alteration in depth, turbidity and precipitation, and for G. brasiliensis in rainfall, conductivity and turbidity. However for P. argentea only oxygen and conductivity explained part of the variation in gonadosomatic index. The length at first maturation showed spatial variation for all species. For the biometrics relationships the estimated of the specific weight using the weight and volume data, was above of the specific weight of the water 1.00 g/cm3 for G. brasiliensis and A. altiparanae, therefore for P. argentea was below. The weight and volume increase similar in function of length. Thus the dispersion of the points of the volume and length and weight and length relationship is very close. The results about the somatic growth of the G. brasiliensis give evidence that the growth is a trait of the life history which can vary even when a small spatial scale is used. Models with individuals nested in sites and with individuals nested in sites and sub-basins fitted better the length-at-age data than the model with individual level. Therefore in growth analysis is important take in account the space and hierarchical... (Complete abstract click electronic access below)
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Concentração de resveratrol e expressão de resveratrol sintase em espécies de ArichisCarvalho, Paula Andréa Sampaio de Vasconcelos [UNESP] 26 April 2013 (has links) (PDF)
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000753267.pdf: 1148159 bytes, checksum: e46fd3be4a1e5a94f82f31452ef03554 (MD5) / O resveratrol é uma fitoalexina produzida em função de estresses bióticos e abióticos e foi encontrado em um número limitado de espécies de plantas, incluindo o amendoim (Arachis hypogaea) e seus parentes silvestres. Este tem também propriedades antioxidantes e em função disso é um promissor antitumoral, cardioprotetor e neuroprotetor. O amendoim é um alotetraploide de constituição genômica AB sendo A. ipaënsis e A. duranensis os doadores de seus genomas B e A, respectivamente. Estudos prévios demonstraram que algumas espécies silvestres do gênero Arachis produzem resveratrol e que ampla variabilidade genética para diferentes características existe entre acessos das espécies silvestres, incluindo ampla variação nos níveis de resistência a doenças fúngicas e nematoides. Portanto, a avaliação de um maior número do gênero e a investigação da variação da produção de resveratrol também entre acessos é fundamental para uma exploração mais adequada das espécies silvestres do gênero Arachis. O melhor entendimento das causas da variação na produção de resveratrol sem dúvida contribuirá para o uso das mesmas e o primeiro passo para esse entendimento sem duvida passa pela identificação do padrão de expressão da resveratrol sintase (RS). Este trabalho tem como objetivos avaliar a variação na produção de resveratrol entre espécies (A. hypogaea, A. stenosperma, A. valida, A. wiliamsii, A. duranensis, A. ipaënsis e um anfidiploide sintético proveniente do cruzamento artificial entre A. duranensis e A. ipaënsis) e entre acessos de duas espécies(A. hypogaea e A. stenosperma) por meio de HPLC e avaliar a expressão relativa da resveratrol sintase por meio de RT-qPCR em A. hypogaea, A. duranensis, A. ipaënsis e um anfidiploide sintético. Folhas foram coletadas de plantas cultivadas em casa de vegetação para os grupos teste e controle e três repetições biológicas ... / Resveratrol is a phytoalexin produced under biotic and abiotic stresses. It has been found in a restricted number of plant species including peanut (Arachis hypogaea) and its wild relatives. This phytochemical has antioxidant properties, being considered a promising antitumour, cardioprotective and neuroprotective agent. Peanut is an allotetraploid specie with an AABB genomic constitution. Arachis ipaënsis and A. duranensis are the donors of the B genome and the A genome, respectively. Previous studies have shown that wild species of the genus Arachis can produce resveratrol. Therefore, the evaluation of other species of thus genus and the analysis of the variation in the production of resveratrol between accessions is essential for better exploitation of wild species in the genus Arachis. It also important the understanding of the variation in resveratrol concentration between species and accessions and that could be reached through the better understating of the role resveratrol synthase.. . The aims of this work were to evaluate the variation in resveratrol production between species (A. hypogaea, A. stenosperma, A. valida, A. wiliamsii, A. duranensis, A. ipaënsis and in a synthetic amphidiploid derived from these two wild species A. duranensis and A. ipaënsis) and between accessions of the same specie (A. hypogaea and A. stenosperma) through HPLC, and to quantify the expression of resveratrol synthase by RT-qPCR in A. hypogaea, A. duranensis, A. ipaënsis and in a synthetic amphidiploid. Leaves for the test and control groups were collected from plants cultivated in a greenhouse and three biological replicates were evaluated for each specie. The synthesis of resveratrol in leaves was induced by treatment with UV for 2 hours and thirty minutes and then the difference in the concentration of resveratrol between species and between the accessions and cultivars of the same species was analyzed. We found new ...
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Análise morfológica e distribuição geográfica de Physalaemus albifrons (Spix, 1824) (Anura, Leptodactylidae, Leiuperinae)Melo, Suélen Helena Martins 27 October 2014 (has links)
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6480.pdf: 1713092 bytes, checksum: 7682b21d5ab678d6b42870e1ac14451b (MD5)
Previous issue date: 2014-10-27 / Universidade Federal de Sao Carlos / Physalaemus is the largest genus, with regard to number of species, of the subfamily Leiuperinae, the taxonomy of which has been the subject of recent studies due to the high intraspecific and low interspecific variation within the group, with patterns of variation possibly related to geographic distribution. The Physalaemus albifrons species was first collected by Johann Baptiste von Spix in 1824, and its type locality is the "Province of Bahia", even though it is distributed from Maranhão to Minas Gerais, in regions characterized by the Caatinga morphoclimatic zone in areas of transition with the Cerrado. Due to the variation in the dorsal pattern found in Physalaemus albifrons, authors have put foward the hypothesis of the species being included in a species complex, meaning there would be more species registered under a single common name. Based on this, 98 individuals were studied, associated with each sampled location by means of analysis of morphological and morphometric characters, thus redescribing the species. Physalaemus albifrons presents four intrapopulational dorsal coloration patterns, varying from homogeneously spotless; longitudinal and irregular linear dark spots; as well as dark spots in an omega-like pattern. The second tubercle next to the tibiotarsal articulation, the absence of inguinal glands and the snout-vent length from 18,1 mm to 33,8mm proved to be diagnostic features in order to differentiate Physalaemus.albifrons from other species of the genus. This species, which may also be described as being average-sized for this genus, with the head greater in width than in length; and the snout subelliptical in dorsal view. The populations presents morphological variation as to the distinction of the tympanic ring which might be visible in some individuals and indistinguishable in others, leading to the definition of two morphological groups which are unified through canonical discriminant analysis, therefore discarding the possible characterization of the species complex in Physalaemus albifrons. / Physalaemus é o maior gênero em número de espécies da subfamília Leiuperinae, cuja taxonomia tem sido alvo de recentes estudos devido à elevada variação intraespecífica e baixa variação interespecífica apresentada pelo grupo, com padrões de variação possivelmente relacionados com a distribuição geográfica. A espécie Physalaemus albifrons foi coletada pela primeira vez por Johann Baptiste von Spix em 1824 e a localidade tipo registrada é Província da Bahia , contudo está distribuída desde o Maranhão até Minas Gerais, em regiões caracterizadas pelo domínio morfoclimático da Caatinga em áreas de transição com o Cerrado. Devido à variação no padrão de desenhos dorsais apresentada por Physalaemus albifrons, autores levantam a hipótese de a espécie estar incluída em um complexo de espécies, ou seja, haveriam mais espécies registradas sob um mesmo nome. Baseando-se nisto, 98 exemplares foram estudados, associados a cada localidade amostrada, analisando-se caracteres morfológicos e morfométricos, redescrevendo-se a espécie. Physalaemus albifrons apresenta quatro padrões intrapopulacionais de coloração dorsal, variando de homogêneo sem manchas, com manchas escuras lineares longitudinais e irregulares e também com manchas escuras em padrão de ômega. O segundo tubérculo presente próximo da articulação tíbio-tarsal, a ausência de glândulas inguinais e o comprimento rostro cloacal de 18,1-33,8 mm se mostraram características diagnósticas para diferenciar Physalaemus albifrons das demais espécies do gênero. Esta espécie, podendo ainda ser descrita como de tamanho médio para este gênero, com a cabeça mais larga do que longa e o focinho subelíptico em vista dorsal. As populações apresentam variação morfológica quanto à distinção do aro timpânico, que pode ser visível em alguns exemplares e indistinguível em outros, definindo-se dois grupos morfológicos unificados através da análise de discriminante canônica, descartando-se, assim, a possibilidade de caracterização do complexo de espécies em Physalaemus albifrons.
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Como a variação espacial das assembleias de peixes determina a pressão de predação sobre as comunidades incrustantes?Pastro, Gabriela January 2015 (has links)
Orientador: Prof. Dr. Fernando Zaniolo Gibran / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, 2015. / Construções antrópicas podem aumentar a disponibilidade de substrato consolidado, o que normalmente resulta no desenvolvimento de comunidades incrustantes diversificadas. Aliada às alterações no hidrodinamismo local, provocadas por quebra-mares ou molhes, essa nova disponibilidade de recursos espaciais, alimentares e refúgios pode resultar também em assembleias de consumidores abundantes e diversificados. Entretanto, este efeito positivo é dependente da intensidade de outros impactos que normalmente estão associados à submersão dessas estruturas (e.g. aumento da sedimentação e de poluentes). Um dos principais processos que estruturam as comunidades de organismos incrustantes é a predação exercida por peixes actinopterígios de diferentes estágios pós-larvais, podendo causar variações em micro-escala (i.e. metros), não necessariamente notáveis em escalas maiores (i.e. quilômetros). Desta forma, a predação pode ser responsável por certa variação temporal e espacial na estruturação e composição das comunidades recifais. Neste contexto, os objetivos deste estudo foram caracterizar quali e quantitativamente, e temporalmente, por meio de censos visuais subaquáticos, a ictiofauna de duas áreas próximas (130 m) em um mesmo ambiente recifal artificial do Yacht Club de Ilhabela (Canal de São Sebastião, São Paulo, Brasil) (Capítulo 1), além de investigar, por meio de observações, registros em vídeos e experimentação in situ, o papel da predação por estes peixes sobre as comunidades locais incrustantes (Capítulo 2). Diferenças em relação às assembleias de peixes entre as áreas estudadas foram evidenciadas nas estações quentes e úmidas (verão e primavera), quando a área abrigada apresentou maior riqueza e abundância. A área do quebra-mar foi caracterizada pela intensa presença do herbívoro territorialista Scartella cristata, enquanto a área dentro da marina apresentou dominância de cardumes de Harengula jaguana e do onívoro generalista Diplodus argenteus. Ao se avaliar a frequência alimentar das espécies foi registrado um pico de atividade no período das 12h00-14h00 na área de dentro da marina, o qual pode ter relação direta com a luminosidade. Cinco espécies de peixes recifais foram registradas predando a comunidade incrustante estabelecidas em placas de PVC, sendo que D. argenteus foi a que exerceu maior pressão de predação, atribuindo-se a esta espécie 94% das 1.6652 mordidas registradas. A área do quebra-mar apresentou maior pressão de predação, com maior número de registros de predação e de mordidas na comunidade incrustante. Os principais itens alimentares predados foram ascídias (especialmente dideminídeos), serpulídios e briozoários arborescentes em ambas as áreas. Este estudo monstra que diferentes áreas podem responder de forma contrastante a um distúrbio ambiental, além de apresentar estruturas de comunidade variáveis no tempo e espaço. Diferenças em micro-escala nas condições ambientais, como as causadas pela construção de marinas, podem afetar a predação por peixes sobre a comunidade incrustante e assim modular sua estrutura, porém isto também pode ser relacionado à disponibilidade de alimento (presas). / Anthropic constructions can increase the availability of consolidated substrate, which usually results in the development of diverse incrusting community. Coupled with local hydrodynamics changes, caused by breakwaters or jetties, this new availability of shelter, food and space resources can also result in abundant and diverse consumer assemblages. However, this positive effect is highly dependent on the intensity of other impacts that are usually associated to the submersion of coastal structures (e.g. sedimentation and pollution). One of the main processes that structure the communities of incrusting organisms is predation exerted by Actinopterygii fishes of different post-larval stages, what may cause variations in micro-scale (i.e. meters), not necessarily recorded at larger scales (i.e. kilometers). Thus, predation may be responsible for certain temporal and spatial variation in the structure and composition of reef communities, especially when it occurs on the recruits of the species with the highest representation in the larval plankton (higher potential for recruitment) before the interactions of competition post-settlement entered in progress. In this context, the objectives of this study were characterize qualitatively and quantitatively, and temporally, fish populations in two nearby areas (130 m) in the same artificial reef environment (Chapter 1), and investigate the role of predation by these fishes on local incrusting communities (Yacht Club de Ilhabela, São Sebastião Channel, São Paulo, Brazil) (Chapter 2). Differences from the abundance and richness of fishes between the studied areas were observed in the hot and wet seasons (spring and summer), when the area inside the marina showed higher richness and abundance than breakwater. The area of breakwater was characterized by intense presence of territorial herbivore Scartella cristata, while the area inside the marina presented dominance by schools of Harengula jaguana and generalist species Diplodus argenteus. When assessing the food frequency, I recorded a peak of activity during 12h00-14h00. Five reef fish species were recorded preying on the incrusting community, and D. argenteus exerted the highest predation pressure, accounting for 94% of the 16,652 registered bites. The area of the breakwater showed higher predation pressure, but had lower richness of predators. The main food items preyed were ascidians (especially didemnids), serpulids and arborescent bryozoans, varying according to the area. The data showed that different areas may respond differently in relation to an environmental disturbance, with community structures varying in time and space. Differences in micro-scale environmental conditions, such as those caused by the construction of marinas, can affect predation by fish and so modulate the structure of in the incrusting community, but it may also be related to the availability of food (prey items).
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Estimativas do coeficiente de herdabilidade entre e dentro de famílias F5 de sojaFinholdt, Rafael Santos [UNESP] 29 June 2012 (has links) (PDF)
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finholdt_rs_me_jabo.pdf: 346249 bytes, checksum: cc24b2ba09715872e92e5acd7aa86e7e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O aumento de produtividade é fator preponderante para o melhoramento de soja e lançamento de novas cultivares. A herdabilidade é o parâmetro que indica a porção genética que será transmitida aos descendentes, sendo de suma importância para os melhoristas conhecerem a herança de cada caráter. O objetivo do trabalho foi estimar as variâncias e os coeficientes de herdabilidades nos sentidos amplo e restrito em populações F5 de soja. O experimento foi conduzido em 2010/11 no delineamento experimental de blocos aumentados de Federer, com quatro cruzamentos biparentais e testemunhas intercalares, em Jaboticabal-SP. Os dados foram analisados utilizando-se o Software Genes. Pelos resultados nota-se estimativas de herdabilidades maiores entre famílias quando comparadas a dentro de famílias, o que indica que a seleção é mais favorável entre famílias quando se avançam as gerações. As estimativas dos coeficientes de herdabilidades nos sentidos amplo e restrito foram próximas, na maioria das situações, mostrando que a maior parte da variância genética é de natureza aditiva, onde métodos de seleção simples podem levar a ganhos satisfatórios. Obteve-se elevados coeficientes de variação genéticos (CVg), onde a razão do coeficiente de variação genético pelo coeficiente de variação experimental (CVg/CVe) pode favorecer o direcionamento da seleção / Yield increase is one of the main factors for soybean breeding for the new cultivars release. Heritability is the parameter that indicates the genetic proportion transmitted to offspring, being very important for breeders to know the traits inheritance. The aim of this work was to estimate variances and heritability coefficients both on broad and narrow sense in F5 soybean populations. The experiment was conducted in 2010/11 season, using Federer augmented blocks design with 4 biparental crosses and intercalated checks, in Jaboticabal-SP. Data were analised using Genes Software. By the results, it can be noticed that heritability among families showed higher estimates when compared to within families estimates; this indicates that selection among families is more favorable for advancing generation. The estimation of heritability coefficients in broad sense and narrow sense were close in most of the situations, showing that the largest part of genetic variance is of additive nature, in which simple selection methods can lead to satisfactory genetic gains. High genetic variance coefficients were obtained, where the relation between genetic variance coefficient and experimental variance coefficient can be favorable to guide the selection
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Variação genética e desempenho de progênies de Pinus caribaea var. hondurensis para produção de madeira e resinaSantos, Wanderley dos [UNESP] 24 February 2014 (has links) (PDF)
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000843769.pdf: 2393250 bytes, checksum: 8fc6404791a243e0e69ba4d6f4a32b14 (MD5) / inus caribea var. hondurensis é a espécie do gênero Pinus mais importante para regiões tropicais. Sua madeira e resina são utilizadas em vários nichos do setor florestal. Porém, a oferta de sementes com qualidade genética é disponibilizada somente por poucas empresas privadas e instituições públicas. Com o objetivo de contribuir para o avanço do programa de melhoramento de Pinus, a proposta do trabalho foi verificar o efeito de competição sobre as estimativas dos parâmetros e do ganho genético de um teste de progênies de P. caribaea var. hondurensis para produção de madeira e resina, bem como analisar a relação entre esses caracteres. O experimento foi estabelecido em delineamento látice 10 x 10, triplo, com 100 tratamentos (96 progênies de um pomar de sementes clonal de P. caribaea var. hondurensis e quatro testemunhas comerciais), dez plantas por parcelas, no espaçamento de 3 x 3 m. Aos 12 anos após o plantio foi realizado um desbaste seletivo, com base nos caracteres silviculturais, mantendo-se seis plantas por parcela. Aos 27 anos após o plantio, a altura total, o diâmetro à altura do peito e a produção de resina dos indivíduos remanescentes foram mensurados. Análise de deviance e as estimativas dos parâmetros genéticos, o ganho esperado na seleção foram realizadas com e sem o efeito de competição, de acordo com o procedimento REML/BLUP. Ainda foram estimados, as correlações genéticas e fenotípicas e a divergência genética. Diferenças fenotípicas significativas, principalmente considerando o efeito da covariável, foram observadas entre e dentro de progênies para todos caracteres avaliados. O desbaste realizado aos 12 anos após o plantio influenciou de modo positivo os caracteres diâmetro à altura do peito e produção de resina. Os valores médios desses caracteres foram de 30,62 cm e 4,83 kg/arv .- 1 /ano -1, respectivamente. Os coeficientes de... / Pinus caribea var. hondurensis is a species of the genus Pinus which is very important to tropical regions. Its wood and resin are used in various niches of the forest sector. However, the supply of quality genetic seeds are produced by few private companies and public institutions, especially by those in the resin sector. The aim is to contribute to the advances in P. caribaea var. hondurensis breeding cycles. The purpose of this work was to verify the competition effect on the estimates of genetic parameter and gain of a P. caribaea var. hondurensis progeny trial for wood and resin production as well as to verify the correlation between these traits. The experiment was established in lattice design 10 x 10 (triple), 100 treatments (96 progeny of a clonal seed orchard and four commercial control of P. caribaea var. hondurensis), 10 plants by plot, spaced at 3 m x 3 m. At twelve years after planting the test plots was thinning which left six plants per plot. The total height, diameter at breast height and the resin production o fall remaining were measured at 27 years following the planting. Analysis of deviance, genetic parameter estimates, the expected gain in the selection, with and without competition effect, and genetic and phenotypic correlation was based on REML/BLUP procedure. Significant phenotypic differences were observed among and within progeny for all available traits, especially with regards to evaluating the competition effect. The thinning at 12 years after planting contributed positively to the increase of plant diameter at breast height and resin production, with an average of 30.62cm and 4.83kg/tree .-1 /year -1 . The individual narrow sense of heritability ranged from 0.25 to 0.38 for dbh and volume. The correlations between the growing traits were positive and significant. Therefore, different selection methods will be proposed separately for two traits (resin and wood). Despite ...
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Diversidade fenotípica e molecular de cultivares brasileiras de soja portadoras de gene RR /Villela, Otávia Tiago. January 2013 (has links)
Orientador: Sandra Helena Unêda Trevisoli / Coorientador: Antonio Orlando Di Mauro / Banca: Dilermando Perecin / Banca: Maria Imaculada Zucchi / Resumo: O estudo da diversidade genética e o conhecimento das relações entre cultivares melhoradas é fundamental para os programas de melhoramento de soja. Sabe-se que existe um grande número de cultivares comercializadas no Brasil entretanto, pequena variabilidade genética está disponível entre elas, em razão da estreita base genética do germoplasma brasileiro. No Brasil mais de 80% do cultivo total de soja provém de sementes geneticamente modificadas, entretanto nada se sabe sobre as relações de parentesco existentes entre os genótipos cultivados. O objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade genética entre 74 cultivares de soja RR oriundas de diferentes programas de melhoramento genético. As análises foram baseadas em técnicas de estatística multivariada a partir de caracteres agronômicos e marcadores moleculares microssatélites (SSR). Dez caracteres agronômicos quantitativos foram empregados nas análises da distância Euclidiana, agrupamento por Tocher, agrupamento pelo critério UPGMA e análise por componentes principais. A diversidade genética, estimada utilizando-se marcadores moleculares, foi realizada por meio de 86 iniciadores SSR polimórficos analisados pelo coeficiente de Jaccard e pela metodologia de agrupamento UPGMA. Para os caracteres agronômicos, as cultivares foram separadas em sete grupos distintos segundo os métodos de Tocher e UPGMA. Neste estudo, a análise de componentes principais revelou que os caracteres número de dias para florescimento, produção de grãos, valor agronômico e número de dias para maturidade foram os que mais contribuíram para a diferenciação das cultivares. O dendrograma gerado com base nos dados moleculares pelo critério de agrupamento UPGMA revelou a formação de seis grupos. Os marcadores SSR amplificaram 195 alelos entre as cultivares e apresentaram valor médio de PIC de 0,42. Tanto as análises baseadas em ... / Abstract: The study of genetic diversity and the knowledge of the relationships among improved cultivars is essential for soybean breeding programs. It is known that there is a large number of cultivars marketed in Brazil however, little genetic variability is available among them, due to the narrow genetic base of Brazilian germplasm. In Brazil more than 80% of the total soybean crop comes from genetically modified seeds, however nothing is known about the evolutionary relationships among these cultivated genotypes. The objective of this study was to analyze the genetic diversity among 74 RR soybean cultivars from different genetic breeding programs. Analyzes were based on multivariate statistical techniques from agronomic traits and microsatellite molecular markers (SSR). Ten quantitative agronomic traits were used in the analysis of the Euclidean distance, Tocher and UPGMA clustering and principal component analysis. Genetic diversity, estimated using molecular markers, was performed with 86 polymorphic SSR primers, analyzed by Jaccard coefficient and by UPGMA clustering method. For agronomic data, the cultivars were separated into seven distinct groups according to Tocher and UPGMA methods. Principal components analysis revealed that among the studied agronomic traits, number of days to flowering, grain yield, agronomic value and number of days to maturity were the main contributors to differentiate cultivars. The dendrogram based on the molecular data and the UPGMA criterion revealed six groups. SSR markers amplified 195 alleles among cultivars and showed 0,42, average value of PIC. Both analyzes based on agronomic traits, as SSR molecular markers were efficient in estimating the genetic divergence among soybean cultivars that carry RR gene / Mestre
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Composição e variação temporal e nictemeral da fauna zooplanctônica na zona de arrebentação em Praia Grande, SP /Moreno, Danúbia. January 2017 (has links)
Orientador: Teodoro Vaske-Junior / Resumo: As áreas costeiras de baixa profundidade, como zonas de arrebentação de praias arenosas são pouco estudadas quando comparadas a outros ecossistemas costeiros. No entanto, são consideradas de grande importância ecológica, pois abrigam alta diversidade de organismos que se alimentam, reproduzem e buscam na região proteção contra predadores. A falta de estudos deve-se principalmente à alta hidrodinâmica existente, sendo muitas vezes difícil de amostrar, principalmente no período noturno. Este estudo analisou a variação temporal e nictemeral da fauna zooplanctônica existente na zona de arrebentação da Praia da Aviação que trata-se de uma praia densamente habitada localizada no município de Praia Grande na costa central do estado de São Paulo. Os organismos foram coletados com rede de plâncton através de arrastos horizontal, superficial e perpendicular à praia em profundidade de 1m. Dados de temperatura e salinidade também foram obtidos juntamente com observações visuais do estado de agitação do mar, vento local e nebulosidade. Este processo ocorreu bimensalmente entre Junho de 2013 e Abril de 2015 durante os períodos diurno e noturno, visando avaliar a variação na composição zooplanctônica e sua relação com as migrações verticais. O zooplâncton da praia analisada foi representado por 116 táxons, englobando organismos holoplanctônicos, meroplanctônicos, bentônicos (presentes na coluna d'água devido à alta turbulência) e bentoplanctônicos (organismos que realizam migração vertical)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Low depth coastal areas, such as surf zones at the sand beaches, are poorly studied when compared to other coastal ecosystems. However, they are considered of great ecological importance, because they shelter a high diversity of organisms that feed, reproduce and seek protection in the region against predators. The lack of studies is mainly due to the existing high hydrodynamics, and is often difficult to sample, especially at night. This study analyzed the temporal and nictemeral variation of the zooplankton existing in the surf zone of Praia da Aviação, a densely populated beach, located in the Praia Grande city, on the central coast of the State of São Paulo. The organisms were collected with plankton net through horizontal trawls, superficial and perpendicular to the beach in depth of 1m. Temperature and salinity data were also obtained along with visual observations of the state of sea agitation, local wind and cloudiness. This process occurred bimonthly between June 2013 and April 2015 during the day and night periods, With the objective of evaluating the variation in zooplankton composition and its relationship with vertical migrations. The zooplankton of the beach was represented by 116 taxa, including holoplanktonic, meroplanktonic, benthic organisms (present in the water column due to the high turbulence) and bentoplanktonic organisms (organisms that perform vertical migration). The faunal composition was quite diverse and, throughout the study, there was little variation in the diversity between the sampling periods as well as discrete seasonal variation. The total abundance of planktonic organisms captured in the daytime ranged from 384 to 14,746 org.m-³ (4.153.1 ± 5.766 org.m-³) and, during the night from 504 to 67,269 org.m-³ (7,845.3 Ñ 18,844 org.m-³). The zooplankton community demonstrated a significant difference (p <0.000), in terms of abundance, between the holoplankton... (Complete abstract electronic access below) / Mestre
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Diversidade fenotípica e molecular de cultivares brasileiras de soja portadoras de gene RRVillela, Otávia Tiago [UNESP] 26 April 2013 (has links) (PDF)
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000738177.pdf: 2127211 bytes, checksum: 7752b2eb6f5bb2aa912ceafe0347ae5e (MD5) / O estudo da diversidade genética e o conhecimento das relações entre cultivares melhoradas é fundamental para os programas de melhoramento de soja. Sabe-se que existe um grande número de cultivares comercializadas no Brasil entretanto, pequena variabilidade genética está disponível entre elas, em razão da estreita base genética do germoplasma brasileiro. No Brasil mais de 80% do cultivo total de soja provém de sementes geneticamente modificadas, entretanto nada se sabe sobre as relações de parentesco existentes entre os genótipos cultivados. O objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade genética entre 74 cultivares de soja RR oriundas de diferentes programas de melhoramento genético. As análises foram baseadas em técnicas de estatística multivariada a partir de caracteres agronômicos e marcadores moleculares microssatélites (SSR). Dez caracteres agronômicos quantitativos foram empregados nas análises da distância Euclidiana, agrupamento por Tocher, agrupamento pelo critério UPGMA e análise por componentes principais. A diversidade genética, estimada utilizando-se marcadores moleculares, foi realizada por meio de 86 iniciadores SSR polimórficos analisados pelo coeficiente de Jaccard e pela metodologia de agrupamento UPGMA. Para os caracteres agronômicos, as cultivares foram separadas em sete grupos distintos segundo os métodos de Tocher e UPGMA. Neste estudo, a análise de componentes principais revelou que os caracteres número de dias para florescimento, produção de grãos, valor agronômico e número de dias para maturidade foram os que mais contribuíram para a diferenciação das cultivares. O dendrograma gerado com base nos dados moleculares pelo critério de agrupamento UPGMA revelou a formação de seis grupos. Os marcadores SSR amplificaram 195 alelos entre as cultivares e apresentaram valor médio de PIC de 0,42. Tanto as análises baseadas em... / The study of genetic diversity and the knowledge of the relationships among improved cultivars is essential for soybean breeding programs. It is known that there is a large number of cultivars marketed in Brazil however, little genetic variability is available among them, due to the narrow genetic base of Brazilian germplasm. In Brazil more than 80% of the total soybean crop comes from genetically modified seeds, however nothing is known about the evolutionary relationships among these cultivated genotypes. The objective of this study was to analyze the genetic diversity among 74 RR soybean cultivars from different genetic breeding programs. Analyzes were based on multivariate statistical techniques from agronomic traits and microsatellite molecular markers (SSR). Ten quantitative agronomic traits were used in the analysis of the Euclidean distance, Tocher and UPGMA clustering and principal component analysis. Genetic diversity, estimated using molecular markers, was performed with 86 polymorphic SSR primers, analyzed by Jaccard coefficient and by UPGMA clustering method. For agronomic data, the cultivars were separated into seven distinct groups according to Tocher and UPGMA methods. Principal components analysis revealed that among the studied agronomic traits, number of days to flowering, grain yield, agronomic value and number of days to maturity were the main contributors to differentiate cultivars. The dendrogram based on the molecular data and the UPGMA criterion revealed six groups. SSR markers amplified 195 alleles among cultivars and showed 0,42, average value of PIC. Both analyzes based on agronomic traits, as SSR molecular markers were efficient in estimating the genetic divergence among soybean cultivars that carry RR gene
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Traços de história de vida de três espécies de peixes em riachos da bacia do rio Corumbataí-SP /Lourenço, Luzia da Silva. January 2013 (has links)
Orientador: Miguel Petrere Junior / Banca: Mauricio Cetra / Banca: Ursulla Pereira Souza / Banca: Walter Barrella / Banca: Roberto Goitein / Resumo: O presente trabalho tem como objetivo avaliar traços de história de vida reprodutivos e relações biométricas de três espécies de peixes de riachos, assim como a variação espacial no crescimento de uma das espécies. As amostragens foram realizadas mensalmente de abril de 2010 a março de 2011 em riachos pertencentes a quatro sub-bacias do rio Corumbataí (Cabeça, Corumbataí, Passa Cinco e Ribeirão Claro), localizadas na região sudeste do Brasil. Baseado no índice gonadossomático, a época de maturação gonadal de Geophagus brasiliensis e Astyanax altiparanae variou entre as estações (seca e cheia), enquanto para Piabina argentea, houve variação espacial (entre sub-bacias) e temporal. Parte da variação do índice gonadossomático de A. altiparanae está relacionada a alterações na profundidade, turbidez e pluviosidade, e para G. brasiliensis na pluviosidade, condutividade e turbidez. Entretanto para P. argentea apenas o oxigênio e a condutividade explicaram parte desta. O comprimento de primeira maturação apresentou variação espacial para todas as espécies. Quanto às relações biométricas a estimativa do peso específico com base nos dados de peso e volume, foi acima do peso específico da água 1,00 g/cm3 para G. brasiliensis e A. altiparanae, porém para P. argentea foi abaixo. O peso e o volume aumentam de forma similar em função do aumento em tamanho corporal, portanto a dispersão dos pontos da relação volume e comprimento e peso e comprimento são similares. Os resultados da análise de dados de crescimento somático de G. brasiliensis fornecem evidências de que o crescimento é um traço de história de vida que pode variar mesmo quando uma escala espacial pequena é utilizada. Modelos com indivíduos aninhados em local e em loca e subbacias ajustaram melhor aos dados de comprimento na respectiva idade do que o modelo ao nível de indivíduo... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The present study has as aim to assess the reproductive traits of the life history and biometrics relationships of the three fish species of the streams, as well as the spatial variation on growth one of the species. The samplings were performed monthly from April 2010 to March 2011 in streams belonging to four sub-basins in the Corumbataí river basin (Cabeça, Corumbataí, Passa Cinco e Ribeirão Claro), located in the south-eastern Brazil. Based on gonadosomatic index, the maturation time of the Geophagus brasiliensis and Astyanax altiparanae varied between seasons (dry and rainy), while for Piabina argentea there was spatial variation (among sub-basins), and temporal. Part of the variation in the gonadosomatic index of the A. altiparanae is related to the alteration in depth, turbidity and precipitation, and for G. brasiliensis in rainfall, conductivity and turbidity. However for P. argentea only oxygen and conductivity explained part of the variation in gonadosomatic index. The length at first maturation showed spatial variation for all species. For the biometrics relationships the estimated of the specific weight using the weight and volume data, was above of the specific weight of the water 1.00 g/cm3 for G. brasiliensis and A. altiparanae, therefore for P. argentea was below. The weight and volume increase similar in function of length. Thus the dispersion of the points of the volume and length and weight and length relationship is very close. The results about the somatic growth of the G. brasiliensis give evidence that the growth is a trait of the life history which can vary even when a small spatial scale is used. Models with individuals nested in sites and with individuals nested in sites and sub-basins fitted better the length-at-age data than the model with individual level. Therefore in growth analysis is important take in account the space and hierarchical... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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