Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-04-13T14:37:43Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 15404926 bytes, checksum: a8b04ee9995e204011a460fb2d269cc9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-13T14:37:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 15404926 bytes, checksum: a8b04ee9995e204011a460fb2d269cc9 (MD5) Previous issue date: 2016-02-23 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O Brasil é apontado como o mais importante centro de diversidade do maracujá e maior produtor mundial da fruta. Entretanto, a ocorrência de virose do endurecimento do fruto e a falta de variedades melhoradas, mais produtivas e com resistência às principais doenças limitam a qualidade e o potencial da cultura. A exploração da variabilidade genética dentro do gênero Passiflora constitui uma atividade importante no melhoramento para identificação de fontes de resistência às principais doenças do maracujazeiro e obtenção de novas variedades com atributos desejáveis. O primeiro capítulo teve como objetivo avaliar a reação de acessos do Banco de Germoplasma de Passiflora spp., ao CABMV e verificar a variabilidade genética disponível por meio de descritores morfológicos. Os resultados permitiram indicação e seleção de indivíduos com resistência/tolerância genética ao CABMV com destaque para os acessos BGP188 (P.edulis f. flavicarpa) e BGP 170 (P. malacophylla). Os agrupamentos indicaram grupos com potencial a serem utilizados em programas de melhoramento genético. Os descritores possibilitaram um melhor ordenamento das espécies P.edulis f. flavicarpa e nas demais espécies silvestres. O segundo capítulo teve com objetivo estimar a diversidade genética entre os acessos de maracujazeiro por meio de características físicos e químicas de frutos e indicar combinações para futuros trabalhos de melhoramento genético em Passiflora. As variáveis massa de casca, massa do fruto, diâmetro e comprimento de fruto contribuíram para a máxima variabilidade observada nos acessos de Passiflora. Para essas características cinco frutos são suficientes para predizer o valor real dos indivíduos com 90% de acurácia. Os caracteres rendimento de suco e acidez titulável apresentam baixa repetibilidade, indicando cautela na seleção de genótipos com base nessas características. O agrupamento UPGMA indicou a existência de variabilidade genética entre os acessos avaliados, apresentando grupos com acessos mais dissimilares com potencial a serem utilizados em futuras etapas de seleção e cruzamentos de genótipos. O terceiro capítulo teve como objetivo caracterizar morfologicamente e avaliar progênies da primeira geração de retrocruzamento para resistência ao CABMV. A incidência de virose avaliada nas progênies híbridas indicou que as progênies das séries RC1-H44 e RC1-H57, foram mais similares ao P. cincinnata, mais tolerantes ao CABMV e apresentaram baixos valores de absorvância. O híbrido RC1-H57-83 se destacou por apresentar menor índice de severidade do CABMV (15,6%), podendo ser utilizado como genitor feminino na geração RC2. A caracterização morfológica nas progênies híbridas possibilitou a identificação de indivíduos com características mais similares aos parentais e com diferentes graus de tolerância ao CABMV. O quarto capítulo teve como objetivo avaliar a recuperação do genoma recorrente em híbridos da primeira geração de retrocruzamento de Passiflora por meio de marcadores moleculares iPBS e selecionar genitores mais tolerantes ao CABMV. Os marcadores iPBS foram capazes de distinguir progênies RC1 de seus parentais e quantificou a recuperação do genoma recorrente. As progênies RC1-H57-89 e RC1-H49-77 com maior percentagem do genoma do genitor recorrente apresentam também maior severidade de virose. As progênies RC1-H57-85 e RC1-H57-91 por serem mais tolerantes ao CABMV são promissoras ao próximo ciclo de retrocruzamento. A análise de agrupamento revelou variabilidade genética entre as progênies RC1, o que demonstra potencial para serem utilizadas nas gerações seguintes de retrocruzamento. / Brazil is named as the most important passion diversity center and largest producer in the world of fruit. However, the occurrence of the virtual hardening of the fruit and the lack of improved varieties, more productive and resistance to major diseases limit the quality and potential of culture. The exploitation of genetic variability within the genus Passiflora is an important activity in improving to identify sources of resistance to major diseases of passion fruit and obtain new varieties with desirable attributes. The first study aimed to evaluate the reaction of hits the Germplasm Bank of Passiflora spp., to CABMV and verify the genetic variability available through morphological descriptors. The results allowed the nomination and selection of individuals with resistance / tolerance to genetic CABMV highlighting the BGP188 access (P. edulis f. flavicarpa) and BGP 170 (P. malacophylla). The groups indicated groups with potential to be used in breeding programs. The descriptors enabled better planning of species P. edulis f. flavicarpa and in other wild species. The second study was in order to estimate the genetic diversity among passion fruit accesses through physical-chemical characteristics of fruits and point combinations for future work on genetic improvement in Passiflora. The mass variables bark, fruit weight, fruit diameter and length contributed to the maximum variability observed in Passiflora hits. For these five fruit characteristics are sufficient to predict the actual value of individuals with 90% accuracy. The characters juice yield and acidity have low repeatability, indicating caution in the selection of genotypes based on these characteristics. The UPGMA indicated the existence of genetic variability among accessions, with groups with more dissimilar access with potential to be used in future stages of selection and genotypes crossings. The third study aimed to characterize morphologically and evaluate progeny of the first generation of backcrossing to resistance CABMV. The incidence of virus assessed in hybrid progenies indicated that the progenies of RC-H44 and RC1-H57 series, were more similar to P. cincinnata, more tolerant CABMV and had low absorbance values. The hybrid RC1-H57-83 stood out with less CABMV severity index (15,6%) and can be used as female parent in RC2 generation. Morphological characterization in hybrid progeny, allowed the identification of individuals with the most similar characteristics to parental and with different degrees of tolerance CABMV. The fourth study was to evaluate the recovery of recurrent genome in hybrids of the first generation of backcrossing Passiflora through molecular markers IPBS and select more tolerant parents to CABMV. The IPBS markers were able to distinguish RC1 offspring of their parents and quantified the recovery of recurrent genome. The RC1- H57-89 and RC1-H49-77 progenies with the highest percentage of recurrent parent genome also have greater severity of virus. The RC1-H57-85 and RC1-H57-91 progenies to be more tolerant CABMV are promising the next backcross cycle. Cluster analysis revealed genetic variation among progenies RC1, which demonstrates the potential to be used in the following generations of backcrossing.

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:24:23Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-07. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:30:35Z : No. of bitstreams: 1 000851956.pdf: 1446006 bytes, checksum: d0fd0cae1f3cd364c6ad457c27e8870b (MD5) / A cultura do pimentão (Capsicum annuum L.) tem elevada importância econômica e social para o Equador. Vários fatores têm contribuído para a baixa produtividade dessa cultura no país e dentre eles destacam-se as doenças de diversas etiologias. Poucas informações sobre a ocorrência de doenças nessa cultura estão disponíveis nas para as condições equatorianas. Neste trabalho foi realizado levantamento da ocorrência da doença pata seca e de viroses na cultura do pimentão, em plantios comerciais, durante anos de 2013 e 2014; a identificação dos agente(s) causal(ais) da pata seca; avaliações do eficácia da pulverização da aplicação de produtos fitossanitários (sulfato de cobre + fosetil alumínio; iprodione + clorotalonil; Trichoderma harzianum + T. koingii) em condições de campo, no controle da doença nos híbridos Nathalie e Quetzal e a sensibilidade in vitro do(s) patógeno(s) dessa doença a fungicidas (tebuconazole, benomil, clorotalonil, fosetil alumínio, iprodione, metalaxil + propanocarb e tebuconazole). A pata seca foi constatada em um 79,2% das propriedades, com incidência entre 5% a 53,6%, em quanto as viroses, foram detectada em 62,5% das propriedades, com incidência entre 9,6% a 61,2%. Os fungos S. clerotium rolfsii e Fusarium spp. foram isolados com maior freqüência das plantas com sintomas de pata seca. Entretanto, S.rolfsii foi mais virulento, sendo considerado o principal agente causal da doença pata seca. Não foi observada diferença dos produtos fitossanitários, aplicados no colo das plantas, na incidência de pata seca, nos dois ensaios realizados em campo. A aplicação de iprodione + clorotalonil propiciou uma maior quantidade de frutos comerciais nos dois ensaios e uma maior produção em um dos ensaios. Os Isolados de S. rolfsii apresentaram maior sensibilidade aos fungicidas tebuconazole, benomil e iprodione, ... / Sweet pepper (Capsicum annuum L.) has high economic and social importance for Ecuador. Several factors have contributed to the low productivity of this crop in the country and among them there are the diseases of different etiologies. Little information on the occurrence of diseases in this culture is available to the Ecuadorian conditions. This study was carried out survey of the occurrence of the disease pata seca and viruses in sweet pepper in commercial plantations, during the years 2013 and 2014; the identification of the agent (s) causal (es) of pata seca; evaluations of the effectiveness of spray application of pesticides (copper sulfate + fosetyl aluminum, iprodione + chlorothalonil; Trichoderma harzianum + T. koingii) in field conditions in controlling the disease in hybrid Nathalie and Quetzal and in vitro sensitivity ( s) pathogen (s) of the disease to fungicides (tebuconazole, benomyl, chlorothalonil, fosetyl aluminum, iprodione, metalaxyl + propanocarb and tebuconazole). The pata seca was found in a 79.2% of the properties, with an incidence of 5% to 53.6%, as in the viruses were detected in 62.5% of the properties, with an incidence of 9.6% to 61.2%. The fungus Sclerotium rolfsii and Fusarium spp. were isolated more frequently plants with symptoms of pata seca. However, S. rolfsii was more virulent, being considered the main causative agent of the disease pata seca. There was no difference of pesticides applied in the base of the plants, the incidence of pata seca in the two trial carried out in the field. The application of iprodione + chlorothalonil provided a larger amount of fruits in the two ...

Made available in DSpace on 2015-05-14T16:53:21Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-26Bitstream added on 2015-05-14T16:58:58Z : No. of bitstreams: 1 000822105.pdf: 1203927 bytes, checksum: 777ff3545f9d68b597faed4db3fe6c67 (MD5) / A exposição das plantas a diferentes estresses bióticos e abióticos interferem com os padrões de expressão de diversos genes. Estudos sobre a expressão diferencial de genes em plantas de tomate infectadas com Pepper yellow mosaic virus (PepYMV gênero Potyvirus) revelaram a repressão de um gene que codifica um receptor do tipo LRR-RLK (leucine-rich repeat receptor-like kinase). Este mesmo receptor, porém, não figura no rol de receptores induzidos pela infecção do tomateiro por um Tospovirus, sugerindo um comportamento diferencial deste gene frente à infecção por outras espécies virais. Os LRR-RLKs constituem um grupo diverso de proteínas ancoradas na membrana plasmática que permitem à célula reconhecer e responder ao ambiente extracelular, sendo um componente da via de transdução de sinal. Este estudo teve como objetivos caracterizar molecular e funcionalmente o gene que codifica um LRR-RLK (recentemente denominado SOBIR1) em plantas de tomate (Solanun lycopersicum) infectadas pelos vírus PepYMV e Tomato chlorotic spot virus (TCSV), gênero Tospovirus, com o intuito de desvendar uma possível participação desse receptor no desencadeamento da resposta de defesa durante a infecção por essas duas espécies virais. A caracterização molecular do gene SlSOBIR1 foi obtida através da análise do perfil de expressão do receptor frente às infecções pelos vírus PepYMV e TCSV e em resposta ao estresse mecânico por meio da técnica de PCR em tempo real. Em paralelo, os níveis de expressão de SlSOBIR1 em diferentes órgãos/ tecidos da planta, bem como a localização subcelular de seu produto foi investigada e uma árvore filogenética foi construída. Nos estudos funcionais foi verificado o efeito da superexpressão do gene SlSOBIR1 em plantas de tabaco infectadas com cada uma das espécies virais. Além disso, investigou-se a expressão de genes de defesa previamente selecionados e espécies reativas de ... / The exposure of plants to various biotic and abiotic stresses interferes with the expression patterns of different host genes. Studies on differential gene expression in tomato plants infected with Pepper yellow mosaic virus (PepYMV) revealed the repression of a gene encoding a leucine-rich repeat receptor-like kinase (LRR-RLK). However, this receptor didn’t figure among the receptors induced in tomato during the infection of a viral species belonging to the Tospovirus genus, suggesting a differential behavior of this gene in response to other virus species. LRR-RLKs constitute a diverse group of proteins anchored in the plasma membrane allowing the cell to recognize and respond to the extracellular environment, being a component of the signal transduction pathway. This study aimed to perform a molecular and functional characterization of the gene encoding such a LRR-RLK from tomato (Solanum lycopersicum) (recently nominated SlSOBIR1) infected by PepYMV and Tomato chlorotic spot virus (TCSV), Tospovirus genus, in order to reveal a possible implication of this receptor in triggering defense responses during infection by these two viral species. Molecular characterization of SlSOBIR1 was acquired through the determination of its expression profile in response to PepYMV and TCSV infection, respectivelly, and to mechanical wounding employing real-time PCR. In parallel, SlSOBIR1 expression levels on different tomato organs/tissues were determined and protein subcellular localization investigated, and a phylogenetic tree was constructed. In functional studies, the effect of SlSOBIR1 overexpression in tobacco plants infected with each virus species was observed. Furthermore, we investigated the expression of previously selected defense genes and determined reactive oxygen species accumulation in SlSOBIR1-overexpressors. The results revealed that the expression of SlSOBIR1 is modulated differently in tomato plants infected PepYMV (repression) ...

Made available in DSpace on 2015-05-14T16:53:23Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-12-16Bitstream added on 2015-05-14T16:58:54Z : No. of bitstreams: 1 000828431.pdf: 2597564 bytes, checksum: d2a5d2090c67ea6f9db3f644cfef982f (MD5) / Realizou-se levantamento sorológico dos seguintes vírus respiratórios Herpesvírus Bovino 1 (BoHV-1), Vírus da Diarreia Viral Bovina (BVDV), Vírus da Parainfluenza Bovina Tipo 3 (bPIV-3) e Vírus Respiratório Sincicial Bovino (BRSV) em bovinos da raça Holandesa variedade Preta e Branca (HPB), criados no estado do Paraná. Colheram-se 714 amostras de sangue da veia jugular de bovinos, não vacinados para os agentes estudados, com mais de seis meses de idade, de 26 propriedades leiteiras, distribuídas em 17 municípios do estado do Paraná. Paralelamente à colheita, aplicou-se um questionário para cada propriedade estudada, com a finalidade de avaliar os fatores de risco associados aos vírus examinados. As amostras sorológicas foram submetidas ao teste de diagnóstico de virusneutralização no Laboratório de Viroses de Bovinos do Instituto Biológico de São Paulo. Foram observadas prevalências de 22,3%; 35,8%; 80,4% e 93,5% de bovinos sororreagentes e 65,3%, 88,5%, 96,1% e 100% das propriedades reagentes para BoHV-1, BVDV, bPIV-3 e BRSV, respectivamente. A coinfecção que ocorreu com maior prevalência foi a bPIV-3 e BRSV (37,1%). Após análise de regressão logística, os fatores de risco associados ao BoHV-1 foram: bovinos com idade maior que 48 meses (OR=15,012; IC95% 7,500 – 30,051), área da propriedade 26 a 50 hectares (OR=11,328; IC95% 2,482 – 51,697), lotação maior de três bovinos por hectare (OR=1,026; IC95% 0,370 – 2,847), percentual de entrada maior que 10% de bovinos (OR=52,520; IC95% 13,269 – 207,876); para o BVDV foram: bovinos com idade maior que 48 meses (OR=4,407; IC95% 2,456 – 7,906), região Sudoeste (OR=52,388; IC95% 4,629 – 5892,873), sistema de produção semi-intensivo (OR=1,333; IC95% 0,261 – 6,815), propriedade com número de animais menor ou igual a 50 bovinos (OR=16,682; IC95% 3,218 – 86,481), percentual de entrada maior que 10% de bovinos (OR=17,56; IC95% 7,613 – 40,506) e ... / A serological survey of the following respiratory viruses: Bovine Herpesvirus 1 (BoHV-1), Bovine Viral Diarrhea Virus (BVDV), Bovine Parainfluenza Virus Type 3 (bPIV-3) and Bovine Respiratory Syncytial Virus (BRSV) in Holstein cattle black and White (HPB), raised in Paraná state was performed. 714 blood samples were collected from the jugular vein of cattle not vaccinated for the studied agents, over six months of age, from 26 dairy herds, distributed in 17 municipalities of Paraná state. Alongside the collection, a questionnaire was used for each property studied in order to assess the risk factors associated with the viruses examined. The serum samples were subjected to the diagnosis test of virus neutralization at the Laboratory of Viral Diseases of Cattle of the Biological Institute of São Paulo. Frequencies of 22.3%; 35.8%; 80.4% and 93.5% of seropositive cattle were observed and 65.3%, 88.5%, 96.1% and 100% of the seropositive properties BoHV-1, BVDV, bPIV-3 and BRSV, respectively. The co-infection that occurred most frequently was the bPIV-3 and BRSV (37.1%). After logistic regression analysis, risk factors associated with BoHV-1 were cattle with more than 48 months of age (OR = 15.012; 95% CI 7.500 to 30.051), property area 26-50 hectares (OR = 11.328; 95% CI 2.482 – 51.697), stocking higher than three animals per hectare (OR = 1.026; 95% CI 0.370 to 2.847), cattle entry percentage higher than 10% (OR = 52.520 entry; 95% CI 13.269 to 207.876); for BVDV were cattle older than 48 months (OR = 4.407; 95% CI 2.456 to 7.906), Southwest region (OR = 52.388; 95% CI 4.629 to 5892.873), semi-intensive production system (OR = 1.333; 95% CI 0.261 to 6.815),property with fewer animals than or equal to 50 (OR = 16.682; 95% CI 3.218 to 86.481), a percentage of cattle entry higher than 10% (OR = 17.56; 95% CI 7.613 – 40.506) and neighboring pasture sharing (OR = 9.148; 95% CI 3.751 to 22.310); for bPIV-3 cattle older than 48 months ...

Made available in DSpace on 2014-12-02T11:16:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-28Bitstream added on 2014-12-02T11:21:34Z : No. of bitstreams: 1 000800093.pdf: 1604007 bytes, checksum: fc387108db5759835424542fb2e70f86 (MD5) / A mosca - branca, Bemisia tabaci (Gennadius) , é um complexo composto por pelo menos 36 espécies crípticas. É uma das mais importantes pragas agrícolas do mundo, sendo vetora de fitovírus, como os begomovírus (gênero Begomovirus , família Geminiviridae ) e cri nivírus (gênero Crinivirus , família Closteroviridae ) que causam sérios problemas em plantas de diversos países do mundo. Desde o final dos anos 80, a espécie Middle East - Asia Minor 1 – MEAM1 (conhecida como biótipo B) tem emergido em muitas regiões tropica is e subtropicais do mundo, deslocando as populações de B. tabaci até então existentes nestas regiões. Trabalhos prévios demonstraram que no Brasil apesar de MEAM1 predominar, existem duas espécies nativas chamadas de New World (NW, também conhecida como b iótipo A) e New World 2 encontradas no Estado de São Paulo. No primeiro capítulo da tese intitulado “Indigenous American species of the Bemisia tabaci complex are still widespread in the Americas” ficou evidenciado que MEAM1 não dizimou completamente as mo scas brancas nativas. NW está presente ao menos na Argentina, Brasil, Ilha de Martinica, México, E stados Unidos e Venezuela , enquanto que foi detectada NW2 na Argentina, Bolívia e Brasil. Espécies invasoras ( Euphorbia sp. e Ipomoea sp.), assim como plantas cultivadas como o tomateiro, soja e algodão podem ser hospedeiras de NW e NW2 . Outra espécie altamente invasiva que merece atenção é a Mediterranean (MED, também conhecida por biótipo Q), por apresentar resistência à maioria dos inseticidas utilizados na agricultura. O segundo capítulo intitulado “First report of ... / The whitefly Bemisia tabaci (Gennadius) is a com plex of at least 36 cryptic species. It is one of the most important agricultural pests in the world, being vector of begomoviruses (genus Begomovirus , family Geminiviridae ) and crinivirus (genus Crinivirus , family Closteroviridae ) that cause serious probl ems in plants in many countries worldwide. Since the late 80s, the Middle East - Asia Minor 1 species – MEAM1 (known as biotype B) has emerged in many tropical and subtropical regions of the world, displacing native populations of B. tabaci . Previous work de monstrated that in Brazil at least two indigenous species called New World (NW, formerly the A biotype) and New World 2 (NW2) were still present in São Paulo State. Our first chapter entitled “Indigenous American species of the Bemisia tabaci complex are s till widespread in the Americas” highlight that MEAM1 has not completely displaced the native B. tabaci from the Americas. NW is present at least in Argentina, Brazil, Martinique, Mexico, United States and Venezuela, and NW2 in Argentina, Bolivia and Brazi l. Wild plants ( Euphorbia sp. and Ipomoea sp.) as well ...

Orientador: Renate Krause Sakate / Coorientador: Julio Massaharu Marubayashi / Banca: Enrico Moriones Alonso / Banca: Antonio Carlos Maringoni / Banca: Marcelo Augusto Boechat Morandi / Banca: Valdir Atsushi Yuri / Banca: Kelly Cristina Gonçalves Rocha / Resumo: A mosca - branca, Bemisia tabaci (Gennadius) , é um complexo composto por pelo menos 36 espécies crípticas. É uma das mais importantes pragas agrícolas do mundo, sendo vetora de fitovírus, como os begomovírus (gênero Begomovirus , família Geminiviridae ) e cri nivírus (gênero Crinivirus , família Closteroviridae ) que causam sérios problemas em plantas de diversos países do mundo. Desde o final dos anos 80, a espécie Middle East - Asia Minor 1 - MEAM1 (conhecida como biótipo B) tem emergido em muitas regiões tropica is e subtropicais do mundo, deslocando as populações de B. tabaci até então existentes nestas regiões. Trabalhos prévios demonstraram que no Brasil apesar de MEAM1 predominar, existem duas espécies nativas chamadas de New World (NW, também conhecida como b iótipo A) e New World 2 encontradas no Estado de São Paulo. No primeiro capítulo da tese intitulado "Indigenous American species of the Bemisia tabaci complex are still widespread in the Americas" ficou evidenciado que MEAM1 não dizimou completamente as mo scas brancas nativas. NW está presente ao menos na Argentina, Brasil, Ilha de Martinica, México, E stados Unidos e Venezuela , enquanto que foi detectada NW2 na Argentina, Bolívia e Brasil. Espécies invasoras ( Euphorbia sp. e Ipomoea sp.), assim como plantas cultivadas como o tomateiro, soja e algodão podem ser hospedeiras de NW e NW2 . Outra espécie altamente invasiva que merece atenção é a Mediterranean (MED, também conhecida por biótipo Q), por apresentar resistência à maioria dos inseticidas utilizados na agricultura. O segundo capítulo intitulado "First report of ... / Abstract: The whitefly Bemisia tabaci (Gennadius) is a com plex of at least 36 cryptic species. It is one of the most important agricultural pests in the world, being vector of begomoviruses (genus Begomovirus , family Geminiviridae ) and crinivirus (genus Crinivirus , family Closteroviridae ) that cause serious probl ems in plants in many countries worldwide. Since the late 80s, the Middle East - Asia Minor 1 species - MEAM1 (known as biotype B) has emerged in many tropical and subtropical regions of the world, displacing native populations of B. tabaci . Previous work de monstrated that in Brazil at least two indigenous species called New World (NW, formerly the A biotype) and New World 2 (NW2) were still present in São Paulo State. Our first chapter entitled "Indigenous American species of the Bemisia tabaci complex are s till widespread in the Americas" highlight that MEAM1 has not completely displaced the native B. tabaci from the Americas. NW is present at least in Argentina, Brazil, Martinique, Mexico, United States and Venezuela, and NW2 in Argentina, Bolivia and Brazi l. Wild plants ( Euphorbia sp. and Ipomoea sp.) as well ... / Doutor

Orientador: Marcos Antonio Machado / Resumo: A morte súbita dos citros (MSC) causou a morte ou erradicação de aproximadamente quatro milhões de plantas de laranja doce na principal região citrícola do Brasil. Embora sua etiologia ainda não esteja completamente resolvida, seus sintomas e distribuição (especial e temporal) indicam uma provável doença viral. Trabalhos anteriores associaram a MSC ao vírus da tristeza dos citros (CTV) e ao CSDaV (Citrus sudden death-associated virus), no entanto, os resultados obtidos destes trabalhos não são conclusivos. Afim de estudar as populações de vírus presentes em plantas de citros afetadas pela MSC, este trabalho realizou uma análise comparativa, através do sequenciamento de alta performance do transcriptoma e dos pequenos RNAs de plantas sintomáticas e assintomáticas para MSC. Os dados revelaram uma infecção viral mista, incluindo o CTV como vírus mais predominante, seguido do CSDaV, um pararetrovírus endógeno de citros (CitPRV) e dois possíveis novos vírus, putativamente denominados de Citrus jingmen-like virus (CJLV) e Citrus virga-like virus (CVLV). As análises de correlação com a MSC indicaram uma provável associação de plantas sintomáticas com o CitPRV, enquanto que os dois novos vírus mostraram estar mais associados com plantas assintomáticas. A associação mais evidente foi observada entre plantas sintomáticas e um genótipo específico de CSDaV, o que nos conduziu a um estudo mais específico de variabilidade genética de 31 isolados de CSDaV, obtidos de plantas MSC-sintomática... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

Orientador: Ivan de Godoy Maia / Banca: Simone da Graça Ribeiro / Banca: Celso Eduardo Benetti / Banca: Márcio Jisé da Silva / Banca: Celso Luís Marino / Resumo: A exposição das plantas a diferentes estresses bióticos e abióticos interferem com os padrões de expressão de diversos genes. Estudos sobre a expressão diferencial de genes em plantas de tomate infectadas com Pepper yellow mosaic virus (PepYMV gênero Potyvirus) revelaram a repressão de um gene que codifica um receptor do tipo LRR-RLK (leucine-rich repeat receptor-like kinase). Este mesmo receptor, porém, não figura no rol de receptores induzidos pela infecção do tomateiro por um Tospovirus, sugerindo um comportamento diferencial deste gene frente à infecção por outras espécies virais. Os LRR-RLKs constituem um grupo diverso de proteínas ancoradas na membrana plasmática que permitem à célula reconhecer e responder ao ambiente extracelular, sendo um componente da via de transdução de sinal. Este estudo teve como objetivos caracterizar molecular e funcionalmente o gene que codifica um LRR-RLK (recentemente denominado SOBIR1) em plantas de tomate (Solanun lycopersicum) infectadas pelos vírus PepYMV e Tomato chlorotic spot virus (TCSV), gênero Tospovirus, com o intuito de desvendar uma possível participação desse receptor no desencadeamento da resposta de defesa durante a infecção por essas duas espécies virais. A caracterização molecular do gene SlSOBIR1 foi obtida através da análise do perfil de expressão do receptor frente às infecções pelos vírus PepYMV e TCSV e em resposta ao estresse mecânico por meio da técnica de PCR em tempo real. Em paralelo, os níveis de expressão de SlSOBIR1 em diferentes órgãos/ tecidos da planta, bem como a localização subcelular de seu produto foi investigada e uma árvore filogenética foi construída. Nos estudos funcionais foi verificado o efeito da superexpressão do gene SlSOBIR1 em plantas de tabaco infectadas com cada uma das espécies virais. Além disso, investigou-se a expressão de genes de defesa previamente selecionados e espécies reativas de ... / Abstract: The exposure of plants to various biotic and abiotic stresses interferes with the expression patterns of different host genes. Studies on differential gene expression in tomato plants infected with Pepper yellow mosaic virus (PepYMV) revealed the repression of a gene encoding a leucine-rich repeat receptor-like kinase (LRR-RLK). However, this receptor didn't figure among the receptors induced in tomato during the infection of a viral species belonging to the Tospovirus genus, suggesting a differential behavior of this gene in response to other virus species. LRR-RLKs constitute a diverse group of proteins anchored in the plasma membrane allowing the cell to recognize and respond to the extracellular environment, being a component of the signal transduction pathway. This study aimed to perform a molecular and functional characterization of the gene encoding such a LRR-RLK from tomato (Solanum lycopersicum) (recently nominated SlSOBIR1) infected by PepYMV and Tomato chlorotic spot virus (TCSV), Tospovirus genus, in order to reveal a possible implication of this receptor in triggering defense responses during infection by these two viral species. Molecular characterization of SlSOBIR1 was acquired through the determination of its expression profile in response to PepYMV and TCSV infection, respectivelly, and to mechanical wounding employing real-time PCR. In parallel, SlSOBIR1 expression levels on different tomato organs/tissues were determined and protein subcellular localization investigated, and a phylogenetic tree was constructed. In functional studies, the effect of SlSOBIR1 overexpression in tobacco plants infected with each virus species was observed. Furthermore, we investigated the expression of previously selected defense genes and determined reactive oxygen species accumulation in SlSOBIR1-overexpressors. The results revealed that the expression of SlSOBIR1 is modulated differently in tomato plants infected PepYMV (repression) ... / Doutor

Orientador: Rolf Dieter Illg / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-23T13:18:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Siqueira_WalterJose_D.pdf: 11194906 bytes, checksum: fce62283a5b049541786b1b739673dae (MD5) Previous issue date: 1997 / Resumo: Bulbinhos obtidos em 1987 do cultivo in vitro de ápices caulinares (meristemas) dos cultivares Lavínia 1632, Amarante e Roxinho 5063 foram plantados inicialmente em casa-de-vegetação (1988) e, posteriormente, em condições de campo (1989 a 1995), com a finalidade de avaliar o desempenho agronômico, a estabilidade e adaptabilidade fenotípicas. De 1988 a 1991, os plantios sucessivos para multiplicação dos materiais foram realizados individualmente, bulbo a bulbo, como progênies ou linhas clonais, procedendo-se da mesma forma para os cultivares controles. No ciclo de multiplicação de 1990, cinco plantas de cada progênie clonal foram amostradas ao acaso e avaliadas para os seguintes caracteres de parte aérea: comprimento (CF) e largura de folha (LF), diâmetro do pseudo-caule (DC) e sintomas de viroses nas folhas(VIR). Os bulbos colhidos nas cinco plantas amostradas foram pesados em dois períodos (PB1 e PB2).No ano de 1991, os bulbos de cada planta amostrada constituíram-se em novas progênies clonais, avaliando-se o vigor das plantas (VIG), VIR e peso médio de bulbo (PM). As correlações fenotípicas nos anos de 1990 e 1991 e entre os dois anos, para os grupos de progênies clonais formados (n° 5, n° 6, n° 8, n° 19 e n° 34) e os controles, mostraram uma estreita associação de caracteres de parte aérea, tanto dentro, como entre os ciclos estudados. O caráter VIR mostrou no plantio de 1990, coeficientes de correlação fenotípica negativos e significativos com DC (r=44,91 a -57,48) e com PBl (r=-46,48 a -56,32). No ano seguinte, o caráter VIR correlacionou-se também com VIG e PM. As correlações fenotípicas de pares de caracteres entre os dois anos ou ciclos de multiplicação, foram significativas e de média magnitudes para a maioria das progênies estudadas. O caráter DC/90, foi o que apresentou maior grau de associação com os caracteres VIR, VIG e PM avaliados no ciclo de 1991. Concluiu-se que, a seleção no campo de plantas com maior DC, num determinado ciclo, produziu uma descendência clonal visualmente mais sadia e mais produtiva no ciclo subseqüente. Observou-se neste trabalho que, a avaliação visual de sintomas de vírus nas folhas, mostrou-se adequada para indicar o comportamento dos caracteres ligados ao vigor e peso de bulbo dentro e entre ciclos de multiplicação. As correlações fenotípicas obtidas para os clones experimentais nos ensaios de 1992 a 1995, mantiveram esta mesma tendência. Sobressaíram-se nestes ensaios os clones experimentais Ct 19, ct 34 e ct Rx, além do cultivar controle Gigante de Curitibanos. A seleção massal de plantas de maior vigor no campo, em especial para o diâmetro do pseudo-caule, ou de bulbos maiores mostrou-se eficiente na recuperação da produtividade dos cultivares controles Lavínia 1632 e Amarante. O clone experimental Ct 19 apresentou redução de produtividade ano a ano de tal forma que, em 1995 a produção relativa média igualou-se ao do cultivar controle Lavínia 1632 com seleção. Fato este, não observado para o clone Ct 34 que manteve o rendimento elevado ao longo de quatro anos de multiplicação. A melhor razão de multiplicação em termos de peso de bulbilhos plantados e peso de bulbos colhidos por metro quadrado de parcela, ficou ao redor de 1:12 (Ct 34, Ct 19) enquanto que os respectivos controles, cv Amarante e Lavínia 1632, tiveram os valores de 1:9,4 e 1:9,8. O estudo sobre a influência do tamanho de bulbilhos plantados no peso de bulbo colhido mostrou uma maior resposta para os clones experimentais derivados de ápices caulinares do que os cultivares controles, exceto para o cultivar Gigante de Curitibanos. Finalmente, o estudo da estabilidade fenotípica dos materiais, por dois modelos estatísticos, revelou os clones Ct 34 e cv Gigante de Curitibanos como os mais responsivos às modificações do ambiente e com maior estabilidade fenotípica. O ct 19, por sua vez, foi mais responsivo aos ambientes desfavoráveis do que nos favoráveis, muito embora, neste ultimo, o patamar de produção inicial tenha sido superior do que os demais / Abstract: Bulblets obtained in 1987 from in vitro culture of stem shoot tip (meristems) of cultivars Lavinia 1632, Amarante and Roxinho 5063 were mul tiplied ini tially in greenhouse (1988) and, later, in field condi tions (1989 to 1995) in order to evaluate the agronomic performance and phenotypic stability as compared to each other and to control cultivars. From 1988 to 1991, the plantings for multiplication were made bulb by bulb, as clonal progenies. The same procedures were observed for the original control cultivars, Lavinia 1632, Amarante and Roxinho 5063. In the 1990 cycle of multiplication, five plants were sampled from each progeny and evaluated for the following vegetative characters: lenght (LF) and width (WF)of the foliar blade, diameter of the pseudo-stem (DS) and leaf vírus symptoms (VS). The bulbs harvested from the five plants sampled were weighed individually after 50 days (BW1) and 160 days (BW2) after harvest. The follow year, progenies from such bulbs were grown and vigor of plant (VP), meam bulb weight (MW)and VS were recorded. The phenotypic correlations obtained from the characters within and between years (199O and 1991) for the each formed groups of clonal progenies (nºs 5, 6, 8, 19 and 34) and the controls showed a close association of the vegetative characters, either within or between the cycles studied, especially for clones 19 and 34. In 1990, VS showed highly significant phenotypic correlation coefficients with DS (r= -44,91 to -57,48) and BWl (r= -46,48 to -56,32). In 1991, VS was also strongly correlated with VP and MW. The phenotypic correlations of the paired characters between both years or cycles of multiplication were significant and of medium magnitude in most of the progenies studied. The character DS/90 showed the highest associations with the three characters evaluated in the 1991 cycle, VIR, VIG and MW. It was concluded that field selection of plants with larger DS, in a given cycle, greatly contributed to obtain healthier plants and with higher yields in the next cycle. It was observed that the visual evaluation of virus symptoms in leaves, made in a practical way in field conditions, provided a reasonable indication about the influence of characters associated to vigor and bulb weight, within and between cycles of multiplication. The phenotypic correlations with the data collected in experiments from 1992 to 1995, maintained the same tendency. In these trials, the best performances were observed for Ct 19, Ct 34 and Ct Rx experimental clones, and the control cultivar Gigante de Curitibanos. Mass selection for plants with higher vigor in the field or with larger bulbs was efficient in recovering yield of controls cvs. Lavinia 1632 and Amarante. The clone ct 19 showed such an year-to year yield reduction that, in 1995, its mean relative yield was close to that of control cultivar Lavinia 1632, after mass selection of the later. In the other hand, Ct34 did not show decrease in mean yield along the years or cycles of multiplication. The best multiplication ratio, as to the weight of planted bulblets and harvested bulbs per meter square of plot, remained at around 1:12 (Ct 34, ct 19), while the respective controls, cv Amarante and Lavinia 1632 showed values of 1:9,4 and 1:9,8. The preliminary study about the influence of size of bulblets planted on harvested bulb weight showed a higher response of experimental clones derived from in vitro culture as compared to the control cul ti vars. The study of phenotypic stability, through two statistical models, indicated clones ct 34 and cv. Gigante de Curitibanos as the most responsive to environmental improvement, as well as showing the greatest phenotypic stability and adaptability. Clone Ct 19 was more responsive in unfavorable than in favorable environments, although, in the later, its initial yield level was higher than the others / Doutorado / Doutor em Ciências

O ToCV é um vírus pertencente à família Closteroviridae, gênero Crinivirus, que ataca plantas de tomate, entre outros hospedeiros, nas principais regiões produtoras do mundo. O vírus é transmitido exclusivamente pela mosca branca, de forma semi-persistente, sendo o biótipo B da Bemisia tabaci o principal vetor, devido à sua distribuição nas zonas produtoras. Os sintomas característicos da doença incluem mosqueado clorótico irregular entre as nervuras que, a princípio, se desenvolve nas folhas do baixeiro e gradualmente avançam por toda extensão da planta. Estes sintomas fazem com que a doença seja confundida, principalmente, com deficiências nutricionais. Uma significativa redução da produção ocorre devido à perda de área fotossinteticamente ativa, com consequente redução no número e tamanho dos frutos. No Brasil, o primeiro relato de ocorrência foi realizado em 2008, com uma incidência que variou de 0,25 a 3,42% (BARBOSA et al., 2008). Até o momento, para as condições brasileiras, desconhece-se a distribuição, a sua gama de hospedeiras, não são conhecidas fontes comerciais de resistência e são raras as informações sobre o comportamento epidemiológico. No presente trabalho, foram feitos levantamentos sistemáticos da incidência em sete campos comerciais, com o objetivo de acompanhar a evolução da incidência da virose e caracterizar os padrões temporal e espacial em condições de campo. De modo geral, o comportamento das epidemias no tempo assumiu um padrão linear de crescimento. Esse padrão é consequência da reposição contínua de vetores infectivos vindos de fora do patossistema, com predomínio de infecções primárias. Quanto ao comportamento espacial, foi observada variação no padrão de distribuição mesmo entre parcelas do mesmo ensaio. De forma geral, foi observado um padrão aleatório de distribuição de plantas doentes, porém quando houve agregação, esta teve influência significativa no aumento da incidência. Foi observado um forte efeito de bordos, apontando para fontes de inóculo externas à lavoura. A distribuição espacial da virose causada pelo ToCV foi semelhante à de outras viroses transmitidas pela mosca-branca, como as causadas pelos Begomovirus, portanto as recomendações para redução da incidência de begomoviroses podem ser aplicadas o manejo da virose causada pelo ToCV. / The ToCV is a virus belonging to the family Closteroviridae, genus Crinivirus, which attacks tomato plants, among other hosts, in the main producing regions of the world. The virus is transmitted exclusively by the whitefly, in a semi persistent manner, and the biotype B of Bemisia tabaci the main vector, due to its distribution among producing areas. The characteristic symptoms of the disease include irregular mottled chlorotic between the veins, which at first, develops in the lower leaves and gradually advance to the fullest extent of the plant. These symptoms cause by disease are mistaken especially with nutritional deficiencies. A significant reduction in production occurs due to loss of photosynthetic active area, with consequent reduction in the number and size of the fruits. In Brazil, the first report of occurrence was in 2008, with an incidence ranging from 0.25 to 3.42% (BARBOSA et al., 2008). So far, for Brazilian conditions, the distribution is unknown, its range of hosts are not known commercial sources of resistance are rare and the information about the epidemiological behavior. In this aim, were made systematic surveys of the incidence in seven commercial fields, with the purpose to monitor the incidence of viral infection and characterize the temporal and spatial patterns in field conditions. In general, the behavior of epidemics in time assumed a linear pattern of growth. This pattern is due to the continuous replacement of infective vectors from outside pathosystem, with a predominance of primary infections. Concerning the spatial behavior has been observed variation in the distribution pattern even within plots of the same trial. Overall, there was a random pattern of distribution of ill plants, however, when there was aggregation, it have a significant influence of increased incidence. A strong edge effect was observed, pointing to external sources of inoculum. The spatial distribution of the viral disease caused by ToCV was similar to other viruses transmitted by whitefly, such as those caused by Begomoviruses, so the recommendations for reducing the incidence of begomoviroses can be applied to management of viral disease caused by ToCV.