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Morfologia, arquitetura radicular e metabolismo de nitrog?nio em variedades de arroz sob baixa disponibilidade de am?nio / Morphology, root architecture and nitrogen metabolism in rice varieties under low ammonium availabilityRANGEL, Rafael Passos 26 February 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-02-26 / CAPES / Root morphology is a major factor related to the efficiency of nutrient acquisition. For this reason, this work compared this characteristic in three contrasting rice varieties: IAC 47 (improved variety) and two traditional varieties cultivated in the state of Maranh?o (Piau? and Manteiga originated in an environment with low nutrient input). These varieties were subjected to a low N-NH4+ supply and analyzed for the root morphology parameters, expression of ammonium high affinity transport system (OsAMT1.1~1.3) and GS activity in three segments of the root system. It was also determined the soluble fractions and total nitrogen in the different segments of the plants (leaves, sheaths and roots) to verify the metabolic alterations as a result of low ammonium input. The GS activity was higher in the second segment in the Manteiga and IAC-47 varieties compared to Piau?, in the other segments. A similar result was observed in the Manteiga variety in the third segment (bottom of the root system) submitted to NH4+ resupply. When grown without NH4+, the Manteiga variety showed higher OsAMT1.3 expression in the lower segment of the root system, and greater root growth, indicating a possible involvement of this transporter in the control of root morphology in rice plants. There was lower expression of OsAMT1.1 and OsAMT1.2 unlike OsAMT1.3 but being distributed to other segments of the root system. In resupply with NH4+ (38 DAG) there was repression of ammonium transporters in the bottom (PI) of the root system and increased expression of OsAMT1.2 the median part (PM) in Piau? variety. In the upper part of the roots (PS) higher levels of ammonium transporter expression was observed in the IAC-47, and Manteiga. This difference in expression between varieties originated from regions with low N availability (Piau? and Manteiga) and improved IAC-47 is an indication that under conditions of limited N, the highest expression of OsAMT1.3 may be associated with an increase in morphological parameters. / A morfologia radicular ? uma das principais caracter?sticas relacionadas ? efici?ncia de aquisi??o de nutrientes em plantas. Deste modo, variedades de arroz contrastantes: uma melhorada, (IAC-47) e duas variedades locais do Maranh?o: (Piau? e Manteiga, origin?rias de cultivos com baixa disponibilidade de nutrientes) foram submetidas a um baixo suprimento de N-NH4+ e avaliadas quanto aos par?metros de morfologia radicular, express?o dos transportadores de alta afinidade para am?nio (OsAMT1.1~1.3) e atividade de GS em tr?s segmentos do sistema radicular. Tamb?m foram determinadas as fra??es sol?veis e o nitrog?nio total nas diferentes partes da planta (folha, bainha e raiz) de forma a acompanhar altera??es metab?licas em resposta a baixa disponibilidade de am?nio. A atividade da GS foi maior na segunda coleta, nas variedades Manteiga e IAC-47 em rela??o a Piau?, nas demais coletas. Resultado semelhante foi observado na parte inferior do sistema radicular, para a variedade Manteiga na terceira coleta com ressuprimento com am?nio. Quando cultivada sem suplementa??o amoniacal, a variedade Manteiga apresentou maior express?o do OsAMT1.3 na parte inferior (PI) do sistema radicular, e maior crescimento de ra?zes, indicando um poss?vel envolvimento desse transportador com o controle da morfologia radicular de plantas de arroz. Houve menor express?o do OsAMT1.1 e OsAMT1.2 diferentemente do OsAMT1.3, por?m distribuindo-se a outros segmentos do sistema radicular. No ressuprimento com am?nio aos 38 dias ap?s a germina??o (38 DAG) houve repress?o dos transportadores de am?nio na parte inferior (PI) do sistema radicular e aumento de express?o do OsAMT1.2 na parte mediana (PM) para a variedade Piau?. Na parte superior das ra?zes (PS) os maiores n?veis de express?o dos transportadores de am?nio de alta afinidade foram observados para as variedades IAC-47 e Manteiga. Esta diferen?a de express?o entre variedades oriundas de regi?es com baixa disponibilidade de N (Piau? e Manteiga) e a variedade melhorada IAC-47 ? um indicio que sob condi??es limitantes de N, a maior express?o do OsAMT1.3 pode estar associado com incremento nos par?metros morfol?gicos.
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Agrobiodiversidade do cará (Dioscorea trifida L.) e sua conservação in-situ em Caapiranga, AmazonasBeyerlein, Patrick 24 March 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-03-24 / FAPEAM / The Amerindian yam (Dioscorea trifida L.) is a food plant native to the Amazon region. Local varieties are cultivated in agroecosystems.However, processes occur that may be causing genetic erosion of the species, running the risk of loss of varieties before knowing their potentials. The research of the thesis had as objectives to register and analyze in-situ conservation practices of the agrobiodiversity, to identify morphological descriptors that discriminate varieties, to develop identification keys for the varieties, to select varieties with favorable agronomic characteristics, to test the viability of hybrid seeds obtained from controlled pollinations and to evaluate the morphological diversity of the hybrid plants. Semi-structured interviews were conducted with the producers generating knowledge about the management of the in-situ agrobiodiversity. The diversity of varieties in the main production center of the Central Amazon region was raised using the snowball method. An experimental plantation with four randomized blocks and four plants per plot for 20 varieties was installed and evaluated the morphological diversityand agronomic characteristics. Sexual reproduction and seed germination were studied and carried out controlled pollinations between varieties and the hybrid plants generated were evaluated. Producer’s knowledge of diversity, propagation methods, exchange of propagating material and the local classification system of varieties were revealed. Morphological descriptors were identified that allowed the creation of an identification key for the aerial and subterranean parts of the local varieties studied. There were significant differences between the varieties in relation to the production of tubers and acceptance by the consumers, which allowed the identification of varieties with higher agronomic potential. Seed dormancy was confirmed and dormancy was broken bystorage (post-dispersion maturity). New genotypes were created by crossings that showed high phenotypic variability and tubers with new characteristics. The results provide tools for the conservation of agrobiodiversity and for genetic improvement, aiming at the rescue and valorization of the native food plants of the Amazon. / O cará (Dioscorea trifida L.) é uma planta alimentícia nativa da região amazônica. Diversas variedades locais são cultivadas nos agroecossistemas, porém, sujeitos aprocessos que podem estar causando erosão genética da espécie, correndo o risco de haver perdas de variedades antes que se possa reconhecer seus potenciais. A pesquisa que embasa a tese teve por objetivos registrar e analisar o conhecimento e as práticas a cerca da conservação in-situ da agrobiodiversidade do cará, identificar descritores morfológicos que discriminam variedades do cará, desenvolver uma chave de identificação para variedades, selecionar variedades com características agronômicas favoráveis, testar a viabilidade de sementes híbridas obtidas de polinizações controladas e avaliar a diversidade morfológica de plantas híbridas. Foram realizadas entrevistas semi-estruturadas com os produtores de cará gerando conhecimento sobre o manejo da agrobiodiversidade in-situ. A diversidade de variedades na principal região de produção do cará na Amazônia Central foi levantada com o método bola de neve. Foi instalado um plantio experimental com quatro blocos casualizados e quatro plantas por parcela com 20 variedades e realizada uma avaliação da diversidade morfológica e agronômica. Descritores morfológicos foram identificados que possibilitaram a criação de uma chave de identificação para as partes aéreas e subterrâneas das variedades estudadas. Houve diferencias significativos entre as variedades em relação à produção de tubérculos e aceitação pelos consumidores o que permitiu a identificação de variedades com elevado potencial agronômico. A dormência de sementes foi comprovada assim como a quebra da dormência após o armazenamento (maturidade pós-dispersão). Novos genótipos foram criados pelos cruzamentos que apresentaram alta variabilidade fenotípica e tubérculos com novas características. Os resultados fornecem ferramentas para a conservação da agrobiodiversidade e para o melhoramento genético, visando o resgate e a valorização das plantas alimentícias nativas da Amazônia.
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Caracterização molecular de recursos genéticos de Cucurbita argyrosperma, Cucurbita ficifolia e Cucurbita pepo. / Molecular characterization of genetic resources of Cucurbita argyrosperma, Cucurbita ficifolia and Cucurbita pepo.Priori, Daniela 25 February 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-02-25 / Genetic resources conserved in genebanks have a great value in terms of conservation of rare types, when they are threatened by abandonment of farming or as a unique resource for plant breeding programs. Among the accessions conserved in genebanks important sources of genetic variability can be found for obtaining more productive genotypes tolerant to biotic and abiotic stresses and improved nutritional quality. To have success in that demand is necessary that the accessions contained in genebanks are characterized and evaluated in terms of both qualitative and quantitative characters. The characterization and evaluation of accessions conserved in genebanks must be priorities in the strategy for management of genetic resources, as they provide better knowledge of the germplasm available, is essential for use in breeding programs. In Brazil, there is little information on genetic resources of Cucurbits, especially as regards Cucurbita ficifolia, Cucurbita argyrosperma. Large number of Cucurbita landraces grown in the country could be better exploited as sources of genes for breeding programs, after genetic characterization. Much of the genetic diversity of different Cucurbita landraces grown in southern Brazil has been lost due to neglect of cultivation or its replacement by commercial hybrid varieties. This work was carried in order to contribute to general knowledge related to genetic resources of Cucurbita argyrosperma, Cucurbita ficifolia and Cucurbita pepo, and with specific objectives to assess the transferability of primers designed to C. pepo in C. argyrosperma and C. ficifolia and to evaluate the genetic variability within and among landraces of C. pepo grown in Rio Grande do Sul through analysis of microsatellite markers. Ten accessions of C. pepo, nine of C. argyrosperma and five of C. ficifolia belonging to the Active Germplasm Bank of Cucurbitaceae from Embrapa Temperate Agriculture were submitted to molecular characterization. The genetic distance between these accessions was determined. The transferability of SSR loci from C. pepo to C. argyrosperma and C. ficifolia was 85% and 80% respectively. The analysis of these 24 accessions with 35 loci generated a total of 105 SSR markers, ranging from one to four alleles per locus, of which 56 (53,33%) were polymorphic, showing that there is genetic diversity in the accessions analyzed. The presence and absence of markers allowed to find 100 loci, varying from one to five alleles per locus, with overall average of three alleles per marker analyzed. Among the 34 loci tested, 29 (85.2%) were polymorphic, showing that there is genetic variability among the accessions of C. pepo analyzed. Data evaluation was done by molecular analysis of molecular variance (AMOVA). It was observed that 54.60% of genetic variability is attributable to variation between accessions and 45.39% is attributed to differences within accessions. A comparative analysis was made between the ten accessions studied, analyzed two by two by AMOVA. From 45 comparisons between the ten accessions significant differences there were detected between 35 comparisons, with average of 57.10% of molecular variation attributed to differences between accessions. Genetic variation among counties where the accessions were collected was not significant, indicating that there is not population subdivision according to geographic region. Results indicate that the microsatellites were efficient for the characterization and molecular analysis
of genetic divergence. These studies contributed to increase the knowledge related to these genetic resources. SSR primers developed for Cucurbita pepo can be used for molecular characterization of C. argyrosperma and C. ficifolia. Landraces of C. argyrosperma and C. ficifolia showed low genetic variation, while C. pepo shows great variability. The largest proportion of variability in C. pepo is distributed between accessions and not within accessions. / Os recursos genéticos conservados em bancos de germoplasma apresentam grande valor do ponto de vista da conservação de tipos raros, quando os mesmos são ameaçados pelo abandono do cultivo ou como recurso insubstituível para programas de melhoramento genético vegetal. Dentre os acessos contidos nos bancos de germoplasma podem ser encontradas importantes fontes de variabilidade genética para a obtenção de genótipos mais produtivos, tolerantes a estresses bióticos e abióticos e com melhor qualidade nutricional. Para que haja sucesso nessa demanda é necessário que os acessos contidos nos bancos de germoplasma sejam caracterizados e avaliados, tanto em termos de caracteres qualitativos quanto quantitativos. No Brasil, há pouca informação sobre os recursos genéticos de Cucurbitáceas, de modo especial no que se refere à Cucurbita argyrosperma e Cucurbita ficifolia. Grande número de variedades locais de Cucurbita cultivadas no país poderiam ser melhor exploradas como fontes de genes para programas de melhoramento, após a devida caracterização. Muito da diversidade genética das variedades locais de diferentes espécies de Cucurbita cultivadas no Sul do Brasil vem sendo perdida devido ao abandono do cultivo ou à sua substituição por variedades híbridas comerciais. Este trabalho foi realizado com o objetivo geral de contribuir para o conhecimento relacionado aos recursos genéticos de Cucurbita argyrosperma, C. ficifolia e C. pepo, e objetivos específicos de avaliar a transferibilidade de loci de microssatélites de C. pepo para C. argyrosperma e C. ficifolia; e avaliar a variabilidade genética entre e dentro de variedades locais de C. pepo cultivadas no Rio Grande do Sul por meio da análise de marcadores microssatélites. Foram analisados dez acessos de C. pepo, nove de C. argyrosperma e cinco de C. ficifolia do acervo do Banco Ativo de Germoplasma de Cucurbitáceas da Embrapa Clima Temperado. A distância genética entre esses acessos foi determinada. A transferibilidade de locos SSR de C. pepo para C. argyrosperma e C. ficifolia foi de 85% e 80%, respectivamente. A análise dos 24 acessos de Cucurbita por meio de 35 loci SSR gerou um total de 105 marcadores SSR, com variação de um a quatro alelos por loco, dos quais 56 (53,33%) foram polimórficos, evidenciando que há diversidade genética entre os acessos analisados. Através dos dados de presença e ausência de marcadores obtidos com 34 combinações de primers, foram encontrados 100 locos com variação de um a cinco alelos por loco, com média geral de três alelos por marcador analisado. Dentre os 40 locos analisados, 29 (85,3%) foram polimórficos, evidenciando que há variabilidade genética entre os acessos de C. pepo analisados. A avaliação dos dados moleculares foi feita pela análise molecular da variância (AMOVA). Deste modo, foi possível verificar que 54,60% da variabilidade genética é atribuída à variação entre acessos e 45,39% é atribuída a diferenças dentro dos acessos. Foi feita a análise comparativa entre os dez acessos estudados, analisados dois a dois, pela análise AMOVA. Das 45 comparações entre os dez acessos, foram significativas as diferenças entre 35 delas, com média de 57,10% da variação molecular atribuída às diferenças entre acessos. A variação genética entre os municípios onde os acessos
foram coletados não foi significativa, indicando que não ocorre subdivisão de populações em função da região geográfica. Os resultados obtidos indicam que os microssatélites foram eficientes para a caracterização molecular e a análise da divergência genética. É possível utilizar primers de microssatélites desenvolvidos para C. pepo na caracterização molecular de C. argyrosperma e C. ficifolia. Variedades locais de C. argyrosperma e C. ficifolia apresentam pouca variabilidade genética, enquanto que C. pepo evidencia grande variabilidade genética. A maior proporção da variabilidade em C. pepo encontra-se distribuída entre os acessos, e não dentro dos acessos.
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Diagnóstico da produção de sementes crioulas em assentamentos rurais do Território Prof. Cory/Andradina (SP) / Diagnosis of landraces production in rural settlements in the Território Prof. Cory/Andradina (SP)Silva, Débora Pavani 26 September 2018 (has links)
Submitted by Débora Pavani Silva (depavanisilva@gmail.com) on 2018-11-13T18:53:31Z
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Previous issue date: 2018-09-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Com a modernização da agricultura nas décadas de 1960 e 1970, houve uma substituição das sementes tradicionais cultivadas por sementes comerciais geneticamente melhoradas, geralmente associadas a pacotes tecnológicos que incluíam mecanização, fertilizantes sintéticos e agrotóxicos. As sementes crioulas permitem que o agricultor mantenha sua alimentação mesmo em épocas de adversidade climática, pois são adaptadas aos ecossistemas nos quais ocorre o cultivo e ampliam sua autonomia produtiva por serem menos exigentes em relação aos insumos externos. O Território Prof. Cory/Andradina (SP), apesar da sua característica histórica de alta concentração fundiária, apresentou avanços em termos de desconcentração com a criação de quase quarenta assentamentos. O objetivo deste estudo foi realizar um diagnóstico da produção de sementes crioulas, identificar os guardiões de sementes nos assentamentos rurais do Território Prof. Cory/Andradina (SP). Foram pesquisados os aspectos socioeconômicos dos guardiões, as variedades locais e tradicionais conservadas por eles, as práticas agrícolas utilizadas, destino da produção oriunda das sementes crioulas, métodos de obtenção e troca e a atuação de instituições públicas na conservação desses materiais. Foram visitados 28 assentamentos do Território, no período entre setembro de 2017 até junho de 2018. A primeira etapa constou da identificação alguns agricultores guardiões de sementes já conhecidos por meio de informantes chaves (técnicos da extensão rural e pesquisadores que atuam na área) para que a partir desses guardiões, pelo método “bola de neve”, fossem identificados outros guardiões. A coleta dos dados se deu por meio de registros fotográficos e de um questionário semiaberto (perguntas fechadas e abertas), aplicado na forma de entrevista junto aos produtores guardiões identificados. Para uma análise da atuação das instituições públicas na conservação da agrobiodiversidade, foram entrevistados três profissionais de entidades atuantes no Território. Constatou-se que o Território Prof. Cory/Andradina não apresenta uma forte tradição em relação à conservação de sementes crioulas, porém algumas famílias mantém o costume de ter sua própria semente, especialmente para cultivos visando o autoconsumo. Foram identificados 55 guardiões em 24 assentamentos rurais, sendo o feijão catador a semente mais frequentemente encontrada. O destino amplamente predominante da comercialização são os circuitos curtos, em que se destacam a venda avulsa ao consumidor e em feiras livres. A redução dos recursos destinados ao Programa de Aquisição de Alimentos (PAA) afetou negativamente na comercialização dos produtos das sementes crioulas. O engajamento de alguns pesquisadores e técnicos de extensão em projetos e/ou pesquisas, envolvendo sementes crioulas e em interação com os guardiões, se mostram promissores para uma maior conscientização dos agricultores e para a ampliação da utilização desse tipo recurso, muito importante para a conservação da agrobiodiversidade e para ampliar a autonomia dos agricultores familiares. / With the modernization of agriculture in the 1960s and 1970s, there was a substitution of landraces by commercially improved commercial seeds, usually associated with technological packages that included mechanization, synthetic fertilizers and agrochemicals. Landraces allow the farmer to maintain his or her diet even in times of climatic adversity, since they are adapted to the ecosystems in which cultivation takes place and increase their productive autonomy by being less demanding in relation to external inputs. The Território Prof. Cory/Andradina (SP) despite its historical characteristic of high concentration of land, presented advances in terms of deconcentration with the creation of almost forty rural settlements. The purpose of this study was to make a diagnosis of the production of landraces and to identify the landraces guardians in the rural settlements of the Território Prof. Cory/Andradina (SP). The socioeconomic aspects of the guardians, the local and traditional varieties conserved by them, the agricultural practices used, the destination of the production from the landraces, the methods of obtaining and exchanging them, and the performance of public institutions in the conservation of these materials were investigated. Were visited 28 rural settlements of the Territory, in the period between September 2017 and June 2018. The first stage consisted of the identification of some landraces guardians already known by means of key informants (extension technicians and researchers working in the area) so that from these guardians, by the "snowball" method, other guardians could be identified. The data collection was done through photographic records and a semi-open questionnaire (closed and opened questions), applied in the form of interviews with the identified guardians. For an analysis of the performance of public institutions in the conservation of agrobiodiversity, three professionals from entities operating in the Territory were interviewed. It was verified that the Território Prof. Cory/Andradina (SP) does not have a strong tradition regarding the conservation of landraces seeds, but some families maintain the habit of having their own seed, especially crops for self-consumption. A total of 55 guardians were identified in 24 rural settlements, with Cowpea bean being the most frequently found. The predominant destination of commercialization are the short circuits, in which stand out the individual sale to the consumer, the street market and. The reduction of resources allocated to the Food Acquisition Program (PAA) has negatively affected the comercialization of landraces products. The involvement of some researchers and extension technicians in projects and/or research, involving landraces and in interaction with the guardians, are promising for a greater awareness of the farmers and for the expansion of the use of this type of resource, very important for conservation of agrobiodiversity and to increase the autonomy of family farmers.
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Diagnóstico da produção de sementes crioulas em assentamentos rurais do Território Prof. Cory/Andradina (SP) /Silva, Débora Pavani. January 2018 (has links)
Orientador: Antonio Lázaro Sant'Ana / Resumo: Com a modernização da agricultura nas décadas de 1960 e 1970, houve uma substituição das sementes tradicionais cultivadas por sementes comerciais geneticamente melhoradas, geralmente associadas a pacotes tecnológicos que incluíam mecanização, fertilizantes sintéticos e agrotóxicos. As sementes crioulas permitem que o agricultor mantenha sua alimentação mesmo em épocas de adversidade climática, pois são adaptadas aos ecossistemas nos quais ocorre o cultivo e ampliam sua autonomia produtiva por serem menos exigentes em relação aos insumos externos. O Território Prof. Cory/Andradina (SP), apesar da sua característica histórica de alta concentração fundiária, apresentou avanços em termos de desconcentração com a criação de quase quarenta assentamentos. O objetivo deste estudo foi realizar um diagnóstico da produção de sementes crioulas, identificar os guardiões de sementes nos assentamentos rurais do Território Prof. Cory/Andradina (SP). Foram pesquisados os aspectos socioeconômicos dos guardiões, as variedades locais e tradicionais conservadas por eles, as práticas agrícolas utilizadas, destino da produção oriunda das sementes crioulas, métodos de obtenção e troca e a atuação de instituições públicas na conservação desses materiais. Foram visitados 28 assentamentos do Território, no período entre setembro de 2017 até junho de 2018. A primeira etapa constou da identificação alguns agricultores guardiões de sementes já conhecidos por meio de informantes chaves (técnicos da extensã... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: With the modernization of agriculture in the 1960s and 1970s, there was a substitution of landraces by commercially improved commercial seeds, usually associated with technological packages that included mechanization, synthetic fertilizers and agrochemicals. Landraces allow the farmer to maintain his or her diet even in times of climatic adversity, since they are adapted to the ecosystems in which cultivation takes place and increase their productive autonomy by being less demanding in relation to external inputs. The Território Prof. Cory/Andradina (SP) despite its historical characteristic of high concentration of land, presented advances in terms of deconcentration with the creation of almost forty rural settlements. The purpose of this study was to make a diagnosis of the production of landraces and to identify the landraces guardians in the rural settlements of the Território Prof. Cory/Andradina (SP). The socioeconomic aspects of the guardians, the local and traditional varieties conserved by them, the agricultural practices used, the destination of the production from the landraces, the methods of obtaining and exchanging them, and the performance of public institutions in the conservation of these materials were investigated. Were visited 28 rural settlements of the Territory, in the period between September 2017 and June 2018. The first stage consisted of the identification of some landraces guardians already known by means of key informants (extension technicians a... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Caracterização molecular de recursos genéticos de Cucurbita argyrosperma, Cucurbita ficifolia e Cucurbita pepo. / Molecular characterization of genetic resources of Cucurbita argyrosperma, Cucurbita ficifolia and Cucurbita pepo.Priori, Daniela 25 February 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-02-25 / Genetic resources conserved in genebanks have a great value in terms of conservation of rare types, when they are threatened by abandonment of farming or as a unique resource for plant breeding programs. Among the accessions conserved in genebanks important sources of genetic variability can be found for obtaining more productive genotypes tolerant to biotic and abiotic stresses and improved nutritional quality. To have success in that demand is necessary that the accessions contained in genebanks are characterized and evaluated in terms of both qualitative and quantitative characters. The characterization and evaluation of accessions conserved in genebanks must be priorities in the strategy for management of genetic resources, as they provide better knowledge of the germplasm available, is essential for use in breeding programs. In Brazil, there is little information on genetic resources of Cucurbits, especially as regards Cucurbita ficifolia, Cucurbita argyrosperma. Large number of Cucurbita landraces grown in the country could be better exploited as sources of genes for breeding programs, after genetic characterization. Much of the genetic diversity of different Cucurbita landraces grown in southern Brazil has been lost due to neglect of cultivation or its replacement by commercial hybrid varieties. This work was carried in order to contribute to general knowledge related to genetic resources of Cucurbita argyrosperma, Cucurbita ficifolia and Cucurbita pepo, and with specific objectives to assess the transferability of primers designed to C. pepo in C. argyrosperma and C. ficifolia and to evaluate the genetic variability within and among landraces of C. pepo grown in Rio Grande do Sul through analysis of microsatellite markers. Ten accessions of C. pepo, nine of C. argyrosperma and five of C. ficifolia belonging to the Active Germplasm Bank of Cucurbitaceae from Embrapa Temperate Agriculture were submitted to molecular characterization. The genetic distance between these accessions was determined. The transferability of SSR loci from C. pepo to C. argyrosperma and C. ficifolia was 85% and 80% respectively. The analysis of these 24 accessions with 35 loci generated a total of 105 SSR markers, ranging from one to four alleles per locus, of which 56 (53,33%) were polymorphic, showing that there is genetic diversity in the accessions analyzed. The presence and absence of markers allowed to find 100 loci, varying from one to five alleles per locus, with overall average of three alleles per marker analyzed. Among the 34 loci tested, 29 (85.2%) were polymorphic, showing that there is genetic variability among the accessions of C. pepo analyzed. Data evaluation was done by molecular analysis of molecular variance (AMOVA). It was observed that 54.60% of genetic variability is attributable to variation between accessions and 45.39% is attributed to differences within accessions. A comparative analysis was made between the ten accessions studied, analyzed two by two by AMOVA. From 45 comparisons between the ten accessions significant differences there were detected between 35 comparisons, with average of 57.10% of molecular variation attributed to differences between accessions. Genetic variation among counties where the accessions were collected was not significant, indicating that there is not population subdivision according to geographic region. Results indicate that the microsatellites were efficient for the characterization and molecular analysis of genetic divergence. These studies contributed to increase the knowledge related to these genetic resources. SSR primers developed for Cucurbita pepo can be used for molecular characterization of C. argyrosperma and C. ficifolia. Landraces of C. argyrosperma and C. ficifolia showed low genetic variation, while C. pepo shows great variability. The largest proportion of variability in C. pepo is distributed between accessions and not within accessions. / Os recursos genéticos conservados em bancos de germoplasma apresentam grande valor do ponto de vista da conservação de tipos raros, quando os mesmos são ameaçados pelo abandono do cultivo ou como recurso insubstituível para programas de melhoramento genético vegetal. Dentre os acessos contidos nos bancos de germoplasma podem ser encontradas importantes fontes de variabilidade genética para a obtenção de genótipos mais produtivos, tolerantes a estresses bióticos e abióticos e com melhor qualidade nutricional. Para que haja sucesso nessa demanda é necessário que os acessos contidos nos bancos de germoplasma sejam caracterizados e avaliados, tanto em termos de caracteres qualitativos quanto quantitativos. No Brasil, há pouca informação sobre os recursos genéticos de Cucurbitáceas, de modo especial no que se refere à Cucurbita argyrosperma e Cucurbita ficifolia. Grande número de variedades locais de Cucurbita cultivadas no país poderiam ser melhor exploradas como fontes de genes para programas de melhoramento, após a devida caracterização. Muito da diversidade genética das variedades locais de diferentes espécies de Cucurbita cultivadas no Sul do Brasil vem sendo perdida devido ao abandono do cultivo ou à sua substituição por variedades híbridas comerciais. Este trabalho foi realizado com o objetivo geral de contribuir para o conhecimento relacionado aos recursos genéticos de Cucurbita argyrosperma, C. ficifolia e C. pepo, e objetivos específicos de avaliar a transferibilidade de loci de microssatélites de C. pepo para C. argyrosperma e C. ficifolia; e avaliar a variabilidade genética entre e dentro de variedades locais de C. pepo cultivadas no Rio Grande do Sul por meio da análise de marcadores microssatélites. Foram analisados dez acessos de C. pepo, nove de C. argyrosperma e cinco de C. ficifolia do acervo do Banco Ativo de Germoplasma de Cucurbitáceas da Embrapa Clima Temperado. A distância genética entre esses acessos foi determinada. A transferibilidade de locos SSR de C. pepo para C. argyrosperma e C. ficifolia foi de 85% e 80%, respectivamente. A análise dos 24 acessos de Cucurbita por meio de 35 loci SSR gerou um total de 105 marcadores SSR, com variação de um a quatro alelos por loco, dos quais 56 (53,33%) foram polimórficos, evidenciando que há diversidade genética entre os acessos analisados. Através dos dados de presença e ausência de marcadores obtidos com 34 combinações de primers, foram encontrados 100 locos com variação de um a cinco alelos por loco, com média geral de três alelos por marcador analisado. Dentre os 40 locos analisados, 29 (85,3%) foram polimórficos, evidenciando que há variabilidade genética entre os acessos de C. pepo analisados. A avaliação dos dados moleculares foi feita pela análise molecular da variância (AMOVA). Deste modo, foi possível verificar que 54,60% da variabilidade genética é atribuída à variação entre acessos e 45,39% é atribuída a diferenças dentro dos acessos. Foi feita a análise comparativa entre os dez acessos estudados, analisados dois a dois, pela análise AMOVA. Das 45 comparações entre os dez acessos, foram significativas as diferenças entre 35 delas, com média de 57,10% da variação molecular atribuída às diferenças entre acessos. A variação genética entre os municípios onde os acessos foram coletados não foi significativa, indicando que não ocorre subdivisão de populações em função da região geográfica. Os resultados obtidos indicam que os microssatélites foram eficientes para a caracterização molecular e a análise da divergência genética. É possível utilizar primers de microssatélites desenvolvidos para C. pepo na caracterização molecular de C. argyrosperma e C. ficifolia. Variedades locais de C. argyrosperma e C. ficifolia apresentam pouca variabilidade genética, enquanto que C. pepo evidencia grande variabilidade genética. A maior proporção da variabilidade em C. pepo encontra-se distribuída entre os acessos, e não dentro dos acessos.
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Express?o de genes relacionados ? absor??o e metabolismo de nitrog?nio em arroz sob alto e baixo suprimento de nitratoBucher, Carlos Alberto 23 February 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-02-23 / Funda??o Carlos Chagas Filho de Amparo ? Pesquisa do Estado do RJ - FAPERJ / Nitrogen is one of the nutrient elements most limiting for plant growth. Thus, increasing plant
nitrogen usage efficiency (NUE) is an essential factor for sustainable agriculture, leading to
an increased food production with less fertilizer input and less environment impact. NUE in
plant involves the uptake and accumulation efficiency, and N use efficiency for grain
production. Understanding the mechanisms regulating these processes is crucial for the
improvement of NUE in crops. Therefore, is essential to comprehend plants response to
different N regimes, mainly N limitation. The usage of plants or varieties with differences in
nutrient use efficiency is another important factor to determine the main mechanisms involved
in these processes. The objectives of this study were to evaluate N metabolism and expression
of genes involved in N uptake and assimilitation of two rice varieties (Piau? and IAC-47),
under different N supply conditions. The N metabolism was evaluated by quantification of
nitrogen fractions in plant tissue and enzymatic activity, expression of genes that code for
high and low affinity N transporters, and N assimilation enzymes. Two experiments were
conducted: the first, to investigate the plants behavior when grown under high and low N
supply; and the second to verify plants response to NO3
- resupply. The IAC-47 variety
showed greatest mass accumulation in all treatments. When plants were grown for a long
period under low N supply it was observed a higher nitrate (NO3
-) content in the tissue of
Piau? variety, which is adapted to low fertility conditions, as well as a high activity of nitrate
reductase and glutamine synthetase in the roots of these plants. When under high NO3
- supply
for a long period, Piau? variety had higher NO3
- concentrations in roots and sheaths, but no
differences were observed in enzymes activity. The nitrate transporters expression was higher
in roots of Piau? plants under low supply of NO3
- when compared to Piau? plants under high N
supply. Nitrate transporters expression in roots of IAC-47 plants showed a pattern opposite to
the one observed for Piau? plants. When plants were resupplied with NO3
-, after a 72 hours
period without N, there was a rapid increase, after 6 hours of resupply, in the expression of
high affinity nitrate transporters genes (OsNRT2.1) and the plastidial glutamine synthetase
(GS2) in the Piau? variety roots, and a higher expression of these in IAC-47 roots after a 24
hours of N resupply. The efficiency of Piau? variety is related to the differentiated control of
N absorption and assimilation mechanisms, which allow bigger expression of high affinity
nitrate transporters in tissue with high levels of soluble N, high N status, indicating that the
control of nitrogen uptake system may be essential for the nitrogen usage efficient. / O nitrog?nio ? um dos elementos minerais que mais limita o desenvolvimento das plantas.
Assim, aumentar a efici?ncia de uso de nitrog?nio (EUN) ? um fator ? essencial para uma
agricultura sustent?vel, levando a um aumento da produ??o de alimentos com menor uso de
insumos e menos impactos ao ambiente. A EUN envolve a efici?ncia de absor??o e ac?mulo e
a efici?ncia de utiliza??o de N para produ??o. Compreender os mecanismos envolvidos nesses
processos e como eles s?o controlados ? fundamental para a melhoria da EUN nas plantas
cultivadas. Para isso, ? essencial entender a resposta e comportamento das plantas a diferentes
regimes de N, principalmente ? limita??o de N. O uso de plantas ou variedades com
diferen?as na EUN ? outro fator importante para verificar os principais mecanismos
envolvidos. Este trabalho teve por objetivo desse trabalho foi verificar o metabolismo e a
express?o de genes envolvidos na absor??o e assimila??o de nitrog?nio nas variedades de
arroz Piau? e IAC-47 sob diferentes condi??es de disponibilidade desse nutriente. O
metabolismo de N foi avaliado atrav?s da quantifica??o das fra??es nitrogenadas no tecido e
atividade enzim?tica, a express?o de genes que codificam para transportadores de N de alta e
baixa afinidade e enzimas de assimila??o de N. Foram realizados dois experimentos: o
primeiro para verificar o comportamento das plantas quando cultivadas sob alto e baixo
suprimento de N; e o segundo, para verificar as repostas ao ressuprimento de N. O ac?mulo
de massa foi maior na variedade IAC-47 em todos os tratamentos. Quando as plantas foram
cultivadas por um longo per?odo sob baixo suprimento de N foi observado maior teor de
nitrato (NO3
-) no tecido da variedade Piau?, adaptada a condi??es de baixa fertilidade, assim
como uma alta atividade da nitrato redutase e glutamina sintetase nas ra?zes dessas plantas.
Sob alto suprimento de NO3
-, por um longo per?odo, a variedade Piau? apresentou maiores
teores de NO3
- nas bainhas e ra?zes, mas n?o foram observas diferen?as na atividade de
enzimas. A express?o dos transportadores de nitrato na variedade Piau? foi mais elevada nas
ra?zes das plantas sob baixo suprimento de NO3
- quando comparado as plantas sob alto
suprimento de N. Na variedade IAC-47 a express?o dos transportadores de NO3
- teve
comportamento oposto ao observado para a Piau?. Quando as plantas receberam NO3
-, ap?s
um per?odo de 72 horas sem N, houve um r?pido aumento, ap?s 6 horas do ressuprimento, na
express?o do gene que codifica para o transportador de NO3
- de alta afinidade OsNRT2.1 e
glutamina sintetase plastidial (GS2) nas ra?zes da variedade Piau?, e 24 horas ap?s o
ressuprimento a express?o foi maior na variedade IAC-47. A efici?ncia da variedade Piau?
esta relacionada ao controle diferenciado dos mecanismos de absor??o e assimila??o de N,
que permite a maior express?o dos transportadores de nitrato de alta afinidade em tecido com
altos teores de N sol?vel, alto status de N, indicando que o controle do sistema de absor??o de
N pode ser essencial para a efici?ncia no uso de nitrog?nio.
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