Includes bibliographical references. / ix, 118, [116] leaves, [5] leaves of plateas : ill. (some col.) ; 30 cm. / Title page, contents and abstract only. The complete thesis in print form is available from the University Library. / Thesis (Ph.D.)--University of Adelaide, Dept. of Microbiology and Immunology, 1992

Diss. (sammanfattning) Umeå : Univ., 2008. / Härtill 4 uppsatser.

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 2007. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 175-194).

LIMA, Anahy de Souza. Víbrio em camarão e na água de três fazendas de carcinicultura do Ceará. 2007. 74f. Dissertação (Mestrado em Ciencias Marinhas Tropicais)- Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2007. / Submitted by Debora Oliveira (deby_borboletinha@hotmail.com) on 2011-11-29T12:22:03Z No. of bitstreams: 1 2007_dis_adslima.pdf: 2071706 bytes, checksum: 515e8e6c8c757b34d245885074813a89 (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2011-12-02T19:30:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_dis_adslima.pdf: 2071706 bytes, checksum: 515e8e6c8c757b34d245885074813a89 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-12-02T19:30:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_dis_adslima.pdf: 2071706 bytes, checksum: 515e8e6c8c757b34d245885074813a89 (MD5) Previous issue date: 2007 / The objective of the present study was to identify Vibrio species in cultures of Litopenaeus vannamei in Northeastern Brazil. During the rainy and dry seasons from August 2005 to October 2006 two L. vannamei culture cycles were observed on three marine shrimp farms (A, B and C) located in the estuaries of Acaraú, Coreaú and Jaguaribe. Sixty shrimp samples and 240 pond water samples were analyzed. The outcome parameters were total vibrio count (standard plate count), saccharose-positive and negative vibrio count, and vibrio species diversity in shrimp and water samples. The lowest total vibrio count found in water samples was 2.0 x 102 CFU/mL (Farms A, and C) during the rainy season and the highest was 1,42 x 108 CFU/mL (Farm B) during the rainy season. The highest total vibrio count in shrimp samples (postlarvae and hepatopancreas) was 4,5 x 108 CFU/g (Farm B) during the dry season. The lowest and highest values observed for saccharosepositive colonies in hepatopancreas were 1.00 x 102 CFU/g (Farms A, and B) during the rainy season and 4,5 x 108 CFU/g (Farm C) during the dry season. The corresponding values for saccharose-negative colonies were 0.98 x 10 CFU/g (Farm A) and 9.50 x 105 CFU/g (Farm C), both in the rainy season. Vibrio counts were always lower in samples collected during the rainy season. A total of 118 Vibrio strains were isolated from the water (n=62) and shrimp (n=56) samples collected at the three farms. Farm B had the largest number of identifiable vibrio species (11). The most frequently isolated species was Vibrio mimicus, followed by V. alginolyticus and V. tubiashii. The lowest survival rate (37.24%) during harvesting was observed for one of the ponds at Farm A during the rainy season. Neither species diversity, nor total vibrio counts, nor saccharosepositive and negative vibrio counts in hepatopancreas samples, was associated with survival rates during harvesting. However, the combination of high vibrio counts and low species diversity observed in water samples from Farm A during the rainy season may have affected survival rates negatively. The number of vibrios increases in proportion with salinity. The likelihood of a vibrio infection in a given shrimp population cannot be determined by total vibrio counts or saccharosepositive and negative counts alone. / O presente estudo teve por objetivo quantificar Vibrio, vibrios sac+ e sac – e identificar as espécies de Vibrio, presentes no cultivo do camarão Litopenaeus vannamei e na água onde é ele cultivado. Acompanharamse dois ciclos do cultivo do L. vannamei em três fazendas (A, B e C),situadas nos estuários dos rios Acaraú, Coreaú e Jaguaribe (CE), de agosto de 2005 a outubro de 2006, nas estações de chuva e estiagem. Foram analisadas 60 amostras de camarão e 240 amostras de água de viveiro. Foram feitos os testes de Contagem Padrão em Placas (CPP) total de Vibrio; CPP das colônias de Vibrio sacarose positivas e negativas, e identificação das espécies nas amostras de camarão e na água. O valor mínimo da CPP de Vibrio nas amostras de água foi de 2,0 x 102 UFC/mL nas fazendas A, e C no período de chuva e o máximo foi 1,42 x 108 UFC/mL na fazenda B, no período de estio. O valor máximo para CPP de Vibrio nas amostras de camarão (pós-larva e hepatopâncreas) foi de 4,5 x 108 UFC/g, na fazenda B no período de estio. O valor mínimo de Vibrio sacarose positiva no hepatopâncreas foi 1,00 x 102 UFC/g nas fazendas A e B no período de chuva e máximo foi 4,5 x 108 UFC/g na fazenda B, no período de estio. O valor mínimo de Vibrio sacarose negativa foi 0,98 x 10 UFC/g de hepatopâncreas na fazenda A, no período de chuva e máximo foi de 9,50 x 105 na fazenda C no período da chuva. A CPP de vibrios das amostras de água e do camarão foi sempre menor no período da chuva. Das amostras de água e camarão das três fazendas foram isoladas 145 cepas de Vibrio. Dessas, 62 foram isoladas da água de cultivo do camarão e 56 foram isoladas do camarão (pós-larva e hepatopâncreas). A fazenda B apresentou maior número de diferentes espécies isoladas e identificadas (11). Durante a pesquisa, os isolados de camarão e água do viveiro, apresentaram uma predominância de Vibrio mimicus, seguidos de V. alginolyticus e V. tubiashii. De todas as fazendas, A, B e C, a fazenda A foi a que apresentou um viveiro com a menor taxa de sobrevivência de camarões na despesca: 37,24%, no período da chuva. Nem a quantidade de víbrios total, nem a de sacarose positiva, ou negativa no hepatopâncreas dos camarões, influencia o índice de sobrevivência dos animais nos viveiros das fazendas, no momento da despesca. A maior ou menor diversidade de víbrios nos camarões não implicou numa maior ou menor taxa de sobrevivência dos animais nos viveiros das fazendas, no momento da despesca. No entanto, quando o número de Vibrio foi alto na água e a diversidade baixa, caso da Fazenda A no período da chuva, a taxa de sobrevivência foi afetada negativamente. O número de víbrios é proporcional ao teor de salinidade das águas. Somente os dados da enumeração de víbrios e/ou os dados da enumeração de víbrio sacarose positiva ou negativa não são suficientes para se avaliar a probabilidade de camarões, de um determinado viveiro, virem a adoecer.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Alimentos, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2013-12-05T22:55:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 320887.pdf: 646974 bytes, checksum: 26010f70ebe59bf7c847f9b58283013b (MD5) Previous issue date: 2013

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:13:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LigiaMRM_TESE.pdf: 4862678 bytes, checksum: 4e18ee0ba221a5515a64d23067db9388 (MD5) Previous issue date: 2012-02-28 / Cinquenta amostras de camar?o fresco e refrigerado (Litopenaeus vannamei) foram coletadas em diferentes pontos de comercializa??o na cidade de Natal RN. As amostras foram maceradas em um gral est?ril e 25 gramas semeadas em 225mL de APA contendo 1% de NaCl e 25g em 225mL de CL incubadas a 35?C - 24 horas. O crescimento em APA foi semeado em placas de ?gar TCBS, incubadas a 35?C-24h para isolamento de Vibrio e Aeromonas. O crescimento do CL foi semeado em Agar EAM, para isolamento de coliformes. Dos 102 isolados, 91 (89,2%) pertenciam ao g?nero Vibrio e 11 (10,8%) ao g?nero Aeromonas, com predomin?ncia de V. cholerae n?o O1/n?o O139, V. alginolyticus, V. carchariae e V. parahaemolyticus K- e A. veronii biogrupo sobria , A. jandaei, A. schubertii, A. veronii biogrupo veronii e A. hydrophila. A menor efici?ncia entre os antimicrobianos foi da AMP (57,8% de resist?ncia) seguida da AMK (29,4%) e TCY (21,6%). As 39 cepas de Vibrio e Aeromonas multirresistentes se distribu?ram em 10 perfis distintos, sendo que um revelou cinco marcos (AMP, CHL, NIT, SXT e TCY) em um isolado de V. carchariae de camar?o, adquirido em supermercados. O ?ndice MAR, nas 39 cepas variou de 0,28 a 0,42, sugerindo que s?o de risco na transfer?ncia e difus?o da resist?ncia na cadeia alimentar. Ap?s a cura plasmidial pelo tratamento com AO de 24 cepas multirresistentes e com resist?ncia intermedi?ria de v?brio e aeromonas escolhidas aleatoriamente, 13 perderam totalmente a resist?ncia e 7 perderam parcialmente, sendo que o maior percentual de perda da resist?ncia ocorreu nas cepas de V. cholerae n?o O1 e n?o O139 (6 cepas), se concentrando nos marcos de resist?ncia a AMP (13), AMK (11), TCY(8) e CIP(3). Os resultados da conjuga??o realizada entre amostras de Vibrio xvi curadas e a E. coli K12C600 demonstraram que 78,5% das culturas de Vibrio testadas revelaram capacidade de transfer?ncia para o gene que confere resist?ncia a AMP e 28,5% para a TCY. Dos coliformes, E. coli foi a mais frequente, seguida de Citrobacter spp, isoladas em 40,3% e 27,5% das amostras respectivamente. AMP foi o antimicrobiano menos eficaz, seguido de TCY. As 11 cepas multirresistentes se distribu?ram em 9 perfis distintos, um deles constitu?do de cinco marcos (AMP, NIT, TCY, CHL, SXT), albergados em uma cepa de Klebsiella spp, oriunda de camar?o adquirido em supermercado, similar ao resultado obtido em V. carchariae. Conclui-se que, os camar?es marinhos frescos e refrigerados, comercializados em Natal-RN evidenciaram contamina??o com coliformes, v?brios e aeromonas multirresistentes a antimicrobianos comumente utilizados na terapia m?dica e veterin?ria, e que, possivelmente, a transfer?ncia de genes de resist?ncia entre bact?rias se constitui um s?rio problema de sa?de p?blica

Aisla un bacteriófago lítico denominado Vf1, procedente del mar peruano, capaz de infectar a Vibrio fluvialis, bacteria que afecta humanos y organismos acuáticos. El bacteriófago Vf1 fue caracterizado con respecto a su morfología, estabilidad térmica, diferentes rangos de pH, sensibilidad frente al cloroformo, exposición a la luz UV, rango de hospederos y la curva de crecimiento de un paso. La microscopía electrónica de transmisión, evidenció cabeza de forma icosaedrica con un diámetro de 82.773 nm y un talo largo no contráctil de 142.318 nm de longitud, características propias a la familia Siphoviridae. El fago Vf1, fue resistente al calor a 20°C por 30 minutos, perdiendo su viabilidad a partir de 50 y 60°C; y en valores de pH entre 7 y 8 mantuvo títulos elevados, disminuyendo el título entre 5 y 6, siendo nulo a valores de pH ácido. La viabilidad frente a la exposición al cloroformo, evidenció una reducción en el título del 50% y frente a la luz UV, la reducción fue del 100% a 90 segundos de exposición. En la curva de crecimiento de un paso evidenció un período de latencia de 20 minutos y el tamaño de la explosión o burst size fue 602 partículas por centro infectivo. Los parámetros biológicos evaluados en este estudio evidenciaron el potencial del bacteriófago Vf1 para poder ser utilizado en fagoterapia, además, la metodología evaluada podría ser utilizado para el aislamiento de otros bacteriófagos de ambientes marinos. / Tesis

Estudia la variabilidad bacteriana de los cuerpos de agua de la zona de Mar Bravo en Ecuador, producido por la producción larvaria del camarón blanco Litopenaeus vannamei, basados en la cuantificación de bacterias viables y bacterias no viables. Encuentra que las concentraciones de bacterias fueron más altas en la estación seca, así como en las tomas realizadas en sicigia, presentando valores 4.5E+05 UFC/ml y para cuadratura 2.0E+05 UFC/ml. Los parámetros químicos como clorofila, carbono, DBO y DQO fueron influenciados con las estaciones ambientales guardando similitud entre los comportamientos de carbono y clorofila. Los datos de producción como sobrevivencia y densidades, no presentaron diferencias significativas cuando fueron analizados por épocas del año. Las correlaciones bacterianas comparando ufc/ml y sitios de muestreos, así como las correlaciones de las bandas moleculares con los sitios fueron más positivas cuando se trabajó con bacterias no viables demostrando que este método fue más exitoso que el método tradicional. No se detectaron genes de toxinas para los genes TDH, TRH y TOX en las bacterias analizadas y el análisis de resistencia a antibióticos fue mayor al 65 % para algunas cepas, teniendo relación también con la época del año. / Tesis

Marine water contains large numbers of fish spoilage bacteria and pathogens including V. cholerae, V. parahaemolyticus, and V. vulnificus. Consumption of contaminated seafood could lead to the transmission of these pathogens to humans. Accurate identification of suspected pathogens and spoilage organisms is important to ensure consumer safety and a long shelf life. This project assessed the bacterial quality of hake during processing. Some attention was also given to pilchards and horse mackerel. The results showed a sharp increase in the mesophilic and sucrose fermenting Vibrio species counts in hake after filleting. It has been suggested that this contamination occurred during processing from biofilms present in the sea-water distribution system. During the study 257 strains isolated from Thiosulphate citrate bile salts sucrose (TCBS) agar were screened to determine the presence of the pathogenic Vibrios amongst these isolates. It was difficult to distinguish between V. alginolyticus and V. parahaemolyticus species due to high sequence similarity in their 16S rRNA genes. Final identification of the isolates required a polyphasic approach and it was found that none of the pathogenic Vibrios were present but that the Vibrio isolates mainly belonged to V. alginolyticus. As it was suspected that the main source of contamination was the treated sea water used during processing the ability of chlorine, ozone and hydrogen peroxide to prevent biolfilm formation was examined. The behaviour of two V. alginolyticus strains (V590 and V595) isolated from the processed hake was evaluated. These strains formed biofilms faster than the V. alginolyticus LMG4409 type strain, but were similar to V. parahaemolyticus LMG2850. Biofilms formed by these bacteria were resistant to 4 mg/l chlorine and to 2 mg/l ozone, but were inhibited by 0.05 % and 0.2 % hydrogen peroxide for biofilms initiation and mature biofilms respectively. The close resemblance of atypical V. alginolyticus isolates to V. parahaemolyticus may indicate the ability of pathogens to survive under similar conditions. Effective decontamination and quality assurance strategies are therefore required when processing fish to prevent disease outbreaks. / Thesis (PhD)--University of Pretoria, 2011. / Microbiology and Plant Pathology / unrestricted

No abstract. See Front page / Dissertation (MSc (Microbiology))--University of Pretoria, 2007. / Microbiology and Plant Pathology / unrestricted