MONTEIRO, Denise Terezinha Lippmann. Comparação da qualidade bacteriológica da água marinha e da areia seca e molhada de duas praias do litoral leste do Ceará. 2013. 71f. Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Instituto de Ciências do Mar, Fortaleza-CE, 2013 . / Submitted by Solange Gomes (solagom@yahoo.com.br) on 2013-11-01T19:12:18Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_dtlmonteiro-1.pdf: 1014462 bytes, checksum: 91b77c85111b5d4ccd845f2fd279d4da (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2013-11-07T15:50:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_dtlmonteiro-1.pdf: 1014462 bytes, checksum: 91b77c85111b5d4ccd845f2fd279d4da (MD5) / Made available in DSpace on 2013-11-07T15:50:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_dtlmonteiro-1.pdf: 1014462 bytes, checksum: 91b77c85111b5d4ccd845f2fd279d4da (MD5) Previous issue date: 2013 / A qualidade microbiológica das águas e areias das praias, principalmente das localizadas em áreas de grande desenvolvimento econômico social e turístico, caso de Aquiraz, deveria ser uma preocupação constante dos órgãos públicos, uma vez que muitas doenças são veiculadas por esses microcosmos, sobretudo às pessoas com deficiência no sistema imunológico, caso dos idosos e crianças. No período de Fevereiro a Maio/2012, semanalmente, foi realizado o monitoramento das águas e das areias (seca e molhada) das praias do Iguape e do Presídio, ambas em Aquiraz, Ceará. Os objetivos da pesquisa foram comparar quantitativamente a microbiota bacteriana presente nas águas do mar e na areia dessas duas praias. Foram avaliados para a água e areia: o NMP de Coliformes Termotolerantes (CT), de Escherichia coli (E.coli), de Enterococcus spp. (ENT) e a contagem de leveduras (somente no sedimento). A técnica usada para estimar a população de CT, E.coli e Enterococcus spp., tanto nas águas como nas areias (seca e molhada) foi a dos tubos múltiplos e o método de Contagem Padrão em Placas (CPP) utilizado para estimar a população das leveduras. Os resultados obtidos para as amostras de água do mar foram comparados com a Resolução do Conselho Nacional do Meio Ambiente nº 274/2000. Os dados obtidos para areia seca e molhada foram comparados à Legislação de Portugal devido à ausência de legislação no Brasil. De acordo com os resultados obtidos, a água da praia do Iguape apresentou uma situação de risco maior do que a praia do Presídio. As areias secas e molhadas apresentaram uma maior contaminação na praia do Iguape. As amostras de areia seca do Iguape e do Presídio apresentaram uma contaminação superior às de areia molhada. Foi observada uma maior contaminação de levedura na praia do Iguape. A areia seca do Iguape está mais contaminada com Enterococcus e leveduras do que a areia seca da Praia do Presidio. Recomenda-se uma ação eficaz de monitoramento pelas autoridades sanitárias no sentido de eliminar as fontes de contaminação por bactérias patogênicas ao homem.

REBOUÇAS, Ricardo Albuquerque. Monitoramento da microbiota bacteriana da água em um sistema fechado de cultivo em uma estação de piscicultura marinha. 2010. 79 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará. Fortaleza, 2010. / Submitted by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2012-02-01T18:21:04Z No. of bitstreams: 1 2010_dis_rareboucas.pdf: 2255644 bytes, checksum: 95d0f6b8a96a5410ed5ff11b737358df (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2012-02-02T16:38:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_dis_rareboucas.pdf: 2255644 bytes, checksum: 95d0f6b8a96a5410ed5ff11b737358df (MD5) / Made available in DSpace on 2012-02-02T16:38:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_dis_rareboucas.pdf: 2255644 bytes, checksum: 95d0f6b8a96a5410ed5ff11b737358df (MD5) Previous issue date: 2010 / This research aimed to quantify, identify and perform antibiotic bacterial groups of the genus Vibrio in the water recirculation to the growing of a marine fish experimental station. Water samples were collected from the cultivation system in the period between September 2007 and May 2008, a total of eight collections involving the rainy and dry seasons. Environmental parameters were within the standards established by Brazilian legislation. The most probable number (MPN) of total coliforms and thermotolerant vary in P1 and P6, respectively: (P1) <1.8 to 3.4 per 10 sqm and standard plate (CCP) of colony forming units (CFU) per milliliter of heterotrophic bacteria between points ranged from <10 to 2.5 x 10 (7) CFU / mL. The number of colonies of Vibrio P1, P2 and P6 ranged from 10 to 2.37 X 10 (4) CFU / mL. Form identified 40 strains isolated from 51 amsotras water between heterotrophic bacteria. These proved to belong to 13 distinct genres, and Aeromonas, Vibrio, and Leuconostoc, the most frequent. Cultures with nitrification capacity coming from water samples were distributed in eight different genera, being found more frequently Arthorbacter, Alcaligenes, and Paracoccus Vibrios. Bili agar Thiosulfate citrate-sucrose (TCBS) were isolated and identified species of the family Vibrionaceae. Of the 28 water samples isolated from 20 strains were identified. The strains identified belonged to 10 different species V. coralliitycus, V. metschnikovii and V. orientalis, had a higher frequency. The isolates identified were subjected to sensitivity. All strains were sensitive to sulfazotrim, chloramphenicol, streptomycin, oxytetracycline and nitrofurantoin. The profile over freqeunte resistance of isolates was CTX-NAL (44.5%) (4 / 9). Of the total isolates, nine (45%) (9 / 20) is shown with a profile of multiple resistance to six different classes of antimicrobials. Was observed in this study antimicrobial resistance: cefotaxime, nalidixic acid, gentamicin, cephalothin, ciprofloxacin, ampicillin, tetracycline, and florfenicol, and may be related to the characteristic plasmid. / O desenvolvimento de cultivos eficientes utilizando sistemas fechados de cultivo com recirculação de água é necessário para uma aquicultura sustentável. Esta pesquisa visou quantificar, identificar grupos bacterianos e realizar antibiograma das espécies do gênero Vibrio presentes na água de recirculação usada para cultivo de uma estação de piscicultura marinha experimental. As amostras de água foram coletadas do sistema de cultivo no período entre setembro de 2007 e maio de 2008, perfazendo um total de 8 coletas envolvendo o período de chuva e estiagem. Os parâmetros ambientais ficaram dentro dos padrões estabelecidos pela legislação brasileira. Os números mais prováveis (NMP) de coliformes totais e termotolerantes variam em P1 e P6 respectivamente: (P1) de < 1,8 a 3,4 por 10² e de padrão em placa (CCP) das Unidades Formadoras de Colônias (UFC) por mililitro das bactérias heterotrôficas entre os pontos oscilaram de < 10 a 2,5X10 (7) UFC/mL. O número de colônias de Vibrio em P1, P2 e P6 oscilou de 10 a 2,37 X 10 (4) UFC/mL. Forma identificadas 40 cepas das 51 isoladas de amsotras de água entre as bactérias heterotróficas. Estas se mostraram pertencentes a 13 gêneros distintos, sendo Aeromonas, Leuconostoc e Vibrio, as mais frequentes. As culturas com capacidade de nitrificação provindas de amostras de água se distribuiram em 8 gêneros diferentes, sendo encontrados com maior freqüência Arthorbacter, Alcaligenes Paracoccus e Vibrios. Em Agar Tiossulfato Citrato Bili-Sacarose (TCBS) foram isoladas e identificadas espécias da família Vibrionaceae. Dos 28 isolados das amostras de água foram identificadas 20 estirpes. As estirpes identificadas pertenciam a 10 diferentes espécies V. coralliitycus, V. metschnikovii e V. orientalis, tiveram maior freqüência. Os isolados identificados foram submetidos a antibiograma. Todas as cepas foram sensíveis ao sulfazotrim, ao cloranfenicol, a estreptomicina, oxitetraciclina, e a nitrofurantoina. Entre a microbiota de vibrios da água no sistema forma encontrados 40% das estirpes sendo resistentes ao ácido nalidíxico, 30% a cefotaxina e a ampicilina, 5% ao florfenicol, a tetraciclina, a cefalotina e agentamicina. O perfil mais freqeunte de resistência dos isolados foi o CTX-NAL (44,5%) (4/9). Do total de estirpes isoladas, nove (45%) (9/20) se mostraram com um perfil de resistência múltipla a seis classes diferentes de antimicrobianos. Foi observada nessa pesquisa a resistência aos antimicrobianos: cefotaxima, ácido nalidíxico, gentamicina, cefalotina, ciprofloxacino, ampicilina, tetraciclina e florfenicol, podendo estar relacionada à característica plasmidial. Estudos sobre a diversidade da microbiota com particular às populações de Vibrio nesses ambientes são de extrema importância para a avaliação da extensão da gravidade em eventos de doenças bacterianas. Pesquisas sobre bactérias nitrificantes entre a população de bactérias heterotróficas dentro do sistema de cultivo de organismos marinhos são importantes para estabelecer os parâmetros biológicos e garantir a sustentabilidade do cultivo

PAES, F. A. Análise de comunidades microbianas de solo de manguezal por T-RFLP e microarranjos de DNA. 2008. XVI; 128 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2008. / Submitted by Solange Gomes (solagom@yahoo.com.br) on 2013-02-06T18:56:41Z No. of bitstreams: 1 Fernanda Araujo Paes.pdf: 880237 bytes, checksum: 6153306cc4bd44febecb7ee196c60094 (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2013-06-04T19:13:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Fernanda Araujo Paes.pdf: 880237 bytes, checksum: 6153306cc4bd44febecb7ee196c60094 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-04T19:13:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fernanda Araujo Paes.pdf: 880237 bytes, checksum: 6153306cc4bd44febecb7ee196c60094 (MD5) Previous issue date: 2008 / Os manguezais são ecossistemas importantes e produtivos, encontrados ao longo da linha da costa de regiões tropicais e subtropicias. Processos importantes, como a ciclagem de nutrientes, estão diretamente conectados à atividade das comunidades microbianas desses solos. Dada sua posição estratégica, os manguezais são bastante impactados no mundo todo. No Brasil, áreas importantes como a da Baía de todos os Santos (BA) são severamente afetadas pela presença do petróleo. Compreender as adaptações da microbiota local e sua dinâmica, frente às alterações ambientais, é essencial para que se consiga manter ou restaurar esses ecossistemas. A presente dissertação investigou a estrutura e a função de comunidades microbianas em uma área do manguezal da baía de Todos os Santos, poluída pela indústria do petróleo. Dois locais foram amostrados – um, situado na área de refinamento dessa indústria e o outro, distante desse local e usado como controle. Além dos dados abióticos medidos, dois métodos independentes de cultivo foram utilizados: T-RFLP e microarranjos de DNA. Os resultados de ambos os sítios, nos experimentos de T-RFLP, mostraram que as duas comunidades bacterianas diferem quanto à sua estrutura. Para o sítio amostrado na área da refinaria, um número maior de OTUs sugere um estímulo ambiental, na comunidade bacteriana, fato associável ao alto teor de matéria orgânica desse local. Para os microarranjos de DNA, categorias similares de genes foram detectadas, em ambos os locais, mas a especificidade de suas sequências foi distinta. Os genes que codificam para a remediação orgânica foram os mais representativos, mais de 40% do total nos dois sítios. Mesmo detectando categorias semelhantes, apenas 4% das sequências genéticas foram comuns aos sítios. Estes dados mostram que organismos diferentes são responsáveis por funções similares em cada ponto. A diferença entre os locais, observada nos experimentos, pode ser relacionada com o fato do sítio 1 situar-se numa região fortemente afetada por hidrocarbonetos. Utilizando-se índices ecológicos, os dados de T-RFLP indicaram o sítio 1 como mais diverso, enquanto os resultados dos microarranjos de DNA mostraram o oposto. Concluindo, a estrutura e função da microbiota local são afetadas pela presença da indústria do petróleo. Estudos adicionais poderão ajudar a compreender a dinâmica dessas comunidades microbianas, frente às futuras exposições ao óleo e/ou derivados.

LIMA, Anahy de Souza. Víbrio em camarão e na água de três fazendas de carcinicultura do Ceará. 2007. 74f. Dissertação (Mestrado em Ciencias Marinhas Tropicais)- Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2007. / Submitted by Debora Oliveira (deby_borboletinha@hotmail.com) on 2011-11-29T12:22:03Z No. of bitstreams: 1 2007_dis_adslima.pdf: 2071706 bytes, checksum: 515e8e6c8c757b34d245885074813a89 (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2011-12-02T19:30:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_dis_adslima.pdf: 2071706 bytes, checksum: 515e8e6c8c757b34d245885074813a89 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-12-02T19:30:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_dis_adslima.pdf: 2071706 bytes, checksum: 515e8e6c8c757b34d245885074813a89 (MD5) Previous issue date: 2007 / The objective of the present study was to identify Vibrio species in cultures of Litopenaeus vannamei in Northeastern Brazil. During the rainy and dry seasons from August 2005 to October 2006 two L. vannamei culture cycles were observed on three marine shrimp farms (A, B and C) located in the estuaries of Acaraú, Coreaú and Jaguaribe. Sixty shrimp samples and 240 pond water samples were analyzed. The outcome parameters were total vibrio count (standard plate count), saccharose-positive and negative vibrio count, and vibrio species diversity in shrimp and water samples. The lowest total vibrio count found in water samples was 2.0 x 102 CFU/mL (Farms A, and C) during the rainy season and the highest was 1,42 x 108 CFU/mL (Farm B) during the rainy season. The highest total vibrio count in shrimp samples (postlarvae and hepatopancreas) was 4,5 x 108 CFU/g (Farm B) during the dry season. The lowest and highest values observed for saccharosepositive colonies in hepatopancreas were 1.00 x 102 CFU/g (Farms A, and B) during the rainy season and 4,5 x 108 CFU/g (Farm C) during the dry season. The corresponding values for saccharose-negative colonies were 0.98 x 10 CFU/g (Farm A) and 9.50 x 105 CFU/g (Farm C), both in the rainy season. Vibrio counts were always lower in samples collected during the rainy season. A total of 118 Vibrio strains were isolated from the water (n=62) and shrimp (n=56) samples collected at the three farms. Farm B had the largest number of identifiable vibrio species (11). The most frequently isolated species was Vibrio mimicus, followed by V. alginolyticus and V. tubiashii. The lowest survival rate (37.24%) during harvesting was observed for one of the ponds at Farm A during the rainy season. Neither species diversity, nor total vibrio counts, nor saccharosepositive and negative vibrio counts in hepatopancreas samples, was associated with survival rates during harvesting. However, the combination of high vibrio counts and low species diversity observed in water samples from Farm A during the rainy season may have affected survival rates negatively. The number of vibrios increases in proportion with salinity. The likelihood of a vibrio infection in a given shrimp population cannot be determined by total vibrio counts or saccharosepositive and negative counts alone. / O presente estudo teve por objetivo quantificar Vibrio, vibrios sac+ e sac – e identificar as espécies de Vibrio, presentes no cultivo do camarão Litopenaeus vannamei e na água onde é ele cultivado. Acompanharamse dois ciclos do cultivo do L. vannamei em três fazendas (A, B e C),situadas nos estuários dos rios Acaraú, Coreaú e Jaguaribe (CE), de agosto de 2005 a outubro de 2006, nas estações de chuva e estiagem. Foram analisadas 60 amostras de camarão e 240 amostras de água de viveiro. Foram feitos os testes de Contagem Padrão em Placas (CPP) total de Vibrio; CPP das colônias de Vibrio sacarose positivas e negativas, e identificação das espécies nas amostras de camarão e na água. O valor mínimo da CPP de Vibrio nas amostras de água foi de 2,0 x 102 UFC/mL nas fazendas A, e C no período de chuva e o máximo foi 1,42 x 108 UFC/mL na fazenda B, no período de estio. O valor máximo para CPP de Vibrio nas amostras de camarão (pós-larva e hepatopâncreas) foi de 4,5 x 108 UFC/g, na fazenda B no período de estio. O valor mínimo de Vibrio sacarose positiva no hepatopâncreas foi 1,00 x 102 UFC/g nas fazendas A e B no período de chuva e máximo foi 4,5 x 108 UFC/g na fazenda B, no período de estio. O valor mínimo de Vibrio sacarose negativa foi 0,98 x 10 UFC/g de hepatopâncreas na fazenda A, no período de chuva e máximo foi de 9,50 x 105 na fazenda C no período da chuva. A CPP de vibrios das amostras de água e do camarão foi sempre menor no período da chuva. Das amostras de água e camarão das três fazendas foram isoladas 145 cepas de Vibrio. Dessas, 62 foram isoladas da água de cultivo do camarão e 56 foram isoladas do camarão (pós-larva e hepatopâncreas). A fazenda B apresentou maior número de diferentes espécies isoladas e identificadas (11). Durante a pesquisa, os isolados de camarão e água do viveiro, apresentaram uma predominância de Vibrio mimicus, seguidos de V. alginolyticus e V. tubiashii. De todas as fazendas, A, B e C, a fazenda A foi a que apresentou um viveiro com a menor taxa de sobrevivência de camarões na despesca: 37,24%, no período da chuva. Nem a quantidade de víbrios total, nem a de sacarose positiva, ou negativa no hepatopâncreas dos camarões, influencia o índice de sobrevivência dos animais nos viveiros das fazendas, no momento da despesca. A maior ou menor diversidade de víbrios nos camarões não implicou numa maior ou menor taxa de sobrevivência dos animais nos viveiros das fazendas, no momento da despesca. No entanto, quando o número de Vibrio foi alto na água e a diversidade baixa, caso da Fazenda A no período da chuva, a taxa de sobrevivência foi afetada negativamente. O número de víbrios é proporcional ao teor de salinidade das águas. Somente os dados da enumeração de víbrios e/ou os dados da enumeração de víbrio sacarose positiva ou negativa não são suficientes para se avaliar a probabilidade de camarões, de um determinado viveiro, virem a adoecer.

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / The Most Probable Numbers (NMPs) of enterococci and thermotolerant coliforms were estimated in 60 oyster samples (crassostrea rhizophorea) sold at two beach restaurantes, A and B, at Praia do Futuro, Fortaleza City, Cearà state, during the period between september 2000 and september 2001. Each sample included 25 individuals, therefore reaching a total of approximately 1,500 tested oyster. The enterococci NMPs in the samples collected at A ranged between <3,0/g and >1,100/g, while those sampled at B were between 3,0/g and >1,100/g. For the thermotolerant coliforms the obtained values were between <3,0/g and 9,300/g for A, and between <3,0/g and >110,000/g for B. Of all the tested samples, 40% of the oyster sampled at A and 43% of those sampled at B showed thermotolerant coliforms NMPs values over the limits established by the National Health Safety Agency ( AgÃncia Nacional de VigilÃncia SanitÃria) for human consumption of raw food (BRASIL, 2001). There was no statistical correlation between the enterococci and thermotolerant coliforms NMPs (p<0.05). 90 strains of E. faecalis (71%), 8 of E. hirae (6%), 2 of E. mundtii (2%) and 1 of E. durans (1%) were isolated at A, while at B 76 strains of E. faecalis (63%), 5 of E. hirae (4%), 2 of E. mundtii (2%) were found. Regarding the thermotolerant coliform group, 56 strains of E. coli (82%), 12 of Enterobacter (17%) and 1 of Citrobacter (1%) were confirmed at A, while 40 strains of E. coli (63%), 19 of Enterobacter (30%), 3 of Citrobacter (5%) and 1 of Klebsiella (2%) were found at B. All the E. coli strains isolated at A were sensitive to the following antimicrobial agents: CIP, CN, CRO, FOX, IMP, NA and SXT. 70% of these strains showed resistence to ampiciline. At B, the higher sensitivies (100%) were observed for the following antimicrobial agents: CIP, CN, CRO, FOX, IMP, NA and NIT. The ampiciline-resistence values were similar to those at A. None of the Enterococcus species showed to be capable to produce growth inhibiting substances (bacteriocins) aganist E. coli. / Foram estimados o NÃmero Mais ProvÃvel (NMP) de enterococos e de coliformes termotolerantes de 60 amostras de ostras (Crassostrea rhizophorae) comercializadas em duas barracas: A e B, na Praia do Futuro em Fortaleza â CE, no perÃodo de setembro de 2000 a setembro de 2001. Cada amostra constava de 25 indivÃduos, totalizando assim a anÃlise de aproximadamente 1.500 ostras. Os NMPs de enterococos para as amostras coletadas na Barraca A variaram de <3,0 a >1100/g , enquanto os estimados nas amostras da Barraca B ficaram entre 3,0 e >1100/g. Para coliformes termotolerantes os valores encontrados nas amostras de ostra foram de <3,0 a 9300,0/g e <3,0 a >110000/g para as Barracas A e B, respectivamente. Do total de amostras analisadas, 40% na Barraca A e 43% na Barraca B mostraram valores de coliformes termotolerantes acima dos padrÃes estabelecidos pela AgÃncia Nacional de VigilÃncia SanitÃria (ANVISA) para espÃcies destinadas a alimentaÃÃo humana e que serÃo ingeridas cruas (BRASIL, 2001). NÃo houve correlaÃÃo estatÃstica entre os NMPs de enterococos e de coliformes termotolerantes ( p< 0,05). Na Barraca A foram confirmadas 90 (71%)cepas de E. faecalis; 8 (6%) de E. hirae; 2(2%) de E. mundtii e 1( 1%) de E. durans, enquanto na B foram confirmadas: 76(63%) cepas de E. faecalis; 5 (4%) de E. hirae e 2(2%) de E. mundtii. Com relaÃÃo aos coliformes termotolerantes, foram confirmadas na Barraca A: 56 (82%)cepas de E. coli; 12 (17%) de Enterobacter e 1 (1%) de Citrobacter e na Barraca B, foram confirmadas 40 (63%) de E. coli; 19 (30%) de Enterobacter; 3 (5%) de Citrobacter e 1 (2%) de Klebsiella. Todas as cepas de E. coli da Barraca A foram sensÃveis ao antimicrobianos: CIP,CN, CRO, FOX, IMP, NA e SXT enquanto, que 70% apresentaram resistÃncia a ampicilina. Na Barraca B, As maiores sensibilidades (100%) foram detectadas aos antimicrobianos CRO, CIP, CN, FOX, F, IMP, NA. e NIT. Com relaÃÃo à resistÃncia a ampicilina, o resultado foi similar ao da Barraca A. Frente a Escherichia coli, nenhuma das cepas, das diferentes espÃcies de Enterococcus, testadas, mostrou capacidade de produzir substÃncias inibidoras (bacteriocinas) de crescimento.

Resumo: Em ambientes marinhos os números de bactérias são mais elevados em regiões próximas da costa, devido à entrada de altas quantidades de matéria orgânica oriunda da terra firme. A Baía de Guaratuba está situada no litoral sul do Paraná. Próximo da sua entrada localizam-se a cidade de Guaratuba e o Balneário de Caiobá e sua porção interna é margeada por manguezais. Durante a presente pesquisa estudou-se a variabilidade temporal do bacterioplâncton, visando sua alteração com a variação da maré e espacial do bacteriobentos em sedimentos subaquáticos em nove estações localizadas ao longo do eixo leste-oeste da baía, assim como a variação espacial do sedimento entre-marés (dezoito estações). Todos os parâmetros foram correlacionados com fatores físico-químicos (salinidade, temperatura, pH, seston, transparência da água, oxigênio dissolvido e granulometria) e biológicos (clorofila). Em todas as estações foram estudados a variabilidade de bactérias heterotróficas totais (microscopia de epifluorescência), da biomassa bacteriana, das bactérias heterotróficas cultiváveis halófilas e halófobas (meio de cultura ZoBell 2216E modificado), dos coliformes totais e Escherichia coli (substrato cromogênico). Os resultados mostraram que durante a maré enchente houve redução de salinidade e pH nas estações internas, assim como um aumento de bactérias heterotróficas totais, da biomassa bacteriana e de coliformes totais nas águas de todas as áreas protegidas da baía. Os maiores valores de bactérias heterotróficas halófobas foram observados em águas de profundidade da estação 9 durante a vazante. Ao contrário, os maiores valores de bactérias heterotróficas halófilas ocorreram na estação 3 durante a enchente. Os maiores valores de E. coli foram observados, nas duas datas de coleta, em águas da estação 3. No sedimento de fundo foram observados os maiores valores de areia na estação 9, seguida de perto pelas estações 1 e 5. Nas mesmas estações puderam ser observados valores baixos de bactérias heterotróficas totais e de biomassa bacteriana. Da mesma forma, as estações internas (8 e 9) e as externas (1, 2, 3 e 5) apresentaram valores baixos de bactérias heterotróficas cultiváveis halófobas. Os valores máximos de bactérias heterotróficas halófilas foram registrados na estação 4, os de coliformes totais nas estações protegidas do estuário e os de E. coli na estação 3. Os estudos efetuados nas regiões entre-marés mostraram nas estações externas, caracterizadas por altos valores de areia e baixos de matéria orgânica, valores baixos de todos os grupos bacterianos estudados. É importante ressaltar que mesmo os valores de E. coli foram mais elevados nos sedimentos de manguezais distantes dos centros urbanos. Concluiu-se assim que as regiões externas e internas da baía são de alta energia e que na água o número de bactérias heterotróficas totais, de biomassa bacteriana, de bactérias cultiváveis halófilas e halófobas da região estudada depende do ciclo das marés. O número de bactérias no sedimento depende não só da granulometria mas também da quantidade de matéria orgânica disponível e que parece ter havido um aumento de bactérias nas estações de cultivo, em decorrência do aumento de matéria orgânica produzida pelos organismos cultivados. Há indícios de que, de acordo com a legislação vigente, nenhuma região da Baía de Guaratuba é adequada para cultivo de espécies destinadas à alimentação humana e que são ingeridas cruas, e que nas regiões mais abrigadas da baía residem os maiores problemas. Palavras chave: bactérias, sedimento, água, Baía de Guaratuba, coliformes.

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No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Liany Figuerêdo de Andrade Melo.pdf: 5680979 bytes, checksum: 26509ea8aef8d1d77265831744059bb7 (MD5) Previous issue date: 2017-09-12 / FACEPE / Palythoa caribaeorum (baba-de-boi) é um cnidário marinho que secreta um muco viscoso o qual apresenta propriedades farmacológicas e abriga uma série de bactérias com potencial de aplicação biotecnológica. No presente trabalho, objetivou-se obtenção desses micro-organismos associados ao muco de populações do zoantídeo oriundas da praia de Porto de Galinhas, litoral sul de Pernambuco, para fins de prospecção de produtos naturais. Foram isoladas 281 bactérias das quais 55 cepas se mantiveram viáveis após o subcultivo e preservação. A identificação dos isolados foi realizada a partir do sequenciamento dos genes 16S rDNA e rpoB, resultando na obtenção de 18 espécies pertencentes aos filos Firmicutes (37 isolados, 67%), Actinobacteria (11 isolados, 20%), Proteobacteria (5 isolados, 9%) e Bacteroidetes (2 isolados, 4%). Exiguobacterium aurantiacum correspondeu à espécie mais abundante com 9 isolados, enquanto o gênero Bacillus se apresentou como o mais diverso, totalizando 19 isolados distribuídos em 8 espécies distintas. Os isolados de Bacillus spp. foram selecionados para investigação do potencial de produção de 8 enzimas em meio sólido. Todas as cepas produziram pelo menos 4 das enzimas investigadas, com gelatinase sendo a mais frequente (19 isolados), seguida por esterase (18), caseinase (17), amilase (12), poligalacturonase (12), pectato liase (12), celulase (11) e lipase (11). Os isolados B. thuringiensis BCLTHR-01 e B. subtilis BCLSUB-02, 03 e 04 foram os melhores produtores enzimáticos, com resultados positivos em todos os ensaios. A cepa BCLTHR-01 também foi investigada quanto ao potencial biolarvicida contra Aedes aegypti. Para produção das toxinas, foi desenvolvido um processo fermentativo em biorreator operando em batelada com um meio de cultura desprovido de carboidratos como fonte de carbono. A biomassa tóxica concentrada (10⁹ UFC/mL) obtida após 48h de fermentação mostrou atividade biológica com valores de CL₅₀ de 0,849 ppm (intervalo de 0,792 a 0,900 ppm) e de CL₉₀ de 1,285 ppm (intervalo de 1,190 a 1,434 ppm), comprovando o potencial de aplicação deste isolado para o controle do vetor. As bactérias marinhas associadas a P. caribaeorum são potencialmente excelentes fontes de metabólitos bioativos. A presença de espécies capazes de degradar hidrocarbonetos, fixar nitrogênio, metabolizar enxofre e produzir enzimas e toxinas com diversas propriedades sugere que o zoantídeo se beneficia através da assimilação de compostos complementares ao seu metabolismo e através da aquisição de um mecanismo adicional de defesa contra patógenos. A complexidade do ambiente marinho induz à adaptação dos micro-organismos, resultando na produção de uma diversidade de moléculas com propriedades únicas que lhes permitem suportar as condições severas dos processos industriais, tornando-as interessantes objetos para aplicação industrial e biotecnológica. / Palythoa caribaeorum (baba-de-boi) is a marine cnidarian that secretes a viscous mucus which presents pharmacological properties and harbors several bacteria with potential for biotechnological application. In the present work, we aimed to obtain these microorganisms associated with the mucus of zoanthid populations from the beach of Porto de Galinhas, south coast of Pernambuco, to prospect for natural products. 281 bacteria were isolated, of which 55 strains remained viable after subculture and preservation. The identification of the isolates was done by sequencing the 16S rDNA and rpoB genes, resulting in 18 species belonging to the Firmicutes (37 isolates, 67%), Actinobacteria (11 isolates, 20%), Proteobacteria (5 isolates, 9 %) and Bacteroidetes (2 isolates, 4%). Exiguobacterium aurantiacum corresponded to the most abundant species with 9 isolates, while the genus Bacillus was the most diverse, totaling 19 isolates distributed in 8 different species. The isolates of Bacillus spp. were selected to investigate the potential to produce 8 enzymes in solid medium. All strains produced at least 4 of the investigated enzymes, with gelatinase being the most frequent (19 isolates), followed by esterase (18), caseinase (17), amylase (12), polygalacturonase (12), pectate lyase (12), cellulase (11) and lipase (11). The isolates B. thuringiensis BCLTHR-01 and B. subtilis BCLSUB-02, 03 and 04 were the best enzymatic producers, displaying positive results in all the assays. The strain BCLTHR-01 was also investigated for its biolarvicidal potential against Aedes aegypti. To produce the toxins, a fermentation process was developed in bioreactor batching with a culture medium devoid of carbohydrates as carbon source. The concentrated toxic biomass (10⁹ CFU/mL) obtained after 48h of fermentation showed biological activity with LC₅₀ value of 0.849 ppm (range of 0.792 to 0.900 ppm) and CL₉₀ value of 1.285 ppm (range of 1.190 to 1.434 ppm), proving the application potential of this isolate for vector control. Marine bacteria associated with P. caribaeorum are potentially excellent sources of bioactive metabolites. The presence of species capable of degrading hydrocarbons, fixing nitrogen, metabolizing sulfur and producing enzymes and toxins with different properties suggests that the zoanthide benefits through the assimilation of compounds complementary to its metabolism and through the acquisition of an additional mechanism of defense against pathogens. The complexity of the marine environment induces the adaptation of microorganisms, resulting in the production of a diversity of molecules with unique properties that allow them to withstand the harsh conditions of industrial processes, making them interesting objects for industrial and biotechnological application.

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-04-25Bitstream added on 2014-11-10T11:58:42Z : No. of bitstreams: 1 000789657_20150501.pdf: 723427 bytes, checksum: e010f1500c19bf2dbef96b2f4e2cd9ef (MD5) Bitstreams deleted on 2015-05-04T12:07:27Z: 000789657_20150501.pdf,Bitstream added on 2015-05-04T12:07:58Z : No. of bitstreams: 1 000789657.pdf: 2409240 bytes, checksum: 847b1a94257016d6acdea160cce6b1ee (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O crescente desenvolvimento do turismo nas regiões litorâneas pode gerar diversos impactos ambientais, aos quais, apenas recentemente, tem-se dedicado a devida atenção. A poluição orgânica pode afetar comunidades microbianas com consequências propagadas através de cadeias alimentares pelágicas inteiras afetando os ciclos biogeoquímicos. Existem poucos estudos sobre a ecologia microbiana nas areias de praia no Brasil. O objetivo deste estudo foi comparar a dinâmica microbiana nas areias de duas praias com diferentes graus de poluição, podendo inferir possíveis efeitos da poluição orgânica e fatores físico-químicos sobre a alça microbiana. Amostras de areia foram coletadas durante 24 horas nos períodos verão e inverno nas praias de Domingas Dias e Itaguá, localizadas no município de Ubatuba, Estado de São Paulo. As amostras foram analisadas para a avaliação das densidades e relações entre bactérias heterotróficas, cianobactérias, nanoflagelados heterótrofos, nanoflagelados autótrofos, microplâncton heterótrofo e microplâncton autótrofo, densidades dos indicadores de contaminação fecal Enterococcus sp. e Escherichia coli, quantidade de matéria orgânica, granulometria e temperatura do sedimento. Foram visualizadas diferenças entre as densidades dos microrganismos das praias de Domingas Dias e Itaguá. As alterações nas flutuações dos microrganismos da alça microbiana mostraram que a sua estrutura e dinâmica podem sofrer alterações advindas de diversos fatores, isolados ou em conjunto, como as descargas de efluentes orgânicos, as quantidades de matéria orgânica e os valores de temperatura do sedimento. A alça microbiana mostra ter um papel fundamental para a transferência de matéria e energia para níveis superiores da cadeia alimentar, principalmente em períodos oligotróficos do ano, ocorrendo alternâncias sazonais das atividades alimentares dos predadores dependendo do status trófico e da... / The increasing development of tourism in coastal regions can generate various impacts to the environment, which only recently has been devoted sufficient attention. Organic pollution may affect microbial communities with consequences spread through the entire pelagic food webs and affecting biogeochemical cycles. There are few studies about microbial ecology in beach sands in Brazil. The aim of this study was to compare the microbial dynamics in sands of two beaches with distinct degrees of sewage input, to infer possible effects of sewage pollution and physical and chemical factors over microbial loop. Beach sand samples were collected during 24 hours in the summer and winter from Domingas Dias and Itaguá beaches, Ubatuba city, São Paulo State. The samples were analysed for heterotrophic bacteria, cyanobacteria, heterotrophic and autotrophic nanoflagellates, and heterotrophic and autotrophic microplankton interactions and densities, Enterococcus sp. and Escherichia coli densities, organic matter quantity, granulometry and temperature. Differences were seen between the densities of the microorganisms from the beaches of Domingas Dias and Itaguá. Changes in the fluctuations of the microorganisms of the microbial loop showed that the structure and dynamics may suffer resulting changes of several factors, alone or together as the discharges of organic wastewater, the amount of organic matter and temperature values of the sediment. The microbial loop is shown to have an important role in the transfer of matter and energy to higher levels of the food chain, especially in oligotrophic periods of the year, occurring seasonal alternations of food depending on the activities of predators and trophic status of environmental pollution

Orientador: Ana Julia Fernandes Cardoso de Oliveira / Banca: Edison Barbieri / Banca: Roberto Fioravanti Carelli Fontes / Resumo: O crescente desenvolvimento do turismo nas regiões litorâneas pode gerar diversos impactos ambientais, aos quais, apenas recentemente, tem-se dedicado a devida atenção. A poluição orgânica pode afetar comunidades microbianas com consequências propagadas através de cadeias alimentares pelágicas inteiras afetando os ciclos biogeoquímicos. Existem poucos estudos sobre a ecologia microbiana nas areias de praia no Brasil. O objetivo deste estudo foi comparar a dinâmica microbiana nas areias de duas praias com diferentes graus de poluição, podendo inferir possíveis efeitos da poluição orgânica e fatores físico-químicos sobre a alça microbiana. Amostras de areia foram coletadas durante 24 horas nos períodos verão e inverno nas praias de Domingas Dias e Itaguá, localizadas no município de Ubatuba, Estado de São Paulo. As amostras foram analisadas para a avaliação das densidades e relações entre bactérias heterotróficas, cianobactérias, nanoflagelados heterótrofos, nanoflagelados autótrofos, microplâncton heterótrofo e microplâncton autótrofo, densidades dos indicadores de contaminação fecal Enterococcus sp. e Escherichia coli, quantidade de matéria orgânica, granulometria e temperatura do sedimento. Foram visualizadas diferenças entre as densidades dos microrganismos das praias de Domingas Dias e Itaguá. As alterações nas flutuações dos microrganismos da alça microbiana mostraram que a sua estrutura e dinâmica podem sofrer alterações advindas de diversos fatores, isolados ou em conjunto, como as descargas de efluentes orgânicos, as quantidades de matéria orgânica e os valores de temperatura do sedimento. A alça microbiana mostra ter um papel fundamental para a transferência de matéria e energia para níveis superiores da cadeia alimentar, principalmente em períodos oligotróficos do ano, ocorrendo alternâncias sazonais das atividades alimentares dos predadores dependendo do status trófico e da... / Abstract: The increasing development of tourism in coastal regions can generate various impacts to the environment, which only recently has been devoted sufficient attention. Organic pollution may affect microbial communities with consequences spread through the entire pelagic food webs and affecting biogeochemical cycles. There are few studies about microbial ecology in beach sands in Brazil. The aim of this study was to compare the microbial dynamics in sands of two beaches with distinct degrees of sewage input, to infer possible effects of sewage pollution and physical and chemical factors over microbial loop. Beach sand samples were collected during 24 hours in the summer and winter from Domingas Dias and Itaguá beaches, Ubatuba city, São Paulo State. The samples were analysed for heterotrophic bacteria, cyanobacteria, heterotrophic and autotrophic nanoflagellates, and heterotrophic and autotrophic microplankton interactions and densities, Enterococcus sp. and Escherichia coli densities, organic matter quantity, granulometry and temperature. Differences were seen between the densities of the microorganisms from the beaches of Domingas Dias and Itaguá. Changes in the fluctuations of the microorganisms of the microbial loop showed that the structure and dynamics may suffer resulting changes of several factors, alone or together as the discharges of organic wastewater, the amount of organic matter and temperature values of the sediment. The microbial loop is shown to have an important role in the transfer of matter and energy to higher levels of the food chain, especially in oligotrophic periods of the year, occurring seasonal alternations of food depending on the activities of predators and trophic status of environmental pollution / Mestre

A poluição, alteração física do habitat e a introdução de espécies invasoras via água de lastro, representam os maiores impactos antropogênicos para os ambientes costeiros. Foram pesquisadas em amostras da região costeira de S. Paulo, regiões portuárias brasileiras e de tanques de lastro de navios, bactérias das espécies Vibrio cholerae (Vc), V. parahaemolyticus (Vp) e V. vulnificus (Vv) que são as que têm maior implicação na saúde pública. As amostras foram avaliadas levando-se em conta parâmetros físico-químicos e microbiológicos e suas relações com a presença de Vc, Vp e Vv. As relações clonais foram verificadas através das técnicas de ERIC, BOX e REP-PCR. Foram identificadas 90 cepas de Vp e 11 de Vc. Foram observadas correlações entre alguns parâmetros microbiológicos e a presença de vibrios. A análise clonal permitiu verificar a alta diversidade das cepas. Concluiu-se que Vc e Vp são autóctones do ambiente costeiro brasileiro e podem ser tornar reservatórios para determinados fatores associados à virulência, gerando cepas com potencial epidêmico. / Pollution, physical alteration of habitat and the introduction of alien species through ballast water constitute the biggest anthropogenic impacts on coastal environments. We examined samples taken from the coastal region of S. Paulo state, Brazilian ports and ship ballast tanks, for bacteria of the species Vibrio cholerae (Vc), V. parahaemolyticus (Vp) and V. vulnificus (Vv) which have the most significant implication for public health. The samples were evaluated for microbiological and physical-chemical parameters as well as the presence of Vc, Vp and Vv. Clonal relationships of bacterial isolates were determined through ERIC, BOX and REP-PCR. A total of 90 strains of Vp and 11 of Vc were identified. Correlations between some microbiological parameters and the presence of vibrios were observed. The clonal analysis revealed extensive strain diversity. We concluded that Vc and Vp are autochthonous bacteria of the Brazilian coastal environment that can become reservoirs for factors associated with virulence, and are capable of generating strains with epidemic potential.