Diversas doenças virais emergentes e re-emergentes têm sido descritas em morcegos. As alterações ambientais provocadas por seres humanos associada a adaptação dos morcegos às áreas urbanas aumentam as chances da transmissão dessas doenças para humanos e animais domésticos. O estudo das coronaviroses associadas a esse hospedeiro tem evidenciado que os morcegos atuam como reservatório dessa doença, enquanto o estudo das rotaviroses ainda foi pouco explorado. Este estudo tem como objetivo verificar a ocorrência de coronavírus e rotavírus em diversas espécies de morcegos do Estado de São Paulo, Brasil, e realizar inferências filogenéticas a partir dos genes RdRp e S dos coronavírus, assim como de genes de proteínas estruturais e não estruturais dos rotavírus. Para tanto, foi utilizada a RT-PCR seguida de sequenciamento de DNA. Para análise filogenética e de diversidade molecular foi utilizado critério de otimização de distância e cálculo das identidades de nucleotídeos e aminoácidos entre as sequências obtidas e sequências recuperadas do GenBank. A ocorrência de coronavírus foi de 2,95% (9/305) e a de rotavírus de 9,18% (28/305). De acordo com a análise filogenética do gene da RdRp oito amostras foram classificadas como alphacoronavirus. A análise do gene S dos CoV mostrou que as amostras deste estudo formaram uma linhagem única, segregadas das demais amostras de alphacoronavírus. Em relação aos rotavírus, foi possível a identificação de um genótipo G3-P[3]-IX-RX-CX-MX-AX-NX-T3-E3-H6, similar a encontrada em morcegos, equinos e humanos. Além disso, outra amostra foi classificada como G20, similar ao genótipo encontrado em humano, sendo que os genótipos encontrados para os genes VP4, NSP3 e NSP5 desse vírus podem ser classificados como novos genótipos. Os resultados obtidos mostram que esses animais podem carrear agentes infecciosos de importância na saúde pública, sendo que mais estudos são necessários para o esclarecimento do papel dos morcegos como reservatório e fonte de infecção destas zoonoses virais. / Several viral emerging and re-emerging diseases have been described in bats. Environmental changes caused by humans associated with the adaptation of bats to urban areas increase the chance of transmission of these infectious diseases to humans and domestic animals. Coronaviruses studies associated with bats have shown that these hosts act as reservoirs for these viruses, while rotaviruses has been poorly studied in these hosts. This study aimed to determine the occurrence of Rotavirus and Coronavirus in several species of bats from São Paulo State, Brazil, and to perform phylogenetic inferences from Coronavirus RdRp and S genes, as well as from Rotavirus structural and non-structural proteins genes. To this end, RT-PCR followed by DNA sequencing was used. Optimization criterion of distance and identities calculation of the nucleotides and amino acids among the obtained sequences and sequences retrieved from the GenBank were used for phylogenetic and molecular diversity analysis. The occurrence of Coronavirus was 2.95% (9/305) and of Rotavirus was 9.18% (28/305). According to phylogenetic analysis of the RdRp gene, eight strains were classified as Alphacoronavirus. The analysis of the CoV S gene showed that the starins of this study formed a single lineage, segregated from other alphacoronaviruses lineages. Regarding Rotavirus, it was possible to identify the genotype G3-P [3] -IX-RX-CX-MX-AX-NX-T3-E3-H6, similar to that reported in bats, horses and humans. In addition, another strain was classified as G20, similar to the genotype described in humans, while the genotypes found for VP4, NSP3 and NSP5 genes may be classified as new genotypes. These results show that bats may carry infectious agents of public health interest, but further studies are necessary to clarify the role of these animals as reservoirs and infectious sources of these viral zoonoses.

Orientador: Simone Baldini Lucheis / Banca: Katia Denise Saraiva Bresciani / Banca: Newton Goulart Madeira / Resumo: Leishmania infantum (syn. L. chagasi) é o agente causador da Leishmaniose Visceral (LV) no Novo Mundo, com áreas endêmicas que se estendem do Sul dos EUA ao norte da Argentina. As leishmanioses assumem grande importância em saúde pública por sua natureza zoonótica e, atualmente, vêm apresentando crescente disseminação nas diferentes regiões do Brasil, em especial no Estado de São Paulo. No Brasil, a Leishmaniose Tegumentar (LT) tem sido assinalada em praticamente todos os Estados e vem crescendo progressivamente nos últimos 20 anos, ocorrendo surtos em todas as regiões do país. Apesar dos registros de ocorrências de infecções esporádicas de leishmaniose felina (LF), são necessários mais estudos para se considerar os felinos como reservatórios importantes nas leishmanioses. Estes animais quase não apresentam sinais clínicos, mesmo estando infectados, constituindo-se em importantes fontes de infecção para outros animais domésticos, o homem ou vice-versa. Coletaram-se amostras de sangue de 50 gatos procedentes do Bosque Municipal de Marília, área de grande concentração de transeuntes e já detectado flebotomíneos no local. Armadilhas do tipo CDC luminosas foram instaladas em dez diferentes pontos do bosque, nos meses de julho a dezembro/2012, tendo-se capturado um total de quatro espécies de Lutzomyia longipalpis (Lu. longipalpis) sendo dois machos e duas fêmeas e quatro espécies fêmeas do gênero Brumptomyia spp. A análise parasitológica do conteúdo intestinal das duas fêmeas da espécie Lu. longipalpis foi negativa. Realizou-se a prova de Reação de Imunofluorescência Indireta (RIFI) para Leishmania infantum, tendo-se quatro (8%) animais reagentes. Todos os animais foram não reagentes à prova de RIFI para Leishmania(Viannia) braziliensis. Em relação ao teste de ELISA indireto para Leishmania infantum, 42% dos animais (21/50) foram reagentes. Para L. braziliensis, 18% dos animais (9/50) foram reagentes ... / Abstract: Leishmania infantum (syn. L. chagasi) is the causative agent of visceral leishmaniasis (VL) in the New World, with endemic areas that spreads from the south of United States until the north of Argentina. Leishmaniasis represents a great importance in public health due to the zoonotic nature, and currently have been presented a great dissemination in different regions of Brazil, specially in Sao Paulo State. In Brazil, cutaneous leishmaniasis has been occurred in almost all States, and have been growing up progressively in the last twenty years, occurring outbreaks in all regions of the country. Even though the sporadic reports of feline leishmaniasis, more studies are necessary to consider cats as the great importance as reservoirs in the feline leishmaniasis. These animals almost do not represent any clinical symptoms, even infected, representing important source of infection to another domestic animals, humans and vice-versa. Blood samples were collected from fifty cats habiting the Municipal Grove from Marília-SP, an area with high number of visitors and already detected sandflies. Traps CDC were installed in ten different points of the Municipal Grove from Marília-SP, since July to December/2012. Four specimens of Lutzomyia longipalpis (Lu. longipalpis) were captured (two males and two females) and four females specimens of the Brumptomyia genre. The parasitological analysis of gut contents of two females of Lu. longipalpis was negative. The Immunofluorescence Antibody Test (IFAT) for Leishmania infantum was performed, resulting in four (8%) reagent animals. All cats were non-reagent to Leishmania braziliensis by IFAT. Regarding to Indirect Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) test for Leishmania infantum, 42% of the animals (21/50) were reagent. For L. braziliensis, 18% of the animals (9/50) were reagent to ELISA test. The Polimerase Chain Reaction (PCR) for Leishmania infantum and for Leishmania braziliensis from ... / Mestre

A Leishmaniose é uma doença parasitária que se apresenta sob várias formas clínicas, desdês a mucocutânea até a visceral que é a forma mais grave da doença. Essa, é causada por um parasita flagelado do gênero Leishmania e apresenta um ciclo de vida heteróxeno, envolvendo o repasto sanguíneo da fêmea de flebotomíneo em animais silvestres e domésticos, como os cães, bem como no homem. Até o momento, o controle da Leishmaniose Visceral (LV) está associado a eliminação de reservatório infectado (cães), porém, isso requer métodos de diagnósticos confiáveis. Nesse estudo, foi utilizado a PCR diagnóstica a partir das sequências spliced leader de RNA (mini-exon) e ensaio Imunohisquímico, utilizando leishmanias spp. marcadas com anticorpos policlonais de biópsias embebidas em parafina. Além disso, utilizamos dados epidemiológicos de Leishmaniose canina e humana do município de Porto Nacional e do Estado Tocantins. Todos os fragmentos de fígado, baço e linfonodo apresentaram amplificação para L. infantum chagasi e nenhuma para L. braziliensis e L. amazonensis. Ao comparar a IHQ em relação a PCR, mostrou-se haver fraca replicabilidade, com P-valor obtido (0,0077), portanto p<0,05, denotando não haver concordâncias entre os dois testes. Quanto aos dados epidemiológicos de Porto Nacional, eles indicaram uma queda significativa do número de cães com Leishmaniose Visceral no ano de 2011 em relação a 2010, no entanto, esse número aumentou gradativamente, alcançando os índices de 2011 no ano de 2014. Para os casos humanos, os anos de 2010 e 2011 foram os anos com maiores registros, apresentando um declínio significativo a partir desse período. No comparativo entre casos humanos e caninos, verifica-se que enquanto os casos humanos apresentaram-se em queda a partir de 2011, os casos caninos vêm aumentando chegando a registrar-se maiores que os humanos a partir de 2012. / Leishmaniasis is a parasitic disease that presents various clinical forms, from mucocutaneous to visceral, which is the most severe form of the disease. It is caused by a flagellate parasite of the genus Leishmania and presents a heteroxenic life cycle, involving blood feeding of the female sand flies in wild and domestic animals, such as dogs, as well as in humans. So far, control of Visceral Leishmaniasis (LV) is associated with the elimination of infected reservoir (dogs), however, this requires reliable diagnostic methods. In this study, the diagnostic PCR based on the spliced leader sequences of RNA (mini-exon) and Immunohischemistry, using leishmanias spp. labeled with paraffin embedded biopsy polyclonal antibodies were used. In addition, we used epidemiological data on canine and human Leishmaniasis in the municipality of Porto Nacional and the state of Tocantins. All fragments of liver, spleen and lymph node showed amplification for L. infantum chagasi and none for L. braziliensis or L. amazonensis. When comparing IHC with respect to PCR, there was a low replicability, with a P-value of 0.0077, therefore p <0.05, denoting that there were no concordances between the two tests. Regarding epidemiological data from Porto Nacional, they indicated a significant decrease in the number of dogs with Visceral Leishmaniasis in 2011 compared to 2010, however, this number increased gradually, reaching the indexes of 2011 in 2014. For human cases, the years 2010 and 2011 were the years with the highest records, showing a significant decline from that period. In the comparison between human and canine cases, it is verified that while human cases have fallen since 2011, canine cases have been increasing and have become larger than humans since 2012.

Submitted by PAULO EDUARDO CARRARO null (ducarrarovet@hotmail.com) on 2016-04-11T19:18:57Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_Paulo_Eduardo_Carraro.pdf: 1129054 bytes, checksum: 9de48e07b97a3734d728f66c385e66e5 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-04-13T13:21:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 carraro_pe_me_jabo.pdf: 1129054 bytes, checksum: 9de48e07b97a3734d728f66c385e66e5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-13T13:21:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 carraro_pe_me_jabo.pdf: 1129054 bytes, checksum: 9de48e07b97a3734d728f66c385e66e5 (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O Programa Nacional de Controle e Erradicação da Brucelose e Tuberculose normatiza a certificação de propriedades livres para diminuir o impacto negativo dessas zoonoses na saúde humana e animal, além de promover a competitividade dos produtos no mercado internacional. Assim, o objetivo do trabalho foi analisar as atividades ao longo do processo de saneamento para a obtenção da certificação e renovação. Os municípios onde estão localizadas as propriedades foram geoprocessados no mapa do circuito pecuário do Estado de São Paulo. Foi utilizado um questionário semiestruturado com questões relativas ao perfil das propriedades (características do proprietário e da propriedade, caracterização da produção e perguntas relacionadas à saúde humana, animal e ambiental) e abordando o processo de saneamento ao longo da certificação e renovação. A análise de correspondência foi feita no software Statistic 7.0. Os proprietários têm em média 63,3 anos de idade, 92% (13/14) possuem nível superior, as propriedades certificadas possuem, em sua maioria, capacidade média (entre 300 e 900 litros) ou grande (maior que 900 litros) de produção diária de leite, os rebanhos com 90 a 499 animais foram os mais frequentes, praticam atividade comercial frequentemente, possuem veterinário responsável pelo menos uma vez ao mês. As propriedades certificadas não estão distribuídas de maneira homogênea no Estado. Elas encontraram dificuldades para obter a certificação e renovação, uma vez que mesmo estando certificadas livres das doenças houve infecção no rebanho, evidenciando a complexidade em combater as enfermidades e necessidade de mais ações conjuntas. Não houve correspondência (p= 0,9973) entre as variáveis da produção e do saneamento. Apenas os circuitos pecuários 1 e 6 não possuem propriedade certificada. O Estado de São Paulo tem poucas propriedades certificadas livres de brucelose e tuberculose, necessitando de maior adesão dos produtores de leite no programa estadual, de maior divulgação do mesmo, da readequação das normas referentes às atividades para obter a certificação, da intensificação da educação sanitária para os produtores de leite, sobretudo, para os pequenos produtores, em todos os circuitos pecuários; de maiores incentivos do setor privado (indústrias) para adesão voluntária ao PECEBT e fiscalização de propriedades produtoras de leite que comercializam o produto, mas não possuem o certificado de livre de brucelose e tuberculose. / The National Program for Control and Eradication of Brucellosis and Tuberculosis acts aiming the certification of free properties to reduce the negative impact of zoonoses on human and animal health, and promote the competitiveness of products in the international market. The objective of the study was to analyze the activities during the sanitation process for obtaining certification and renewal. Municipalities that contains the properties were geoprocessed map of the livestock circuit of São Paulo. It used one semi-structured questionnaire with questions regarding the profile of properties (owner characteristics and property characterization of production and questions related to human, animal and environmental health) and by addressing the sanitation process throughout the certification and renewal. Correspondence analysis was made on the Statistic 7.0 software. The owners have on average 63.3 years old, 92% (13/14) have a university degree, certified farms have, in most cases, the average milk production (between 300 and 900 liters) to large (greater than 900 liters ), three farms have cattle younger than 50 animals, practicing commercial activity often have veterinarian responsible at least once a month. Certified farms are not distributed in homogeneous way in the State. The properties found it difficult to obtain certification and renewal, although, being certified free of disease, the infection occurred in the herd, highlighting the complexity of combat disease and in need of more joint actions. The variables studied showed no correspondence (p = 0,9973). Only the livestock circuits 1 and 6 do not have certified property. The State of São Paulo has few free certified properties of brucellosis and tuberculosis, requiring greater adhesion of milk producers in the state program of greater disclosure thereof, the readjustment of the rules pertaining to the activities to obtain certification, the intensification of health education for dairy farmers, especially for small producing, in all livestock circuits; greater incentives of the private sector (industries) for voluntary adherence to PECEBT and surveillance of producing properties of milk that sell the product, but do not have the certificate free of brucellosis and tuberculosis.

Orientador: Valeria Marçal Felix de Lima / Banca: Maria cecilia Rui Luvizotto / Banca: Rosemeri de Oliveira Vasconcelos / Resumo: Leishmania são protozoários intracelulares obrigatórios que infectam células fagocitárias de mamíferos ocasionando a leishmaniose visceral canina (LVC). Por apresentarem um intenso parasitismo cutâneo, os cães infectados possuem papel chave na transmissão da doença. Para sobreviver no hospedeiro, as leishmanias são capazes de desenvolver mecanismos de escape por alterações das respostas de células fagocitárias, tais como o NO e o ROS responsáveis pela morte intracelular do parasita. A HO-1 também pode estar envolvida na regulação da resposta imune, porém seu papel na leishmaniose visceral canina ainda não está claro. A produção excessiva de NO, ROS e HO-1 pode ser prejudicial e estar relacionada com a apoptose e desregulação imunológica na LVC. Assim o este estudo teve a finalidade de investigar os níveis de ROS, NO e atividade HO-1 em células mononucleares do sangue periférico e leucócitos do baço e sua correlação com a apoptose celular. Para isso foram utilizadas células mononucleares sanguíneas e leucócitos de baço de cães infectados e saudáveis. As células foram isoladas e cultivadas durante 24 horas, na sequencia foram incubadas com sondas para NO ou ROS e foi determinada a apoptose celular. Todos as análises foram realizadas por citômetria de fluxo. Após a lise das células em cultura, a atividade HO-1 foi determinada no lisado celular por método colorimétrico. O metabolismo oxidativo estava reduzido e a taxa de apoptose dos mononucleares sanguíneos aumentada, por influê... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Leishmania are obligate intracellular protozoan that infects phagocytic mammalian cells causing canine visceral leishmaniasis (CVL). Because they have an intense cutaneous parasitism, infected dogs have key role in disease transmission. To survive in the host, the Leishmania are able to develop escape mechanisms by changes in phagocytic cell responses, such as the NO and the ROS responsible for the death of intracellular parasites. The HO-1 may also be involved in regulating the immune response, but their role in canine visceral leishmaniasis is not yet clear. The excessive production of NO, ROS and HO-1 can be detrimental and to be related to immune dysregulation and apoptosis in LVC. So this study aimed to investigate the levels of ROS, NO and HO-1 activity in mononuclear cells of peripheral blood leukocytes and spleen and its correlation with cell apoptosis. For this they used blood mononuclear cells and spleen leukocytes from infected and healthy dogs. Cells were isolated and cultured for 24 hours following probes were incubated with NO or ROS and cell apoptosis was determined. All analyzes were performed by flow cytometry. After lysis of the cells in culture, HO-1 activity in cell lysate was determined by a colorimetric method. Oxidative metabolism was reduced and the apoptosis rate of increased blood mononuclear, influenced by ROS. The levels of ROS and NO were decreased in leukocytes from the spleen of infected dogs, and increased apoptotic rate was observed in spleen ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Márcia Marinho / Banca: Sandra de Moraes Gimenes Bosco / Banca: Luzia Helena Queiroz / Resumo: Os morcegos são hospedeiros de uma rica diversidade de microrganismos. Muitos trabalhos apontam uma estreita ligação entre os quirópteros e fungos com potencial patogênico, principalmente por habitar ambientes como cavernas, grutas e ocos de árvores, favoráveis, à manutenção e propagação dos fungos. O seguinte trabalho teve como objetivo estudar a microbiota fúngica gastrintestinal de morcegos capturados vivos ou cedidos pelos Laboratórios de Chiroptera e de Raiva do Departamento de Apoio e Produção Animal da Unesp de Araçatuba. Para o cultivo micológico foi utilizado macerados de baço, fígado, intestinos e fezes e inoculados em tubos contendo ágar Sabouraud com cloranfenicol e BHI incubados a temperaturas de 25º e 37º C, respectivamente por um período não inferior a 10 dias.Os cultivos com características de leveduras foram submetidos à coloração com tinta Nanquim, à hidrólise da uréia, termotolerância e fenoloxidase, enquanto que os miceliais foram identificados de acordo com características morfológicas e tintoriais. A PCR foi utilizada para a identificação de espécie com potencial patogênico. Das 98 amostras pertencentes a 11 espécies de morcegos procedentes de 15 cidades estudadas, 20% são da espécie Carollia perspicillata, seguidas de 19%, Artibeus lituratus, 17%, Molossus rufus, 13%, Glossophga soricina, 9%, Nyctinomops macrotis, 8%, Molossus molossus, 7%, Desmodus rotundus, 2%, Lasiurus ega, e 1% de Eptesicus furinalis, Myotis nigricans e Tadarida brasiliensis. De acordo com a dieta houve predomínio de espécies frugívoras (40%) e insetívoras (40%), seguidas de nectarívoras (13%) e sanguívoras (7%). De acordo com a procedência dos morcegos destaca-se a cidade de Guararapes com 28% das amostras, seguida por Araçatuba (23%), Mirandópolis (16%), Penápolis (7%), Andradina (6%), Ilha Solteira (5%), Birigui (4%)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Bats are hosts of a rich diversity of microorganisms. Many studies indicate a close link between bats and fungi with pathogenic potential, especially for living in environments such as caves, grottoes and hollow trees, favorable to the maintenance and spread of fungi. The present research aimed to study the gastrointestinal mycoflora of bats captured alive or provided by Laboratório de Chiroptera and Laboratório de Raiva from Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Produção Animal of UNESP - Araçatuba. For the mycological culture was used macerated spleen, liver, intestines and feces and inoculated into tubes containing Sabouraud agar and BHI with chloramphenicol and incubated at 25 º C and 37 º C, respectively for a period not less than 10 days. The crops with yeastlike characteristics were stained with Indian ink, tested for hydrolysis of urea, phenoloxidase and thermotolerance, whereas mycelial were identified according to morphological characteristics and staining. PCR was used to identify species with pathogenic potential. Of the 98 samples belonging to 11 species of bats coming from 15 cities studied, 20% of the species were Carollia perspicillata, followed by 19%, Artibeus lituratus, 17%, Molossus rufus, 13%, Glossophga soricina, 9%, Nyctinomops macrotis, 8%, Molossus molossus, 7%, Desmodus rotundus, 2%, Lasiurus ega, and 1% Eptesicus furinalis, Myotis nigricans and Tadarida brasiliensis. Regarding the diet there was a greater predominance of frugivorous (40%) and insectivorous (40%) species followed by nectarivore (13%) and sanguivorous (7%). Regarding the origin of bats stands the city of Guararapes with 28% of samples, followed by Araçatuba (23%), Mirandópolis (16%), Penápolis (7%), Andradina (6%), Ilha Solteira (5 %), Birigui (4%), Pereira Barreto and Coroados (2%) each and Auriflama, Barbosa, Bilac, Brauna, Brejo Alegre Castilho 1% of samples each... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Silmara Marques Allegretti / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-14T06:53:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Presotto_Douglas_M.pdf: 2909601 bytes, checksum: e84648e96ca5cedc35dc57d264d439bd (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Endoparasitoses em cães produzidas por nematódeos das Famílias Toxocaridae, Trichuridae, Onchocercidae, Ancylostomatidae, Strongyloididae e por cestódeos da família Dilepididae são uma ocorrência freqüente na clínica veterinária, além de se constituírem em infecções zoonóticas prevalentes em áreas urbanas; as produzidas por protozoários dos gêneros Cystoisospora e Giardia, também tem adquirido grande importância para a saúde humana e animal. O convívio estreito entre homens e cães, aliado ao crescimento dessa população nos centros urbanos, tem feito de algumas dessas endoparasitoses um importante problema de Saúde Pública. Assim, o conhecimento de sua prevalência constituiu-se em importante instrumento de prevenção e controle. Este presente estudo objetivou determinar a prevalência dessas infecções em cães do município de Hortolândia, situado no Estado de São Paulo, bem como avaliar o risco à saúde para a população humana; amostras de fezes (n = 250), sangue (n = 66) e material de necropsias (n = 50) foram coletadas e examinadas no período compreendido entre os anos de 2006 e 2008. As amostras foram obtidas a partir de cães sem controle (errantes), adultos (a partir de um ano de idade), recolhidos e mantidos nas dependências do Centro de Controle de Zoonoses (CCZ) e avaliadas pelos métodos parasitológicos tradicionais para pesquisa de helmintos e protozoários. As necropsias foram realizadas em animais submetidos à eutanásia, após avaliação veterinária. A prevalência geral de endoparasitos neste estudo foi de 87,2% em amostras fecais e de 100% em necropsias. Nas amostras fecais os parasitos observados foram: Ancylostoma sp. (79,2%), Giardia duodenalis (20,0%), Toxocara sp. (16,8%), Cystoisospora sp. (16,4%), Trichuris vulpis (11,6%), Dipylidium caninum (1,6%) e Toxascaris leonina (1,2%). Nas necropsias, Ancylostoma caninum (72,0%), Dipylidium caninum (64,0%), Toxocara canis (44,0%), Cystoisospora sp. (30,0% em material fecal de necropsia), Trichuris vulpis (20,0%) e Toxascaris leonina (2,0% em material fecal de necropsia). Houve diferença estatisticamente significativa em relação ao sexo para os nematódeos Toxocara spp., com maior ocorrência nos machos (p = 0,0137) e Trichuris vulpis, com maior ocorrência nas fêmeas (p = 0,0015). Houve diferença estatisticamente significativa em relação à estação do ano para os nematódeos Ancylostoma spp., com menor ocorrência na primavera (p = 0,0001) e Trichuris vulpis, com maior ocorrência no inverno (p = 0,0039). Os resultados demonstraram altas prevalências dessas infecções parasitárias em cães adultos, com idades variáveis, a partir de um ano, até animais senis, e também em animais imunossuprimidos, devido às condições adversas à que estavam submetidos (abandono, maus-tratos, desnutrição e doenças concomitantes); os resultados sugerem também um alto grau de contaminação ambiental e, conseqüentemente, o risco à saúde humana (diretamente, pelo contato com esses ambientes e indiretamente, pela exposição a que podem ficar submetidos os cães domiciliados, quando em contato com esses ambientes ou com cães de rua). / Abstract: Parasitic diseases in dogs, produced by nematodes (families Toxocaridae, Trichuridae, Onchocercidae, Ancylostomatidae and Strongyloididae) and cestodes (family Dilepididae), are a frequent occurrence in the clinical veterinary medicine. These helmintic diseases are important zoonotic infections, prevalent in urban areas; infectious diseases caused by protozoans (genus Cystoisospora and Giardia), also have acquired great importance for the animal and humam health. The close relationship between men and dogs, and the growth of canine population in the urban areas, has made some of these parasitic infections an important problem of Public Health. Thus, the knowledge of its prevalence is an important way of prevention and control. This present work purposed to determine the prevalence of these infections in dogs from the city of Hortolândia (Brazil), as well as evaluate the risk to the human health; feces samples (n = 250), blood samples (n = 66) and samples from necropsies (n = 50) were collected and examined in the understood period between the years of 2006 and 2008. These samples came from stray dogs (uncontrolled), adults (from one year of age), captured and kept in the dependences of the Center of Zoonoses Control (CCZ) and evaluated by the traditional methods of laboratory for diagnosis of helminths and protozoans. The necropsies had been done in animals submitted to the euthanasia, after veterinary evaluation. The overall prevalence of endoparasites in this work was 87,2% in feces samples and 100% in necropsies. The parasites observed in feces samples were Ancylostoma sp. (79,2%), Giardia duodenalis (20,0%), Toxocara sp. (16,8%), Cystoisospora sp. (16,4%), Trichuris vulpis (11,6%), Dipylidium caninum (1,6%) and Toxascaris leonina (1,2%). The parasites observed in necropsies were Ancylostoma caninum (72,0%), Dipylidium caninum (64,0%), Toxocara canis (44,0%), Cystoisospora sp. (30,0% in necropsy's feces samples), Trichuris vulpis (20,0%) e Toxascaris leonina (2,0% in necropsy's feces samples). There was statistically significant difference between gender for the nematodes Toxocara spp., with higher prevalence in males (p = 0,0137) and Trichuris vulpis, with higher prevalence in females (p = 0,0015). There was statistically significant difference between seasons for the nematodes Ancylostoma spp., with less prevalence in spring (p = 0,0001) and Trichuris vulpis, with higher prevalence in winter (p = 0,0039). The data demonstrated the high prevalence of these parasitic infections in adult dogs, with changeable ages, from one year, until senile animals, mainly in animals under adverse life conditions (abandonment, malnutrition, illnesses); they also suggest the high degree of environmental contamination and, consequently, the risk to the human health (directly, by the contact with these environments and indirectly, by the exposition of the domiciliated dogs, when in contact with these environments or stray dogs). / Mestrado / Mestre em Parasitologia

Diversas doenças virais emergentes e re-emergentes têm sido descritas em morcegos. As alterações ambientais provocadas por seres humanos associada a adaptação dos morcegos às áreas urbanas aumentam as chances da transmissão dessas doenças para humanos e animais domésticos. O estudo das coronaviroses associadas a esse hospedeiro tem evidenciado que os morcegos atuam como reservatório dessa doença, enquanto o estudo das rotaviroses ainda foi pouco explorado. Este estudo tem como objetivo verificar a ocorrência de coronavírus e rotavírus em diversas espécies de morcegos do Estado de São Paulo, Brasil, e realizar inferências filogenéticas a partir dos genes RdRp e S dos coronavírus, assim como de genes de proteínas estruturais e não estruturais dos rotavírus. Para tanto, foi utilizada a RT-PCR seguida de sequenciamento de DNA. Para análise filogenética e de diversidade molecular foi utilizado critério de otimização de distância e cálculo das identidades de nucleotídeos e aminoácidos entre as sequências obtidas e sequências recuperadas do GenBank. A ocorrência de coronavírus foi de 2,95% (9/305) e a de rotavírus de 9,18% (28/305). De acordo com a análise filogenética do gene da RdRp oito amostras foram classificadas como alphacoronavirus. A análise do gene S dos CoV mostrou que as amostras deste estudo formaram uma linhagem única, segregadas das demais amostras de alphacoronavírus. Em relação aos rotavírus, foi possível a identificação de um genótipo G3-P[3]-IX-RX-CX-MX-AX-NX-T3-E3-H6, similar a encontrada em morcegos, equinos e humanos. Além disso, outra amostra foi classificada como G20, similar ao genótipo encontrado em humano, sendo que os genótipos encontrados para os genes VP4, NSP3 e NSP5 desse vírus podem ser classificados como novos genótipos. Os resultados obtidos mostram que esses animais podem carrear agentes infecciosos de importância na saúde pública, sendo que mais estudos são necessários para o esclarecimento do papel dos morcegos como reservatório e fonte de infecção destas zoonoses virais. / Several viral emerging and re-emerging diseases have been described in bats. Environmental changes caused by humans associated with the adaptation of bats to urban areas increase the chance of transmission of these infectious diseases to humans and domestic animals. Coronaviruses studies associated with bats have shown that these hosts act as reservoirs for these viruses, while rotaviruses has been poorly studied in these hosts. This study aimed to determine the occurrence of Rotavirus and Coronavirus in several species of bats from São Paulo State, Brazil, and to perform phylogenetic inferences from Coronavirus RdRp and S genes, as well as from Rotavirus structural and non-structural proteins genes. To this end, RT-PCR followed by DNA sequencing was used. Optimization criterion of distance and identities calculation of the nucleotides and amino acids among the obtained sequences and sequences retrieved from the GenBank were used for phylogenetic and molecular diversity analysis. The occurrence of Coronavirus was 2.95% (9/305) and of Rotavirus was 9.18% (28/305). According to phylogenetic analysis of the RdRp gene, eight strains were classified as Alphacoronavirus. The analysis of the CoV S gene showed that the starins of this study formed a single lineage, segregated from other alphacoronaviruses lineages. Regarding Rotavirus, it was possible to identify the genotype G3-P [3] -IX-RX-CX-MX-AX-NX-T3-E3-H6, similar to that reported in bats, horses and humans. In addition, another strain was classified as G20, similar to the genotype described in humans, while the genotypes found for VP4, NSP3 and NSP5 genes may be classified as new genotypes. These results show that bats may carry infectious agents of public health interest, but further studies are necessary to clarify the role of these animals as reservoirs and infectious sources of these viral zoonoses.

Les communautés cries de la Baie-James sont restées attachées à leurs pratiques traditionnelles. De ce fait, elles sont, encore aujourd'hui, en contact étroit avec la faune et théoriquement, plus à risque de contracter des zoonoses. Neuf infections zoonotiques ont été investiguées à partir des sérums de 267 participants à Chisasibi (166) et Waskaganish (101) en 2008. Ces personnes ont aussi répondu à un questionnaire documentant leurs caractéristiques sociodémographiques et leurs activités de chasse et de trappe. Des taux de séroprévalence plus élevés pour Leptospira sp. (23%), Francisella tularensis (18%), le virus Jamestown Canyon (17%) et Toxoplasma gondii (9%) ont été documentés. Une séroprévalence inférieure à 5% a été obtenue pour C. burnetii, E. granulosus, T. canis, ainsi que le virus Snow Shoe Hare. Par ailleurs, aucune sérologie positive pour Trichinella sp. n'a pu être détectée chez les participants des deux communautés. Les séroprévalences des infections par Leptospira sp. et T. gondii étaient plus élevées à Chisasibi qu'à Waskaganish, alors que celles pour T. canis et le virus Jamestown Canyon étaient plus élevées à Waskaganish qu'à Chisasibi. Certaines variables en lien avec la faune ont été associées statistiquement à l'exposition à divers pathogènes. On a noté une relation entre la manipulation de lièvres et une sérologie positive pour Leptospira sp., alors que l'absence de port de gants lors de la manipulation des animaux a été associée à l'exposition au virus Jamestown Canyon. Des tendances statistiques ont également été détectées concernant la relation entre la manipulation de canards et l'exposition à Toxoplasma gondii, ainsi qu'entre l'absence de port de gants lors de la manipulation des animaux et le fait d'avoir des activités de chasse et de trappe au printemps et une sérologie positive pour Leptospira sp. respectivement à Chisasibi et Waskaganish. L'examen des dossiers médicaux n'a pas révélé de problèmes de santé importants liés aux maladies zoonotiques. Néanmoins, une proportion importante de la population a été exposée à certains pathogènes, en particulier au virus Jamestown Canyon et aux bactéries Leptospira sp. et F. tularensis.

Slaughterhouses are places where animals are slaughtered for food. In developing countries a lack of appropriate facilities and limited resources mean the slaughter industry is poorly regulated. Poor hygiene practices in slaughterhouses can result in the transmission of diseases from animals to people called zoonoses. Slaughterhouse workers are generally considered at increased risk of being exposed to such diseases due to their close contact with animals and animal products. The aims of this study were: to assess the current conditions in slaughterhouses and the knowledge, attitudes and practices of workers in ruminant and pig slaughterhouses in western Kenya; to determine the exposure of slaughterhouse workers to different zoonotic pathogens; to investigate the risk factors associated with exposure to these pathogens and to quantify the risk of zoonotic disease exposure for slaughterhouse workers compared to the general population. Slaughterhouses in western Kenya were visited between May 2011 and October 2012. Seven hundred and thirty-eight workers were recruited from 142 slaughterhouses. Overall, the slaughterhouses lacked facilities, with 65% (95% CI 63–67%) of slaughterhouses having a roof, cement floor and solid sides, 60% (95% CI 57–62%) had a toilet and 20% (95% CI 18–22%) hand-washing facilities. Less than half of workers 32% (95% CI 29–34%) wore personal protective clothing. Antemortem inspection was practiced at 7% (95% CI 6–8%) of slaughterhouses and 18% (95% CI 16–19%) of workers reported slaughtering sick animals. Slaughterhouse workers were screened for five zoonotic diseases. The unadjusted seroprevalence of the zoonotic diseases were: brucellosis 0.1% (95% CI 0.007– 0.8%); leptospirosis 13.4% (95% CI 11.1–16.1%); Q fever 4.5% (95% CI 3.2–6.2%); Rift Valley fever (RVF) 1.2% (95% CI 0.6–2.3%); taeniasis 1.8% (95% CI 1.0– 3.0%); and cysticercosis 2.6% (95% CI 1.7–4.0%). Risk factors for leptospirosis and Q fever were examined by multivariable logistic regression. Risk factors associated with leptospirosis seropositivity included: having wounds (OR 2.7; 95% CI 1.4–5.3); smoking at work (OR 1.8; 95% CI 1.1–3.0); eating at work (OR 2.1; 95% CI 1.2–3.6); and cleaning the intestines (OR 3.8; 95% CI 1.8–8.2). Protective factors were: working at a slaughterhouse where antemortem inspection was performed (OR 0.6; 95% CI 0.4–0.9). The risk factors significantly associated with Q fever seropositivity included: being intoxicated at work (OR 3.2; 95% CI 1.1–9.4). The odds ratio for leptospirosis seropositivity in slaughterhouse workers was determined to be 2.3 (95% CI 1.6–3.4) times that of the community. For Q fever the odds ratio for seropositivity in slaughterhouse workers was 1.9 (95% CI 1.0–3.8) times that of the community. This is the first report of a range of zoonotic pathogens in slaughterhouse workers in Kenya. This study indicated the potential risk factors for zoonotic disease exposure in slaughterhouses. The current working conditions in slaughterhouses in western Kenya are far below the recommended standard. Improvements need to be made to facilities and practices in all slaughterhouses. Training is recommended to improve awareness for workers, managers and inspectors of the risks of zoonotic disease exposure and methods to reduce it.