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CENTRALIDADE DA CAMINHADA ALEATÓRIA EM REDES COMPLEXASBenicio, Marily Aparecida 09 April 2013 (has links)
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Marily Aparecida Benicio.pdf: 2662358 bytes, checksum: ba11ae50b21bd9be5feba0d2bf5fd563 (MD5)
Previous issue date: 2013-04-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Studies of complex networks help us to understand and model many real world situations. The world abounds in networks that can be found in many real contexts. The term network
refers to relations between two sets and can be represented by means of graph theory. The classification of complex networks is given according to the models created to represent them, such as Random networks, networks of Small World, No Scaling networks and hierarchical networks. From the perspective of complex networks, a study which make
significant contributions analysis is the phenomenon of diffusion of information in networks, which can be understood through the random walk process, which is characterized by a stochastic used as a mechanism transportation and research in complex networks. A random walk in complex networks can be used to check the behavior of each network model front dissipation. Each network model presents a different behavior with respect to the number of random walkers that pass through the network node over time. The number of walkers will depend on the structure of the networks generated by each model and measures of centrality of each node. Measures of centrality of the vertices of the network are useful for comparing the efficienc of the nodes with respect to receiving and sending information being indicative of the rapidity with which this transport happens. The objective of this work is to study the process of random walk and use it to analyze the efficiency of Centrality measures, inferring the number of random walkers who pass by us in complex networks. Measures of centrality are analyzed centralities Degree, Centrality Intermediation by Minor Roads, Centralization of Random Walk. To compare the efficiency of these measures of centrality in the different network models, numerical simulations were performed. With these, it was noticed that the behavior of the diffusion of walkers varies for each network model. Random network for the flow of walkers from the evenly is not possible to highlight some vertex of utmost importance within the network. It can be observed that the measure of centrality of Random Walk is the one that showed greater efficiency by pointing a greater flow of walkers to the vertices that had a higher value for this measure. / Os estudos sobre redes complexas nos auxiliam a compreender e modelar muitas situações do mundo real. O mundo é abundante em redes que podem ser encontradas em diversos contextos reais. O termo redes faz referência às relações estabelecidas entre dois conjuntos e podem ser representadas por meio da teoria de grafos. A classificação das redes complexas se dá de acordo com os modelos criados para representá-las, tais como as redes Aleatórias, redes de Pequeno Mundo, redes Sem Escala e redes Hierárquicas. Dentro da perspectiva de redes complexas, um estudo que pode trazer contribuições importantes é análise do fenômeno de difusão de informação em redes, os quais podem ser entendidos através do processo da caminhada aleatória, a qual se caracteriza por ser um processo estocástico utilizado como um mecanismo de transporte e pesquisa em redes complexas. A caminhada aleatória nas redes complexas pode ser utilizada para verificar o comportamento de cada modelo de rede frente à dissipação. Cada modelo de rede apresenta um comportamento diferente com relação ao número de caminhantes aleatórios que passam por nó da rede ao longo do tempo. Este número de caminhantes irá depender da estrutura das redes geradas por cada modelo e das medidas de Centralidade de cada nó. As medidas de centralidade dos vértices da rede são úteis para comparar a eficiência dos
nós com relação ao recebimento e envio de informações sendo indicativos da rapidez com a qual, este transporte acontece. O objetivo deste trabalho é estudar o processo da
caminhada aleatória e utilizá-la para analisar a eficiência das medidas de Centralidade, inferindo o número de caminhantes aleatórios que passam pelos nós nas redes complexas.
As medidas de centralidade analisadas são as centralidades do Grau, Centralidade de Intermediação por Menores Caminhos, Centralidade da Caminhada Aleatória. Para comparar a eficiência das referidas medidas de Centralidade nos diferentes modelos de redes, foram realizadas simulações numéricas. Com estas, percebeu-se que o comportamento da difusão de caminhantes varia para cada modelo de rede. Para a rede Aleatória o fluxo de caminhantes se da de maneira uniforme não sendo possível destacar algum vértice de maior importância dentro da rede. Pode-se observar que a medida de
Centralidade da Caminhada Aleatória é a que mostrou maior eficiência ao apontar o um maior fluxo de caminhantes aos vértices que possuíam um maior valor para essa medida.
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(Não-) monotonicidade em adsorção sequencial aleatória com um parâmetro de cooperação negativaRasteiro, Lillian Rossi January 2013 (has links)
Orientador: Thomas Logan Ritchie / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC. Programa de Pós-Graduação em Matemática, 2013
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Regressão aleatória na detecção de QTL para características de crescimento de suínos / Random regression to detect QTL for growth traits in swinePinheiro, Valéria Rosado 24 February 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-02-24 / Many studies are focused on the search for QTL(quantitative trait loci) that affects growth traits in swine, and almost all studies have found QTL with significant effects. However, most of these studies use information related to the body weight on specific ages or average weight gain. Thus, it becomes interesting to evaluate all the growth information with the focus on longitudinal data simultaneously. This study aims to use random regression models (RRM) in order to detect QTL (quantitative trait loci) for growth traits in swine from a population F2 Piau x Commercial. To this end, it was considered a RRM with random polygenic effects, permanent environment and QTL, being the covariance matrix associated with the latter known as IBD (identical-by-descent). The presence of a significant QTL was found by likelihood ratio test considering the model described above as being the complete and this same without the QTL effect as null model. Comparisons between these models were made at the positions of the markers (6 microsatellite markers) and at positions between markers. In the position with greater evidence of QTL effect was calculated the heritability and the genetic polygenic and QTL values for body weight throughout the growth period studied. The results showed a significant effect of QTL at position 65 of chromosome 7. / Muitos estudos são voltados para a busca de QTL (locos de características quantitativas) que afetam características de crescimento em suínos, sendo que a quase totalidade tem encontrado QTL com efeitos significativos. No entanto, a maioria destes estudos utiliza informações referentes a peso corporal em idades específicas ou ganho de peso médio. Dessa forma, torna-se interessante avaliar simultaneamente todas as informações de crescimento sob o enfoque de dados longitudinais. O presente trabalho tem como objetivo utilizar modelos de regressão aleatória (MRA) com o intuito de detectar QTL para características de crescimento em suínos de uma população F2 Piau x Comercial. Para tanto, considerou-se MRAs com efeitos aleatórios poligênico, de ambiente permanente e de QTL, sendo a matriz de covariância associada a este último denominada de IBD (identical-by-descent). A presença de um QTL com efeito significativo foi verificada mediante teste de razão de verossimilhanças considerando o modelo descrito como sendo o completo e o mesmo sem o efeito de QTL como sendo o modelo nulo. As comparações entre estes modelos foram realizadas nas posições dos marcadores (6 marcadores microssatélites) e nas posições entre marcadores. Na posição com maior evidência de efeito de QTL foi calculada a herdabilidade e os valores genéMany studies are focused on the search for QTL(quantitative trait loci) that affects growth traits in swine, and almost all studies have found QTL with significant effects. However, most of these studies use information related to the body weight on specific ages or average weight gain. Thus, it becomes interesting to evaluate all the growth information with the focus on longitudinal data simultaneously. This study aims to use random regression models (RRM) in order to detect QTL (quantitative trait loci) for growth traits in swine from a population F2 Piau x Commercial. To this end, it was considered a RRM with random polygenic effects, permanent environment and QTL, being the covariance matrix associated with the latter known as IBD (identical-by-descent). The presence of a significant QTL was found by likelihood ratio test considering the model described above as being the complete and this same without the QTL effect as null model. Comparisons between these models were made at the positions of the markers (6 microsatellite markers) and at positions between markers. In the position with greater evidence of QTL effect was calculated the heritability and the genetic polygenic and QTL values for body weight throughout the growth period studied. The results showed a significant effect of QTL at position 65 of chromosome 7.ticos poligênicos e de QTL para peso em todo o período de crescimento estudado. Os resultados mostraram um efeito significativo de QTL na posição 65 do cromossomo 7.
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Estresse térmico e a qualidade do leite em vacas da raça Holandesa: uma abordagem genômica / Heat stress and milk quality in Holtein cows: a genomic approachEula Regina Carrara 04 April 2018 (has links)
O estresse térmico causa prejuízos para a atividade leiteira. É possível selecionar animais para tolerância ao calor, uma vez que existe variação genética de características produtivas quando avaliadas em diferentes ambientes climáticos. Para uma correta avaliação genética em função de diferentes ambientes, a utilização de modelos que se ajustem aos dados é fundamental. Ao mesmo tempo, ferramentas genômicas podem auxiliar nos processos de avaliação e seleção genética para tolerância ao calor. Nesse contexto, foram desenvolvidos dois estudos. No primeiro, objetivou-se estudar as funções de variância de características de produção e qualidade do leite em relação a um índice de temperatura e umidade (THI), ajustadas por polinômios de Legendre de ordens dois a sete, avaliar qual função melhor se ajusta aos dados e compreender como os componentes de variância e os coeficientes de herdabilidade se comportam em função do THI. Para isso, foram utilizadas 74.470 informações de produção de leite (PROD, kg/dia), escore de células somáticas (ECS), porcentagens de gordura (GOR), proteína (PROT), lactose (LACT), caseína (CAS) e perfil de ácidos graxos (saturados - SAT; insaturados - INSAT; monoinsaturados - MONO; poli-insaturados - POLI; ácido palmítico - C16:0; ácido esteárico - C18:0; e ácido oléico - C18:1) de 5.224 vacas da raça Holandesa avaliadas por meio de modelos de regressão aleatória em 167 valores distintos do THI. À exceção de POLI, houve variação em todos os componentes de variância ao longo do THI para todas as características. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,07 a 0,43. Para PROD, GOR, LACT, ECS, SAT e C16:0, as estimativas de herdabilidade diminuíram com o aumento do THI e para CAS, MONO, INSAT e C18:1, aumentaram. Para PROT e C18:0 as estimativas de herdabilidade foram maiores em valores intermediários do THI e menores nos extremos. No segundo estudo, objetivou-se estimar o efeito de marcadores SNP (polimorfismos de nucleotídeo único) sobre as características PROD, CAS, ECS, SAT e INSAT e estimar o valor genético genômico (GEBV) considerando dois valores de THI, um representando o conforto térmico e outro o estresse térmico. Os valores genéticos dos animais para os dois ambientes foram usados como fenótipos nos estudos de associação genômica (GWAS). Foram utilizados genótipos de 1.157 vacas para 60.671 marcadores SNP. Para as análises genômicas, foram utilizadas somente vacas com fenótipo e genótipo. Foi utilizado o método GBLUP (melhor predição linear não-viesada genômica) sob abordagem bicaracterística para realizar o GWAS. Com objetivo de comparar os ambientes, foram considerados os 55 SNP de maior variância aditiva explicada para cada situação e 10% dos animais com maiores valores genéticos genômicos. Em geral, os SNP apresentaram poucas diferenças em suas variâncias aditivas explicadas quando comparados em ambiente de conforto e estresse térmico. Com relação aos valores genéticos genômicos, houve reclassificação dos animais para PROD (correlações 0,90 e 0,90), CAS (correlações 0,88 e 0,86), SAT (correlações 0,88 e 0,87) e INSAT (correlações 0,97 e 0,97). Para ECS, apenas um animal foi reclassificado entre os ambientes (correlações 1,00). O primeiro estudo permitiu avaliar os componentes de variância ao longo de todo o gradiente ambiental. Por sua vez, o segundo estudo permitiu avaliar a variância individual dos marcadores moleculares, complementando o estudo genético das características. Mesmo que pequenas, foi possível verificar diferenças genéticas entre os animais entre os ambientes considerados. / Heat stress causes damage to dairy farming activities. It is possible to select animals for heat tolerance, because there is genetic variation of productive traits when evaluated in different climatic environments. For a correct genetic evaluation according to different environments, the use of models that fit to the data is fundamental. At the same time, genomic tools can aid in the evaluation and genetic selection processes for heat tolerance. In this context, two studies were developed. In the first, the aim was to study the variance functions of milk production and quality traits in relation to a temperature and humidity index (THI), adjusted by Legendre polynomials of orders two to seven, to evaluate which function best fits the data and understand how the variance components and heritability coefficients behave as a function of THI. For this, records of milk yield (MY), somatic cell score (SCS), percentage of fat (FP), protein (PP), lactose (LP), casein (CP) and acid fatty acids (saturated - SAT, unsaturated - UNSAT, monounsaturated - MONO, polyunsaturated - POLY, palmitic acid - C16:0, stearic acid - C18:0; and oleic acid - C18:1) from 5,224 Holstein cows and evaluated using random regression models in 167 different levels of THI were used. With the exception of POLY, there was variation in all variance components along the THI for all traits. Estimates of heritability ranged from 0.07 to 0.43. For MY, FP, LP, SCS, SAT and C16:0, estimates of heritability decreased with increasing THI and for CP, MONO, UNSAT and C18:1 increased. For PP and C18:0, heritability estimates were higher in intermediate THI values and lower at the extremes. In the second study, the objective was to estimate the effect of SNP markers on traits MY, CP, SCS, SAT and UNSAT and to predict the genomic breeding values (GEBV) using these effects, considering two levels of THI: a thermal comfort and an heat stress. The breeding values of the animals for the two environments were used as phenotypes for the genomic wide association studies (GWAS). Genotypes of 1,157 cows to 60,671 SNP markers were used. The GBLUP method (genomic best linear unbiased prediction) was used under a bitrait approach to perform GWAS. With the aim of comparing the environments, the 55 SNP with the greater variance explained for each situation and the 10% animals with the greater GEBV were used. Differences were observed in the variance explained by SNP between the comfort and heat stress environment. There was a re-rankink of animals considering the GEBV for MY (correlations 0.90 and 0.90), CP (correlations 0.88 and 0.86), SAT (correlations 0.88 and 0.87) and UNSAT (correlations 0.97 and 0.97). For SCS, only one animal was reclassified between the environments (correlations 1.00). The first study allowed to evaluate the components of variance along the entire environmental gradient. In turn, the second study allowed to evaluate the individual variance of the molecular markers, complementing the genetic study of the traits. Although small, it was possible to verify genetic differences among the animals among the considered environments.
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Funções de covariâncias e modelos de regressão aleatória na avaliação genética do crescimento de bovinos jovens da raça Tabapuã / Covariance functions and random regression models for genetic evaluation of young Tabapuã beef cattleSakaguti, Eduardo Shiguero 15 September 2000 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-08T13:20:14Z
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Previous issue date: 2000-09-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Avaliou-se o crescimento de bovinos até dois anos de idade por meio de análises de funções de covariâncias (CF), relativas aos pesos corporais da raça Tabapuã, criados em regime de pasto. As CF foram estimadas de duas maneiras diferentes: 1) a partir das matrizes de estimativas de (co)variâncias (MTC) genéticas e fenotípicas, obtidas pela metodologia de máxima verossimilhança restrita (REML), no peso ao nascer e nos pesos ajustados aos 120, 205, 240, 365, 420 e 550 dias de idade; e 2) por meio de modelos de regressão aleatória (RRM). Avaliou-se a utilização de polinômios de Legendre na descrição dos efeitos aleatórios e polinômios ordinários, em curvas fixas de crescimento, e dos efeitos da idade da vaca. Modelos com altos coeficientes de determinação (R 2 > 0,98) foram obtidos pela utilização do efeito da idade da vaca no dia de pesagem dos animais (i.e., a idade da vaca no parto mais a idade do animal no dia da pesagem), em polinômios quadráticos e em curvas médias de crescimento, diferenciadas para machos e fêmeas e descritas por meio de polinômios cúbicos. A análise das CF, obtidas das MTC, mostrou-se bastante útil, pois, além de estimar covariâncias entre qualquer par de idades, a análise das autofunções, associadas aos autovalores das matrizes de coeficientes das CF, revelou que as curvas de crescimento dos animais podem ser rapidamente alteradas pela seleção. Fatores como desmame, ganho compensatório e seleção de animais provocaram várias mudanças na trajetória das (co)variâncias genéticas, fazendo com que apenas as CF de ordens de ajuste mais complexas estimassem valores mais próximos das estimativas da REML dos pesos ajustados às idades-padrão. Entretanto, os polinômios de Legendre, de alta ordem, tenderam a descrever estranhas ondulações nas trajetórias das variâncias, principalmente nas extremidades do período. Em razão das limitações computacionais, os RRM foram empregados nos pesos corporais medidos entre as idades de 365 e 650 dias, utilizando-se apenas polinômios lineares de Legendre. Os RRM apresentaram melhor ajuste em relação aos dados, permitiram estimar valores genéticos e componentes de variância de qualquer idade e forneceram parâmetros adicionais úteis às avaliações genéticas de bovinos de corte. / Growth from birth to two years of age of Tabapuã beef cattle raised under pasture conditions was evaluated by covariance functions (CF) estimated by two different ways: 1) from genetic and phenotypic matrices of (co)variance (MTC) estimated by restricted maximum likelihood methods (REML) of birth weight and adjusted weights at 120, 205, 240, 365, 420 and 550 days of age; and 2) by random regression models (RRM). Legendre polynomials were used to describe random effects and ordinary polynomials were used in fixed growth curves and in age-of-dam effect. Models with high goodness of fit (R 2 > 0,98) were obtained using quadratic polynomials for age-of-dam effect at weighing day (i.e., age of dam at birth plus age of animals at weighing day) and cubic polynomials for separated mean growth curves of males and females. Estimation of CF is a very useful tool to analyze beef cattle growth. It was possible to estimate covariance between any pair of ages and the analyses of the eigenfunctions associated with the eigenvalues of CF coefficients matrix showed that the growth curves of Tabapuã calves could be easily changed by selection. Weaning stress, compensatory growth and selection of animals caused several changes on (co)variance trajectories. Therefore only CF of more complex order of fit were able to estimate values near to REML estimates of weights adjusted to standard ages. However, these high-order Legendre polynomials tended to draw strange sharp waves on variance trajectories at the period edges. Due to computing limitations, RRM were applied on body weights measured from 365 to 650 days and only linear Legendre polynomials were used. The RRM allowed better goodness of fit to the weight data, estimated breeding values and variance components for weights at any pair of ages, and provided additional and very useful parameters for beef cattle genetic evaluation. / Tese importada do Alexandria
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Avaliação genética de parte da trajetória de crescimento de ovinos das raças santa inês, poll dorset e somalis brasileira utilizando modelos de regressão aleatória / Genetic evaluation of partial growth trajectory of santa inês, poll dorset and somalis brasileira breed sheep using random regression modelsOliveira, Kassiana Adriano Pinto de January 2008 (has links)
OLIVEIRA, Kassiana Adriano Pinto de. Avaliação genética de parte da trajetória de crescimento de ovinos das raças santa inês, poll dorset e somalis brasileira utilizando modelos de regressão aleatória. 2008. 69 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Zootecnia, Fortaleza-CE, 2008 / Submitted by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-02T13:24:30Z
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Previous issue date: 2008 / Data set of 220, 336 and 19,303 records, respectively of Poll Dorset, Somalis Brasileira and Santa Inês sheep, born between 1996 and 2008, belonging to Gaasa Agropecuária Ltda, supported by Programa de Melhoramento Genético de Caprinos e Ovinos de Corte (GENECOC) of Embrapa Caprinos e Ovinos, were analyzed with the aim to evaluate distinct polynomial functions with different order of fit for fixed and random regressions of growth trajectory and to estimate (co)variances components and genetic parameters of this trajectory. Fixed effects used in analysis for all breeds were contemporary group (animals born in the same year-season), sex and birth type (single, twin, triple). Separately, for each breed, 24 models, with different orders, were evaluated to verify the best fit for fixed trajectory and for random regression of additive direct, maternal and permanent environmental effects. Ordinary and Legendre polynomials, varying of two (linear) to four (cubic) orders, were evaluated for fixed regression of average growth trajectory. Legendre and quadratic bspline functions, varying of three (quadratic) to four (cubic) orders, were evaluated for random regressions. For all breeds, Legendre polynomials of order fourth were sufficient to fit random regression. However, in fixed regression, ordinary polynomials were best to Poll Dorset and Santa Inês breeds, while Legendre were best for Somalis Brasileira. Fixed trajectory was linear for Poll Dorset and Somalis Brasileira and quadratic for Santa Inês. In Poll Dorset, direct heritability was low (<0.05) until 100 days, when so increased until 212 days reaching 0.74. In major portion of trajectory, maternal heritability for this breed were higher than direct heritability, this last overpass the first only after 150 days of age, about 100 days after weaning of animals. In Somalis Brasileira breed, the standard of direct heritability estimates presented two parabolas: one between birth and 73 day, with maximum of 0.21 at 49 days, and other from 73 day to rest of trajectory, with maximum of 0.53 at 253-256 days. Maternal heritability increased until 76 day, with maximum of 0,95, decreasing for 0.47 at 261 day, increasing again until final of trajectory, reaching 0.80. In Santa Inês breed, direct heritabilities at days 1, 50, 150, 250 and 411 were 0.24, 0.12, 0.44, 0.84 and 0.96, respectively, while maternal heritabilities for the same ages, respectively, were 0.24, 0.19, 0.09, 0.02 and 0.01. In all breeds, genetic correlations among weights in subsequent ages were high, tend to unity, with negative correlations between weights at early ages and weights at late ages. There is sufficient genetic variability to permit selection of these breeds for alter its growth trajectory. However, differences in standard of this variability suggest different procedures for selection of each breed. Genetic control of weights at initial ages is not the same in late ages. This aspect is important for establishment of adequate strategies of selection. Selection of animals for slaughter in early age must be different of that to replacement animals / Foram avaliados 220, 336 e 19.303 registros de pesos de ovinos, respectivamente das raças Poll Dorset, Somalis Brasileira e Santa Inês, nascidos entre 1996 e 2008, de propriedade da fazenda Gaasa Agropecuária Ltda, associada ao Programa de Melhoramento Genético de Caprinos e Ovinos de Corte (GENECOC) da Embrapa Caprinos e Ovinos, com o objetivo de avaliar distintas funções polinomiais com diferentes ordens para o melhor ajuste das regressões fixas e aleatórias da trajetória de crescimento e estimar os componentes de (co) variância e parâmetros genéticos desta trajetória. Os efeitos fixos utilizados nas análises para todas as raças foram grupo de contemporâneos (animais nascidos no mesmo ano e estação), sexo e tipo de nascimento (simples, duplo, triplo). Separadamente, para cada uma das raças, foram avaliados 24 modelos, com diferentes ordens, para verificar o melhor ajuste simultâneo de regressão fixa da trajetória de crescimento e da regressão aleatória para efeitos genéticos aditivo direto e materno e de ambiente permanente do animal. Para ajuste da regressão fixa da trajetória média de crescimento, foram avaliados polinômios ordinários e de Legendre, com ordens variando de dois (linear) a quatro (cúbica). Para as regressões aleatórias, foram avaliadas as funções de Legendre e b-spline quadrática, com ordens variando de três (quadrática) a quatro (cúbica). Para todas as raças, funções com polinômios de Legendre de quarta ordem foram suficientes para ajustar a parte aleatória. Entretanto, para a parte fixa, os polinômios ordinários foram melhores para as raças Poll Dorset e Santa Inês, enquanto os de Legendre foram melhores para a raça Somalis Brasileira. A trajetória fixa foi linear para as raças Poll Dorset e Somalis Brasileira, e quadrática para a raça Santa Inês. Na raça Poll Dorset, a herdabilidade direta se manteve baixa (<0,05) até cerca de 100 dias de idade, quando passou a aumentar até os 212 dias de idade, atingindo um valor de 0,74. Na maior parte da trajetória, as herdabilidades maternas nesta raça superaram as herdabilidades diretas, sendo que esta última somente ultrapassou a primeira após os 150 dias de idade, cerca de 100 dias após o desmame dos animais. Na raça Somalis Brasileira, o padrão das estimativas de herdabilidade direta apresentou duas parábolas: uma entre o nascimento e o dia 73, com valor máximo de 0,21 aos 49 dias, e uma outra entre 73 dias e o restante da trajetória, com valor máximo de 0,53 aos 253-256 dias. A herdabilidade materna aumentou até o dia 76, com máxima de 0,95, reduzindo para 0,47 no dia 261, voltando a subir novamente até o final da trajetória, alcançando o valor de 0,80. Na raça Santa Inês, as herdabilidades diretas nos dias 1, 50, 150, 250 e 411 foram iguais a 0,24, 0,12, 0,44, 0,84, e 0,96, respectivamente, enquanto as herdabilidades maternas nas respectivas idades foram 0,24, 0,19, 0,09, 0,02 e 0,01. Em todas as raças, as correlações genéticas entre pesos de idades subseqüentes, próximas entre si, foram elevadas, tendendo à unidade, havendo correlações negativas entre pesos tomados em idades mais jovens e aqueles tomados em idades mais avançadas. Existe variabilidade genética suficiente para permitir seleção destas raças, de forma a alterar suas trajetórias de crescimento. Entretanto, as diferenças no padrão desta variabilidade sugerem diferentes procedimentos de seleção para cada uma das raças. O controle genético sob os pesos nas fases iniciais do crescimento não é o mesmo que atua em idades mais tardias. Este aspecto é importante para o estabelecimento de adequadas estratégias de seleção. A seleção de animais para abate em idade jovem deve assim ser diferente daquela para animais de reposição no rebanho
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Parâmetros genéticos e fenotípicos do perfil de ácidos graxos do leite de vacas da raça holandesa / Genetic and phenotypic parameters of the fatty acid profile of milk from Holstein cowsMary Ana Petersen Rodriguez 05 July 2013 (has links)
Durante as últimas décadas, o melhoramento genético em bovinos leiteiros no Brasil baseou-se somente na importação de material genético, resultando em ganhos genéticos de pequena magnitude para as características de interesse econômico. Dessa forma, existe a necessidade eminente de avaliações genéticas dos animais sob condições nacionais de ambiente, de maneira a se prover um aumento na produção de leite aliado à qualidade. Neste contexto, o conhecimento sobre a composição do leite é de extrema importância para o entendimento de como alguns fatores ambientais e, principalmente genéticos podem influenciar no aumento dos conteúdos de proteína (PROT), gordura (GOR) e ácidos graxos (AG) benéficos e na redução da contagem de células somáticas, visando a melhoria da qualidade nutricional deste produto. Diante disso, o objetivo desse trabalho foi predizer os teores de AG de interesse usando regressão linear bayesiana, bem como estimar componentes de variância, coeficientes de herdabilidade e comparar modelos de diferentes ordens de ajuste por meio de funções polinomiais de Legendre, sob modelos de regressão aleatória. Amostras de leite foram submetidas a análises de cromatografia gasosa e espectrometria em infravermelho médio para determinação dos ácidos graxos. A comparação dos resultados obtidos por ambos os métodos foi realizada por meio da correlação de Pearson, análise de Bland-Altman e regressão linear bayesiana e, posteriormente, equações de predição foram desenvolvidas para os ácidos graxos mirístico (C14:0) e linoléico conjugado (CLA), a partir de regressões lineares simples e múltipla bayesiana considerando-se prioris nãoinformativas e informativas. Polinômios ortogonais de Legendre de 1ª a 6ª ordens foram utilizados para o ajuste das regressões aleatórias das características. A predição dos AG por meio da aplicação da regressão linear foi viável, com erros de predição variando entre 0,01 e 4,84g por 100g de gordura para o C14:0 e 0,002 e 1,85 por 100g de gordura para o CLA, sendo neste caso os menores erros de predição obtidos quando adotada a regressão múltipla com priori não informativa. Os modelos que melhor se ajustaram para GOR, PROT, C16:0, C18:0, C18:1c9, CLA, saturados (SAT), insaturados (INSAT), monoinsaturados (MONO) e poliinsaturados (POLI) foi o de 1ª ordem, e para escore de célula somática (ESC) e C14:0 o de 2ª ordem. As estimativas de herdabilidade obtidas variaram de 0,08 a 0,11 para GOR; 0,28 a 0,35 para PROT; 0,03 a 0,22 para ECS; 0,12 a 0,31 para C16:0; 0,08 a 0,14 para C18:0; 0,24 a 0,43 para C14:0; 0,07 a 0,17 para C18:1c9; 0,13 a 0,39 para CLA; 0,14 a 0,31 para SAT; 0,04 a 0,14 para INSAT; 0,04 a 0,13 para MONO; 0,09 a 0,20 para POLI e 0,12 para PROD, nos modelos que melhor se ajustaram. Concluise que melhorias na qualidade nutricional do leite podem ser obtidas por meio da inclusão das características produtivas e do perfil de ácidos graxos em programas de seleção genética. / During the last decades, genetic improvement in dairy cattle in Brazil was based only on the importation of genetic material, resulting in small genetic gains for economic interest traits. There is a perceived need for genetic evaluation under national environment conditions to provide an increase in milk production allied to quality. In this context, the knowledge of the milk composition is very important for understanding how certain environmental factors and especially genetic factors may influence the increase in protein content (PROT), fat (FAT), beneficial fatty acids (FA) and in reducing somatic cell count, aiming to improve the nutritional quality of this product. The aim of this study was to predict the levels of interest FA using Bayesian linear regression and estimate the components of variance, coefficients of heritability and compare models with different orders of adjustment by Legendre polynomials functions, in random regression models. Milk samples were subjected to gas chromatography analysis and mid-infrared spectrometry for the determination of fatty acids. The comparison of the results obtained by both methods was performed using Pearson\'s correlation, Bland-Altman analysis and Bayesian linear regression, subsequently, prediction equations were developed for the fatty acids myristic (C14:0) and conjugated linoleic (CLA) from simple linear regressions and multiple Bayesian considering non-informative and informative priors. Legendre orthogonal polynomials from 1st to 6th orders were used to fit the random regression of the traits. That was viable the prediction of FA by applying the linear regression with prediction errors ranging from 0.01 to 4.84 g per 100 g of fat for C14:0 and 0.002 to 1.85 per 100 g of fat for CLA, in this case the smaller prediction errors obtained when adopted the multiple regression with non-informative priori. The models that best fit for FAT, PROT, C16:0, C18:0, C18:1C9, CLA, saturated (SAT), unsaturated (UNSAT), monounsaturated (MONO) and polyunsaturated (POLY) was the one of 1st order and for somatic cell scores (SCS) and C14:0 the one of 2nd order. The estimates of heritability ranged from 0.08 to 0.11 for FAT; 0.28 to 0.35 for PROT; 0.03 to 0.22 for SCS; 0.12 to 0.31 for C16:0; 0.08 to 0.14 for C18:0; 0.24 to 0.43 for C14:0; 0.07 to 0.17 for C18:1C9; 0.13 to 0.39 for CLA; 0.14 to 0.31 for SAT; 0.04 to 0.14 for UNSAT; 0.04 to 0.13 for MONO, 0.09 to 0.20 for POLY and 0.12 for PROD, in the models that best fit. We conclude that improvements in the nutritional quality of milk can be obtained through the inclusion of productive traits and fatty acid profile in genetic selection programs.
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Estresse térmico sobre a predição de valores genéticos para características de produção e qualidade do leite de vacas Holandesas / Heat stress on breeding value prediction for production traits and milk quality of Holstein cowsMayara Salvian 16 December 2015 (has links)
A raça Holandesa apresenta alto rendimento na produção de leite, por isto, diversos países têm optado pela importação de sêmen para substituir as raças leiteiras locais. Esta estratégia seria eficaz se o sêmen importado fosse utilizado nas mesmas circunstâncias em que foram selecionados. Caso exista interação genótipo ambiente significativa, é esperada uma nova classificação dos touros, porém se o efeito da interação genótipo ambiente não é levada em consideração, os valores genéticos preditos (EBVs) podem ser tendenciosos, reduzindo a resposta de seleção. Diante disso, os objetivos deste trabalho foram comparar modelos de diferentes ordens de ajuste por meio de funções polinomiais de Legendre, utilizando modelos de regressão aleatória e estimar os coeficientes de herdabilidade para os teores de gordura, proteína, ácido graxo saturado, ácido graxo insaturado, e produção de leite. Além de estimar o valor genético dos animais, sob a interferência do estresse térmico. Foram utilizadas informações fenotípicas coletadas mensalmente ao longo da lactação e modelos com polinômios ortogonais de Legendre de primeira a sexta ordem, para verificar a interferência de estresse térmico, foram utilizadas informações de temperatura e umidade do dia de coleta. Os modelos que melhor se ajustaram foram os de primeira e segunda ordem. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,02 a 0,52 para teor de gordura; de 0,03 a 0,63 para teor de proteína; de 0,05 a 0,63 para ácido graxo saturado; de 0,019 a 0,364 para ácido graxo insaturado e de 0,133 a 0,390 para produção de leite nos diferentes modelos estudados. As estimativas de valores genéticos variaram de -0,5 a 0,5 em ambiente sem estresse térmico e de -0,2 a 0,2 em ambiente com estresse térmico para o teor de gordura; de -0,4 a 0,4 para ambiente sem estresse térmico e de -0,2 a 0,2 em ambiente com estresse térmico para o teor de proteína; de -0,3 a 0,3 em ambiente sem estresse térmico e de -0,2 a 0,2 em ambiente com estresse térmico para ácido graxo saturado; de -0,1 a 0,1 em ambiente sem estresse térmico e de -0,1 a 0,1 em ambiente com estresse térmico para ácido graxo insaturado e de - 6 a 6 em ambiente sem estresse térmico e de -2 e 2 em ambiente com estresse térmico para produção de leite. De acordo com os resultados, as herdabilidades indicam que o teor de gordura, proteína, ácido graxo saturado produção de leite podem ser utilizados como critério de seleção. Com o uso de informações de temperatura e umidade do ar, foi possível verificar a presença de interação genótipo ambiente para teor de gordura, proteína, ácido graxo saturado e produção de leite aos 205 dias em lactação. / Due to the high milk production of Holstein cattle, many countries have chosen to import semen to replace local dairy breeds. This strategy would be effective if these semen was used in the same circumstances in which they were selected. However, if there is significant genotype environment interaction, it is expected a new bulls ranking, but if the effect of genotype environment interaction is not considered, the estimated breeding values (EBVs) may be tendentious, reducing the selection response. The objectives of this study were estimate breeding value under heat stress and heritability coefficients, and also to compare models of different adjustment orders through Legendre polynomials, using random regression models for fat, protein, saturated fatty acid, unsaturated fatty acid and milk production. There were used phenotypic information collected monthly through the lactation period and Legendre orthogonal polynomials models from the first to sixth order. To verify the interference of heat stress, there was used temperature and humidity information on the day of the evaluation was performed. The first and second order models were the ones that better fitted. Heritability estimates were from 0.02 to 0.52 for fat; 0.03 to 0.63 for protein; 0.05 to 0.63 for saturated fatty acid; 0.019 to 0.364 for unsaturated fatty acid and 0.133 to 0.390 for milk production on the different models tested. Estimates of the genetic value were from -0.5 to 0.5 on environment without heat stress and -0.2 to 0.2 on environment with heat stress for fat; -0.4 to 0.4 on environment without heat stress and -0.2 to 0.2 on environment with heat stress for protein; -0.3 to 0.3 on environment without heat stress and -0.2 to 0.2 on environment with heat stress for saturated fatty acid; -0.1 to 0.1 on environment without heat stress and of -0.8 to 0.8 on environment with heat stress for unsaturated fatty acid; -6 to 6 on environment without heat stress and -2 to 2 on environment with heat stress for milk production. The heritability indicates that the fat, protein, saturated fatty acid and milk production can be used as selection criteria. With the use of temperature and humidity information, it was possible to verify the presence of genotype environment interaction for fat, protein, saturated fatty acid and milk production at 205 days in milk.
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Variações de produtividade da porção oeste do Atlântico Sul ao longo dos últimos 15 mil anos a partir de estudo quantitativo de nanofósseis calcários / Productivity changes of the western South Atlantic region during the las 15,000 years based on quantitative study of calcareous nannofossilHeliane Bevervanso Ferrarese 14 April 2010 (has links)
O objetivo do presente estudo foi estimar as possíveis variações na produtividade das águas superficiais da porção oeste do oceano Atlântico Sul ao longo dos últimos 15.000 anos, contribuindo para a melhor compreensão das variações oceanográficas ocorridas na região no decorrer deste tempo. Foram realizadas análises quantitativas de nanofósseis calcários em um testemunho da Bacia de Santos, a partir da técnica de decantação aleatória. Isótopos estáveis de carbono e oxigênio em rocha total e teor de carbonato de cálcio também foram utilizados para interpretações sobre paleoprodutividade. A produtividade primária das águas superficiais apresentou variações ao longo dos últimos 15.000 anos. Variações no aporte continental e na profundidade da termoclina/nutriclina devem ter influenciado as condições das águas superficiais da região, e conseqüentemente, a produtividade dos cocolitoforídeos. Estimou-se que a produtividade da camada fótica superior tenha diminuído desde o início do Holoceno. Anterior a este período, uma maior contribuição continental teria propiciado condições mais favoráveis ao desenvolvimento dos cocolitoforídeos que habitam as camadas mais superficiais do oceano. / The aim of this study consisted in estimate possible changes on southwestern Atlantic Ocean surface water productivity for the last 15.000 years, contributing to a better understanding of oceanographic changes that occurred along this time. Quantitative calcareous nannofossils analyses were carried out on a Santos Basin core using the random settling technique. Bulk carbon and oxygen stable isotopes and calcium carbonate content were also used for paleoproductivity interpretation. Primary productivity of surface waters presented variation along the last 15.000 years. Variations in continental contribution and thermocline/nutricline depth must have influenced the surface water conditions and therefore coccolithophorids productivity. Upper photic zone productivity was estimated and seems to have diminished since early Holocene. Prior to this time, a major continent contribution would have provided more favorable conditions for the development of the coccolithophorids that inhabit the upper layers of the ocean.
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Adição seqüencial aleatória de elementos escalantes em d dimensôesVIEIRA, Manoel de Carvalho 31 January 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Um grande número de problemas desafiadores está associado ao estudo de interfaces, pois existem
inúmeros processos físicos, químicos e biológicos complexos que ocorrem por inteiro na
fronteira entre duas fases, ou são apenas iniciados nessa interface. Como exemplos destes,
podemos citar alguns processos que são importantes na indústria e no mundo natural, e que
envolvem a adsorção de moléculas e de partículas com distribuição de tamanhos extremamente
variadas: armazenamento e seqüestro de poluentes, filtragem, passivação de superfícies, processos
cinéticos e de catálise heterogênea, carcinogênese, farmacoterapia. Um dos modelos de
adsorção mais simples e mais estudado é o de adsorção seqüencial aleatória (ASA). Ao modelo
clássico, no qual unidades são adicionadas uma a uma, ao acaso, em um meio, excluindo-se
sobreposições, foram adicionadas moléculas de diferentes tamanhos, gerando dessa forma uma
atmosfera polidispersa. Esta atmosfera é posta em contato com um substrato de área A com
o qual as moléculas interagem através de forças de dispersão de curto alcance. Estamos interessados,
em particular, no caso em que as moléculas são representadas por quadrados de área
a = l2 distribuídos segundo a lei de escala n(a) = n(1)a−t , com 0 ≤ t < ¥. Estudamos três
regras de preenchimento: uma onde precedência é dada aos elementos menores, outra onde o
privilégio é dado aos maiores e ainda outra onde não há preferência à escolha das moléculas.
Para examinar o rendimento da densidade de preenchimento, q (t ), usamos os vínculos: (i) a
soma da área de todas as moléculas, desde as de área unitária, até a de área máxima, amax, é
igual a A e (ii) n(amax) = 1 e (iii) cada molécula tem apenas uma única chance de ser adsorvida.
Cada regra expõe um comportamento distinto, caracterizado por extremos na densidade
de ocupação, no intervalo 1,0 ≤t ≤ 2,0. Entretanto, para t ≈ 6.0 temos a atmosfera próxima
ao limite monodisperso e, para todas as regras usadas, a fração de cobertura converge para um
valor bem abaixo do caso clássico, onde não há limitação para o número de tentativas de adsorção.
Dentre outros resultados, obtivemos também a ocupação para o caso onde as moléculas
são cubos de volume v = ld com d > 2, onde o aumento em d provoca uma mudança quantitativa
na densidade de ocupação, que pode ser associada ao aumento dos graus de liberdade do
sistema
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