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Reconfiguração automática de I/O para aplicações paralelas no sistema de arquivos dNFSp2

Kassick, Rodrigo Virote January 2010 (has links)
Diversas aplicações executadas em ambientes de cluster necessitam de uma área de armazenamento permanente com alta capacidade e que forneça uma visão homogênea dos dados entre todos os nós. Esta área compartilhada é comumente implementada através de um sistema de arquivos distribuído, permitindo o acesso através da abstração mais comum para gerenciamento de dados. A disparidade entre poder de processamento e desempenho de dispositivos de armazenamento atuais, no entanto, torna tais sistemas um ponto crítico ao desempenho de aplicações paralelas que lidam com grandes volumes de dados. Ambientes de cluster podem apresentar execução concorrente de aplicações em conjuntos independentes de máquinas. Desta forma, uma grande quantidade de clientes com características distintas farão acessos ao sistema de arquivos compartilhado. Em tais casos, o dimensionamento do sistema de armazenamento distribuído nem sempre poderá prover o desempenho necessário à execução das aplicações com os recursos inicialmente a ele destinados. O presente trabalho propõe uma estratégia de reconfiguração dinâmica para o sistema de arquivos dNFSp. Esta estratégia leva em consideração o comportamento temporal presente em aplicações paralelas para inserir servidores de dados exclusivos a aplicações com alta demanda de I/O. Com a utilização de servidores exclusivos, torna-se possível isolar aplicações com comportamentos que causam grande perda de desempenho no sistema como um todo. Foi desenvolvida uma ferramenta de monitoramento do desempenho junto aos servidores do dNFSp, de forma a solicitar novos servidores apenas quando a interação das fases de I/O das aplicações em execução interferirem no desempenho do sistema. Esses novos servidores são solicitados para um sistema escalonador de recursos para cluster, de forma a utilizar nós livres para o armazenamento de dados. Os resultados mostram que a estratégia proposta é capaz de detectar a saturação do sistema de armazenamento e iniciar os servidores exclusivos, levando a um ganho de desempenho para as aplicações em execução. A reconfiguração dinâmica também mostrou-se capaz de evitar baixos desempenhos causados pela interação dos períodos de inatividade de aplicações temporais e pela utilização de diversos processos de I/O em um único nó. / Several applications executed in cluster environments need a shared storage area with high capacity and a homogeneous view of the stored data to all processing nodes. This area is commonly implemented as a distributed file system, allowing the access to data through the well-known file abstraction. The great gap in performance of processors and storage devices, on the other hand, makes such system a critical point to the performance of parallel applications. A common trait of large cluster environments is the concurrent execution of applications. In this scenario, many clients with distinct behaviors will compete to access the shared storage system. The number of I/O resources originally dedicated to this shared storage may provide unsatisfactory performance to the applications in this case. This work proposes a dynamic reconfiguration strategy for the dNFSp file system. This strategy takes into consideration the temporal behavior of distributed applications to launch dedicated I/O resources to the more I/O-demanding applications. The exclusiveness of data servers allows for the isolation of access patterns that cause contention on the system, resulting in improved performance for all executing applications. We developed a tool to monitor the performance of the storage servers in order to launch new servers only when the interaction of I/O phases from running applications cause each other’s performance to drop. These resources are required to a batch scheduler system present on the cluster, allowing the use of computing nodes for temporary data storage. The results show that the proposed metrics lead to the detection of performance saturation on the file system and the start of the dedicated resources, resulting in increased I/O performance. The reconfiguration has also been able to avoid some low performance situations caused by interactions of inactivity periods from temporal applications and by utilization of several I/O processes on the same cluster node.
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Processamento da rede neocognitron para reconhecimento facial em ambiente de alto desempenho GPU

Silva, Gustavo Poli Lameirão da 30 August 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:05:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 1899.pdf: 6848122 bytes, checksum: 73de4f19b5358e6ac6d95ad0e75e7ea1 (MD5) Previous issue date: 2007-08-30 / Financiadora de Estudos e Projetos / This work presents an implementation of the Neocognitron Neural Network, using a high performance computing architecture based on GPU (Graphics Processing Unit). Neocognitron is an artificial neural network, proposed by Fukushima and collaborators, constituted of several hierarchical stages of neuron layers, organized in two-dimensional matrices called cellular plains. For the high performance computation of Face Recognition application using Neocognitron it was used CUDA (Compute Unified Device Architecture) as API (Application Programming Interface) between the CPU and the GPU, from GeForce 8800 GTX of NVIDIA company, with 128 ALU s. As face image databases it was used a face database created at UFSCar, and the CMU-PIE (Carnegie Melon University - Pose, Illumination, and Expression) database. The load balancing through the parallel processing architecture was obtained by means of the distributed processing of the cellular connections as threads organized in blocks, following the CUDA philosophy of development. The results showed the viability of this type of device as a massively parallel data processing tool, and that smaller the granularity of the parallel processing, and the independence of the processing, better is its performance. / Neste trabalho é apresentada a implementação da Rede Neural Neocognitron, usando uma arquitetura de computação de alto desempenho baseada em GPU (Graphics Processing Unit). O Neocognitron é uma rede neural artificial, proposta por Fukushima e colaboradores, constituída de vários estágios de camadas de neurônios, organizados em matrizes bidimensionais denominadas planos celulares. Para o processamento de alto desempenho da aplicação de reconhecimento facial usando neocognitron foi utilizado o CUDA (Compute Unified Device Architecture) como API (Application Programming Interface) entre o CPU e o GPU, da GeForce 8800 GTX da empresa NVIDIA, com 128 ALU s. Como repositórios de imagens faciais foram utilizados imagens faciais desenvolvido na UFSCar e o banco da Universidade de Carnegie Melon, CMU-PIE. O balanceamento de carga na arquitetura de processamento paralelo foi obtido considerando o processamento de uma conexão de neurônio como um thread, e um conjunto de threads, como um bloco, segundo a filosofia de desenvolvimento dentro deste ambiente. Os resultados mostraram a viabilidade do uso deste tipo de dispositivo como ferramenta de processamento de dados maciçamente paralelo e que quanto menor a granularidade da paralelização e a independência dos processamentos, melhor é seu desempenho.
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Contribui??o ao estudo avan?ado das argamassas de alto desempenho para reparos estruturais / Contribution to the study of advanced high performance mortar for structural repairs

Oliveira, Lenilson Xavier Ferreira de 29 December 2014 (has links)
Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-01-14T18:59:50Z No. of bitstreams: 1 LenilsonXavierFerreiraDeOliveira_DISSERT.pdf: 13173079 bytes, checksum: 590a6e34e1200cb0a727b018faf5262c (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2016-01-15T19:37:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 LenilsonXavierFerreiraDeOliveira_DISSERT.pdf: 13173079 bytes, checksum: 590a6e34e1200cb0a727b018faf5262c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-15T19:37:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LenilsonXavierFerreiraDeOliveira_DISSERT.pdf: 13173079 bytes, checksum: 590a6e34e1200cb0a727b018faf5262c (MD5) Previous issue date: 2014-12-29 / In?meras estruturas de concreto no Brasil e no mundo est?o atingindo o limite de sua vida ?til projetada, completando um ciclo de cinco ou mais d?cadas de uso e opera??o. Al?m das estruturas mais antigas, existem ainda estruturas com reduzido tempo de servi?o, e qualidade discut?vel, que j? apresentam patologias em estado t?o avan?ado que chegam a comprometer o seu desempenho. Vindo ao encontro dessas necessidades e no sentido de contribuir para o avan?o cient?fico e tecnol?gico do setor, este trabalho apresenta um m?todo para dosagem, preparo e aplica??o de argamassas de alto desempenho para recupera??o de estruturas deterioradas, al?m de sugerir procedimentos para a realiza??o desses reparos, fomentando a cultura das manuten??es preventivas e desmistificando a complexidade atribu?da a tais opera??es. Para tanto, foram realizados ensaios mec?nicos, microestruturais e relacionados ? durabilidade em corpos-de-prova moldados com s?lica ativa e l?tex de estireno-butadieno. Os resultados indicaram que a ado??o desses ingredientes, na composi??o da argamassa de reparo, provocou uma redu??o significativa da permeabilidade total e descontinuidade de poros, assim como promoveu uma melhor integridade dos constituintes da argamassa, traduzindo-se em uma amplia??o, expressiva, das suas capacidades mec?nicas. Quando comparada aos produtos industrializados da constru??o civil, com padr?es similares, proporcionou uma economia da ordem de 85%, que permitiria recuperar, com os mesmos custos, quase cinco vezes mais estruturas comprometidas. Este estudo, de vi?s altamente tecnol?gico, vem oferecer ? constru??o civil uma argamassa polim?rica de alto desempenho, com fun??o reparadora e custo mais acess?vel, que pode ser adotada em canteiros de obras, implementando a??es de natureza sustent?vel e ainda atendendo ?s atuais exig?ncias elencadas pela literatura, relacionadas ? desempenho, vida ?til e durabilidade das estruturas reparadas.
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High performance trace replay event simulation of parallel programs behavior / Ferramenta de alto desempenho para análise de comportamento de programas paralelos baseada em rastos de execução

Korndorfer, Jonas Henrique Muller January 2016 (has links)
Sistemas modernos de alto desempenho compreendem milhares a milhões de unidades de processamento. O desenvolvimento de uma aplicação paralela escalável para tais sistemas depende de um mapeamento preciso da utilização recursos disponíveis. A identificação de recursos não utilizados e os gargalos de processamento requere uma boa análise desempenho. A observação de rastros de execução é uma das técnicas mais úteis para esse fim. Infelizmente, o rastreamento muitas vezes produz grandes arquivos de rastro, atingindo facilmente gigabytes de dados brutos. Portanto ferramentas para análise de desempenho baseadas em rastros precisam processar esses dados para uma forma legível e serem eficientes a fim de permitirem uma análise rápida e útil. A maioria das ferramentas existentes, tais como Vampir, Scalasca e TAU, focam no processamento de formatos de rastro com semântica associada, geralmente definidos para lidar com programas desenvolvidos com bibliotecas populares como OpenMP, MPI e CUDA. No entanto, nem todas aplicações paralelas utilizam essas bibliotecas e assim, algumas vezes, essas ferramentas podem não ser úteis. Felizmente existem outras ferramentas que apresentam uma abordagem mais dinâmica, utilizando um formato de arquivo de rastro aberto e sem semântica específica. Algumas dessas ferramentas são Paraver, Pajé e PajeNG. Por outro lado, ser genérico tem custo e assim tais ferramentas frequentemente apresentam baixo desempenho para o processamento de grandes rastros. O objetivo deste trabalho é apresentar otimizações feitas para o conjunto de ferramentas PajeNG. São apresentados o desenvolvimento de um estratégia de paralelização para o PajeNG e uma análise de desempenho para demonstrar nossos ganhos. O PajeNG original funciona sequencialmente, processando um único arquivo de rastro que contém todos os dados do programa rastreado. Desta forma, a escalabilidade da ferramenta fica muito limitada pela leitura dos dados. Nossa estratégia divide o arquivo em pedaços permitindo seu processamento em paralelo. O método desenvolvido para separar os rastros permite que cada pedaço execute em um fluxo de execução separado. Nossos experimentos foram executados em máquinas com acesso não uniforme à memória (NUMA).Aanálise de desempenho desenvolvida considera vários aspectos como localidade das threads, o número de fluxos, tipo de disco e também comparações entre os nós NUMA. Os resultados obtidos são muito promissores, escalando o PajeNG cerca de oito a onze vezes, dependendo da máquina. / Modern high performance systems comprise thousands to millions of processing units. The development of a scalable parallel application for such systems depends on an accurate mapping of application processes on top of available resources. The identification of unused resources and potential processing bottlenecks requires good performance analysis. The trace-based observation of a parallel program execution is one of the most helpful techniques for such purpose. Unfortunately, tracing often produces large trace files, easily reaching the order of gigabytes of raw data. Therefore tracebased performance analysis tools have to process such data to a human readable way and also should be efficient to allow an useful analysis. Most of the existing tools such as Vampir, Scalasca, TAU have focus on the processing of trace formats with a fixed and well-defined semantic. The corresponding file format are usually proposed to handle applications developed using popular libraries like OpenMP, MPI, and CUDA. However, not all parallel applications use such libraries and so, sometimes, these tools cannot be useful. Fortunately, there are other tools that present a more dynamic approach by using an open trace file format without specific semantic. Some of these tools are the Paraver, Pajé and PajeNG. However the fact of being generic comes with a cost. These tools very frequently present low performance for the processing of large traces. The objective of this work is to present performance optimizations made in the PajeNG tool-set. This comprises the development of a parallelization strategy and a performance analysis to set our gains. The original PajeNG works sequentially by processing a single trace file with all data from the observed application. This way, the scalability of the tool is very limited by the reading of the trace file. Our strategy splits such file to process several pieces in parallel. The created method to split the traces allows the processing of each piece in each thread. The experiments were executed in non-uniform memory access (NUMA) machines. The performance analysis considers several aspects like threads locality, number of flows, disk type and also comparisons between the NUMA nodes. The obtained results are very promising, scaling up the PajeNG about eight to eleven times depending on the machine.
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Study of load distribution measures for high-performance applications / Estudos de medidas de distribuição de carga para aplicação de alto desempenho

Rodrigues, Flavio Alles January 2016 (has links)
Balanceamento de carga é essencial para que aplicações paralelas tenham desempenho adequado. Conforme sistemas de computação paralelos crescem, o custo de uma má distribuição de carga também aumenta. Porém, o comportamento dinâmico que a carga computacional possui em certas aplicações pode induzir disparidades na carga atribuída a cada recurso. Portanto, o repetitivo processo de redistribuição de carga realizado durante a execução é crucial para que problemas de grande escala que possuam tais características possam ser resolvidos. Medidas que quantifiquem a distribuição de carga são um importante aspecto desse procedimento. Por estas razões, métricas frequentemente utilizadas como indicadores da distribuição de carga em aplicações paralelas são investigadas nesse estudo. Dado que balanceamento de carga é um processo dinâmico e recorrente, a investigação examina como tais métricas quantificam a distribuição de carga em intervalos regulares durante a execução da aplicação paralela. Seis métricas são avaliadas: percent imbalance, imbalance percentage, imbalance time, standard deviation, skewness e kurtosis. A análise revela virtudes e deficiências que estas medidas possuem, bem como as diferenças entres as mesmas como descritores da distribuição de carga em aplicações paralelas. Uma investigação como esta não tem precedentes na literatura especializada. / Load balance is essential for parallel applications to perform at their highest possible levels. As parallel systems grow, the cost of poor load distribution increases in tandem. However, the dynamic behavior the distribution of load possesses in certain applications can induce disparities in computational loads among resources. Therefore, the process of repeatedly redistributing load as execution progresses is critical to achieve the performance necessary to compute large scale problems with such characteristics. Metrics quantifying the load distribution are an important facet of this procedure. For these reasons, measures commonly used as load distribution indicators in HPC applications are investigated in this study. Considering the dynamic and recurrent aspect in load balancing, the investigation examines how these metrics quantify load distribution at regular intervals during a parallel application execution. Six metrics are evaluated: percent imbalance, imbalance percentage, imbalance time, standard deviation, skewness, and kurtosis. The analysis reveals the virtues and deficiencies each metric has, as well as the differences they register as descriptors of load distribution progress in parallel applications. As far as we know, an investigation as the one performed in this work is unprecedented.
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Cell selection to minimize power in high-performance industrial microprocessor designs / Seleção de portas lógicas para minimização de potência em projetos de microprocessadores de alto desempenho

Reimann, Tiago Jose January 2016 (has links)
Este trabalho aborda o problema de dimensionamento portas lógicas e assinalamento de Vt para otimização de potência, área e temporização em circuitos integrados modernos. O fluxo proposto é aplicado aos conjuntos de circuitos de teste dos Concursos do International Symposium on Physical Design (ISPD) de 2012 e 2013. Este fluxo também é adapatado e avaliado nos estágios pós posicionamento e roteamento global em projetos industriais de circuitos integrados, que utilizam uma ferramenta precisa de análise estática de temporização. As técnicas propostas geram as melhores soluções para todos os circuitos de teste do Concurso do ISPD 2013 (no qual foi a ferramenta vencedora), com em média 8% menos consumo de potência estática quando comparada com os outros concorrentes. Além disso, após algumas modificações nos algoritmos, nós reduzimos o consumo em mais 10% em média a pontência estáticas com relação aos resultados do concurso. O foco deste trabalho é desenvolver e aplicar um algoritmo estado-da-arte de seleção portas lógicas para melhorar ainda mais projetos industriais de alto desempenho já otimizados após as fases de posicionamento e roteamento do fluxo de projeto físico industrial. Vamos apresentar e discutir vários problemas encontrados quando da aplicação de técnicas de otimização global em projetos industriais reais que não são totalmente cobertos em publicações encontradas na literatura. Os métodos propostos geram as melhores soluções para todos os circuitos de referência no Concurso do ISPD 2013, no qual foi a solução vencedora. Considerando a aplicação industrial, as técnicas propostas reduzem a potência estática em até 18,2 %, com redução média de 10,4 %, sem qualquer degradação na qualidade de temporização do circuito. / This work addresses the gate sizing and Vt assignment problem for power, area and timing optimization in modern integrated circuits (IC). The proposed flow is applied to the Benchmark Suites of the International Symposium on Physical Design (ISPD) 2012 and 2013 Contests. It is also adapted and evaluated in the post placement and post global routing stage of an industrial IC design flow using a sign-off static timing analysis engine. The proposed techniques are able to generate the best solutions for all benchmarks in the ISPD 2013 Contest (in which we were the winning team), with on average 8% lower leakage with respect to all other contestants. Also, after some refinements in the algorithms, we reduce leakage by another 10% on average over the contest results. The focus of this work is to develop and apply a state-of-the-art cell selection algorithm to further improve already optimized high-performance industrial designs after the placement and routing stages of the industrial physical design flow. We present the basic concepts involved in the gate sizing problem and how earlier literature addresses it. Several problems found when applying global optimization techniques in real-life industrial designs, which are not fully covered in publications found in literature, are presented and discussed. Considering the industrial application, the proposed techniques reduce leakage power by up to 18.2%, with average reduction of 10.4% without any degradation in timing quality.
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A benchmark suite for distributed stream processing systems / Um benchmark suite para sistemas distribuídos de stream processing

Bordin, Maycon Viana January 2017 (has links)
Um dado por si só não possui valor algum, a menos que ele seja interpretado, contextualizado e agregado com outros dados, para então possuir valor, tornando-o uma informação. Em algumas classes de aplicações o valor não está apenas na informação, mas também na velocidade com que essa informação é obtida. As negociações de alta frequência (NAF) são um bom exemplo onde a lucratividade é diretamente proporcional a latência (LOVELESS; STOIKOV; WAEBER, 2013). Com a evolução do hardware e de ferramentas de processamento de dados diversas aplicações que antes levavam horas para produzir resultados, hoje precisam produzir resultados em questão de minutos ou segundos (BARLOW, 2013). Este tipo de aplicação tem como característica, além da necessidade de processamento em tempo-real ou quase real, a ingestão contínua de grandes e ilimitadas quantidades de dados na forma de tuplas ou eventos. A crescente demanda por aplicações com esses requisitos levou a criação de sistemas que disponibilizam um modelo de programação que abstrai detalhes como escalonamento, tolerância a falhas, processamento e otimização de consultas. Estes sistemas são conhecidos como Stream Processing Systems (SPS), Data Stream Management Systems (DSMS) (CHAKRAVARTHY, 2009) ou Stream Processing Engines (SPE) (ABADI et al., 2005). Ultimamente estes sistemas adotaram uma arquitetura distribuída como forma de lidar com as quantidades cada vez maiores de dados (ZAHARIA et al., 2012). Entre estes sistemas estão S4, Storm, Spark Streaming, Flink Streaming e mais recentemente Samza e Apache Beam. Estes sistemas modelam o processamento de dados através de um grafo de fluxo com vértices representando os operadores e as arestas representando os data streams. Mas as similaridades não vão muito além disso, pois cada sistema possui suas particularidades com relação aos mecanismos de tolerância e recuperação a falhas, escalonamento e paralelismo de operadores, e padrões de comunicação. Neste senário seria útil possuir uma ferramenta para a comparação destes sistemas em diferentes workloads, para auxiliar na seleção da plataforma mais adequada para um trabalho específico. Este trabalho propõe um benchmark composto por aplicações de diferentes áreas, bem como um framework para o desenvolvimento e avaliação de SPSs distribuídos. / Recently a new application domain characterized by the continuous and low-latency processing of large volumes of data has been gaining attention. The growing number of applications of such genre has led to the creation of Stream Processing Systems (SPSs), systems that abstract the details of real-time applications from the developer. More recently, the ever increasing volumes of data to be processed gave rise to distributed SPSs. Currently there are in the market several distributed SPSs, however the existing benchmarks designed for the evaluation this kind of system covers only a few applications and workloads, while these systems have a much wider set of applications. In this work a benchmark for stream processing systems is proposed. Based on a survey of several papers with real-time and stream applications, the most used applications and areas were outlined, as well as the most used metrics in the performance evaluation of such applications. With these information the metrics of the benchmark were selected as well as a list of possible application to be part of the benchmark. Those passed through a workload characterization in order to select a diverse set of applications. To ease the evaluation of SPSs a framework was created with an API to generalize the application development and collect metrics, with the possibility of extending it to support other platforms in the future. To prove the usefulness of the benchmark, a subset of the applications were executed on Storm and Spark using the Azure Platform and the results have demonstrated the usefulness of the benchmark suite in comparing these systems.
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Análise computacional da disseminação de epidemias considerando a diluição e a mobilidade dos agentes / Analysis of epidemic dissemination considering dilution and mobility of the agents

Cruz, Vicente Silva January 2013 (has links)
Pesquisas sobre a propagação de epidemias são uma constante devido a sua relevância para a contenção de doenças. Porém, devido aos diversos tipos de doenças existentes, a observação de um comportamento genérico e aproximado torna-se impraticável. Neste âmbito, a elaboração de modelos matemáticos epidêmicos auxiliam no fornecimento de informações que podem ser usadas por orgãos públicos para o combate de surtos epidêmicos reais. Em paralelo, por causa do grande volume de dados que são processados na execução da simulação desses modelos, o constante aumento dos recursos computacionais desenvolvidos vem em auxílio desta tarefa. O objetivo desta dissertação é estudar o comportamento da disseminação de uma epidemia simulada computacionalmente através do modelo epidêmico SIR em reticulados quadrados considerando duas propriedades: a existência de vértices vazios e a movimentação aleatória dos agentes. Essas propriedades são conhecidas por taxas de diluição e mobilidade, respectivamente. Para alcançar esse objetivo, algumas técnicas físico-estatística, tais como a análise das transições de fase e fenômenos críticos, foram aplicadas. Através destas técnicas, é possível observar a passagem do sistema da fase em que ocorre um surto epidêmico para a fase em que a epidemia é contida, bem como estudar a dinâmica do modelo quando ele está na criticidade, ou seja, no ponto de mudança de fase, conhecido por ponto crítico. Foi constatado que a taxa de diluição influencia a disseminação das epidemias porque desloca a transição de fase negativamente, reduzindo o valor crítico da imunização. Por sua vez, a taxa da movimentação dos agentes favorece o espalhamento da doença, pois a transição de fase é positivamente deslocada e seu ponto crítico, aumentado. Além disso foi observado que, apesar desse incremento, ele não é completamente restaurado devido às restrições de mobilidade dos agentes e ao alto grau de desconectividade da rede causado pelas altas taxas de diluição. Neste trabalho nós mostramos as razões deste comportamento. / Research on the spreading of epidemics are frequent because of their relevance for the containment of diseases. However, due to the variety of existing illnesses, the observation of an approximated generic behavior becomes impractical. In this context, the development of mathematical models of epidemics assists in providing information that can be used to make strategic decisions for the combat of real epidemic outbreaks. In parallel, because of the large volume of data which has to be processed in the simulation of these models, the increase of computational performance helps with this task. The objective of this thesis is to study the behavior of the spreading of an epidemic, by computationally simulating an SIR epidemic model on square lattices, considering two properties: the existence of empty vertices and random movement of agents. These properties are known as dilution rate and mobility rate, respectively. To achieve this goal, techniques of statistical physics, such as the analysis of phase transition and power laws, were applied. With these techniques, it is possible to observe the transition of the system from the phase in which an outbreak occurs to the phase where the epidemic is contained. Additionally, we studied the dynamics of the model when it is in criticality, that is, at the point of phase transition, known as the critical point. It was found that a higher dilution rate reduces the spreading of epidemics because it shifts the phase transition negatively, reducing the value of its critical point. On the other hand, increasing the rate of movement of the agents favors the spreading of the disease, because the phase transition is shifted positively and its critical point is increased. It was noticed that, despite of this increasing, this point is not completely restored due to restricted mobility of agents and the high degree of the network disconectivity caused by the high dilution rates. In this work we show the reasons for this behavior.
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Code profiling and optimization in transactional memory systems / Profiling e otimização de código em sistemas de memória transacional

Cordeiro, Silvio Ricardo January 2014 (has links)
Memória Transacional tem se demonstrado um paradigma promissor na implementação de aplicações concorrentes sob memória compartilhada que busquem evitar um modelo de sincronização baseado em locks. Em vez de sujeitar a execução a um acesso exclusivo com base no valor de um lock que é compartilhado por threads concorrentes, uma aplicação sob Memória Transacional tenta executar seções críticas de modo otimista, desfazendo as modificações no caso de um conflito de acesso à memória. Entretanto, apesar de a abordagem baseada em locks ter adquirido um número significativo de ferramentas automatizadas para a depuração, profiling e otimização automatizados (por ser uma das técnicas de sincronização mais antigas e mais bem pesquisadas), o campo da Memória Transacional ainda é comparativamente recente, e programadores frequentemente precisam adaptar manualmente suas aplicações transacionais ao encontrar problemas de eficiência. Este trabalho propõe um sistema no qual o profiling de código em uma implementação de Memória Transacional simulada é utilizado para caracterizar uma aplicação transacional, formando a base para uma parametrização automatizada do respectivo sistema especulativo para uma execução eficiente do código em questão. Também é proposta uma abordagem de escalonamento de threads guiado por profiling em uma implementação de Memória Transacional baseada em software, usando dados coletados pelo profiler para prever a probabilidade de conflitos e determinar que thread escalonar com base nesta previsão. São apresentados os resultados de experimentos sob ambas as abordagens. / Transactional Memory has shown itself to be a promising paradigm for the implementation of shared-memory concurrent applications that eschew a lock-based model of data synchronization. Rather than conditioning exclusive access on the value of a lock that is shared across concurrent threads, Transactional Memory attempts to execute critical sections optimistically, rolling back the modifications in the event of a data access conflict. However, while the lock-based approach has acquired a significant body of debugging, profiling and automated optimization tools (as one of the oldest and most researched synchronization techniques), the field of Transactional Memory is still comparably recent, and programmers are usually tasked with an unguided manual tuning of their transactional applications when facing efficiency problems. We propose a system in which code profiling in a simulated hardware implementation of Transactional Memory is used to characterize a transactional application, which forms the basis for the automated tuning of the underlying speculative system for the efficient execution of that particular application. We also propose a profile-guided approach to the scheduling of threads in a software-based implementation of Transactional Memory, using collected data to predict the likelihood of conflicts and determine what thread to schedule based on this prediction. We present the results achieved under both designs.
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Energy consumption and performance of HPC architecture for Exascale / Consumo de energia e desempenho de arquiteturas PAD para Exascale

Oliveira, Daniel Alfonso Gonçalves de January 2013 (has links)
Uma das principais preocupações para construir a próxima geração de sistemas PAD é o consumo de energia. Para quebrar a barreira de exascale a comunidade científica precisa investigar alternativas que possam lidar com o problema de consumo de energia. Sistemas PAD atuais não se preocupam com energia e já consomem GigaWatts. Requisitos de consumo de energia restringirão fortemente sistemas futuros. Nesse contexto processadores de alta potência abrem espaço para novas arquiteturas. Duas arquiteturas surgem no contexto de PAD. A primeira arquitetura são as unidades de processamento gráfico (GPU), GPUs possuem vários núcleos de processamento, suportando milhares de threads simultâneas, se adaptando bem a aplicações massivamente paralelas. Hoje alguns dos melhores sistemas PAD possuem GPUs que demonstram um alto desempenho por um baixo consumo de energia para várias aplicações paralelas. A segunda arquitetura são os processadores de baixo consumo, processadores ARM estão melhorando seu desempenho e mantendo o menor consumo de energia possível. Como exemplo desse ganho, projetos como Mont-Blanc apostam no uso de ARM para construir um sistema PAD energeticamente eficiente. Este trabalho visa verificar o potencial dessas arquiteturas emergentes. Avaliamos essas arquiteturas e comparamos com a arquitetura mais comum encontrada nos sistemas PAD atuais. O principal objetivo é analisar o consumo de energia e o desempenho dessas arquiteturas no contexto de sistemas PAD. Portanto, benchmarks heterogêneos foram executados em todas as arquiteturas. Os resultados mostram que a arquitetura de GPU foi a mais rápida e a melhor em termos de consumo de energia. GPU foi pelo menos 5 vezes mais rápida e consumiu 18 vezes menos energia considerando todos os benchmarks testados. Também observamos que processadores de alta potência foram mais rápidos e consumiram menos energia, para tarefas com uma carga de trabalho leve, do que comparado com processadores de baixo consumo. Entretanto, para tarefas com carga de trabalho leve processadores de baixo consumo apresentaram um consumo de energia melhor. Concluímos que sistemas heterogêneos combinando GPUs e processadores de baixo consumo podem ser uma solução interessante para alcançar um eficiência energética superior. Apesar de processadores de baixo consumo apresentarem um pior consumo de energia para cargas de trabalho pesadas. O consumo de energia extremamente baixo durante o processamento é inferior ao consumo ocioso das demais arquiteturas. Portanto, combinando processadores de baixo consumo para gerenciar GPUs pode resultar em uma eficiência energética superior a sistemas que combinam processadores de alta potência com GPUs. / One of the main concerns to build the new generation of High Performance Computing (HPC) systems is energy consumption. To break the exascale barrier, the scientific community needs to investigate alternatives that cope with energy consumption. Current HPC systems are power hungry and are already consuming Megawatts of energy. Future exascale systems will be strongly constrained by their energy consumption requirements. Therefore, general purpose high power processors could be replaced by new architectures in HPC design. Two architectures emerge in the HPC context. The first architecture uses Graphic Processing Units (GPU). GPUs have many processing cores, supporting simultaneous execution of thousands of threads, adapting well to massively parallel applications. Today, top ranked HPC systems feature many GPUs, which present high processing speed at low energy consumption budget with various parallel applications. The second architecture uses Low Power Processors, such as ARM processors. They are improving the performance, while still aiming to keep the power consumption as low as possible. As an example of this performance gain, projects like Mont-Blanc bet on ARM to build energy efficient HPC systems. This work aims to verify the potential of these emerging architectures. We evaluate these architectures and compare them to the current most common HPC architecture, high power processors such as Intel. The main goal is to analyze the energy consumption and performance of these architectures in the HPC context. Therefore, heterogeneous HPC benchmarks were executed in the architectures. The results show that the GPU architecture is the fastest and the best in terms of energy efficiency. GPUs were at least 5 times faster while consuming 18 times less energy for all tested benchmarks. We also observed that high power processors are faster than low power processors and consume less energy for heavy-weight workloads. However, for light-weight workloads, low power processors presented a better energy efficiency. We conclude that heterogeneous systems combining GPUs and low power processors can be an interesting solution to achieve greater energy efficiency, although low power processors presented a worse energy efficiency for HPC workloads. Their extremely low power consumption during the processing of an application is less than the idle power of the other architectures. Therefore, combining low power processors with GPUs could result in an overall energy efficiency greater than high power processors combined with GPUs.

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