Orientador : Prof. Dr. Renato Goldenberg / Coorientadora : Profª Drª Andrea Onofre de Araújo / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Botânica. Defesa: Curitiba, 23/02/2016 / Inclui referências / Resumo: A família Gesneriaceae possui cerca de 150 gêneros contendo 3000 espécies, tem distribuição pantropical e monofiletismo comprovado por evidências morfológicas e moleculares. Para o Brasil são registrados cerca de 200 espécies, com maior diversidade para a região sudeste do país onde se concentram a maior parte dos trabalhos florísticos já feitos para o grupo. No Paraná, onde não foi feito ainda nenhum levantamento florístico para a família, foram encontrados 7 gêneros: Besleria (1), Codonanthe (3), Gloxinia (1), Napeanthus (2), Nematanthus (6), Seemannia (1) e Sinningia (23). A maioria das espécies habitam áreas de Floresta Atlântica, com menos espécies em campos ou cerrado. Tendo em vista sintetizar a informação taxonômica sobre a família Gesneriaceae no Paraná, nesta dissertação são apresentados dois capítulos. No primeiro são apresentadas descrições, chaves de identificação, dados de distribuição, floração e ilustrações das espécies de Besleria, Codonanthe , Gloxinia, Napeanthus, Nematanthus e Seemannia do estado. No segundo capítulo é apresentado tratamento semelhante, desta vez para as espécies de Sinningia ocorrentes no Paraná. Palavraschave: Columneinae, Ligeriinae, Nematanthus , Taxonomia, Sinningia. / Abstract: Gesneriaceae is a monophyletic family with about 150 genera and 3000 species, and pantropical distribution. In Brazil there are more than 200 species, with greater diversity to the southeast of the country, where most floristic tratments on the family have been done. In Paraná there are seven genres with native or naturalized species: Besleria( 1), Codonanthe (3), Gloxinia (1), Napeanthus (2), Nematanthus (6), Seemannia (1) and Sinningia (23). Most species inhabit Atlantic Forest areas, with fewer species in grasslands or cerrado. In order to synthethize taxonomic information about the Gesneriaceae in Parana, this dissertation provide a treatment in two chapters. In the first we present descriptions, identification keys, data on distribution and phenology, and illustrations for the species of Besleria, Codonanthe, Gloxinia, Napeanthus, Nematanthus and Seemannia. In the second chapter we have a similar treatment on the species of Sinningia occurring in Paraná. Keywords:Columneinae, Ligeriinae, Nematanthus , Taxonomy, Sinningia .

Orientador : Prof. Dr. Renato Goldenberg / Coorientadora : Profª Drª Andrea Onofre de Araújo / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Botânica. Defesa: Curitiba, 23/02/2016 / Inclui referências / Resumo: A família Gesneriaceae possui cerca de 150 gêneros contendo 3000 espécies, tem distribuição pantropical e monofiletismo comprovado por evidências morfológicas e moleculares. Para o Brasil são registrados cerca de 200 espécies, com maior diversidade para a região sudeste do país onde se concentram a maior parte dos trabalhos florísticos já feitos para o grupo. No Paraná, onde não foi feito ainda nenhum levantamento florístico para a família, foram encontrados 7 gêneros: Besleria (1), Codonanthe (3), Gloxinia (1), Napeanthus (2), Nematanthus (6), Seemannia (1) e Sinningia (23). A maioria das espécies habitam áreas de Floresta Atlântica, com menos espécies em campos ou cerrado. Tendo em vista sintetizar a informação taxonômica sobre a família Gesneriaceae no Paraná, nesta dissertação são apresentados dois capítulos. No primeiro são apresentadas descrições, chaves de identificação, dados de distribuição, floração e ilustrações das espécies de Besleria, Codonanthe , Gloxinia, Napeanthus, Nematanthus e Seemannia do estado. No segundo capítulo é apresentado tratamento semelhante, desta vez para as espécies de Sinningia ocorrentes no Paraná. Palavraschave: Columneinae, Ligeriinae, Nematanthus , Taxonomia, Sinningia. / Abstract: Gesneriaceae is a monophyletic family with about 150 genera and 3000 species, and pantropical distribution. In Brazil there are more than 200 species, with greater diversity to the southeast of the country, where most floristic tratments on the family have been done. In Paraná there are seven genres with native or naturalized species: Besleria( 1), Codonanthe (3), Gloxinia (1), Napeanthus (2), Nematanthus (6), Seemannia (1) and Sinningia (23). Most species inhabit Atlantic Forest areas, with fewer species in grasslands or cerrado. In order to synthethize taxonomic information about the Gesneriaceae in Parana, this dissertation provide a treatment in two chapters. In the first we present descriptions, identification keys, data on distribution and phenology, and illustrations for the species of Besleria, Codonanthe, Gloxinia, Napeanthus, Nematanthus and Seemannia. In the second chapter we have a similar treatment on the species of Sinningia occurring in Paraná. Keywords:Columneinae, Ligeriinae, Nematanthus , Taxonomy, Sinningia .

Orientador : Hermogenes de Freitas Leitão Filho / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-14T01:56:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Semir_Joao_D.pdf: 27621912 bytes, checksum: 451224eaf0998d893efe723d1a545fde (MD5) Previous issue date: 1991 / Resumo: o gênero Lychnophora, como circunscrito no presente trabalho, consta de 68 espécies, em oposição aos 11 táxons registrados na última revisão. Destas, 27 espécies são novas para a ciência. Das demais, algumas espécies representam novas combinações, bem como táxons excluídos ou sinonimizados na última revisão. Não foi reconhecida nenhuma categoria infraespecífica, e as anteriormente descritas foram sinonimizadas. As espécies L. damazoi, L. itatiaiae, L. unicaulis e L. vanisschoti foram excluídas do gênero. Foi aceita a inclusão dos gêneros Lychnocephalus e Lychnophoriopsis em Lychnophora, como em trabalhos anteriores. Os gêneros Chronopappus, Haplostephium, Paralychnophora e Episcothamnus foram considerados como sinônimos, com suas espécies combinadas em Lychnophora. Parte das espécies de Piptolepis e duas espécies de Eremanthus (R. leucodendron e R.veadeiroensis) foram também combinadas no presente gênero. O gênero foi subdividido em seis seções: Lychnophora, Lychnophoriopsis, Lychnophorioides, Lychnocephaliopsis, Sphaeranthus e Chronopappus. Com base nas observações de campo e estudo de amplo material examinado de Herbários, foram propostas novas terminologias referentes aos hábitos, folhas e inflorescências. Além disto, novos caracteres morfológicos foram observados, sendo aqui referidos pela primeira vez. Desta forma, os caracteres distintivos de Lychnophora foram ampliados, bem como a sua variabilidade, para uma melhor circunscrição do gênero e seu real limite em relação aos demais gêneros da tribo Vernonieae. Lychnophora é considerado um gênero endêmico do Brasil, tendo as suas espécies uma distribuição restrita aos complexos rupestres de quartzito da Bahia, Goiás e Minas Gerais. As espécies apresentaram cinco padrões de distribuição, podendo ser encontradas: nas formações rupestres dos três Estados (L. salicifolia); em Minas Gerais e Goiás (L. ericoides); em Minas Gerais e Bahia (L. granmogolense, L. passerina e L. rosmarinifolia). As demais espécies ocorrem nos complexos rupestres de um determinado Estado ou são microendêmicas de uma localidade. Excluindo aquelas de distribuição restrita as espécies de Lychnophora geralmente apresentam populações disjuntas em várias localidades. As espécies de distribuição ampla revelaram-se mais polimórficas e as de distribuição restrita mais uniformes na sua macromorfologia. Foram relacionados os ambientes onde ocorre Lychnophora e são descritas as suas adaptações à seca, ao fogo e às geadas, que podem ocorrer nestes habitats. Considerações sobre as populações de Lychnophora bem como dados sobre a dispersão de aquênios são discutidos / Abstract: The genus Lychnophora, as here circumscribed, comprises 68 species, in contrast to the 11 taxa recognized in the last revision. There are 27 species new to science and some others represent new combinations and excluded or synonymized taxa from the previous revision. Infraspecific taxa were not recognized and those previously described were synonymized here. L. damazoi, L. itatiaiae, L. unicaulis and L. vanisschoti were excluded from the genus. The inclusion of the genera Lychnocephalus and Lychnophoriopsis in Lychnophora was accepted in agreement with previous studies. Beside these, Chronopappua, Haplostephium, Paralychnophora and Episcothamnus were also placed under Lychnophora. Some species of Piptolepsia and two species of Eremanthus (E.leucodendron e E.veadeiroenais) were also transfered to Lychnophora. Six sections are recognized: Lychnophora, Lychnophoriopsis, Lychnophorioides, Lychnocephaliopsis, Sphaeranthus and Chronopappus. On the basis of field observations and extensive studies of herbarium material, a new terminology is proposed for habit, leaf and inflorescence morphology. Moreover, new macromorphological characters were studied and are described here for the first time. Based on this new evidence, the generic circumscription of Lychnophora was widened and its boundaries redefined in relation to other genera of the tribe Vernonieae, making the genus a more natural assemblage. Lychnophora is a brazilian endemic genus and its species have a restricted distribution in the inland quartzite "rupestre" complex from Bahia, Goiás and Minas Geraie states. Five distribution patterns were recognized: species distributed in alI three states (L. salicifolia); species from Minas Gerais and Goiás (L. ericoides); species from Minas Gerais and Bahia (L. granmogolenae, L. passerina e L. rosmarinifolia); species that are restricted to one of the states and species microendemic to a given locality. The more widely distributed species usually have disjunct populations occurring in many localities. The more widely distributed species showed a broader range of macromorphological polymorphism whereas species with more restricted distributions had a more uniform morphological pattern. The environments where Lychnophora species occur and adaptation of these species to drought, fire and frost are discussed. The nature of Lychnophora species populations and achene dispersion are also discussed. / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Ciências Biológicas

CAVALCANTE, L. L. Malacofauna associada ao prado de Halodule wrightii Ascherson em Barra Grande, Piauí. Fortaleza, 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2015. / Submitted by Geovane Uchoa (geovane@ufc.br) on 2016-05-02T13:12:13Z No. of bitstreams: 1 2015_dis_llcavalcante.pdf: 1552595 bytes, checksum: 35c2d859b0f8083c0cc0ba1119608cd4 (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2016-06-14T19:39:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_dis_llcavalcante.pdf: 1552595 bytes, checksum: 35c2d859b0f8083c0cc0ba1119608cd4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-14T19:39:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_dis_llcavalcante.pdf: 1552595 bytes, checksum: 35c2d859b0f8083c0cc0ba1119608cd4 (MD5) Previous issue date: 2015 / The environment composed by Halodule wrightiiat coastal zone is very important for fish and invertebrate communities. Among invertebrates, mollusks are one of themost important groupin sea grass environments. The present study focused on quantitative and qualitative analysis of the mollusk community associated with seagrass patches of Halodule wrightii at Barra Grande (PI) beach, evaluating seasonal and spatial variation on characteristics of the seagrass bank and sediment in an attempt to explain variation on this community. Campaigns every two months were performed from Dec/2013 to Oct/2014 to collect samples of sediment, seagrass and mollusks at three seagrass patches located at intertidal zone. In the laboratory, samples were washed with a 0.05 mm mesh and mollusks specimens were screened and identified. We analyzed vegetal biomass, stems density and sediment properties (i.e. grain size, organic matter, percentage of mud). Despite of some biomass differences being observed, the bank properties showed no significant variation between dry and wet periods. We verified that there was significant variation in seagrass biomass but not in stem density among the patches. Sediment also showed variation between periods, in the grain size, and among patches in all evaluatedproperties. We have found 1476 individuals of gastropods, belonging to 25 species and representing 88.4% of all mollusks found at the seagrass bank. One polyplacophora species was registered too. TheBivalviataxon wasrepresented by189individuals, distributed in 24species, representing 11.3%of the mollusks associated to H. wrightii. The mollusks community studied showed significant variation on abundance, richness and composition between both, periods of the study and patches sampled. The results indicates that bivalve assemblage seems to respond more closely than gastropods to variation in seagrass bank parameters,such as vegetation biomass and stem density, mostly because of modifications caused by the bank on sediment properties. On the other hand, gastropods are more sensible to seasonal variations, like precipitation rate or intertidal dryness. Lastly, the seagrass bank composed by Halodule wrightii at Barra Grande showed to be one of most dense banks of Brazil and to have great importance to the associated mollusk fauna justifying the implementation offuther studies and inclusion of these ecosystems on the management plan of APA Delta do Parnaíba for better conservation of Piauí’s shore biodiversity. / O ambiente formado por Halodule wrightii na zona costeira é de grande importância para peixes e invertebrados. Dentre os invertebrados, os moluscos formam um dos mais importantes grupos nesse ambiente. O objetivo desse trabalho foi analisar quali-quantitativamente a malacofauna associada a manchas da angiosperma marinha H. wrightii na praia de Barra Grande- PI, avaliando variações sazonais e espaciais de aspectos do prado e do sedimento, objetivando explicar as variações na comunidade de Mollusca. Foram realizadas campanhas bimensais entre os meses de dezembro/2013 e outubro/2014, coletando-sedentro de três manchas na zona entremarés. Também foram coletadas amostras de sedimento dentro das manchas. Em laboratório, as amostras foram lavadas em malha 0,05mm e a malacofauna triada e identificada. Foram feitas análises da biomassa vegetal, densidade de hastes e análises granulométricas. O prado não apresentou diferenças significativas entre períodos seco e chuvoso, apesar de diferenças na biomassa terem sido observadas. Entre manchas, houve diferenças significativas na biomassa, mas não entre densidade de hastes. O sedimento apresentou diferenças significativas entre os períodos, para o tamanho do grão e para todos os parâmetros entre manchas. Para a fauna, foram encontrados um total de 1.476 indivíduos de gastrópodes, distribuídos em 25 espécies, representando 88,4% do total de moluscos encontrados. Foi registrada também uma espécie de Polyplacophora. Para Bivalvia foram encontrados 189 espécimes, distribuídos em 24 espécies, representando 11,3% dos moluscos associados. A comunidade, tanto de Gastropoda quanto Bivalvia, também mostrou variações na abundância, riqueza e composição de espécies entre períodos e entre manchas. Os resultados indicam que a comunidade de Bivalvia parece responder mais as características da mancha, como biomassa e densidade de hastes, do que Gastropoda, principalmente pela modificação exercida no sedimento. Gastropoda parece responder mais a variações sazonais, como precipitação, e locais, como dessecação na zona entremarés, do que Bivalvia. Por fim, o prado de H. wrightii em Barra Grande mostrou ser um dos mais densos no Brasil e com grande importância para a malacofauna a ele associada, justificando a condução de mais estudos e inclusão desse ecossistema no Plano de Manejo do APA Delta do Parnaíba, para melhor conservação da biodiversidade no litoral do Piauí.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Botânica, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2013. / Submitted by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2015-11-30T16:54:58Z No. of bitstreams: 1 2013_ThaísNogalesdaCostaVasconcelos.pdf: 4025956 bytes, checksum: 73141855a97ac408b03810198552ee96 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2016-01-25T13:34:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_ThaísNogalesdaCostaVasconcelos.pdf: 4025956 bytes, checksum: 73141855a97ac408b03810198552ee96 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-25T13:34:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_ThaísNogalesdaCostaVasconcelos.pdf: 4025956 bytes, checksum: 73141855a97ac408b03810198552ee96 (MD5) / A polinização é a grande responsável pelo controle da reprodução das angiospermas e um dos processos ecológicos mais importantes em ecossistemas terrestres. A polinização biótica, além de ser mais eficaz, também é responsável por uma maior taxa evolutiva em angiospermas, já que a pressão seletiva imposta por constantes mudanças na oferta de polinizadores estimula a especiação. Por ser uma interação tão importante, os pesquisadores tentam desvendar como ocorreu o surgimento da relação entre plantas e polinizadores na evolução das angiospermas. Dois tipo de padrões evolutivos são observados: espécies filogeneticamente próximas que compartilham estratégias de floração semelhantes e espécies pouco relacionadas que também compartilham de estratégias de floração semelhantes. É possível analisar como esses padrões evolutivos se comportam em um clado monofilético de plantas através de cálculos de sinal filogenético dos caracteres significativos e distâncias filogenéticas médias entre as espécies. Além disso, um outro padrão evolutivo é observado no display floral de vários grupos de plantas: um trade-off entre tamanho e número de flores por inflorescência, causado por um constraint nos recursos energéticos da floração. O objetivo desse trabalho foi estimar como eram as estratégias de floração e polinização dos primeiros representantes da ordem Myrtales e analisar padrões evolutivos nessas estratégias de floração, como contraints filogenéticos, evolução convergente e trade-off no display floral. Utilizamos, para isso, dados obtidos através da análise de exsicatas, literaturas específicas e especialistas, sobre doze características morfológicas em 99 espécies de Myrtales. Para as informações de filogenia, utilizamos dois marcadores moleculares de cloroplasto disponíveis no GenBank. Utilizando o método de reconstrução de caraceres ancestrais, estimamos que as flores das primeiras espécies de Myrtales eram generalistas e, provavelmente, adaptadas a polinização por insetos, dados parcialmente suportados pela análise de flores fósseis do período. Em seguida, utilizamos agrupamento por UPGMA para selecionar doze tipos florais em Myrtales a partir de dados morfológicos. Nossos resultados mostram que há uma forte carga filogenética na evolução desses tipos florais, demonstrado pelo alto valor de sinal filogenético de síndromes florais, e que tipos filogeneticamente próximos possuem uma probabilidade maior de adaptação entre si, assim como tipos morfologicamente mais próximos possuem uma maior probabilidade de compartilhar polinizadores similares. Por fim, nosso trabalho confirma a existência de um trade-off entre tamanho e número de flores por inflorescência no display floral, demonstrando, ainda, que características florais que aparentam ter um maior custo energético no display floral também são aquelas mais evolutivamente maleáveis. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Pollination is the main responsible factor for Angiosperm reproduction control and one of the most important ecological processes of terrestrial ecosystems. Biotic pollination, besides being more efficient, is also responsible for a higher evolutionary rate in Angiosperms, since the selective pressure imposed by constant changes in pollinator offer stimulates speciation. As this is such an important interaction, researchers have tried to unravel how the relationship between plants and pollinators arose during Angiosperm evolution. Two different types of evolutionary patterns emerge: phylogenetically close species that share similar floral strategies and distantly related species that also share similar floral strategies. It is possible to analise how these two patterns behave in a monophyletic clade of plants through the comparison of phylogenetic signal of significant characters and average phylogenetic distance between the species. Another evolutionary pattern observed is the trade-off that occurs in several groups of plants between flower size and numbers of flowers per inflorescence, caused by a constraint of energy resources available for flowering. The objective of this study is to estimate what were the flowering strategies of the first representatives of the order Myrtales and analise evolutionary patters in its flowering strategies, such as phylogenetic contraints, convergent evolution and trade-offs in floral display. We collected data by consulting herbarium specimens, specialized literature and taxonomic experts, regarding 12 norphological characters in 99 species of Myrtales. The phylogeny was infered using two chloroplast molecular markers available in GenBank. Our results show that the flowers of the first species of Myrtales were generalists and, probably, adapted to insect pollination, this data is partially supported by the analysis of fossil flowers of the period. The next step was to use UPGMA to group species of Myrtales in 12 floral types using morphological data. Our results also showes a strong phylogenetic signal in the evolution of floral syndromes in the order Myrtales, demonstrated by the high phylogenetic signal of floral types. Finally, our work confirms the existence of trade-off between size and number of flowers per inflorescence in floral display, demonstrating that the floral characters that apparently have a higher energetic cost in the floral display also appear to be most plastic from an evolutionary point of view.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2007. / Submitted by Priscilla Brito Oliveira (priscilla.b.oliveira@gmail.com) on 2009-12-01T21:18:45Z No. of bitstreams: 1 2007_ElizangelaRibeiroAlves.pdf: 4464733 bytes, checksum: e756a861e29908c763515fb403d25720 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2009-12-03T21:26:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_ElizangelaRibeiroAlves.pdf: 4464733 bytes, checksum: e756a861e29908c763515fb403d25720 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-12-03T21:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_ElizangelaRibeiroAlves.pdf: 4464733 bytes, checksum: e756a861e29908c763515fb403d25720 (MD5) Previous issue date: 2007 / Brachiaria é uma gramínea de grande importância econômica. No Brasil, são estimados 70 milhões de hectares cultivados com esta forrageira. Seu melhoramento e a ampliação da variabilidade genética são de grande importância para a sustentabilidade e crescimento da agropecuária no Brasil. Um dos entraves para o melhoramento Brachiaria é a presença da apomixia, modo de reprodução onde não há recombinação para a formação do embrião. A compreensão dos mecanismos que regulam a apomixia possibilitará a utilização desse modo de reprodução como ferramenta biotecnológica para fixar características agronômicas de interesse em espécies cultivadas. A ocorrência de apomixia em espécies, como as de Brachiaria, que conservaram a habilidade de se reproduzir por sexualidade permite estudos comparativos, tanto estruturais, quanto genéticos e moleculares. Comparações, ao longo do desenvolvimento, entre sacos embrionários de plantas sexuais e apomíticos poderão revelar as diferenças que irão especificar se um saco embrionário seguirá a via apomítica ou sexual. Neste trabalho foi comparada, por hibridização in situ, a expressão temporal e espacial de sete seqüências de cDNA em ovários de plantas sexuais e apomíticas de Brachiaria. Nas plantas apomíticas, o transcrito de BbrizREC foi detectado preferencialmente no meiócito, no momento imediatamente anterior à diferenciação de iniciais apospóricas, indicando que esse transcrito pode estar associado à morte programada do meiócito e ao aparecimento das iniciais apospóricas. Em momentos posteriores da diferenciação, precursores da fertilização, BbrizMYO, BbrizAQP, BbrizMAPK apresentaram expressão preferencial nas sinérgides, sugerindo o envolvimento de BbrizMYO e BbrizMAPK no processo de fertilização e de BbrizAQP na ativação da oosfera. Nas apomíticas peseudogâmicas o embrião é formado a partir do desenvolvimento autônomo da oosfera, mas a fertilização da célula central é necessária para formar o endosperma. O presente trabalho também contribuiu para o estabelecimento da técnica de fertilização in vitro em Brachiaria que permitirá, em condições controladas, avaliar o papel de diferentes genes no decorrer deste processo e assim contribuir à melhor compreensão da reprodução em angiospermas. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Brachiaria is a forage grass of great economic importance. In Brazil, an estimated area of 70 million hectares is cultivated with Brachiaria species. Improvement of breeding programs and genetic variability is very important for the culture and sustainability of pastures in Brazil. One of the barriers for Brachiaria improvement is the asexual mode of reproduction through seeds - apomixis. The understanding of the mechanisms that regulate apomixis makes possible its use in biotechnological programs to fix interesting agronomic characteristics in cultivated plants. Species that show both apomictic and sexual mode of reproduction allow morphological, genetic and molecular comparative studies. Analysis of embryo sac development from sexual and apomictic plants can report the differences that will specify the sexual or apomictic pathway. In the present work, the temporal and spatial expression of cDNA sequences was analyzed by in situ hybridization in ovaries of apomictic and sexual plants. BbrizREC was preferentially expressed in the meiocyte, just before apospore initials differentiation, suggesting its involvement in programmed cell death of the meyocite and appearance of apospore initials. Later on in the reproduction, before fertilization, BbrizMYO, BbrizAQP, BbrizMAPK were preferentially expressed in the synergids, suggesting that BbrizMYO and BbrizMAPK are concerned in this process and BbrizAQP in egg cell activation. In pseudogamic apomicts embryo is formed from autonomous development of the egg cell, but the central cell fertilization is required to form the endosperm. The present work contributed to establishing an in vitro fertilization technique in Brachiaria that will make possible, in controlled conditions, to evaluate the role of different genes along this process, contributing to a better understanding of reproduction in angiosperms.

Orientador: George J. Shepherd / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-21T10:22:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Torres_RoseliBuzanelli_D.pdf: 12444369 bytes, checksum: b2fdbd0db87134f3e3f82038d47dc9de (MD5) Previous issue date: 1996 / Resumo: Trema micrantha (L.) Blume (Ulmaceae) é uma árvore pioneira, que se distribui desde o sul dos Estados Unidos da América até a Argentina. Ocorre com freqüência nas fases iniciais da sucessão secundária das áreas desflorestadas do estado de São Paulo, geralmente em populações agregadas. Foram estudados vários aspectos da biologia da reprodução desta espécie, em duas populações naturais no município de Campinas (SP, Brasil) - uma na Reserva Municipal da Mata Santa Genebra (22º 49' 45" S e 47º 06' 33" W) e a outra, na mata Santa Elisa (220 55' S e 470 05' W). Foram feitas amostragens mensais da produção de flores de 27 árvores da mata Santa Genebra, durante 36 meses consecutivos. Na mata Santa Elisa foram acompanhadas 36 árvores e a amostragem mensal foi realizada durante 12 meses. Nesta última população também foram feitos testes para se verificar o modo de reprodução e coletas de sementes para testes de germinação. Observou-se que T. micrantha produz três tipos de flores: femininas, masculinas e hermafroditas, estas protogínicas, raras e esporádicas. Embora mortologicamente hermafroditas, várias destas flores eram funcionalmente masculinas, pois o ovário não continha óvulo. O acompanhamento da produção de flores permitiu identificar quatro fenótipos sexuais nas duas populações: 1) plantas femininas constantes, que só produzem flores femininas; 2) plantas femininas preferenciais, que produzem flores femininas e, às vezes, também flores masculinas em pequena proporção; 3) plantas masculinas preferenciais, que produzem flores masculinas e, de vez em quando, também flores femininas em taxas pequenas e 4) plantas hermafroditas crípticas, que iniciam a estação reprodutiva como masculinas ou monóicas e depois passam a preferencial ou totalmente femininas. As flores hermafroditas geralmente ocorrem nestas plantas hermafroditas crípticas. A proporção relativa dos quatro mortos sexuais foi equivalente nas duas populações, ou seja, as plantas femininas constantes constituíram 53 a 60% dos indivíduos e as hermafroditas crípticas, cerca de 36%. As plantas masculinas ou femininas preferenciais foram raras, com apenas um ou dois indivíduos de cada categoria, em cada uma das populações estudadas. A mudança sexual das plantas hermafroditas crípticas ocorreu geralmente no início da primavera (outubro), porém de forma assincrônica. Não foi possível estabelecer correlações claras entre os fatores climáticos e a expressão sexual das plantas hermafroditas crípticas, mas as temperaturas mínimas mostraram certa correlação com a mudança sexual observada nestas plantas. O exame de material herborizado mostrou um padrão de produção de flores masculinas e femininas ao longo do ano que é semelhante ao observado nas populações naturais estudadas, indicando que este comportamento reprodutivo pode ser característico da espécie como um todo. Não foram observadas diferenças significativas no tamanho inicial, na taxa de crescimento ou na sobrevivência entre as plantas femininas constantes e. as hermafroditas crípticas. As observações de campo sugerem que a espécie seja anemófila, uma condição comum entre as Ulmaceae. A análise dos grãos de pólen indicaram alta viabilidade (> 79,7%) e grande produção de grãos por flor (ca. de 110.800). Os testes de cruzamento indicaram que T. micrantha é uma espécie xenógama facultativa, podendo se reproduzir através de fecundação cruzada nas plantas femininas constantes ou de auto-fecundação, nas plantas hermafroditas crípticas durante a sua fase monóica. Também houve evidência de que pode ocorrer agamospermia, porém em proporção muito baixa, sendo necessários mais testes para a sua confirmação. Os testes com as sementes indicaram que a porcentagem de germinação é maior para as sementes dos frutos maduros (em relação às dos frutos verdes totalmente desenvolvidos), em tratamento de embebição em água destilada e sob temperaturas alternadas. Também observou-se que as sementes provenientes das plantas femininas constantes germinaram significativamente mais do que as das hermafroditas crípticas. São necessários mais testes, para se verificar se estes resultados são devidos à viabilidade ou à dormência diferencial das sementes das duas formas sexuais. Levantamento bibliográfico sobre o sistema de reprodução de outras espécies da família, para as regiões tropical e sub tropical do continente americano, indicou que a andromonoicia é a condição predominante, principalmente entre os gêneros com o maior número de espécies. Os resultados obtidos para T. micrantha são inéditos para espécies arbóreas neotropicais e de difícil comparação, devido à falta de trabalhos que abordem a sexualidade das plantas de forma quantitativa. Outra dificuldade adicional é a falta de uma terminologia uniforme que descreva estes fenômenos. É recomendável, portanto, um esforço para se uniformizar a terminologia e a metodologia de coleta de dados, em estudos de longo prazo e em populações naturais, pois é provável que o tipo de variação da expressão sexual observada neste estudo seja mais comum do que geralmente se reconhece / Abstract: Trema micrantha (L.) Blume (Ulmaceae) is a pioneering tree species with a distribution area extending from the southem United States to Argentina. It is frequent in the initial phases of secondary succession in deforested areas in São Paulo state, usually in densely crowded populations. Various aspects of the reproductive biology of this species were studied in two natural populations in the municipality of Campinas (SP, Brazil) - one in the Reserva Municipal da Mata de Santa Genebra (22°49'45"S and 47°06'33"W) and the other in the Mata Santa Elisa (22°55'S and 47°05'W). Monthly samples of flower production were taken from 27 trees at Santa Genebra during 36 consecutive months. At Santa Elisa, 36 trees were accompanied by monthly sampling for a 12 month period. This population was also used for tests of the breeding system and collection of seeds for germination experiments. It was observed that T. micrantha produces three types of flowers - temale, male and hermaphrodite, with the latter protogynous, rare and sporadic in occurrence. Although morphologically hermaphrodite, many of these flowers are functionally male since they lack ovules in their ovaries. Analysis of flower production suggests the presence of tour sexual phenotypes in both populations: 1) constant females, which only produce tem ale flowers; 2) preferential females which produce female flowers and, from time to time, a small proportion of male flowers; 3) preferential males which produce male flowers and, from time to time, female flowers in small proportions; 4) cryptic hermaphrodites which begin the reproductive season as males or monoecious plants and later become totally or preterentially female. Hermaphrodite flowers generally occur on the cryptic hermaphrodite plants. The relative proportions of the four morphs were very similar in the two populations with constant females accounting for 53-60% of the individuals and cryptic hermaphrodites around 36%. Preferential males and females were rare, with only one or two individuals in each category in each of the populations. The change in sexual expression in the cryptic hermaphrodites generally began in spring (October), but was asynchronous. It was not possible to establish a clear correlation between climatic factors and sexual expression in the cryptic hermaphrodites, although minimum temperature showed some correlation. Examination of herbarium material showed a similar pattern of sex expression during the year and suggests that the pattern observed in the Campinas populations may be typical for the species as a whole. No significant differences were detected in initial size, growth rate or survival between constant females and cryptic hermaphrodites. Field observations suggest that the species is anemophilous, a common condition in the Ulmaceae. Observations of pollen grains showed high viability (> 79%) and abundant production of pollen (approx. 110,800 grains per male flower). Crossing experiments suggest that T. micrantha plants are facultatively outcrossed, with obligatory outcrossing in the constant females and possible selfing in the cryptic hermaphrodites, at least in their monoecious phase. There was also some evidence for occurrence of agamospermy, but if this does occur, it is only at I__ frequency, and needs to be confirmed. Germination tests indicate a higher germination rate for mature seeds (as opposed to fully developed but green fruits), preimbibition in distilled water and altemating temperatures. Seeds from constant females showed significantly higher germination rates than those from cryptic hermaphrodites. More tests are necessary to determine whether this was due to different viability rates or to differences in dormancy between the two morphs. A survey of data from the literature showed that andromonoecy was the predominant condition reported for the majority of the species of Ulmaceae occurring in the tropical and subtropical regions of the Americas, especially in the genera with larger numbers of species. The data obtained for T. micrantha suggest a system which has not previously been reported for neotropical tree species and, indeed, appears to be very rare with only a few similar cases reported in the literature. The results are, however, very difficult to compare with other studies because of the lack of investigations which treat sexual expression in plants quantitatively. The absence of an adequate terminology to describe these more complex systems of sex expression is an additional difficulty. It is recommended, therefore, that an attempt should be made to standardize terminology and methodology for data collection together with an increase in longer term studies of natural populations, since it is likely that the type of variation in sex expression observed in this study is more common than is generally recognized. / Doutorado / Doutor em Ciências

Orientador: Angela Borges Martins / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-26T04:57:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Goldenberg_Renato_D.pdf: 35550881 bytes, checksum: e4503f005285566b74fcf2a699f9faa7 (MD5) Previous issue date: 2000 / Doutorado / Doutor em Biologia Vegetal

Orientador : Michael Georges Albert Vincentz / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T21:57:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Correa_LuizGustavoGuedes_M.pdf: 1325278 bytes, checksum: f7f714047563af533df52eaada63e5bd (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: O Crescimento e desenvolvimento de todos os organismos dependem de uma regulação adequada da expressão gênica. A expressão gênica diferencial resulta do controle da taxa de iniciação da transcrição por fatores de transcrição. Os fatores de transcrição do tipo bZIP foram descritos em todos os eucariotos. Seu domínio conservado é constituído de uma região rica em aminoácidos básicos que se ligam às bases do DNA, e o zíper de leucinas, responsável pela dimerização. Análises genéticas, moleculares e bioquímicas indicam que os bZIPs são importante reguladores de processos específicos de angiospermas. A identificação de possíveis grupos de genes ortólogos (PoGOs) a partir de diferentes linhagens evolutivas permite racionalizar estudos funcionais. Dentro deste contexto, o presente trabalho visa um melhor conhecimento sobre a evolução e função dos fatores de transcrição do tipo bZIP em angiospermas. Identificamos um conjunto não redundante de 77 bZIPs no genoma de Arabidopsis e 113 no genoma de Oryza sativa. Análises filogenéticas entre o conjunto de Oryza e Arabidopsis permitiram identificar 11 grupos de genes homólogos. Análises mais detalhadas levaram à identificação de 33 PoGOs, que possivelmente representam 33 funções ancestrais de angiospermas, além de um PoGO exclusivo a monocotiledôneas e um possível grupo de parálogos exclusivo a Arabidopsis. Baseado no conjunto de resultados apresentado, propomos uma classificação atualizada das bZIP de angiospermas e um modelo evolutivo das mesmas. Esta abordagem está abrindo novas perspectivas para o estudo funcional de bZIPs. Ensaios de expressão transiente de fusões traducionais de AtbZIP76 e AtbZIP78 com RFP em células de cebola mostram que estes bZIPs são direcionados ao núcleo, apesar de possuírem um domínio básico defectivo / Abstract: Growth and development of all organisms depend on proper regulation of gene expression. Differential gene expression is the result of the control of transcription initiation rates by transcription regulation factors. bZIP transcription factors were described in all eukaryotes. Their conserved domain is constituted by a basic aminoacids rich region that bond to DNA bases, and a leucine zipper, responsible for dimerization. Genetic, molecular and biochemical analysis indicate that bZIP factors are important regulator of specific angiosperm processes. Identification of possible groups of orthologous genes (PoGO) from different evolutionary lineages allows rationalizing functional studies. Within this context, the present work aims a better knowledge of the evolution and function of bZIP transcription factors in angiosperms. We identified a non-redundant set of 77 bZIP factors in the Arabidopsis genome and 113 bZIP in Oryza sativa genome. Phylogenetic analysis of Oryza and Arabidopsis sets of bZIP allowed identifying 11 groups of homologue genes. More detailed analysis led to the identification of 33 PoGOs, that possibly correspond to 33 ancestral functions in angiosperms, a exclusive monocot PoGO and a possible groups of paralogous genes in Arabidopsis. Based on the results presented here, we propose an updated bZIP classification and a model of their evolution. This approach is revealing new perspectives on bZIP functional studies. Transient expression essays of traductional fusions of AtbZIP76 and AtbZIP78 with RFP in onion cells show that these bZIPs do target the nucleus, despite their defective basic domain / Mestrado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Botânica, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2016. / Submitted by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2016-05-31T20:40:49Z No. of bitstreams: 1 2016_MarceloKuhlmannPeres.pdf: 5403784 bytes, checksum: c4d8c21f8773a215af1b0fd906863c0b (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-05-31T20:41:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_MarceloKuhlmannPeres.pdf: 5403784 bytes, checksum: c4d8c21f8773a215af1b0fd906863c0b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-31T20:41:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_MarceloKuhlmannPeres.pdf: 5403784 bytes, checksum: c4d8c21f8773a215af1b0fd906863c0b (MD5) / A dispersão de sementes é processo chave no ciclo de vida das plantas e entender esse processo em comunidades naturais, de um ponto de vista ecológico e evolutivo, pode ajudar a prever fatores ambientais necessários para a reprodução e sobrevivência da vegetação, auxiliando trabalhos de conservação e recuperação de áreas degradadas, como aquelas presentes no bioma Cerrado. No entanto, pouco ainda se sabe sobre a influência das diferentes estratégias de dispersão das plantas na constituição florística desse bioma megadiverso e na evolução e regeneração natural dos seus diferentes tipos de vegetação. Com base nisso, esse estudo teve como objetivo entender como as angiospermas das formações florestais, savânicas e campestres do bioma Cerrado se apresentam em termos de dispersão de sementes e as interações com animais frugívoros num contexto ecológico e filogenético. Para tanto, trabalhamos com as espécies da flora e da fauna do Distrito Federal, região bastante representativa sobre a biodiversidade do Cerrado, para responder questões relacionadas à evolução das estratégias de dispersão no bioma. Foi investigada a distribuição das diferentes síndromes de dispersão e das diferentes categorias de frutos nas formas de vida e formações da vegetação do bioma. Também foi testado o sinal filogenético das síndromes e tipos de frutos para avaliar a conservação evolutiva dessas características, com base em uma árvore filogenética para gêneros de angiospermas do Cerrado. Ainda, foram construídas potenciais redes de interações planta-frugívoros, com ampla representatividade de táxons do bioma. Os resultados encontrados mostraram que a distribuição das diferentes síndromes de dispersão e tipos de diásporos foi significativamente associada às diferentes formações do bioma, mas, principalmente, às formas de vida mais encontras nessas formações. Também foi observado entre as espécies e gêneros analisados a proporção de 1:1:1, entre zoocoria, anemocoria e autocoria, aparentando que as síndromes estão distribuídas de modo equilibrado nas formações do Cerrado. Espécies zoocóricas e animais frugívoros estiveram associados principalmente às formações florestais e houve predomínio de interações fruto-aves nas redes. As redes foram significativamente modulares e altamente generalistas, com os módulos diferenciando-se entre eles principalmente quanto ao tamanho dos diásporos e porte dos frugívoros. Os testes de sinal filogenético resultaram em valores altos (próximo a “1”) para as síndromes zoocoria, anemocoria e autocoria e para os tipos de frutos, indicando que essas características parecem ter sido filogeneticamente conservadas ao longo da história evolutiva das angiospermas. No entanto, entre as síndromes zoocóricas, especificamente, e os módulos das redes de interações, foram verificados baixos valores de sinal filogenético, indicando que interações planta-frugívoross tendem a ser mais maleáveis evolutivamente, de modo que diferentes animais são capazes de interagir com frutos de diferentes linhagens das angiospermas. Por último, foi construída uma chave interativa de múltiplas entradas, ricamente ilustrada, com acesso gratuito pela internet, para identificação de gêneros e espécies de frutos do Cerrado que são atrativos para fauna. De maneira geral, esse estudo relacionou alta representatividade da flora e da fauna frugívora (aves e mamíferos) nas diferentes formações da vegetação do Cerrado, fornecendo visão geral sobre a funcionalidade das diferentes estratégias de dispersão das plantas do bioma do ponto de vista ecológico e filogenético. Assim, espera-se que estas informações possam ser úteis para compor planos de manejo e de recuperação de áreas degradas nessa região neotropical megadiversa. _________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Seed dispersal is a key process in the life cycle of plants and understanding this process in natural communities from ecological and evolutionary perspectives can help predict environmental factors necessary for reproduction and survival of the vegetation, assisting programs of conservation and restoration of degraded areas such as those present in the Cerrado biome. However, little is known about the influence of different plant dispersal strategies in floristic constitution of this mega-diverse biome and in the evolution and natural regeneration of its different types of vegetation. Based on that, this study aimed to understand how the angiosperms of forest, savanna and grassland formations of the Cerrado biome are shown in terms of seed dispersal and interactions with fruit-eating animals in an ecological and phylogenetic context. For that, we work with the species of flora and fauna of the Brazilian Federal District, a core centre on Cerrado biodiversity, to answer questions related to the evolution of dispersal strategies in the biome. We investigated the distribution of different syndromes and the different categories of fruits between the life forms and vegetation formations of the biome. In addition, to testing the phylogenetic signal of these syndromes and fruit types and assess the evolutionary conservation of these traits, we constructed a phylogenetic tree for angiosperm genera in Cerrado. Furthermore, potential and highly diverse plant-frugivore networks were constructed. The results showed that the distribution of different dispersal syndromes and fruit types was significantly associated with the different formations of the biome, but mainly with the life forms most commonly found in these formations. It was also observed between species and genus analyzed the ratio of 1: 1: 1 between zoochory, anemochory and autochory, appearing that these syndromes are distributed evenly in the biome. Zoochoric species and fruit-eating animals were associated mainly to forests and there was a predominance of fruit-bird interactions. The networks were significantly modular and highly generalists, with modules differing from each other mainly on size of diaspores and size of frugivores. Phylogenetic signal tests resulted in higher values (close to "1") for zoochory, anemochory and autochory syndromes and fruit types, indicating that these characteristics seem to be phylogenetically conserved throughout evolutionary history of angiosperms. However, among zoochorous syndromes specifically and modules of networks, were verified low phylogenetic signal values, indicating that plant-frugivore interactions tend to be more flexible evolutionarily, so that different animals are able to interact with fruits of different lineages of angiosperms. Finally, we constructed an illustrated interactive key of multiple entries, with free internet access, for identification of genus and species of fruits of the Cerrado that are attractive to wildlife. Overall, this study related high representation of flora and frugivorous fauna (birds and mammals) in the different formations of the Cerrado vegetation, providing an overview of the functionality of different dispersal strategies of the biome plants from an ecological and phylogenetic perspective. We expected that this information can be useful for management and plans of recovery of degraded areas in this megadiverse Neotropical region.