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Bioprospecção, estudos bioquímicos de enzimas oxidativas e seu sinergismo com celulases na hidrólise de biopolímeros / Bioprospecting, biochemical studies of oxidative enzymes and their synergism with cellulases in the hydrolysis of biopolymersLeite, Ana Elisa Tognoli 19 July 2017 (has links)
A demanda por fontes renováveis de energia juntamente com o esgotamento das reservas de combustíveis fósseis e do aquecimento global tem despertado grande interesse. A degradação da biomassa lignocelulósica para a produção de biocombustíveis tem se revelado uma alternativa viável, contudo tem enfrentado desafios em função de sua recalcitrância. Novos preparados enzimáticos envolvendo não só celulases com mecanismo hidrolítico, mas também proteínas com atividade auxiliares têm sido desenvolvidas e comercializadas. Contudo a adição de enzimas oxidativas nestes coquetéis ainda é passível de desenvolvimento e otimização. Nesse âmbito, o objetivo desse trabalho foi analisar três possíveis abordagens para a resolução desse problema. A primeira através do isolamento de fungos filamentosos de compostagem com o intuito de obter novas enzimas com função oxidativa. A segunda, constituiu o estudo de sinergismo de uma enzima acessória da família GH43 com o coquetel enzimático industrial Accellerase e a terceira no estudo da enzima oxidativa monooxigenases lítica de polissacarídeo (Lpmo) assim como sua interação sinérgica com uma endoglucanase de Trichoderma harzianum. A atividade celulolítica dos fungos foi determinada por análise do halo hidrolítico, assim como por reações enzimáticas utilizando substratos específicos. Os potenciais fungos produtores de enzimas oxidativas foram identificados por amplificação e sequenciamento da região ITS3. Dezesseis fungos foram isolados e testados, destes três apresentaram atividade positiva para a enzima lacase. O sequenciamento revelou que todos os fungos pertencem à mesma espécie patogênica Scedosporium prolificans, A enzima BlAbn1 (GH43) foi expressa em células de E. coli (BL21) e purificada para análise do sinergismo com o coquetel enzimático Accellerase em diferentes condições como sinergismo sequencial ou simultâneo, diferentes pH´s, tempo de reação e concentração enzimática. No sinergismo simultâneo e análises em pH 5 e pH 8 a taxa de sinergismo encontrada foi muito baixa apenas 4 %. Contudo no sinergismo sequencial com diferentes tempos e concentrações enzimáticas foi encontrado um aumento de 30 % na liberação de açúcares redutores na reação de 20 horas, mostrando que há ação sinérgica. O estudo da enzima oxidativa Lpmo foi realizado utilizando a enzima purificada após expressão heteróloga em Aspergillus nidulans. Análises com diferentes substratos e doadores de elétrons assim como sinergismo com uma endoglucanases foram realizados. Ácido ascórbico e pirogalol apresentaram-se como doadores de elétrons utilizando celulose amorfa (PASC), xilano e arabinoxilano como substratos. Ação sinérgica entre a endoglucanase e Lpmo foi observada, apresentando um aumento na liberação de açúcares redutores na ordem de 15 %. Em habitats naturais os microrganismos produtores de enzimas hidrolíticas e auxiliares apresentam ação sinérgica como demonstrado para enzimas da família GH43 com coquetéis enzimáticos e de enzimas oxidativas com endoglucanases. Este efeito pode ser explorado e utilizado na melhora da composição dos coquetéis enzimáticos dedicados á produção de biocombustíveis lignocelulósicos. / The demand for renewable energy sources coupled with the depletion of fossil fuel reserves and global warming has aroused great interest. The degradation of lignocellulosic biomass for the production of biofuels has proved to be a viable alternative, however it has faced challenges due to its recalcitrance. New enzymatic preparations involving not only cellulases with a hydrolytic mechanism, but also proteins with an auxiliary activity have been developed and commercialized. However the addition of oxidative enzymes in these cocktails is still amenable to development and optimization. In this context, the objective of this work was to analyze three possible approaches to solve this problem. The first one through the isolation of filamentous fungi from composting in order to obtain new enzymes with oxidative function. The second was the synergism study of an accessory enzyme of the GH43 family with the industrial enzymatic cocktail Accellerase and the third in the study of lytic polysaccharide monooxygenases (Lpmo) oxidative enzyme as well as its synergistic interaction with a Trichoderma harzianum endoglucanase. The cellulolytic activity of the fungi was determined by analysis of the hydrolytic halo, as well as by enzymatic reactions using specific substrates. Potential fungi producing oxidative enzymes were identified by amplification and sequencing of the ITS3 region. Sixteen fungi were isolated and tested, of these three showed positive activity for the lacase enzyme. Sequencing revealed that all fungi belong to the same pathogenic species Scedosporium prolificans. The enzyme BlAbn1 (GH43) was expressed in E. coli cells (BL21) and purified for synergism analysis with the enzymatic cocktail Accellerase under different conditions such as sequential synergism or Different pH, reaction time and enzymatic concentration. In simultaneous synergism and analyzes at pH 5 and pH 8 the synergism rate found was very low, only 4%. However in the sequential synergism with different times and enzymatic concentrations a 30% increase in the release of reducing sugars in the reaction of 20 hours was found, showing that there is synergistic action. The study of the oxidative enzyme Lpmo was performed using the enzyme purified after heterologous expression in Aspergillus nidulans. Analyzes with different substrates and electron donors as well as synergism with an endoglucanase were performed. Ascorbic acid and pyrogallol were presented as electron donors using amorphous cellulose (PASC), xylan and arabino-xylan as substrates. Synergistic action between endoglucanase and Lpmo was observed, with an increase in the release of reducing sugars approximately 15%. In natural habitats, the microorganisms producing hydrolytic and auxiliary enzymes present synergistic action as demonstrated for enzymes of the GH43 family with enzymatic cocktails and oxidative enzymes with endoglucanases. This effect can be exploited and used in improving the composition of the enzymatic cocktails dedicated to the production of lignocellulosic biofuels.
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Regressão binária bayesiana com o uso de variáveis auxiliares / Bayesian binary regression models using auxiliary variablesFarias, Rafael Braz Azevedo 27 April 2007 (has links)
A inferência Bayesiana está cada vez mais dependente de algoritmos de simulação estocástica, e sua eficiência está diretamente relacionada à eficiência do algoritmo considerado. Uma prática bastante utilizada é a introdução de variáveis auxiliares para obtenção de formas conhecidas para as distribuições {\\it a posteriori} condicionais completas, as quais facilitam a implementação do amostrador de Gibbs. No entanto, a introdução dessas variáveis pode produzir algoritmos onde os valores simulados são fortemente correlacionados, fato esse que prejudica a convergência. O agrupamento das quantidades desconhecidas em blocos, de tal maneira que seja viável a simulação conjunta destas quantidades, é uma alternativa para redução da autocorrelação, e portanto, ajuda a melhorar a eficiência do procedimento de simulação. Neste trabalho, apresentamos propostas de simulação em blocos no contexto de modelos de regressão binária com o uso de variáveis auxiliares. Três classes de funções de ligação são consideradas: probito, logito e probito-assimétrico. Para as duas primeiras apresentamos e implementamos as propostas de atualização conjunta feitas por Holmes e Held (2006). Para a ligação probito-assimétrico propomos quatro diferentes maneiras de construir os blocos, e comparamos estes algoritmos através de duas medidas de eficiência (distância média Euclidiana entre atualizações e tamanho efetivo da amostra). Concluímos que os algoritmos propostos são mais eficientes que o convencional (sem blocos), sendo que um deles proporcionou ganho superior a 160\\% no tamanho efetivo da amostra. Além disso, discutimos uma etapa bastante importante da modelagem, denominada análise de resíduos. Nesta parte adaptamos e implementamos os resíduos propostos para a ligação probito para os modelos logístico e probito-assimétrico. Finalmente, utilizamos os resíduos propostos para verificar a presença de observações discrepantes em um conjunto de dados simulados. / The Bayesian inference is getting more and more dependent of stochastic simulation algorithms, and its efficiency is directly related with the efficiency of the considered algorithm. The introduction of auxiliary variables is a technique widely used for attainment of the full conditional distributions, which facilitate the implementation of the Gibbs sampling. However, the introduction of these auxiliary variables can produce algorithms with simulated values highly correlated, this fact harms the convergence. The grouping of the unknow quantities in blocks, in such way that the joint simulation of this quantities is possible, is an alternative for reduction of the autocorrelation, and therefore, improves the efficiency of the simulation procedure. In this work, we present proposals of simulation using the Gibbs block sampler in the context of binary response regression models using auxiliary variables. Three class of links are considered: probit, logit and skew-probit. For the two first we present and implement the scheme of joint update proposed by Holmes and Held (2006). For the skew-probit, we consider four different ways to construct the blocks, and compare these algorithms through two measures of efficiency (the average Euclidean update distance between interactions and effective sample size). We conclude that the considered algorithms are more efficient than the conventional (without blocks), where one of these leading to around 160\\% improvement in the effective sample size. Moreover, we discuss one important stage of the modelling, called residual analysis. In this part we adapt and implement residuals considered in the probit model for the logistic and skew-probit models. For a simulated data set we detect the presence of outlier used the residuals proposed here for the different models.
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Construções com o verbo acabar em português brasileiro / Constructions with the verb acabar in brazilian portugueseRodero, Aline Garcia 30 June 2010 (has links)
Neste trabalho, propomos uma análise do verbo acabar e de algumas das sentenças em que ele pode aparecer à luz de modelos formais para a análise linguística. Buscamos investigar as características sintático-semânticas dessas sentenças e procuramos identificar que tipo de estrutura sintática melhor representa sua formação. Travaglia (2004b) discute a poligramaticalização do verbo acabar e mostra que esse verbo está se gramaticalizando em sentidos diferentes. Esse autor aponta sete valores gramaticais em diferentes estágios de gramaticalização para tal verbo, além do sentido como verbo pleno. Sugerimos uma redução das oito possibilidades de interpretação de acabar sugeridas por Travaglia a cinco, pois quatro dos exemplos diferenciados por aquele autor parecem permitir uma mesma leitura. Nas sentenças que analisamos nesta dissertação, fazemos um recorte abrangendo o verbo acabar que traz uma idéia de resultado ou fase final de um evento, com uma leitura algo aconteceu e, no final das contas, a situação terminou de tal forma. Vários testes foram feitos para definir o estatuto desse verbo, como auxiliar ou como aspectualizador, porém esses testes não apontam para uma mesma direção. Observamos que acabar não apresenta um comportando uniforme, ora comportando-se como um verbo auxiliar, ora como um aspectualizador. Apesar do grande número de características que observamos para esse verbo comportando-se como um auxiliar, o consideramos como um aspectualizador (na terminologia de Wachowicz (2005, 2007)), principalmente pelo fato de operar sobre o intervalo de tempo denotado pelo verbo principal, restringindo esse intervalo para sua fase final ou para seu resultado, que é uma forte característica dos aspectualizadores, conforme Lunguinho (2005, 2009) e Wachowicz (2005, 2007). Esse verbo apresenta todas as características de alçamento perante os testes propostos por Davies & Dubinsky (2004). O verbo acabar está selecionando uma proposição em todos os exemplos em foco neste trabalho, uma small clause, e o sujeito lógico da predicação no núcleo dessa small clause alça para a posição de sujeito superficial. O verbo acabar funciona como um verbo inacusativo, selecionando apenas um argumento interno, no caso, uma SC. Ferreira (2009) prevê que um verbo inacusativo funcione como uma construção de alçamento. Essa autora considera os auxiliares como um subgrupo dos verbos inacusativos e esses, por sua vez, como um subgrupo dos verbos de alçamento. Por conta disso, prevemos que acabar esteja em uma intersecção entre os subgrupos de verbos inacusativos que selecionam uma SC, um CP, um DP e os verbos auxiliares, já que apresenta algumas características desse último. Comparamos as propriedades de acabar com algumas propriedades das passivas das línguas naturais, como discutido em Jaeggli (1986). Duas das propriedades das passivas das línguas naturais são também propriedades dos verbos inacusativos e, logo, dos verbos de alçamento: i) o NP na posição de sujeito não recebe papel-; e ii) o NP na posição de VP não recebe Caso verbal. Então, essas propriedades se verificam tanto para as passivas quanto para o verbo acabar, porém de formas um pouco diferentes. Sendo assim, essas construções podem ter uma mesma leitura, mas não a mesma estrutura sintática. É possível estabelecer uma relação entre as sentenças passivas e as estruturas de alçamento em que acabar pode ocorrer, devido ao fato de verbos auxiliares e inacusativos apresentarem propriedades de verbo de alçamento, como explicado em Ferreira (2009). Além disso, passivas podem apresentar algumas características comuns àquelas construções. Assim, obtemos uma leitura parecida para todas essas construções. / In this dissertation, we offer an analysis of the verb acabar and some sentences in which it can figure according to the formal linguistics. We investigate the syntactic-semantic characteristics of these sentences and try to identify what kind of syntactic structure best represents them. Travaglia (2004b) discusses the poligrammaticalization of the verb acabar and shows that this verb is grammaticalizing in different ways. This author shows seven grammar values in different levels of grammaticalization for this verb, besides its meaning as a lexical verb. We suggest a reduction of these eight possibilities to interpret acabar into five, since four examples analysed in different ways by that author seems to allow a same reading. In the sentences we analyse in this dissertation, we reduce the scope of our investigation only to the verb acabar that brings an idea of an event result or final phase, bringing a reading like: something happened and, by the end, the situation ended up like this. Many tests were done to define this verb as an auxiliary or aspectualizer, but these tests dont show the same results. We observe that acabar dont exhibit an uniform behaviour, sometimes working as an auxiliary verb, other times as an apectualizer. In spite of the great range of characteristics that we observe for this verb behaving as an auxiliary, we consider it an aspectualizer (following Wachowicz (2005, 2007)), mainly due to the way it works over the time interval expressed by the main verb, restricting this interval to its final phase or to its result, that is a strong characteristic for the aspectualizers, according to Lunguinho (2005, 2009) and Wachowicz (2005, 2007). This verb shows all raising characteristics according to the tests proposed by Davies & Dubinsky (2004). The verb acabar is selecting a proposition in all of the examples in focus on this dissertation, a small clause, and the logical subject of the predicate in the nucleus of this small clause raises to a superficial subject position. The verb acabar works as an unnacusative verb, selecting only one internal argument, in this case, a SC. Ferreira (2009) assumes that an unnucusative verb behaves as a raising structure. This author considers auxiliaries as a subgroup of the unnacusatives, and the later verbs, as a subgroup of the raising verbs. For this reason, we assume that acabar is in crossroads between unnacusative verbs subgroup that selects a SC, a CP, a DP and the auxiliary verbs, since it shows some characteristics of these verbs. We compare the properties of acabar with some properties of passives in natural languages, as discussed in Jaeggli (1986). Two of the three properties of passives in natural languages are also the properties of unnacusative verbs and, consequently, of raising verbs: i) the NP in the subject position doesnt receive a -role; and ii) the NP in the position of VP doesnt receive structural Case. So, these properties are true not only for the passives, but also for the verb acabar, but in different ways. Then, these constructions can have the same reading, but not the same syntactic structure. It is possible to establish a relation between these passive sentences and the raising structures in which acabar can occur, in spite of the fact that auxiliary verbs and unnacusatives present properties of raising verbs, as discussed in Ferreira (2009). Besides, passives can present some characteristics common to that constructions. Then, we get a similar reading to all of these constructions.
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Determinação do papel estrutural que proteínas auxiliares exercem para ativação das glicosiltransferases na biossíntese de antibióticos macrolídeos. / Determining the structural role that auxiliary proteins have upon activation of glycosyltransferase in the biosynthesis of macrolide antibiotics.Sá, Larissa Antelo de 10 November 2017 (has links)
Produtos naturais constituem uma das principais fontes de moléculas bioativas que possuem diversas aplicabilidades. Dentre os produtos naturais, policetídeos representam uma ampla classe de compostos estruturalmente diversos cuja atividade biológica, muitas vezes está relacionada com os grupos funcionais que estão ligados ao seu esqueleto central (aglicona). Os macrolídeos representam uma classe de antibiótico amplamente utilizado e são um exemplo de policetídeos cuja atividade é dependente de moléculas de açúcares. As enzimas que realizam a glicosilação de policetídeos são as glicosiltransferases, as quais apresentam uma especificidade estrita para 6-desoxiaçúcares, porém uma especificidade relaxada para açúcares não usuais e substratos aceptores. Estudar essa flexibilidade catalítica das glicosiltransferases de produtos naturais pode contribuir para a geração de novos compostos através de glicodiversificação. Esses novos compostos podem apresentar novas atividades biológicas e propriedades farmacocinéticas melhoradas. Além da especificidade relaxada, existe um pequeno grupo de glicosiltransferases que possui um comportamento peculiar no qual uma proteína auxiliar é necessária para sua atividade catalítica, por exemplo o par TylM2/TylM3 envolvidos na biossíntese do antibiótico macrolídeo tilosina em Strepromyces fradiae. Estudar a interação e as mudanças conformacionais que ocorrem durante a formação do complexo glicosiltransferase-proteína auxiliar é fundamental para entender a influência que essas as proteínas auxiliares exercem sobre as glicosiltransferases, e com isso gerar informações que possam ser úteis na aplicação de glicodiversificação. Neste trabalho foi realizado a sublonagem de genes sintéticos que codificam a glicosiltransferase TylM2 e a proteína auxiliar TylM3 e as proteínas recombinantes foram produzidas e purificadas. Além disso foram realizadas técnicas de caracterização estrutural para proteína TylM2 no qual essa glicosiltransferase parece formar um tetrâmero em solução na ausência de sua proteína auxiliar. Ensaios de cristalização com TylM2 rendeu cristais que difratam a uma resolução abaixo de 3,0Å, mesmo após tentativas de otimização, que dificultam a determinação de sua estrutura A criação de modelos teóricos por modelagem comparativa para TylM2 e TylM3 permitiu uma investigação sobre possíveis diferenças entre a TylM2 e suas homólogas. / Natural products compose one of the main sources of bioactive molecules that have several applications. Amongst natural products, polyketides represent a broad class of structurally diverse compounds whose biological activity is often related to the functional groups that are linked to their central skeleton (aglycone). Macrolides represent a class of widely used antibiotic and are an example of polyketides whose activity is dependent on sugar molecules. The enzymes that perform the glycosylation of polyketides are glycosyltransferases, which have a strict specificity for 6-deoxy sugars, but a relaxed specificity for unusual sugars and acceptor substrates. Studying this catalytic flexibility of glycosyltransferases of natural products may contribute to the generation of novel compounds through glycodiversification. These novel compounds may exhibit new biological activities and improved pharmacokinetic properties. In addition to the relaxed specificity, there is a small group of glycosyltransferases who have a peculiar behavior in which an auxiliary protein is required for its catalytic activity, an example of such is the TylM2 / TylM3 pair involved in the biosynthesis of the macrolide antibiotic tylosin in Strepromyces fradiae. Studying the interaction and conformational changes that occur during the formation of the glycosyltransferase-auxiliary protein complex is critical to understanding the influence that these auxiliary proteins have on glycosyltransferases, and thereby generate information that may be useful in the application of glycodiversification. In this work, synthetic genes coding the glycosyltransferase TylM2 and the auxiliary protein TylM3 was sub cloned into pET28a vectors and the recombinant proteins were produced and purified. In addition, structural characterization techniques were performed with TylM2 which appears to form a tetramer in solution in the absence of its auxiliary protein. Crystallization assays of TylM2 yielded crystals that diffracted bellow 3.0Å and presented pathologies which prevented determining of its structure, even after attempts of optimization. The creation of theoretical models by homology modelling for TylM2 and TylM3 allowed for an investigation into possible differences that make TylM2 possess a more stringent flexibility toward acceptor substrates when compared to other homologues.
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Estudo experimental da utilização do gás HHO como combustível auxiliar em motores de combustão internaFernandes, Thiago Gonçalves January 2018 (has links)
Este trabalho contém um estudo experimental para a obtenção e a validação de um combustível à base de água, obtido através da eletrolise desta e denominado de HHO (Gás de Brown), a ser utilizado como auxiliar na queima de hidrocarbonetos dos demais combustíveis fósseis e de fontes renováveis como o álcool hidratado (etanol). Para a realização deste trabalho foi utilizado um eletrolisador composto por placas de aço inox 316L e eletrólito à base de hidróxido de potássio, conjunto este de eletrólito em sua concentração ideal, material de construção do eletrolisador determinado através de estudo prévio em bibliografia. Posto o sistema em funcionamento, realizado a análise exergética da composição e do gás gerado, onde se verificou a existência de energia disponível para gerar trabalho útil e que o maior desperdício se encontrava na potência elétrica utilizada para a produção do gás. Após esta validação o gás foi submetido a testes em dinamômetro de desempenho e emissões com motores de combustão interna com deslocamento de 1,6 litros, porém com configurações diferentes de alimentação. Para que os dados refletissem a utilização de maior demanda de combustível, como no trânsito urbano, foram escolhidas as rotações de 1500rpm, 2500rpm e 3500rpm, com aberturas de borboleta em dois estágios, total 100% e abertura parcial a 40%. As variáveis controladas foram a potência, o torque, o consumo instantâneo de combustível, o fator lambda (λ) e a emissão dos gases CO, CO2 e HC. Em ambos os testes, aberturas total e parcial, com suas respectivas particularidades de no sistema de alimentação, foram apresentadas tendências de melhora em desempenho e reduções de emissões, devido aos valores obtidos estarem dentro das incertezas de medição no caso do sistema de alimentação por carburador e combustível principal o álcool hidratado, contudo no caso do sistema de alimentação por injeção eletrônica programável à gasolina comercial, com injeção de gás individualizada os resultados apresentados ficaram moderadamente acima das incertezas de medição. Entretanto, o sistema utilizado no experimento com gasolina + HHO e injeção programável, apresentou uma redução de emissões de CO em 26,4% (abertura parcial) e 18,6% (abertura total), reduzindo as emissões de HC em 16% (abertura parcial) e 14,5% (abertura total) e, por sua vez, o consumo de combustível reduziu em 29,6%. / This work contains an experimental study to obtain and validate a water-based fuel obtained through the electrolysis of this one and denominated HHO (Brown Gas), to be used as an auxiliary in the hydrocarbon burning of other fossil fuels and renewable sources such as hydrated alcohol (ethanol). For this work, an electrolyzer composed of 316L stainless steel plates and electrolyte based on potassium hydroxide was used, this electrolyte assembly in its ideal concentration, electrolyte construction material determined through a previous bibliography study. After the system was in operation, the exergy analysis of the composition and generated gas was performed, where the existence of available energy to generate useful work was verified and that the greatest waste was in the electric power used for the production. After this validation the gas was submitted to dynamometer tests of performance and emissions with engines of internal combustion with displacement of 1.6 liters, but with different feeding configurations. For the data to reflect the use of higher fuel demand, such as in urban traffic, the revolutions of 1500rpm, 2500rpm and 3500rpm were chosen, with twostage butterfly apertures, total 100% and partial opening at 40%. The variables controlled were power, torque, instantaneous fuel consumption, lambda factor (λ) and emission of CO, CO2 and HC gases. In both tests, total and partial openings, with their respective peculiarities of the feed system, presented trends of improvement in performance and emission reductions, due to the values obtained being within the uncertainties of measurement in the case of the carburetor feed system and the main fuel is the hydrated alcohol, however in the case of the commercial gasoline programmable electronic fuel injection system with individualized gas injection the presented results were moderately above the measurement uncertainties. However, the system used in the experiment with gasoline + HHO and programmable injection showed a reduction of CO emissions by 26.4% (partial opening) and 18.6% (total opening), reducing HC emissions by 16% ( partial opening) and 14.5% (total opening) and, in turn, fuel consumption decreased by 29.6%.
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Uncaria tomentosa na desinfecção de canais radiculares contaminados por patógenos endodônticos / Antimicrobial activity of Uncaria tomentosa against endodontic pathogens in infected root canalsMorante, Daniel Rodrigo Herrra 12 March 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-03-12 / The aim of this in vitro study was to evaluate antimicrobial activity of four auxiliary substances against Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus and Candida albicans, commonly isolated microorganisms in endodontic failure cases, on which was tested: 2% chlorhexidine gel (CHX), 2% Uncaria tomentosa gel (UG), 2% CHX gel and UG in equal parts (1:1) (CHX + UG) and Natrosol (NAT). Firstly, the agar diffusion method was used; the inhibition halos were measured and significance was determined using ANOVA and Tukey`s test (p <0.05). The more effective auxiliary substance against E. faecalis and C. albicans was CHX + UG, followed by CHX and UG. Against S. aureus, CHX+UG had a similar effect to that shown by CHX and UG.The NAT group had not effect against any microorganism. Secondly was evaluating antimicrobial activity of auxiliary substances in infected dentin. It was used a total of 120 pre-molars, which were divided for each organism into 4 groups (n = 10). Microbiological samples were collected before the chemomechanical preparation (PQM) (S1), after PQM (S2) and after 7 days of intracanal medication (MIC) for each group (S3). The count of colony forming units (CFU/mL) was statistically analyzed by Kruskal-Wallis and Mann-Whitney test (p <0.05). In S2, all groups showed a significant reduction of CFU/mL compared with S1 In groups CHX, CHX+UG and UG there was no CFU/mL. In S3, specimens contaminated with E. faecalis of the CHX and NAT groups had significantly higher microbial load compared with S2, but CHX+UG group kept the value obtained in S2, similar to that obtained by UG group. Specimens contaminated with S. aureus and C. albicans of the CHX, CHX+UG and UG groups remained the negative values of S2. With results obtained it was concluded, that the association CHX+UG has the ability to inhibit microbial growth of E. faecalis and C. albicans higher than shown by CHX and UG. Against S. aureus, CHX and UG had a similar effect. It was also found that CHX, CHX+UG and UG were effective in disinfecting the canal after PQM, but only after 7 days the groups that received CHX+UG and UG as MIC, remained root canals free of CFU of E. faecalis. Thus, UG alone or in combination with CHX, was effective in disinfecting root canals. / O objetivo deste estudo foi avaliar, por meio de testes in vitro, o potencial antimicrobiano de quatro substâncias auxiliares sobre microrganismos comumente isolados nos casos de insucesso do tratamento endodôntico, Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus e Candida albicans; Foram testados: gel de digluconato clorexidina a 2% (CHX), gel de Uncaria tomentosa a 2% (UG), gel de CHX e UG a 2% em partes iguais (1:1) (CHX+UG) e Natrosol (NAT). Primeiramente foi utilizado o método de difusão em ágar. Os valores coletados pela mensuração dos halos de inibição foram analisados estatisticamente com ANOVA de um critério e o teste de Tukey (p<0,05). A substância auxiliar que mostrou-se mais efetiva sobre E. faecalis e C. albicans foi CHX+UG , seguida da CHX e UG. Frente a S. aureus, CHX+UG apresentou um efeito semelhante ao mostrado pela CHX e UG. O Grupo NAT não mostrou capacidade de inibição sobre nenhum dos microrganismos. A segunda parte do estudo visou avaliar a capacidade antimicrobiana das sustâncias auxiliares em dentina contaminada. Foi utilizado um total de 120 pré-molares inferiores distribuídos em 4 grupos para cada microrganismo (n=10). Foram feitas coletas microbiológicas antes do preparo químico-mecânico (PQM) (S1), após PQM (S2), e após 7 dias com medicação intracanal (MIC) (S3). A contagem das unidades formadoras de colônia (UFC/mL) foi analisada estatisticamente pelo teste de Kruskal-Wallis e teste de Mann-Whitney (p<0,05). Em (S2), todos os grupos apresentaram uma redução significativa de UFC/mL em comparação com S1. Nos grupos CHX, UG e CHX+UG não houve a presença de UFC/mL; para S3, os espécimes contaminados com E. faecalis dos grupos CHX e NAT apresentaram carga microbiana significativamente maior à apresentada em S2; porém o grupo CHX+UG manteve o valor obtido em S2, valor que foi semelhante ao obtido pelo grupo UG. Os espécimes contaminados com S. aureus e C. albicans dos grupos CHX, UG e CHX+UG mantiveram os valores negativos de S2, assim não apresentaram UFC/mL. Concluiu-se que a associação CHX+UG apresenta capacidade de inibição do crescimento microbiano sobre E. faecalis e C. albicans superior ao mostrado por CHX e UG. Frente a S. aureus, CHX e UG apresentaram efeito semelhante. Concluiu-se também que CHX, UG e CHX+UG foram eficazes na desinfecção do canal após PQM, porém após 7 dias só os grupos que receberam CHX+UG e UG como MIC, mantiveram os canais livres de UFC de E. faecalis. Assim, UG só ou em associação com CHX, se mostrou eficaz na desinfecção de canais radiculares.
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Being objective : communities of practice and the use of cultural artefacts in digital learning environmentsHopes, David January 2014 (has links)
Over the past decade there has been a dramatic increase in the volume of digital content created from museum, library and archive collections but research on how this material is actually used, particularly in digital learning environments, has fallen far behind the rate of supply. In order to address this gap, this thesis examines how communities of practice (CoPs) involved in the supply and use of digital artefacts in the Higher Education sector in the UK interact with content and what factors affect this process. It focuses on a case study involving the digitisation of Shakespeare collections used in postgraduate research, and the testing of use in a range of different learning environments. This produced a number of significant findings with implications for the HE and cultural sectors. Firstly, similar patterns of artefact use were found across all users suggesting there are generic ways in which everyone interacts with digital artefacts. However, distinct forms of use did emerge which correspond with membership of particular communities of practice. Secondly, members of a CoP appear to share a particular learning style and this is influenced by the learning environment. Finally, the research indicates that a mixed method for analysing and measuring use, piloted and tested in the case study, is possible.
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Futures studies in contemporary Islamic and Western thought : a critical study of the works of Ziauddin Sardar, Mahdi Elmandjra, Alvin Toffler and Daniel BellWan Zakaria, Wan Fariza Alyati Binti January 2010 (has links)
Futures Studies, or the study of future, is a post-Enlightenment new field of inquiry in Western history of intellectual tradition. It attempts to study the probable, possible and desirable futures for human. Nevertheless, the study and concern on future is not a unique Western phenomenon. Indeed, every society and civilization has its own version of “futures studies”, as found in astrology, numerology, palm reading and so on and so forth. Islam - as the religion of fitrah (primordial nature) - regards future within an eternal conception of time – the dunyā and the akhīrah. With the influence of Western analysis on future, this research attempts at firstly recognizing the notion of future in both Islam and Western traditions. In so doing, we chose two Muslim scholars, Ziauddin Sardar and Mahdi Elmandjra, who are both prominent in the study of future, and also two Western scholars, Alvin Toffler and Daniel Bell as representatives of Western tradition in studying future. Secondly, this research traces the development of futures thinking in both Western and Islamic context and argues that futures thinking, indeed Futures Studies, has become a significant mode of thinking in Western society within its reception of modernity, and now postmodernity. The development of Futures Studies and futures thinking on their Muslim counterpart shows similar interest, though with much slower pace. Our analysis therefore focuses on the thematical aspects of the scholars’ thoughts and compares the divergences between both Muslim and Western views on future, as well as their resemblances. We then conclude that the significance of futures thinking and Futures Studies should be urgently recognized by the Muslims in order to resolve their present condition in which they become part of the contributing factor. This, as we argue and believe, should be realized through an ijtihādic struggle – to be ready to criticize oneself, and recognize one’s weaknesses and mistakes in understanding and practicing one’s own religion and then to set forward the best resolution to be implemented for a desirable future. Only through this process of self-criticism and self-awareness that we can contemplate a self-renewal process for ourselves, and most importantly, for the Muslim society and its civilization in the future.
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The light of conscience : Jean Barbeyrac on moral, civil and religious authorityBisset, Sophie January 2012 (has links)
Jean Barbeyrac (1674-1744) is best known for his annotated French translations of the natural law treatises of Hugo Grotius, Samuel Pufendorf and Richard Cumberland and has generally been understood through the prism of his interpretations of these. However, not only was he in fact an independent natural law thinker, who drew eclectically from a vast array of authors, synthesising their ideas to construct his own distinct theory; he also wrote extensively on morals and politics in other genres, works that have received very little attention and never been seen in their coherence with his natural law ideas. This thesis considers Barbeyrac as a thinker in his own right, drawing together all of his major and many of his minor works and situating them within a number of the wider contexts Barbeyrac inhabited: namely, as a Huguenot refugié, a member of the Republic of Letters and a professional academician. Barbeyrac's central concern was the relationship between moral, civil and religious authority, and the core of his solution was a comprehensive concept of conscience that unified and naturalised man's moral and religious duties and served as the source of authoritative moral judgement. The first three chapters of the dissertation focus on the structure of his natural law theory, arguing that the attempt to establish conscience as a comprehensive faculty of moral judgement caused intractable philosophical tensions, reflected in his innovative but inchoate theory of permissive natural law. The final two chapters extend this analysis beyond Barbeyrac's natural law, arguing that despite his efforts to balance the potentially competing demands that arise when the authority of conscience comes into conflict with other sources of moral authority, namely ecclesiastical and civil, Barbeyrac had to insist that, ultimately, individuals must uphold the first and principal duty of natural law to follow the light of conscience.
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Obtenção de compostos intermediários para a síntese do agente anti-HIV Tenofovir, e de derivados do D-manitolSIQUEIRA, Edmilson Clarindo de 13 April 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-04-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / In this study we investigated the resolution of rac-1,2-propanediol and rac-2,3- isopropylidene glycerol using chiral amines (R)- and (S)-1-phenylethylamine (27). The alcohols are esterified to form hemi-phthalates, and treated with the enantiomers of 27 resulting in the following salts (R)-27.(±)-52 and (S)-27.(±)-52 in good yields. However, salts (R)-27.(±)-33 and (S)-27.(±)-33 did not form crystalline material. In addition we studied the resolution of (±)-14 and (±)-31 through the use of amino acids benzyl esters and brucine as auxiliaries. Attempts to obtain the benzyl ester of L-tryptophan (59) were negative; attempts to obtain benzyl esters of Lphenylalanine (58) and L-lysine (57) were also negative. In the case of brucine (35) there was no noticeable diastereoisomeric enrichment during repeated crystallizations. As an extension to this, we performed dehydration of D-mannitol (40) in an acid medium. Modifications of the published method resulted in obtaining a new derivative, the 2,5-anhydro-1,3-O-benzyl-D-mannitol (81) whose structure was established via x-ray study. / Neste trabalho foi avaliada a resolução dos alcoóis rac-1,2-propanodiol (14) e rac-2,3-isopropilideno glicerol (31) pelas aminas quirais (R)- e (S)-1-feniletilamina (27) via processo de dessimetrização: os alcoóis foram esterificados, na forma de ftalatos, e tratados com os enantiômeros de 27 que resultou nos seguintes sais (R)-27.(±)-52 e (S)-27.(±)-52 em bons rendimentos. Todavia, os sais (R)-27.(±)-33 e (S)-27.(±)-33 não foram isolados em sua forma cristalina. Adicionalmente, foi estudada a resolução de (±)-14 e (±)-31 através do uso de aminoácidos, na sua forma benzílica, e brucina como auxiliares quirais. Tentativas de obter o éster benzil de L-triptofano (59), foram negativas. Alternativas de usar Lfenilalanina (58) e L-lisina (57) também foram negativas. Condizente com este tipo de resolução foi ensaiada também o alcalóide brucina (35), porém não houve enriquecimento diastereoisomérico durante repetidas cristalizações. Como extensão ao trabalho realizado com os alcoóis, foi investigada a desidratação do D-manitol (40) em meio ácido. Modificações desta metodologia conduziram à obtenção de um novo derivado deste substrato, o 2,6-anidro-1,3-di-Obenzil- D-manitol (81), que foi caracterizado por raios-X.
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