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Coronavírus em aves silvestres e domésticas provinientes de diferentes regiões do Brasil. / Coronavirus in wild and domestic birds from different regions of Brazil.Carla Meneguin Barbosa 21 September 2015 (has links)
Apesar de ainda não terem sido relatados Coronavírus aviários com potencial zoonótico, espécies de aves silvestres e domésticas podem portar CoVs de grande importância econômica como o vírus da Bronquite Infecciosa (IBV). Além disso, nos últimos anos, diversos novos CoVs geneticamente distintos do IBV vêm sendo identificados em diferentes famílias de aves e mamíferos silvestres e domésticos. O Brasil contem 18% do total da diversidade de espécies de aves no mundo, no entanto, estudos sobre a presença de Coronavírus em aves silvestres ainda são bastante escassos. O presente estudo tem por objetivo realizar análise retrospectiva da presença de Coronavírus em amostras de aves silvestres e domésticas de diferentes regiões brasileiras coletadas entre os anos de 2004 e 2013 através de RT-PCR; realizar a caracterização molecular e a análise filogenética afim de correlacionar sua epidemiologia às rotas de migrações de aves, à proximidade das regiões urbanas e de granjas avícolas, verificando a possibilidade de transmissão. Do total de 746 amostras testadas, 25 apresentaram resultados positivos para os Coronavírus com primers para o gene da RpRd e foram sequenciadas. Obtivemos sucesso no sequenciamento de 7 dessas amostras, sendo 4 positivas para Gammacoronavírus e 3 positivas para Deltacoronavírus. Na tentativa de sequenciamento do gene da proteína S uma galinha (Gallus gallus), da Ilha de Marajó-PA, mostrou sequência que foi identificada como uma cepa de IBV. Este trabalho é inédito no Brasil, pois demonstra a presença de Gamma e Deltacoronavírus aviários circulando em diversas regiões, próximo a áreas urbanas e indústrias avícolas, mostrando evidências de que aves silvestres podem carrear estes Coronavírus entre diferentes sítios migratórios no Brasil. / Regardless it has never been reported any avian Coronavirus with zoonotic potential, species of both wild and domestic birds can carry CoVs of great economic importance as the Infectious Bronchitis Virus (IBV). Furthermore, recently, many new CoVs, genetically distinct from IBV have been identified in different families of wild and domestic birds and mammals. Even though Brazil contains 18% of the bird species diversity in the world studies about the presence of Coronaviruses in wild birds are still quite scarce. This study aims to perform retrospective analysis of the presence of coronavirus in wild birds and domestic samples of different Brazilian regions collected between the years 2004 and 2013 by RT PCR and to perform molecular characterization and phylogenetic analysis in order to correlate its epidemiology to routes of bird migrations , the proximity of urban and poultry industry regions , verifying the possibility of transmission. Of the amount of 746 samples tested, 25 were positive for Coronavirus in PCR and nested PCR tests with primers for RpRd gene and were sequenced. We have succeeded in sequencing 7 of these samples which 4 were positive for Gammacoronavirus and 3 for Deltacoronavirus. In attempt of sequencing the S protein gene, we have succeeded in a chicken sample (Gallus gallus) from Ilha de Marajó-PA. This sample was identified as a strain of IBV. This work is unprecedented in Brazil, as it demonstrates the presence of Gamma and Deltacoronavirus in birds circulating in different regions, close to urban areas and poultry industries, showing evidence that wild birds may carry these Coronavirus between different migratory sites in Brazil.
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Alterações da formação hipocampal do Calidris pusilla associadas à migração outonal de longa distânciaMAGALHÃES, Nara Gyzely de Morais 31 August 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-08-31 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / FAPESPA - Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas / Após a reprodução na tundra ártica superior, os maçaricos acometidos pela inquietação migratória traçam uma rota preliminar herdada e utilizam bússolas naturais, mapas e marcos visuais, até alcançar, ainda no hemisfério norte, sítios de parada que dispõem dos recursos nutricionais necessários ao rápido e elevado ganho de reservas energéticas, tal como acontece na Baia de Fundy-Canadá. Após esse sítio de parada que é utilizado por 75 % da população de Calidris pusilla, a experiência migratória outonal de longa distância continua com voos de 6 dias ininterruptos sem escala sobre o Atlântico até que essas aves chegam a América do Sul e depois na ilha de Canela – Brasil. Para testar a hipótese de que o processo migratório de longa distância influenciaria a neurogênese, número de astrócitos GFAP positivos e a ativação de genes de expressão rápida capturamos 12 indivíduos em plena atividade migratória na Baia de Fundy e 9 indivíduos na Ilha de Canelas no Brasil. Após a imunomarcação seletiva para neurônios maduros (NeuN), neurônios imaturos (Dcx), astrócitos (GFAP), e ativação neuronal por genes de expressão rápida (c-Fos) quantificamos esses marcadores na formação hipocampal e comparamos resultados dessa quantificação dos indivíduos em migração (Baia de Fundy) com aqueles em período de invernada (Ilha de Canela). Para tanto utilizamos análises estereológicas quantitativas que permitiu estimar o total de células, o número de células ativas, o número total de astrócitos e de neurônios novos e maduros. Para verificar se as diferenças encontradas eram estatisticamente significativas empregamos o teste t Student. Nossos resultados confirmaram que a migração outonal provocou mudanças hipocampais em Calidris pusilla. Após a migração detectamos que a formação hipocampal possui volume maior e mais neurônios novos em contrapartida, menos células ativadas e menor número de astrócitos. Entretanto, esse processo não influenciou o número de células totais e de neurônios maduros. Sugerimos que a diferença encontrada entre o volume e número de neurônios novos, dos indivíduos em plena migração e após o processo ter sido concluído, possivelmente ocorreu em função do processo migratório em combinação com as condições encontradas durante o início do período invernada. O presente trabalho demonstra pela primeira vez que as aves marinhas migratórias de longa distância oferecem janela de oportunidade única para investigar muitas questões relacionadas à neurobiologia celular da migração de uma forma geral, e em particular, sobre a plasticidade neural associada à função da neurogênese do hipocampo adulto das aves. Futuramente pretendemos monitorar a neurogênese nessa espécie durante todo o período de invernada. / After breeding in the upper Arctic tundra, shorebirds affected by migratory restlessness trace an inherited preliminary route and use compasses, maps and visual landmarks, until they reach, in the northern hemisphere, stopover sites that have the necessary nutritional resources for fast and high gain of energy reserves for migratory journey, as in the Bay of Fundy-Canada. Following this stopover site that is used by 75% of the population of Calidris pusilla, the long-distance autumn migratory experience continues with uninterrupted 6-day non-stop flights over the Atlantic until these birds reach South America and then the island of Canela-Brazil. To test the hypothesis that the long-distance migratory process would influence neurogenesis, astrogenesis and activation of earlier-expression genes, we captured 12 individuals in full migratory activity in the Bay of Fundy and 9 individuals in the Island of Canela in Brazil. After selective immunostaining for mature neurons (NeuN), immature neurons (Dcx), astrocytes (GFAP), and neuronal activation by early genes (c-Fos), we quantified these markers in the hippocampal formation and compared the results of this quantification of the individuals in migration (Bay of Fundy) with those of wintering birds (Canela Island). We used quantitative stereological analyzes to estimate the total number of cells of hippocampal formation, number of active cells, total number of astrocytes and young and mature neurons. To verify if the differences found were statistically significant, we used the Student t test. Our results confirmed that autumnal migration alone, caused hippocampal changes in Calidris pusilla. After migration, we detected that the hippocampal formation has fewer activated cells and fewer astrocytes, more new neurons and greater relative volume in the quantified hemisphere (left hemisphere). However, this process did not influence the number of total cells and mature neurons. We suggest that the difference found between the volume and number of new neurons, of the full migration and wintering individuals, possibly occurred due to the migratory process in combination with local conditions found during the beginning of the wintering period. Taken together our findings demonstrate long-distance migratory shorebirds offer a unique opportunity to investigate many issues related to the cellular neurobiology of migration in general, and, on the neural plasticity associated with hippocampal neuronal and neurogenesis in adult birds.
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Ensaios estereológicos e morfologia tridimensional na formação hipocampal de aves migratórias marinhas: análise quantitativa da imunomarcação seletiva de neurônios e micróglia em Calidris pusilla e Actitis maculariaDINIZ, Cristovam Guerreiro 14 August 2013 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-12-02T21:37:09Z
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Previous issue date: 2013 / É objetivo do presente trabalho implantar como modelos para estudo da formação hipocampal das aves migratórias as espécies de maçarico Calidris pusilla e Actitis macularia que abandonam as regiões geladas do Canadá, fugindo do
inverno, em direção à costa da América do Sul e do Caribe onde permanecem até
a primavera quando então retornam ao hemisfério norte. Mais especificamente
pretende-se descrever a organização morfológica qualitativa e quantitativa da
formação hipocampal, empregando citoarquitetonia com cresil violeta e
imunomarcação para neurônios e células da glia, sucedidas por estimativas
estereológicas do número total de células identificadas com marcadores seletivos
para aquelas células, assim como comparar a morfologia tridimensional da micróglia
das aves com a dos mamíferos. As coletas de campo para a caracterização da
formação hipocampal do Calidris pusilla e Actitis macularia em seus aspectos
morfológicos foram feitas no Brasil na Ilha Canelas (0°47'21.95"S e 46°43'7.34"W)
na Costa da Região Nordeste do Pará no município de Bragança, e no Canadá, na
Baia de Fundy perto de Johnson's Mills na cidade de New Brunswick (45°50'19.3"
N 64°31'5.39" W).
A definição dos limites da formação hipocampal foi feita empregando-se as
técnicas de Nissl e de imunomarcação para NeuN. Para a definição dos objetos de
interesse das estimativas estereológicas e das reconstruções tridimensionais
empregou-se imunomarcação com anticorpo anti-NeuN para neurônios e anti-IBA-
1 para micróglia. As estimativas estereológicas revelaram em média número similar
de neurônios nas duas espécies enquanto que no hipocampo de Actitis macularia
observou-se número de micróglias 37% maior do que no de Calidris pusilla. Além
disso, encontrou-se que em média o volume da formação hipocampal do Actitis
macularia é 38% maior do que o encontrado em Calidris pusilla.
Os estudos comparativos da morfologia microglial das duas espécies de aves
com a dos mamíferos Rattus novergicus e Cebus apella revelaram diferenças
morfológicas significantes que indicam que as micróglias das aves mostram em
média, menor complexidade (dimensão fractal), tem diâmetros e perímetros de
soma menores e possuem ramos mais finos do que aquelas do rato e do macaco. / The aim of this report is to describe the hippocampal formation of two
migratory birds, Calidris pusilla and Actitis macularia, that leave the cold regions of
the Canadian Tundra, escaping the winter, towards the coast of South America and
the Caribbean Islands where they remain until winter ends returning to the Northern
hemisphere. We intend to describe the qualitative and quantitative morphological
organization of the hippocampal formation, using cytoarchitetonics with cresyl violet
and immunostaining for neurons and microglia, followed by stereological estimates
of the total number of cells identified with selective markers. We intend as well to
compare the three-dimensional morphology of hippocampal microglia of these
species with those of the dentate gyrus of Wistar rats and Capuchin monkey. The
shorebirds used in the characterization were captured in Canela Island, Bragança
City, State of Pará, Brazil (0°47'21.95"S and 46°43'7.34"W), as well as in Canada,
in the Bay of Fundy, near Johnson's Mills, New Brunswick (45° 50' 19.3" N 64°
31' 5.39" W).
The hippocampal formation limits definition was performed employing Nissl
staining and immunostaining for NeuN. For the objects of interest definition of
stereological estimates and three-dimensional reconstructions we used
immunostaining with anti NeuN for neurons and anti-IBA-1 for microglia respectively.
The stereological results revealed similar number of neurons in both species
whereas the number of microglia in Actitis macularia was 37% higher than in Calidris
pusilla. Furthermore, it was found that the hipocampal formation average volume in
Actitis macularia was 38% higher than that found in Calidris pusilla. Comparative
studies of the microglial morphology with mammals (Rattus novergicus and Cebus
apella) revealed significant morphological differences that indicate microglia in birds
shows on average lower complexity (smaller fractal dimension), smaller tree
volumes and areas and thinner branches than rat and monkey microglia.
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Aspectos ecológicos da avifauna aquática nas fozes dos rios Tijucas e Inferninho, Santa Catarina, BrasilRubert, Barbara 07 October 2016 (has links)
Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2017-05-09T12:19:17Z
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Previous issue date: 2016-10-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Estuaries are highly productive environments susceptible to environmental variables, and
important to the life cycle of various species, to waterfowl serve as a point of rest, feeding
and nesting. These sites also receive migratory birds seeking the accumulation of energy
required for the return to the reproductive areas. These species, as well as residents, have
their distribution, occurrence, abundance and behavior influenced by environmental
variables, seasonality and human presence. Thus this study aimed to characterize the
structure of the community of waterfowl, as well as behavioral pattern, relationship with
environmental variables and habitat use by them in the mouths of the rivers Tijucas and
Inferninho. The Tijucas’ Bay where this study was conducted, presents sediment
deposition and formation of extensive muddy plans. To collect the data length of 1.1 km
was covered in each mouth, from June 2015 to May 2016, sampling occurred every two
hours, from 08 hours to 16 hours. The data collected were species, average number,
activity and micro-habitat. five microhabitats were considered, based on different faces
found in two locations, and analyzed environmental variables were: wind speed, tide
height, precipitation and temperature. The curve of rarefaction and Jackknife 2 were used
to determine the sample sufficiency, Shannon index was used to estimate the annual and
monthly diversity and similarity among the studied areas was calculated using the Jaccard
index. Analysis of Variance (ANOVA) and Kruskal-Wallis test were used to determine
the differences between species richness, average number and behavior of the species for
hours and months of sampling. The behavior relative frequency was grouped by similarity
of Bray-Curtis, the Indicator Species Analysis was used to determine the association of
species with micro-habitats, and used Canonical Correlation Analysis (CCA) to
determine the correlation between the variables environmental and behavior and between
species. Were recorded 44 species of waterfowl in the voices of the two rivers, 10
migratory. The similarity between the two areas was 75%, indicating high similarity of
microhabitats between areas. The diversity at the mouth of the river Tijucas was higher
than the mouth of the river Inferninho, this difference is related to river discharge of
rivers, hence the nutrient input. The difference in species richness, abundance was
significant only between the months of observation, and the months with the highest
diversity occurred in the late spring, summer and early fall, probably due to the life cycle
and arrival of migratory species. The rest was the most frequent activity, followed by
foraging, this was negatively related to temperature variation, it suggests that the higher
the temperature, the lower the foraging, avoiding waste of energy and water. Foraging
was negatively correlated with the height of the tide as the low tide provides a food
resource. The indicator species analysis showed that most of the species was associated
with only one micro-habitats, this can be explained by the abundance of available
resource, since rich environments allow specialization of species. / Os estuários são ambientes de elevada produtividade, suscetíveis a variáveis ambientais,
e importantes para o ciclo de vida de diversas espécies, para as aves aquáticas servem
como ponto de descanso, alimentação e nidificação. Esses locais ainda recebem aves
migratórias que buscam o acúmulo de energia necessário para o regresso às áreas
reprodutivas. Essas espécies, assim como as residentes, têm suas distribuição, ocorrência,
abundância e comportamento influenciados pelas variáveis ambientais, sazonalidade e
presença humana. Dessa forma esse estudo teve o objetivo de caracterizar a estrutura da
comunidade de aves aquáticas, bem como padrão comportamental, relação com variáveis
ambientais e uso de hábitat pelas mesmas nas fozes dos rios Tijucas e Inferninho. A Baía
de Tijucas, onde esse trabalho foi realizado, apresenta deposição de sedimento e formação
de extensos planos lamosos. Para coletar os dados a extensão de 1,1 km foi percorrida em
cada foz, de junho de 2015 a maio de 2016, as amostragens ocorreram a cada duas horas,
das 08 horas às 16 horas. Os dados coletados foram: espécie, número médio, atividade
realizada e micro-habitat ocupado. Foram considerados cinco micro-hábitats, baseado nas
diferentes fisionomias encontradas nos dois locais, e as variáveis ambientais analisadas
foram: velocidade do vento, altura da maré, precipitação e temperatura. A curva de
rarefação e Jackknife 2 foram usados para determinara a suficiência amostral, o índice de
Shannon foi usado para estimar a diversidade anual e mensal, e a similaridade entre as
áreas estudadas foi calculado através do índice de Jaccard. Análise de Variância
(ANOVA) e teste de Kruskal-Wallis foram usados para determinar as diferenças entre
riqueza, número médio e comportamento das espécies por horário e meses de
amostragem. A frequência relativa de comportamentos foi agrupada pela similaridade de
Bray-Curtis, a Análise de Espécie foi usada para determinar a associação das espécies
com os micro-habitats, e usou-se Análise de Correlação Canônica (CCA) para determinar
a correlação entre as variáveis ambientais e comportamentos e entre espécies. Foram
registradas 44 espécies de aves aquáticas nas fozes dos dois rios, sendo 10 migratórias. A
similaridade entre as duas áreas foi de 75%, indicando alta semelhança de micro-habitats
entre as mesmas. A diversidade na foz do rio Tijucas foi maior que a foz do rio Inferninho,
essa diferença está relacionada a descarga fluvial dos rios, consequentemente ao aporte
de nutrientes. A diferença de riqueza, abundancia foi significativa apenas entre os meses
de observação, e os meses com maiores diversidades ocorreram no final da primavera,
verão e começo do outono, provavelmente devido ao ciclo de vida e chegada das espécies
migratórias. O descanso foi a atividade mais frequente, seguido de forrageio, este esteve
negativamente relacionada a variação de temperatura, sugere que quanto maior a
temperatura, menor o forrageio, evitando dispêndio de energia e água. O forrageio esteve
negativamente relacionado com a altura da maré, já que a maré baixa disponibiliza
recurso alimentar. A análise de espécies indicadoras apontou que a maior parte das
espécies esteve associada a apenas um micro-habitat, isso pode ser explicado pela
abundância de recurso disponível, já que ambientes ricos permitem a especialização das
espécies.
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As aves limícolas migratórias nas praias de Aracaju : avaliação da influência antrópica e contribuição para ações de desenvolvimento costeiroAlmeida, Bruno Jackson Melo de 11 March 2010 (has links)
The incessant growth of human populations, and the increase in recreational activities on seashores have altered the natural conditions of most coastal ecosystems, with a series of consequences for the distribution, abundance, and behavior of a range of organisms. While Atalaia beach in the city of Aracaju is highly urbanized, it is an important point in the
migratory cycle of some species of migratory Nearctic shorebirds. The principal objective of the present study was to characterize the avian fauna of Atalaia beach, and to evaluate the influence of anthropogenic impacts on the spatial distribution and habitat use of migratory shorebirds. For this, a total of 81 surveys of a 5 km stretch of the beach were conducted on a monthly basis between October, 2008, and November, 2009. Data were also collected on the homogeneous availability organic matter of benthic macrofauna and the presence of beachgoers along the same stretch of shore. A total of 70 bird species were identified, of which the most abundant were the migratory shorebirds, with over 2500
individuals being recorded between October and March. The most common species were Arenaria interpres, Calidris alba, Calidris pusilla, and Charadrius semipalmatus, which together accounted for 79,09% of all birds recorded. These species were not distributed
homogeneously across the survey area (H = 31.98; g.l. = 9; p = 0.002), nor did their abundance correlate with the availability of invertebrates (rs = 0.14; p = 0.71; n = 10). Unexpectedly, the sectors of the area with the highest concentrations of beachgoers also harbored the greatest abundance of birds (rs = 0.61; p = 0.059; n = 10). This appears to have been at least partly explained by the availability of leftover food within these areas,
which represent an alternative dietary resource for the migratory shorebirds, and interferes in their behavior patterns. There is a clear need to better understand this phenomenon, and its potential consequences for the birds. / O contínuo crescimento das populações humanas, e o aumento das atividades recreativas ao longo do litoral alteram as condições naturais dos diversos ecossistemas costeiros, e consequentemente afetam a ocorrência, distribuição e comportamento de diversos
organismos. Embora inserida no contexto urbano da cidade de Aracaju, a praia da Atalaia, apresenta-se como uma importante área no ciclo migratório de aves limícolas neárticas. O presente trabalho tem por principal objetivo trazer informações sobre a avifauna da praia
da Atalaia, fazendo uma breve avaliação da influência antrópica sobre a distribuição espacial e uso de habitat das aves limícolas migratórias. Para isso, foram realizadas um total de 81 amostragens ao longo de 5 km de extensão de praia no período entre os meses
de outubro de 2008 a novembro de 2009. Foram coletados dados sobre a homogeneidade espacial da macrofauna bêntica a partir da mensuração da matéria orgânica, bem como o número de pessoas foi contabilizado ao longo dessa faixa de praia. Foi identificado um total 70 espécies de aves, dentre estas as aves limícolas migratórias foram as mais abundantes, com registros de mais 2500 indivíduos entre os meses de outubro e março. As espécies mais comuns foram Arenaria interpres, Calidris alba, Calidris pusilla, e
Charadrius semipalmatus que em conjunto totalizaram 79,09% do número total de indivíduos registrados. Essas espécies não apresentaram distribuição homogênea ao longo da faixa de praia amostrada (H = 31,98; g.l. = 9; p = 0,002), tampouco a abundância
apresentou correlação os potenciais setores de disponibilidades de invertebrados (rs = 0,14; p = 0,71; n = 10). Inesperadamente, os setores de praia com maiores concentrações de pessoas também registraram as maiores abundâncias de aves (rs = 0,61; p = 0,059; n = 10). Tal fato parece estar associado com a oferta de restos de comidas e de lixo existentes nessas áreas, o que pode constituir um recurso alimentar alternativo para as aves migratórias, e consequentemente, influenciando os padrões de ocorrência e comportamentais dessas espécies. Faz-se necessário ampliar os estudos e pesquisas para um melhor entendimento dessa situação, e principalmente avaliar quais as potenciais consequências dessas substâncias para as aves e o ciclo migratório.
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