Under covid-19-pandemin har avloppsvattenbaserad epidemiologi (WBE) använts i stor utsträckning som ett komplement till kliniska tester över många delar av världen. Detta projekt syftade till att detektera och kvantifiera belastningen av Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) i avloppsvattenprover med hjälp av Revers transkriptas kvantitativ polymeraskedjereaktion (RT-qPCR). De analyserade proverna kom från fyra olika avloppsreningsverk i Sverige, under perioden november 2022 till maj 2023. Studien omfattade en översikt över olika provtagnings- och analytiska tekniker och normaliseringsmetoder som används i WBE-studier, vilket betonade vikten av metodval. SARS-CoV-2-RNA upptäcktes i alla analyserade prover och infektionstrender kunde identifieras effektivt, inklusive COVID-19-vågen som observerades under semesterperioden. De dominerande varianterna som upptäcktes under denna övervakningsperiod var omikron variantens undergrupper, BA.2. och BA.2.75. Den veckovisa kvantifierade SARS-CoV-2-belastningen i avloppsvattenproverna visade en signifikant positiv korrelation till de kliniska fall som rapporterats i motsvarande avrinningsområden. Denna associering förstärktes ytterligare genom att normalisera SARS-CoV-2-innehållet med fekal biomarkör peppar milt fläckvirus (PMMoV). Dessutom har två metoder för tidig varning, nämligen medelvärdet plus två standardavvikelser (MSD) och positiv procentuell förändring (PPC), implementerats på avloppsvattendata, vilket pekar på vikten av att tillämpa sådana varningsmetoder för att ge förståeliga och tolkbara resultat. Denna studie ger värdefulla insikter om övervakning och analys av SARS-CoV-2 i avloppsvatten, vilket bidrar till utvecklingen av robusta system för tidig varning och folkhälsostrategier. / During the COVID-19 pandemic, wastewater-based epidemiology (WBE) has been applied extensively as a complementary tool to clinical testing across many parts of the globe. This project aimed to detect and measure the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) load in wastewater samples using Reverse transcriptase quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). The analyzed samples were from four different wastewater treatment plants (WWTPs) in Sweden, covering the period from November 2022 through May 2023. The study encompassed an overview of various sampling and analytical techniques and normalization approaches employed in WBE studies, highlighting the importance of method selection. SARS-CoV-2 RNA was detected in all the samples analyzed, and infection trends could be identified effectively, including the COVID-19 peak observed during the holiday season. The dominant variants detected during this monitoring period were the omicron variants; omicron BA.2. and omicron BA.2.75. The weekly quantified SARS-CoV-2 load in the wastewater samples showed a significant positive correlation to the clinical cases reported in the corresponding catchment areas. This association was further enhanced by normalizing SARS-CoV-2 content with the fecal biomarker pepper mild mottle virus (PMMoV). Furthermore, two early warning methods, namely the mean plus two standard deviations (MSD) and positive percentage change (PPC), were implemented on the wastewater data pinpointing the importance of applying such warning methods to provide understandable and interpretable results. This study provides valuable insights into the monitoring and analysis of SARS-CoV-2 in wastewater, contributing to the development of robust early warning systems and public health strategies.

Globalt har hela världens befolkning påverkats både ekonomiskt och psykiskt av coronaviruset SARS-CoV-2, som har drabbat så många människor med covid-19 att det klassas som en pandemi. Strax efter pandemins utbrott upptäcktes det att viruset utsöndras från avföring och ut i spillvattennätet som leder till reningsverken. Då virusmängden ökar i avloppsvattnet ökar även covid-19 fallen i samhället. Ökning av virusmängd i avloppsvatten kan nämligen signalera om att det förekommer smittspridning i samhället. Avloppsvattenbaserad övervakning kan dock användas som komplement till andra teststrategier vilket EU-kommissionen har nämnt i en rekommendation. Trender kan analyseras för att i ett tidigt skede informera sjukvård och regioner om ökad smittspridning.  På Kungsängens reningsverk i Västerås kommun har Mälarenergi analyserat avloppsvattnet för att ta reda på om ökning av virus i avloppsvatten kan indikera på ökad smittspridning i Västerås kommun. De har samlat in proverna och skickat det till SGS Analytics AB Sweden som har analyserat proverna med RT-qPCR. CT-värdena har normaliserats med vattenflöden. Korrelationstest har gjorts mellan virusmängd i avloppsvattnet och covid-19 fall, dödsfall samt IVA-fall. Det fanns ett signifikant svagt negativt samband mellan virusmängd i avloppsvatten och covid-19 fall per vecka. Mellan virusmängd och IVA-fall eller dödsfall fanns inget samband. Det finns en del felkällor som kan ha påverkat virusmängden. Vid höga vattenflöden kan PCR inhibitorer från tillskottsvatten och lakvatten ha påverkat CT-värdena. Värdena är höga på sommaren trots att covid-19 fall, dödsfall och IVA-fall var som lägst. Inhibitorer skapar direkt eller indirekt högre CT-värden vilket tolkas som lägre virusmängder.