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Perfil de Virulência de Isolados Clínicos de Staphylococcus aureus Relacionados a Diferentes Clones EpidêmicosLUZ, Ana Carolina de Oliveira 09 March 2015 (has links)
Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-04-26T17:32:19Z
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Previous issue date: 2015-03-09 / CNPQ / FACEPE / Staphylococcus aureus é considerado o patógeno mais importante de seu gênero, responsável por diversas infecções, variando desde infecção de pele e tecidos moles, até pneumonia, endocardite e sepse. Uma das causas da diversidade patogênica desta bactéria é a grande variedade de fatores de virulência que podem ser produzidos. O presente estudo foi desenvolvido com o objetivo de melhor compreender o perfil de virulência de S. aureus, e a possível relação destes com os clones epidêmicos circulantes na região estudada. Para tal, foram estudados 89 isolados clínicos de S. aureus provenientes de diferentes hospitais de Recife/PE, obtidos de diversas fontes de infecção e com diferentes perfis genéticos. Foram realizadas investigações dos genes fnbA e fnbB (ligação à fibronectina), cna (ligação ao colágeno), clfA e clfB (fatores clumping, ligação ao fibrinogênio), icaA e icaD (produção de biofilme), lukF-PV e lukS-PV (leucocidina Panton Valentine), cap5 e cap8 (cápsula polissacarídica), genes do cluster gênico de enterotoxinas (seg, sei, sem, sen e seo), e análise do proteoma e secretoma de dois clones amplamente distribuídos. Todos os isolados apresentaram no mínimo oito fatores de virulência. Foram estabelecidos 39 genótipos, dos quais nenhum se mostrou clone específico. Analisando-se o padrão protéico, diversas proteínas, em especial três fatores de virulência, mostraram-se diferencialmente expressos. Como conclusão, pode-se sugerir que os isolados clínicos estudados possuem alto potencial virulento, possuindo um arcabouço genético capaz de desenvolver quadros clínicos graves. / Staphylococcus aureus is considered the most important pathogen within its genre, responsible for a variety of infections, ranging from skin and soft tissue infections to pneumonia, endocarditis and sepsis. One of the causes for this bacterium’s pathogenic diversity is the great variety of virulence factors that can be produced. The present study was developed aiming a better comprehension the virulence profile of S. aureus, and the possible relationship between them and current epidemic clones in the study area. To do so, we studied 89 clinical isolates of S. aureus from various sources of infection and with different genetic backgrounds. Investigations were conducted for the genes fnbA and fnbB (fibronectin binding proteins), cna (collagen binding protein), clfA and clfB (clumping factors, fibrinogen binding proteins), icaA and icaD (biofilm formation), lukF-PV and lukS-PV (leucocidin Panton Valentine), cap5 and cap8 (capsule polyssacharides), genes from the enterotoxin gene cluster (seg, sei, sem, sen and seo), and proteome and secretome analysis of two widely spread epidemic clones. All isolates showed positive for, at least, eight virulence factors. Thirty-nine genotypes were stablished, none of which showed itself as clone specific. Analysing the proteic pattern, several proteins, in special three virulence factors, were differentially expressed. As conclusion, we can suggest that the clinical isolates studied have a high virulence potential, possessing a genetic background capable of developing severe clinical syndromes.
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Degradação de petróleo por cultura mista de fungos e bactériasMELO, Erik Jonne Vieira de 18 February 2011 (has links)
Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-06-30T19:06:37Z
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Previous issue date: 2011-02-18 / CNPQ / O petróleo é o recurso energético mais utilizado na sociedade atual, porém seu uso ocasiona grandes riscos de impactos ambientais. Portanto, a aplicação de técnicas como a biorremediação, que utiliza o metabolismo dos microrganismos, para eliminação ou redução de poluentes é aplicada em acidentes com petróleo e seus derivados. O objetivo deste trabalho foi de avaliar a capacidade dos microrganismos em degradar petróleo e estabelecer as melhores condições para a biorremediação. Os microrganismos (18 bactérias e 14 fungos) utilizados pertencem as Coleções de Microrganismos da UFPE. Inicialmente foram selecionados 3 bactérias e 3 fungos com potencialidade para degradação do petróleo. Essas linhagens foram submetidas à aclimatação em concentrações crescentes do poluente. O consórcio foi definido através de delineamento experimental utilizando uma matriz de Plackett & Burman e o melhor consórcio foi submetido a um ensaio em reator. Dentre os fungos o Aspergillus oryzae apresentou a melhor taxa de degradação com 66,05% dos compostos alifáticos e a bactéria B15 apresentou percentual de 32,43%. O planejamento experimental mostrou o consórcio número 12 com degradação de 91,96% dos hidrocarbonetos alifáticos do petróleo. Em biorreator observa-se um perfil característico para um consórcio misto, com degradação dos hidrocarbonetos de 87,52%. Com base nos resultados, isoladamente o Aspergillus oryzae pode ser apontado como promissor na biorremediação e o consórcio selecionado também pode ser utilizado na degradação de hidrocarbonetos alifáticos de petróleo. / Oil is the most used energy resource in our society, but their use produces serious risks of environmental impacts. Therefore, the application of techniques such as bioremediation, which uses the metabolism of microorganisms for elimination or reduction of pollutants is applied in accidents petroderivados. The aim of this study was to evaluate the ability of microorganisms to degrade oil and establish the best conditions for bioremediation. The microorganisms (18 bacteria and 14 fungi) used belong Collections of Microorganisms, UFPE. Initially we selected three bacteria and three fungi with potential for oil degradation. These strains were subjected to acclimation at increasing concentrations of oil. The consortium was set by experimental design using a matrix of Plackett & Burman and best consortium submitted to a test reactor. Among the fungi Aspergillus oryzae showed the best degradation rate with 66.05% of aliphatic compounds and bacteria B15 presented a percentage of 32.43%. The planning consortium showed the number 12 with 91.96% of the degradation of aliphatic hydrocarbons from petroleum. In a bioreactor there is a characteristic profile for a mixed consortium, with degradation of the hydrocarbons of 87.52%. Based on results alone Aspergillus oryzae is reported as promising in bioremediation and the consortium can also be used in the degradation of aliphatic hydrocarbons from petroleum.
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Bioprospecção de actinobactérias endofíticas de folhas de Moiringa oleifera Lam. em três localidades do Estado de Pernambuco e avaliação dos metabólitos secundários produzidos por esses micro-organismosSOUZA, Igor Felipe Andrade Costa de 26 February 2016 (has links)
Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-07-13T16:44:02Z
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Previous issue date: 2016-02-26 / CNPQ / Moringa oleifera Lamarck é uma planta pertencente à Família das Moringaceae, caracterizada como uma planta arbórea. Os vegetais possuem uma microbiota característica que tem importância para a sua sanidade e manutenção. Sendo esses micro-organismos denominados de endofíticos. Destaca-se a presença das actinobactérias, como produtores de metabólitos bioativos. O presente trabalho teve por objetivo a bioprospecção, através do isolamento, da identificação e da avaliação de actinobactérias endofíticas isoladas de folhas da M. oleifera. As folhas foram coletadas no campus Recife da Universidade Federal de Pernambuco, no Jardim Botânico do Recife do Recife e na cidade de Caruaru no Estado de Pernambuco, Brasil. Sendo processadas no prazo de 24 horas, através da metodologia de desinfecção. O isolamento foi realizado por maceração. A observação macroscópica foi realizada através da observação de características das colônias. A caracterização micromorfológica foi realizada através da técnica de microcultivo em placa. Testes fenotípicos para classificação taxonômica foram realizados. A análise do potencial de produção de metabólitos com atividade antimicrobiana foi realizada através de uma seleção primária em meio sólido, pela técnica do ―Teste em Bloco de Gelose‖. A actinobactéria endofítica selecionada no ensaio primário como melhor produtora do composto bioativo, foi cultivada em meios líquidos e testada contra micro-organismos testes. A Atividade antimicrobiana durante a fermentação foi avaliada através do teste de Difusão em Ágar. Foram isolados 33 actinobactérias endofíticas, sendo 21 (63,6%) linhagens provenientes das folhas coletadas da M. oleifera no Jardim Botânico do Recife; 8 (24,2%), no campus Recife da UFPE; e 4 (12,2%), na Cidade de Caruaru. A análise macroscópica verificou-se que não houve diversidade em relação aos aspectos observados. A análise microscópica permitiu inferir que em apenas 13 (39,4%) isolados foi possível determinar o gênero, sendo eles: Streptomyces e Actinomadura. Os ensaios fenotípicos foram inconclusivo diante da diversidade de gêneros pertencentes ao Filo Actinobacteria. Das 33 actinobactérias, 21(62,6%) apresentaram atividade inibitória sobre o fungo filamentoso. Apenas 5(15,2%) isolados apresentaram atividade sobre os micro-organismos testes Gram-negativos. Os micro-organismos testes Gram-positivos foram bastante sensíveis quando do teste de inibição, apresentando halos médio de até 35mm. A ação sobre o Mycobaterium smegmatis foi observada em representantes de todos os grupos isolados. Sobre as leveduras, observa-se que 5(12,2%) actinobactérias endofíticas apresentaram atividade insignificante frente a esses micro-organismos testes. No ensaio primário, não houve produção de compostos bioativos nos meios de cultivo: ISP-1, ISP-4, Meio Khanna, ALA, AVP, BDA, CAA, GAA, YCED, pelo Strptomyces sp. CC4. Através da análise estatística, observou-se que os meios K e MPE são os melhores estatisticamente. Durante o processo de extração do principio ativo, observou-se que este encontra-se na biomassa, sendo o metanol o melhor solvente extrator. A análise qualitativa da atividade antimicrobiana demonstrou que as actinobactérias isoladas das folhas de M. oleifera possuem potencial biotecnológico na produção de compostos bioativos com ação farmacológica. / Moringa oleifera Lamarck is a plant belonging to the family of Moringaceae characterized as a woody plant. Plants have a characteristic microbiota that is important for your health and maintenance. And these micro-organisms called endophytes. There is the presence of actinomycetes as producers of bioactive metabolites. This study aimed to bioprospecting, through the isolation, identification and evaluation of endophytic actinomycetes isolated from leaves of M. oleifera. The leaves were collected in Recife campus of the Federal University of Pernambuco, in the Botanical Garden of Recife Recife and the city of Caruaru in Pernambuco State, Brazil. Being processed within 24 hours methodology by disinfection. The isolation was carried out by maceration. Macroscopic observation was performed by observing the characteristics of the colonies. The micromorphological characterization was performed by microculture plate technique. phenotypic tests for taxonomic classification were performed. The analysis of metabolites with antimicrobial activity production potential was performed by a primary selection in solid medium, the technique of "Test agar block." The endophytic actinobacteria selected in the primary test as the best producer of the bioactive compound, was cultured in liquid media and tested against microorganisms tests. The antimicrobial activity during fermentation was evaluated using the diffusion test in agar. 33 endophytic actinomycetes were isolated, 21 (63.6%) strains collected from the leaves of M. oleifera in the Botanical Garden of Recife; 8 (24.2%) in Recife UFPE campus; and 4 (12.2%) in the city of Caruaru. Macroscopic analysis showed that there was no diversity with respect to observed aspects. Microscopic analysis allowed to infer that in only 13(39.4%) isolates were unable to determine the genre, namely: Streptomyces and Actinomadura. Phenotypic tests were inconclusive given the diversity of genres belonging to the phylum Actinobacteria. Of the 33 actinomycetes, 21(62.6%) had inhibitory activity against the filamentous fungus. Only 5(15.2%) isolates showed activity against microorganisms Gram-negative tests. Microorganisms Gram-positive tests were sensitive enough when the inhibition test, showing halos average of up to 35mm. Action on Mycobacterium smegmatis was observed in representatives of all isolated groups. On the yeast, it is observed that 5(12.2%) endophytic actinomycetes showed negligible activity against these microorganisms tests. In the primary test, there was no production of bioactive compounds in culture media: ISP-1, ISP-4, Khanna, ALA, AVP, BDA, CAA, GAA, YCED by Streptomyces sp. CC4. The statistical analysis showed that media K and MPE are the best statistically. During the extraction process the active ingredient, it was observed that this is the biomass, methanol being the best extraction solvent. Qualitative analysis of antimicrobial activity showed that the isolated actinomycetes of M. oleifera leaves have biotechnological potential in the production of bioactive compounds with pharmacological action.
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Efeitos isolados de cipermetrina e metomil na microbiota humanaRIBEIRO, Sarana Héren Pereira 31 March 2016 (has links)
Submitted by Rafael Santana (rafael.silvasantana@ufpe.br) on 2018-01-31T19:35:35Z
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Previous issue date: 2016-03-31 / CAPES / O Brasil é o maior consumidor de pesticidas. Cipermetrina é um pesticida no grupo
dos piretróides, altamente tóxico (classe II). Metomil é um metilcarbamato, extremamente
tóxico (classe I). Ambos são credenciados para uso em várias culturas e diversos
resíduos de agrotóxicos têm sido encontrados nos alimentos, dos mais variados
tipos, no Brasil. Isto levanta o problema que envolve o consumo desenfreado
de pesticidas e seus efeitos sobre a microbiota humana. A colonização adequada da
microbiota normal impede o adoecimento do organismo, por diversos mecanismos
funcionais e de defesa que dependem da atuação de micro-organismos comensais.
O objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos isolados da Cipermetrina e Metomil sobre
a microbiota humana. Os testes realizaram-se com bactérias e leveduras comensais,
utilizando espécies comuns da microbiota humana (Escherichia coli, Staphylococcus
aureus, S. epidermidis, Candida albicans, C. krusei, C. tropicalis, C. parapsilosis,
C. guilliermond). Para os testes foram usados métodos de microtitulação em
caldo Mueller-Hinton (para bactérias) e caldo Saboreaud (para leveduras), conforme
norma técnica da ANVISA. Cipermetrina e Metomil provaram ser capazes de destruir
esses micro-organismos. A ênfase é sobre cipermetrina, cujas concentrações bactericida
(0,03 mg) e fungicida (0,03 mg) ficaram muito próximas à Ingestão Diária Aceitável
(IDA) estabelecida pela ANVISA (0,05 mg/ kg peso). Portanto, os níveis de
consumo de cipermetrina estabelecidos como ingestão segura podem gerar riscos
para a saúde. Não se exclui o risco do Metomil que, com ação microbicida em concentrações
maiores, é igualmente comprometedor, porque as doses bactericidas e
fungicidas também se aproximaram de sua IDA. / Brazil is the largest consumer of pesticides. Cypermethrin is a pesticide in the highly
toxic (Class II) pyro-trophic group. Methomyl is an extremely toxic methylcarbamate
(class I). Both are accredited for use in several crops and various agrotoxic residues
have been found in foods in Brazil. This raises the problem that involves the uncontrolled
consumption of pesticides and their effects on a human microbiota. An adequate
colonization of the normal microbiota prevents the organism from becoming
diseased, through several functional and defense mechanisms that depend on the
performance of commensal microorganisms. The objective of this study was to evaluate
the isolated effects of Cypermethrin and Methomyl on a human microbiota. The
tests were carried out with bacteria and commensal yeasts, using common species
of the human microbiota (E. coli, Staphylococcus aureus, S. epidermidis, Candida
albicans, C. krusei, C. tropicalis, C. parapsilosis, C. guilliermond). For the tests, microtiter
methods were used in Mueller-Hinton broth (for bacteria) and Saboreaud
broth (for yeasts), according to the ANVISA technical standard. Cypermethrin and
Metomil proved to be capable of destroying these microorganisms. The emphasis is
on cypermethrin, whose bactericidal (0.03 mg) and fungicidal (0.03 mg) were very
present in the Acceptable Daily Intake (ADI) established by ANVISA (0.05 mg / kg
bw). Therefore, the levels of cypermethrin consumption established as safe intake
may lead to health risks. The risk of Metomil, which with the bactericidal and fungicidal
doses also approached its ADI, is not excluded.
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Purificação e caracterização de uma lectina antimicrobiana da raiz de Portulaca elatiorSILVA, José Dayvid Ferreira da 26 February 2016 (has links)
Submitted by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-04-20T18:19:01Z
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Previous issue date: 2016-02-26 / CAPES / Plantas contêm lectinas, ligantes de carboidratos e proteínas hemaglutininantes, capazes de induzir respostas biológicas em células de plantas e animais. Portulaca elatior é uma planta tóxica para o gado e cabras. Este estudo identificou um tecido de P. elatior com atividade hemaglutinante (AH), isolado a lectina a partir dele e determinada às características da lectina isolada. Extratos de folhas, caule e raiz foram investigados e o extrato de raiz foi o único a apresentar HA, com isso foi selecionado para isolamento da lectina por cromatografia em coluna de quitina. A lectina de raiz de P. elatior (PeRoL) eluída da coluna de quitina apresentou peptídeos com 32 e 15 kDa na SDS-PAGE sob condições não redutoras e redutoras, respectivamente. A AH de PeRoL se manteve a 120ºC e numa faixa de pH de 4.0 a 8.0 e os íons Ca2+ e Mn2+ não estimularam a lectina. O dissacarídeo trealose foi o melhor carboidrato inibidor da AH. Ensaios revelaram que o extrato da raiz de P. elatior contêm trealose e apresentou uma AH de 4-1 e pós-purificado de 4096-1 enquanto o extrato tratado com trealase apresentou AH de 256-1. Estes resultados revelam que trealose é o inibidor endógeno da AH de PeRoL. PeRoL apresentou atividade bacteriostática contra Pseudomonas aeruginosa (CMI 32,5 µg/mL), Enterococcus faecalis (CMI 8,1 µg/mL) e Staphylococcus aureus (CMI 4,06 µg/mL) e atividade fungicida contra Candida albicans (CMI e CMF 16,5 µg/mL), Candida parapsilosis, Candida krusei e Candida tropicalis (CMI e CMF 15 µg/mL). O estudo demonstrou que a raiz de P. elatior contem PeRoL, um ligante de quitina e lectina antimicrobiana, bem como a trealose, o carboidrato inibidor de PeRoL. / Plants contain lectins, carbohydrate binding and hemagglutinin proteins, capable of induce biological responses in cells of plants and animals. Portulaca elatior is a plant toxic to cattle and goats. This study identified the P. elatior tissue with the best specific hemagglutinating activity (SHA), isolated the lectin from it and determined characteristics of isolated lectin. Leaf, stem and root extracts were investigated and the root extract, which was the one that presented HA, was selected to isolate lectin by chitin column chromatography. P. elatior root lectin (PeRoL) eluted from chitin column showed polypeptide bands with 32 and 15 kDa on SDS-PAGE under non-reducing and reducing conditions, respectively. The PeRoL HA was active at 120ºC and pH range from 4.0 to 8.0 and Ca2+ and Mn2+ did not affect its HA. The disaccharide threalose was the best carbohydrate inhibitor of HA. Assays revealed that the root extract containing threalose and showed HA 4-1 and post-purification 4096-1 while the root extract treated with threalase showed HA 256-1. These data revealed that trehalose is an endogenous inhibitor of PeRoL HA. PeRoL showed bacteriostatic activity against Pseudomonas aeruginosa (MIC 32.5 µg/mL), Enterococcus faecalis (MIC 8.1 µg/mL) and Staphylococcus aureus (MIC 4.06 µg/mL) and fungicide activity against Candida albicans (MIC and MFC 16.5 µg/mL), Candida parapsilosis, Candida krusei and Candida tropicalis (MIC and MFC 15 µg/mL). The study demonstrated that root of P. elatior contain PeRoL, a chitin-binding and antimicrobial lectin as well as threalose, a carbohydrate inhibitor of PeRoL.
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Avaliação de lectina solúvel em água de sementes de Moringa oleifera (WSMoL) no controle da biocorrosãoMOURA, Maiara Celine de 29 July 2016 (has links)
Submitted by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-06-01T17:12:10Z
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Previous issue date: 2016-07-29 / FACEPE / Bactérias são organismos procariontes capazes de se adaptar aos mais variados tipos de habitat;
podem crescer e aderir a várias superfícies, formando comunidades complexas conhecidas
como biofilmes. O desenvolvimento de biofilme, na maioria dos casos, resulta em riscos para
a saúde em ambientes clínicos, devido a elevada patogênese, e causa perdas econômicas em
diferentes setores da indústria, sendo a principal causa da biocorrosão. Estratégias de controle
dos biofilmes envolve o uso de antibióticos e biocidas; entretanto, bactérias dentro de biofilmes
são mais resistentes a vários tipos de tratamentos. Diversos mecanismos de resistência
bacteriana aos antimicrobianos sintéticos são descritos. Pesquisas têm sido desenvolvidas com
o objetivo de identificar compostos naturais capazes de agir frente a microrganismos
planctônicos e em biofilmes visando aplicações médicas e industriais. As lectinas são proteínas
que se ligam especificamente a carboidratos e podem ter atividades biológicas importantes,
podendo atuar como agentes antibacterianos e antibiofilme. Este trabalho avaliou a atividade
antibacteriana da lectina solúvel em água de sementes de Moringa oleifera (WSMoL) contra
bactérias que podem estar envolvidas na biocorrosão e infecções humanas (Bacillus sp.,
Bacillus cereus, Bacillus pumillus, Bacillus megaterium, Micrococcus sp., Pseudomonas sp.,
Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas stutzeri e Serratia marcescens) investigando seu
efeito no crescimento, sobrevivência e permeabilidade celular. Em adição, também estudamos
a formação de biofilme por S. marcescens e Bacillus sp. (ambas bactérias sensíveis a WSMoL)
e avaliamos o efeito de WSMoL na formação de biofilme e sobre biofilmes pré-estabelecidos
para ambas as espécies. Um protótipo de revestimento de superfícies com WSMoL por técnica
de imersão (dipping coating) e a viabilidade das células dentro de biofilmes desenvolvidos sob
a superfície revestida com a lectina também foram determinados. WSMoL inibiu o crescimento
bacteriano, induziu a aglutinação e promoveu o extravasamento de proteínas de todas as
espécies bacterianas avaliadas. Efeito bactericida foi detectado contra Bacillus sp., B. pumillus,
B. megaterium, P. fluorescens e S. marcescens. Microscopia de fluorescência de células de S.
marcescens mostrou que WSMoL causou danos a sua estrutura. A lectina foi capaz de impedir
a formação de biofilmes de S. marcescens e Bacillus sp., principalmente para Bacillus sp. a 41,6
e 20,8 μg/mL; o mecanismo de antiformação pode estar associado com a perda da viabilidade
celular. WSMoL não destruiu a matriz de biofilmes pré-estabelecidos de S. marcescens,
entretanto, as células aderidas apresentaram-se presas e danificadas em estruturas envolvidas
pela lectina. Sobre biofilmes de Bacillus sp., a lectina a 208 μg/mL drasticamente reduziu o
número de células aderidas a superfície. WSMoL espontaneamente aderiu a superfície de vidro
produzindo uma superfície revestida com a área de 116 μg/cm2, sendo capaz de alterar a
viabilidade de células de S. marcescens que aderiram a essa superfície e prevenir a adesão de
células de Bacillus sp., impedindo a formação de biofilme, sem interferir na viabilidade. Esse
trabalho demonstra o potencial de WSMoL como uma ferramenta no controle de biofilmes
formados por bactérias corrosivas e patogênicas, que representam um desafio em ambientes
clínicos e industriais. / Bacteria are prokaryotic organisms able to adapting to the most varied types of habitat; can
grow and adhere to many surfaces, forming complex communities known as biofilms. Biofilm
development, in most cases, results in health risks in clinical environments and causes economic
losses in different industries sectors, being the main cause of biocorrosion. Control strategies
of biofilms involves the use of antibiotics and biocides; however, bacteria whitin biofilms are
more resistant to various treatments. Various mechanisms of bacterial resistance to
antimicrobial synthetic compounds are described. Researches have been developed in order to
identify natural compounds able to act against planktonic microorganisms and inside biofilms
for medical and industrial applications. Lectins are proteins that bind specifically to
carbohydrates and may have important biological activities, acting as antibacterial and
antibiofilm agents. This work evaluated the antibacterial activity of a water-soluble Moringa
oleifera seed lectin (WSMoL) against bacteria that could be involved in biocorrosion and
human infections (Bacillus sp., Bacillus cereus, Bacillus pumillus, Bacillus megaterium,
Micrococcus sp., Pseudomonas sp., Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas stutzeri and
Serratia marcescens) by evaluating its effect on growth, survival and cell permeability. In
addition, we also studied the formation of biofilm by S. marcescens and Bacillus sp. (both
bacteria sensitive to WSMoL) and evaluated the effect of WSMoL on biofilm formation and
under established biofilms for both strains. A prototype of WSMoL-coated surfaces by dipping
coating and the viability of cells within biofilm developed under the coated-surface were also
determinated. WSMoL inhibited the bacterial growth, induced agglutination and promoted the
leakage of proteins from cells of all strains. Bactericidal effect was detected against Bacillus
sp., B. pumillus, B. megaterium, P. fluorescens and S. marcescens. Fluorescence microscopy of
S. marcescens cells showed that WSMoL caused damage to its structure. The lectin was able to
impair biofilms formation of S. marcescens and Bacillus sp., mainly for Bacillus sp. at 41.6 and
20.8 μg/mL; the antibiofilm mechanism can be associated with the lost of cell viability.
WSMoL did not destroy preformed S. marcescens biofilms; despite the fact that attached cells
presented trapped and damaged in hollow structures made by lectin. On Bacillus sp. biofilm,
the lectin at 208 μg/mL drastically reduced the number of attached cells on surface. WSMoL
spontaneously adhere on glass surface producing a lectin-coated area at 116 μg/cm2 that was
able to alter the viability of S. marcescens cells, which adhered to the surface and preventing
Bacillus sp. attachment, impairing biofilm development, without interfering in cell viability.
This work propose the use of WSMoL as a potential tool to control biofilms formed by corrosive
and pathogenic bacteria, which pose a challenge in clinical and industrial settings.
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Bioprospecção da interação plantas/bactérias diazotróficas associadas a duas variedades de cana-de-açúcar em mudas micropropagadasBARRETO, Maria do Carmo Silva 21 February 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-02-21 / CAPES / A FBN por bactérias diazotróficas associadas a plantas não leguminosas pode contribuir com parte do suprimento de N para as plantas, reduzindo os custos de produção e danos ambientais. O uso dessas bactérias tem sido foco de inúmeras pesquisas, por ser uma alternativa para reduzir o uso de fertilizantes químicos nitrogenados. Neste contexto o trabalho teve como objetivos avaliar a combinação de bactérias diazotróficas endofíticas regionais visando à introdução comercial da prática da inoculação destas bactérias em biorreatores em plantas micropropagadas de cana-de-açúcar na variedade RB92579; isolar, identificar e verificar a população de bactérias diazotróficas associadas à cana-de-açúcar variedade RB867515, em diferentes Estados do Nordeste do Brasil assim como avaliar os efeitos de diferentes estirpes de bactérias endofíticas oriundas da cana-de-açúcar RB867515 em sua fase inicial de crescimento (45 e 150 Dias Após Inoculação), com e sem inoculação e adubação nitrogenada. As variáveis analisadas foram: massa seca da parte aérea e raiz, perfilho e teor de N acumulada na planta. Amostras de colmos e raízes de cana-de-açúcar foram coletadas em três Estados do Nordeste do Brasil: Paraíba, Pernambuco e Alagoas. As raízes e colmos foram submetidas à desinfestação superficial e utilizou-se os meios semi-seletivos Nfb, JMV, LGI-P e JNFb para contagem e isolamento, e em seguida procedeu-se a caracterização fisiológica e molecular dos isolados bacterianos. Foram isoladas 52 bactérias endofíticas nativas as quais foram avaliadas à capacidade de fixar nitrogênio, a atividade de redução do acetileno (ARA), capacidade de solubilizar fosfato inorgânico e produção de ácido indol acético (AIA). Foram realizados três ensaios em casa de vegetação em delineamento inteiramente ao acaso, em tubete com substrato estéril e em vasos com solo. No ensaio com a variedade RB92579 em vasos com solo, a inoculação mista promoveu um aumento significativo da massa seca da parte aérea das plantas sem adição do adubo nitrogenado, enquanto que o acúmulo de N-total nos tecidos não apresentou diferença significativa entre os tratamentos com e sem adubação. Quanto ao potencial biotecnológico da comunidade bacteriana, 57% do total de isolados apresentaram capacidade de fixar N2in vitro, 69% apresentaram halo de solubilização, com índice de solubilização (IS) variando de 1,4 a 3,3 em meio de cultura com fosfato inorgânico e que praticamente todos os isolados foram capazes de produzir AIA. A inoculação de bactérias fixadoras de nitrogênio nativas da região Nordeste em mudas micropropagadas de cana-de-açúcar na variedade RB867515 aos 45 DAI não houve diferença significativa entre as plantas inoculadas e o controle não inoculado. Em vasos aos 150 DAI, a inoculação promoveu o desenvolvimento e também apresentaram performance semelhante ao tratamento nitrogenado. Os resultados mostram que a resposta da inoculação na micropropagação em biorreator de imersão temporária (BIT) é possível, e sugere um grande potencial na resposta à inoculação e otimização do processo em escala comercial, assim como a aplicação de estirpes homólogas pode ter contribuído para uma melhor resposta pela interação bactérias endofítica vs variedades de cana-de-açúcar (RB92579 e RB867515). / BNF by diazotrophic bacteria associated with non-leguminous plants may contribute with part of the N supply to the plants, reducing production costs and environmental damage. The use of these bacteria has been the focus of numerous researches, since it is an attractive alternative to reduce the use of chemical nitrogen fertilizers. In this context, the work had as objectives evaluate thecombination of regional endophytic diazotrophic bacteria aiming at the commercial introduction of the inoculation of these bacteria in bioreactors in micropropagated plants of sugarcane variety RB92579; isolated, identify and verify the sugarcane-associated diazotrophic bacteria population inthe sugarcane variety (RB867515), in different states of northeastern Brazil and evaluate the effects of different strains of endophytic bacteria from the sugarcane variety RB867515, on its growth at the initial growth stage (45 and 150 Days After Inoculation), with and without inoculated and nitrogen fertilization equivalent to 80 kg of N ha-1. The variables analyzed were: dry mass of shoots and roots, tillering and N content accumulated in the plant. Samples of stems and roots of sugarcane were collected in three States of the northeast of Brazil: Paraíba, Pernambuco and Alagoas. Roots and stems were submitted to surface disinfestation and the semi-selective media NFb, JMV, LGI-P and JNFb were used for counting and isolation, and then the molecular and physiological characterization of the bacterial isolates. Fifty-two native endophytic bacteria were isolated and characterized, being evaluated for their nitrogen fixation ability, acetylene reduction activity (ARA), inorganic phosphate solubilization and indole acetic acid (IAA) production. Were carried out in a greenhouse in a completely randomized design, in a tube with sterile commercial substrate and another in pots with soil. In the soil pot experimente with variety RB92579, the mixed inoculation promoted a significant increase in the dry mass of shoots of the plants without nitrogen fertilizer addition, whereas the total N accumulation in the tissues did not present significant difference between the treatments with and without fertilization. Concerning the biotechnological potential of the bacterial community, 57% of the total isolates showed in vitro N2-fixation ability, 69% presented solubilization halo, with solubilization index (SI) ranging from 1.4 to 3.3 in culture medium with inorganic phosphate and virtually all isolates were able to produce IAA. The inoculation of nitrogen-fixing bacteria native to the northeast region in micropropagated seedlings of sugarcane variety RB867515 at 45 days after inoculation, there was no significant difference between the inoculated plants and the uninoculated control. In pots, at 150 DAI, the inoculation promoted plant development and also presented similar performance to the nitrogen treatment. The results show that inoculation response in micropropagation in temporary immersion bioreactor (BIT) is possible and suggests a great potential in response to inoculation and optimization of the process in commercial scale, as the application of homologous strains may have contributed to a better response by interaction between endophytic bacteria and sugarcane varieties (RB92579 and RB867515).
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Sensor impedimétrico baseado em nanopartículas de ouro modificadas com Clavanina A em camadas automontadas de cisteína para detecção de bactériasMIRANDA, Juliana Lima de 29 July 2016 (has links)
Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-07-10T21:08:12Z
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Previous issue date: 2016-07-29 / FACEPE / As infecções hospitalares são uma das principais causas de morte e aumento da morbidade entre pacientes hospitalizados. O grupo de patógenos associados a estas infecções são denominadas bactérias oportunistas. Escherichia coli, Salmonella typhimurium, Enterococcus faecalis e Staphylococcus aureus são bacterias importantes associadas a infecções hospitalares. As nanopartículas de ouro (AuNPs) e peptídeos antimicrobianos (PAMs) têm sido amplamente estudados visando o desenvolvimento de biossensores mais eficazes. Cisteína (Cys) é um aminoácido comumente usado para a modificação da superfície de AuNPs devido ao seu grupo tiol que se liga espontaneamente às superfícies metálicas. A Clavanina A (ClavA) é um PAM que se destaca por apresentar atividade contra bactérias Gram-negativas (BGN) e Gram-positivas (BGP). O objetivo desse trabalho foi o estudo das propriedades eletroquímicas do sistema AuNPsCysClavA visando o desenvolvimento de um biossensor para a identificação de BGN e BGP. O processo da modificação do eletrodo foi avaliada por espectroscopia de impedância eletroquímica (EIE) e a voltametria cíclica (VC). EIE e VC foram utilizadas em uma faixa de frequência de 100 mHz e 100 KHz e faixa de varredura de -0,2V para 0,7V, respectivamente. Um aumento gradual do diâmetro do semicírculo Cole-Cole foi observada depois de cada passo da modificação do eletrodo. Como esperado, uma resposta semelhante foi observada na resistência de transferência de carga (Rᴄᴛ) devido à adsorção dos componentes do sensor. O aumento do Rᴄᴛ é mais evidente após a adsorção do BGN e BGP. Foram observadas as respostas mais significativas para S. typhimurium e E. coli. Além disso, os voltamogramas cíclicos do eletrodo de ouro limpo mostraram picos anódicos e catódicos bem definidos. Subsequentemente, uma diminuição dos picos anódicos e catódicos foi mais expressa após a adsorção de S. typhimurium e E. coli. Os resultados mostraram uma boa sensibilidade do sensor. O biossensor proposto pode ser uma alternativa viável para a detecção específica das bactérias. / Nosocomial infections are a major cause of death and increased morbidity among hospitalized patients. The group of pathogens associated to these infections are denominated opportunistic bacteria. Escherichia coli, Salmonella typhimurium, Enterococcus faecalis and Staphylococcus aureus are important bacteria associated to nosocomial infections. Gold nanoparticles (AuNPs) and antimicrobial peptides (AMPs) have been extensively investigated aiming the development of more effective biosensors. Cysteine (Cys) is an amino acid commonly used for surface modification of AuNPs due to its thiol group that spontaneously bind to metal surfaces. Clavanin A (ClavA) is an AMP with activity against Gram-negative (GNB) and Gram-positive (GPB) bacteria. The objective of this work was to study the electrochemical properties of ClavACysAuNPs system for the development of a biosensor to identify GNB and BGP. The stepwise process of the electrode modification was evaluated by electrochemical impedance spectroscopy (EIS) and cyclic voltammetry (CV). EIS and CV were recorded in a frequency range of 100 mHz to 100 KHz and scan range of -0.2V to 0.7V, respectively. A gradual increase of the Cole-Cole semicircle diameter was observed after each step of the electrode modification. As expected, a similar response was observed in the charge transfer resistance (Rᴄᴛ) due to the adsorption of the components of the sensor. The Rᴄᴛ increase is more evident after adsorption of the NBG and GPB. The most significant responses were observed for S. typhimurium and E. coli. In addition, cyclic voltammograms of the bare gold electrode showed well-defined anodic and cathodic peaks. Subsequently, a decrease in the cathodic and anodic peaks are more expressed after adsorption of S. typhimurium and E. coli. The results showed a good sensitivity of the sensor. The proposed biosystem can be a viable alternative for specific detection of bacteria.
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Biodiversidade bacteriana em água do mar: isolamento, caracterização e aplicação no tratamento de águas contaminadas pelo óleo combustível marítimo MF-380MELO, Erik Jonne Vieira de 26 February 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-02-26 / O combustível marinho ou “Marine Fuel-(MF)”, ou Bunker, conhecido também como Liquido de Fase Não Aquosa (LFNA), é obtido por destilação fracionada do petróleo bruto, contituído principalmente por hidrocarbonetos de cadeias longas (alcanos, cicloalcanos e aromáticos), possibilitando diferentes categorias químicas. O óleo MF-380 tem como propriedades elevada emulsificação, baixa evaporação e intemperização lenta, permanecendo assim por longos períodos nos sedimentos, sendo um xenobiótico de difícil degradação. Neste sentido, estudos iniciais foram realizados com a água do mar do Porto de Suape, PE, Brasil, avaliando os aspectos biológicos, particularmente a biota bacteriana local. A coleta da água do mar foi realizada em três pontos, sendo as bactérias isoladas em membrana filtrante (0,22 µm), utilizando meios de culturas seletivos, sendo isoladas um total de 602 bactérias, não sendo observado diferenças no número de bactérias isoladas para os diferentes pontos de amostragem. Observou-se ainda que, o gênero mais frequente foi Bacillus (98%), seguido de Serratia (2%). As bactérias isoladas foram avaliadas quanto ao potencial oxidativo, frente ao combustível MF-380 (cedido pela TRANSPETRO). Os ensaios de degradação foram realizados em Erlenmeyers (500 mL), no meio Bushnell Haas-BH, na presença de 1% a 5% do MF-380 como fonte de carbono, incubados em condições estáticas, temperatura de 30±1ºC, por 10 dias. Excelentes resultados foram obtidos com 24h, onde 90 bactérias (15,2%) demonstraram habilidade oxidativa, e a partir dessas, observou-se que sete bactérias demonstraram atividade lipolítica (4,5 U/L a 77,2 U/L). A bactéria selecionada P11-A, com (77,2% de atividade lipolítica), demonstrou degradar 100% de Dodecano e 93,9% do Pentadecano, respectivamente, para a concentração de 3% do MF-380. Na concentração mais elevada do MF-380 (5%) observou-se uma maior degradação para hidrocarbonetos com cadeias menores pela mesma bactéria, como para Eicosano (91,6%) e Docosano (85,7%). A partir desses resultados foi realizado consorcio entre as sete bactérias selecionadas pela atividade lipolítica, empregando um planejamento Plackett & Burman, onde a variável dependente demonstrou que a bactéria P11-A (Bacillus sp.) apresentou maior potencial biotecnológico para degradação do óleo MF-380. Portanto, os estudos realizados sugerem que o Bacillus sp. (P11-A) pode ser aplicado nos processos de biorremediação pelo óleo combustível MF-380, possibilitando o interesse pelas indústrias petrolíferas. / The marine fuel or "Marine Fuel- (MF)" or Bunker, also known as non-aqueous phase liquids (LFNA) is obtained by fractional distillation of crude oil, composed primarily of long chain hydrocarbons (alkanes, cycloalkanes and aromatics ), enabling different chemical classes. The MF-380 oil has properties as high emulsification, low evaporation and slow weathering, remaining for long periods in sediments, with a xenobiotic difficult degradation. Initial studies were performed with seawater the Port of Suape, PE , Brazil, evaluating the biological, particularly bacterial biota site. The collection of sea water was performed at three points, and the bacteria isolated in membrane filter (0.22 microns) using means of selective cultures, and isolated a total of 602 bacteria, not observable differences in the number of bacteria to isolated the different sampling points. It was also observed that the most common genus Bacillus was (98%), followed by Serratia (2%). Bacterial isolates were evaluated for oxidative potential, compared to the MF-380 fuel (donated by TRANSPETRO). The degradation tests were performed in Erlenmeyer flasks (500 ml), the middle Bushnell-Haas BH, in the presence of 1% to 5% of MF-380 as the carbon source, incubated in static conditions, temperature 30 ± 1 ° C for 10 days. Excellent results were obtained with 24, 90 where bacteria (15.2%) showed oxidative ability, and from these, we found that 7 bacteria showed lipase activity (4,5U / L to 77,2U / L). The bacterium selected P11-A, (77.2% of lipase activity) showed 100% Dodecane degrade and 93.9% of pentadecane, respectively, to a concentration of 3% MF-380. At the higher concentration of MP-380 (5%) observed increased degradation to smaller hydrocarbon chains with the same bacteria, such as for eicosane (91.6%) and docosane (85.7%). From these results was carried out between 7 bacteria consortium selected by lipase activity, employing a Plackett & Burman planning, where the dependent variable showed that the P11-A bacterium (Bacillus sp.) showed higher biotechnological potential for MF-380 oil degradation. Therefore, studies have suggested that Bacillus sp. (P11-A) can be applied in bioremediation processes for fuel oil MF-380, allowing interest in the oil industry.
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Caracterização fitoquímica e avaliação da atividade biológica de Hirtella racemosa var. Hexandra (Willd. Ex Schult.) Prance (Chrysobalanaceae)LIMA, Victor Hugo Moreira de 13 February 2015 (has links)
Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-08-28T21:34:36Z
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Previous issue date: 2015-02-13 / CAPES / A utilização de plantas medicinais para o tratamento de enfermidades é uma prática exploratória e largamente difundida no Brasil. Muitas espécies da família Chrysobalanaceae são utilizadas na medicina popular. Hirtella racemosa var. hexandra (Willd. ex Schuldt.) Prance, popularmente conhecida como ajirú-do-mato, ajururana ou murtinha, é uma planta de porte arbusivo que se desenvolve em biomas como caatinga, restinga e cerrado. Esta planta tem sido popularmente utilizada no Brasil, para o tratamento do diabetes, porém existem poucos estudos fitoquímicos da espécie em questão. Este trabalho teve como objetivo realizar a caracterização fitoquímica e a avaliação da atividade biológica (antimicrobiana, antioxidante e toxicidade) das folhas de H. racemosa. Foi realizada a extração dos metabólitos em aparelho de Soxhlet, utilizando solventes de polaridades distintas para posterior avaliação das atividades biológicas. Os métodos empregados para atividade antimicrobiana foram difusão em ágar por disco e poço, Concentração Inibitória Mínima (CIM) e Concentração Bactericida Mínima (CBM). Os extratos foram avaliados sobre bactérias Gram-positivas e Gram-negativas. O estudo fitoquímico realizado em CCD (Cromatografia em Camada Delgada) identificou no extrato bruto a apresença de fenóis, taninos, antocianinas, flavonóides, esteróides, triterpernóides e saponinas. Em geral, a inibição promovida pelos extratos no teste de difusão em ágar por poço foi maior do que os valores obtidos por disco, independentemente do extrato vegetal testado. A CIM variou entre 0,39 a 100 mg.mL⁻¹, sendo que para as bactérias Gram-negativas a variação das CIMs foi entre 3,13 a 12,5 mg.mL⁻¹ e de 0,78 a 12,5 mg.mL⁻¹ para as Gram-positivas, indicando estas como sendo as bactérias mais suscetíveis. Os percentuais de determinação do sequestro de DPPH variaram de 8,13% a 90,78%. No bioensaio de toxicidade do extrato de Hirtella racemosa frente à A. salina, a dose letal capaz de matar 50% das larvas (DL₅₀) foi de 43,4 mg L⁻¹. O valor de DL₅₀ do extrato indica que ele possui atividade biológica considerada significativa. Nesse estudo, podemos constatar que o extrato apresenta grupos de compostos químicos derivados do metabolismo secundário das plantas, além de apresentar atividade antioxidante e antimicrobiana. O teste de toxicidade contra A. salina mostrou que o extrato apresenta toxicidade ativa. Os resultados obtidos nesta pesquisa contribuem para o conhecimento de uma espécie vegetal com potenciais farmacológicos inexplorados, podendo vir a colaborar no desenvolvimento de novas drogas. / The use of medicinal plants for the treatment of diseases is an exploratory practical and widespread in Brazil. Many Chrysobalanaceae family species are used in folk medicine. Hirtella racemosa var. hexandra (Willd. ex Schuldt.) Prance, popularly known as ajirú-do-mato, ajururana or murtinha, is a arbusivo sized plant that grows in biomes such as scrub, salt marsh and savanna. This plant has been popularly used in Brazil for the treatment of diabetes, but there are few phytochemical studies of the species concerned. This study aimed to carry out the phytochemical characterization and evaluation of biological activity (antimicrobial, antioxidant and toxicity) of H. racemosa leaves. Extraction of the metabolites was performed in a Soxhlet apparatus using solvents of different polarities for subsequent evaluation of biological activities. The methods used for antimicrobial activity were spread on agar for disk and well, Minimum Inhibitory Concentration (MIC) and Minimum Bactericidal Concentration (MBC). The extracts were evaluated on Gram-positive and Gram-negative bacteria. The phytochemical study in Thin Layer Chromatography identified in the crude extract to The presence of phenols, tannins, anthocyanins, flavonoids, steroids, triterpernóides and saponins. In general, inhibition extracts promoted by the agar diffusion test per well was higher than the values obtained by the disc, regardless of the plant extract tested. The MIC ranged from 0.39 to 100 mg.mL⁻¹, and for Gram-negative bacteria variation of MICs was between 3.13 to 12.5 mg.mL⁻¹ and 0.78 to 12.5 mg.mL⁻¹ for Gram-positive, indicating this to be the most susceptible bacteria. The percentages of determination of DPPH abduction ranged from 8.13% to 90.78%. In the bioassay toxicity Hirtella racemosa extract opposite the A. salina, the lethal dose capable of killing 50% of the larvae (LD₅₀) was 43.4 mg L⁻¹. The LD₅₀ value of the statement indicates that it has biological activity considered significant. In this study, we can see that the extract shows groups of chemical compounds derived from secondary metabolism of plants, besides having antioxidant and antimicrobial activity. The toxicity test against A. salina showed that the extract shows active toxicity. The results of this research contribute to the knowledge of a plant species with potential untapped pharmacological and may have to collaborate in developing new drugs.
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