A área de pesquisa denominada Informática para Biodiversidade enfrenta o desafio de suprir a demanda por tecnologia de apoio à conservação da biodiversidade. Dentre as áreas da ecologia que se beneficiam de recursos tecnológicos, a modelagem de distribuição de espécies se destaca pelo número de ferramentas e de algoritmos desenvolvidos para os pesquisadores da área. No entanto, estudos demostram que a modelagem tem se tornado mais complexa, bem como, a necessidade por melhorias da aplicação de novas técnicas e soluções computacionais. A interoperabilidade computacional para os dados de biodiversidade, que incluem os modelos gerados pelas ferramentas de modelagem, é citada pelos autores e pesquisadores da área como uma preocupação que demanda estudos, definição de melhores práticas e soluções de computação. Cada tópico que envolve a modelagem como, algoritmos, parâmetros, dados de ocorrência, camadas ambientais, ferramentas e técnicas para a elaboração de modelos, além dos padrões de metadados e perfis de aplicação, são objetos de estudo para que seja possível a interoperabilidade nesse campo de pesquisa. Este trabalho apresenta, portanto, uma estratégia computacional para apoiar a interoperabilidade entre os modelos gerados pelas ferramentas de modelagem de distribuição de espécies, através do uso de padrões de metadados e pelo desenvolvimento de um perfil de aplicação que apoie essa interoperabilidade. São apresentados dois estudos de caso com o objetivo de validar essas estratégias e uma arquitetura computacional para apoiar comunidades de desenvolvimento de ferramentas de modelagem a buscarem essa interoperabilidade entre os dados fornecidos e processados por elas. As contribuições deste trabalho envolvem a disponibilização de um perfil de aplicação voltado para a área de modelagem de distribuição de espécies, um protótipo de software para processar os modelos gerados pelas ferramentas de modelagem, o incentivo e o uso do digital objetct identification para disponibilização dos dados, além do processo de pesquisa e da validação de metodologias que foram utilizadas para se alcançarem os resultados desta pesquisa. / The research area called Informatics for Biodiversity faces the challenge of meeting the demand for technology to support biodiversity conservation. Among the areas of ecology that benefit from technological resources, the modeling of species distribution is notable for the number of tools and algorithms developed to researchers in this area. However, studies have shown that modeling has become more complex, as well as the need for improvements in the application of new techniques and computational solutions. The computational interoperability for biodiversity data, which includes models generated by modeling tools, is cited by authors and researchers in the field as a concern that demands studies, definition of best practices and computing solutions. Each topic that involves modeling such as algorithms, parameters, occurrence data, environmental layers, tools, techniques for the elaboration of models, standards of metadata and application profiles are objects of study of this dissertation. This thesis presents a computational strategy to support the interoperability between the models generated by the modeling tools of species distribution, through the use of metadata standards and the development of an application profile that supports this interoperability. Two case studies are presented with the objective of validating these strategies and we also present a computational architecture to support communities to develop of modeling tools to seek this interoperability between the data supplied and processed by them. The contributions of this work involve the provision of an application profile for the area of species distribution modeling, a software prototype to process the models generated by the modeling tools, the incentive and use of the digital objetct identification to make data available, and in addition to the process of research and validation of methodologies that were used to summarize the results of this research.

O processo de elaboração, execução, coleta e análise de dados de experimentos ambientais com abelhas utilizando meios computacionais como suporte a pesquisa, é uma atividade complexa por exigir do pesquisador conhecimentos específicos aos quais ele não foi preparado para atuar. Laboratórios virtuais conhecidos como Weblabs são ferramentas de apoio a pesquisa, pois permitem a realização de experimentos sem a necessidade da presença física da equipe de pesquisadores. O modelo matemático utilizado junto com a sua interpretação são partes do experimento, porém não são tratados dessa maneira atualmente nos Weblabs. Este trabalho propõe a especificação de uma arquitetura de referência a ser empregada como modelo para permitir o desenvolvimento de componentes que disponibilizem serviços com a capacidade de efetuar a integração de dados coletados por meio de experimentos científicos executados com o auxílio dos Weblabs com ferramentas especialistas voltadas a experimentos ambientais e de biodiversidade. A especificação é baseada no paradigma de arquitetura orientada a serviços, permitindo o gerenciamento de análise de experimentos utilizando Weblabs e disponibilizando os serviços especificados para funcionamento em ambientes distribuídos. Este modelo é a base para um estudo de caso com a elaboração de uma prova de conceito, por meio do desenvolvimento de um componente que publique, disponibilize e integre os dados coletados em um Weblab com uma ferramenta especialista em análises ambientais. / The preparation, execution, collection and closing of an experiment using computational means to support the research, is a complex activity because it requires specific knowledge of the researcher to whom he was not prepared to act. WebLabs are known support tools to researchers, because they allow performing experiments without the physical presence of the research team. Among the activities undertaken by the researcher, after collecting data, performs the analysis of data, in which mathematical and statistical models are applied to interpret the data. In a Weblab experiments are performed through web in remote laboratories, and also needed to analyze the data obtained with the data collection. The mathematical model used along with their interpretation are events that are part of the experiment, but are not treated that way today in Weblabs. This paper proposes the specification of reference architecture to be used as a template to allow the development of components that provide services with the ability to make the integration of data collected through scientific experiments carried out with the help of weblabs with tools aimed at environmental and biodiversity experiments. The specification is based on the paradigm of service oriented architecture, allowing management analysis using Weblab experiments and providing the services specified for operation in distributed environments. This model is the basis for a case study with the development of a proof of concept, through development of a component that publishes and distributes and integrates the data collected in a Weblab with a special tool in environmental analysis.

A modelagem de nicho ecológico combina dados ambientais com informações sobre a ocorrência de uma espécie para obter modelos que descrevem a sua distribuição probabilística em uma região. Algoritmos computacionais geram modelos baseados na hipótese de que, se uma espécie foi encontrada sob as condições que definem o seu nicho, então ela pode sobreviver em qualquer lugar que ofereça as mesmas condições. A técnica de modelagem normalmente utiliza dados obtidos de diferentes provedores, em grandes quantidades e em formatos diferentes, e os resultados são exportados para outras ferramentas de análise e interpretação, como os SIGs, Sistemas de Informação Geográfica. Os sistemas de informação disponíveis para modelagem de nicho ecológico são monolíticos e, embora efetivamente implementem algoritmos para gerar modelos, não foram projetados para atender todos os requisitos da modelagem. Este trabalho define uma solução mais abrangente, na forma de uma infraestrutura orientada a serviços para a modelagem de nicho ecológico. A opção pela orientação a serviços está diretamente relacionada com a integração de sistemas. A infraestrutura especifica um barramento de serviços para gerenciá-los, com funcionalidades como roteamento e garantia de entrega, e para tratar questões de interoperabilidade. Antes de construir a infraestrutura, foi formalizado o processo de modelagem de nicho ecológico. Ele permitiu definir o domínio do problema, identificar falhas e potenciais evoluções, e acelerar a curva de aprendizado de pesquisadores iniciantes. Definida a infraestrutura, foram abordados outros aspectos da modelagem, resultando em soluções integradas para alguns dos problemas identificados. Em algoritmos para geração de modelos, foi apresentada uma solução usando tecnologia adaptativa, com resultados promissores. Em computação de alto desempenho, o Garp, um dos algoritmos mais utilizados para modelagem, foi paralelizado. Além de resultados positivos em relação ao desempenho, esta iniciativa mostrou como se evoluir neste sentido. Para integração com outros provedores e disponibilização de recursos oferecidos por outras ferramentas de software, foi proposta a integração com serviços de SIG, utilizando padrões estabelecidos para serviços geoespaciais. Em conjunto, estas soluções mostram a capacidade da infraestrutura de atender os requisitos já identificados e evoluir para incorporar novas características que a evolução natural das técnicas de modelagem venham a desenvolver. Incorporando as soluções propostas à infraestrutura, foi desenvolvido um portal de modelagem para atender aos usuários desta técnica. A modelagem de nicho ecológico apresenta desafios em diferentes áreas do conhecimento e a abordagem adotada permitiu formalizá-los. Trabalhos em andamento incluem a avaliação de modelos, a evolução do barramento de serviços, o desenvolvimento de ontologias e a incorporação de sistemas legados, com potenciais benefícios para a modelagem de nicho ecológico. Como resultado adicional, o próprio desenvolvimento do trabalho mostrou que a solução é integrável com outros domínios, comprovadamente os de agricultura de precisão e polinizadores, mostrando a versatilidade e o potencial da infraestrutura de serviços apresentada. / Ecological niche modelling combines environmental data and information about the occurrence of a species to obtain models to describe its probabilistic distribution in a region. Computational algorithms generate models based on the hypothesis that, if a species was found under the conditions which define its niche, then it may survive in any place which offers the same conditions. The modelling technique usually applies data obtained from different providers, in large quantities and different formats, and the results are exported to other analysis and interpretation tools, such as GIS, Geographic Information Systems. Information systems available for ecological niche modelling are monolithic and, although they effectively implement algorithms for model generation, they were not designed to meet all modelling requirements. This work defines a more comprehensive solution, a service-oriented infrastructure for ecological niche modelling. The choice of a service-oriented solution is directly related to system integrations requirements. The infrastructure specifies a service bus to manage services with many features, such as routing and delivery, and to treat interoperability issues. Before building the infrastructure, the ecological niche modelling process was formalized. It allows defining the problem domain, identifying failures, gaps and potential evolutions, and increasing the learning curve of beginners. Having the infrastructure defined, other modelling aspects were addressed, resulting in integrated solutions for some of the identified problems of the technique. In algorithms for model generation, a solution using adaptive technology was introduced, with promising results. In high performance computing, the Garp, one of the algorithms most applied for modelling, became parallel. Besides positive results related to performance, this initiative showed how to evolve in this sense. Related to integration with other providers and availability of resources offered by other software tools, a proposal to integrate GIS services was presented, applying patterns for geospatial services. Together, these solutions show the ability of the infrastructure to meet all identified requirements and to evolve in order to incorporate new features that the natural evolution of modelling techniques may develop in the future. Incorporating the proposed solutions to the infrastructure, a portal of ecological niche modelling was developed to serve the users of this technique. Ecological niche modelling presents challenges in different areas of knowledge and the adopted approach allowed formalizing them. Research work is ongoing and includes model evaluation, bus services evolution, ontologies development and incorporation of legacy systems, with several potential benefits for ecological niche modelling. As an additional result, the development of this work indicates that the solution may be extended to other domains, such as precision agriculture and pollinators, showing the versatility and the potential of the presented services infrastructure.

Os polinizadores prestam um importante serviço no resultado das colheitas e na conservação de ecossistemas. Estima-se que os valores gerados pelos seus serviços somem 200 bilhões de dólares ao ano. Entretanto, a FAO, braço das Nações Unidas para a Agricultura, indica um declínio significativo dos polinizadores, apontando para uma crise de polinização. As ações para a conservação e o uso sustentável dos polinizadores em resposta a esta crise, demandam um significativo suporte das Tecnologias da Informação em várias das suas atividades. Em particular, na integração de diferentes fontes e tipos de dados, que é decorrência da complexidade dos processos biológicos que se pretende entender e manejar, e da velocidade com que essas áreas evoluem. Devido às ações de resposta ao declínio dos polinizadores, a comunidade científica brasileira e internacional, que necessitam de mais acesso aos dados sobre biodiversidade, demandam um novo papel da Webbee, um sistema de informação sobre a biodiversidade brasileira em abelhas nativas. Ela deve incorporar os dados regionais e se integrar às redes de dados globais sobre biodiversidade como referência em informações sobre espécies e espécimes de abelhas nativas brasileiras, e de polinização por estas abelhas. Visando proporcionar uma fundamentação para o desenvolvimento de ferramentas que atendam esses requisitos de integração e de interoperabilidade para a Webbee, é proposta uma arquitetura orientada a serviços que adota as ferramentas de padronização e de comunicação de dados sobre biodiversidade utilizados e mantidos por entidades internacionais, tais como GBIF, IABIN-PTN e TDWG. Dada a importância da interação para o processo de polinização, e devido à ausência de um padrão específico para a troca deste tipo de dado, um esquema conceitual de dados de interação entre espécimes foi desenvolvido em um processo iterativo com a participação da comunidade científica via TDWG. Este esquema é a base de um estudo de caso proposto para a realização de provas de conceito, sob a forma de uma ferramenta de digitalização, catalogação e publicação de dados sobre espécimes e interação entre eles. / Pollinators provide an important service in agriculture and the conservation of ecosystems. It is estimated that the values generated by their services reach 200 billion dollars a year. However, the Food and Agriculture Organization of the United Nations indicates a significant decline of pollinators, pointing to a \"crisis of pollination. The actions for the conservation and sustainable use of pollinators in response to this crisis demand significant support from Information Technology. Particularly, in the integration of diverse sources and type of data, that is a consequence of the complexity of the biological processes that one strives to understand and manage, and of the high speed at which area evolves. As a response to the pollinators decline, the international and Brazilian scientific communities, that need greater access to biodiversity data, demand a new role to Webbee, an information systems about the Brazilian biodiversity on native bees. It should incorporate regional data and integrate to global biodiversity data networks as a reference for information on species and specimens of Brazilian native bees, and pollination by those bees. Aiming to provide a foundation for the development of tools that meet these requirements of integration and interoperability of Webbee, it is proposed a service-oriented architecture based on tools and services for standardization and communication of biodiversity data used by international entities such as GBIF, IABIN-PTN and TDWG. Given the importance of interaction in the pollination process, and due to the absence of specific standards for the exchange of such data, a conceptual data schema about interaction between specimens was developed in an iterative process involving the scientific community via TDWG. This schema is the base of a case study proposed to conduct a proof of concept, in the form of a tool for digitization, cataloging and publishing data on specimens and interactions between them.

Zoneamentos ambientais (ZA) são instrumentos utilizados em diversas áreas como instrumento de planejamento territorial e para ordenamento de atividades econômicas. Sua utilização como ferramenta de apoio a outros instrumentos da Política Nacional do Meio Ambiente (PNMA), como o licenciamento ambiental, deve incorporar aspectos ecológicos visando à incorporação da preocupação com a conservação da biodiversidade em fases estratégicas da tomada de decisão. O estudo de caso sobre a expansão do setor sucroalcooleiro de São Paulo representa a integração entre os processos de licenciamento ambiental (etapa de triagem) e o denominado \"Zoneamento Agroambiental do Setor Sucroalcooleiro do Estado de São Paulo\" (ZAA-SP), onde a localização dos pedidos em relação ao mapa elaborado indica o tipo de estudo a ser realizado para avaliação do projeto. Foi estabelecido um panorama para seleção de critérios e indicadores voltados à conciliação entre preocupações com a conservação da biodiversidade e o desenvolvimento do setor por meio da abordagem DPSIR (Força motriz, Pressão, Estado, Impacto, Resposta), que permite uma avaliação causal entre o processo produtivo e as características ambientais por ele afetadas, além de permitir adaptações que foram necessárias para o seu desenvolvimento. Posteriormente, foram desenvolvidas análises espaciais na região Noroeste do estado de São Paulo, onde se criaram 8 (oito) cenários para avaliar: (i) a influência da escala dos dados adotados em cada critério avaliado e (ii) a decisão pelos valores de referência para estes indicadores. Os resultados indicaram um acréscimo de \'áreas inadequadas\' e \'adequadas com restrições\' em um total superior a 2Mha no cenário \"ideal\". O rigor quanto ao indicador de declividade foi responsável pelo maior acréscimo de áreas \'inadequadas\' – o que neste estudo representa um aspecto relevante tanto para a conservação e manutenção de recursos hídricos e do solo, mas também define o método de colheita, manual ou mecanizada – e as áreas indicadas para novas áreas protegidas influenciaram na delimitação das áreas \'adequadas com restrições\', a partir da delimitação das zonas de amortecimento de Unidades de Conservação de Proteção Integral. Estes cenários foram confrontados com a localização de unidades industriais de novos pedidos de licenciamento, além de suas áreas de influência, procurando avaliar se os estudos exigidos para o projeto em questão eram condizentes com as recomendações do ZAA-SP. Considerando o mapa do cenário ideal (com novas bases de dados e novos parâmetros), dos pedidos avaliados por Relatório Ambiental Preliminar (RAP) por estarem em zonas mais adequadas no ZAA-SP, 36,6% deveriam ter sidos reavaliados quanto a esta decisão, com a possibilidade de elaboração de estudos completos (Estudo de Impacto Ambiental e Relatório de Impacto Ambiental – EIA/RIMA), sendo que duas destas propostas já deveriam ter sido negadas por terem sido alocadas em zonas \'inadequadas\' neste último mapa. Considerando as áreas de plantio (áreas de influência) dos empreendimentos analisados houve um incremento superior a 340% de alocação de \'áreas inadequadas\' entre o ZAA-SP e o cenário mais conservador das análises, equivalente a mais de 1Mha em áreas absolutas. Isto é preocupante, pois as atividades agrícolas do setor ensejam uma série de impactos sobre a biodiversidade e os ecossistemas. Desta forma, baseados na adaptação e atualização do instrumento, a consideração equivocada das características do território pode prejudicar os processos de avaliação de impactos quando estes não exigirem estudos mais completos. A partir do estudo de caso, percebe-se que a integração de instrumentos da PNMA deve ser conduzida com parcimônia para que cada instrumento adote critérios e indicadores adequados ao seu objetivo, pois decisões erradas já nas primeiras etapas de avaliação de projetos prejudicam a capacidade dos instrumentos envolvidos de exercer seu papel dentro dos sistemas de gestão ambiental. / Environmental zoning (EZ) are instruments applied by many fields such as territorial planning and for planning of economic activities. Its use as a support tool to other instruments of the National Environmental Policy (NEP), as the environmental licensing, must incorporate ecological aspects for conservation of biodiversity in strategic phases of decision making. The study case about the expansion of sugarcane sector of São Paulo representes an integration between the environmental licensing process (screening stage) and the so-called \"Agro-Environmental Zoning of Sugarcane Industry of the State of São Paulo\" (ZAA-SP), where location of requests in the elaborated map indicates the type of study to be conducted for evaluating the project. A framework was established for selection of criteria and indicators aimed at reconciling concerns about biodiversity conservation and the development of the sector through the DPSIR approach (Driving force, Pressure, State, Impact, Response), allowing a causal evaluation between production process and the environmental characteristics affected by it, and allowed adjustments which were necessary for its development. Later, spatial analyzes were developed in the northwestern region of the state of São Paulo, where were created eight (8) scenarios to assess: (i) the influence of the scale of databases used in each criteria and (ii) the decision by reference values for these indicators. The results indicated an increase of \'unsuitable areas\' and \'suitable with restrictions\' in a total of more than 2Mha in the \"ideal\" scenario. Slope restrictions indicator was responsible for the largest increase of inappropriate areas - which in this study is an important issue both for conservation and maintenance of water resources and soil, but also sets the harvest method, manual or mechanized - and indicated areas for new protected areas influenced the definition of \'suitable with restrictions\' zones, derived from definition of Full Protection Conservation Units buffer zones. These scenarios were confronted with the location of industrial units of new applications, as well as their areas of influence, seeking to assess whether the studies required for the project in question were consistent with the ZAA-SP\'s recommendations. Considering the map of the \"ideal\" scenario (with new databases and new parameters), the applications evaluated by Preliminary Environmental Report (PER) for being in more suitable areas in ZAA-SP, 36.6% should be reassessed about this decision, with the possibility of preparing more complete studies (Environmental Impact Statement - EIS), and two of these proposals should have been denied because they were allocated into \'inadequate\' zones in the latter map. Considering the plantation areas (areas of influence) of the analyzed enterprises, there was an increase of more than 340% of allocation in the \'unsuitable areas\' between the ZAA-SP and the most conservative scenario analyzes, equivalent to more than 1Mha in absolute areas. This is worrying because the agricultural activities of the sector cause impacts on biodiversity and ecosystems. Thus, based on the adaptation and updating of the instrument, the erroneous consideration of the characteristics of the territory can hinder the assessment of impacts when they do not require more comprehensive studies. From the study case, we can see that the integration of NEP instruments should be conducted sparingly so that each instrument can adopt appropriate criteria and indicators to your goal, because wrong decisions within the first steps of project evaluation undermine the ability of instruments involved to exercise its role within the environmental management systems.

Estudos da dinâmica de florestas tropicais evidenciam a importância do conhecimento da relação existente entre a luz e a distribuição das espécies para o entendimento da regeneração e manutenção da diversidade dessas comunidades. Para contribuir com este conhecimento para as espécies que ocorrem nas Restingas o presente estudo descreveu a distribuição dos indivíduos arbustivo-arbóreos com DAP maior que 4,8cm em treze categorias indiretas de regime de luz em 5,12 hectares de uma Floresta de Restinga situada na Ilha do Cardoso, Município de Cananéia, SP. Estas categorias correspondem aos diferentes microsítios de luz do mosaico florestal, e são oriundas da combinação entre condições quanto ao tipo ou ausência de cobertura (cobertura decídua, cobertura perenifólia ou a pleno sol) e situações de localização dos indivíduos arbustivoarbóreos na floresta (clareira, sub-bosque, dossel). As espécies amostradas foram classificadas em grupos ecológicos de acordo com a literatura disponível em pioneiras, secundárias iniciais, sub-bosque, clímax e não classificadas para correlação com a distribuição de seus indivíduos nas categorias de luz. Foram amostrados 7.277 indivíduos arbustivo-arbóreos sendo 381 pioneiros distribuídos em 12 espécies, 4.138 secundários iniciais distribuídos em 24 espécies, 48 típicos de sub-bosque distribuídos em duas espécies, 2.133 climáxicos distribuídos em 48 espécies e 577 indivíduos distribuídos em 19 espécies permaneceram sem classificação. Das 105 espécies amostradas, 35 apresentaram uma distribuição preferencial por determinados microsítios de luz. Estes padrões de distribuição encontrados sugeriram que a quantidade de luz que chega ao subbosque das Florestas de Restinga não restringe a ocorrência de espécies pioneiras apenas às clareiras. Para algumas espécies a classificação em grupos ecológicos encontrada na literatura não foi coerente com a distribuição dos indivíduos, tendo sido sugerida uma classificação diferente de acordo com sua ocorrência nessa Floresta de Restinga, que só se confirmará através de repetições deste estudo ao longo do tempo. Foram delimitadas 77 clareiras na área de estudo durante a classificação dos indivíduos nas categorias indiretas de regime de luz, para as quais foram estimadas área, forma, composição de espécies e de indivíduos para análise da distribuição das espécies e grupos ecológicos em seu interior e favorecer futuras comparações com estudos recorrentes na área ou com estudos de regeneração natural. Repetições desse método numa mesma área, ao longo do tempo, e em diferentes áreas da mesma formação florestal proporcionarão o acúmulo de dados não só sobre a distribuição momentânea dos indivíduos, mas da dinâmica dessas florestas, promovendo o conhecimento sobre o comportamento ecológico das espécies e dos padrões de distribuição das mesmas em relação à luz. / Tropical Forest dynamics studies elucidate the importance of knowledge about the relationship between light and distribuition of species to understanding the regeneration and diversity mainteinence of these communities. To contribute with this knowledge to Restinga Forest species this study described the distribuition of trees with dbh (diameter at breast high) ≥4,8cm in thirteen (13) indirect light categories, in 5,12ha of a Restinga Forest in Ilha do Cardoso, Cananeia Municipal District, Sao Paulo State. These categories correspond to different light micro-sites within the forest mosaic and are derived of the combination of the type or absence of covery where the individuals can be under of (under decidual trees, under evergreen trees or under intense light) and the position which each individual can ocupy within the forest (gap, understory, canopy). All the species were classified in ecological groups according to available literature into pioneers, early secondary, understory, climax and non-classified to correlation with their individuals distribuition within the light categories. There were sampled 7.277 tree specimens represented by 381 pioneers of 12 different species, 4.138 early secondary of 24 species, 48 understory of 2 species, 2.133 climax of 48 species and 577 non-classified specimens of 19 different species. Among the 105 species sampled, 35 presented preferential distribuition for some light micro-sites. These distribuition patterns suggest that the light quantity reaching the understory doesn't restrict the occurence of pioneer species only to gaps. For some species the classification in ecological groups found in the literature were not coherent with the individuals distribuition and there were been suggested another classification according to its occurence in the Restinga Forest, which will be confirmed only through repetitions of this study among time. There were delimited 77 gaps in the study area during the classification in the indirect light categories, to which there were estimated area, shape, species and individuals compositions to assess the distribuition of species and ecological grups within these gaps and support comparisons with repeated studies in this area and with natural regeneration studies. Recurring studies using this method over the same spot during time or in different areas of the same Forest formation will provide data accumulation not only about the instantaneous distribuition of the specimens, but also about these forests dynamics, promoting the knowledge about the ecological bahaviour of species and about distribuition patterns of these species according to light regimes.

Made available in DSpace on 2016-04-28T20:15:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009 - Raquel de Oliveira Simoes.pdf: 2148721 bytes, checksum: 7408aa4a20471b27145d83c2bea4886a (MD5) Previous issue date: 2009-01-28 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The objective of this study was to describe the composition and structure of helminthes community comparing the helminthes community component and infracommunity from sympatric rodents Akodon spp. and Oligoryzomys nigripes in the Atlantic Forest and in the different fragments size and the Parque Nacional da Serra dos ?rg?os (PARNA SO reserve. One hundred and fifty-six specimens of Akodon spp. and fifty-seven of Oligoryzomys nigripes were collected in Teres?polis, being 38 rodents in 4 small fragments (30 Akodon spp. and 8 O. nigripes), 58 in 4 medium fragments (43 Akodon spp. and 15 O. nigripes), 87 in 4 large fragments (67 Akodon spp. and 20 O. nigripes) and 30 in PARNASO (16 Akodon spp. e 14 O. nigripes). The stydy was done for two years (2004- 2005). The animals were necropsied and the viscera and cavities examined to helminthes parasites. A total of eighteen helminthes species were collected: 15 from Akodon spp. and12 from O. nigripes. Nine species were common for both rodents. The rodent Akodon spp. showed a higher richness than O. nigripes. A low degree of similarity between the helminthes infracommunities from Akodon spp. and O. nigripes was detected, although these rodents species live in coexistence. The terrestrial and arboreal behavior of O. nigripes and terrestrial behavior of Akodon spp. would determine this difference between both parasite communities. Probably, with the share of soil resource boths species of rodents could disseminate or be infected by the parasite. The prevalence of Stilestrongylus aculeata and mean abundance for Stilestrongylus eta increased, respectively, in small, medium and large fragments in Akodon spp.. The rodent O. nigripes showed high prevalence rate and mean abundance values for Stilestongylus lanfrediae (over 86%) regardless of the fragments size studied. The difference in mean richness for Akodon spp. and O. nigripes in different fragments size and PARNASO were not significant. There were variations between the helminthes infracommunities for the two species of rodent in different fragments size and PARNASO. These differences may also be related to the environmental changes that can produce both positive and negative effects on the transmission of helminthes parasites. / O objetivo deste trabalho foi descrever a composi??o e estrutura da comunidade helm?ntica comparando a comunidade componente e a infracomunidade dos helmintos das popula??es de roedores simp?tricos Akodon spp. e Oligoryzomys nigripes na Mata Atl?ntica e os diferentes tamanhos de fragmentos e a reserva do Parque Nacional da Serra dos ?rg?os (PARNASO). Cento e cinq?enta e seis esp?cimes de Akodon spp. e cinq?enta e sete de O. nigripes foram coletados no munic?pio de Teres?polis, sendo 38 roedores em 4 fragmentos pequenos (30 Akodon spp. e 8 O. nigripes), 58 em 4 fragmentos m?dios (43 Akodon sp p. e 15 O. nigripes), 87 em 4 fragmentos grandes (67 Akodon spp. e 20 O. nigripes) e 30 no PARNASO (16 Akodon spp. e 14 O. nigripes). O estudo foi feito durante dois anos (2004- 2005). Os animais foram necropsiados tendo suas v?sceras e cavidades tor?cica e abdominal examinadas para recupera??o de helmintos parasitos. Um total de 18 esp?cies de helmintos foram coletados: 15 em Akodon spp. e 12 em O. nigripes. Nove esp?cies foram comuns aos dois roedores. O roedor Akodon spp. teve uma maior riqueza parasit?ria do que O. nigripes. Um baixo grau de similaridade entre as infracomunidades de helmintos de Akodon spp. e O. nigripes foi observado, embora sejam esp?cies que coexistam. O comportamento terrestre e arbor?cola de O. nigripes e apenas terrestre de Akodon spp. poderia determinar essa diferen?a entre as duas comunidades de helmintos parasitos. Provavelmente, ao compartilharem os recursos do solo, ambas as esp?cies podem se infectar ou disseminar o parasita. A preval?ncia para Stilestrongylus aculeata e a abund?ncia m?dia para S. eta aumentaram, respectivamente, nos fragmentos pequenos, m?dios e grandes no Akodon spp.. O roedor O. nigripes apresentou elevada taxa de preval?ncia e valores de abund?ncia m?dia para S. lanfrediae (acima de 86%) independente do tamanho dos fragmentos estudados. A diferen?a na riqueza m?dia de Akodon spp. e O. nigripes nos diferentes tamanhos de fragmentos e no PARNASO n?o foi significativa. Houve varia??es entre as infracomunidades de helmintos das duas esp?cies de roedores nos diferentes tamanhos de fragmentos e PARNASO, podendo essas diferen?as estarem relacionadas com as altera??es ambientais causadas pela fragmenta??o que podem produzir tanto efeitos positivos como negativos na transmiss?o dos helmintos parasitos.

Submitted by Rosivalda Pereira (mrs.pereira@ufma.br) on 2017-12-06T19:58:17Z No. of bitstreams: 1 EtielleAndrade.pdf: 5645245 bytes, checksum: 50dac4ede343d307c2d8d6fef223061f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-06T19:58:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 EtielleAndrade.pdf: 5645245 bytes, checksum: 50dac4ede343d307c2d8d6fef223061f (MD5) Previous issue date: 2017-06-13 / FAPEMA / This study aimed to evaluate the diversity patterns and structure of anuran’s communities in the Cerrado remnants of the Parque Estadual do Mirado-PEM, correlating environmental variables with distribution patterns of the species and identifying factors that determine the conservation status of the park. Although the PEM is located an area of great ecological importance, few studies were conducted on the biological communities, especially of amphibians. Thus, we perform a survey about the amphibian’s species describing the richness and composition of anuran fauna and analyzing the influence of different vegetation types in their formation. The sampling was carried out through active search and survey on breeding sites in different water bodies in the PEM, which resulted in the registration of 31 species belonging to five families: Leptodactylidae, Hylidae, Bufonidae, Microhylidae and Phyllomedusidae. Species richness in the PEM was greater than that recorded by several other authors in different regions of Brazil, being formed by typical Cerrado species and by species strongly associated with other biomes. The replacement of the species among the different water bodies was considered high in all combination pairs tested, even among the nearest water bodies. The results revealed a different use in vocalization sites, forming different groups with varying degrees of overlap, with environmental heterogeneity being the best criterion to explain the high diversity and spatial and temporal distribution of the species. Structurally complex environments have greater availability of resources and the composition of communities is regulated by the degree of overlap in the use of available microenvironments. The PEM is an important corridor bioregional conservation and understand the factors that act on the ecological and biogeographic processes of species are useful in the implementation of the management plan of the park and essential for the conservation of amphibians of the Maranhão state. / O presente trabalho teve por objetivo avaliar os padrões de diversidade e estruturação das comunidades de anfíbios anuros em remanescentes de Cerrado do Parque Estadual do MiradorPEM, correlacionando as variáveis ambientais com os padrões de distribuição das espécies e identificando fatores que determinem o estado de conservação do parque. Apesar do PEM se encontrar numa área de grande importância ecológica, poucos foram os trabalhos realizados sobre as comunidades biológicas, especialmente a de anfíbios. Assim, foi realizado um levantamento das espécies de anfíbios, de modo a descrever a riqueza e a composição da anurofauna, analisando a influência dos diferentes tipos vegetacionais na sua formação. As amostras foram realizadas através de procura ativa e o levantamento em sítios reprodutivos em diferentes corpos d’água no parque que resultou no registro de 31 espécies, pertencentes à cinco famílias: Leptodactylidae, Hylidae, Bufonidae, Microhylidae e Phyllomedusidae. A riqueza de espécies no PEM foi maior que a registrada por vários outros autores em diferentes regiões do Brasil, sendo formada por espécies típicas de Cerrado e por espécies fortemente associadas a outros biomas. A substituição das espécies entre os diferentes corpos d’água amostrados foi considerada elevada em todos os pares de combinação testados, mesmo entre os corpos d’água mais próximos. Os resultados revelaram o uso diferenciado nos sítios de vocalização, formando diferentes grupos com graus variados de sobreposição, sendo a heterogeneidade ambiental o melhor critério para explica a elevada diversidade e a distribuição espaço-temporal das espécies. Ambientes estruturalmente complexos apresentam maior disponibilidade de recursos e a composição das comunidades é regulada pelo grau de sobreposição no uso dos microambientes disponíveis. O PEM é um importante corredor biorregional de conservação e entender os fatores que agem sobre os processos ecológicos e biogeográficos das espécies são úteis na implantação do plano de manejo do parque e fundamental para a conservação das espécies de anfíbios anuros do Maranhão.

Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2017-04-05T19:15:35Z No. of bitstreams: 1 2012 - Luana Priscila de Carvalho Pereira.pdf: 1129568 bytes, checksum: 6b12f4f6e3ee122c2cacabbf7752a126 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-05T19:15:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012 - Luana Priscila de Carvalho Pereira.pdf: 1129568 bytes, checksum: 6b12f4f6e3ee122c2cacabbf7752a126 (MD5) Previous issue date: 2012-06-26 / CAPES / Tropical forests have been recognized as the biome of the planet that has the highest species richness and high endemism. The Amazon forest is part of this scenario and its high diversity has not been fully identified, as well as the patterns that govern it. Although research on the biodiversity of this biome have advanced in recent years, certain groups still have limited knowledge about their geographical and seasonal distribution or even ignored in studies about monitoring, conservation and management. In this sense, the main objective of this study was to determine the composition, richness and rarity of poneromorph ants using different sampling techniques, as well as investigate the effect of seasonality and certain environmental factors in the community. The ants were collected in the National Forest Tapirap?-Aquir? in July 2009, January and July 2010 and January 2011 in three different areas (A1, A2 and A3). In areas A1 and A2 were determined four sampling points inside the forest where they were made two transects of 100 meters and installed every 10 meters a pitfall trap and attractive sardine baits on the undergrowth vegetation and soil. The pitfall was active for 48 hours and baits for an hour. In the A3 was determined only one distance into the woods where it was made the same sampling procedures. We found 46 species of poneromorph ants, belonging to eight genera. The sampling technique that was more effective against the richness of the ant fauna found was the pitfall, which recorded 44 species (95.7% of total) and included all the genera found. Then the bait on the soil showed the richness of 19 species (41.3% of total) and the bait on vegetation presented species richness of six (13% of total). All ants found belong to two sub-families, which were Ponerinae and Ectatominae. The species Gnamptogenys striatula Mayr, and Pachycondyla unidentata 1883 (Mayr, 1862) were found only in the bait on vegetation, they are absent on the ground baits and pitfall throughout sampling. The results for the composition of the poneromorph ant fauna and its seasonal distribution do not show a clear stratification in the community, and the ant species that occurred in the dry and rainy seasons do not form distinct groups in the three sampled areas. Statistical tests to evaluate the influence of environmental variables on the distribution of poneromorfas ants species revealed no association patterns. The identification of the species found has special relevance because contribute to the consolidation of the knowledge of the biodiversity of the Amazon rainforest poneromorfas ants and allow comparative studies with other tropical forest regions. / As florestas tropicais tem sido reconhecidas como o bioma do planeta que possui a maior riqueza de esp?cies, al?m de elevado endemismo. A floresta amaz?nica faz parte desse cen?rio e sua alta diversidade ainda n?o foi totalmente identificada, assim como os padr?es que a regulam. Embora as pesquisas sobre a biodiversidade desse bioma tenham avan?ado nos ?ltimos anos, determinados grupos ainda apresentam conhecimento restrito sobre sua distribui??o geogr?fica e sazonal ou at? mesmo s?o ignorados em estudos de monitoramento, conserva??o e manejo. Nesse sentido, o objetivo principal desse estudo foi conhecer a composi??o, riqueza e raridade das esp?cies de formigas poneromorfas utilizando diferentes t?cnicas de amostragem, assim como investigar o efeito da sazonalidade e de determinados fatores ambientais na comunidade. As formigas foram coletadas na Floresta Nacional Tapirap?-Aquir? em julho de 2009, janeiro e julho de 2010, e janeiro de 2011 em tr?s ?reas distintas (A1, A2 e A3). Nas ?reas A1 e A2 foram determinados quatro pontos de amostragem no interior da mata onde foram feitos dois transectos de 100 metros e instalada a cada 10 metros uma armadilha tipo pitfall e iscas atrativas de sardinha sobre a vegeta??o subarbustiva e no solo. O pitfall permaneceu ativo por 48 horas e as iscas durante uma hora. Na ?rea A3 foi determinada apenas uma dist?ncia dentro da mata onde foram realizados os mesmos procedimentos de amostragem. Foram encontradas 46 esp?cies de formigas poneromorfas, pertencentes a oito g?neros. A t?cnica de amostragem que teve maior efic?cia em rela??o a riqueza da mirmecofauna encontrada foi o pitfall, que registrou 44 esp?cies (95,7% do total) e incluiu todos os g?neros encontrados. Em seguida, a isca no solo apresentou riqueza de 19 esp?cies (41,3% do total) e a isca sobre a vegeta??o apresentou riqueza de seis esp?cies (13% do total). Todas as formigas encontradas pertencem a duas sub-fam?lias, sendo elas Ponerinae e Ectatomminae. As esp?cies Gnamptogenys striatula Mayr, 1883 e Pachycondyla unidentata (Mayr, 1862) foram encontradas apenas nas iscas sobre a vegeta??o, estando ausentes nas iscas no solo e no pitfall em toda amostragem. Os resultados para composi??o da fauna de formigas poneromorfas e sua distribui??o sazonal indicam n?o haver uma clara estratifica??o na comunidade, sendo que as esp?cies de formigas que ocorreram na esta??o seca e na esta??o chuvosa n?o formam grupos distintos nas tr?s ?reas amostradas. Os testes estat?sticos aplicados para avaliar a influ?ncia das vari?veis ambientais medidas sobre a distribui??o das esp?cies de formigas poneromorfas n?o revelaram padr?es de associa??o. A identifica??o das esp?cies encontradas tem especial relev?ncia pelo fato de contribuir para a consolida??o do conhecimento da biodiversidade de formigas poneromorfas na Floresta Amaz?nica e permitir estudos comparativos com outras regi?es de floresta tropical.

The present study is a taxonomical treatment of the species of Euphorbiaceae Juss. from Three areas of the Caxiuanã National Forest (l03()' e 2o30' S; 51015' e 52" 15' W), situated in the northem region of Brazil, State of Pará, at the municipalities of Portei and Melgaço. The two first ones, localized in Portei, is the permanent parcel of the Research Program in Biodiversity - PPBio (01o58'58" S; 51038T6" W). It is a grid of 25 km2 divided into 30 parcels, in which there areb sub parcels of 250 x 40 m, where the collections were carried out narrow river Caquajó (0lo57'37"S; 5 l037'52"W). The third area is the Ferreira Penna Research Station - ECFP (Io 30' e Io 50' S; 51° 15' a 51° 45' W), localized at Melgaço. In grid the collection methodology followed the rules of the PPBio, which states that the collections should be done in 20 m of both sides of the sub parcel. In the other areas the collections followed the traditional techniques: according to the visualization of specimens. For the analysis and taxonomical Identification of the specimens there were used the usual techniques, the experience of the adviser, consults by other specialists and specialized literature. Seventeen species, distributed in 12 genera, nime tribes and five subfamilies were identified. The subfamily Euphorbioideae and the genus Mabea Aublet were the most representatives. Mabea angularis Hollander is newly recorded for the State of Pará. Identification keys, descriptions of genera and species, illustrations, taxonomical comments, as well as additional notes on the phenology, uses, traditional names, and comments on the distribution of the species are given. Geographical distribution maps of the species are presented as well. / O presente trabalho refere-se ao tratamento taxonômico das espécies de Euphorbiaceae Juss. coletadas em três áreas da Floresta Nacional de Caxiuanã (103(T e 203(F S; 51015' e 52015' W), a qual localiza-se na região Norte do Brasil, estado do Pará, nos municípios de Portei e Melgaço. As duas primeiras, localizadas no município de Portei, a parcela permanente do Programa de Pesquisa em Biodiversidade - PPBio (01o58'58" S; 51038T6" W), uma grade de 25 km2 dividida em 30 parcelas, dentro das quais localizam-se sub-parcelas de 250 x 40 m e o igarapé Caquajó (0lo57'37"S; 5 l037'52"W). A terceira área é a Estação Científica Ferreira Penna - ECFP (Io 30' e Io 50' S; 51° 15' a 51° 45' W), localizada no município de Melgaço. Na grade, a metodologia de coleta está de acordo com as normas do PPBio, ou seja, coletando-se na faixa de 20 m de cada lado da sub-parcela. Nas outras áreas, a coleta foi conforme as técnicas usuais em taxonomia, ou seja, de acordo com a visualização dos espécimes. Para a análise e identificação taxonômica dos exemplares coletados, foram utilizadas técnicas usuais, experiência do orientador, consulta a outros especialistas e literatura especializada. Identificou-se 17 espécies, distribuídas em 12 gêneros, nove tribos e cinco subfamílias. A subfamília Euphorbioideae e o gênero Mabea Aublet foram os mais representativos. Mabea angularis Hollander é citada pela primeira vez para o Estado do Pará. São apresentadas chaves de identificação, descrições dos gêneros e espécies, ilustrações, comentários taxonômicos, assim como notas adicionais sobre a fenologia, usos, nomes vulgares e comentários sobre a distribuição das espécies nos diferentes ambientes observados. São também apresentados mapas de distribuição geográfica para as espécies analisadas.