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Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-10T15:46:54Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 7112958 bytes, checksum: 886b156d9c12527ec0b0385426439822 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-10T15:46:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 7112958 bytes, checksum: 886b156d9c12527ec0b0385426439822 (MD5) Previous issue date: 2014-02-18 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A fragmentação florestal é considerada a ameaça contemporânea mais importante à conservação da biodiversidade. A literatura tem mostrado que o papel das espécies pioneiras como facilitadoras para a reconstrução de ambientes naturais é muito importante pelas suas características de criar condições para estabelecimento das espécies nativas clímax. Espécies arbóreas pioneiras ao ocuparem áreas de pastagens pertubardas com solos empobrecidos geram pequenos agregados de outras espécies ao seu redor e representam focos de recrutamento de sementes por atraírem animais dispersores, oferecendo-lhes poleiros, frutos, sombra e locais de nidificação, acelerando assim o processo de sucessão, dessa forma atuando como espécies nucleadoras e facilitadoras da sucessão. Cecropia hololeuca é uma espécie pioneira em sucessão secundária e é potencialmente uma espécie facilitadora. Para investigar a hipótese de que Cecropia hololeuca apresenta padrão agregado nas comunidades florestais secundárias da paisagem e está associada espacialmente ao muriqui-do-norte (Brachyteles hypoxanthus), e demonstrar sua função nucleadora e facilitadora, foi avaliado seu padrão de distribuição espacial, através de imagens de satélite Rapid Eye, e análises espaciais geradas a partir de dados do Índice de Moran ́s I, correlacionadas com metadados de levantamentos de ocorrência de muriquis-do- norte (Brachyteles hypoxanthus) no Parque Estadual da Serra do Brigadeiro - PESB. Cecropia hololeuca apresentou padrão agregado de distribuiçao espacial segundo o Índice de Moran ́s I (I= 0,74), em área de sobreposição de forrageamento de Brachyteles hypoxanthus na região norte do PESB. Confirmando a hipótese de que Cecropia hololeuca possui distribuição agregada em uma comunidade florestal secundária de Mata Atlântica e que sua distribuição espacial está sobreposta à ocorrência de Brachyteles hypoxanthus, espécie de primata associado à estrutura florestal regenerada por facilitação. Essa confirmação demonstra o caráter facilitador de Cecropia hololeuca. Contudo, além de confirmar a facilitação promovida por Cecropia hololeuca, evidencia-se a enorme importância dessa espécie nos processos interativos da Mata Atlântica. / The fragmentation, forest is considered the most important contemporary threat to biodiversity conservation. The literature has shown that the role of pioneer species as facilitators for the reconstruction of natural environments is very important because of their characteristics to create the conditions for the occurrence of climax native species. Pioneer tree species to occupy areas with poor soils disturbed pastures generate small aggregates of other species around them and represent represent foci of recruitment seed for attracting animals seed dispersers, offering them perches, fruit, shade and nesting sites, thus speeding, the succession process thus acting as nucleation and facilitate successional species. Cecropia hololeuca is a pioneer species in secondary succession and is potentially a facilitative species. To investigate the hypothesis Cecropia hololeuca has an aggregated pattern in secondary forest communities of the countryside and is spatially associated with the muriqui northern (Brachyteles hypoxanthus), and demonstrate their function and facilitating nucleation. evaluated their spatial distribution pattern through Rapid Eye satellite images, and spatial analysis of data generated from the Moran's I index, correlated with metadata surveys occurrence of muriquis northern (Brachyteles hypoxanthus) in the Serra do Brigadeiro State Park. The results for the spatial analysis of Cecropia hololeuca was aggregate pattern in the Index of Moran's I (I = 0.74), in overlapping area of foraging Brachyteles hypoxanthus in the northern region of the Serra do Brigadeiro State Park. Confirming the hypothesis that Cecropia hololeuca has aggregated distribution in a secondary forest community of Atlantic Forest and its spatial distribution is correlated with the occurrence of Brachyteles hypoxanthus. primate species associated with forest structure regenerated by facilitation.This confirmation demonstrates the character of Cecropia hololeuca facilitator. However, in addition to confirming the facilitation promoted by Cecropia hololeuca. However, addition to confirming the facilitation promoted by Cecropia hololeuca, evidences the enormous importance of this species in the interactive processes of the Atlantic Forest.

<p>Insects encounter many microorganisms in nature and to survive they have developed counter measures against the invading pathogens. In <i>Drosophila melanogaster</i> research on insect immunity has mainly been focused on infections by bacteria and fungi. We have explored the immune response against natural infections of the parasite <i>Octosporea muscaedomesticae</i> and the <i>Drosophila</i> C virus as compared to natural infections of bacteria and fungi. By using Affymetrix <i>Drosophila</i> GeneChips, we were able to obtain 48 genes uniquely induced after parasitic infection. It was also clearly shown that natural infections led to different results than when injecting the pathogens. </p><p>In order to search for the ultimate role of the lepidopteran protein hemolin, we used RNA interference (RNAi). We could show that injection of double stranded RNA (dsRNA) of <i>Hemolin</i> in pupae of <i>Hyalophora cecropia</i> led to embryonic malformation and lethality and that there was a sex specific difference. We continued the RNAi investigation of hemolin in another lepidopteran species, <i>Antheraea pernyi</i>, and discovered that hemolin was induced by dsRNA<i> per se</i>. A similar induction of hemolin was seen after infection with baculovirus and we therefore performed <i>in vivo</i> experiments on baculovirus infected pupae. We could show that a low dose of ds<i>Hemolin</i> prolonged the period before the <i>A. pernyi</i> pupae showed any symptoms of infection, while a high dose led to a more rapid onset of symptoms. By performing <i>in silico</i> analysis of the hemolin sequence from <i>A. pernyi</i> in comparison with other<i> Hemolin</i> sequences, it was possible to select a number of sites that either by being strongly conserved or variable could be important targets for future studies of hemolin function.</p>

Une entité botanique peut être considérée comme une succession ordonnée d'entités botaniques d'un niveau d'organisation inférieur (ex : une unité de croissance peut se décrire comme une succession de métamères). Pour chaque entité botanique, il est possible de mesurer un certain nombre de variables qui traduisent ses caractéristiques (longueur de l'entre-nœud, type de production axillaire). La succession des valeurs prises par une ou plusieurs variables mesurées est alors appelée « séquence d'événements botaniques ». Des travaux récents menés chez des arbres fruitiers et forestiers ont permis de développer une approche statistique adaptée à l'analyse d'échantillons de séquences allant de l'analyse exploratoire à la construction de processus Markoviens. L'objectif de cette thèse est (i) d'évaluer la pertinence d'une approche couplant analyse architecturale et analyse de séquences extraites d'architectures mesurées, (ii) d'apporter une vision et une compréhension nouvelle des phénomènes de croissance, de ramification et de floraison par l'utilisation de modèles statistiques adaptés et (iii) d'analyser les applications possibles des comparaisons de séquences et de modèles dans l'étude de l'influence du milieu et la caractérisation de la plasticité architecturale. Cette problématique est illustrée par (i) l'étude des structures de ramification des différents types d'unités de croissance des pousses annuelles mono- ou polycycliques de chêne rouge d'Amérique (Quercus rubra), (ii) des synchronismes de ramification et de floraison chez Cecropia obtusa et (iii) par l'étude de l'évolution de la phyllotaxie et des modalités de ramification au cours de l'ontogénie sur plusieurs espèces de Cupressus. Les résultats montrent que la répartition des productions axillaires sur une entité porteuse n'est pas aléatoire mais qu'elle est le plus souvent organisée en une succession de zones homogènes ou montre des motifs répétés à un niveau plus local. Les mécanismes sous-jacents potentiellement responsables des organisations révélées à diverses échelles et l'apport de la prise en compte de l'information structurelle des arbres dans la mesure et l'analyse statistique des données sont discutés

Insects encounter many microorganisms in nature and to survive they have developed counter measures against the invading pathogens. In Drosophila melanogaster research on insect immunity has mainly been focused on infections by bacteria and fungi. We have explored the immune response against natural infections of the parasite Octosporea muscaedomesticae and the Drosophila C virus as compared to natural infections of bacteria and fungi. By using Affymetrix Drosophila GeneChips, we were able to obtain 48 genes uniquely induced after parasitic infection. It was also clearly shown that natural infections led to different results than when injecting the pathogens. In order to search for the ultimate role of the lepidopteran protein hemolin, we used RNA interference (RNAi). We could show that injection of double stranded RNA (dsRNA) of Hemolin in pupae of Hyalophora cecropia led to embryonic malformation and lethality and that there was a sex specific difference. We continued the RNAi investigation of hemolin in another lepidopteran species, Antheraea pernyi, and discovered that hemolin was induced by dsRNA per se. A similar induction of hemolin was seen after infection with baculovirus and we therefore performed in vivo experiments on baculovirus infected pupae. We could show that a low dose of dsHemolin prolonged the period before the A. pernyi pupae showed any symptoms of infection, while a high dose led to a more rapid onset of symptoms. By performing in silico analysis of the hemolin sequence from A. pernyi in comparison with other Hemolin sequences, it was possible to select a number of sites that either by being strongly conserved or variable could be important targets for future studies of hemolin function.

Submitted by RENATA FABREGA GONÇALVES null (re-ofs@hotmail.com) on 2018-04-19T12:12:21Z No. of bitstreams: 1 dissertacao_RenataFGoncalves.pdf: 3889454 bytes, checksum: f8a3b73bdac15a81960d45dfa7109f4d (MD5) / Rejected by Adriana Aparecida Puerta null (dripuerta@rc.unesp.br), reason: Prezada Renata, O documento "Influência da paisagem na estrutura e diversidade genética de uma espécie pioneira em fragmentos da Mata Atlântica" enviado para a coleção Instituto de Biociências Rio Claro foi recusado pelo(s) seguinte(s) motivo(s): - Capa: falta ao final da capa o nome da cidade e ano - Rio Claro e Abril 2018, conforme consta na Página de rosto. - Falta a folha de aprovação, que deve ser solicitada à Seção de Pós-Graduação e deve ser inserida após a ficha catalográfica. Elemento obrigatório. O documento enviado não foi excluído. Para revisá-lo e realizar uma nova tentativa de envio, acesse: https://repositorio.unesp.br/mydspace Em caso de dúvidas entre em contato pelo email repositoriounesp@reitoria.unesp.br. Agradecemos a compreensão e aguardamos o envio do novo arquivo. Atenciosamente, Biblioteca Campus Rio Claro Repositório Institucional UNESP https://repositorio.unesp.br on 2018-04-19T19:20:28Z (GMT) / Submitted by RENATA FABREGA GONÇALVES null (re-ofs@hotmail.com) on 2018-04-20T17:51:05Z No. of bitstreams: 1 dissertacao_RenataFGoncalves.pdf: 4060192 bytes, checksum: 24e6f0e6e47096c10a1f84f3a3206c5d (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Aparecida Puerta null (dripuerta@rc.unesp.br) on 2018-04-23T12:54:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 gonçalves_rf_me_rcla.pdf: 2991756 bytes, checksum: c544ce14a67ac400bd3b97498a9e3108 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-23T12:54:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 gonçalves_rf_me_rcla.pdf: 2991756 bytes, checksum: c544ce14a67ac400bd3b97498a9e3108 (MD5) Previous issue date: 2017-12-05 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Florestas secundárias são produtos da degradação de vegetação primária e subsequente regeneração natural e se destacam como um componente florestal dominante em paisagens tropicais, contribuindo para o restabelecimento das funções ecológicas e com o fornecimento de serviços ecossistêmicos. Porém, a capacidade de restauração depende primariamente da chegada e estabelecimento de plantas pioneiras, enquanto a manutenção das populações florestais depende de condições ambientais propícias, como a ocorrência de dispersão de sementes e fluxo gênico entre os fragmentos florestais e regenerantes. Com o intuito de avaliar como espécies vegetais pioneiras abundantes respondem à composição da paisagem o presente estudo analisou a variação espacial genética de Cecropia hololeuca Miq. (Urticaceae) ao longo de uma região heterogênea e com diferentes graus de fragmentação. O estudo foi realizado em 18 paisagens ao longo de um gradiente de cobertura florestal de 21% a 90% dentro da região do Corredor Cantareira-Mantiqueira. A partir de oito marcadores microssatélites, foi possível identificar três grandes agrupamentos genéticos, indicando fraca estruturação genética de C. hololeuca ao longo da região estudada. Os atributos da paisagem que mais contribuíram à diferenciação genética entre os grupos de indivíduos (populações espaciais) foram distância geográfica, proporção de área urbana e presença de rodovias e, também contribuindo de forma positiva, mas em menor intensidade, o eucalipto. Embora a cobertura florestal tenha diminuído a diferenciação genética entre as manchas, contribuindo na conectividade entre elas, esta contribuição foi a mais fraca dentre as variáveis testadas nos modelos. Desta forma, é importante considerar estruturas relacionadas à urbanização ao se tratar de conectividade funcional, já que o fluxo gênico parece estar respondendo de forma negativa aos impactos antrópicos recentes. Ainda assim, a utilização de C. hololeuca em programas de restauração ecológica para esta região apresenta grande potencial de sucesso, desde o seu estabelecimento em áreas abandonadas, devido às sementes que podem ser dispersas a longas distâncias, até contribuindo com condições favoráveis para o desenvolvimento da sucessão ecológica. / Secondary forests are products of primary vegetation degradation and subsequent natural regeneration and stand out as a dominant forest component in tropical landscapes, contributing to the restoration of ecological functions and the provision of ecosystem services. Restauration depends first on the arrival and establishment of pioneer trees and second on favorable environmental conditions and maintenance of ecological processes such as pollen and seed dispersal from within and across forest patches. In order to evaluate how abundant pioneer species respond to the landscape composition, the present study analyzed the genetic spatial variation of Cecropia hololeuca Miq. (Urticaceae) along the heterogeneous region of the Cantareira-Mantiqueira Corridor, in Northeast São Paulo. The study was conducted in 18 landscapes, with forest cover varying from 21% to 90%. Using data on eight microsatellites markers we identified three genetic clusters, indicating weak genetic structure of C. hololeuca throughout the studied region. The landscape attributes that had the greatest contribution to genetic differentiation between groups of individuals (spatial populations) were geographic distance, proportion of urban area and presence of highways and, with a positive but with weaker effect, proportion of eucalyptus plantations. Contrary to our expectations, forest cover was considered less important to both genetic diversity and genetic differentiation between spatial populations. Recent anthropogenic land uses, such as urbanization, seem to affect more strongly the functional connectivity across the region. The utilization of C. hololeuca in ecological restauration programs holds great success potential. Pollen and seeds can travel long distances and transpose a myriad of land uses and covers, therefore can contribute significantly to the natural regeneration in abandoned and degraded pastures creating favorable conditions to ecological succession.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-01-12T10:57:12Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1369974 bytes, checksum: 9fd8ea4315b0b8b8c2670673f4f5c850 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-12T10:57:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1369974 bytes, checksum: 9fd8ea4315b0b8b8c2670673f4f5c850 (MD5) Previous issue date: 2004-07-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As espécies Sclerolobium paniculatum Vogel var. subvelutinum Benth. e Solanum lycocarpum A. St.-Hil. são típicas do Cerrado sensu stricto que sobressaem em áreas degradadas por desmatamentos e pelo fogo, enquanto a espécie Cecropia pachystachya Trécul se destaca em Matas de Galeria perturbadas pela formação de clareiras; ambas as espécies apresentam comportamento pioneiro. Este trabalho visou verificar o pioneirismo em espécies de Cerrado sensu stricto e de Matas de Galeria do Bioma Cerrado, através da análise da germinação e do crescimento inicial dessas espécies, assim como foram avaliados os bancos de sementes dos solos de áreas do Cerrado e de Matas de Galeria, com e sem perturbações. O estudo do comportamento germinativo das sementes revelou que, uma vez aplicados os tratamentos para superação da dormência, todas as espécies apresentam elevado percentual de germinação, independentemente das condições de luz. A escarificação mecânica e o corte do tegumento aceleram a germinação de Sclerolobium paniculatum var. subvelutinum e Solanum lycocarpum, enquanto Cecropia pachystachya apresentou dormência fisiológica superada por ácido giberélico e nitrato de potássio. As três espécies apresentam comportamento similar quanto à germinação em diferentes condições de luz, uma vez superada a barreira da dormência. O desenvolvimento das variáveis alométricas e a produção de biomassa indicaram a necessidade de elevados percentuais de luz para o desenvolvimento destas, confirmando seu caráter pioneiro. O estudo do banco de sementes da Cascalheira, do Cerrado sensu stricto com e sem perturbação, das Matas do Capetinga e do Gama, com e sem perturbação, mostrou que,quanto maior o grau de perturbação, maior o estoque do banco de sementes formado por diásporos com características de gramíneas, em detrimento de espécies arbóreas. Constatou-se a existência de um gradiente no Cerrado sensu stricto no qual a relação sementes viáveis/sementes totais do banco foi: Cerrado não-perturbado > Cerrado perturbado por fogo e desmatamento > Cascalheira. Também no caso da Mata de Galeria do Capetinga houve uma nítida distinção entre área perturbada (com clereira) e não (ou menos) perturbada (interior da mata), sendo: Mata do Capetinga não perturbada > Mata do Capetinga perturbada. Contudo, na Mata de Galeria do Gama, por se tratar de uma mata mais conservada do que a do Capetinga, a relação sementes viáveis/sementes totais do banco foi semelhante para ambas as condições (borda e interior da mata), sendo possível a recuperação das áreas degradadas através do banco de sementes. / Sclerolobium paniculatum Vogel var. subvelutinum Benth. and Solanum lycocarpum A. St.-Hil. are typical species of the Cerrado sensu stricto that occur mostly in degraded lands by deforestations and fire, while Cecropia pachystachya Trécul occurs mostly in Gallery forest gaps. The objective of this work was to detect the pioneer behavior of these three species, through the analysis of germination and initial growth. Moreover, seed banks in the Cerrado sensu stricto and Gallery forest areas, with and without disturbances, were evaluated. The study of the seeds germinative behavior showed that once applied adequate treatments to overcome dormancy, all the species presented high germination levels, independent of light conditions. Mechanic scarification and seed tegument cutting accelerated germination of Sclerolobium paniculatum var. subvelutinum and Solanum lycocarpum, while physiological dormancy of Cecropia pachystachya was surpassed by giberelic acid and potassium nitrate. The three species showed a similar behavior related to germination at various light conditions, since the dormancy barrier was surpassed. The pioneering character was confirmed since alometric variables and biomass production was associated with high light percentages. The seed banks studies showed that a higher number of grass diaspora was found in the more degraded areas, replacing the forest trees species seed bank. These results suggested a gradient in relation to viable seeds/total seeds in the seed bank of the Cerrado sensu stricto: not disturbed Cerrado > Cerrado disturbed by fire and deforestation > Gravel pit. In the Capetinga gallery forest, that is a forest disturbed by fire, there was a clear distinction between a degraded area (large gap) and a less disturbed one. However, in the Gama gallery forest, that is a less disturbed forest, the relation viable seeds/total seeds was similar between disturbed and undisturbed areas (interior of the forest), allowing to state that the recovery of disturbed areas, in this forest, could occur naturally through the seed bank. / Não foi localizado o cpf do autor.