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Caracterização molecular de Staphylococcus spp. coagulase-negativos isolados do molusco bivalve Anomalocardia brasiliana (GMELIN, 1791)

BATISTA, Jacqueline Ellen Camelo 22 February 2013 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-07-21T15:37:36Z No. of bitstreams: 1 Jacqueline Ellen Camelo Batista.pdf: 835746 bytes, checksum: b0b2b877160378bd92adbf49b27783c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-21T15:37:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jacqueline Ellen Camelo Batista.pdf: 835746 bytes, checksum: b0b2b877160378bd92adbf49b27783c3 (MD5) Previous issue date: 2013-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The species Anomalocardia brasiliana is found in abundance on the beaches of the Brazilian coast and much appreciated in Northeastern cuisine. This study aimed to characterize molecular enterotoxins and resistance gene mecA in Staphylococcus spp. isolates of coagulase-negative beef samples A. brasiliana in the metropolitan area of Recife, Brazil. Isolated from fresh samples (n = 9), collected in the resort of Mangue Seco, Igarassu-PE, were identified as Staphylococcus xylosus (4/9), Staphylococcus cohnii spp. urealyticus (4/9) and Staphylococcus sciuri (1/9). Among commercialized samples (n = 21) were identified Staphylococcus sciuri (16/21), Staphylococcus xylosus (4/21) and Staphylococcus lentus (1/21). The determination of antibiotic resistance profile was performed following the CLSI guidelines. The highest rates of resistance were observed in isolates from fresh samples against erythromycin (58.53%), penicillin (51.21%) and tetracycline (43.9%). Isolated from samples marketed presented greater resistance to oxacillin (55.3%) and penicillin (36.8%). All isolates were characterized as coagulase-negative and were resistant to oxacillin and / or cefoxitin and positive for the presence of mecA gene but phenotypically susceptible to vancomycin. Also, the genes for enterotoxins seg and seh were detected in 77,7% and 88,8% of isolates from environmental samples, versus 90.5% and 100% of the isolates of real samples, respectively. The results of this study reveal the presence of Staphylococcus coagulase-negative methicillin-resistant carriers of toxigenic genes in bivalve mollusk A. brasiliana. This is first report of Staphylococcus coagulase-negative methicillin-resistant bivalve mollusk in A. brasiliana. / A espécie Anomalocardia brasiliana é encontrada em abundância nas praias da costa brasileira e bastante apreciada na culinária nordestina. Neste estudo, objetivou-se a caracterização molecular de enterotoxinas e do gene de resistência mecA de Staphylococcus spp. coagulase-negativos isolados de amostras da carne de A. brasiliana na região metropolitana do Recife, Brasil. Isolados de amostras in natura (n=9), coletados no balneário de Mangue Seco, Igarassu-PE, foram identificados como Staphylococcus xylosus (4/9), Staphylococcus cohnii spp. urealyticus (4/9) e Staphylococcus sciuri (1/9). Dentre amostras comercializadas (n=21), foram identificados Staphylococcus sciuri (16/21), Staphylococcus xylosus (4/21) e Staphylococcus lentus (1/21). A determinação do perfil de resistência a antibióticos foi realizada seguindo orientações do CLSI. Os maiores índices de resistência foram observados em isolados de amostras in natura contra eritromicina (58,53%), penicilina (51,21%) e tetraciclina (43,9%). Isolados de amostras comercializadas apresentaram maior percentual de resistência à oxacilina (55,3%) e penicilina (36,8%). Todos os isolados foram caracterizados como coagulase-negativos e foram resistentes à oxacilina e/ou cefoxitina e positivos para a presença do gene mecA, mas sensíveis fenotipicamente à vancomicina. Ainda, os genes das enterotoxinas seg e seh foram detectados em 77,7 % e 88,8% dos isolados de amostras ambientais, contra 90,5% e 100% dos isolados de amostras comercializadas, respectivamente. Os resultados obtidos nesse estudo revelam a presença de Staphylococcus coagulase-negativos resistentes à meticilina portadores de genes toxigênicos no molusco bivalve A. brasiliana. Este é primeiro relato de Staphylococcus coagulase-negativos resistentes à meticilina no molusco bivalve A. brasiliana.
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Estudo teórico do complexo cefoxitina-proteína 5 de ligação à penicilina da Escherichia Coli por dinâmica molecular com método híbrido de mecânica quântica/ mecânica molecular / Theoretical study of the complex cefoxitin-penicillin-binding protein 5 from Escherichia Coli for molecular dynamics with hybrid method of quantum mechanics/molecular mechanics

SILVA, Thaís Boulhosa Barros da 12 December 2014 (has links)
Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-01-31T12:20:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_EstudoTeoricoComplexo.pdf: 2354484 bytes, checksum: 80f0f32eb8a6fac1bd5aa7978b92d56f (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-02-01T12:21:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_EstudoTeoricoComplexo.pdf: 2354484 bytes, checksum: 80f0f32eb8a6fac1bd5aa7978b92d56f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-01T12:21:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_EstudoTeoricoComplexo.pdf: 2354484 bytes, checksum: 80f0f32eb8a6fac1bd5aa7978b92d56f (MD5) Previous issue date: 2014-12-12 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The Penicillin Binding Proteins (PBPs) are important for the development of new drugs against bacterial infections biological targets. This study was aimed to understand the interaction between the protein and cefoxitin 5 Penicillin-Binding (PBP5) of Escherichia coli (deposited in the PDB under the code 3MZE) through simulation Molecular Dynamics (MD), using the approach hybrid quantum molecular mechanics (QM/MM) and mechanical. As well as develop a prototype to evaluate, through computer simulation, the susceptibility of Gram negative bacteria against antibiotics. The analysis of antimicrobial susceptibility to antibiotics tested has shown that this strain of E. coli ATCC 8739 was sensitive to 5 antimicrobials study. The strain of E. coli derived from the clinical isolate was resistant to ciprofloxacin 5 μg and gentamicin 10 μg, intermediate sensitivity to cefepime 30 μg and ceftazidime 30 μg, and sensitivity to cefoxitina 30 μg. The difference in susceptibility of E. coli strain ATCC 8739 and strain of E. coli isolated from a clinical can show a molecular immunological memory of the bacteria. We observed no production of β-lactamases by the strain of E. coli derived from clinical isolate, suggested because no observed difference in antimicrobial susceptibility with respect to the presence or absence of EDTA on the disks containing the antibiotics. The analysis has revealed that protonation of the deprotonated His146, His151, His216 and His320 residues. The stabilization of the complex was studied after 0,6 ns of MD simulation. Moreover, a decomposition analysis in terms of energy was performed to determine the contributions of individual amino acid residues for protein-ligand interactions. The results revealed that cefoxitin has a strong interaction with Lis44, Lis210, Ser41, Gli212, His213, Glu246 residue, apart from water, which are important for stabilizing cefoxitin-PBP5 complex. The electrostatic potential map Molecular cefoxitin revealed a highly electrophilic center corresponding to the β-lactam ring, which promotes hydroxyl attack nuceofílico the serine residue of the E. coli PBP5 active site region. These results can give support the planning of new more selective and effective drugs to control bacterial infections. The experimental results were statistically consistent with the theoretical results thus this work can be used as a prototype for computing theoretical evaluate the antimicrobial susceptibility to Gram negative bacteria. This study may find applications in future planning and development of new and potent compounds with antimicrobial activity. Mainly in attempts to modify an inhibitor, particularly of the cephalosporin class in order to improve its selectivity and its activity. / As Proteínas de Ligação à Penicilina/“Penicillin Binding Proteins” (PLPs/PBPs) são alvos biológicos importantes para o desenvolvimento de novos fármacos contra infecções bacterianas. Neste estudo, objetivou-se, compreender a interação entre a cefoxitina e a Proteína 5 de Ligação à Penicilina (PBP5) da Escherichia coli (depositado no PDB sob o código 3MZE), através de simulação de Dinâmica Molecular (DM), usando a abordagem híbrida de mecânica quântica e mecânica molecular (QM/MM). Assim como, desenvolver um protótipo para avaliar, através de simulação computacional, a suscetibilidade de bactérias Gram negativas frente a antimicrobianos. A análise da suscetibilidade antimicrobiana aos antibióticos testados revelou que a cepa de E. coli ATCC 8739 foi sensível aos 5 antimicrobianos do estudo. A cepa de E. coli proveniente do isolado clínico apresentou resistência à ciprofloxacina 5 μg e à gentamicina 10 μg, sensibilidade intermediária à cefepime 30 μg e à ceftazidima 30 μg e sensibilidade à cefoxitina 30 μg. A diferença na suscetibilidade entre a cepa de E. coli ATCC 8739 e a cepa de E. coli proveniente de isolado clínico pode evidenciar uma memória imunológica molecular da bactéria. Observou-se ausência de produção de β-lactamases pela cepa de E. coli oriunda de isolado clínico, sugerida por não se ter observado diferença de suscetibilidade antimicrobiana com relação à presença ou à ausência de EDTA nos discos contendo os antimicrobianos. A análise de protonação revelou estarem desprotonados os resíduos His146, His151, His216 e His320. A estabilização do complexo estudado ocorreu após 0,6 ns de simulação de DM. Além disso, uma análise de decomposição em termos de energia foi realizada para determinar as contribuições individuais dos resíduos de aminoácidos para as interações proteína-ligante. Os resultados revelaram que a cefoxitina apresenta forte interação com os resíduos Lis44, Lis210, Ser41, Gli212, His213, Glu246, além da água, os quais são importantes para estabilizar o complexo cefoxitina-PBP5. O Mapa do Potencial Eletrostático Molecular da cefoxitina revelou um centro altamente eletrofílico na região correspondente ao anel β-lactâmico, o que favorece o ataque nuceofílico da hidroxila do resíduo de serina do sítio ativo da PBP5 de E. coli. Estes resultados podem dá suporte para o planejamento de novos fármacos mais seletivos e eficazes no controle de infecções bacterianas. Os resultados experimentais foram estatisticamente condizentes com os resultados teóricos, portanto, esse trabalho pode ser utilizado como um protótipo teórico computacional para avaliar a suscetibilidade antimicrobiana para bactérias Gram negativas. Esse estudo poderá encontrar aplicações futuras no planejamento e desenvolvimento de novos e potentes compostos com atividade antimicrobiana. Principalmente, nas tentativas de modificar um inibidor, em particular da classe das cefalosporinas, a fim de melhorar a sua seletividade e a sua atividade.
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Análise qualitativa e quantitativa de cefoxitina sódica em injetáveis: desenvolvimento e validação de métodos analíticos e estudo de estabilidade

Tozo, Greici Cristiani Gomes [UNESP] 30 October 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-10-30Bitstream added on 2014-06-13T19:20:21Z : No. of bitstreams: 1 tozo_gcg_dr_arafcf.pdf: 1418802 bytes, checksum: 299e470daf39de736e522b2d987e1a61 (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / A cefoxitina sódica (CAS 33564-30-6), antimicrobiano cefalosporínico, apresenta espectro de atividade contra microrganismos Gram-negativos mais amplo que as cefalosporinas mais antigas. Também é eficaz contra Proteus e Serratia indol-positivos, mostrando alta resistência à hidrólise por b-lactamases. Indicada no tratamento de peritonites e outras infecções intra-abdominais e intrapélvicas; sinusites, infecções ginecológicas, septicemias; endocardites; infecções do trato urinário, gonorréia não complicada, infecções do trato respiratório, ossos, articulações e pele. Apesar de este fármaco ser altamente estudado e pesquisado no que concerne à atividade antimicrobiana, farmacocinética e farmacodinâmica, há poucos estudos na literatura em relação ao desenvolvimento de metodologia analítica para esta cefalosporina. Desta forma, pesquisas envolvendo métodos analíticos são de fundamental importância e altamente relevantes para otimizar sua análise na indústria farmacêutica e farmpacia magistral de modo a garantir a qualidade do produto já comercializado. A proposta deste projeto foi desenvolver metodologias de análise para a cefoxitina sódica, fármaco comercializado no mercado médico-farmacêutico brasileiro. Foram desenvolvidos e validados métodos por CLAE com detector UV a 235 nm, com acetonitrila: água: ácido acético 5 M (22 : 78 : 1) como fase móvel e faixa de concentração de 20,0 à 30,0 μg/mL, tempo de retenção de 7,5 minutos. O coeficiente de correlação obtido foi de 0,9995 e a equação da reta y = 335,67x + 2391,9. O teste recuperação média obtido foi de 100,50%, com desvio padrão de 1,70%. O teor médio... / Sodium cefatoxin (CAS 33564-30-6), a cephalosporinic antibiotic, has a wider spectrum of activity against Gram-negative microrganisms than older cephalosporin. It is also efficient against the indol-positive Proteus and Serratia and has a high resistance to b- lactamases hydrolysis. Sodium cefatoxin is recommended for the treatment of peritonitis and other intra-abdominal and intra-pelvic infections; sinusitis, gynecological infections, septicemy, endocarditis; urinary tract infections, non-complicated gonorrhea, respiratory tract infections, bones, articulations and skin. Although this drug has been strongly studied and many researches have been developed about its antibiotics activity, pharmacokinetics and pharmacodynamics, there are few studies in the literature about the development of analytical methodology to this cephalosporin. Researches dealing with analytical methods are extremely important and highly relevant to optimize its analysis at the pharmaceutical industry and manipulation pharmacy, guaranteeing quality of the commercialized product. This project proposes the development of methodologies for analysis of sodium cefatoxin, a commercialized drug at the medical-pharmaceutical Brazilian market. Methods for CLAE with UV detector at 235nm were developed and validated with acetonitrile: water: acetic acid 5M (22: 78:1) as mobile phase and concentration range of 20.0 to 30.0 μg/mL, detention time of 7.5 minutes. The correlation coefficient obtained was 0.9995 and the line equation y = 335.67x + 2391.9. The medium recovery test was 100.50% with standard deviation of 1.70%. The medium content of sodium cefoxitin determined by CLAE... (Complete abstract click electronic access below)
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DETECÇÃO DA RESISTÊNCIA À OXACILINA E PERFIL DE SENSIBILIDADE DE Staphylococcus COAGULASE NEGATIVOS ISOLADOS EM UM HOSPITAL ESCOLA / DETECTION OF OXACILLIN RESISTANCE AND SUSCEPTIBILITY OF COAGULASE-NEGATIVE Staphylococcus ISOLATED IN A HOSPITAL SCHOOL

Rigatti, Fabiane 29 October 2010 (has links)
For many years coagulase negative Staphylococcus (CoNS), skin commensals, were regarded as mere contaminants. However, in recent decades, they emerged as important agents of nosocomial infections, particularly in immunocompromised patients and patients with biomaterials. This is attributed to increasing antimicrobial resistance by these microorganisms, and oxacillin resistance was the main mechanism presented by CoNS. Thus, this study aimed to characterize this resistance, as well as the susceptibility of 160 isolates of CoNS obtained from patients admitted to HUSM, and also compare phenotypic tests used in laboratory detection of oxacillin resistance with genotypic detection of mecA gene, considered the gold standard. The antimicrobial susceptibility tests were performed by the qualitative technique of disk diffusion (CLSI 2009), as well as by semi-quantitative method (MicroScan ®). The phenotypic detection of resistance was performed by using cefoxitin and oxacillin disk. The genotypic identification of mecA gene was performed by PCR. Together with the molecular detection of mecA gene was performed the detection of gene icaD, responsible for biofilm formation. S. epidermidis (62%) was the main species identified among the samples selected for this study, and the prevalent clinical material was blood (38%). Due to the fact that they are skin commensals, an evaluation of clinical significance of the selected samples was performed. It presented that 48% of the isolates were considered more likely to be the etiologic agents of infections. The adult and neonatal ICUs represent prevalent clinical units in isolation of CoNS, with 33% and 29% of the isolates, respectively. Regarding the antimicrobial susceptibility, a high rate of resistance among the isolates was observed. These were grouped into seven prevalent susceptibility profiles, in which three were characterized by resistance to most of the antimicrobials tested. All strains were susceptible to linezolid, teicoplanin and tigecycline, in total 59 isolates (36.8%). All isolates were susceptible to vancomycin. Through the results of phenotypic tests, 89% and 94% of the isolates were characterized as oxacillin resistant by using cefoxitin and oxacillin disks, respectively. The molecular technique revealed that 79% of isolates carried mecA gene. A susceptibility of 96% to cefoxitin disk and 95% to oxacillin disk could be found from the statistical analysis when compared to the gold standard. Biofilm formation was observed in 45% of samples tested, in which S. epidermidis has been identified as prevalent in positive biofilm samples (74%). The phenotypic methods used in this study are equivalent for detecting oxacillin resistance when compared to the gold standard, and the use of oxacillin disk together with cefoxitin disk should be encouraged, since the oxacillin disk can identify other resistance mechanisms not mediated by mecA. In relation to susceptibility of the isolates, there was a high resistance to first-choice antimicrobial used for the treatment of CoNS. / Por muitos anos os Staphylococcus coagulase negativos (SCoN), comensais da pele, foram considerados como simples contaminantes. No entanto, nas últimas décadas, emergiram como importantes agentes de infecções nosocomiais, principalmente em imunocomprometidos e portadores de biomateriais. Isso é atribuído a crescente resistência antimicrobiana apresentada por estes microrganismos, sendo a resistência à oxacilina o principal mecanismos apresentado pelos SCoN. Desta forma, este estudo objetivou caracterizar esta resistência, bem como o perfil de sensibilidade de 160 isolados de SCoN obtidos de pacientes admitidos no HUSM. Além de comparar testes fenotípicos utilizados na detecção laboratorial da resistência à oxacilina com a detecção genotípica do gene mecA, considerado padrão ouro. Os testes de sensibilidade aos antimicrobianos foram efetuados pela técnica qualitativa de difusão do disco (CLSI 2009), bem como pelo método semi-quantitativo (MicroScan®). A detecção fenotípica da resistência foi realizada com os discos de cefoxitina e oxacilina. A identificação genotípica do gene mecA foi realizada por PCR. Juntamente a detecção molecular do gene mecA foi realizado a detecção do gene icaD, responsável pela formação de biofilme. S. epidermidis (62%) foi à principal espécie identificada entre as amostras selecionadas para este estudo e sangue, o material clínico prevalente (38%). Devido a serem comensais da pele, foi realizada uma avaliação da significância clínica das amostras selecionadas, de onde evidenciamos que 48% dos isolados foram considerados os prováveis agentes etiológicos das infecções. As UTIs adulto e neonatal representam as unidades clínicas prevalentes no isolamento de SCoN, com 33% e 29% dos isolados, respectivamente. Em relação a sensibilidade aos antimicrobianos observou-se um elevado índice de resistência entre os isolados. Estes foram agrupados em 7 perfis de sensibilidade prevalentes, sendo que 3 caracterizaram-se pela resistência a maioria dos antimicrobianos testados. Todas as cepas foram sensíveis à linezolida, teicoplamina e tigeciclina, totalizando 59 (36,8%). Todos os isolados foram sensíveis à vancomicina. Através dos resultados dos testes fenotípicos, verificou-se que 89% e 94% dos isolados foram caracterizados como resistentes à oxacilina, utilizando os discos de cefoxitina e oxacilina, respectivamente. Pela técnica molecular, 79% dos isolados carreavam o gene mecA. A partir da análise estatística evidenciou-se sensibilidade de 96% para o disco de cefoxitina e de 95% para o disco de oxacilina, quando comparados ao padrão ouro. A formação de biofilme foi evidenciada em 45% das amostras testadas, onde o S. epidermidis foi identificado como prevalente nas amostras biofilme positivas (74%). Os métodos fenotípicos utilizados neste estudo mostrarm-se equivalentes na detecção da resistência à oxacilina quando comparados ao padrão ouro, sendo que o uso do disco de oxacilina em conjunto com o de cefoxitina deve ser encorajado, uma vez que, o disco de oxacilina pode identificar outros mecanismos de resistência não mediados pelo gene mecA. Em relação ao perfil de sensibilidade dos isolados houve grande resistência aos antimicrobianos de primeira escolha usados para o tratamento de SCoN. Palavras-chave: SCoN, resistência, oxacilina, cefoxitina, gene mecA.
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Análise qualitativa e quantitativa de cefoxitina sódica em injetáveis : desenvolvimento e validação de métodos analíticos e estudo de estabilidade /

Tozo, Greici Cristiani Gomes. January 2007 (has links)
Orientador: Hérida Regina Nunes Salgado / Banca: Marcos Antonio Segatto / Banca: Cristiane Masetto de Gaitani / Banca: Maria Virgínia Costa Scarpa / Banca: Thereza Christina Vessoni Penna / Resumo: A cefoxitina sódica (CAS 33564-30-6), antimicrobiano cefalosporínico, apresenta espectro de atividade contra microrganismos Gram-negativos mais amplo que as cefalosporinas mais antigas. Também é eficaz contra Proteus e Serratia indol-positivos, mostrando alta resistência à hidrólise por b-lactamases. Indicada no tratamento de peritonites e outras infecções intra-abdominais e intrapélvicas; sinusites, infecções ginecológicas, septicemias; endocardites; infecções do trato urinário, gonorréia não complicada, infecções do trato respiratório, ossos, articulações e pele. Apesar de este fármaco ser altamente estudado e pesquisado no que concerne à atividade antimicrobiana, farmacocinética e farmacodinâmica, há poucos estudos na literatura em relação ao desenvolvimento de metodologia analítica para esta cefalosporina. Desta forma, pesquisas envolvendo métodos analíticos são de fundamental importância e altamente relevantes para otimizar sua análise na indústria farmacêutica e farmpacia magistral de modo a garantir a qualidade do produto já comercializado. A proposta deste projeto foi desenvolver metodologias de análise para a cefoxitina sódica, fármaco comercializado no mercado médico-farmacêutico brasileiro. Foram desenvolvidos e validados métodos por CLAE com detector UV a 235 nm, com acetonitrila: água: ácido acético 5 M (22 : 78 : 1) como fase móvel e faixa de concentração de 20,0 à 30,0 μg/mL, tempo de retenção de 7,5 minutos. O coeficiente de correlação obtido foi de 0,9995 e a equação da reta y = 335,67x + 2391,9. O teste recuperação média obtido foi de 100,50%, com desvio padrão de 1,70%. O teor médio... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sodium cefatoxin (CAS 33564-30-6), a cephalosporinic antibiotic, has a wider spectrum of activity against Gram-negative microrganisms than older cephalosporin. It is also efficient against the indol-positive Proteus and Serratia and has a high resistance to b- lactamases hydrolysis. Sodium cefatoxin is recommended for the treatment of peritonitis and other intra-abdominal and intra-pelvic infections; sinusitis, gynecological infections, septicemy, endocarditis; urinary tract infections, non-complicated gonorrhea, respiratory tract infections, bones, articulations and skin. Although this drug has been strongly studied and many researches have been developed about its antibiotics activity, pharmacokinetics and pharmacodynamics, there are few studies in the literature about the development of analytical methodology to this cephalosporin. Researches dealing with analytical methods are extremely important and highly relevant to optimize its analysis at the pharmaceutical industry and manipulation pharmacy, guaranteeing quality of the commercialized product. This project proposes the development of methodologies for analysis of sodium cefatoxin, a commercialized drug at the medical-pharmaceutical Brazilian market. Methods for CLAE with UV detector at 235nm were developed and validated with acetonitrile: water: acetic acid 5M (22: 78:1) as mobile phase and concentration range of 20.0 to 30.0 μg/mL, detention time of 7.5 minutes. The correlation coefficient obtained was 0.9995 and the line equation y = 335.67x + 2391.9. The medium recovery test was 100.50% with standard deviation of 1.70%. The medium content of sodium cefoxitin determined by CLAE... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Caracterização de Estafilococos Coagulase-Negativa de origem hospitalar e comunitária quanto à diversidade clonal e a determinantes de resistência antimicrobiana

Pinheiro, Luiza. January 2018 (has links)
Orientador: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Resumo: A alta frequência de Estafilococos Coagulase-Negativa (CoNS) na pele de indivíduos saudáveis e em doenças associadas ao sangue, associados à seleção de cepas resistentes devido a uso indiscriminado de antimicrobianos, tornou mais estreitos os limites entre o ambiente hospitalar e o comunitário quanto à distribuição de cepas. Objetivou-se, com este estudo, caracterizar isolados de CoNS de origem hospitalar e comunitária da cidade de Botucatu-SP quanto ao perfil clonal, analisar os aspectos de resistência à oxacilina pela aferição de metodologia de detecção, e investigar os determinantes de heterorresistência à vancomicina nessas cepas. As espécies estudadas incluíram S. epidermidis, S. haemolyticus, S. warneri, S. hominis, S. lugdunensis, S. capitis, S. saprophyticus, S. pasteuri, S. simulans e S. xylosus. O teste de disco-difusão (TDD) com discos de oxacilina e cefoxitina, fitas de Etest impregnadas com oxacilina e pesquisa do gene mecA por PCR em tempo real foram realizadas. A triagem em ágar com 6 e 8 µg/ml de vancomicina, microdiluição em caldo para aferição da Concentração Inibirtória Mínima (MIC), microscopia eletrônica de transmissão para verificar espessamento da parede celular e alterações fenotípicas por testes bioquímicos foram realizadas. O perfil clonal foi determinado por PFGE (Pulsed-Field Gel Eletrophoresis) e para clones de S. epidermidis, o MLST (Multilocus Sequence Typing). S. epidermidis apresentou alta diversidade clonal, mas presença de clusters no ambien... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The high frequency of Coagulase-Negative Staphylococci (CoNS) on the skin of healthy individuals and in bloodstream infections, together with the selection of resistant strains, has narrowed the boundaries between the hospital and the community environment for the distribution of strains. This study aimed to characterize CoNS isolated from clinical and colonization specimens of patients and individuals from Botucatu-SP, to compare their clonal profile, to analyze the determination of oxacillin resistance by the evaluation of the methodology of detection, and to investigate the determinants of reduced susceptibility to vancomycin in those strains. CoNS species included S. epidermidis, S. haemolyticus, S. warneri, S. hominis, S. lugdunensis, S. capitis, S. saprophyticus, S. pasteuri, S. simulans and S. xylosus. The disc diffusion test (DDT) using oxacillin and cefoxitin discs was employed, Etest strips impregnated with oxacillin and mecA gene detection by real-time PCR were used. An agar screening with 6 and 8 µg/ml of vancomycin, the broth microdiluition method for the Minimal Inhibitory Concentration (MIC), the transmission eletronic microscopy for evaluation of cellwall thickening and phenotypic modifications by biochemical tests were performed. Clonal profile was determined by PFGE (Pulsed-Field Gel Eletrophoresis) and, for S. epidermidis clones, MLST (Multilocus Sequence Typing). S. epidermidis presented high clonal diversity, despite some clusters circulating within hospi... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

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