Orientador: José Maurício Barbanti Duarte / Coorientador: Susana González / Banca: Alexandre Reis Percequillo / Banca: Renata Alonso Miotto / Banca: Eduardo Andrade Botelho de Almeida / Banca: Jesus Aparecido Ferro / Resumo: Considerada a espécie de cervídeo brasileira mais ameaçada de extinção, Mazama bororo, foi recentemente descrita em 1996. Devido a isso, aspectos básicos de sua biologia ainda são desconhecidos. Dessa maneira, o presente trabalho teve como objetivo utilizar DNA extraído de espécimes recentes e de museus para descrever a sua distribuição histórica, investigar a existência de padrões filogeográficos, avaliar a taxonomia da espécie e os erros de identificação no material analisado pertencente aos acervos científicos de museus. Para tanto, foi realizada a extração de DNA de 200 amostras de ossos turbinais obtidos em museus de história natural e 78 destes espécimes foram identificados a partir de iniciadores do gene citocromo b (224bp). O total de 22 espécimes identificados como pertencentes à espécie Mazama bororo permitiu conhecer áreas inéditas da distribuição histórica e, possivelmente atuais, da espécie, como os estados de Rio Grande do Sul, Minas Gerais, Goiás, Espírito Santo e Bahia. Além disso, a comparação entre o DNA dos holótipos de Mazama bororo e de Mazama americana jucunda indica que a espécie M. bororo corresponde à subespécie M. americana jucunda, descrita em 1913, demonstrando a necessidade de elevar essa subespécie à categoria de espécie. Análises filogeográficas da espécie demonstram que M. bororo não apresenta uma estruturação populacional histórica e que diversidade genética é baixa quando comparada a outras espécies, um indicativo de que políticas de manutenç... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Mazama bororo was recently described in 1996 and is considered the most threatened species of Brazilian deer. Due to this, basic aspects of its biology are still unknown. Thus, this research project aims to use DNA extracted from recent specimens and from natural history collections to review the taxonomy, to describe historical distribution and to investigate the existence of phylogeographic patterns on M. bororo. For this purpose, we extracted DNA from 200 samples of turbinate bones obtained from natural history collections and 78 of these were identified from cytochrome b initiator (224bp). We obtained a total of 22 specimens identified as M. bororo. This result allowed identify unpublished areas on historical and perhaps current distribution of M. bororo in states such as Rio Grande do Sul, Minas Gerais, Goiás, Espírito Santo and Bahia. Moreover, the comparison among the DNA from holotype of M. bororo and Mazama americana jucunda indicates that M. bororo corresponds to the subspecies M. americana jucunda, described in 1913, highlighting the need to raise this subspecies to full species status. Our results also demonstrates that M. bororo did not show a genetic structuration of their populations and that their genetic diversity is lower than other species, highlighting the need to increase conservation and environment policy efforts to maintenance of this species. Finally, when we compare the morphological identification available on natural history collections with the identification obtained from molecular markers we found that the error rate resulting from the classification based on morphological characters was 26%. Nevertheless, we expect with the help of DNA from natural history collections will be possible to select non-convergent morphological characters for this group, allowing thus correct morphological identifications ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: José Maurício Barbanti Duarte / Banca: Elias Alberto Gutierrez Carnelossi / Banca: Estevam Guilherme Lux Hoppe / Resumo: A espécie Mazama americana (veado-mateiro) é conhecida como a maior espécie pertencente ao gênero Mazama, e também um dos cervídeos mais abundantes e amplamente distribuídos na floresta Neotropical. A espécie já passou por diferentes classificações taxonômicas ao longo do tempo devido a potencial existência de diversas espécies dentro do que hoje é conhecido como M. americana. É considerada um complexo de espécies crípticas, pois apresenta alta taxa de paralelismo morfológico entre indivíduos com uma variação cromossômica coerente em termos geográficos, sugerindo a existência de unidades evolutivamente distintas. Assim, o objetivo do trabalho foi propor um neótipo para M. americana a partir da caracterização morfológica, citogenética e molecular de um topótipo, no sentido de fazer uma descrição emendada da espécie a partir de uma visão integrativa, permitindo assim a comparação com outros padrões já descritos na literatura considerados M. americana. Para tanto, um indivíduo foi coletado na localidade tipo da espécie (Guiana Francesa), e caracterizado por técnicas de morfologia tradicional (medidas cranianas, coloração da pele, biometria corporal) e morfometria geométrica, assim como por análises citogenéticas (banda C, banda G, coloração Ag-NOR, coloração convencional de Giemsa) e moleculares (análises filogenéticas de genes mitocondriais e nucleares). Os resultados corroboram evidências da existência de um complexo de espécies dentro do que hoje se considera M. americana, já... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / The red brocket deer species, Mazama americana, is known as the largest species of the genus Mazama, and also one of the most abundant deer and widely distributed in Neotropical forests. This species has undergone different taxonomic classifications over time due to the potential existence of several species within what is currently known as M. americana, which is considered as a complex of cryptic species. Individuals included in this species show a high morphological convergence between them with a consistent chromosomal variation in geographical terms, suggesting the existence of different evolutionary units. The objective of this study, therefore, was to obtain the morphological, cytogenetic and molecular profile of a M. americana topotype to gain an exact description of the species and be able to compare them with other standards already described in the literature for M. americana. For this purpose, an individual was collected at the type locality of this species (French Guiana) and characterized by traditional morphological techniques (cranial measurements, skin color, body biometrics), geometric morphometry, cytogenetic analysis (Band C, Band G Ag-NOR staining, conventional Giemsa staining) as well as molecular analysis (phylogenetic analyzes of mitochondrial and nuclear genes). Among highlights of the results, cytogenetic analysis showed a pattern that does not fit into any of the Mazama americana variants until now known. Similarly, the molecular analysis revealed the existence of, at least, two different species within this taxon, being clear the morphological similarity in all variants, proving once again that the red brocket variants are impossible to differentiate only by morphological characters. All these results, therefore, corroborate the existence of several species within M. americana species, contributing largely to ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Karin Wether / Banca: Edviges Maristela Pituco / Banca: Liria Hiromi Okuda / Banca: Hélio José Montassier / Banca: Maria da Glória Buzinaro / Resumo: RESUMO - Língua azul (LA) é uma doença viral infecciosa que afeta ruminantes domésticos e selvagens e é transmitida por mosquitos vetores do gênero Culicoides (Diptera: Ceratopogonidae). É de notificação obrigatória segundo lista da OIE (Organização Mundial de Saúde Animal) e do Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento do Brasil. Os sinais clínicos e lesões em casos agudos de infecção pelo vírus da língua azul (VLA) são sutis ou inexistentes; e quando presentes são muito semelhantes com outras enfermidades hemorrágicas, havendo a necessidade de técnicas laboratoriais complementares para o diagnóstico definitivo dessa enfermidade. O presente trabalho teve como objetivo realizar um estudo epidemiológico da doença da língua azul nos cervídeos pertencentes ao Núcleo de Pesquisa e Conservação de Cervídeos - NUPECCE e nos ruminantes domésticos mantidos nas proximidades, utilizando técnicas sorológicas (ELISA competitivo em fase sólida e imunodifusão dupla em gel de ágar - IDGA) e moleculares (RT-qPCR), além da investigação da população de insetos hematófagos existentes no local. Para pesquisa do VLA e seus anticorpos foi utilizado sangue total e soro dos cervídeos brasileiros provenientes do criatório e dos outros ruminantes domésticos mantidos nas proximidades do criatório. Dos cervídeos que vieram a óbito também foram colhidos fragmentos de órgãos para diagnóstico molecular. Pela técnica de IDGA apresentaram anticorpos anti-vírus da LA: 47,43% (37/78) dos cervídeos, 9... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Bluetongue (BT) is an infectious viral disease that affects domestic and wild ruminants, transmitted by vectors, mosquitoes of the genus Culicoides (Diptera: Ceratopogonidae). The notification is mandatory according to the list of the OIE (World Organisation of Animal Health) and the Ministry of Agriculture, Livestock and Supply of Brazilian Government. Clinical signs and lesions in acute cases of infection are often subtle or nonexistent; and when present are very similar with others hemorrhagic diseases, it is necessary to use complementary techniques for the definitive diagnosis of the disease. This study aimed to perform an epidemiological study of BT disease in captive cervids using serological (solid phase competitive ELISA and double agar gel imunodifusion - AGID) and molecular techniques (RT-qPCR), in addition to the investigation of the population of hematophagous insects in the area. To investigate the Bluetongue virus (BTV) and their antibodies, whole blood and serum from Brazilian captive cervids and domestic ruminants located nearby were used. From cervids that died, fragments of organs were collected for molecular diagnosis. Using the AGID technique performed, the animals presented anti-BTV antibodies: 47.43% (37/78) of cervids, 90.9% (120/132) of cattle, 55.49% (96/173) of sheep and 19.56% (9/46) of goats. By the solid phase competitive ELISA were reagents: 38.46% (30/78) of cervids, 93.18% (123/132) of cattle, 60.69% (105/173) of sheep and 23.91% (11/46) of goats. Using RT-qPCR from the whole blood the positive results were: 10.14% (7/69) of cervids, 0.75% (1/132) of cattle, 10.65% (18/169) of sheep and 9.09% (4/44) of goats. From the 46 deer that died, RT-qPCR was also performed and 8.69% (4/46) animals were positive for BTV. Between 2015 and 2016, bloodsucking insects of the family Ceratopogonidae, Psychodidae and Simuliidae (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Karin Werther / Banca: Eliana Reiko Matushima / Banca: Eveline dos Santos Zanetti / Resumo: Os cervídeos têm sido acometidos por doenças hemorrágicas virais, tais como, doença epizoótica hemorrágica (DEH), língua azul (LA) e doença hemorrágica por adenovírus (DHA). Como as lesões macroscópicas, entre elas, enterite hemorrágica, edema pulmonar, petéquias e sufusões em diversos órgãos, são observadas nas três doenças, há necessidade de técnicas acuradas para realizar o diagnóstico definitivo. A partir do material de arquivo (blocos de parafina) existente no Departamento de Patologia Veterinária da FCAV - Unesp, 42 cervídeos brasileiros, tanto de vida livre como de cativeiro, foram selecionados, por apresentarem sinais clínicos e/ou lesões macroscópicas sugestivas de doenças virais hemorrágicas. Das amostras analisadas, utilizando técnica de imunoistoquímica, todas apresentaram resultado negativo para adenovírus. Utilizando técnica de RT-PCR em tempo real para vírus da doença epizoótica hemorrágica, os resultados foram também negativos. A mesma técnica aplicada para vírus da língua azul revelou sete animais positivos (16,66%) confirmados com eletroforese em gel de agarose 4% e sequenciamento. Todos os casos positivos foram de animais provenientes de cativeiro, sendo três fêmeas (duas jovens, uma adulta) e quatro machos jovens. As principais alterações macroscópicas observadas nesses animais foram conteúdo intestinal hemorrágico, mucosas avermelhadas do trato gastrointestinal, úlceras em língua e petéquias em diversos órgãos. Na histologia observou-se principalmente infiltrado inflamatório, hemorragia e congestão em diversos órgãos. Os vírus da DHA e DEH não estão envolvidos nos óbitos dos cervídeos estudados. A relevância deste trabalho está no fato de ser a primeira descrição de material genético do vírus da LA em cervídeos brasileiros / Abstract: Cervids have been affected by viral hemorrhagic diseases, such as Epizootic hemorrhagic disease (EHD), Bluetongue (BT), and Adenoviral hemorrhagic disease (AHD). Once that gross lesions, among them, hemorrhagic enteritis, pulmonary edema, petechiae and suffusions in several organs, are similar, it is necessary to use accurate techniques to the definitive diagnosis. From the archival material (paraffin blocks) available in the Department of Veterinary Pathology of FCAV - Unesp, 42 Brazilian deer, both free living and captive, were selected because they had lesions suggestive of hemorrhagic viral disease. The samples analyzed, using Immunohistochemistry, were all negative for adenovirus. Using real time RT-PCR for EHD, the results were also negative. The same technique applied to BT virus revealed seven positive animals (16,66%) confirmed after agarose 4% gel electrophoresis and gene sequencing. The main macroscopic changes observed in these animals were hemorrhagic intestinal contents, reddish mucous membrane of the gastrointestinal tract, ulcers on tongue and petechiae in various organs. Mostly histological changes observed were inflammatory infiltrate, hemorrhage, and congestion in various organs. All positive cases were from captive animals, three females (two young and one adult), and four young males. The AHD and EHD virus are not involved in the deaths of the deers studied in this research. The significance of this study is due to the fact that it was the first time the genome of BT virus was identified in Brazilian cervids / Mestre

Orientador: José Luiz Laus / Banca: José Maurício Barbanti Duarte / Banca: Alexandre Pinto Ribeiro / Resumo: Cervídeos da fauna brasileira, muitos dos quais sob risco de extinção, não estão livres de afecções oculares. O conhecimento sobre os parâmetros oftálmicos é particularmente importante, notadamente para o diagnóstico e a terapêutica das oftalmopatias que os acometem. Foram avaliadas a produção lacrimal, empregando-se o teste da lágrima de Schirmer; a pressão intraocular, pela tonometria digital de aplanação; a biometria ocular, à ultrassonografia; a biometria craniana, à paquimetria; e as condições da retina, pela eletrorretinografia. Estudaram-se e compararam-se as espécies Mazama americana, Mazama nemorivaga, Mazama gouazoubira, Mazama nana, Mazama bororo, Blastocerus dichotomus, Odocoileus virginianus e Ozotoceros bezoarticus, livres de afecções oftálmicas. Valores de Schirmer mostraram-se menores que os referidos para animais domésticos e selvagens e não diferiram entre as espécies avaliadas. Valores de pressão intraocular não diferiram das de animais de famílias semelhantes já estudadas. Diferenças entre as espécies foram encontradas relativamente à PIO, estando o maior valor com o O. bezoarticus (19 mmHg) e o menor com o M. nemorivaga (5 mmHg). Animais que habitam áreas de vegetação predominantemente densa exibiram córneas mais espessas. Animais que habitam áreas de vegetação predominantemente aberta, exibiram córneas mais delgadas. Relativamente à espessura da lente e ao comprimento axial do olho, espécies com olhos de maior tamanho foram as de áreas de vegetação fechada e espécies com olhos de menor tamanho corresponderam às de vegetação aberta. A eletrorretinografia não apontou diferenças entre as espécies / Abstract: Brazilian deer, some of which are at risk of extinction, are not free from ophthlamic lesions. Knowledge about ophthalmic parameters is particularly important, especially for diagnostics and therapeutics of ophthalmopaties that can affect them. At this study, tear production, measured with Schirmer tear test, introcular pressure, measured with applanation tonometry, ocular biometry, measured from ultrasonographic images, head biometry, using a caliper rule, and retina conditions, by electroretinography, were evaluated. Several adult captive deer, from eight different species (Mazama americana, Mazama nemorivaga, Mazama gouazoubira, Mazama nana, Mazama bororo, Blastocerus dichotomus, Odocoileus virginianus e Ozotoceros bezoarticus), free from ophthalmic lesions, were studied and compared. Tear production did not differ between studied species and were lower than values in domestic and other wild animals. Intraocular pressure were similar to other animal from resembling families. IOP data showed differences between species, where the highest values were found in O. bezoarticus (19 mmHg), and the lowest in M. nemorivaga (5 mmHg). Corneal thickness was higher in animals living in areas with dense vegetation, while lower values were found in animals who live in areas with open vegetation. The same correlation could me made when looking at lens thickness and axial lenght, where species with bigger eyes live in areas with dense vegetation, while species with smaller eyes live in areas with open vegatation. Electroretinography did not show differences between species / Mestre

Orientador: José Maurício Barbanti Duarte / Coorientador: Eveline dos Santos Zanetti / Banca: Maria Emilia Franco Oliveira / Banca: Gisele Zoccal Mingoti / Banca: Maria Denise Lopes / Resumo: A região neotropical passa por um período crítico em termos de perda de biodiversidade. Dentro deste contexto, há um crescente aumento do número de espécies de cervídeos neotropicais sofrendo redução em seu tamanho populacional, podendo ocasionar ausência de fluxo gênico e consequente diminuição da variabilidade genética e à endogamia, afetando o desempenho reprodutivo e aumentando o risco de extinção. Neste contexto, o uso das biotécnicas da reprodução nos animais silvestres será útil para programas de conservação das mais diversas espécies. Assim, o objetivo do presente trabalho foi avaliar a viabilidade da técnica de inseminação artificial intrauterina por videolaparoscopia (IAUL), com sêmen congelado, na espécie M. gouazoubira. Foram utilizadas cinco fêmeas adultas e dois machos adultos inteiros, da espécie M. gouazoubira, sendo que, quatro fêmeas foram submetidas a dois procedimentos de IAUL com intervalo aproximado de 5 meses e uma fêmea passou por um procedimento, totalizando nove inseminações. As fêmeas receberam um dispositivo intravaginal contendo 0,33g de progesterona, cuja permanência foi de oito dias. No momento da retirada do dispositivo, foi administrado 265μg (1mL) de cloprostenol sódico. Oito horas após a retirada do dispositivo as fêmeas passaram a ser monitoradas (com rufiões) quanto a manifestação do estro comportamental a cada seis horas. Os procedimentos de IAUL foram realizados 12-14 horas após início do estro e os animais receberam uma aplicação de 2,5mg (2mL) de hormônio luteinizante (LH). As inseminações foram realizadas com sêmen descongelado, na concentração de 50 x 106 espermatozoides/dose, envasados em palhetas de 0,25mL, com motilidade e vigor mínimos de 30% e 2, respectivamente, pós descongelação. A avaliação da presença do corpo lúteo (CL) funcional foi feita com a dosagem hormonal de metabólitos fecais ... / Abstract: The neotropical region undergoes a critical period in terms of biodiversity loss. Within this context there is a rising increasing of neotropical deer species suffering a shrinking in its population. The population decreasing as well the gene flow absence can lead to the genetic variability reduction and endogamy, affecting the reproductive performance and increasing the extinction risk. In this context, the wild animal reproduction biotechnique knowledge might be useful to further conservation programs to several species. Thus, this work aim was evaluate the videolaparoscopic intrauterine artificial insemination technique (LAI), using frozen semen of M. gouazoubira. To the procedure, five adult females and two stags of M. gouazoubira were used. Four females were submitted two LAI procedures in a five months interval and one female suffered one procedure, totalizing nine inseminations. The females received an intravaginal device containing 0.33g of progesterone foreight days. At the device removal time, 265μg (1mL) of sodium cloprostenol was i.m. administred. Eight hours later the females started being monitored (with teasers ) regarding to the behaviorial estrus every six hours. The LAI procedures were done 12-24 hours after the estrus beginning, when the animals received 2.5mg (2mL) of luteinizing hormone (LH). Inseminations were done using 0.25mL straws (50x106 espermatozoons/mL) of thawed semen, with minimal motility and vigor of 30% and 2, respectively, in the post thaw. The corpus luteum (CL) presence evaluation was done by progesterone fecal metabolites hormonal dosage. The gestation diagnostic was done from 45 to 55 days after LAI by transabdominal ultrasonography. Only eight LAI procedures were able to be evaluated regarding the gestation percentage due the death of one female just after the second insemination procedure, resulting in 50% (4/8) of gestation. The average time from ... / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-31Bitstream added on 2014-06-13T19:15:43Z : No. of bitstreams: 1 kawanami_ae_me_jabo.pdf: 824530 bytes, checksum: e2cb2bd3bc907bc0688a009fdfc6fefd (MD5) / Os cervídeos têm sido acometidos por doenças hemorrágicas virais, tais como, doença epizoótica hemorrágica (DEH), língua azul (LA) e doença hemorrágica por adenovírus (DHA). Como as lesões macroscópicas, entre elas, enterite hemorrágica, edema pulmonar, petéquias e sufusões em diversos órgãos, são observadas nas três doenças, há necessidade de técnicas acuradas para realizar o diagnóstico definitivo. A partir do material de arquivo (blocos de parafina) existente no Departamento de Patologia Veterinária da FCAV – Unesp, 42 cervídeos brasileiros, tanto de vida livre como de cativeiro, foram selecionados, por apresentarem sinais clínicos e/ou lesões macroscópicas sugestivas de doenças virais hemorrágicas. Das amostras analisadas, utilizando técnica de imunoistoquímica, todas apresentaram resultado negativo para adenovírus. Utilizando técnica de RT-PCR em tempo real para vírus da doença epizoótica hemorrágica, os resultados foram também negativos. A mesma técnica aplicada para vírus da língua azul revelou sete animais positivos (16,66%) confirmados com eletroforese em gel de agarose 4% e sequenciamento. Todos os casos positivos foram de animais provenientes de cativeiro, sendo três fêmeas (duas jovens, uma adulta) e quatro machos jovens. As principais alterações macroscópicas observadas nesses animais foram conteúdo intestinal hemorrágico, mucosas avermelhadas do trato gastrointestinal, úlceras em língua e petéquias em diversos órgãos. Na histologia observou-se principalmente infiltrado inflamatório, hemorragia e congestão em diversos órgãos. Os vírus da DHA e DEH não estão envolvidos nos óbitos dos cervídeos estudados. A relevância deste trabalho está no fato de ser a primeira descrição de material genético do vírus da LA em cervídeos brasileiros / Cervids have been affected by viral hemorrhagic diseases, such as Epizootic hemorrhagic disease (EHD), Bluetongue (BT), and Adenoviral hemorrhagic disease (AHD). Once that gross lesions, among them, hemorrhagic enteritis, pulmonary edema, petechiae and suffusions in several organs, are similar, it is necessary to use accurate techniques to the definitive diagnosis. From the archival material (paraffin blocks) available in the Department of Veterinary Pathology of FCAV – Unesp, 42 Brazilian deer, both free living and captive, were selected because they had lesions suggestive of hemorrhagic viral disease. The samples analyzed, using Immunohistochemistry, were all negative for adenovirus. Using real time RT-PCR for EHD, the results were also negative. The same technique applied to BT virus revealed seven positive animals (16,66%) confirmed after agarose 4% gel electrophoresis and gene sequencing. The main macroscopic changes observed in these animals were hemorrhagic intestinal contents, reddish mucous membrane of the gastrointestinal tract, ulcers on tongue and petechiae in various organs. Mostly histological changes observed were inflammatory infiltrate, hemorrhage, and congestion in various organs. All positive cases were from captive animals, three females (two young and one adult), and four young males. The AHD and EHD virus are not involved in the deaths of the deers studied in this research. The significance of this study is due to the fact that it was the first time the genome of BT virus was identified in Brazilian cervids