Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2017-02-02T12:36:32Z No. of bitstreams: 2 Tese - Bruno Vilela de Moraes e Silva - 2016.pdf: 2908668 bytes, checksum: 88cc5e7beddd3698aef28d0ab94f3bd4 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-02-06T09:41:35Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Bruno Vilela de Moraes e Silva - 2016.pdf: 2908668 bytes, checksum: 88cc5e7beddd3698aef28d0ab94f3bd4 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-06T09:41:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Bruno Vilela de Moraes e Silva - 2016.pdf: 2908668 bytes, checksum: 88cc5e7beddd3698aef28d0ab94f3bd4 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / La extinción es un proceso central en la evolución de las especies y como todo proceso biológico su complejidad es causada por la conjunción de factores actuantes y sus correspondientes interacciones. En esta tesis buscamos estudiar parte de esas causas, particularmente como el tiempo comprendido entre la descripción científica de una especie hasta la actualidad puede influir en nuestro conocimiento sobre la misma y su riesgo de extinción asociado. Desde las serpientes del nuevo mundo (primer capítulo) hasta diversos grupos animales de todo el mundo (segundo capítulo), enfocamos en como el tamaño del cuerpo, el rango de distribución geográfica y la abundancia relativa están generando una correlación entre el año en que una especie fue descripta, la cantidad de información y el riesgo de extinción. Mostramos como esas correlaciones pueden ocasionar errores en estudios correlativos y probables consecuencias negativas para el conocimiento de la biodiversidad, puesto que los resultados demuestran que se están perdiendo especies menos conocidas para la ciencia. En el tercer capítulo, indicamos como la edad del clado, juntamente con otras características evolutivas, influencian el riesgo de extinción actual en plantas ibéricas y mediterráneas, y como este efecto pude llevar a una pérdida desproporcional de historia evolutiva en la región. Presentamos un modelo teórico de como los patrones evolutivos del riesgo de extinción observados pueden ser explicados por la interacción con la historia biogeográfica. Finalmente, agregamos herramientas para la obtención, manipulación y análisis de datos, que fueron usados en los diferentes capítulos de esta tesis, en un paquete de R, presentado en el último capítulo. Se ejemplifican sus funcionalidades al estudiar el patrón global del año de descripción en anfibios, mostrando el papel relativo de la influencia humana y el rango de distribución. / A extinção é um processo chave na evolução das espécies e, como a maior parte dos processos biológicos, envolve uma complexidade causada pela multiplicidade de fatores envolvidos e suas correspondentes interações. Nessa tese procuramos estudar nos dois primeiros capítulos parte dessas causas, particularmente como o tempo compreendido entre a descrição científica de uma espécie até a atualidade pode influenciar o nosso conhecimento sobre a mesma e seu risco de extinção associado. Partindo das serpentes do Novo Mundo (primeiro capítulo) e depois ampliando os resultados a diversos grupos animais em um nível global (segundo capítulo), focamos em como o tamanho do corpo, a distribuição geográfica e a abundância estão gerando uma correlação entre o ano em que uma espécie foi descrita, sua informação associada e seu risco de extinção. Mostramos como isso pode ocasionar potenciais erros em estudos correlativos e prováveis consequências negativas para o conhecimento científico da biodiversidade, já que os resultados indicam que estamos perdendo as espécies menos conhecidas para a ciência. No terceiro capítulo, mostramos como a idade de uma espécie, juntamente com outras características evolutivas, influenciam o risco de extinção atual em plantas ibéricas e mediterrâneas, e como essa relação pode levar a uma perda desproporcional de história evolutiva na região. Apresentamos uma proposta teórica de como o padrão filogenético do risco de extinção observado pode ser explicado pela interação com a história biogeográfica. Por fim, agregamos uma série de ferramentas de obtenção, manipulação e análise dados macroecológicos desenvolvidas ao longo dos capítulos dessa tese em um pacote de R, apresentado no último capítulo. Exemplificamos a sua funcionalidade ao revelar o padrão global do ano de descrição em anfíbios, mostrando o papel relativo da influência humana e do tamanho da distribuição geográfica.

Este trabalho tem como objetivo principal contribuir para o conhecimento da flora da Serra do Cipó, Minas Gerais, através do estudo taxonômico das espécies do clado urticóide da ordem Rosales ocorrentes na área. Esse grupo compreende cerca de 110 gêneros e aproximadamente 4000 espécies distribuídas nas famílias Ulmaceae, Cannabaceae, Moraceae e Urticaceae, diagnosticados pela presença de cistólitos, flores reduzidas e inconspícuas com 5 ou menos estames e gineceu bicarpelar com ovário unilocular portando um único óvulo apical ou basal. O levantamento das espécies urticóides foi realizado baseando-se em consultas bibliográficas, visitas aos principais herbários com coleções de materiais da Serra do Cipó, expedições de coleta aos principais pontos amostrados e exploração de novas áreas. Na Serra do Cipó foram encontrados 15 gêneros e 20 espécies distribuídas da seguinte maneira: duas espécies em Cannabaceae Martynov Celtis iguanaea (Jacq.) Sarg. e Cannabaceae Martynov (L.) Blume; 11 em Moraceae Link. Brosimum gaudichaudii Tréc., Dorstenia brasiliensis Lam., Ficus calyptroceras (Miq.) Miq., F. gomelleira Kunth & C.D. Bouché, F. obtusifolia Kunth, F. obtusiuscula (Miq.) Miq., F. pertusa L.f., Helicostylis tomentosa (Poepp. & Endl.) Rusby, Maclura tinctoria (L.) D. Don ex Steud., Pseudolmedia laevigata Tréc. e Sorocea guilleminiana Gaudich.; e sete em Urticaceae Juss., sendo elas: Boehmeria caudata Sw., Cecropia hololeuca Miq., C. pachystachya Tréc., Coussapoa microcarpa (Schott) Rizzini, Pilea microphylla (L.) Liebm., Pourouma guianensis Aubl. e Urera baccifera (L.) Gaudich. São apresentadas descrições morfológicas, chaves de identificação de gêneros e espécies, ilustrações, dados sobre fenologia, distribuição geográfica, habitats e comentários sobre as espécies estudadas. / This work has as main objective to contribute for knowledgement of the Flora da Serra do Cipó, Minas Gerais, through the taxonomic study of the species of urticalean clade of order Rosales in this area. This group includes about 110 genera and approximately 4000 species distributed in families Ulmaceae, Cannabaceae, Moraceae and Urticaceae, diagnosticated to presence of cystolithes, reducted and inconspicuous flowers with five or fewer stamens, two carpels gynoecium and unilocular ovary with a single apical or basal ovule. The taxonomic study of urticoid was carried out based on bibliographical consultations, in field activities and visits in the main herbaria with collections of material from Serra do Cipó. They were found 15 genera and 20 species of urticoide in Serra do Cipo, MG, like this distributed: two species of Cannabaceae Martynov Celtis iguanaea (Jacq.) Sarg. and Cannabaceae Martynov (L.) Blume; 11 species of Moraceae Link. Brosimum gaudichaudii Tréc., Dorstenia brasiliensis Lam., Ficus calyptroceras (Miq.) Miq., F. gomelleira Kunth & C.D. Bouché, F. obtusifolia Kunth, F. obtusiuscula (Miq.) Miq., F. pertusa L.f., Helicostylis tomentosa (Poepp. & Endl.) Rusby, Maclura tinctoria (L.) D. Don ex Steud., Pseudolmedia laevigata Tréc. and Sorocea guilleminiana Gaudich.; and seven species of Urticaceae Juss., being them Boehmeria caudata Sw., Cecropia hololeuca Miq., C. pachystachya Tréc., Coussapoa microcarpa (Schott) Rizzini, Pilea microphylla (L.) Liebm., Pourouma guianensis Aubl. and Urera baccifera (L.) Gaudich. Morpholological descriptions, identification key of genera and species, illustrations, notes on phenology, geographic distribution, habitats information and general comments about species studied are provided.

Tricomas secretores são apêndices epidérmicos presentes nas maiorias das plantas desempenhando funções diversas, dentre elas a defesa contra herbivoria. Dentre as famílias que apresentam tricomas secretores destaca-se Cannabaceae, que é amplamente estudada por produzir compostos psicoativos e outros utilizados como aromatizantes de cerveja. Recentemente alguns gêneros pertencentes à Ulmaceae foram inseridos em Cannabaceae, como Celtis e Trema. Tais gêneros são os mais numerosos em espécies da família. Considerando que tricomas secretores são os principais sítios de produção de substâncias de interesse econômico, e que são amplamente utilizados como caráter de valor taxonômico, o presente trabalho comparou a distribuição e morfologia de tricomas secretores de duas espécies de Cannabaceae (Celtis pubescens e Trema micrantha) e três espécies afins de Ulmaceae (Ampelocera glabra, Phyllostylon rhamnoides e Ulmus parvifolia). Os dados foram comparados aos existentes na literatura e discutidos em um contexto sistemático. Os tricomas secretores de Trema micranta foram, ainda, analisados em detalhe quanto à ontogenia, análise química do exsudato (in situ e direto) e ultraestrutura. Para tal, amostras de folhas e flores (pistiladas e estaminadas) foram coletadas, fixadas e processadas para análise de microscopia de luz, eletrônica de varredura e de transmissão. Foram encontrados cinco morfotipos diferentes nas espécies estudadas. C. pubescens e T. micrantha apresentaram tricomas secretores capitados e filiformes, que diferiram quanto ao pedúnculo, unisseriado em C. pubescens e bisseriado em T. micrantha. As três espécies de Ulmaceae apresentaram um único morfotipo (capitado com pedúnculo unicelular). Os tricomas de T. micranta iniciam o desenvolvimento com uma divisão anticlinal, semelhante ao que ocorre em Cannabis sativa. Seus tricomas secretam terpenos, alcaloides e compostos fenólicos. Testes químicos comprovaram a presença de alcaloides e os indicadores de canabinoides sugerem que T. micrantha apresenta potencial para produção desses compostos. A morfologia dos tricomas encontrados nas espécies de Cannabaceae é diferente da observada nas espécies de Ulmaceae, o que apoia a atual circunscrição destas famílias. A diversidade morfológica e de termos utilizados torna difíceis a classificação e comparação entre os tipos de tricomas secretores, sendo necessários esforços no sentido de padronizar a caracterização destas estruturas secretoras, em especial nas famílias que compõem o clado urticoide. / Secretory trichomes are epidermal appendages that are present in most plants performing various functions, among them the defense against herbivory. Cannabaceae comprises plants covered with secretory trichomes, and is a well-known family for producing psychoactive compounds and others used as beer flavorings. Recently some genera belonging to Ulmaceae were inserted into Cannabaceae, such as Celtis and Trema, the species-richest genera of the family. As the secretory trichomes are the main plant source of economically important substances and are widely used as taxonomic markers, the present study compared the distribution and morphology of secretory trichomes of two species of Cannabaceae (Celtis pubescens and Trema micrantha) and three related species of Ulmaceae (Ampelocera glabra, Phyllostylon rhamnoides and Ulmus parvifolia). The data were compared to those in the literature and discussed in a systematic context. The secretory trichomes of Trema micranta were also analyzed in detail regarding ontogeny, histolocalization of substances and ultrastructure. For this, samples of leaf and flower (pistillate and staminate) were collected, fixed and processed for analyses of light microscopy, scanning electron microscopy and transmission electron microscopy. For T. micranta chemical tests in situ and direct were carried out; in addition, samples were prepared for ultrastructural study in transmission electron microscopy. Five different morphotypes of secretory trichomes were found in the species studied. C. pubescens and T. micrantha exhibited capitate and filiform secretory trichomes that differed in the stalk, uniseriate in C. pubescens and biseriate in T. micrantha. The three species of Ulmaceae had a single morphotype (capitate with a unicellular stalk). The trichomes of T. micranta originate of a first anticlinal cell division, similar to what occurs in Cannabis sativa. They secrete terpenes, alkaloids and phenolic compounds. Chemical tests have confirmed the presence of alkaloids and cannabinoid indicators suggest that T. micrantha is a putative species for the production of these compounds. The morphology of the trichomes found in the species of Cannabaceae is different from that observed in the species of Ulmaceae, which supports the current circumscription of these families. The diversity of morphology and terms employed makes it difficult to classify and compare the types of secretory trichomes. In this sense, efforts are needed to standardize the characterization of these secretory structures, especially in the families that comprise the urticalean rosids.

Ministério da Educação, Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovação e Comunicação, Universidade Federal Rural da Amazônia e Museu Paraense Emílio Goeldi / Pucciniales fungi comprise biotrophic phytoparasites that cause rust on plants and it is classified in the Pucciniomycetes class of the Basidiomycota phylum. These fungi have high host specificity and parasitize several plant species. The objective of this work was to carry out taxonomic studies of Pucciniales species occuring on plants of the Fabid clade in the state of Amapá and investigating the association between host plant species and parasite fungus. To this end, taxonomic studies were carried out on rust specimens from herbaria MG and HAMAB, and material available in the MPEG Mycology laboratory collected in nine localities of the state of Amapá between 1987 and 2014. Identification of rust fungi was based on host specificity, morphological analysis of sori and spores, and on specialized literature. Twenty-seven species of the order Pucciniales were identified, classified into 15 genera and six families: Chaconiaceae (Chaconia Juel, Maravalia Arthur and Olivea Arthur), Pileolariaceae (Atelocauda Arthur & Cummins), Pucciniaceae (Puccinia Pers. and Uromyces (Link) Unger), Phakopsoraceae (Cerotelium Arthur, Crossopsora Syd. & P. Syd. and Phakopsora Dietel), Raveneliaceae (Apra J.F. Hennen & F.O. Freire, Dicheirinia Arthur and Ravenelia Berk.), Uropyxidaceae (Sorataea Syd.), and two anamorphic genera, Aecidium Pers. and Uredo Pers. These rust species were associated to 25 genera and nine families of the Fabid clade (Chrysobalanaceae, Clusiaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Malpighiaceae, Moraceae, Passifloraceae, Phyllantaceae and Rhamnaceae). Fabaceae was the family that stood out, with 12 genera parasitized by 13 rust species. New records were identified to the Brazilian Amazon (Uromyces desmodiicola Jørst.), and for Amapá state (Aecidium byrsonimatis Henn., Aecidium passifloricola Henn., Aecidium vinnulum H.S. Jacks. & Holw., Chaconia brasiliensis Y. Ono & J.F. Hennen, Chaconia clusiae Berndt., Phakopsora tomentosae F.A. Ferreira & Gasparotto, Uredo pusilla F. Kern, Thurst. & Whetzel and Uredo ulei Henn.). Three probable new taxa for science were identified (Aecidium sp., Sorataea sp. and Uromyces sp.). Descriptions, geographic distribution and taxonomic comments are provided for the identified Pucciniales species. Identification keys to rust species were elaborated, when more than one species occurred on the same host plant family. This study increased the knowledge on Pucciniales fungi in the Amapá state and represents a contribution to the knowledge of the microdiversity of the Amazon biome. / Fungos Pucciniales são fitoparasitas biotróficos, causadores de ferrugens em plantas e estão classificados na classe Pucciniomycetes do filo Basidiomycota. Estes fungos possuem alta especificidade quanto aos seus hospedeiros, parasitando várias espécies vegetais. O presente trabalho teve por objetivo estudar taxonomicamente espécies de Pucciniales que ocorrem em plantas do clado Fabideas, no estado do Amapá, e associar a planta hospedeira ao fungo parasita. Para isso, foram realizados estudos taxonômicos de espécimes de ferrugens disponíveis nos herbários MG e HAMAB, e de coleções disponíveis no laboratório de Micologia do MPEG, procedentes de coletas realizadas em nove municípios do estado do Amapá, no período entre 1987 e 2014. A identificação das ferrugens foi baseada na especificidade em relação à planta hospedeira, na análise morfológica dos soros e esporos e na literatura especializada. Foram identificadas 27 espécies da ordem Pucciniales, distribuídas em 15 gêneros e seis famílias: Chaconiaceae (Chaconia Juel, Maravalia Arthur e Olivea Arthur), Pileolariaceae (Atelocauda Arthur & Cummins), Pucciniaceae (Puccinia Pers. e Uromyces (Link) Unger), Phakopsoraceae (Cerotelium Arthur, Crossopsora Syd. & P. Syd. e Phakopsora Dietel), Raveneliaceae (Apra J.F. Hennen & F.O. Freire, Dicheirinia Arthur e Ravenelia Berk.), Uropyxidaceae (Sorataea Syd.), e dois gêneros anamorfos, Aecidium Pers. e Uredo Pers. Estas espécies de ferrugem estão associadas a 25 gêneros e nove famílias do clado Fabideas (Chrysobalanaceae, Clusiaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Malpighiaceae, Moraceae, Passifloraceae, Phyllantaceae e Rhamnaceae). Fabaceae destacou-se apresentando 12 gêneros parasitados por 13 espécies de ferrugens. Novos registros foram identificados para Amazônia brasileira (Uromyces desmodiicola Jørst.), e para o estado do Amapá (Aecidium byrsonimatis Henn., Aecidium passifloricola Henn., Aecidium vinnulum H.S. Jacks. & Holw., Chaconia brasiliensis Y. Ono & J.F. Hennen, Chaconia clusiae Berndt., Phakopsora tomentosae F.A. Ferreira & Gasparotto, Uredo pusilla F. Kern, Thurst. & Whetzel e Uredo ulei Henn.). Três prováveis novos táxons para a ciência foram identificados (Aecidium sp., Sorataea sp. e Uromyces sp.). Apresenta-se as descrições, distribuição geográfica e comentários taxonômicos para as espécies de Pucciniales identificadas, assim como chaves de identificação das ferrugens foram elaboradas para famílias de plantas hospedeiras com mais de uma espécie. Este estudo amplia o conhecimento sobre a riqueza de fungos Pucciniales do estado do Amapá e contribui também para o conhecimento da micodiversidade do bioma Amazônia.

Este trabalho tem como objetivo principal contribuir para o conhecimento da flora da Serra do Cipó, Minas Gerais, através do estudo taxonômico das espécies do clado urticóide da ordem Rosales ocorrentes na área. Esse grupo compreende cerca de 110 gêneros e aproximadamente 4000 espécies distribuídas nas famílias Ulmaceae, Cannabaceae, Moraceae e Urticaceae, diagnosticados pela presença de cistólitos, flores reduzidas e inconspícuas com 5 ou menos estames e gineceu bicarpelar com ovário unilocular portando um único óvulo apical ou basal. O levantamento das espécies urticóides foi realizado baseando-se em consultas bibliográficas, visitas aos principais herbários com coleções de materiais da Serra do Cipó, expedições de coleta aos principais pontos amostrados e exploração de novas áreas. Na Serra do Cipó foram encontrados 15 gêneros e 20 espécies distribuídas da seguinte maneira: duas espécies em Cannabaceae Martynov Celtis iguanaea (Jacq.) Sarg. e Cannabaceae Martynov (L.) Blume; 11 em Moraceae Link. Brosimum gaudichaudii Tréc., Dorstenia brasiliensis Lam., Ficus calyptroceras (Miq.) Miq., F. gomelleira Kunth & C.D. Bouché, F. obtusifolia Kunth, F. obtusiuscula (Miq.) Miq., F. pertusa L.f., Helicostylis tomentosa (Poepp. & Endl.) Rusby, Maclura tinctoria (L.) D. Don ex Steud., Pseudolmedia laevigata Tréc. e Sorocea guilleminiana Gaudich.; e sete em Urticaceae Juss., sendo elas: Boehmeria caudata Sw., Cecropia hololeuca Miq., C. pachystachya Tréc., Coussapoa microcarpa (Schott) Rizzini, Pilea microphylla (L.) Liebm., Pourouma guianensis Aubl. e Urera baccifera (L.) Gaudich. São apresentadas descrições morfológicas, chaves de identificação de gêneros e espécies, ilustrações, dados sobre fenologia, distribuição geográfica, habitats e comentários sobre as espécies estudadas. / This work has as main objective to contribute for knowledgement of the Flora da Serra do Cipó, Minas Gerais, through the taxonomic study of the species of urticalean clade of order Rosales in this area. This group includes about 110 genera and approximately 4000 species distributed in families Ulmaceae, Cannabaceae, Moraceae and Urticaceae, diagnosticated to presence of cystolithes, reducted and inconspicuous flowers with five or fewer stamens, two carpels gynoecium and unilocular ovary with a single apical or basal ovule. The taxonomic study of urticoid was carried out based on bibliographical consultations, in field activities and visits in the main herbaria with collections of material from Serra do Cipó. They were found 15 genera and 20 species of urticoide in Serra do Cipo, MG, like this distributed: two species of Cannabaceae Martynov Celtis iguanaea (Jacq.) Sarg. and Cannabaceae Martynov (L.) Blume; 11 species of Moraceae Link. Brosimum gaudichaudii Tréc., Dorstenia brasiliensis Lam., Ficus calyptroceras (Miq.) Miq., F. gomelleira Kunth & C.D. Bouché, F. obtusifolia Kunth, F. obtusiuscula (Miq.) Miq., F. pertusa L.f., Helicostylis tomentosa (Poepp. & Endl.) Rusby, Maclura tinctoria (L.) D. Don ex Steud., Pseudolmedia laevigata Tréc. and Sorocea guilleminiana Gaudich.; and seven species of Urticaceae Juss., being them Boehmeria caudata Sw., Cecropia hololeuca Miq., C. pachystachya Tréc., Coussapoa microcarpa (Schott) Rizzini, Pilea microphylla (L.) Liebm., Pourouma guianensis Aubl. and Urera baccifera (L.) Gaudich. Morpholological descriptions, identification key of genera and species, illustrations, notes on phenology, geographic distribution, habitats information and general comments about species studied are provided.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-04-13T14:16:02Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 00 Santelmo Vasconcelos Tese Final.pdf: 5907295 bytes, checksum: f9f2150b754187a5591b2d05cd74670d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-13T14:16:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 00 Santelmo Vasconcelos Tese Final.pdf: 5907295 bytes, checksum: f9f2150b754187a5591b2d05cd74670d (MD5) Previous issue date: 2015-02-13 / CAPES / CNPq / FACEPE / O gênero Philodendron, um dos principais componentes da flora Neotropical, é o segundo maior da família Araceae, contando com aproximadamente 500 espécies e uma enorme diversidade ecológica. Assim como vários outros grupos vegetais da América tropical, ainda há uma grande defasagem de estudos para o gênero, principalmente no que concerne à sistemática filogenética e à evolução cariotípica das espécies de Philodendron. Desta forma, foram realizadas análises de filogenia molecular baseadas em marcadores plastidiais (rpl32-trnL, trnQ-5’-rps16 e trnV-ndhC) e nucleares (ITS), bem como contagens cromossômicas e estimativas do conteúdo de DNA, levando em consideração espécies das principais subdivisões do gênero e dos grupos irmãos. Ao todo, foram realizadas contagens cromossômicas para 48 espécies, sendo 38 novas, assim como uma revisão de todos os números diploides disponíveis, totalizando 69 espécies, onde a maioria (32 spp.) apresentou 2n = 32, seguido de 2n = 34 (20 spp.). Nas análises filogenéticas foi confirmada a hipótese de parentesco dos subgêneros de Philodendron, onde P. subg. Philodendron e P. subg. Pteromischum apareceram como grupos irmãos e P. subg. Meconostigma como a primeira linhagem a divergir, com os três formando um grupo monofilético. Adicionalmente, foram realizadas estimativas de conteúdo de DNA para 163 acessos, incluindo 108 espécies de Philodendron, bem como 17 espécies de grupos relacionados, onde foi observada uma grande diversidade no tamanho genômico no gênero, variando entre 2,48 e 7,58 pg, indicando uma maior importância da amplificação/eliminação de DNA repetitivo para a evolução cariotípica do grupo, em vez das alterações drásticas nos números cromossômicos, como poliploidizações. / Philodendron, one of the most important components of the Neotropical flora, is the second largest genus within Araceae, which presents approximately 500 species and a huge ecologic diversity. As well as it is observed for other plant groups from tropical America, one can still note a remarkable lack of studies on the evolution of the genus, mainly regarding to phylogenetic systematics and karyotype evolution analyses among Philodendron species. Thus, a molecular phylogeny based on chloroplast (rpl32-trnL, trnQ-5’-rps16 e trnV-ndhC) and nuclear (ITS) markers, as well as chromosome counts and DNA C-value estimations were performed, with species from the main subdivisions within the genus and sister groups. Fortyeight chromosome numbers were described herein, from which 38 were new. Besides, all the available diploid numbers were revised, totalizing 69 species with known chromosome numbers, from which the major part (32 spp.) presented 2n = 32, followed by 2n = 34 (20 spp.). In the phylogenetic analyses, the morphological hypothesis of relationship among the subgenera was confirmed, in which P. subg. Philodendron and P. subg. Pteromischum were recovered as sister groups and P. subg. Meconostigma as the first diverging lineage of the monophyletic group. In addition, DNA content estimations were performed for 163 accessions, including 108 species from Philodendron and 17 from related groups, in which a wide variation of genome sizes were observed, ranging from 2.48 to 7.58 pg. Therefore, it was indicated that the mechanisms of amplification/elimination of repetitive DNA might be more important for the karyotype evolution within the group, in comparison to drastic numeric changes in chromosome numbers such as polyploidization.

Tricomas secretores são apêndices epidérmicos presentes nas maiorias das plantas desempenhando funções diversas, dentre elas a defesa contra herbivoria. Dentre as famílias que apresentam tricomas secretores destaca-se Cannabaceae, que é amplamente estudada por produzir compostos psicoativos e outros utilizados como aromatizantes de cerveja. Recentemente alguns gêneros pertencentes à Ulmaceae foram inseridos em Cannabaceae, como Celtis e Trema. Tais gêneros são os mais numerosos em espécies da família. Considerando que tricomas secretores são os principais sítios de produção de substâncias de interesse econômico, e que são amplamente utilizados como caráter de valor taxonômico, o presente trabalho comparou a distribuição e morfologia de tricomas secretores de duas espécies de Cannabaceae (Celtis pubescens e Trema micrantha) e três espécies afins de Ulmaceae (Ampelocera glabra, Phyllostylon rhamnoides e Ulmus parvifolia). Os dados foram comparados aos existentes na literatura e discutidos em um contexto sistemático. Os tricomas secretores de Trema micranta foram, ainda, analisados em detalhe quanto à ontogenia, análise química do exsudato (in situ e direto) e ultraestrutura. Para tal, amostras de folhas e flores (pistiladas e estaminadas) foram coletadas, fixadas e processadas para análise de microscopia de luz, eletrônica de varredura e de transmissão. Foram encontrados cinco morfotipos diferentes nas espécies estudadas. C. pubescens e T. micrantha apresentaram tricomas secretores capitados e filiformes, que diferiram quanto ao pedúnculo, unisseriado em C. pubescens e bisseriado em T. micrantha. As três espécies de Ulmaceae apresentaram um único morfotipo (capitado com pedúnculo unicelular). Os tricomas de T. micranta iniciam o desenvolvimento com uma divisão anticlinal, semelhante ao que ocorre em Cannabis sativa. Seus tricomas secretam terpenos, alcaloides e compostos fenólicos. Testes químicos comprovaram a presença de alcaloides e os indicadores de canabinoides sugerem que T. micrantha apresenta potencial para produção desses compostos. A morfologia dos tricomas encontrados nas espécies de Cannabaceae é diferente da observada nas espécies de Ulmaceae, o que apoia a atual circunscrição destas famílias. A diversidade morfológica e de termos utilizados torna difíceis a classificação e comparação entre os tipos de tricomas secretores, sendo necessários esforços no sentido de padronizar a caracterização destas estruturas secretoras, em especial nas famílias que compõem o clado urticoide. / Secretory trichomes are epidermal appendages that are present in most plants performing various functions, among them the defense against herbivory. Cannabaceae comprises plants covered with secretory trichomes, and is a well-known family for producing psychoactive compounds and others used as beer flavorings. Recently some genera belonging to Ulmaceae were inserted into Cannabaceae, such as Celtis and Trema, the species-richest genera of the family. As the secretory trichomes are the main plant source of economically important substances and are widely used as taxonomic markers, the present study compared the distribution and morphology of secretory trichomes of two species of Cannabaceae (Celtis pubescens and Trema micrantha) and three related species of Ulmaceae (Ampelocera glabra, Phyllostylon rhamnoides and Ulmus parvifolia). The data were compared to those in the literature and discussed in a systematic context. The secretory trichomes of Trema micranta were also analyzed in detail regarding ontogeny, histolocalization of substances and ultrastructure. For this, samples of leaf and flower (pistillate and staminate) were collected, fixed and processed for analyses of light microscopy, scanning electron microscopy and transmission electron microscopy. For T. micranta chemical tests in situ and direct were carried out; in addition, samples were prepared for ultrastructural study in transmission electron microscopy. Five different morphotypes of secretory trichomes were found in the species studied. C. pubescens and T. micrantha exhibited capitate and filiform secretory trichomes that differed in the stalk, uniseriate in C. pubescens and biseriate in T. micrantha. The three species of Ulmaceae had a single morphotype (capitate with a unicellular stalk). The trichomes of T. micranta originate of a first anticlinal cell division, similar to what occurs in Cannabis sativa. They secrete terpenes, alkaloids and phenolic compounds. Chemical tests have confirmed the presence of alkaloids and cannabinoid indicators suggest that T. micrantha is a putative species for the production of these compounds. The morphology of the trichomes found in the species of Cannabaceae is different from that observed in the species of Ulmaceae, which supports the current circumscription of these families. The diversity of morphology and terms employed makes it difficult to classify and compare the types of secretory trichomes. In this sense, efforts are needed to standardize the characterization of these secretory structures, especially in the families that comprise the urticalean rosids.

Orientador: Ana Paula Fortuna Perez / Resumo: Poiretia Vent. (Leguminosae, Papilionoideae, Dalbergieae, Clado Adesmia) é caracterizado pela presença de glândulas punctiformes em todo corpo vegetal, hábito arbustivo, subarbustivo ou trepador, estames monadelfos, anteras dimórficas e frutos do tipo lomento. A última revisão taxonômica do gênero data da década de 80 e muitas de suas espécies ainda apresentam uma delimitação difícil com sobreposição de caracteres, dificultando uma precisa identificação dos táxons. Como mencionado, uma das características morfológicas mais marcantes do gênero é a presença de glândulas orbiculares com forte odor por toda a planta e apesar disto, estudos investigativos morfológicos e anatômicos, especialmente destas glândulas, objetivando a busca de potenciais caracteres com valor taxonômico são inexistentes no gênero. Por isso, um estudo taxonômico e anatômico, com ênfase nas estruturas secretoras de folíolos, visando a precisa delimitação dos táxons deste gênero, a partir de técnicas usuais em taxonomia e anatomia, foi realizado. Como resultado, são apresentados dois capítulos nesta tese. O primeiro capítulo apresenta a revisão taxonômica, no qual foram reconhecidas 12 espécies exclusivamente Americanas e predominantemente Tropicais. Todas ocorrem no Brasil, das quais nove são endêmicas. Foram realizadas duas lectotipificações e duas neotipificações. Além disso, é fornecida uma chave para identificação, descrições, comentários quanto às suas distribuições geográficas, incluindo mapas, status ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Poiretia Vent. (Leguminosae, Papilionoideae, Dalbergieae, Adesmia clade) is characterized by presence of punctiform glands throughout the entire plant body, shrubby, subshrubby and climbing plants, monadelfhous stamens, dimorphic anthers and fruit of the lomento type. The last taxonomic revision of the genus dates back to the 1980s and many of its species still have a difficult delimitation with overlapping characters, making it difficult to accurately identify taxa. As mentioned, one of the most striking morphological characteristics of the genus is the presence of orbicular glands with a strong odor throughout the plant and despite this, morphological and anatomical investigative studies, especially of these glands, aiming at the search for potential characters with taxonomic value are nonexistent in the genus. For this reason, a taxonomic and anatomical study, with emphasis on the secretory structures of leaflets, aiming at the precise delimitation of the taxa of this genus, using techniques usual in taxonomy and anatomy, was carried out. As a result, two chapters are presented in this thesis. The first chapter presents the taxonomic revision, which recognized 12 exclusively American and predominantly Tropical species. All of them occur in Brazil, of which nine are endemic to the country. Two lectotypifications and two neotypifications were performed. In addition, it is provided an identification key, descriptions, comments about it’s geographical distributions, including ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

An interdisciplinary approach integrating micro and macroevolution, genomic, morphometric and morphological variation, systematics, quantitative genetics, and biogeography was employed to investigate the evolutionary history of the genus Holochilus (Rodentia: Sigmodontinae). Holochilus presents poorly defined species, with nomenclatural problems and phylogenetic relationships on species level unknown. The current species number possibly does not reflect its real diversity, and no work combining genetic and morphometric evidences from all its geographic range was performed. This genus belongs to the tribe Oryzomyini, and along with other 14 genera constitute the Oryzomyini clade D, the most comprehensive generic diversity of the tribe, occupying distinct environments. The internal phylogenetic relationship within this clade is still unclear and variable. Due to its broad geographic distribution, Holochilus also represents a key piece on the study of the evolution of oryzomines of open formations of South America. Based on a comprehensive sampling, I analyzed patterns of morphometric and genomic variation within Holochilus, in order to delimit the species belonging to this genus, as well as access the phylogenetic relationship between these lineages. I investigated the sexual and ontogenetic variation in this group, comparing natural and captive populations, seeking for understand the effect of the environmental differences in the pattern of variation and ontogenetic trajectories (Chapter 1). I also evaluated and compared the genomic variation among three species of Holochilus to verify the influence of the biomes and the climatic changes in the genomic signatures (Chapter 2). I applied a model-based approach to delimit species (Chapter 3). And finally, additional investigations were made to propose the phylogenetic relationship between members of clade D, and provide date intervals for the main diversifications events, as well as the possible process responsible for the biogeographic pattern current observed related with the forest and open areas occupation (Chapter 4). Sexual dimorphism exhibited small degree of variation among populations. The greater ontogenetic variation is found in the younger age classes, but oldest individuals also show larger degree of differentiation. There are also great differences in the ontogenetic trajectories among samples, where individuals from the captive population exhibited the lower degree of variation between all age classes. The quantitative genetic analysis showed that genomic differences are observed across the taxa, and it was associated with geography. Ecological niche models revealed that biomes with larger areas of stability also presented more genomic structure, suggesting that historical dimension impacted population isolation/connectivity. Results also shows that biomes not only differ geographically and environmentally (based on past climatic conditions), but also show significant association between the environmental space and the genetic variation that is not related with geography. Eight independent lineages within Holochilus were recovered, and the phylogenetic arrangement partially corroborates previous studies. Finally, the phylogeny proposed for the clade D presented some differences in comparisons with other previously reported, and suggest that most of the cladogenetic events happened during the Pleistocene, being the expansion of open environments an important driver of diversification in this group. / Uma abordagem interdisciplinar integrando micro e macroevolução, variação genômica, morfométrica e morfológica, sistemática, genética quantitativa e biogeografia foi empregada para investigar a história evolutiva do gênero Holochilus (Rodentia: Sigmodontinae). O gênero Holochilus apresenta espécies mal definidas, com problemas nomenclaturais e relações desconhecida. O número atual de espécies possivelmente não reflete a sua diversidade real e, até o momento, não foi realizado nenhum trabalho combinando evidências genéticas e morfométricas englobando toda a distribuição geográfica desse grupo. Este gênero pertence à tribo Oryzomyini, e juntamente com outros 14 gêneros (a diversidade genérica mais abrangente da tribo) formam o clado D. A relação filogenética interna dentro deste clado ainda é variável. Devido à sua ampla distribuição geográfica, Holochilus também representa uma peça chave no estudo da evolução dos oryzomíneos de formações abertas da América do Sul. Com base em uma amostragem abrangente, analisei padrões de variação morfométrica e genômica dentro de Holochilus, a fim de delimitar as espécies pertencentes a este gênero, bem como acessar a relação filogenética entre essas linhagens. Investiguei a variação sexual e ontogenética deste grupo, comparando populações naturais e de cativeiro, buscando entender o efeito das diferenças ambientais no padrão de variação e nas trajetórias ontogenéticas (Capítulo 1). Eu também avaliei e comparei a variação genômica entre três espécies de Holochilus a fim de verificar a influência dos biomas e das mudanças climáticas nas assinaturas genômicas das espécies (Capítulo 2). Em seguida eu apliquei uma abordagem baseada em modelos para delimitar as espécies (Capítulo 3). Finalmente, investigações adicionais foram realizadas para propor as relações filogenéticas entre os membros do clade D, fornecendo datas para os principais eventos de diversificação, e inferências sobre possíveis processos responsáveis pelo padrão biogeográfico atual, relacionado os mesmos com a ocupação florestal e áreas abertas (Capítulo 4). O dimorfismo sexual apresentou pequeno grau de variação entre as populações. A maior variação ontogenética é encontrada nas classes etárias mais jovens e mais velhas. Há também grandes diferenças nas trajetórias ontogenéticas entre as amostras, onde indivíduos da população cativeiro exibiram o menor grau de variação entre todas as classes etárias. A análise genética quantitativa mostrou que diferenças genômicas são observadas em todos os táxons e essa diferença está associada à geografia. Modelos de nichos ecológicos revelaram que os biomas com maiores áreas de estabilidade também apresentaram maior estruturação genômica, sugerindo que uma dimensão histórica impactou o isolamento/conectividade entre as populações. Os resultados também mostram que os biomas não só diferem geograficamente e ambientalmente (baseado em condições climáticas passadas), mas também mostram associação significativa entre o espaço ambiental e a variação genética que não está relacionada com a geografia. Adicionalmente, foi recuperado oito linhagens independentes dentro de Holochilus, e o arranjo filogenético parcialmente corrobora estudos anteriores. Finalmente, a filogenia proposta para o clado D apresentou algumas diferenças em comparação com outros estudos, e sugeriu que a maioria dos eventos cladogenéticos ocorreram durante o Pleistoceno, sendo a expansão dos ambientes abertos um importante motor de diversificação neste grupo.

O gênero Drosera (Droseraceae) compreende cerca de 200 espécies, 30 delas ocorrendo no Brasil. Nesta dissertação, é realizada a revisão taxonômica do clado tetraploide-brasileiro de Drosera, compreendendo 17 espécies e uma variedade. São apresentados e discutidos dados sobre morfologia, ecologia, distribuição geográfica e status de conservação para estas espécies, com mapas de distribuição, ilustrações, fotografias e tabelas comparativas. Os complexos D. graminifolia, D. Montana e D. villosa são discutidos nos capítulos 1, 2 e 3, respectivamente. Além disso, essas três espécies são recircunscritas com base em evidências morfológicas e de sua ecologia. Drosera ascendens, D. spiralis, D. tomentosa e suas duas variedades são restabelecidas, e D. villosa var. latifólia é elevada ao status específico. Drosera chrysolepis é lectotipificada e três novas espécies são descritas. Drosera camporupestris, D. grantsaui, D. graomogolensis, D. quartzicola, D. tentaculata e D. schwackei também pertencem ao clado e são aqui tratadas. Na seção Taxonomia, é apresentada uma chave de identificação e, no anexo II, uma lista com todos os táxons de Drosera ocorrentes no Brasil e aqui aceitos / The genus Drosera (Droseraceae) comprises around 200 species, 30 occurring in Brazil. In this dissertation is carried out the taxonomic revision of the Brazilian-tetraploid clade of Drosera, comprising 17 species and a variety. Here are presented and discussed data on the morphology, ecology, geographic distribution, and conservation status for these species, with distribution maps, drawings, photographs, and comparative tables. The complexes D. graminifolia, D. Montana, and D. villosa are discussed in chapters 1, 2, and 3, respectively. These three species are recircumscribed based on of morphological and ecological evidences. Drosera ascendens, D. spiralis, D. tomentosa and its two varieties are reestablished, and D. villosa var. latifolia is raised to specific rank. Drosera chrysolepis is lectotypified and three new species are described. Drosera camporupestris, D. grantsaui, D. graomogolensis, D. quartzicola, D. tentaculata, and D. schwackei also belong to this clade and are here treated. In section Taxonomy it is presented a dicotomic key and, in appendix II, a list with all Drosera taxa occurring in Brazil here accepted