Orientador: Neuza Diniz da Cruz / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-15T15:38:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Forni-Martins_ElianaRegina_M.pdf: 7931862 bytes, checksum: b217d1734f457dc0317901d167c18911 (MD5) Previous issue date: 1984 / Resumo: Foram realizados estudos citotaxonômicos em dez espécie do complexo Phaseolus-Vigna-Macroptilium (Leguminosae Papilionoideae). As espécies estudadas foram : M. atropurpureum, M. bracteatum, M. erythroloma, M. lathyroides, P. atropurpureum, M. bracteatum, M. erythroloma, M. lathyroides, P. coccineus, P. lunatus, P. vulgaris, V. peduncularis, V. radiota e V. unguiculata. Ideogramas, cariótipos e fórmulas cariotípicas, comprimento total de cromatina (CTC) e índice TF%, que exprime o grau de simetria cariotípica, são apresentados para cada espécie estudada. Os resultados obtidos mostraram discordância com dados de literatura, esta bastante controvertida. As possíveis causas para essas discrepâncias são discutidas, com o objetivo de explicar as diferenças observadas. Foram calculados o desvio-padrão e o coeficiente de variação, tanto para comprimento cromossômico como para índice centromérico de cada par cromossômico de cada espécie estudada, objetivando avaliar o grau de variação nos resultados obtidos. Considerando todos os valores, apenas 6,8% mostraram coeficientes de variação que podem ser considerados altos (entre 20,1% e 30%); a maior parte mostrou valores intermediários (entre 10,1% a 20%). Todos os cariótipos mostraram o mesmo número (2n=22) e semelhança na forma e tamanho de cromossomos. Contudo, existiu alguma tendência a agrupar espécies de um mesmo gênero e de individualizar cada gênero estudado através da comparação de dados de CTC e TF%... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Cytotaxonoic studies were carried out on tem species of the Phaseolus-Vigna-Macroptilium complex (Leguminosae Papilionoideae). The species studies were: M. atropurpureum, M. bracteatum, M. erythroloma, M. lathyroides, P. coccineus, P. lunatus, P. vulgaris, V. peduncularis, V. radiata and V. unguiculata. Ideogramas karyotypes and karyotype formulae, total chromatin length (TCL) and TF% index, which express the degree of karyotype symmetry, are presented for each species studied. The results obtained showed no agreement with the literature, which is very confused. The possible causes of those discrepancies are dicussed, aiming to explain the differences observed. The standard deviation and coefficient of variation of both centromeric index and chromosome length of each chromosome pair were calculated in each species as an estimulate of variation. Considering all the data, only 6,8% showed a coefficient of variation which can be considered high (between 20,1 to 30%); the majority showed intermediate values (between 10,1 to 20%). All the karyotypes showed the same number (2n=22) and similarities on both chromosome shape and length. However there was some tendency for species of the same genus to group together it was possible to characterize each genus studied through the comparison of TCL and TF% figures... Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Mestrado / Mestre em Biologia Vegetal

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:04:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4475_1.pdf: 1695025 bytes, checksum: 4742bf368d4d996b894978b7670582c3 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2000 / Acrostichum aureum L. e A. danaeifolium Langsd. & Fisch. são espécies morfologicamente similares que crescem em simpatria em comunidades de mangue. Com o objetivo de avaliar as diferenças citológicas entre ambas as espécies, foram analisados seus cariótipos através da análise cromossômica convencional, da coloração com os fluorocromos CMA e DAPI, da coloração com nitrato de prata e da hibridização in situ utilizando como sonda o DNAr 45S. Ambas as espécies mostraram o mesmo número cromossômico (2n=60) mas diferiram na morfologia cromossômica. Acrostichum aureum apresentou a fórmula cariotípica 2m+4sm+38st+16t e A. danaeifolium 2m+10sm+42st+6t. O padrão de bandas CMA + mostrou somente quatro bandas terminais em A. danaeifolium e seis em A. aureum. Bandas DAPI+ não foram encontradas. O número máximo de nucléolo por núcleo interfásico e o número de sítios de DNAr 45S foram compatíveis com o número de bandas CMA+ : quatro em A. danaeifolium e seis em A. aureum. Todos os indivíduos analisados meioticamente mostraram pareamento cromossômico normal (30II) e segregação. Esses resultados sugerem que essas espécies mostrem pequenas, mas bem definidas, diferenças cariotípicas e apesar de suas similaridades morfológicas e ecológicas, elas parecem ser reprodutivamente isoladas

Orientador: Eliana Regina Forni Martins / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-04T01:30:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mansanares_MarianaEsteves_D.pdf: 1785636 bytes, checksum: 8a6d2b6535290f7c8fa33138c901fd02 (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: A subtribo Lychnophorinae abrange nove gêneros, encontrados nos campos rupestres nos estados de Minas Gerais, Bahia e Goiás, tendo, a maioria das espécies, alto grau de endemismo. Um desses gêneros é Lychnophora, o qual apresenta discordância entre diferentes autores quanto ao seu limite e número de espécies (desde 68 a apenas 11). Essa diferença de interpretação baseia-se na sinonimização e na transferência de diversas espécies para gêneros próximos, como Lychnophoriopsis e Paralychnophora. Além disso, há dificuldades na delimitação de outros gêneros da subtribo Lychnophorinae, como Minasia, Proteopsis e Heterocoma. Foi iniciado o estudo citotaxonômico de espécies de Lychnophora e de outros gêneros da subtribo, objetivando a análise de características cromossômicas que pudessem ser úteis ao entendimento taxonômico do grupo como um todo. Foram determinados números cromossômicos de cerca de 49 espécies, constatando-se 2n=34, 36 ou 38. Esses números cromossômicos distribuem-se entre espécies de diversas seções de Lychnophora e também nos gêneros próximos, de forma que não podem ser usados como caracteres distintivos nos níveis intergenéricos e infragenéricos. Entretanto, números cromossômicos são muito importantes na diferenciação de algumas espécies de Lychnophora, cujos limites taxonômicos têm sido questionados. Por exemplo, no taxon sinonimizado como L. ericoides, diferentes números cromossômicos foram encontrados, sugerindo a validade das antigas espécies: 2n=34 para L. ericoides e L. pinaster, 2n=36 para L. gardneri e 2n=38 para L. pseudovillosissima. Outros caracteres cariotípicos foram analisados em sete espécies da subtribo, como tamanho e morfologia dos cromossomos, evidenciando uma relativa constância. Os cromossomos são pequenos, medindo entre 1,10 e 2,58?m, e são predominantemente metacêntricos, embora alguns submetacêntricos também tenham sido observados em algumas espécies. Estudos envolvendo a hibridação in situ, com a sonda de rDNA 45S, têm demonstrado grande diversidade nos resultados, com variação de dois a dez sítios de hibridação entre espécies. Assim, a comparação desses marcadores cromossômicos poderá trazer novos subsídios para a taxonomia de Lychnophora e de gêneros de Lychnophorinae. Adicionalmente, a análise da microsporogênese revelou a existência de algumas anormalidades meióticas em algumas espécies / Abstract: The subtribe Lychnophorinae is composed by 9 genera, most of them endemic to the Brazilian ¿campos rupestres¿ of Minas Gerais, Bahia and Goiás, with high degree of endemism in many species. In one genus, Lychnophora, there is disagreement between different authors regarding the species limit and number (from 11 to 68). This interpretation difference is based in sinonimization and in the transference of several species to closely related genera, like Lychnophoriopsis and Paralychnophora. Besides, there are difficulties in the delimitation of other genera of Lychnophorinae, like Minasia, Proteopsis and Heterocoma. The cytotaxonomic study of species of Lychnophora and of other genera of the subtribe was made, aiming out at increasing the knowledge of chromosome characteristics that could be useful to the understanding of the taxonomy of the group as a whole. Chromosome numbers of about 49 species were determined, with 2n=34, 36 or 38. These chromosome numbers were distributed among species of several sections of Lychnophora and also closely related genera, so that they can't be used as distinctive characters in the intergeneric and infrageneric levels below section level. However, chromosome numbers were very important for the differentiation of some species of Lychnophora, wich taxonomic limits have been questioned. For example, in L. ericoides, in wich some species were sinonimized, different chromosome numbers were found, suggesting the validity of the previous species: 2n=34 to L. ericoides and L. pinaster, 2n=36 to L. gardneri and 2n=38 to L. pseudovillosissima. Other karyotype characters were analyzed in seven species of the subtribe, like chromosomes size and morphology, showing constancy of these characters. The chromosomes are small, with 1,0 to 2,58 ?m, and they are mainly metacentric, however some submetacentrics were observed. Studies involving DNA in situ hybridization, with 45S rDNA, have demonstrated great diversity between species, with variation from two to ten hybridization sites. Thus, comparison of these chromosome molecular markers can bring new subsidies for the taxonomy of Lychnophora and Lychnophorinae. Microsporogenesis analysis revealed the existence of meiotic abnormalities in some species / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutor em Biologia Vegetal

Orientador: Eliana Regina Forni Martins / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-11T11:47:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oliveira_VanessaMancusode_M.pdf: 2101182 bytes, checksum: 4b6aba0f8011aa1dbf7656da7b98141b (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: O gênero Vernonia é o maior da tribo Vernonieae (Asteraceae), possuindo mais de 1.000 espécies. O Brasil é o maior centro de diversidade das espécies do Novo Mundo deste gênero. As subdivisões de Vernonia têm sido de difícil circunscrição devido ao seu tamanho, que acomoda muitas variações e paralelismos. Recentemente, este gênero foi segregado em outros 22, e o mesmo ficou restrito apenas aos representantes da América do Norte. Entretanto, essa mudança não foi aceita por alguns autores. O objetivo deste trabalho foi subsidiar a proposta sobre a segregação de Vernonia em gêneros menores (sensu ROBINSON) ou da manutenção de sua integridade (sensu BAKER) mediante a comparação de cariótipo. No total, foram estudadas 14 espécies de Vernonia. Oito delas, pertencentes à seção Lepidaploa, correspondentes às subseções Axilliflorae, Macrocephalae, Oligocephalae, Paniculatae e Scorpioideae foram estudadas através da técnica de Giemsa. As espécies foram coletadas em áreas de cerrado e de campo rupestre e em ambiente perturbado, nos Estados de São Paulo, Minas Gerais e Goiás. Foram realizadas contagens cromossômicas nestas mesma espécies, que variaram de 2n=20 a 2n=60 e, elaborados cariótipos, verificando-se o predomínio de cromossomos metacêntricos, e alguns submetacêntricos. O tamanho dos cromossomos variou de 0,73 a 3,5µm, o tamanho total de cromatina (CTC) de 23,5 a 44,9 µm e, o índice de assimetria TF% de 32,2 a 45,9. O índice de assimetria intracromossômica (A1) variou de 0,30 a 0,85, enquanto o índice de assimetria intercromossômica (A2) de 0,14 a 0,40. Vernonia rubriramea foi a espécie que mostrou ter cariótipo mais simétrico. Também foi elaborada uma coletânea dos números cromossômicos das espécies de Vernonia, incluindo os resultados obtidos e os disponíveis em literatura, como publicações de revisão e artigos específicos. Foram aplicadas as técnicas de bandamentos AgNOR e CMA/DA/DAPI e a técnica de FISH com a seqüência de DNAr 45S em algumas espécies de Vernonia, incluindo também algumas que tiveram seu cariótipo elaborado com técnicas de coloração convencional (Giemsa). De modo geral, as espécies apresentaram dois sítios de DNAr 45S terminais, sempre localizados no braço curto do cromossomo, com exceção de V. condensata e V. geminata, com quatro, e V. bardanoides, com seis sítios. A hibridação in situ evidenciou, na população de V. geminata coletada em Assis, um par de sítios de DNAr 45S centromérico, e na população coletada em Analândia, dois sítios apareceram em cromossomos B. Foram observados até seis cromossomos Bs nesta última população. Essa foi a única espécie que apresentou cromossomos extranumerários. Os bandamentos CMA/DA/DAPI e AgNOR evidenciaram em algumas espécies, um par de bandas CMA+ e um par de bandas NOR, sempre localizadas na região terminal do braço curto dos cromossomos, com exceção de V. platensis e V. scorpioides, que apresentaram três pares de bandas CMA+. Os dados cariotípicos obtidos no presente trabalho e mais dados em literatura não são suficientes para apoiar conclusivamente qualquer das propostas taxonômicas vigentes para Vernonia, devido à inexistência de um padrão cariotípico característico/distintivo para cada grupo taxonômico, ou seja, para suas seções e subseções (sensu BAKER) ou para os novos gêneros (sensu ROBINSON), considerados a partir de seu desmembramento. No entanto, até o momento, parece existir uma tênue relação com a conceituação de ROBINSON (1999a) para os gêneros Lessingianthus, Vernonanthura, e Chrysolaena, com os números cromossômicos obtidos. Diante da não disponibilidade de sondas funcionais com as seqüências de DNAr 5S e DNA telomérico, tentou-se a obtenção de sondas específicas para Vernonia mediante a técnica de PCR com primers específicos. Obteve-se sucesso apenas na amplificação do DNA telomérico com os primers de Arabidopsis (Tel-1 e Tel-2) / Abstract: The genus Vernonia is the largest of the tribe Vernonieae (Asteraceae), comprising more than 1.000 species. The greatest center of diversity of this genus from the New World is in Brazil. The subdivisions of Vernonia have been a difficult constituency because of its size, which accommodates many variations and parallels. Recently, this genus was dismembered into 22 genera and Vernonia was restricted to North America. However, most of the modifications proposed were not accepted for others workers in this field. In order to assess the validity of maintaining this genus (sensu BAKER) or dividing it into several lesser genera (sensu ROBINSON), we described a mitotic analyses (Giemsa technique) of eight species of Vernonia, belonging to subsections Axilliflorae, Macrocephalae, Oligocephalae, Paniculatae and Scorpioideae of the section Lepidaploa. Specimens were collected in ¿cerrado¿, rupiculous and disturbed areas, in the states of Sao Paulo, Minas Gerais and Goiás. Chromosome numbers (2n=20 to 2n=60) and karyotypes were analyzed, with predominance of metacentric and some submetacentric chromosomes. The chromosomes size varied from 0.73 to 3.5µm, the total chromatin length (TCL) ranged from 23.5 to 44.9µm, and the asymmetry index TF% ranged from 32.2 to 45.9%. The intrachromosomal asymmetry index (A1) varied from 0.30 to 0.85, while the interchromosomal asymmetry index (A2) ranged from 0.14 to 0.40. The species V. rubriramea had the most symmetrical karyotype. We prepared a compilation of the chromosome numbers of species of Vernonia, including the results obtained here and the available literature, as publications of review and specific articles. We applied AgNOR and CMA/DA/DAPI banding and FISH with the sequence of rDNA 45S in some species of Vernonia, including some that had their karyotype analyzed with the Giemsa technique. The chromosome number ranged from 2n = 20 to 60, but most frequent chromosomal numbers were 2n = 32 and 34. Generally, the species showed two terminals sites of rDNA 45S, always located on the short arm of chromosome, except for V. condensata and V. geminata, with four, and V. bardanoides, with six sites. The technique of FISH showed in the population of V. geminata collected in Assis, one pair of centromeric sites of rDNA 45S, and the population collected in Analândia, two sites appeared in B chromosomes. That was the only species that showed extra numerous chromosomes. The CMA/DA/DAPI and AgNOR banding neither evidenced in some species, one pair of CMA+ bands and one pair of NOR bands, always located in the terminal region of the short arm of chromosome, except for V. platensis and V. scorpioides, which had three pairs of CMA+ bands. Despite of the little representativity of the samples, the karyotypic characters obtained in this study and in literature did not allow conclusive support to the taxonomic proposes to Vernonia, due to the inexistence of a distinctive/characteristic karyotypic pattern for each taxonomic group, which means, sections and subsections (sensu BAKER) or new genera (sensu ROBINSON). Nevertheless, the available data indicate only a tenuous relationship between the chromosome numbers observed here and reported in the literature compared to the taxonomic reorganization of the genera Lessingianthus, Vernonanthura and Chrysolaena. Due to the non-availability of functional probes with the rDNA 5S and telomeric sequences, we tried to obtain probes specific for Vernonia with the PCR technique with specific primers. We had sucess only in the DNA amplification with telomeric primers of Arabidopsis (Tel-1 and Tel-2) / Mestrado / Doutor em Biologia Vegetal

Submitted by Katiane Souza (katyane.souza@gmail.com) on 2016-06-05T18:18:33Z No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 2456208 bytes, checksum: c8d4f023af4b75f22897ab5d9a8cb347 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-05T18:18:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 2456208 bytes, checksum: c8d4f023af4b75f22897ab5d9a8cb347 (MD5) Previous issue date: 2012-06-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Were studied with CMA3 and DAPI fluorochrome staining techniques and in situ hybridization with 45S and 5S rDNA probes, representatives of the subfamilies Pesreskioideae, Opuntioideae and Cactoideae, 28 species of 14 genera, occurring mainly in the Northeast of Brazil, aiming to identify the heterochromatin distribution and location of rDNA sites in these species and their taxonomic implications. In the subfamilies Pereskioideae and Opuntioideae, chromosome numbers range from 2n = 22 in Pereskia aculeata, P. bahiensis, P. grandiflora (Pereskioideae), Brasilopuntia brasiliensis, Tacinga funalis and T. palmadora, 2n = 44 O. dillenii and 2n = 88 in O. ficus-indica (Opuntioideae). All species presented symmetric karyotypes and small chromosomes, with average sizes range from 1.94 μm in O. dillenii to 3.17 μm in P. aculeata. A pair of terminal CMA+ bands corresponding to the NORs occurred in all cytotypes in diploid and also O. dillenii (tetraploid), except in O. ficus-indica (octoploid) that exhibited two pairs of terminal bands. Additional CMA bands were observed in the interstitial region in the long arm of B. brasiliensis chromosome pair, while a variable number of pericentromeric bands were seen in three chromosome pairs in O. dillenii and in the majority of chromosomes in O. ficus-indica. The sites of 45S rDNA bands corresponded to the terminal CMA, while 5S sites were located in the interstitial region of a chromosome pair in P. aculeata, P. bahiensis and P. grandiflora, as in B. brasiliensis the 5S site was subterminal. In the subfamily Cactoideae, there were no previous chromosome records for Arrojadoa, Micrathocereus and Pilosocereus genera, as in Melocactus azureus, M. levitestatus, Stephanocereus luetzelburgii, Discocactus zehntneri, Hylocereus setaceus and Harrisia adscendens. In Arrojadoa, data for chromosome CMA+ banding pattern does not support inclusion of A. aurespina in A. rodantha limits. In Melocactus and Pilosocereus genera, there was a wide numeric variation of CMA+ pericentromeric bands, while CMA+ bands corresponding to the NORs were generally corresponding to the ploidy level. In species where 45S rDNA sites were mapped, there was a complete correspondence with the terminal CMA+ bands, and there were no additional 45S sites. Moreover, 5S sites were extremely variable in number and chromosomal location. 5S sites adjacent to 45S sites were characteristic of all Pilosocereus species analyzed. The variability in the number and distribution of CMA+ bands and 5S sites location were important cytotaxonomic characteristics in the studied taxa delimitation. / Foram estudadas através do bandeamento com os fluorocromos CMA3 e DAPI e hibridização in situ com sondas de DNAr 45S e 5S, representantes das subfamílias Pesreskioideae, Opuntioideae e Cactoideae, em 28 espécies de 14 gêneros, ocorrentes principalmente no Nordeste do Brasil, objetivando identificar a distribuição da heterocromatina e a localização dos sítios de DNAr nessas espéciese suas implicações taxonômicas. Para as subfamílias Pereskioideae e Opuntioideae, os números cromossômicos variaram de 2n = 22 em Pereskia aculeata, P. bahiensis, P. grandiflora (Pereskioideae), Brasilopuntia brasiliensis, Tacinga funalis e T. palmadora; 2n = 44 em O. dillenii e 2n = 88 em O. ficus-indica (Opuntioideae). Todas as espécies apresentaram cariótipos simétricos e cromossomos pequenos, com tamanhos médios variando de 1,94μm em O. dillenii a 3,17μm em P. aculeata. Um par de bandas CMA+ terminais correspondentes as RONs ocorreu em todos os citotipos diplóides e em O. dillenii (tetraplóide), exceto em O. ficus-indica (octaplóide) que exibiu dois pares de bandas terminais. Bandas CMA adicionais foram observadas na região intersticial do braço longo de um par cromossômico de B. brasiliensis, enquanto um número variável de bandas pericentroméricas foi visualizado em três pares cromossômicos de O. dillenii e na maioria dos cromossmos de O. ficus-indica. Os sítios de DNAr 45S corresponderam às bandas CMA terminais, enquanto os sítios 5S foram localizados na região intersticial de um par cromossômico de P. aculeata, P. bahiensis e P. grandiflora, enquanto em B. brasiliensis o sítio 5S foi subterminal. Na subfamília Cactoideae, não havia registros cromossômicos prévios para os gêneros Arrojadoa, Micrathocereus e Pilosocereus, nem para as espécies Melocactus azureus, M. levitestatus, Stephanocereus luetzelburgii, Discocactus zehntneri, Harrisia adscendens e Hylocereus setaceus. Em Arrojadoa, os dados cromossômicos para o padrão de bandas CMA+ não suportam a inclusão de A. aurespina nos limites de A. rodantha. Para os gêneros Melocactus e Pilosocereus, ocorreu uma ampla variação no número de bandas CMA+ pericentroméricas, enquanto as bandas CMA+ correspondentes as RONs, em geral foram correspondentes aos níveis de ploidia. Nas espécies onde os sítios de DNAr 45S foram mapeadas, houve total correspondência com as bandas CMA+ terminais, não tendo sido observados sítios 45S adicionais. Por outro lado, os sítios 5S foram bastante variáveis em número e localização cromossômica. Sítios 5S adjacentes aos sítios 45S foram característicos de todas as espécies analisadas de Pilosocereus. A variabilidade no número e distribuição de bandas CMA+ e localização de sítios 5S foram características citotaxonômicas importantes na delimitação dos táxons estudados.

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-02-11T18:56:57Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Aline Almeida Mattos.pdf: 3417727 bytes, checksum: c5c27457db3dabcfb4b55c7e2378496e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-11T18:56:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Aline Almeida Mattos.pdf: 3417727 bytes, checksum: c5c27457db3dabcfb4b55c7e2378496e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2007-10-24 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The species Simulium guianense s.l. Wise is incriminated as the main vector of Onchocerca volvulus Leuckart, which is the ethiologic agent of oncocerciasis in the Amazonian focus of the disease, located in the northern portion of South América. The objectives of this study were to analyze different populations of this species using polythene chromosomes and mitochondrial gene sequences of the COI region to evaluate the relationships among these populations. The specimens for the cytotaxonomic study were collected in the Brazilian states of Amazonas, São Paulo and Goiás (Rio Ponte de Pedra) and for the molecular study the specimens were collected in the states of Amazonas, Amapá, Goiás (Rios Ponte de Pedra and Verdão), Maranhão and Roraima (one population from the Homoxi oncocerciasis focus and two from sites outside of the focus: Caroebe and Surumu). The polythene chromosomes from the analyzed populations were compared with a standard map that had been previously established for this species. The cytological analysis indicates the presence of polymorphic inversion in the Amazonas and São Paulo populations; the population from Goiás (Rio Ponte de Pedras) had two fixed inversions. Comparing 702 bp from the COI mithochondrial gene in the nine studied populations, a considerable number of polymorphic sites were observed, thereby allowing population and phylogeographic analyses to be undertaken. A representative cladogram was constructed to analyse the relationships among the observed haplotypes. The cladogram suggests that the populations from the northern region of Brazil (Amapá, Amazonas and the Caroebe site in Roraima) share one haplotype, while the populations from the Amazonian focus (Homoxi site in Roraima) is most closely related to the population from the Surumu site in Roraima, as these populations share a common haplotype. The populations from São Paulo and Goiás, Rio Verdão (from the southeast and centro-west regions of Brazil, respectively) have high haplotypic variability, each specimen being represented by one haplotype. The population from the Rio Ponte de Pedra site in Goiás did not share haplotypes with any of the other populations studied, including the population from the Rio Verdão site in Goiás, located approximately 50 Km away in the same hydrological basin. The populations from Amazonas and the Caroebe site in Roraima had negative values of F ST, suggesting that they exchange alleles freely and do not show any genetic structure. The population from Maranhão is well sructured in relation to the others with a low number of migrants; this population appears to be derived from the population in São Paulo. The NJ phylogeographic tree constructed using the F ST values indicates the division of the analyzed populations into two groups separated by the Amazon River. The northern group is represented by the populations in Amapá, Roraima (Surumu, Homoxi and Caroebe) and Amazonas, while the southern group is represented by Maranhão, the Rio Verdão site in Goiás, and São Paulo. The results obtained by cytological and molecular techniques suggested that the S. guianense s.l. populations analyzed, in general, do not constitute a species complex, as has been suggested by some authors, even though the populations had high genetic variability. The only exception is the population from Goiás (Rio Ponte de Pedra), which probably represents a species that is new to science. / A espécie Simulium guianense s.l. Wise é incriminada como principal vetor de Onchocerca volvulus Leuckart, causadora da oncocercose no foco Amazônico, localizado no norte da América do Sul. Os objetivos do presente estudo foram analisar diferentes populações dessa espécie utilizando cromossomos politênicos e seqüências da região do gene mitocondrial COI, para avaliar as relações entre essas diferentes populações. Para a análise cromossômica, os espécimes foram coletados nos estados do Amazonas, São Paulo e Goiás (Rio Ponte de Pedra) e para a análise molecular foram coletados nos estados do Amazonas, Amapá, Goiás (Rios Ponte de Pedra e Verdão), Maranhão e Roraima (uma população na área do foco de oncocercose-Homoxi e, duas fora da área do foco, Caroebe e Surumu). Os cromossomos politênicos das populações analisadas foram comparados com mapas estabelecidos anteriormente para essa espécie. As análises citológicas do padrão de bandas dos cromossomos politênicos mostraram inversões polimórficas, na condição heterozigota nas populações do Amazonas e São Paulo, e a de Goiás (Rio Ponte de Pedras) apresentaram duas inversões fixas. Comparando 702 pb da região do gene mitocondrial COI das nove populações estudadas, um valor considerável de sítios polimórficos foram observados, permitindo estudos populacionais e filogeográficos. Um cladograma representativo foi construído a fim de relacionar os haplótipos detectados, permitindo observar que as populações do norte, Amapá, Amazonas e RR-Caroebe compartilham um mesmo haplótipo, enquanto a área do foco Amazônico (RR-Homoxi) está mais relacionada com as populações de RR-Surumu, compartilhando um haplótipo em comum. As populações de São Paulo e Goiás, Rio Verdão (das regiões sudeste e centro-oeste, respectivamente) apresentam elevada variabilidade haplotípica, onde cada indivíduo é representado por um haplótipo. A população do Rio Ponte de Pedra, de Goiás não compartilhou haplótipos com as outras populações estudadas, nem mesmo com a do Rio Verdão, também em Goiás, localizada a aproximadamente 50 Km de distância. As populações do Amazonas e RR-Caroebe apresentaram valores negativos de F ST, sugerindo que elas, trocam alelos livremente, representando uma população sem estrutura genética. A população do Maranhão, que se mostrou bem estruturada em relação às outras, tem baixo número de migrantes, mas parece ser derivada da população de São Paulo. Usando os valores de F ST uma árvore filogenética de NJ foi gerada e pode-se observar uma separação entre os grupos ao norte da calha do Rio Amazonas, representados por indivíduos do Amapá, RR (Surumu, Homoxi e Caroebe) e Amazonas, e outro ao sul da calha do Rio Amazonas (Maranhão, GO-Rio Verdão e São Paulo). Os resultados obtidos, utilizando técnicas citogenéticas e moleculares, sugerem que as populações de S. guianense s.l. analisadas, no geral, não fazem parte de um complexo de espécie, como sugerido por alguns autores, apesar de apresentar acentuada variabilidade genética. A exceção é a população de Goiás (Rio Ponte de Pedra) que, provavelmente, representa uma nova espécie para a Ciência.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tatiana Cristina Machado.pdf: 1197786 bytes, checksum: 5f8b2181ba411a99fe6d77d54ddc3784 (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The Characidium genus shows a broad karyotypic variability regarding the origin and diversification of the sex chromosomes, intra-and interindividual variation of B chromosomes and location of sites and number of NORs chromosomes bearing. Variations in the sex chromosomes Z and W morphology provide an excellent model to study chromosomal differentiation associated with a potential mechanism for reproductive isolation. In this study, we obtained a probe of the sex chromosome W of Characidium gomesi by chromosome microdissection , amplification by DOP-PCR and conducting comparative chromosome painting of W probe together with the 18S rDNA probe in some populations / species: C. gomesi of Rio Verde (PR), C. gomesi of Rio Grande (SP), C. gomesi of Ribeirão Minhoca (MG), C. lauroi of the Rio Grande (SP), C. zebra of Passa Cinco (SP). The conventional analysis of the populations of C. gomesi from rio Verde and ribeirão Minhoca, not yet described, showed the diploid number with 50 chromosomes and the presence of sex chromosome ZZ / ZW in advanced stages of differentiation. With the use of dual FISH, W and 18S rDNA probes, in populations of C. gomesi, C. lauroi and C. zebra was hypothesized a pathway of differentiation of sex chromosomes in the group. In this possible pathway, transposition / translocation of the NORs sites to proto sex chromosome was the first event this differentiation. Thereafter, the heterochromatization of other repetitive DNAs, not present in NORs site, acted on the alteration of the chromosomes Z and W morphologies. The heterochromatization of W chromosome wasintense in C. gomesi and C. alipioi species so the NOR siteswere again transposed to an autosomal condition. Was discussed also the biogeographic barriers help to differentiation of sex chromosomes in Characidium promoting reproductive isolation and speciation of the group. / O gênero Characidium apresenta alta variabilidade cariotípica no que diz respeito a origem e diversificação dos cromossomos sexuais, variação intra e interindividual de cromossomos B e localização e número de sítios de RONs. Variações populacionais na morfologia dos cromossomos sexuais Z e W propiciam excelente modelo de estudo de variação cromossômica associada a mecanismo em potencial para o isolamento reprodutivo. Neste estudo, foi obtida sonda do cromossomo sexual W de Characidium gomesi por microdissecção cromossômica posterior ao bandamento C, amplificação por DOP-PCR e realização de pintura cromossômica comparativa desta sonda W juntamente com o rDNA 18S em algumas populações/espécies do gênero: C. gomesi do rio Verde (PR), C. gomesi do rio Grande (SP), C. gomesi do ribeirão Minhoca (MG), C. lauroi do ribeirão Grande (SP), C. zebra do rio Passa Cinco (SP). A análise convencional das populações de C. gomesi do ribeirão Minhoca e rio Verde, ainda não descritas, demonstraram o número diplóide de 50 cromossomos e presença de cromossomos sexuais ZZ/ZW em estágio avançado de diferenciação. Com a utilização da dupla FISH sonda W e rDNA 18S nas populações de C. gomesi, C. lauroi e C. zebra foi possível hipotetizar uma via de diferenciação dos cromossomos sexuais no grupo. Nessa possível via, a transposição/translocação da RON para um proto cromossomo sexual foi um primeiro evento da diferenciação. Posteriormente, a heterocromatinização de outros DNAs repetitivos não presentes na RON atuou na alteração das morfologias dos cromossomos ZW. Nas espécies C. gomesi e C. alipioi a heterocromatinização do W é intensa, a RON sofreu nova transposição e é observada em condição autossômica. Ainda, foi discutido o isolamento biogeográfico e a diferenciação dos cromossomos sexuais em Characidium com eventos essenciais ao isolamento reprodutivo e especiação do grupo.

Oligoryzomys é o gênero mais especioso da tribo Oryzomyini e está amplamente distribuído na região Neotropical. O objetivo deste trabalho é contribuir para a citotaxonomia e investigar a evolução cromossômica no gênero. Foram analisados 117 exemplares pertencentes às espécies: O. flavescens (2n=64-66, NF=66), O. fornesi (2n=62, NF=64), O. microtis (2n=64, NF=64), O. moojeni (2n=70, NF=72), O. nigripes (2n=62, NF=78-82), O. stramineus (2n=52, NF=68) e Oligoryzomys sp. A (2n=70, NF=72). As seis primeiras possuem cariótipos espécie-específicos e, dessa forma, reiteramos a importância da informação citogenética para a citotaxonomia. A pintura cromossômica comparativa (Zoo-FISH) com sondas de O. moojeni revelou hibridação em 29 segmentos autossômicos em O. fornesi; 30 em O. microtis; 31 em O. nigripes; e 32 em O. rupestris e Oligoryzomys sp. 2. Os resultados mostraram uma extensa reorganização genômica na evolução cromossômica do gênero, decorrente de fissões, fusões em tandem, rearranjos Robertsonianos e perda/inativação, surgimento ou reposicionamento de centrômero. / Oligoryzomys is the most specious genus within the tribe Oryzomyini and it is distributed throughout Neotropical region. This work aims to contribute to citotaxonomy and to investigate the chromosomal evolution of the genus. A total of 117 individuals were cytogenetically analysed, and they belong to the species: O. flavescens (2n=64-66, FN=66), O. fornesi (2n=62, FN=64), O. microtis (2n=64, FN=64), O. moojeni (2n=70, FN=72), O. nigripes (2n=62, FN=78-82), O. stramineus (2n=52, FN=68), and Oligoryzomys sp. A (2n=70, FN=72). The first six species possess species-specific karyotypes, and therefore we emphasize the importance of cytogenetic studies for citotaxonomy. Comparative chromosome painting (Zoo-FISH) with O. moojeni probes hybridized to 29 segments on metaphases of O. fornesi, 30 on O. microtis, 31 on O. nigripes, and 32 on O. rupestris and Oligoryzomys sp. 2. The results showed an extensive genomic reshuffling, due to fissions, tandem and Robertsonian fusions, loss/inactivation or repositioning of centromeres.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-26Bitstream added on 2014-06-13T20:10:17Z : No. of bitstreams: 1 catroli_gf_me_rcla.pdf: 1485218 bytes, checksum: 9a78fa3bdfa0dc448f03c9b7e0511773 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A família Hylidae passou nos últimos anos por extensas modificações na taxonomia e sistemática, realizadas com base principalmente em dados moleculares e com pouca ou nenhuma contribuição de informações citogenéticas. Como conseqüência, alguns novos gêneros de Hylidae foram criados, sendo esse o caso de Bokermannohyla, atualmente o terceiro mais abundante dentro de Cophomantini, uma das quatro tribos da subfamília Hylinae. Levando-se em conta que os dados citogenéticos no gênero são muito escassos, limitados a apenas três das 27 espécies, análises cariotípicas foram realizadas em B. circumdata, B. hylax e Bokermannohyla sp., do grupo de B. circumdata, e em B. alvarengai, B. ibitiguara e B. saxicola, do grupo de B. pseudopseudis. As seis espécies compartilham um cariótipo similar com 2n=24 e NF=48. Nas espécies do grupo de B. circumdata, as Ag-RON estão localizadas nos braços longos dos cromossomos do par 11, enquanto nas espécies do grupo de B. pseudopseudis, esse marcador citológico está nos braços curtos dos cromossomos do par 4 de B. alvarengai e nos braços longos dos cromossomos dos pares 1 e 11 de B. ibitiguara e B. saxicola, respectivamente. O padrão de bandamento C obtido em todas as espécies, com exceção de B. hylax, é predominantemente centromérico, mas algumas delas mostraram bandas pericentromérica, intersticial ou terminal, assim como banda C coincidente com o sítio da Ag-RON. Os cromossomos de Bokermannohyla sp., B. ibitiguara e B. saxicola não mostraram nenhuma região repetitiva rica em bases AT com a coloração pelo DAPI, mas a banda C telomérica dos cromossomos do par 10 de B. circumdata eram brilhantes. Com o fluorocromo GC-específico CMA3, a região centromérica dos cromossomos das quatro espécies aparece fluorescente, assim como os sítios da RON. Padrões de bandas de replicação foram obtidos em B. alvarengai e B. circumdata... / In the last years, the family Hylidae went through extensive taxonomic and systematic revisions, based mostly on molecular data with few or no contribution of cytogenetic information. As a result, some new hylid genera were erected, and this is the case of Bokermannohyla, now the third most speciose genus within Cophomantini, one of the four tribes of the subfamily Hylinae. Taking into account that cytogenetic data on the genus are very scanty, restricted to only three of its 27 species, karyotypic analyses were carried out in B. circumdata, B. hylax and Bokermannohyla sp., assigned to the B. circumdata group, and in B. alvarengai, B. ibitiguara and B. saxicola, assigned to the B. pseudopseudis group. The six species share a similar karyotype with 2n=24 and FN=48. In the species of the B. circumdata group, Ag-NOR are located in the long arms of the chromosome pair 11, whereas in species of the B. pseudopseudis group, this cytological marker is in the long arms of the chromosome pairs 1 and 11 of B. ibitiguara and B. saxicola, respectively, and in the short arms of the chromosome pair 4 of B. alvarengai. The C banding pattern obtained in all species, except for B. hylax, is mostly centromeric, but some of them showed pericentromeric, interstitial or terminal bands, as well as C band coincident to the Ag-NOR site. The chromosomes of Bokermannohyla sp., B. ibitiguara and B. saxicola showed no special AT-rich repetitive regions with DAPI staining, but the telomeric C band of the chromosome pair 10 of B. circumdata exhibited brilliant fluorescence. With the GC-specific CMA3 fluorochrome, the centromeric region of the chromosomes of the four species appeared brightly stained, as well as the NOR sites. Replication banding patterns were obtained in B. alvarengai and B. circumdata, but in the later species the chromosomes were poorly differentiated, probably due to incomplete BrdU incorporation... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador : Eliana Regina Forni-Martins / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-06T21:09:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Costa_JuliaYamagishi_D.pdf: 4268702 bytes, checksum: 5ceb4f75d53e52eb1a73e6e26179508e (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: Dentro da família Orchidaceae, composta por cerca de 25.000 espécies, o gênero Hoffmannseggella (antiga seção Parviflorae do gênero Laelia Lindl.) é composto por espécies rupícolas, endêmicas da Cadeia do Espinhaço/MG. Estudos sugerem uma evolução rápida para o gênero, com a transição do hábito epifítico para o rupícola, mudança de polinizadores e eventos de hibridização e poliploidia como os principais mecanismos evolutivos envolvidos na origem das espécies de Hoffmannseggella. Estudos cromossômicos prévios haviam sugerido o número básico de x=20 para o gênero, com alta incidência de poliplóides. No presente trabalho, foram obtidas contagens cromossômicas para dez espécies: H. angereri n=20/2n=40, H. bradei n=20-21/2n=40, H. briegeri 2n=80, H. caulescens 2n=80, H. cinnabarina 2n=40, H. crispata n=20, H. fournieri n=20/2n=40, H. liliputana 2n=40/60, H. rupestris n=40/2n=80 e 2n=40 e H. viridiflora 2n=44. Foi observada aneussomatia em células de meristema radicular em H. briegeri (2n=80) e H. rupestris (2n=80), ocorrência de citótipos em H. rupestris (2n=40/80) e anormalidades meióticas em várias espécies, com presença de monovalentes, disjunção adiantada de bivalentes e possíveis tetravalentes nas espécies poliplóides. Por ocorrerem em sincronopatria, apresentarem alta similaridade morfológica e pelas características cromossômicas, é provável que H. viridiflora tenha se originado por aneuploidia a partir de H. bradei. Através dos procedimentos de bandamentos C, CMA/DA/DAPI e DAPI/AMD, foi possível observar grandes diferenças entre os cariótipos das espécies H. angereri, H. bradei, H. briegeri, H. caulescens, H. fournieri, H. liliputana e H. rupestris. Em geral, as espécies apresentaram grande número de bandas C (predominantemente centroméricas e subteloméricas), poucas bandas CMA/DA+ (subteloméricas), e grande variação no número de bandas DAPI/AMD+ (predominantemente teloméricas). Apenas H. bradei apresentou somente duas bandas heterocromáticas, uma CMA/DA+ DA/DAPI- e uma DAPI/AMD+ e H. briegeri apresentou polimorfismo para bandas CMA/DA/DAPI. Com relação aos sítios 45S de DNAr, os resultados foram uniformes, sendo que as espécies diplóides, com 2n=40, apresentaram dois sítios, enquanto as espécies poliplóides, com 2n=80, apresentaram 4 sítios / Abstract: Inside Orchidaceae, composed of almost 25,000 species, Hoffmannseggella H.G.Jones (previous genus Laelia Lindl., section Parviflorae) is characterized by rupiculous species, endemic to the Espinhaço Range/ MG. Previous studies suggested an explosive evolution of the genus, with transition from epiphytic to rupiculous habitat, changes on pollinator specificity and events of hibridization and polyploidy as the main evolutionary mechanisms that originated Hoffmannseggella species. Chromosome data from literature suggested the base number of x=20 for the genus, with high incidence of polyploids. The present work presents chromosome counts for ten species: H. Angereri n=20/2n=40, H. bradei n=20-21/2n=40, H. briegeri 2n=80, H. caulescens 2n=80, H. cinnabarina 2n=40, H. crispata n=20, H. fournieri n=20/2n=40, H. liliputana 2n=40/60, H. rupestris n=40/2n=80 and 2n=40 and H. viridiflora 2n=44. We observed aneussomaty on root meristematic cells of H. briegeri (2n=80) and H. rupestris (2n=80), two distinct cytotypes of H. rupestris (2n=40 and 2n=80) and meiotic abnormalities in several species, like monovalents, early disjunction of bivalents and putative tetravalents on polyploid species. Because they are found sinchronopatric, with high morphological and chromosomal similarity, we suggest that H. viridiflora (2n=44) is an aneuploid derived from H. bradei (2n=40). With C, CMA/DA/DAPI and DAPI/AMD banding techniques, we observed great differences among H. angereri, H. bradei, H. briegeri, H. caulescens, H. fournieri, H. liliputana e H. rupestris. With exception of H. bradei, that presented only two heterochromatic, one CMA/DA+ DA/DAPI- and one DAPI/AMD+ bands, all species presented a high number of C-bands (mainly centromeric and subtelomeric), few CMA/DA+ bands (subtelomeric), and great numeric differences of DAPI/AMD+ bands (mainly telomeric). We also observed, in H. briegeri, a polymorphism of CMA/DA/DAPI bands. The hybridization sites of 45S rDNA were uniform among species, with diploid species (2n=40) presenting two hybridization signals and polyploid species (2n=80) presenting four signals / Doutorado / Doutor em Biologia Vegetal