Made available in DSpace on 2014-06-12T16:28:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo2062_1.pdf: 1509610 bytes, checksum: 0d01745da91f48293497491ad7abe7cb (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A utilização de dados LIDAR para a obtenção de representações fiéis a respeito da superfície terrestre vem, nos últimos anos, consagrando-se como uma das alternativas mais viáveis e recorridas para se adquirir o MDS (Modelo Digital de Superfície) e principalmente do MDT (Modelo Digital do Terreno). Essa aceitação se justifica em especial pelo auto grau de automação na aquisição e processamento de dados, mas também se destaca a notável resolução altimétrica e planimétrica que os dados LIDAR oferecem. A obtenção automática do MDT a partir desses dados ocorre por meio de um processo conhecido por classificação, que consiste na remoção virtual dos pontos de um MDS que, em principio, não pertencem à superfície do terreno propriamente dita, mas sim às informações que se encontram sobre o solo, tais como edificações e elementos da própria natureza. Esse tema se trata de uma questão atual e ainda não concluída pelos principais centros de pesquisa nessa área do conhecimento em nível mundial. Nesse sentido, o presente trabalho, considerando aspectos visuais e numéricos, apresenta um estudo comparativo entre quatro métodos de filtragem e classificação automática de pontos que constituem o MDS oriundo dos dados LIDAR, a fim de se obter o respectivo MDT de quatro regiões distintas do Centro Politécnico da Universidade Federal do Paraná UFPR em Curitiba, Paraná Brasil. Os métodos implementados e variações propostas são pertinentes às principais linhas de pesquisa à respeito do assunto. A partir da análise dos resultados apresentados, discutidos e pontuados os principais problemas encontrados, é possível afirmar que a filtragem e classificação de dados LIDAR para geração automática do MDT é um fato bem sucedido, uma vez que os produtos gerados apresentam notável coerência visual e indicadores numéricos considerados satisfatórios

Made available in DSpace on 2014-06-12T16:30:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5075_1.pdf: 3477676 bytes, checksum: 57ba33dea24e451fae4d38ac3d17c17a (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / Este trabalho mostra a integração de dados auxiliares para melhorar a classificação digital da imagem do sensor ETM+ (Landsat 7) na diferenciação de tipos florestais. Os dados auxiliares são aqui relacionados com a topografia do lugar. A área de estudo encontra-se inserida num brejo de altitude abrangendo parte dos municípios de Belo Jardim, Brejo da Madre de Deus e Tacaimbó, no Agreste pernambucano. A metodologia classifica parte da imagem que recobre a área pelo método supervisionado utilizando o algoritmo da máxima verossimilhança e comparar este resultado com a integração de dados auxiliares antes, durante e depois do processo de classificação da imagem. A matriz de erros permitiu analisar as similaridades espectrais entre as classes de tipos florestais e a acurácia da classificação por meio do desempenho global da classificação e do coeficiente de contingência Kappa. A classificação sem integração da altimetria apresentou um desempenho global de 90,29% e 0,8544 (85,44%) para o valor de Kappa e com na incorporação da altimetria antes do processo de classificação tem-se um desempenho global de 94,74% e um coeficiente kappa de 0,9157 (91,57%). Já para a incorporação da altimetria durante do processo de classificação tem-se um desempenho global de 95,18% e um coeficiente kappa de 0,9211 (92,11%). E finalmente na incorporação da altimetria após o processo de classificação tem-se um desempenho global de 94,57% e um coeficiente kappa de 0,9134 (91,34%). As três técnicas utilizadas mostraram que são eficientes para melhorar a estimativa das áreas cobertas por esses tipos de vegetação

Made available in DSpace on 2014-06-12T16:31:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo525_1.pdf: 1509610 bytes, checksum: 0d01745da91f48293497491ad7abe7cb (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A utilização de dados LIDAR para a obtenção de representações fiéis a respeito da superfície terrestre vem, nos últimos anos, consagrando-se como uma das alternativas mais viáveis e recorridas para se adquirir o MDS (Modelo Digital de Superfície) e principalmente do MDT (Modelo Digital do Terreno). Essa aceitação se justifica em especial pelo auto grau de automação na aquisição e processamento de dados, mas também se destaca a notável resolução altimétrica e planimétrica que os dados LIDAR oferecem. A obtenção automática do MDT a partir desses dados ocorre por meio de um processo conhecido por classificação, que consiste na remoção virtual dos pontos de um MDS que, em principio, não pertencem à superfície do terreno propriamente dita, mas sim às informações que se encontram sobre o solo, tais como edificações e elementos da própria natureza. Esse tema se trata de uma questão atual e ainda não concluída pelos principais centros de pesquisa nessa área do conhecimento em nível mundial. Nesse sentido, o presente trabalho, considerando aspectos visuais e numéricos, apresenta um estudo comparativo entre quatro métodos de filtragem e classificação automática de pontos que constituem o MDS oriundo dos dados LIDAR, a fim de se obter o respectivo MDT de quatro regiões distintas do Centro Politécnico da Universidade Federal do Paraná UFPR em Curitiba, Paraná Brasil. Os métodos implementados e variações propostas são pertinentes às principais linhas de pesquisa à respeito do assunto. A partir da análise dos resultados apresentados, discutidos e pontuados os principais problemas encontrados, é possível afirmar que a filtragem e classificação de dados LIDAR para geração automática do MDT é um fato bem sucedido, uma vez que os produtos gerados apresentam notável coerência visual e indicadores numéricos considerados satisfatórios

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-11-06T15:05:25Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) CABRAL,2016 CLASSIFICAÇÃO- MÍDIA.pdf: 6786673 bytes, checksum: f08a9006039a32ba05a18c6706ec435f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-06T15:05:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) CABRAL,2016 CLASSIFICAÇÃO- MÍDIA.pdf: 6786673 bytes, checksum: f08a9006039a32ba05a18c6706ec435f (MD5) Previous issue date: 2016-03-03 / A aprendizagem da Estatística vem sendo proposta desde o Ensino Fundamental como reflexo da sociedade atual que passa a lidar cada vez mais com uma grande quantidade de dados. Assim, é fundamental compreender essas informações sistematizadas e, principalmente, saber realizar pesquisas e sistematizar as informações a partir de seus interesses. Para tal, é importante inserir a criança no universo da pesquisa. Na realização de uma pesquisa é preciso compreender a importância de cada uma de suas fases e suas interpelações, considerando todas as etapas de um ciclo investigativo. Nesse estudo estamos interessados em uma dessas etapas: a classificação dos dados. Para organizar as informações, sejam elas em tabelas ou gráficos, é necessário saber classificar. Dessa forma, é de extrema importância levar aos alunos a criarem ou descobrirem critérios de classificação e não somente que eles conheçam determinadas classificações prontas. Nesse sentido, essa pesquisa teve como objetivo investigar a aprendizagem de alunos do 4º ano do Ensino Fundamental sobre a habilidade de classificar, considerando diferentes tipos de habilidades relacionadas à classificação. Participaram do estudo 103 alunos de três escolas públicas da Região Metropolitana do Recife organizados em três grupos: G1 – participava de uma sequência de atividades que envolvia a compreensão do descritor/critério; G2 – participava de uma sequência de atividades que envolvia a reflexão sobre elemento, classe e descritor/critério; G3 – não participava de sequencias de atividades, se constituindo como grupo controle. Foi realizado um pré-teste, uma sequência de atividades de ensino (grupos G1 e G2) e dois pós-testes com cada grupo. A sequência de atividades realizada em cada turma ocorreu em três dias, com aproximadamente duas horas de duração cada uma. Os resultados revelaram que os alunos dos três grupos apresentaram um fraco desempenho no pré-teste, demonstrando dificuldades em criar critérios para classificar livremente. Entretanto, após as vivencias das crianças nas sequencias de atividades foram observados avanços significativos na aprendizagem dos grupos G1 e G2 e não no G3. Dessa forma, fica evidente a possibilidade de aprendizagem dos alunos em criar critérios de classificação, independente do tipo de intervenção. Assim, podemos afirmar que alunos dos anos iniciais quando levados a refletir sobre como classificar demonstram capacidade e facilidade para aprender e compreender que há uma diversidade de critérios que podem ser utilizados desde que atenda as propriedades de exclusividade e exaustividade. / The fact that there are proposals to teach Statistics in Elementary school is a reflection of how modern society deals with ever-increasing amounts of information. Understanding these systematized data is fundamental, especially knowing how to research and systematize the information based on one’s interests. Therefore, it is important to introduce children to the world of research. When carrying out research, one needs to understand the importance of each phase and its interpellations, considering every step of an investigative cycle. In this study we are interested in one of these steps: the classification of data. To organize information, be it in tables or graphs, one needs to know how to classify it. Thus, it is extremely important to lead students to create or discover classification criteria; it is not sufficient that they know certain accepted classifications. To this end, the goal of this research was to investigate how students from the 4th grade of elementary school learned about the ability to classify, considering different types of abilities related to classification. 103 students from 3 public schools in the greater Recife area took part in the study. They were organized into three groups: G1 participated in a sequence of activities that involved understanding descriptor/criteria; G2 participated in a sequence of activities that involved reflection about element, class, and descriptor/criteria; and G3, who did not participate in any sequence of activities, acted as a control group. Students did a pre-test, a sequence of teaching activities (for the G1 and G2 groups), and two post-tests for each group. The sequence of activities with each group took place over three days, for about two hours each day. The results reveal that students from all three groups had low performance on the pre-test, demonstrating difficulties in creating criteria for free classification. However, after the children participated in the sequences of activities, we were able to observe significant advances in learning in groups G1 and G2, but not in G3. This provides evidence that it is possible to teach students to create classification criteria, independent of the type of intervention. Thus, we can deduce that students from the early years of elementary school, when led to reflect on how to classify, demonstrate the capacity and have no difficulty in learning and understanding that there is a range of criteria that can be used, as long as these respect the properties of exclusivity and completeness.

Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-07-24T22:29:05Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Manuela Menezes de Lima.pdf: 11410878 bytes, checksum: 7eb0852a926f4cd055a7ae5a117521c0 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-07-25T17:46:41Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Manuela Menezes de Lima.pdf: 11410878 bytes, checksum: 7eb0852a926f4cd055a7ae5a117521c0 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-25T17:46:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Manuela Menezes de Lima.pdf: 11410878 bytes, checksum: 7eb0852a926f4cd055a7ae5a117521c0 (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / CNPQ / Os cnidários da ordem Antipatharia (Cnidaria: Hexacorallia), popularmente conhecidos como corais negros, estão distribuídos por todos os oceanos do mundo, ocorrendo principalmente em profundidades maiores que 50 m. Sabe-se, porém, que a biodiversidade de mar profundo ainda está subestimada, e a escassez de estudos é ainda maior dentro da ordem. Uma das regiões que melhor representa esse estado deficiente de conhecimento é o Atlântico Sul. Através da identificação de corais negros depositados na Coleção de Cnidaria do Museu Nacional da UFRJ e no Museu de Oceanografia da UFPE, provenientes da porção sul da Cordilheira Meso-Atlântica e da plataforma continental brasileira, aqui registra-se a ampliação na distribuição de 18 espécies, pertencentes à seis famílias (Antipathidae, Cladopathidae, Leiopathidae, Myriopathidae, Schizopathidae e Stylopathidae). Quatro espécies (Parantipathes laricides; Triadopathes triadocrada; Stichopathes paucispina e S. spiessi) são registradas pela primeira vez para o Oceano Atlântico. Aqui também é registrada pela primeira vez a associação entre poliquetas polinoídeos e corais negros no Atlântico Sul Ocidental. Através de uma análise de similaridade faunística, foram revelados dois principais centros de endemismo neste oceano: o grupo do Caribe e o Canadá + Nordeste do Atlântico. O levantamento prévio à análise mostrou várias regiões que nunca foram amostradas, ou com ocorrências escassas. O panorama aqui exposto evidencia a necessidade de fomentar os estudos taxonômicos e biogeográficos com corais de mar profundo, para que a real diversidade do grupo possa ser elucidada. / Cnidarians of the order Antipatharia (Cnidaria: Hexacorallia), popularly known as black corals, are spread throughout all oceans of the world, occurring mainly in depths greater than 50 m. Knowledge about deep-sea biodiversity, however, is still underestimated, and the scarcity of studies is even greater within this order. One of the regions that best represent this state of knowledge is the South Atlantic. Through identification of black corals deposited in collections of the Museu Nacional (Rio de Janeiro) and the Museu de Oceanografia da UFPE, from the southern portion of the Mid-Atlantic Ridge and from the Brazilian continental shelf, we record herein the distribution of 18 species belonging to six families (Antipathidae, Cladopathidae, Leiopathidae, Myriopathidae, Schizopathidae and Stylopathidae). Four species (Parantipathes laricides; Triadopathes triadocrada; Stichopathes paucispina and S. spiessi) are recorded for the first time in the Atlantic Ocean. The association between polynoid polychaetes and black corals is also recorded for the first time in Southwestern Atlantic waters. An analysis of faunistic similarity was performed, revealing two main centers of endemism in this ocean: The Caribbean group and the Canada + Northeast Atlantic group. However, a preliminary survey showed several regions poorly known, with scarce records. The results presented herein highlight the need to promote taxonomic and biogeographic studies on deep sea corals, in order to elucidate the real diversity of antipatharians in the Atlantic.

Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-07-24T22:41:26Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Rafael Antonio Brandão.pdf: 2983685 bytes, checksum: 7340ed7599abfa8bbe60d6ff413ccf73 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-07-25T17:48:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Rafael Antonio Brandão.pdf: 2983685 bytes, checksum: 7340ed7599abfa8bbe60d6ff413ccf73 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-25T17:48:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Rafael Antonio Brandão.pdf: 2983685 bytes, checksum: 7340ed7599abfa8bbe60d6ff413ccf73 (MD5) Previous issue date: 2017-02-24 / CNPQ / A família Edwardsiidae, atualmente com cerca de 75 espécies, ocorre em diferentes ambientes marinhos, desde as regiões tropicais até os polos. Apesar desta ampla distribuição pouco se sabe sobre a diversidade do grupo na porção sul do Oceano Atlântico, onde apenas cinco espécies são registradas. Destas, apenas duas são registradas oficialmente para o Brasil: Nematostella vectensis Stephenson, 1935, registrada em 2010 no estado de Pernambuco e Edwardsia migottoi Gusmão, Brandão & Daly, 2016, endêmica do país e ocorrendo nas costas dos estados do Rio de Janeiro e São Paulo. Segundo indicam alguns trabalhos, desde 1967 indivíduos do gênero Edwardsia são citados como parte da anemonofauna da costa brasileira, porém, nenhum destes registros oferece uma descrição detalhada nem identificação em nível de espécie e até o momento pouco da diversidade dessas anêmonas é conhecido. Assim, este trabalho é o primeiro a tratar a diversidade da Família Edwardsiidae na costa brasileira. Este estudo foi conduzido fazendo uso de material que se encontra depositado em coleções de diferentes instituições do país. Os exemplares obtidos foram dissecados sob estereomicroscópio e alguns foram submetidos ao processamento histológico. Foi realizado um inventário das cnidas que ocorrem nos diferentes tecidos destes indivíduos (cnidoma). São descritas neste trabalho cinco espécies, das quais três são novas, pertencentes à três gêneros: Edwardsia migottoi; Scolanthus sp. nov. 1; Scolanthus sp. nov. 2; Scolanthus sp. nov.3 e Nematostella vectensis. Estas espécies haviam sido coletadas na costa dos estados de Pernambuco (E. migottoi) Rio de Janeiro (Scolanthus sp. nov. 2; Scolanthus sp. nov.3), São Paulo (E. migottoi e Scolanthus sp. nov. 1) e Paraná (N. vectensis). Este é o primeiro registro do gênero Scolanthus para o Brasil. Com esses novos registros a família Edwardsiidae passa a ter três espécies novas e o número de espécies que ocorrem na porção sul do Oceano Atlântico sobre de cinco para oito. / The Edwardsiidae family, currently with about 75 species, occurs in different marine environments, from the tropics to the poles. Despite this wide distribution little is known about the diversity of the group in the southern portion of the Atlantic Ocean where only five species are registered. Of those there are only two oficial records for Brazil: Nematostella vectensis Stephenson, 1935, registered in 2010 in the state of Pernambuco and Edwardsia migottoi Gusmão, Brandão & Daly, 2016, endemic to the country and occurring in the coasts of Rio de Janeiro and São Paulo. According to some studies, since 1967, individuals of the genus Edwardsia are cited in different studies as part of the benthic community of Brazil, however, none of these records provides a detailed description or identification at the species level, therefore little of the diversity of these anemones is known. This work is the first aiming to describe the diversity of the Edwardsiidae Family of the Brazilian coast. This study was conducted using material that is deposited in collections of different institutions in the country. The specimens were dissected under stereomicroscope and some were sent for histological processing. An inventory of cnidae that occur in different tissues of these individuals was conducted (cnidom). Here are described five species, three of which are new, belonging to three genera: Edwardsia migottoi; Scolanthus sp. nov. 1; Scolanthus sp. nov. 2; Scolanthus sp. nov.3 and Nematostella vectensis. These species were sampled on the coast of the states of Pernambuco (E. migottoi), Rio de Janeiro (Scolanthus sp. nov. 2; Scolanthus sp. nov. 3), São Paulo (E. migottoi and Scolanthus sp. nov. 1) and Paraná (N. vectensis). This is the first register of the genus Scolanthus for Brasil. The registers here presented increased de number of Edwardsiidae species by three and rised the number of species of the family occurring in South Atlantic water from five to eight.

Made available in DSpace on 2018-08-02T00:00:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_2875_DissertacaoMestradoAlexandrePereiradoCarmo.pdf: 1545299 bytes, checksum: 40ab4f867605450328bc2ab7d7bb8805 (MD5) Previous issue date: 2010-06-14 / Nessa pesquisa, estudamos a anatomia cerebral, os padrões oscilatórios dos circuitos neurais do sistema tálamo-cortical e sugerimos um modelo para as fontes cerebrais baseado em dipolos elétricos, então, calculamos atenuação do campo elétrico e formamos um sistema de equações lineares para separar os sinais de EEG linearmente misturados no Encéfalo. Esse método foi testado em classificadores baseados em regras, classificadores estatísticos (Análise por Discriminante Quadrático, Análise por Discriminante Linear e Análise por Discriminante Regularizado) e redes neurais artificiais durante a classificação de 3 tarefas mentais, relacionadas à imaginação de movimento das mãos direita/esquerda e a geração de palavras começando com uma mesma letra qualquer.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:03:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4671_1.pdf: 3454327 bytes, checksum: 7c1a9aa99e2d4f841c7e7ce5e199cdac (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / As pteridófitas são consideradas um grupo cosmopolita apresentando uma gama de adaptações quanto aos tipos de substratos, formas de vida e ambientes de ocorrência, influenciadas principalmente pelo clima e relevo. Considerando estas adaptações ecológicas do grupo, foram selecionadas duas áreas para amostragem da vegetação (fragmento Água Azul - Usina Cruangi, município de Timbaúba, estado de Pernambuco e fragmento Maria Maior, município de São José da Laje, incluindo também o inventário da pteridoflora nas matas do Engenho Coimbra, município de Ibateguara ambos da Usina Serra Grande, no estado de Alagoas, todos remanescentes da Floresta Atlântica). O estudo teve por objetivos conhecer as diferentes pteridofloras do fragmento florestal Água Azul e do fragmento Maria Maior, observar as formas de vida, tipos de substratos e tipos de ambientes de ocorrência, realizar uma análise comparativa das pteridofloras nas duas áreas selecionadas e evidenciar as associações das espécies em função desses parâmetros condicionantes. Foram empregados métodos tradicionais para o levantamento florístico. Para os aspectos ecológicos estudados foi utilizada literatura especializada e observações de campo. Foi empregado o Índice de Sorensen para determinar a similaridade florística entre os dois fragmentos e para a análise multivariada foi utilizado o Programa NTSys PC 2.1, e o Índice de Similaridade de Jaccard em função dos aspectos ecológicos para ambos os fragmentos. No fragmento Água Azul ocorrem 16 famílias, 42 gêneros e 85 espécies e no fragmento Maria Maior ocorrem 16 famílias, 38 gêneros e 76 espécies. Nos dois fragmentos, as famílias de maior riqueza de espécies foram Pteridaceae, Polypodiaceae, Thelypteridaceae e Dryopteridaceae e os gêneros foram Adiantum e Thelypteris. Os ambientes de ocorrência predominantes foram as espécies encontradas nos cursos de riachos, em afloramentos rochosos, nas encostas, nas bordas de trilhas no interior da mata, na borda da mata e em locais encharcado (espécies não exclusivas). Foram registradas 88 espécies como novas referências para Alagoas, uma para a Região Nordeste - Thelypteris jamesonii (Hooker) R.M. Tryon e uma para o Brasil - Danaea bipinnata H. Tuomisto, bem como 12 gêneros coletados nos dois fragmentos estudados no Estado, totalizando 144 espécies até o presente momento. Entre as 112 espécies registradas nos fragmentos Água Azul e Maria Maior, 36 são exclusivas para o primeiro, 27 exclusivas para o segundo e 49 comuns para ambos. Em ambos os fragmentos, a maioria das espécies são terrícolas e hemicriptófitas rosuladas e reptantes, ocorrendo no interior da mata em barrancos ao longo de cursos de regatos e afloramentos rochosos. A similaridade florística dos fragmentos é elevada (J= 43,75%). Foi possível determinar cinco grupos para o fragmento Água Azul e seis grupos para o fragmento Maria Maior. Em geral, os aspectos ecológicos que determinaram a associação dos grupos foram as variações entre os ambientes de ocorrência e o substrato terrícola

Orientadores: Fabiano Lopes Thompson, Marcelo Brocchi / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-16T10:05:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tonon_LucianeAlessandraChimetto_D.pdf: 11157072 bytes, checksum: 9af9fa6e5b1ce542596bb28c5a9bf67e (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Microrganismos têm um papel fundamental na saúde de cnidários, estabelecendo relações ecológicas diversas, de parasitismo até mutualismo. O conhecimento acerca da diversidade de procariontes associados com cnidários e corais no Brasil ainda é escasso. Este é o primeiro estudo enfocando a caracterização taxonômica de bactérias heterotróficas incluindo fixadoras de nitrogênio (N2) e especialmente vibrios isolados do muco do coral endêmico Mussismilia hispida e de zoantídeos simpátricos Palythoa caribaeorum, Palythoa variabilis e Zoanthus solanderi da região de São Sebastião-SP, Brasil. Ao todo, foram obtidos 488 isolados bacterianos destes cnidários, empregando-se os meios de cultivo Ágar Marinho (AM), Ágar Fixação de Nitrogênio (NFb) e Ágar Tiosulfato-Citrato-Bile-Sacarose (TCBS). Os cnidários foram coletados em três praias (Grande, Portinho e Preta) na região de São Sebastião em 2005 e 2006. A maioria dos isolados obtidos pertenciam à classe Gammaproteobacteria. Mais da metade foram identificados como vibrios com base em sequências parciais do gene 16S rRNA. Vibrios do grupo core corresponderam a 80 % das bactérias potencialmente fixadoras de N2 e revelaram alta similaridade de sequência no gene pyrH com V. harveyi e V. alginolyticus. Dezenove isolados representativos, pertencentes às espécies V. harveyi, V. alginolyticus, V. campbellii e V. parahaemolyticus foram capazes de crescer 6 vezes sucessivas em meio NFb e alguns deles mostraram forte atividade da nitrogenase pelo teste de redução de acetileno (ARA). Cerca de 150 vibrios isolados em TCBS foram caracterizados por meio de sequências de 16S rRNA, recA e pyrH. Os taxa mais abundantes foram V. harveyi, V. rotiferianus, V. campbellii, V. alginolyticus, V. mediterranei (=V. shillonii), V. chagasii, V. tubiashii e uma espécie nova de Vibrio. Com exceção de V. chagasii que foi encontrado apenas no muco de M. hispida, as demais espécies foram observadas nos diferentes hospedeiros, não havendo fortes evidências da presença de espécies hospedeiro-específicas. A variabilidade intra-específica dos vibrios foi avaliada por meio de padrões de banda de elementos palindrômicos extragênicos repetitivos (rep-PCR). Esta análise revelou alta diversidade genômica entre os isolados. Cada isolado apresentava um padrão de rep-PCR distinto, indicando uma grande diversidade de populações co-existindo no mesmo habitat. As identificações geradas pelo rep-PCR concordaram com as identificações obtidas pelo MLSA (Multilocus Sequence Analysis). Diversos isolados de diferentes grupos microbianos apresentaram menos de 97 % de similaridade em sequências do gene 16S rRNA com espécies conhecidas, indicando que elas seriam possíveis espécies novas. Ao todo, sete espécies novas foram descritas por meio da taxonomia polifásica: Marinobacterium coralli sp. nov., Marinomonas brasilensis sp. nov., Photobacterium swingsii sp. nov., P. jeanii sp. nov., Vibrio communis sp. nov., V. variabilis sp. nov. e V. marinum sp. nov. Os dados fenotípicos, quimiotaxonômicos, genotípicos e filogenéticos obtidos a partir da descrição das sete espécies novas demonstraram que há uma ampla variabilidade fenotípica intra-específica. Este estudo determinou a identidade dos principais grupos de bactérias cultivadas do muco de corais, sobretudo, os vibrios. Uma das espécies de vibrios mais abundantes no muco dos corais é V. communis sp. nov. A fixação de N2 representa um fenótipo comum entre as espécies de vibrios estudadas, sugerindo uma função positiva no holobionte. / Abstract: Microorganisms have a key role in the health of cnidarians establishing ecologic relationships, of parasitism to mutualism. The knowledge on the diversity of prokaryotes associated with corals in Brazil is very limited. This is the first study on the taxonomic characterization of heterotrophic bacteria, including putative N2-fixing and specially vibrios isolated from mucus of endemic coral Mussismilia hispida and the sympatric zoanthids Palythoa caribaeorum, Palythoa variabilis and Zoanthus solanderi. Cnidarian specimens were isolated in the beaches Grande, Portinho and Preta from São Sebastião region, SP, Brazil, in 2005 and 2006. A total of 488 isolates were obtained using different culture media, i.e. Marine Agar (MA), Nitrogen Fixation (NFb) and Thiosulphate-Citrate- Bile-Sucrose Agar (TCBS). The majority of the isolates fell within the class Gammaproteobacteria and more than half of them were vibrios based on 16S rRNA gene sequences. Based on pyrH gene sequences 80 % of the putative N2-fixing bacteria clustered with the Vibrio core species group (i.e. V. harveyi and V. alginolyticus). Nineteen representative isolates of V. harveyi, V. alginolyticus, V. campbellii and V. parahaemolyticus) were capable of growing six successive times in nitrogen-free medium and some of them showed strong nitrogenase activity by means of the acetylene reduction assay (ARA). About 150 vibrios isolated on TCBS were characterized by means of 16S rRNA, recA and pyrH gene sequences. The most abundant taxa were V. harveyi, V. rotiferianus, V. campbellii, V. alginolyticus, V. mediterranei (=V. shillonii), V. chagasii, V. tubiashii and a new Vibrio species. With the exception of V. chagasii which was found only in the mucus of M. hispida, the other species appeared in different hosts with no strong evidence for the presence of host-specific species. A high genomic diversity was observed using rep-PCR. Each vibrio isolate represented a different co-occuring population, suggesting huge intra-especific diversity. There was a complete agreement between the grouping based on rep-PCR and identification based on MLSA (Multilocus Sequence Analysis). Several isolates had less than 97 % similarity towards know species based on 16S rRNA gene sequence, indicating that they are possibly new species. In total, seven new species were described based on polyphasic taxonomy: Marinobacterium coralli sp. nov., Marinomonas brasilensis sp. nov. Photobacterium swingsii sp. nov., P. jeanii sp. nov., Vibrio communis sp. nov., V. variabilis sp. nov. and V. marinum sp. nov. The new species were characterized by polyphasic taxonomy. Based on phenotypic, chimiotaxonomic, genotypic and phylogenetic data obtained from description of new species, it was demonstrated a huge intra-specific phenotypic variability. This study determined the taxonomic identity of heterotrophic bacteria, especially Vibrio, isolates from cnidarians. V. communis sp. nov. is one of the most frequently found species in the corals. Nitrogen fixation is a common phenotypic trait among vibrios, suggesting that these bacteria may have a positive function in the holobiont. / Doutorado / Genetica de Microorganismos / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-10-16T15:36:31Z No. of bitstreams: 1 Vitoria Regina Faustino da Silva.pdf: 4335112 bytes, checksum: b0abdc1e3d2cfbdb2d0f4ca198be9b2d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-16T15:36:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vitoria Regina Faustino da Silva.pdf: 4335112 bytes, checksum: b0abdc1e3d2cfbdb2d0f4ca198be9b2d (MD5) Previous issue date: 2018-09-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Luvisols are considered as a grouping of soils with textural B, clay fraction of high-activity clays, high base status. They are soils with evolution according to the performance of the bissiallitization process combined with the production of iron oxides and the mobilization of clay from the superficial horizon, with accumulations in subsurface horizons. Studies in Luvisols have indicated the formation of clay in situ (argilation) as the main process of formation of Bt, however other processes such as argiluviation and lithologic discontinuity may be of comparable or greater importance in the creation of textural contrast, which characterizes this grouping of solos. In the semi-arid region of Pernambuco, bissiallitization becomes the predominant weathering path, with predominance of clay minerals 2: 1 (smectite and illite), 1: 1 (kaolinite), with illite interstratified with smectites. Fersiallitization and rubification were described as the most outstanding pedogenetic processes. Thus, this study sought to understand the genesis of clay minerals and texture contrast of Luvisols of the semi-arid region of Pernambuco (Brazil), evaluating the morphology, mineralogy and micromorphology along a transect in the semi-arid formed from the amphibolite alteration, as well as classify soils according to the Brazilian Soil Classification System (SiBCS) and WRB / FAO. The following characteristics were considered: being inserted in the semi-arid Pernambucano, native or secondary vegetation, without any kind of influence or anthropic action, mafic metamorphic crystalline basement (particularly amphibolites). The micromorphological analysis of the thin sections indicated no pedofeatures of clay illuviation thus the formation of clay in situ (argilation) responsible for the texture contrast in these profiles. Profile 1 located in Itacuruba (PE) was classified as Luvissolo Chromic Ortic vertissolic solodic saline (WRB- Chromic Vertic Luvisol (hypereutric, protosalic, sodic)), profile 2 as Luvissolo Chromic Ortic vertissolic (Chromic Vertic Luvisol (hypereutric)) and profile 3 as Luvissolo Chromic Ortic typical (Chromic Luvisol (hypereutric)). Profile 1 did not fit into a class cataloged in SiBCS, constituting a new class of Luvissolo. / Os Luvissolos são considerados como um grupamento de solos com B textural, fração argila de atividade alta e alta saturação por bases. São solos com evolução segundo atuação do processo de bissialitização conjugada à produção de óxidos de ferro e à mobilização de argila da parte superficial, com acumulações em horizontes subsuperficiais. No entanto estudos em Luvissolos têm apontado a formação de argila in situ (argilação) como principal processo de formação do Bt, no entanto, outros processos tais como argiluviação e descontinuidade litológica podem ser de importância comparável ou maior na criação de contraste textural, que caracteriza este grupamento de solos. Na região semiárida de Pernambuco a bissialitização torna-se o caminho de intemperismo predominante, com predominância de argilominerais 2:1 (esmectitas e ilita), 1:1 (caulinita), com ilita interestratificada com esmectitas. A fersialitização e a rubificação foram descritas como os processos pedogenéticos mais marcantes. Sendo assim, este estudo buscou compreender a gênese de argilominerais e do contraste de textura de Luvissolos do semiárido de PE, avaliando a morfologia, mineralogia e micromorfologia ao longo de um transecto no semiárido de Pernambuco, formados a partir da alteração de anfibolitos, assim como classificar os solos de acordo com Sistema Brasileiro de Classificação dos Solos (SiBCS) e WRB/FAO. Levou-se em consideração as seguintes características: estar inserido no semiárido Pernambucano, vegetação nativa ou secundária, sem qualquer tipo de influência ou ação antrópica, embasamento cristalino metamórfico máfico (particularmente anfibolitos). A análise micromorfológica das seções finas indicou que não há pedofeições de iluviação de argila, assim a formação de argila in situ (argilação) o responsável pelo contraste de textura nestes perfis. O Perfil 1 localizado em Itacuruba (PE) foi classificado como Luvissolo Crômico Órtico salino vertissólico solódico (Chromic Vertic Luvisol (hypereutric, protosalic, sodic)), perfil 2 como Luvissolo Crômico Órtico vertissólico (Chromic Vertic Luvisol (hypereutric)) e o perfil 3 como Luvissolo Crômico Órtico típico (Chromic Luvisol (hypereutric)). O Perfil 1 não se enquadrou em uma classe catalogada no SiBCS, constituindo uma nova classe de Luvissolo.