Made available in DSpace on 2017-07-21T14:19:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 SUELYN FERNANDA DA SILVA.pdf: 3051294 bytes, checksum: 677dca6509612434b3c257db9647f482 (MD5) Previous issue date: 2015-04-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Meta-analysis is the analysis results of various studies, and is performed in order to synthesize these results statistically formal manner. One application is in the meta validation diagrammatic scales to assess severity of disease in plants. The aim of this study was a metaanalysis in diagrammatic scales of data validation, used to help determine the severity of disease in different cultures, using software that perform meta-analysis with data that correlate variables and have free or trial version, was developed a computer model to automate this task in a simplified manner compared to the software used, R and Comprehensive Meta-Analisys. The database for the meta-analysis comprised a total of 64 studies with the validation subject diagrammatic scales, these studies were split and led to 3 separate databases for reviews where scales were used, was not used and the evaluators They were trained to scale. The meta-analysis with the models of fixed effect and random effect on the R software was carried out in order to obtain the lowest value of the Akaike Information Criterion, which was used to determine the most appropriate model, and then performed a meta-analysis with the Comprehensive Meta-Analisys software. The computational model developed uses the structure of a wizard software, which performs the steps of meta-analysis found the form of literature this model performs the meta-analysis tasks on specific steps guiding the user through every step facilitating the realization of the meta-analysis, so the system It provides options to the user and according to the choice made the system identifies the next step to run until the end of the meta-analysis. It was concluded that the computational model helped to simplify the process of meta and also by the results obtained it is concluded that there are benefits in using scales diagrammatic having a higher overall correlation has been established to 0.97 where it was used. / Metanálise é a análise de resultados de diversos estudos, e é realizada a fim de sintetizar esses resultados de uma maneira estatisticamente formal. Uma das aplicações da metanálise está na validação de escalas diagramáticas para a avaliação de severidade de doenças em plantas. O objetivo deste trabalho foi realizar metanálise em dados de validação de escalas diagramáticas, usadas para auxílio na determinação do grau de severidade de doenças em diferentes culturas, utilizando softwares que realizam metanálise com dados que correlacionam variáveis e que possuem versão gratuita ou para teste, foi desenvolvido um modelo computacional para automatizar tal tarefa de maneira simplificada comparado aos softwares utilizados, R e Comprehensive Meta-Analisys. A base de dados para a metanálise foi composta por um total de 64 estudos com o tema validação de escalas diagramáticas, estes estudos foram divididos e originou-se 3 bases de dados separadas por avaliações onde as escalas eram utilizadas, não eram utilizadas e os avaliadores eram treinados com a escala. Foi realizada a metanálise com os modelos de efeito fixo e de efeito aleatório no software R, a fim de se obter o menor valor do Critério de Informação de Akaike, o qual foi utilizado para determinar o modelo mais adequado, e em seguida realizada a metanálise com o software Comprehensive Meta-Analisys. O modelo computacional desenvolvido utiliza a estrutura de um software assistente, que realiza as etapas da metanálise encontradas da literatura de forma este modelo executa as tarefas da metanálise em passos específicos guiando o usuário por todas as etapas facilitando a realização da metanálise, desta forma o sistema fornece opções ao usuário e de acordo com a escolha realizada o sistema identifica o próximo passo a ser executado até o fim da metanálise. Concluiu-se que o modelo computacional auxiliou a simplificar o processo de metanálise e através dos resultados obtidos conclui-se também que existem benefícios no uso de escalas diagramáticas tendo sido estabelecida uma correlação global superior a 0,97 nos casos em que ela foi usada.

Made available in DSpace on 2016-04-28T14:58:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008 - Fabio Mathias Correa.pdf: 2421517 bytes, checksum: 7f7f9e77fc6d68db6e05dbd9994c1e38 (MD5) Previous issue date: 2008-02-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / The late blight of the tomato, caused by Phytophthora infestans (Mont) of Bary it is one of the main diseases of the tomato. However, the quantification of the severity of the disease, doesn't possess a standard method of evaluation and that, it can interfere in the comparison of results among and inside of experiments, once the scale of evaluation of the disease should be standardized. A diagrammatic scale should represent all variation of the existent disease in the field and to make possible necessary evaluations and perfected, independent of the existent differences among appraisers. Another important factor in the epidemiological studys, is the correct application of the methodologies of evaluation of treatments or cultivars. Therefore, the present work has as objectives: 1) to develop and to validate a diagrammatic scale for quantification of the severity of the late blight in tomateiro leaves and 2) to compare the use of AUDPC (area under disease progress curve), certain according to Shanner & Finney (1977), with the use of mixed models and mixed lineal models widespread in the selection of gen?tipos of resistant tomateiro to the requeima. Three diagrammatics scales were proposed for evaluation of the late blight in tomato leaves. The first scale, denominated scale-detailed, it was composed by nine values of severity intensity (0, 3, 6, 12, 22, 40, 60, 77 and 90%), the second climb, call of having scale-simplified, it was composed by seven severity values (0, 3, 12, 22, 40, 60 and 77%) and the third scale, of having James-modified, composed by seven severity values (0, 1, 5, 10, 16, 32 and 50%). For the validation of the scales, 24 appraisers accomplished two evaluations in leaves 50 tomato leaves with different severity levels, where the precision, acuracy and repetibility were appraised through simple lineal regression, analysis of variance of the mistakes and correlation coefficient. Among the proposed scales, two came as tools that allow a good precision and acuracy in the evaluation of the severity of the late blight in tomato leaves, being the detailed scale and the simplified scale. With relationship to the analysis methods, the use of direct AACPD, calculated by the sum of Riemann, and of mixed and mixed models widespread, it was verified that the direct use of AUDPC, doesn't get to describe all existent variation in the sample, probably for the great number of treatments. The use of mixed models widespread, that it considers the distribution of Poisson, it was shown more appropriate for to describe the epidemic caused by late blight in tomato, being more suitable in the selection of tomato cultivars seeking to the resistance the this disease. / A requeima, causada por Phytophthora infestans ? uma das principais doen?as do tomateiro. Para quantificar a severidade da doen?a, n?o h? um m?todo padr?o, o que pode interferir na compara??o de resultados entre e dentro de experimentos, uma vez que a escala de avalia??o da doen?a deve ser padronizada. Uma escala diagram?tica deve representar toda a varia??o da severidade no campo e possibilitar avalia??es precisas e acuradas, independente das diferen?as entre avaliadores. Outro fator importante no estudo epidemiol?gico ? a correta aplica??o das metodologias de avalia??o de tratamentos ou gen?tipos. Portanto, o presente trabalho objetivou: 1) desenvolver e validar uma escala diagram?tica para quantifica??o da severidade da requeima em folhas de tomateiro e 2) comparar o uso da ?rea abaixo da curva de progresso da doen?a (AACPD), com o uso de modelos mistos e modelos lineares mistos generalizados na sele??o de gen?tipos de tomateiro resistentes ? requeima. Tr?s escalas diagram?ticas foram propostas para avalia?ar a requeima em folhas de tomateiro. A primeira, denominada escala-detalhada, foi composta por nove valores de intensidade de severidade (0, 3, 6, 12, 22, 40, 60, 77 e 90%). A segunda escala, chamada de escala-simplificada, foi composta por sete valores de severidade (0, 3, 12, 22, 40, 60 e 77%) e a terceira, de Jamesmodificada, composta por sete valores de severidade (0, 1, 5, 10, 16, 32 e 50%). Para a valida??o das escalas, 24 avaliadores realizaram duas avalia??es em 50 folhas de tomateiro com diferentes n?veis de severidade, e a precis?o, acur?cia e a repetibilidade dos avaliadores foram avaliados atrav?s de regress?o linear simples, an?lise de vari?ncia dos erros e coeficiente de correla??o de Pearson. Dentre as escalas propostas, duas (escala detalhada e escala simplificada) apresentaram uma boa precis?o e acur?cia para a avalia??o da severidade da requeima em folhas de tomateiro. Quanto aos m?todos de an?lise, constatou-se que o uso direto da AACPD, obtido pela soma de Riemann, n?o conseguiu descrever toda varia??o existente na amostra, provavelmente pelo grande n?mero de tratamentos. O uso de modelos mistos generalizados, que considera a distribui??o de Poisson, foi mais adequado para descrever a epidemia, sendo mais indicado na sele??o de gen?tipos de tomate resistentes a doen?a.

Submitted by LEILA CRISTIANE DELMADI (leila.delmadi@unemat.br) on 2018-02-16T19:25:10Z No. of bitstreams: 1 TESE FINAL_Leila Cristiane Delmadi 08_02_18.pdf: 4391349 bytes, checksum: e4b70ce78d01a2f04c5de286b9ee9c47 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Lucia Martins Frederico null (mlucia@fca.unesp.br) on 2018-02-19T11:36:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 delmadi_lc_dr_botfca.pdf: 4391349 bytes, checksum: e4b70ce78d01a2f04c5de286b9ee9c47 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-19T11:36:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 delmadi_lc_dr_botfca.pdf: 4391349 bytes, checksum: e4b70ce78d01a2f04c5de286b9ee9c47 (MD5) Previous issue date: 2017-06-02 / A espécie florestal Tectona grandis (Teca) é nativa do sudeste asiático, possui grande porte, rápido crescimento, produtora de madeira nobre e valorizada por sua beleza, resistência e durabilidade. No Brasil, surgiu como uma alternativa substituta a outras espécies, como o mogno (Swietenia macrophylla) e a cerejeira (Torresea acreana). A presente pesquisa teve como objetivo investigar a condição fitossanitária da teca em frutos e, testar a resistência de três diferentes clones à doenças fúngicas. Os objetivos específicos foram: i) avaliar frutos de teca de 3 procedências (Alta Floresta/MT, Cáceres/MT e Botucatu/SP) quanto a presença de patógenos; ii) testar a resistência de 3 clones (S0, S1 e S3) de T. grandis aos patógenos: Olivea tectonae, Fusarium oxysporum e Ceratocystis fimbriata em condições controladas; iii) elaborar uma escala diagramática com folhas adultas de T. grandis, para avaliação da ferrugem causada pelo fungo O. tectonae; iv) testar a resistência de 3 clones de teca (S0, S1 e S3) à doenças fúngicas em plantio de campo. Os experimentos foram conduzidos no Laboratório de Patologia Florestal - FCA/UNESP-Botucatu e também na Fazenda Experimental da UNESP em São Manoel/SP. Como resultados para o teste com frutos, obteve-se: Procedência Alta Floresta/MT, 13,33% de Aspergillus sp.; 3,33% de Colletotrichum sp. e Alternaria sp.; 1,66% de Septoria sp. e Penicillium sp.. Para os frutos procedentes de Cáceres/MT, 61,66% para o patógeno Fusarium sp., 8,33% com Penicillium sp., 1,66% com Arthrosporium sp. e Cunninghamella sp. Quanto a procedência Botucatu/SP, 21,66% com Aspergillus sp., 23,33% com Alternaria sp., 8,33% com Fusarium sp., 10% com Penicillium sp., 5% para Nigrospora sp. e 3,33% com Ovularia e Humicola. O experimento em condições controladas, com o fungo Olivea tectonae foi realizado com a pulverização de uma suspensão de esporos em concentração de 2,42 x 105 urediniósporos/mL-1. Observou-se que o período latente foi de 5 dias e, na análise de severidade o clone S0 apresentou um número de 59,4 pústulas/3cm², S1 com 86,6 e S3 com 88,1 pústulas/3cm². A inoculação dos fungos Fusarium oxysporum e Ceratocystis fimbriata foi feita com a introdução de um disco de cultura micelial em uma abertura feita no caule da planta a 10 cm do colo. Com a inoculação do F. oxysporum os resultados médios das lesões encontradas no caule, foram: S0 com 8,25 cm, S1 com 8,77 cm e S3 com 11,25 cm de lesão. Já com a inoculação do C. fimbriata as médias das lesões se deram, conforme segue: S0 com 13,2 cm, S1 com 15,3 cm e S3 com 14,8 cm de lesão. Não houve diferença significativa entre as médias nos clones testados. Para a elaboração da escala diagramática, foram determinados 7 níveis de severidade em função da distribuição da amostra para as folhas adultas (N0 = 0%; N1 = 2,5%; N2 = 5%; N3 = 10%; N4 = 20%; N5 = 40% e N6 = 80%). Com a adoção da escala proposta, a totalidade dos avaliadores apresentou melhor precisão, com R² = 0,93 em comparação ao resultado obtido sem o uso da escala (R² = 0,88). O plantio em campo se deu com a introdução de 4.274 mudas de teca, divididas em 3 clones distintos (S0, S1 e S3). Foram identificadas as doenças fúngicas com ocorrência natural, ferrugem e cancro, causadas respectivamente, pelos fungos: O. tectonae e Neofusiccocum parvum. Não houve diferença estatística entre os clones para nenhum dos patógenos avaliados. Conclui-se com isso, que nas condições em que foi instalado o experimento, os clones testados não apresentaram resistência horizontal as doenças acima descritas. / The forest species Tectona grandis (Teak) is native to Southeast Asia, has large, rapidly growing producer of noble wood and valued for its beauty, strength and durability. In Brazil, it emerged as a replacement alternative to other species, such as mahogany (Swietenia macrophylla) and Cherry tree (Torresea acreana).The present research had as objective to investigate the phytosanitary condition of teak fruits and to test the resistance of three different clones to fungal diseases. The specific objectives were: i) to evaluate teak fruits from 3 provenances (Alta Floresta/MT, Cáceres/MT and Botucatu/SP) in the presence of pathogens; ii) to test the resistance of 3 clones (S0, S1 and S3) of T. grandis to pathogens: Olivea tectonae, Fusarium oxysporum and Ceratocystis fimbriata under controlled conditions; iii) to elaborate a diagrammatic scale with adult leaves of T. grandis, to evaluate the rust caused by the fungus O. tectonae; iv) to test the resistance of 3 teak clones (S0, S1 and S3) to fungal diseases in field planting. The experiments were conducted at the Laboratory of Forest Pathology - FCA/UNESP/Botucatu and also at the experimental farm of UNESP in São Manoel/SP. As results for the fruit test, we obtained: Provenance Alta Floresta/MT, 13.33% of Aspergillus sp.; 3.33% of Colletotrichum sp. and Alternaria sp.; 1.66% of Septoria sp. and Penicillium sp.. For fruits from Cáceres/MT, 61.66% for the pathogen Fusarium sp., 8.33% with Penicillium sp., 1.66% with Arthrosporium sp. and Cunninghamella sp. As for Botucatu/SP, 21.66% with Aspergillus sp., 23.33% with Alternaria sp., 8.33% with Fusarium sp., 10% with Penicillium sp., 5% for Nigrospora sp. and 3.33% with Ovularia and Humicola. The control under controlled conditions with fungus Olivea tectonae was carried out by spraying a suspension of spores in a concentration of 2,42 x 105 uredynopores/ml-1. It was observed that the latent period was 5 days and in the severity analysis clone S0 presented a number of 59,4 pustules/3cm², S1 with 86,6 and S3 with 88.1 pustules/3cm². The inoculation of fungi Fusarium oxysporum and Ceratocystis fimbriata was made with the introduction of a mycelial culture disc into an opening made in the plant stem at 10 cm from the colon. With the inoculation of F. oxysporum the average results of the lesions found in the stem were: S0 with 8,25 cm, S1 with 8,77 cm and S3 with 11,25 cm of lesion. With the inoculation of C. fimbriata, the mean of the lesions were as follows: S0 with 13,2 cm, S1 with 15,3 cm and S3 with 14,8 cm of lesion. There was no statistical difference between the clones tested. For the elaboration of the diagrammatic scale, 7 levels of severity were determined as a function of the sample distribution for the adult leaves (N0 = 0%, N1 = 2,5%, N2 = 5%, N3 = 10%, N4 = 20%, N5 = 40% and N6 = 80%). With the adoption of the proposed scale, all the evaluators presented better accuracy, with R² = 0,93 compared to the result obtained without the use of the scale (R² = 0,88). Field planting occurred with the introduction of 4.274 teak seedlings, divided into 3 distinct clones (S0, S1 and S3). Fungal diseases with natural occurrence, rust and cancer, caused respectively by fungi: O. tectonae and Neofusiccocum parvum. There was no statistical difference between the clones for any of the evaluated pathogens. It was concluded that, under the conditions in which the experiment was installed, the clones tested did not show horizontal resistance to the diseases described above.

Resumo: A seleção assistida por marcadores moleculares têm contribuído com os estudos para o desenvolvimento de cultivares resistentes. Os ganhos mais evidentes podem ocorrer em doenças como a ferrugem asiática da soja, onde a alta variabilidade do patógeno e a busca por novas fontes de resistência têm dificultado o sucesso dos melhoristas. Assim, os objetivos deste trabalho foram estudar a herança da resistência à ferrugem em diferentes fontes e desenvolver marcadores SCAR ligados a um loco de resistência para seleção assistida. Populações F2 oriundas dos cruzamentos PI 459025 x CD 208 (1), PI 200526 x CD 205 (2), PI 200456 x Conquista (3) e GC 84058-21-4 x IAC Foscarin 31 (4) foram submetidas à inoculação com a ferrugem e avaliadas quanto ao tipo de lesão (RB - resistente ou TAN - suscetível). O teste de Qui-quadrado indicou a presença de um gene dominante para os cruzamentos 1 e 2, enquanto no 3 e 4 observou-se a presença de um gene recessivo. A análise multivariada agrupou os genótipos mais similares, com base nos caracteres severidade da doença, número de vagens, número de sementes e ciclo, avaliados nos cruzamentos 2 a 4. Diferenças significativas foram encontradas em número de lesões e esporulação para genótipos RB e TAN. Dois bulks de DNA foram obtidos de plantas homozigotas resistentes e suscetíveis no cruzamento 1, para a análise de BSA. Dos 600 iniciadores RAPD testados, três foram discriminativos e localizam-se a 4,5, 6,2 e 10,2 cM do loco de resistência, em fase de repulsão. Um desses marcadores foi convertido a SCAR e se manteve discriminativo, podendo ser indicado para seleção assistida de genótipos resistentes com a mesma fonte. / Abstract: Assisted selection by molecular markers has contributed to development studies of resistant cultivars. The most evident gains may occur for diseases like the Asian soybean rust, where the high variability of pathogen and the search for new resistance sources has difficult the breeder success. Thus, the aims of this work were to study the rust resistance inheritance in different sources and develop SCAR markers linked to a rust resistance locus for assisted selection. F2 populations from crosses PI 459025 x CD 208 (1), PI 200526 x CD 205 (2), PI 200456 x Conquista (3) and GC 84058-21-4 x IAC Foscarin 31 (4) were submitted to rust inoculation and evaluated by the lesion type reaction (RB - resistant or TAN - susceptible). Chi-square test indicated the presence of a single dominant gene for crosses 1 and 2, whereas the 3 and 4 crosses showed a single recessive gene. Multivariate analysis has grouped the most similar genotypes based on disease severity, number of pods, number of seeds and cycle for 2 to 4 crosses. Significant differences were observed in lesions number and sporulation rate for RB and TAN genotypes. Two DNA bulks were obtained, for BSA analysis, on cross 1, from resistant and susceptible homozygous plants. From the 600 tested RAPD primers, three of them were discriminative and located in repulsion phase at 4.5, 6.2 and 10.2 cM from the resistance locus. One of the RAPD markers was converted to SCAR and confirmed its discriminative nature. So it can be indicated for assisted selection of genotypes with the same resistance source. / Orientador: Antonio Orlando Di Mauro / Coorientador: José Baldin Pinheiro / Coorientadora: Sandra Helena Unêda Trevisoli / Banca: Eduardo Antonio Gavioli / Banca: Natal Antonio Vello / Banca: Janete Apparecida Desidério Sena / Banca: Rinaldo César de Paula / Doutor

Made available in DSpace on 2017-07-25T19:30:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fabricio Passini.pdf: 1507090 bytes, checksum: 826f7bba535f87d3e863773bee392e0c (MD5) Previous issue date: 2007-07-25 / This dissertation reports three researches carried out at Ponta Grossa State University. The elaboration and validation of a diagrammatic scale to assess Asian rust severity in common bean crops; the verification of commonly used cultivars in Paraná resistance levels to Asian rust disease; and the sowing date influence on Asian rust severity levels. To elaborate the diagrammatic scale, fifty leaflets from JALO PRECOCE and RADIANTE cultivars were collected. Based on the Quant program, the maximum severity levels were determined (77,10%) as well as the minimum levels (1,02%) and through the “Weber and Fechener’s stimulus law” six other intermediate severity levels were obtained (2,3%)-(5,11%)-(10,97%)-(21,99%)- (39,19%)-(59,58%). The real severity determination was done through the randomly collection of fifty leaflets with different severity levels. Scale validation was performed by ten raters only five of them were experienced in phytopathology. The leaflets assessment was firstly carried out without the scale and later with the use of it. As a result, they not only improved their precision, as well as presented absolute errors levels lower than 10% when supported by the scale, agreeing with Nutter’s data. Seven among the ten raters were accurate. Aiming at assessing cultivars resistance levels to Asian rust disease, under natural infection conditions, twenty-three common bean cultivars were submitted to assessment, PRETO, CARIOCA and MANTEIGÃO. Based on the results, it may be seen that the cultivars from MANTEIGÃO group (JALO PRECOCE and RADIANTE) presented a high severity level to the disease with severity levels of 40%, while CARIOCA and PRETO group cultivars demonstrated levels varying from resistant to susceptible. Among the cultivars, the lowest severity levels were found in the IPR-36 (2,6%), FTBONITO (3,7%) and IPR-CHOPIM (3,8%) cultivars. Concerning to the cultivars cycle, it could be observed that the earliest mature were the ones which presented the highest severity levels to Asian rust. In conclusion, it may be affirmed that the common bean resistance levels to Asian rust vary from resistant to susceptible. The MANTEIGÃO group cultivars presented the highest resistance levels to the disease. In order to assess two common bean cultivars response to Asian rust (IPR SARACURA e IPRUIRAPURU),sowed in ten different dates, an experiment was conducted. The first season was sowed on 04/10/2005 and the nine others followed a fifteen-day break until the last one sowed on 15/02/2006. Severity assessments were carried out in all phenological stages in each sowing date. The results show that only in the seventh season, when the common bean plants were in the R-8 phenological stage, the Asian rust presence could be confirmed. There were statistics differences among the sowing date, however no meaningful differences could be observed in the first nine seasons among the cultivars according to the severity percentage or to the AACPD. The IPR-SARACURA cultivar was, nevertheless, statistically higher to IPR-UIRAPURU in the tenth season. In conclusion, the later the sowing is done, the earlier the Asian rust is found in the beans crop. In addition, Asian rust negatively influenced on the cultivars bean yield potential, considering that the weight of 1000 bean was the only component to be affected. / Nesta pesquisa três trabalhos foram desenvolvidos: a elaboração e validação de uma escala diagramática para avaliação da ferrugem asiática na cultura do feijão; a verificação dos níveis de resistência à ferrugem asiática das cultivares de feijão freqüentemente utilizadas no estado do Paraná; e a influência de épocas de semeadura do feijão em relação à severidade da ferrugem asiática. Para elaborar a escala diagramática, foram coletados 50 folíolos das cultivares JALO PRECOCE e RADIANTE. Com o programa Quant foram determinados os níveis de severidade máxima (77,10%) e mínima (1,02%) encontradas no campo e através da “lei do estimulo visual de Weber e Fechner” foram determinados mais seis níveis intermediários de severidade (2,3)-(5,11)-(10,97)-(21,99)-(3 9,19)-(59,58). Para determinação da severidade real foram coletados aleatoriamente 50 folíolos de feijão com diferentes níveis de severidade. Dos 10 avaliadores participantes, apenas cinco possuíam experiência em quantificação de doenças de plantas . Primeiramente, a avaliação dos 50 folíolos foi realizada sem a escala e posteriormente com o auxilio desta. Os avaliadores não apenas melhoraram sua precisão, como também apresentaram, ao utilizar a escala, erros absolutos inferiores a 10%. Sete dos dez avaliadores foram considerados acurados. Objetivando avaliar os níveis de resistência de cultivares à ferrugem asiática, sob condições naturais de infecção, 23 cultivares de feijão dos grupos PRETO, CARIOCA e MANTEIGÃO foram avaliadas. Com base nos resultados, percebe-se que cultivares do grupo MANTEIGÃO (JALO PRECOCE e RADIANTE) apresentaram alta severidade da doença, com níveis de até 40% de severidade, enquanto feijões dos grupos CARIOCA e PRETO demonstraram níveis variando de resistentes a suscetíveis. Dentre as cultivares, os menores níveis de severidade foram encontrados nas ultivares IPR-31 (2,6%), FT-BONITO (3,7%) e IPR-CHOPIM (3,8%). Quanto ao ciclo das cultivares, observou-se que as mais precoces foram aquelas que apresentaram maiores níveis de severidade à ferrugem asiática. Conclui-se que os níveis de resistência das cultivares de feijão à ferrugem asiática variaram de resistentes a suscetíveis. As cultivares do grupo MANTEIGÃO foram as que apresentaram maiores níveis de resistência à ferrugem asiática. A fim de avaliar o comportamento quanto à ferrugem asiática, de duas ultivares de feijão (IPR SARACURA e IPR-UIRAPURU), semeadas em 10 diferentes épocas realizou-se o experimento. A primeira época foi semeada no dia 04/10/2005 e outras nove épocas com intervalo de 15 dias, até o dia 15/02/2006. Foram realizadas avaliações de severidade em todos os estádios fenológicos em cada uma das épocas de semeadura. Quanto aos resultados, percebe-se que somente na sétima época, quando as plantas de feijão encontravam-se no estádio fenológico R8, a presença da ferrugem asiática foi confirmada. Houve diferenças estatísticas entre as épocas de semeadura, entretanto não foram observadas diferenças significativas nas nove primeiras épocas entre as cultivares em relação à porcentagem de severidade e na área abaixo da curva do progresso da doença. Contudo, na décima época a severidade da ferrugem asiática na cultivar IPR-SARACURA foi superior estatisticamente a cultivar IPR-UIRAPURU. Pode-se concluir que quanto mais tarde se realiza a semeadura, mais cedo se manifesta a ferrugem asiática no feijão. Conclui-se, ainda, que a ferrugem asiática influenciou negativamente na produtividade de grãos das cultivares de feijão, sendo que o componente do rendimento afetado foi o peso de 1000 grãos.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-08-08Bitstream added on 2014-06-13T19:42:47Z : No. of bitstreams: 1 costa_mm_dr_jabo.pdf: 539143 bytes, checksum: 38e4165c8bd5de4a8cf35184bd7ea3a7 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A seleção assistida por marcadores moleculares têm contribuído com os estudos para o desenvolvimento de cultivares resistentes. Os ganhos mais evidentes podem ocorrer em doenças como a ferrugem asiática da soja, onde a alta variabilidade do patógeno e a busca por novas fontes de resistência têm dificultado o sucesso dos melhoristas. Assim, os objetivos deste trabalho foram estudar a herança da resistência à ferrugem em diferentes fontes e desenvolver marcadores SCAR ligados a um loco de resistência para seleção assistida. Populações F2 oriundas dos cruzamentos PI 459025 x CD 208 (1), PI 200526 x CD 205 (2), PI 200456 x Conquista (3) e GC 84058-21-4 x IAC Foscarin 31 (4) foram submetidas à inoculação com a ferrugem e avaliadas quanto ao tipo de lesão (RB – resistente ou TAN – suscetível). O teste de Qui-quadrado indicou a presença de um gene dominante para os cruzamentos 1 e 2, enquanto no 3 e 4 observou-se a presença de um gene recessivo. A análise multivariada agrupou os genótipos mais similares, com base nos caracteres severidade da doença, número de vagens, número de sementes e ciclo, avaliados nos cruzamentos 2 a 4. Diferenças significativas foram encontradas em número de lesões e esporulação para genótipos RB e TAN. Dois bulks de DNA foram obtidos de plantas homozigotas resistentes e suscetíveis no cruzamento 1, para a análise de BSA. Dos 600 iniciadores RAPD testados, três foram discriminativos e localizam-se a 4,5, 6,2 e 10,2 cM do loco de resistência, em fase de repulsão. Um desses marcadores foi convertido a SCAR e se manteve discriminativo, podendo ser indicado para seleção assistida de genótipos resistentes com a mesma fonte. / Assisted selection by molecular markers has contributed to development studies of resistant cultivars. The most evident gains may occur for diseases like the Asian soybean rust, where the high variability of pathogen and the search for new resistance sources has difficult the breeder success. Thus, the aims of this work were to study the rust resistance inheritance in different sources and develop SCAR markers linked to a rust resistance locus for assisted selection. F2 populations from crosses PI 459025 x CD 208 (1), PI 200526 x CD 205 (2), PI 200456 x Conquista (3) and GC 84058-21-4 x IAC Foscarin 31 (4) were submitted to rust inoculation and evaluated by the lesion type reaction (RB – resistant or TAN – susceptible). Chi-square test indicated the presence of a single dominant gene for crosses 1 and 2, whereas the 3 and 4 crosses showed a single recessive gene. Multivariate analysis has grouped the most similar genotypes based on disease severity, number of pods, number of seeds and cycle for 2 to 4 crosses. Significant differences were observed in lesions number and sporulation rate for RB and TAN genotypes. Two DNA bulks were obtained, for BSA analysis, on cross 1, from resistant and susceptible homozygous plants. From the 600 tested RAPD primers, three of them were discriminative and located in repulsion phase at 4.5, 6.2 and 10.2 cM from the resistance locus. One of the RAPD markers was converted to SCAR and confirmed its discriminative nature. So it can be indicated for assisted selection of genotypes with the same resistance source.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-03-04Bitstream added on 2014-06-13T20:46:30Z : No. of bitstreams: 1 celoto_mib_dr_ilha.pdf: 2236478 bytes, checksum: fe75a04fbb8e850c1386270aaffe5f0e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Na região de Junqueirópolis, SP, a mancha alvo (Corynespora cassiicola) é a principal doença que vem ocorrendo na cultura da acerola, causando intensa desfolha. Devido a falta de estudos sobre esse patossistema e as dificuldades para a adequação de produtos químicos para uso nesta cultura, os objetivos do presente trabalho foram: 1 – elaborar e validar uma escala diagramática para quantificação da mancha alvo; 2 – avaliar o efeito in vitro da temperatura no crescimento micelial e na germinação de esporos de C. cassiicola e a influência da temperatura e da duração do período de molhamento foliar no desenvolvimento da mancha alvo em mudas de acerola, mantidas em condições de câmara de crescimento; 3 – avaliar o efeito in vitro e in vivo das caldas sulfocálcica, bordalesa e Viçosa sobre C. cassiicola; 4 – avaliar o efeito in vitro de produtos químicos sobre C. cassiicola e no controle da mancha alvo da acerola no campo; 5 – determinar o efeito da poda no controle da mancha alvo e na produção da acerola. A escala diagramática proposta proporcionou bons níveis de acurácia e precisão, mostrando-se adequada para as avaliações da severidade da mancha alvo. As temperaturas ótimas estimadas para o crescimento micelial e a germinação de esporos de C. cassiicola foram de 26,1 e 27,8oC, respectivamente. Para que a infecção ocorra é necessário pelo menos 12h de molhamento foliar. O estabelecimento da mancha alvo ocorre na faixa de 20 a 30oC. As caldas sulfocálcica, bordalesa e Viçosa presentes na superfície das folhas de acerola e in vitro inviabilizaram os esporos de C. cassiicola. Assim, o uso das caldas, na cultura da acerola, pode contribuir na redução de fontes de inóculo do patógeno. Tebuconazole, carbendazim, epoxiconazole + piraclostrobina, DDAC, Nutriphite P + K e Ecolife® apresentaram efeito fungitóxico sobre C. cassiicola in vitro... / In Junqueirópolis, SP, the target spot (Corynespora cassiicola), main leaf disease occurred in barbados cherry, causing intense defoliate. Because few studies about this pathosystem and difficulties for adaptation of chemical products in barbados cherry, the objectives of the work were: 1 – elaborate and validate a diagrammatic scale to quantification of target spot; 2 – effect in vitro of temperature on mycelial growth and spores germination of C. cassiicola and the influence of temperature and the duration of leaf wetness in the development of target spot on seedling of barbados cherry in growthing chamber; 3 – effect in vitro and in vivo of line sulfhur, bordeaux mixture and ‘calda Viçosa’ on C. cassiicola; 4 – effect in vitro of chemical products on C. cassiicola and in the control of target spot of barbados cherry in field condition; 5 – effect of pruning in the control of target spot and production of barbados cherry. The scale provided good levels of accuracy and precision proved to be adequate for severity assessments of target spot of barbados cherry. The estimated maximum temperatures for mycelia growth and for spores germination of C. cassiicola were 26,1oC and 27,8oC, respectively. The presence of free water on the surface of barbados cherry leaves was necessary for the development of target spot, being necessary at least 12h of leaf wetness to infection happened. In the development of lesions of target spot in barbados cherry seedlings, occurs in the range 20 to 30oC. Line sulfhur, Bordeaux mixture and ‘calda Viçosa’ in surface of leaves barbados cherry and in vitro unviability the spores of C. cassiicola. For the reasons, the use of the syrups, in the culture of the acerola, it can contribute in the reduction of sources of inoculum of the pathogen. Tebuconazol, carbendazin, epoxiconazol + piraclostrobin, DDAC, Nutriphite... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Marli de Fátima Stradioto Papa / Banca: Luiz de Souza Corrêa / Banca: Aparecida Conceição Boliani / Banca: César Júnior Bueno / Banca: Marise Cagnin Martins Parisi / Resumo: Na região de Junqueirópolis, SP, a mancha alvo (Corynespora cassiicola) é a principal doença que vem ocorrendo na cultura da acerola, causando intensa desfolha. Devido a falta de estudos sobre esse patossistema e as dificuldades para a adequação de produtos químicos para uso nesta cultura, os objetivos do presente trabalho foram: 1 - elaborar e validar uma escala diagramática para quantificação da mancha alvo; 2 - avaliar o efeito in vitro da temperatura no crescimento micelial e na germinação de esporos de C. cassiicola e a influência da temperatura e da duração do período de molhamento foliar no desenvolvimento da mancha alvo em mudas de acerola, mantidas em condições de câmara de crescimento; 3 - avaliar o efeito in vitro e in vivo das caldas sulfocálcica, bordalesa e Viçosa sobre C. cassiicola; 4 - avaliar o efeito in vitro de produtos químicos sobre C. cassiicola e no controle da mancha alvo da acerola no campo; 5 - determinar o efeito da poda no controle da mancha alvo e na produção da acerola. A escala diagramática proposta proporcionou bons níveis de acurácia e precisão, mostrando-se adequada para as avaliações da severidade da mancha alvo. As temperaturas ótimas estimadas para o crescimento micelial e a germinação de esporos de C. cassiicola foram de 26,1 e 27,8oC, respectivamente. Para que a infecção ocorra é necessário pelo menos 12h de molhamento foliar. O estabelecimento da mancha alvo ocorre na faixa de 20 a 30oC. As caldas sulfocálcica, bordalesa e Viçosa presentes na superfície das folhas de acerola e in vitro inviabilizaram os esporos de C. cassiicola. Assim, o uso das caldas, na cultura da acerola, pode contribuir na redução de fontes de inóculo do patógeno. Tebuconazole, carbendazim, epoxiconazole + piraclostrobina, DDAC, Nutriphite P + K e Ecolife® apresentaram efeito fungitóxico sobre C. cassiicola in vitro... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In Junqueirópolis, SP, the target spot (Corynespora cassiicola), main leaf disease occurred in barbados cherry, causing intense defoliate. Because few studies about this pathosystem and difficulties for adaptation of chemical products in barbados cherry, the objectives of the work were: 1 - elaborate and validate a diagrammatic scale to quantification of target spot; 2 - effect in vitro of temperature on mycelial growth and spores germination of C. cassiicola and the influence of temperature and the duration of leaf wetness in the development of target spot on seedling of barbados cherry in growthing chamber; 3 - effect in vitro and in vivo of line sulfhur, bordeaux mixture and 'calda Viçosa' on C. cassiicola; 4 - effect in vitro of chemical products on C. cassiicola and in the control of target spot of barbados cherry in field condition; 5 - effect of pruning in the control of target spot and production of barbados cherry. The scale provided good levels of accuracy and precision proved to be adequate for severity assessments of target spot of barbados cherry. The estimated maximum temperatures for mycelia growth and for spores germination of C. cassiicola were 26,1oC and 27,8oC, respectively. The presence of free water on the surface of barbados cherry leaves was necessary for the development of target spot, being necessary at least 12h of leaf wetness to infection happened. In the development of lesions of target spot in barbados cherry seedlings, occurs in the range 20 to 30oC. Line sulfhur, Bordeaux mixture and 'calda Viçosa' in surface of leaves barbados cherry and in vitro unviability the spores of C. cassiicola. For the reasons, the use of the syrups, in the culture of the acerola, it can contribute in the reduction of sources of inoculum of the pathogen. Tebuconazol, carbendazin, epoxiconazol + piraclostrobin, DDAC, Nutriphite... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor