Les installations d'épuration des eaux usées sont des systèmes de grande dimension, non linéaires, sujets à des perturbations importantes en flux et en charge. Une commande prédictive (MPC) a été appliquée au Benchmark BSM1 qui est un environnement de simulation qui définit une installation d'épuration. Une identification en boucle ouverte d'une station d'épuration d'eaux usées a été réalisée pour déterminer un modèle linéaire en se basant sur un ensemble de mesures entrée sortie du Benchmark BSM1. Les réponses indicielles en boucle ouverte ont été obtenues à partir de variation échelon des entrées autour de leurs valeurs stationnaires. Le modèle tient compte des non-linéarités à travers des paramètres variables. Les réponses indicielles obtenues permettent de déterminer par optimisation les fonctions de transfert continues correspondantes. Ces fonctions de transfert peuvent être regroupées en cinq modèles mathématiques. Des fonctions de transfert continues de premier ordre, de premier ordre avec un intégrateur, des réponses inverses, de second ordre et de second ordre avec zéro représentant les réponses indicielles ont été identifiées. Les valeurs numériques des coefficients de chaque modèle choisi ont été calculées par un critère des moindres carrés. La commande prédictive (MPC) utilise le modèle obtenu comme un modèle interne pour commander le procédé. Deux stratégies de la commande prédictive DMC et QDMC d'une station d'épuration avec ou sans compensation par anticipation ont été testées. La commande par anticipation est utilisée pour réduire l'effet de deux perturbations mesurées, le débit entrant et la concentration entrante en ammonium, sur le système / Wastewater treatment processes are large scale, non linear systems, submitted to important disturbances of influent flow rate and load. Model predictive control (MPC) widely used industrial technique for advanced multivariable control, has been applied to the Benchmark Simulation Model 1 (BSM1) simulation benchmark of wastewater treatment process. An open loop identification method has been developed to determine a linear model for a set of input-output measurements of the process. All the step responses have been obtained in open loop from step variations of the manipulated inputs and measured disturbances around their steady state values. The non-linearities of the model are taken into account by variable parameters. The step responses coefficient obtained make it possible to determine by optimization the corresponding transfer functions. That functions are classified by five mathematical models, such as : first order, first order with integrator, inverse response, second order and second order with zero. The numerical values of coefficients of each model selected were calculated using a least squares criterion. Model predictive control (MPC) uses the resulting model as an internal model to control the process. Dynamic matrix control DMC and quadratic dynamic matrix control QDMC predictive control strategies, in the absence and presence of feedforward compensation, have been tested. Two measured disturbances have been used for feedforward control, the influent flow rate and ammonium concentration

Les contaminations par les moisissures représentent un problème majeur au sein de l'industrie agroalimentaire, pharmaceutique, cosmétique, et dans le secteur médical. Actuellement, l'identification des champignons filamenteux est basée sur l'analyse des caractéristiques phénotypiques, nécessitant une expertise et pouvant manquer de précision, ou sur les méthodes moléculaires, coûteuses et fastidieuses. Dans ce contexte, l'objectif de cette étude a consisté à développer un protocole simple et standardisé à l'aide de la spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier (IRTF) combinée à une méthode d'analyse chimiométrique, proposant une méthode alternative pour l'identification rapide des moisissures. Au total, 498 souches de champignons filamenteux (45 genres et 140 espèces) ont été analysées à l'aide d'un spectromètre IRTF à haut débit. L'analyse discriminante des moindres carrés partiels (PLS -DA), méthode chimiométrique supervisée, a été appliquée à chaque spectre dans les gammes spectrales 3200-2800 et 1800-800 cm-1. Différents modèles de calibration ont été construits à partir de 288 souches, ceci en cascade de la sous-division jusqu'à l'espèce en se basant sur la taxonomie actuelle. La prédiction des spectres en aveugle, obtenus à partir de 105 souches, au niveau du genre et de l'espèce est respectivement de 99,17 % et 92,3 %. La mise en place d'un score de prédiction et d'un seuil a permis de valider 80,22 % des résultats. L'implémentation d'une fonction de standardisation (SF) a permis d'augmenter le pourcentage de spectres bien prédits, acquis sur un autre instrument, de 72,15 % (sans fonction) à 89,13 %, validant la transférabilité de la méthode. Puisqu'une biomasse mycélienne suffisante peut être obtenue après 48h de culture et que la préparation des échantillons implique l'utilisation d'un protocole simple, la spectroscopie IRTF combinée à la PLS-DA apparaît comme une méthode rapide et peu coûteuse, ce qui la rend particulièrement attractive pour l'identification des champignons filamenteux au niveau industriel. Les résultats obtenus placent la spectroscopie IRTF parmi les méthodes analytiques prometteuses et avant-gardistes, possédant un haut pouvoir discriminant et une forte capacité d'identification, en comparaison avec les techniques conventionnelles. / Mold contaminants represent a major problem in various areas such as food and agriculture, pharmaceutics, cosmetics and health. Currently, molds identification is based either on phenotypic characteristics, requiring an expertise and can lack accuracy, or on molecular methods, which are quite expensive and fastidious. In this context, the objective was to develop a simple and standardized protocol using Fourier transform infrared (FTIR) spectroscopy combined with a chemometric analysis, allowing to implement an alternative method for rapid identification of molds. In total, 498 fungal strains (45 genera and 140 species) were analyzed using a high-throughput FTIR spectrometer. Partial Least Squares Discriminant Analysis (PLS-DA), a supervised chemometrics method, was applied to each spectrum in the spectral ranges 3200-2800 and 1800-800 cm-1 for the identification process. Using 288 strains, different calibration models were constructed in cascade and following the current taxonomy, from the subphylum to the species level. Blind prediction of spectra from 105 strains at the genus and species levels was achieved at 99.17 % and 92.3% respectively. The establishment of a prediction score and a threshold permitted to validate 80.22% of the obtained results. The implementation of a standardization function (SF) permitted to increase the percentage of well predicted spectra from strains analyzed using another instrument from 72.15% (without SF) to 89.13% and permitted to verify the transferability of the method. Since sufficient mycelial biomass can be obtained at 48h culture and sample preparation involved a simple protocol, FTIR spectroscopy combined with PLS-DA is a very rapid and cost effective method, which could be particularly attractive for the identification of moulds at the industrial level. The results obtained places FTIR spectroscopy among the avant-garde promising analytical approaches, with high discriminant power and identification capacity, compared to conventional techniques.

La mondialisation du spectacle footballistique et l’évolution des médias ont engendré le développement d’une nouvelle catégorie de public : les téléspectateurs extraterritoriaux. Comprendre leur comportement s’avère un thème de recherche important en marketing du sport pour les fédérations, les ligues et les clubs professionnels. Notre recherche doctorale est centrée sur à la compréhension des préférences de publics extraterritoriaux qui suivent les rencontres de football à distance par le biais des médias. D’un point de vue théorique, nous avons construit un modèle conceptuel et des hypothèses qui associent, d’une part, une approche expérientielle issue du marketing et, d’autre part, le processus d’identification issu de la psychologie sociale. De plus, nous avons intégré l’influence sociologique d’autres variables culturelles : la proximité géographique et lien historique vis-à-vis de l’équipe soutenue, et sportives : style de jeu, meilleur joueur et victoire pour expliquer la préférence pour l’une des deux équipes. Nous avons testé qualitativement (20 sujets) et quantitativement (903 sujets) notre modèle de recherche sur les téléspectateurs extraterritoriaux marocains qui suivent à la télévision deux équipes espagnoles : le Real de Madrid et le FC Barcelone. Les résultats ont montré que leurs préférences sont surtout liées : au processus d’identification, à la proximité géographique et au lien historique à l’équipe soutenue, et au style de jeu et à la victoire de l’équipe qu’ils soutiennent. Ces résultats sont importants car la compréhension des attentes de ce nouveau segment permet aux managers et aux clubs professionnels d’affiner leurs stratégies marketing et leurs produits pour satisfaire en tant que marque de sport: les spectateurs, les supporters à distance transterritoriaux et les téléspectateurs extraterritoriaux. / The globalization of football as entertainment and the changes in media have generated the development of a new category of public: international viewers. Understanding their behavior proves to be an important research topic for the marketing of federations, leagues and professional clubs. The research is focused on understanding the preferences of international viewers who follow football games in the media. From a theoretical point of view, the conceptual model and the hypotheses have been constructed based on an experimental approach to marketing and the identification process of social psychology. The research model focuses on Moroccan viewers watching two Spanish teams Real Madrid and FC Barcelona on television. It has been tested qualitatively (20 subjects) and quantitatively (903 subjects). Moreover, the influence of other cultural variables has been incorporated. These are the historical connection and geographical proximity to the supported team, and sporting variables: based on playing style, best player and wins to explain the preference for one of the two teams. The results have shown that the preference of Moroccan viewers is above all linked to: [1] the process of identification, [2] the historical connection and geographical proximity to the team, as well as [3] the sporting variables: playing style and wins. These results are important to the development of professional clubs. The sponsors’ understanding of the expectations of the foreign consumer segment enables managers and professional clubs to seek appropriate strategies and solutions to satisfy: the spectators, both ex-patriot and international.

L'entreprise de cette recherche doctorale s'articule autour de trois axes de réflexion. Elle a, pour un temps, consisté en la redécouverte freudienne d'une intelligence de la notion de méconnaissance. Dans l’exploration des procédés fondateurs de la psyché et des mécanismes associés, cette méconnaissance apparaît en filigrane tout au long de l'oeuvre du maître de la psychanalyse et sa consistante à la fois structurelle et processuelle est supposée. La visite de l'enseignement de l'héritage de la psychiatrie classique ainsi que l'examen lacanien ont permis, par la suite, le développement du concept de méconnaissance. Il est défini à travers les empreintes corrélatives des mécanismes de reconnaissance et de l'identification, ceci afin de modéliser quatre actes psychiques fondant des méconnaissances singulières selon la prégnance de leur ancrage dans les champs de l'imaginaire et du symbolique. Le délire est alors appréhendé tel un savoir, « Ça-voir » authentique, dont l'efficience de la liaison avec une image signifiante dévoile les qualités de son expression. Un déploiement de nouvelles perspectives théoriques a été un dernier pas, avancées faisant valoir l'existence de logiques délirantes chez des patients en fonction de la particularité d’un discours psychotique, schizophrénique ou paraphrénique. L'argumentation psychopathologique a été engagée dans une intention d'ouvertures thérapeutiques sur la clinique des psychoses. / All research and works during all these years are gathered in this document based on three main phases. The first phase was to rediscosver Freud’s theory about smart concept of “méconnaissance” meaning "misconstrue" or "misrecognize”. As we have explored the foundations of the psyché and all related mechanisms, this misconstrue appears within all Freud’s work long where both structural and processual components have been evaluated. Following the heritage of classical psychiatry school, and deepening lacanien’s theories and teachings, the second step has allowed to develop and detail the “méconnaissance” concept. According to Lacan’s lessons, identification and acknowledgement are the two key drivers of this concept. To build on them, it is possible to modelize four psychic acts founded on particular “méconnaissance” depending on the close links to the fields of imaginary and symbol. So, delusion could be viewed as a kind of knowledge, a true “ça-voir”, closely connected to a significant image. Last but not least, the third phase dealt with new theoritical perspectives based on the existence of delirious logic for patients according to their specific psychosis, schizophrenia and paraphrenia talkings. Psychopathological arguments were binded in order to identify new open therapeutic areas for clinical psychosis.

This D.Sc. thesis proposes new perspectives for modeling drill string torsional dynamics under uncertainties. This work develops a novel stochastic hysteretic (nonreversible) bit-rock interaction model. Firstly, a new nominal interaction model, which depends not only on the bit speed, but also on the bit acceleration is developed. Then, a new stochastic model for the bit-rock interaction, taking into account the inherent fluctuations during the drilling, is also proposed. Furthermore, here a new test-rig is proposed to analyze drill string dynamics and bit-rock interaction, which is able to reproduce stick-slip phenomena while drilling a rock sample using standard masonry bits, as well as to validate bit-rock interaction models. An original strategy for modeling uncertainties globally, based on terms of the nonparametric probabilistic approach, considering a simple torsional model for a drill string, is also proposed herein. This strategy allows to control the dispersion level of each interior and interface DOFs of each drill string substructure independently, which can provide more information to improve the operational safety. / This D.Sc. thesis proposes new perspectives for modeling drill string torsional dynamics under uncertainties. This work develops a novel stochastic hysteretic (nonreversible) bit-rock interaction model. Firstly, a new nominal interaction model, which depends not only on the bit speed, but also on the bit acceleration is developed. Then, a new stochastic model for the bit-rock interaction, taking into account the inherent fluctuations during the drilling, is also proposed. Furthermore, here a new test-rig is proposed to analyze drill string dynamics and bit-rock interaction, which is able to reproduce stick-slip phenomena while drilling a rock sample using standard masonry bits, as well as to validate bit-rock interaction models. An original strategy for modeling uncertainties globally, based on terms of the nonparametric probabilistic approach, considering a simple torsional model for a drill string, is also proposed herein. This strategy allows to control the dispersion level of each interior and interface DOFs of each drill string substructure independently, which can provide more information to improve the operational safety

Biometrics is the science and technology of measuring and analyzing biological data for authentication purposes. Its progress has brought in a large number of civilian and government applications. The candidate modalities used in biometrics include retinas, fingerprints, signatures, audio, faces, etc. There are two types of biometric system: single modal systems and multiple modal systems. Single modal systems perform person recognition based on a single biometric modality and are affected by problems like noisy sensor data, intra-class variations, distinctiveness and non-universality. Applying multiple modal systems that consolidate evidence from multiple biometric modalities can alleviate those problems of single modal ones. Integration of evidence obtained from multiple cues, also known as fusion, is a critical part in multiple modal systems, and it may be consolidated at several levels like feature fusion level, matching score fusion level and decision fusion level. Among biometric modalities, both audio and face modalities are easy to use and generally acceptable by users. Furthermore, the increasing availability and the low cost of audio and visual instruments make it feasible to apply such Audio-Visual (AV) systems for security applications. Therefore, this dissertation proposes an algorithm of face recognition. In addition, it has developed some novel algorithms of fusion in different levels for multiple modal biometrics, which have been tested by a virtual database and proved to be more reliable and robust than systems that rely on a single modality. / by Lin Huang. / Thesis (Ph.D.)--Florida Atlantic University, 2010. / Includes bibliography. / Electronic reproduction. Boca Raton, Fla., 2010. Mode of access: World Wide Web.

Dans le cadre de la collecte sous-marine d'échantillons biologiques et minéraux pour la recherche scientifique par un robot sous-marin équipé de bras manipulateurs, ce projet de thèse a pour but principal le développement de nouvelles techniques de manipulation des échantillons, plus fiables, permettant d'en assurer l'intégrité physique et leur exploitabilité par les chercheurs. Les nouvelles techniques de manipulation proposées prennent en compte l'actionnement particulier des nouveaux bras électriques sous-marins équipant les engins récents, afin d'augmenter la précision du positionnement des outils embarqués par le manipulateur. Un outil amovible, compliant, et mesurant les efforts d'interaction entre les bras du sous-marin et leur environnement est aussi proposé, et des méthodes permettant de tirer partie des caractéristiques de cet outil sont développées et testées expérimentalement. L'engin sous-marin hybride HROV Ariane, équipé de deux bras électriques hétérogènes, offre la plateforme opérationnelle pour la validation expérimentale des solutions proposées. / The research carried out in the scope of this doctorate degree aims to develop innovative techniques to improve the collection of biological and mineral samples underwater using robotic manipulators. The end goal is to enhance the handling by robotic means in order to maximise sample quality provided to marine scientists. The proposed techniques are based on an in-depth analysis of the robotic arm actuators used in most recent underwater intervention vehicles, in order to improve the accuracy of the positionning of the tools held by the manipulator arms. An instrumented tool has also been developed with the aim to measure the reaction forces and adapt the interaction between the arm's end-effector and its environment to improve samples handling. These methods and the other contributions described in this thesis have been experimentally validated using Ifremer's hybrid-ROV Ariane equipped with two electrically actuated heterogeneous robotic arms.

Le traitement d’images médicales a pour but d’aider les médecins dans leur diagnostic et d’améliorer l’interprétation des résultats. Les scanners tomo-densitométriques (scanners X) sont des outils d’imagerie médicale utilisés pour reconstruire des images 3D du corps humain.De nos jours, il est très important de sécuriser les images médicales lors de leur transmission, leur stockage, leur visualisation ou de leur partage entre spécialistes. Par exemple, dans la criminalistique des images, la capacité d’identifier le système d’acquisition d’une image à partir de cette dernière seulement, est un enjeu actuel.Dans cette thèse, nous présentons une première analyse du problème d’identification des scanners X. Pour proposer une solution à ce type de problèmes, nous nous sommes basés sur les méthodes d’identification d’appareils photo. Elles reposent sur l’extraction de l’empreinte des capteurs. L’objectif est alors de détecter sa présence dans les images testées. Pour extraire le bruit, nous utilisons un filtre de Wiener basé sur une transformation en ondelettes. Ensuite, nous nous appuyons sur les propriétés relatives aux images médicales pour proposer des solutions avancées pour l’identification des scanners X. Ces solutions sont basées sur une nouvelle conception de leur empreinte, cette dernière étant définie en trois dimensions et sur les trois couches : os, tissu et air.Pour évaluer notre travail, nous avons généré des résultats sur un ensemble de données réelles acquises avec différents scanners X. Finalement, nos méthodes sont robustes et donnent une précision d’authentification élevée. Nous sommes en mesure d’identifier quelle machine a servi pour l’acquisition d’une image 3D et l’axe selon lequel elle a été effectuée. / Medical image processing aims to help the doctors to improve the diagnosis process. Computed Tomography (CT) Scanner is an imaging medical device used to create cross-sectional 3D images of any part of the human body. Today, it is very important to secure medical images during their transmission, storage, visualization and sharing between several doctors. For example, in image forensics, a current problem consists of being able to identify an acquisition system from only digital images. In this thesis, we present one of the first analysis of CT-Scanner identification problem. We based on the camera identification methods to propose a solution for such kind of problem. It is based on extracting a sensor noise fingerprint of the CT-Scanner device. The objective then is to detect its presence in any new tested image. To extract the noise, we used a wavelet-based Wiener denoising filter. Then, we depend on the properties of medical images to propose advanced solutions for CT-Scanner identification. These solutions are based on new conceptions in the medical device fingerprint that are the three dimension fingerprint and the three layers one. To validate our work, we applied our experiments on multiple real data images of multiple CT-Scanner devices. Finally, our methods that are robust, give high identification accuracy. We were able to identify the acquisition CT-Scanner device and the acquisition axis.

Le concept de subjectivation a guidé l’avancée de cette thèse, pour saisir les remaniements des processus de la construction subjective chez l’enfant, pris dans les discours dominants de notre postmodernité. La création d’un espace psychique différencié inhérent aux processus de subjectivation, pose d’emblée le lien à l’Autre et aux autres, au sein de l’institution, familiale et sociale, dans laquelle évolue l’enfant. Les incidences sur le déroulement de la construction subjective ont été explorées à partir du champ de l’école, dans la triangulation père–mère-enfant et sa répétition parents–enfant–école. Une approche historique de l’institution scolaire a permis de dégager cinq basculements cliniques, témoignant de l’évolution des places assignées aux différents acteurs de l’école et aux idéaux respectifs, entraînant des retombées sur les enjeux subjectifs et intersubjectifs.C’est en suivant l’articulation filiation/affiliation, développée à partir des enjeux de nominations et d’identifications que le rapport au père va se poser. Il s’agira d’interroger la fonction du père imaginaire, empêchée par l’ombre portée de l’Autre maternel. Cet empêchement, adossé aux discours dominants de l’immédiateté effaçant la différence générationnelle, semble s’ériger comme un point de butée sur lequel achoppe le déploiement imaginaire de la fonction phallique au temps de l’enfance. L’empêchement de cet "à venir" porté par la promesse oedipienne, semble mettre en exergue le rapport fraternel, l’autre semblable du temps du complexe d’intrusion. L’Autre social est appelé en suppléance de plus en plus tôt dans le parcours de la subjectivation au temps de l’enfance, parcours qui ne peut se penser sans l’Autre, pour aller de l’UN à l’autre. / The concept of subjectivization guided the progress of this thesis, to understand the reorganizations in the processes of the subjective self-construction of the child, caught in the dominant discourses of our postmodern time.The creation of a differentiated psychic space inherent to the processes of subjectivization, poses at the outset the link to the Other and the link to the others within the family and social institution in which the child evolves. The impact on the subjective construction processes was explored from the angle of the school, according to the father-mother-child triangulation and its repetition in the school-parents-child triangulation. An historical approach of the academic institution has enabled to extricate five clinical changeovers, showing an evolution in the places assigned to the different school partners and the respective idealized roles, affecting the subjective and intersubjective issues.The relationship with the father will arise from the filiation / affiliation articulation, developed from the concepts and issues of naming and identification. The function of the imaginary father (paternal imago) will be examined and seems hindered by the shadow cast by the maternal Other. This impediment, leaning on the dominant discourses of immediacy erasing the generation difference, seems to put up a stumbling block on the imaginary phallic function deployment at the time of childhood. The impediment of this "future to come”, carried by the oedipal promise, seems to highlight the fraternal term, built at the time of the intrusion complex.The social Other is called in substitution, always earlier in the process of subjectivization at the time of the childhood. This process cannot be conceived without the Other, in order to find the path the One to the other.

Ha Wai-Yan. / Thesis (M.Phil.)--Chinese University of Hong Kong, 1999. / Includes bibliographical references (leaves 166-180). / Abstracts in English and Chinese. / Acknowledgements --- p.ii / Abstract --- p.iii / Abbreviations --- p.vi / Table of Contents --- p.vii / Chapter Chapter 1 --- General Introduction --- p.1 / Chapter 1.1 --- "Hstory, cultivation and trade" --- p.2 / Chapter 1.2 --- Botany --- p.4 / Chapter 1.3 --- Chemical Constituents and Pharmacological effects --- p.8 / Chapter 1.4 --- Authentication of Chinese herbal materials --- p.13 / Chapter 1.4.1 --- Morphological marker --- p.15 / Chapter 1.4.2 --- Histological marker --- p.18 / Chapter 1.4.3 --- Chemical marker --- p.20 / Chapter 1.4.4 --- Molecular markers --- p.24 / Chapter 1.4.4.1 --- Protein marker --- p.24 / Chapter 1.4.4.2 --- DNA-based markers --- p.26 / Chapter 1.4.4.2.1 --- PCR-based markers --- p.27 / Chapter 1.4.4.2.1.1 --- Random-primed PCR --- p.28 / Chapter 1.4.4.2.1.2 --- Simple Sequence Repeats (SSR) --- p.30 / Chapter 1.4.4.2.1.3 --- Polymerase Chain Reaction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) --- p.31 / Chapter 1.4.4.2.2 --- Hybridization-based markers --- p.33 / Chapter 1.4.4.2.3 --- Sequencing-based markers --- p.35 / Chapter 1.5 --- Objectives and Strategies of the studies --- p.39 / Chapter Chapter 2 --- General Materials and Methods --- p.40 / Chapter 2.1 --- Reagents and Buffers --- p.41 / Chapter 2.1.1 --- Media for bacterial culture --- p.41 / Chapter 2.1.2 --- Reagents for preparation of competent cells --- p.42 / Chapter 2.1.3 --- Reagents for plasmid DNA preparation --- p.42 / Chapter 2.1.4 --- Reagents for agarose gel electrophoresis --- p.43 / Chapter 2.1.5 --- Reagents for polyacrylamide gel electrophoresis --- p.43 / Chapter 2.1.6 --- Reagents for Southern hybridization --- p.44 / Chapter 2.2 --- Agarose Gel electrophoresis of DNA --- p.46 / Chapter 2.3 --- Purification of PCR products --- p.46 / Chapter 2.3.1 --- From agarose gel using Geneclean® II kit --- p.46 / Chapter 2.3.2 --- Using Microspin´ёØ Column --- p.47 / Chapter 2.4 --- End modification of PCR amplified DNA --- p.47 / Chapter 2.5 --- Preparation of Escherichia coli Competent Cells --- p.48 / Chapter 2.6 --- "Ligation and Transformation of E, coli" --- p.49 / Chapter 2.7 --- Plasmid Preparation --- p.50 / Chapter 2.7.1 --- Minipreparation of plasmid DNA --- p.50 / Chapter 2.7.2 --- Preparation of plasmid DNA using Wizard® Plus SV Minipreps DNA Purification Kit (Promega) --- p.50 / Chapter 2.8 --- Screening for the Presence of insert in plasmid --- p.51 / Chapter 2.8.1 --- Rapid alkaline lysis --- p.51 / Chapter 2.8.2 --- PCR screening --- p.52 / Chapter 2.8.3 --- Restriction digestion of plasmid DNA --- p.53 / Chapter 2.9 --- DNA sequencing --- p.53 / Chapter 2.9.1 --- Plasmid sequencing using T7 Sequencing Kit --- p.53 / Chapter 2.9.2 --- Cycle Sequencing from PCR products or plasmid --- p.54 / Chapter 2.10 --- DNA Sequencing electrophoresis --- p.55 / Chapter 2.10.1 --- Preparation of 6 % polyacrylamide gel solution --- p.55 / Chapter 2.10.2 --- Gel casting --- p.55 / Chapter 2.10.3 --- Electrophoresis of Sequencing Gel --- p.56 / Chapter 2.10.4 --- Autoradiography --- p.57 / Chapter 2.11 --- DNA elution from dried sequencing gel --- p.57 / Chapter 2.12 --- Southern blot analysis --- p.58 / Chapter 2.12.1 --- Restriction digestion of genomic DNA --- p.58 / Chapter 2.12.2 --- Purification of digested DNA and agarose gel electrophoresis --- p.58 / Chapter 2.12.3 --- Capillary transfer of DNA to a Hybond´ёØ N+ nylon membrane --- p.59 / Chapter 2.12.4 --- DNA radiolabeling by nick translation --- p.60 / Chapter 2.12.5 --- Purificaiton of radiolabeled probe by NICK® Spin Column --- p.60 / Chapter 2.12.6 --- Hybridization of DNA --- p.61 / Chapter Chapter 3 --- Plant DNA extraction --- p.62 / Chapter 3.1 --- Introduction --- p.63 / Chapter 3.2 --- Reagents and buffer for total DNA extraction --- p.66 / Chapter 3.3 --- Extraction methods --- p.70 / Chapter 3.3.1 --- Sample preparation --- p.70 / Chapter 3.3.2 --- CTAB extraction method --- p.70 / Chapter 3.3.3 --- Potassium acetate/ SDS extraction method --- p.71 / Chapter 3.3.4 --- GIBRO Plant DNAzol® reagent for genomic DNA isolation --- p.72 / Chapter 3.4 --- Qualitative and quantitative analysis of DNA --- p.74 / Chapter 3.5 --- Results --- p.75 / Chapter 3.6 --- Discussion --- p.78 / Chapter Chapter 4 --- Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) analysis of P. ginseng and P. quinquefolius --- p.81 / Chapter 4.1 --- Introduction --- p.82 / Chapter 4.2 --- Materials and methods --- p.88 / Chapter 4.2.1 --- Plant materials --- p.88 / Chapter 4.2.2 --- Choice of Primers and radiolabeling --- p.89 / Chapter 4.2.3 --- AFLP assay --- p.90 / Chapter 4.2.4 --- Electrophoresis of AFLP fingerprint --- p.91 / Chapter 4.2.5 --- Similarity Index (S.I.) analysis of AFLP profile --- p.91 / Chapter 4.2.6 --- Re-amplification of polymorphic DNA fragments isolated from dried sequencing gel --- p.92 / Chapter 4.2.7 --- Cloning and Sequencing of the AFLP fragments --- p.93 / Chapter 4.2.8 --- Conversion of AFLP marker into Directed Amplification of Minisatellite-region DNA polymorphism (DAMD) marker --- p.93 / Chapter 4.3 --- Results --- p.95 / Chapter 4.4 --- Discussion --- p.102 / Chapter Chapter 5 --- Direct Amplification of Length Polymorphisms (DALP) analysis of P. ginseng and P. quinquefolius --- p.107 / Chapter 5.1 --- Introduction --- p.108 / Chapter 5.2 --- Materials and methods --- p.112 / Chapter 5.2.1 --- Plant materials --- p.112 / Chapter 5.2.2 --- Choice of Primers --- p.113 / Chapter 5.2.3 --- Alternative labelled Amplification reaction --- p.114 / Chapter 5.2.4 --- Electrophoresis of the multi-locus amplification products --- p.114 / Chapter 5.2.5 --- Isolation and Re-amplification of polymorphic DALP fragments from dried sequencing gel --- p.115 / Chapter 5.2.6 --- Cloning and Sequencing --- p.115 / Chapter 5.2.7 --- Conversion of DALP marker to Sequence Tagged Site (STS) marker --- p.116 / Chapter 5.3 --- Results --- p.117 / Chapter 5.4 --- Discussion --- p.135 / Chapter Chapter 6 --- Sequence-characterized amplified region (SCAR): the sequel of random amplified polymorphic DNA (RAPD) --- p.137 / Chapter 6.1 --- Introduction --- p.138 / Chapter 6.2 --- Materials and methods --- p.140 / Chapter 6.2.1 --- Plant materials --- p.140 / Chapter 6.2.2 --- PCR reaction --- p.141 / Chapter 6.2.3 --- Cloning and sequencing --- p.143 / Chapter 6.3 --- Results --- p.144 / Chapter 6.4 --- Discussion --- p.157 / Chapter Chapter 7 --- Outlook --- p.159 / Chapter 7.1 --- Molecular authentication of Chinese medicinal materials --- p.160 / Chapter 7.2 --- Development of molecular markers for Ginseng --- p.161 / Appendix I --- p.164 / Appendix II --- p.165 / References --- p.166