• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 4
  • 4
  • 3
  • 1
  • 1
  • 1
  • Tagged with
  • 16
  • 7
  • 5
  • 5
  • 5
  • 4
  • 4
  • 4
  • 3
  • 3
  • 3
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
1

Utilização de abordagens moleculares in vivo no estudo de homólogos do fator de iniciação da tradução 4G (elF4G) de tripanosomatídeos

Maria Nascimento Moura, Danielle January 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:04:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6198_1.pdf: 3495809 bytes, checksum: 29b3819f257869527a19c6ce13a6eb0c (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os tripanosomatídeos são protozoários causadores de infecções humanas e animais, dentre elas a Doença de Chagas (T. cruzi), Doença do Sono (T. brucei) e as várias formas de Leishmaniose (Leishmania sp.). Estes parasitas possuem algumas características moleculares bem distintas quando comparados aos outros eucariotos, como a ausência de controle de expressão gênica durante a etapa da transcrição dos mRNAS. Portanto, os eventos pós-transcricionais, incluindo a tradução, são pontos fundamentais de regulação da expressão gênica nesses organismos. Baseado nesses fatos, partiu-se para a identificação de homólogos a fatores que atuam durante o processo de iniciação da tradução em tripanosomatídeos, focando os estudos no complexo eIF4F. Esse complexo (formado pelas subunidades eIF4A, eIF4E e eIF4G) atua na etapa de reconhecimento do mRNA e sua associação ao ribossomo. Em relação aos homólogos do eIF4G, foram identificadas cinco seqüências em L. major e T. brucei, que atualmente estão em diferentes fases de caracterização. Visando a obtenção de maiores informações que complementem os resultados in vitro obtidos em trabalhos paralelos, foram realizados ensaios de análise in vivo, que incluíram as técnicas de interferência de RNA e de localização celular de proteínas de fusão fluorescentes, as quais foram aplicadas a três dos cinco homólogos de T. brucei (TbEIF4G3-5). Com isso, foi identificada a presença das proteínas no citoplasma da célula de T. brucei e também que os três homólogos em estudo são essenciais à sua viabilidade celular, mas que apresentam perfis diferenciados quando submetidos ao RNAi. Apesar de importantes, esses resultados mostram ainda a necessidade de ensaios complementares que continuem a caracterização dessas proteínas e elucidem seu papel na iniciação da tradução dos tripanosomatídeos
2

Análise da expressão e localização subcelular dos homólogos TbEIF4G1 e TbEIF4G2 do fator de iniciação da tradução eIF4G de Trypanosoma brucei

Pontes de Lima, Rodrigo 31 January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:02:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3639_1.pdf: 1283864 bytes, checksum: c19ef1285163584deb577abe247a01c6 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os tripanosomatídeos, agentes causadores de enfermidades de impacto mundial, se destacam dos demais eucariotos por apresentarem um conjunto de processos moleculares únicos, inclusive a ausência de controle da sua transcrição. Dessa forma, o controle de sua expressão gênica deve ocorrer após a transcrição. Assim, um ponto importante de controle é a iniciação da tradução, um processo ainda pouco conhecido nos tripanosomatídeos. Em eucariotos, de forma geral, esta começa com a ligação ao mRNA do complexo eIF4F, formado pelos polipeptídeos: eIF4E, eIF4A e eIF4G. A subunidade eIF4G atua como proteína estruturadora do complexo se ligando às demais subunidades e a outros fatores de tradução. Em Trypanosoma brucei foram identificados cinco homólogos do eIF4G, conservados em Leishmania major, denominados de TbEIF4G1-5. Este trabalho buscou contribuir com a caracterização dos homólogos TbEIF4G1 e TbEIF4G2 a partir da amplficação e clonagem dos seus genes, completos e/ou fragmentos contendo seu domínio HEAT central, em vetor de expressão bacteriano. A análise das sequências clonadas apresentou divergências genéticas em relação às descritas na literatura, mas, a princípio, de baixo significado biológico. Em seguida, realizou-se a expressão das respectivas proteínas recombinantes e obtenção de soro policlonal em coelhos. Estes soros foram utilizados em ensaios de western-blot e imunocitoquímica para analisar a expressão das proteínas nativas e sua localização subcelular. Os mesmos genes foram também clonados em vetor plasmidial para superexpressão da proteína recombinante fusionada à EYFP em T. brucei. Observou-se que o TbEIF4G1 é expresso na fase procíclica, mas é raro ou ausente na sanguínea. Já o TbEIF4G2 é expresso raramente ou ausente em ambas as fases. Ambas as proteínas se mostraram exclusivamente citoplasmáticas, o que reforça um papel na tradução que merece ser melhor estudado com as ferramentas, proteínas e anticorpos, produzidos neste estudo
3

Análise da participação de dois homólogos do fator elF4G na iniciação da síntese protéica de Trypanosoma brucei

Maria Nascimento Moura, Danielle 31 January 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:03:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo9598_1.pdf: 7683157 bytes, checksum: 0a5c0a98daf12b68a6ab6903f4d4966b (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os tripanossomatídeos são protozoários parasitas que incluem patógenos humanos dos gêneros Trypanosoma e Leishmania e que apresentam como característica marcante a presença de mecanismos moleculares diferenciados, como a regulação da expressão gênica basicamente pós-transcricional. Nestes organismos a tradução pode desempenhar um papel importante para esta regulação, principalmente durante a etapa de iniciação, quando ocorrem interações controladas por fatores protéicos que permitem o recrutamento do ribossomo para a ligação aos mRNAs a serem traduzidos. De fato, indícios obtidos até o momento sugerem que a iniciação da síntese proteica nestes parasitas pode incluir processos diferenciados daqueles observados em outros organismos. Nos eucariotos em geral, o complexo de iniciação da tradução eIF4F desempenha várias funções relacionadas ao recrutamento do ribossomo ao mRNA e é formado por um componente central o fator eIF4G, além de seus parceiros eIF4E e eIF4A. Em L. major, cinco homólogos do fator eIF4G foram identificados (LmEIF4G1- 5), todos conservados em T. brucei (TbEIF4G1-5). Em trabalhos anteriores, dois destes homólogos (LmEIF4G3 e LmEIF4G4) apresentaram propriedades compatíveis com uma atuação na tradução. Neste trabalho, seus ortólogos de T. brucei, TbEIF4G3 e TbEIF4G4, foram selecionados com o intuito de continuar a sua caracterização funcional utilizando agora técnicas in vivo. Em um primeiro momento, reações de imunofluorescência confirmaram a localização citoplasmática das duas proteínas. Em seguida, em ensaios de depleção por RNAi, ambas se mostraram essenciais à viabilidade do parasita, embora apenas no caso do TbEIF4G3 tenha se observado uma diminuição significativa da tradução imediatamente após sua depleção. Ensaios de imunoprecipitação confirmaram interações específicas com homólogos do eIF4E (TbEIF4G3 com TbEIF4E4 e TbEIF4G4 com TbEIF4E3) e ainda a interação entre TbEIF4G3 e um homólogo da proteína de ligação à cauda poli-A (TbPABP1). Para ambos os homólogos, células procíclicas expressando proteínas com mutações em motivos putativos de ligação ao eIF4E apresentaram pequena redução no crescimento. Já em relação ao motivo de ligação ao eIF4A, modificações em sua sequência no TbEIF4G3 levaram a uma forte redução no crescimento de células em cultura, mas nenhum efeito foi observado em mutações equivalentes no TbEIF4G4. Para investigar mais diretamente o papel destas proteínas na tradução, ensaios com mRNAsrepórteres foram desenvolvidos, mas os dados preliminares não se mostraram úteis na identificação da função individual das proteínas avaliadas. Entretanto, vários vetores de transfecção e uma nova linhagem celular com expressão constitutiva da enzimarepórter luciferase foram obtidos e poderão ser usados na otimização dos ensaios e investigação da atuação dos homólogos selecionados em trabalhos futuros. Em resumo, os resultados confirmam a existência de dois complexos eIF4F distintos, mediados por motivos de interação eIF4G/eIF4E diferenciados, e ressaltam o papel crítico do TbEIF4G3 na manutenção da viabilidade e da síntese proteica em T. brucei
4

Caracterização de possíveis homólogos aos fatores de iniciação da tradução eIF4G e eIF4A de Leishmania major

Robson de Souza Reis, Christian January 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:06:54Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6324_1.pdf: 1187846 bytes, checksum: fab93aac3ac6d96c08d4c73f504e7338 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Em eucariotos, a iniciação da tradução é um processo essencial de regulação pós-transcricional da expressão gênica. Neste processo, atuam proteínas designadas eIFs (fatores de iniciação da tradução). Destas destaca-se o complexo eIF4F eIF4E, eIF4A e eIF4G que permite associar o mRNA ao ribossomo. Identificamos no genoma de Leishmania major seqüências que apresentam homologia aos componentes do eIF4F. Este trabalho contempla a caracterização de um homólogo do eIF4A (LmeIF4A2) e três homólogos eIF4G (LmeIF4G1-3). O gene LmeIF4A2 foi clonado, expresso e utilizado na produção de anticorpos. Ensaios de Western-blot sugeriram não haver expressão do LmeIF4A2 na fase promastigota de Leishmania major. Em seguida realizamos construções com os LmeIF4G1-3, fusionando-os a GST, permitindo a realização de ensaios de pull down visando investigar sua associação com as proteínas LmeIF4A1-2. O LmeIF4A2 não interage com nenhum dos LmeIF4G1-3 e o LmeIF4A1 interage especificamente com o LmeIF4G3. Em outra etapa produzimos anticorpos contra as proteínas LmeIF4G1-3 para avaliar sua expressão na forma promastigota do parasita. A expressão do LmeIF4G3 foi confirmada, todavia não detectamos a expressão dos LmeIF4G1-2. A interação eIF4G/eIF4E foi investigada em ensaios onde homólogos LmeIF4G1-3 foram incubados a homólogos LmeIF4E1-3, para tentar reconstituir parcialmente o complexo eIF4F in vitro, e testados quanto a sua afinidade pelo cap sintético. Estes resultados se mostraram inconclusivos. A utilização de novas abordagens e a caracterização dos demais fatores será importante na elucidação da tradução nestes protozoários
5

Estudo de novas propriedades associadas à regulação e função de complexos do tipo eIF4F em Trypanosoma brucei

MALVEZZI, Amaranta Muniz 09 March 2015 (has links)
Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-08-12T13:39:46Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) tese amaranta.pdf: 1596892 bytes, checksum: 5d4ba09b331b3e559fa3f104e519a054 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-12T13:39:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) tese amaranta.pdf: 1596892 bytes, checksum: 5d4ba09b331b3e559fa3f104e519a054 (MD5) Previous issue date: 2015-03-09 / CNPq / A iniciação da tradução é a etapa mais complexa de um processo crítico para a sobrevivência dos seres vivos, onde se destaca a atuação do complexo eIF4F, formado pelas subunidades eIF4E, eIF4A, e eIF4G. Seis homólogos de eIF4E (EIF4E1 a 6) e cinco de eIF4G (EIF4G1 a 5) foram identificados no protozoário Trypanosoma brucei. Este trabalho buscou contribuir no estudo de complexos do tipo eIF4F neste patógeno, inicialmente analisando a expressão de subunidades de complexos já definidos, formado pelos EIF4E4/EIF4G3 e EIF4E3/EIF4G4. Observou-se que, à exceção do EIF4G3, essas subunidades são representadas por isoformas originárias de eventos de fosforilação. No caso do EIF4E4, esses eventos estão associados às fases de crescimento do microorganismo e as fosforilações dos EIF4E3 e EIF4E4 são direcionadas às suas extremidades N-terminais. A etapa seguinte compreendeu o estudo de duas proteínas hipotéticas, encontradas com novos complexos baseados nos EIF4E5/EIF4G1 e EIF4E6/EIF4G5 (Tb117.5 e TbG5-IP). Essas são homólogas de enzimas associadas a formação da extremidade 5’ dos mRNAs, porém apresentaram localização citoplasmática. Sua associação aos referidos complexos foi investigada e enquanto a Tb117.5 se associa com uma subpopulação do complexo EIF4E5/EIF4G1, a TbG5-IP se mostrou parte integrante do complexo EIF4E6/EIF5G5. A depleção por RNA interferência dessas proteínas não alterou a viabilidade celular apesar do insucesso na obtenção de deleção dupla dos seus genes. Os dados obtidos sugerem uma divergência funcional nesses complexos ainda não encontrada em outros eucariotos. / The initiation of translation is the most complex stage of a critical process required for the survival of all living beings and which requires the activity of the eIF4F complex, formed by the eIF4E, eIF4A, and eIF4G subunits. Six homologues of eIF4E (EIF4E1 to 6) and five of eIF4G (EIF4G1 to 5) were identified in the protozoan Trypanosoma brucei. This study aimed to contribute to the study of eIF4F-like complexes within this pathogen, initially analyzing the expression of subunits found in already defined complexes, formed by EIF4E4/EIF4G3 and EIF4E3/EIF4G4. Except for EIF4G3, all these subunits are represented by multiple isoforms originating from phosphorylation events. For EIF4E4, these events are associated with the microorganism’s growth phase and the phosphorylations of both EIF4E3 and EIF4E4 are directed to their N- terminal ends. The next step included the study of two hypothetical proteins found within new complexes based on EIF4E5/EIF4G1 and EIF4E6/EIF4G5 (Tb117.5 and TbG5-IP). These are homologous to enzymes associated with the formation of the mRNAs’ 5’ end but showed cytoplasmic localization. Their association with the new complexes was investigated and while Tb117.5 is associated with a subset of the EIF4E5/EIF4G1 complex, TbG5-IP proved to be an integral part of the EIF4E6/EIF5G5 complex. The depletion by RNA interference of these proteins did not affect cell viability despite the failure to achieve a double deletion of their genes. The data suggest a functional divergence in these complexes that is not found in other eukaryotes.
6

Estudo de novas propriedades associadas à regulação e função de complexos do tipo eIF4F em Trypanosoma brucei

MALVEZZI, Amaranta Muniz 09 March 2015 (has links)
Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-08-12T13:48:49Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) tese amaranta.pdf: 1596892 bytes, checksum: 5d4ba09b331b3e559fa3f104e519a054 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-12T13:48:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) tese amaranta.pdf: 1596892 bytes, checksum: 5d4ba09b331b3e559fa3f104e519a054 (MD5) Previous issue date: 2015-03-09 / CNPq / A iniciação da tradução é a etapa mais complexa de um processo crítico para a sobrevivência dos seres vivos, onde se destaca a atuação do complexo eIF4F, formado pelas subunidades eIF4E, eIF4A, e eIF4G. Seis homólogos de eIF4E (EIF4E1 a 6) e cinco de eIF4G (EIF4G1 a 5) foram identificados no protozoário Trypanosoma brucei. Este trabalho buscou contribuir no estudo de complexos do tipo eIF4F neste patógeno, inicialmente analisando a expressão de subunidades de complexos já definidos, formado pelos EIF4E4/EIF4G3 e EIF4E3/EIF4G4. Observou-se que, à exceção do EIF4G3, essas subunidades são representadas por isoformas originárias de eventos de fosforilação. No caso do EIF4E4, esses eventos estão associados às fases de crescimento do microorganismo e as fosforilações dos EIF4E3 e EIF4E4 são direcionadas às suas extremidades N-terminais. A etapa seguinte compreendeu o estudo de duas proteínas hipotéticas, encontradas com novos complexos baseados nos EIF4E5/EIF4G1 e EIF4E6/EIF4G5 (Tb117.5 e TbG5-IP). Essas são homólogas de enzimas associadas a formação da extremidade 5’ dos mRNAs, porém apresentaram localização citoplasmática. Sua associação aos referidos complexos foi investigada e enquanto a Tb117.5 se associa com uma subpopulação do complexo EIF4E5/EIF4G1, a TbG5-IP se mostrou parte integrante do complexo EIF4E6/EIF5G5. A depleção por RNA interferência dessas proteínas não alterou a viabilidade celular apesar do insucesso na obtenção de deleção dupla dos seus genes. Os dados obtidos sugerem uma divergência funcional nesses complexos ainda não encontrada em outros eucariotos. / The initiation of translation is the most complex stage of a critical process required for the survival of all living beings and which requires the activity of the eIF4F complex, formed by the eIF4E, eIF4A, and eIF4G subunits. Six homologues of eIF4E (EIF4E1 to 6) and five of eIF4G (EIF4G1 to 5) were identified in the protozoan Trypanosoma brucei. This study aimed to contribute to the study of eIF4F-like complexes within this pathogen, initially analyzing the expression of subunits found in already defined complexes, formed by EIF4E4/EIF4G3 and EIF4E3/EIF4G4. Except for EIF4G3, all these subunits are represented by multiple isoforms originating from phosphorylation events. For EIF4E4, these events are associated with the microorganism’s growth phase and the phosphorylations of both EIF4E3 and EIF4E4 are directed to their N- terminal ends. The next step included the study of two hypothetical proteins found within new complexes based on EIF4E5/EIF4G1 and EIF4E6/EIF4G5 (Tb117.5 and TbG5-IP). These are homologous to enzymes associated with the formation of the mRNAs’ 5’ end but showed cytoplasmic localization. Their association with the new complexes was investigated and while Tb117.5 is associated with a subset of the EIF4E5/EIF4G1 complex, TbG5-IP proved to be an integral part of the EIF4E6/EIF5G5 complex. The depletion by RNA interference of these proteins did not affect cell viability despite the failure to achieve a double deletion of their genes. The data suggest a functional divergence in these complexes that is not found in other eukaryotes.
7

Regulation of Mnk1 by p38α MAPK in Stress Mediated Translation Initiation

Gemberling, Sarah Lawson January 2014 (has links)
<p>Multiple signaling pathways control protein synthesis by modulating translation initiation factors. Map Kinase Integrating Kinase 1 (Mnk1) relays signals to its major downstream target eIF4E. Activation of Mnk1 and subsequent phosphorylation of eIF4E results in changes in translation rates for subsets of mRNAs. Both the Erk1/2 and p38 MAPK pathways activate Mnk1 meaning that Mnk1 responds to growth signals through Erk1/2 and stress signals through p38 MAPK. However, it is not clear how Mnk1 mediates translational changes specific to each pathway. We investigated the activation of Mnk1 by stress and cytokines through the p38 MAPK pathway. We found that of the four different p38 MAPK isoforms, p38&alpha; alone controls acute stress and cytokine signaling to translation machinery. Furthermore, this regulatory axis is greatly diminished in neurons. We discovered that p38&alpha; expression is repressed in the brain due to two neuron-selective microRNAs, miR-124 and -128. Next, we investigated the mechanism of p38&alpha; mediated Mnk1 activation to see if it differed from Erk1/2 mediated activation. Looking at the induced binding of Mnk1 to eIF4G, we found that the dissociation rate varies depending on the activating pathways. This shows that Mnk1 is not a true convergence point of p38 and Erk1/2 MAPK pathways resulting in identical downstream effects, but that Mnk1 mediates pathway specific effects on translation factors.</p> / Dissertation
8

eIF4E Phosphorylation Balances Cap-dependent and Cap-independent Translation Initiation

Goetz, Christian January 2011 (has links)
<p>Signaling pathways converge on the translation machinery and influence protein synthesis globally or specifically on certain classes of transcripts. The experiments described in this thesis focus on regulation of translation initiation through the cap-binding protein eIF4E. </p><p>Aberrant regulation of eIF4E has important roles in several pathologies and, most notably, in tumorigenesis. Nevertheless, the understanding of the molecular con-sequences of changes in eIF4E activity remains incomplete. We employ a cell-free system to demonstrate that eIF4E function is required for efficient cap-dependent translation but inhibitory for translation of both cellular and viral RNAs relying on cap-independent mechanisms. Furthermore, we show that phosphorylation of eIF4E favors cap-independent translation in vitro. </p><p>To verify that our findings in the cell-free system are representative of an in vivo system, we also analyzed growth of an oncolytic poliovirus, relying purely on cap-independent translation, in the context of varying activity of signaling pathways. Data obtained from this virus helps to confirm that phosphorylation of eIF4E does indeed result in increased cap-independent translation. Additionally, these experiments provide important information for the clinical application of this oncolytic poliovirus, as they help to explain virus specificity and might allow for rational patient selection.</p> / Dissertation
9

Příprava kvasinkového systému pro studium lidské iniciace translace / Preparation of yeast system for investigation of the human translation initiation

Holásková, Lucie January 2013 (has links)
Protein synthesis is principally regulated at the initiation stage in which eIF4F complex plays an important role. The eIF4F complex contains three subunits - eIF4A, eIF4E and eIF4G. The eIF4E is cap binding protein, the eIF4A is RNA dependent helicase which unwinds secondary structures at mRNA and scaffolding eIF4G protein. The interaction with other translation initiation factors is important for protein synthesis. The goal of my thesis was to create a new Saccharomyces cerevisiae yeast strain with the human eIF4F factor. Firstly I replaced yeast eIF4E protein with human eIF4E protein. I used a cre/loxP recombination to prepare yeast strains with deleted genes eIF4GI (huΔ4G1) and eIF4GII (huΔ4G2). Characterization of the new yeast strains showed that the human eIF4E protein replaced yeast ortholog factor better than the eIF4E protein from yeast Candida albicans. First experiments showed putative role of the eIF4GII protein during the cell growth under the temperature and osmotic stress. Key words: translation initiation, eIF4E, eIF4G, Saccharomyces cerevisiae
10

Effet des microARNs sur la traduction cellulaire et virale / Regulation of cellular and viral translation by microRNAs

Limousin, Taran 20 December 2013 (has links)
Les microARN jouent un grand rôle dans la régulation de l'expression des gènes bien que leur mécanisme d'action soit encore sujet à débat. Des premières études chez le vers C. elegans aux différents systèmes in vitro qui ont ensuite été développés, plusieurs modèles ont été proposés, comme l'inhibition de la traduction au niveau de l'initiation ou de l'élongation, et la déstabilisation du transcrit par déadénylation. Cependant, à la lumière des découvertes récentes, un consensus semble apparaître et indique que les miARN inhiberaient d'abord la traduction avant d'induire la déadénylation du transcrit, provoquant ainsi sa dégradation prématurée. D'autre part, le blocage traductionnel semble impliquer à la fois la coiffe en 5' et la queue poly(A) en 3' de l'ARNm ainsi que les facteurs qui s'y lient, c'est à dire le facteur d'initiation de la traduction eIF4F et la Poly(A) Binding Protein (PABP). Ces résultats ont conduit au modèle selon lequel, les miARN seraient capables d'empêcher la liaison entre ces deux facteurs et donc la circularisation du transcrit qui est essentielle à la fois au recrutement de la machinerie traductionnelle et à la stabilité de l'ARNm. Afin de mieux comprendre ce mécanisme, notre laboratoire a développé un système in vitro basé sur l'utilisation du lysat de réticulocytes de lapin qui permet d'étudier l'effet traductionnel des miARN en s'affranchissant de dégradation du transcrit. L'étude de l'effet de drogues et d'enzymes virales, capables de bloquer spécifiquement la fonction de chaque facteur d'initiation dans ce système, a permis de déterminer le rôle clé de eIF4G et PABP dans l'inhibition traductionnelle par les miARN. Cependant, leur interaction n'est pas requise et le blocage s'effectue plutôt au cours de l'étape de balayage de la région 5' non codante par la petite sous-unité ribosomique. En parallèle de cette étude in vitro, un travail sur des lignées cellulaires a permis de déterminer l'influence de la queue poly(A) sur l'effet miARN. De façon très surprenante, l'expression des transcrits non polyadénylés n'est plus inhibée et est même stimulée par les miARN. Cet effet est dépendant de l'association du domaine MIF4G du facteur eIF4G avec le facteur eIF3, ce qui suggère qu'en l'absence de queue poly(A), les miARN seraient capables de stimuler le recrutement de la petite sous-unité ribosomique sur l'ARNm. L'ensemble de ces résultats révèle la complexité de l'effet miARN sur la traduction et ouvre de nouvelles voies / The mechanism by which microRNAs (miRNAs) can control gene expression has been a great matter of debate. From the first studies in worm to the in vitro systems that are used today, many models have been proposed that include regulation at the level of translation or at the level of mRNA stability by controlling 3' deadenylation and decay. Recent studies provided a consensus model of all these discrepancies and suggested that translation inhibition occured first and is followed by deadenylation and further degradation of the target transcript. Moreover, translation silencing seems to occur at the initiation level, and requires eIF4F and PABP initiation factors. This led to the hypothesis that miRNAs could interfere with the interaction between these two factors thus affecting the circularisation of the mRNA, which is essential for translation efficiency. In order to gain insight into this mechanism, we have used an in vitro system based on the rabbit reticulocyte lysate that fully recapitulates miRNA effects on translation with virtually no effect on deadenylation and decay. Using this system and a wide spectrum of translational inhibitors, we have narrowed down the step of initiation at which repression is exerted and we found that miRNAs affect mainly ribosomal scanning. This effect requires the presence of both eIF4G and PABP but does not rely on their physical interaction. Further analysis of miRNA repression in cells revealed that the poly(A) tail was an absolute requirement for miRNA action. To most of our surprise, we observed that removal of the poly(A) resulted in a shift from repression to stimulation of mRNA expression. This effect seems to require the middle domain of eIF4G and the presence of the Ago proteins. Altogether, these results reveal the complexity of miRNA effect and open new prospects on translation regulation

Page generated in 0.2392 seconds