Área de endemismo ou elemento biótico é uma região geográfica que apresenta congruência distribucional entre táxons. Não há um padrão aceito universalmente para delimitação de áreas de endemismo e, portanto, várias metodologias são usadas para sua identificação. Nesta dissertação, propomos uma comparação integrada de alguns métodos de análises de endemismo, com base em dados de distribuição hipotéticos e reais. Desta forma, este estudo tem como objetivos: (1) comparar a Análise de Parcimônia de endemicidade (PAE), a Análise de endemicidade (EA) e um novo método de codificação que propomos a Análise de Distribuições de Três-Itens (3ID), avaliando sua performance com base na capacidade de identificar padrões hipotéticos predefinidos de áreas de endemismo, representando áreas não conflitantes, aninhadas e sobrepostas; (2) analisar os padrões de distribuição de 214 espécies de hidrozoários bentônicos, pelágicos e benthopelágicos não-sifonóforos do Oceano Atlântico Sul Ocidental (OASO), usando três métodos biogeográficos para testar hipóteses anteriores de regionalização biogeográfica e avaliar o performance da PAE, a EA e a 3ID com conjuntos de dados reais. No capítulo 2, intitulado “Comparison of analysis of endemism procedures based on hypothetical distributions”, nós comparamos a PAE, EA e 3ID e encontramos que a 3ID tem o maior percentual de sucesso na recuperação de áreas de endemismo predefinidas. Adicionalmente, a EA é o único método capaz de recuperar padrões sobrepostos, porém também encontra padrões espúrios. Nós sugerimos, portanto, que a melhor opção para identificação de áreas de endemismo é o uso de 3ID e EA em conjunto. No capítulo 3, intitulado “Biogeographic patterns of benthic and planktonic hydrozoans from the southwestern Atlantic Ocean”, nós utilizamos dados distribucionais de 214 espécies de hidrozoários bentônicos, pelágicos e bentopelágicos não-sifonóforos do OASO (20°-60°S, 33°-75°W), os quais foram organizados em diferentes matrizes (concatenada, bentônica, pelágica, e bentopelágica) de acordo com as diferentes estratégias de ciclo de vida em Hydrozoa. Todas as matrizes foram analisadas por meio da PAE, EA e 3ID. Os resultados mostram três padrões biogeográficos gerais: (1) Tropical (2) Temperado-Quente, e (3) Temperado-Frio. Os padrões obtidos variam de acordo com o tipo de ciclo de vida em Hydrozoa, demonstrando a importância de analisar-se separadamente conjuntos de dados de espécies com diferentes estratégias de reprodução. Cada método teve um desempenho diferente e, portanto, concluímos que o uso de 3ID e EA em conjunto é a melhor opção para inferir padrões biogeográficos marinhos / Areas of endemism or biotic elements comprise regions delimited by more than one taxon with coincident patterns of distribution. There is not an accepted universal protocol for delimitation of areas of endemism, and therefore, they are identified by several different methods. In this study, we propose an integrative comparison of different methods for identification of areas of endemism based on data of hypothetical and real distributions. Therefore, the general aims of this study are: (1) to compare the Parsimony Analysis of Endemicity (PAE), the Endemicity Analysis (EA) and a new coding method that we propose, the Three-Item Analysis of Distributions (3ID) to contrast their performance based on their ability to identify hypothetical predefined areas of endemism representing non-conflicting, nested and overlapping patterns; (2) to analyze the patterns of distribution of benthic, pelagic and benthopelagic non-siphonophore hydrozoans of the Southwestern Atlantic Ocean (SWAO), to test previous biogeographic hypotheses of regionalization for the area and to evaluate the performance of the endemicity methods based on real datasets. In chapter 2, entitled “Comparison of analysis of endemism procedures based on hypothetical distributions”, we compared the performance of PAE, EA and 3ID, and we found that 3ID has the greatest percentage of success in retrieving predefined areas of endemism. EA is the only method that recovers overlapping patterns, but it can also find spurious patterns. We recommend the use of 3ID together with EA as the best available option for hypothesizing areas of endemism. In chapter 3, entitled “Biogeographic patterns of benthic and planktonic hydrozoans from the southwestern Atlantic Ocean”, we used the distribution 214 hydrozoan species from the SWAO (20°-60°S, 33°-75°W), which were organized in different data matrices (concatenated, benthic, pelagic, and benthopelagic) according to the different life cycle strategies in Hydrozoa. All matrices were analyzed through PAE, EA and 3ID. The resulting areas showed three broad biogeographic patterns: (1) Tropical, (2) Warm-Temperate and (3) Cold-Temperate. The output patterns varied according to the life cycle of hydrozoan species, demonstrating the importance in analyzing separately data of species with different strategies of life cycle. Each method performed differently, and we concluded that the use of 3ID and EA together is the best approach to infer strong biogeographic patterns for the marine realm

Made available in DSpace on 2015-04-17T14:55:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 6612338 bytes, checksum: 944e87b47204fb137759922d590127af (MD5) Previous issue date: 2013-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Atlantic Forest is one of the richest regions of the world, both in species diversity, as in endemism. Due to this and to the degree of devastation, a few years ago, this biome was considered one of the 25 worldwide biodiversity hotspots. However, the historical relationships between different sectors of the Atlantic Forest are poorly understood. A critical step in that knowledge is the delimitation of the areas of endemism, which are basic units for biogeographic analyzes. Studies performed in this subject have advanced enough, both south and southeastern Atlantic Forest, by using the distribution patterns of harvestmen which occur into this region, nevertheless, a gap remains regarding to the northeastern Atlantic Forest. Therefore, this study aims to delimit the areas of endemism in Atlantic Forest north São Francisco river, by using Opiliones species distributions, also comparing the obtained results by different methodologies and finally evaluating the influence of the size of the cells on the results. In total, we used 1581 occurrences of 224 species, and of these, 18 are not yet described. The occurrences were obtained of field collecting, literature and museums. We used three numeric methods to search for areas of endemism that work using the occurrence of species in a set of cells on a grid: Endemicity Analysis (NDM), Parsimony Analysis of Endemicity (PAE) and Biotic Element Analysis (BEA). For the three methods were applied three grids: a less detailed grid (2° X 2°), a intermediated grid (1° X 1°) and one more detailed grid (with 0,5° X 0,5° cells). Afterwards, the areas of endemism were delimited by applying on the results of the numeric analyzes a protocol based on a number of combined criteria derived from areas of endemic concepts described in the literature. Altogether, thirteen endemism areas were delimited for Atlantic Forest, and, three of these correspond to the northeastern Atlantic Forest: Area of Endemism Bahia (BA), Area of Endemism Brejos Cearenses (BCE) and Area of Endemism Pernambuco (PE). The results from NDM and PAE were similar, whereas BEA results were entirely different and arbitrary. The size of cells had influences in the analysis, both on the number of areas found, as the number of cells included in each area. The largest amount of data used, turned limited areas into more robust, especially those of the northeastern Atlantic Forest, if compared to previous work. These areas, as well as those from south and southeastern Atlantic Forest probably correspond to areas of Pleistocene forest refuge, when the entire Atlantic Forest experienced cycles of expansion and contraction. These oscillations are associated with the cycles of glaciation and warming that occurred during the Quaternary, where, the expansion of northeastern Atlantic Forest boundaries probably led it to a contact with the Amazon Rainforest. Other likely causes were marine transgressions or tectonism, in this case, applied to the region of Baía de Todos os Santos. / A Mata Atlântica é uma das regiões mais ricas do mundo, tanto em diversidade de espécies quanto em endemismo. Devido a isso e ao grau de devastação desse bioma, há alguns anos ela foi enquadrada como um dos 25 hotspots mundias de biodiversidade. Entretanto, as relações históricas entre os diferentes setores da Mata Atlântica são pouco conhecido. Uma etapa fundamental é a delimitação das áreas de endemismo, que são unidades básicas para análises biogeográficas. Os estudos nessa área avançaram bastante na Mata Atlântica do sul e sudeste com o uso das distribuições dos opiliões que ocorrem nessa região, entretanto, permanece uma lacuna com relação à Mata Atlântica nordestina. Diante disso, o objetivo do presente estudo foi delimitar as áreas de endemismo da Mata Atlântica localizada ao norte do rio São Francisco, utilizando as distribuições de espécies de Opiliones, além de comparar os resultados obtidos pelas diferentes metodologias utilizadas e avaliar a influência do tamanho das células sobre os resultados. Ao todo, foram utilizadas 1581 ocorrências de 224 espécies, sendo que, dessas, 18 ainda não estão descritas. As ocorrências foram obtidas por coletas, revisão de literatura e visita a museus. Foram utilizados três métodos numéricos para busca de áreas de endemismo que trabalham usando a ocorrência das espécies num conjunto de células de uma grade: a Análise de Endemicidade (NDM), a Análise de Parcimônia de Endemicidade (PAE) e a Análise de Elementos Bióticos (BEA). Para os três métodos foram aplicados três grades: uma grade menos detalhada (2° X 2°), uma grade intermediária (1° X 1°) e uma grade mais detalhada (com células de 0,5° X 0,5°). Em seguida, as áreas de endemismo foram delimitadas aplicando, sobre os resultados das análises numéricas, um protocolo baseado numa série de critérios combinados que, por sua vez, derivam de conceitos de áreas de endemismo descritos na literatura. Ao todo, foram delimitadas treze áreas de endemismo para a Mata Atlântica, sendo que, dessas, três correspondem à Mata Atlântica nordestina: a Área de Endemismo Bahia (BA), a Área de Endemismo Brejos Cearenses (BCE) e a Área de Endemismo Pernambuco (PE). Os resultados obtidos pela NDM e pela PAE foram similares, enquanto que a BEA apresentou resultados completamente diferentes e arbitrários. O tamanho das células utilizadas teve influência nas análises, tanto na quantidade de áreas encontradas, quanto na quantidade de células incluída em cada área. A maior quantidade de dados utilizada tornou áreas delimitadas mais robustas, sobretudo aquelas da Mata Atlântica nordestina, quando comparada a trabalhos anteriores. Essas áreas, assim como aquelas da Mata Atlântica sul e sudeste, provavelmente correspondem às áreas de refúgios florestais pleistocênicos, quando a Mata Atlântica inteira experimentou ciclos de expansão e retração. Essas oscilações estão associadas aos ciclos de glaciação e aquecimento que ocorreram durante o Quaternário, sendo que, na Mata Atlântica nordestina, a expansão de seus limites provavelmente ocasionou um contato com a Floresta Amazônica. Outras causas prováveis foram às transgressões marinhas ou tectonismo, no caso, aplicados a região da Baía de Todos os Santos.

A esquistossomose mansoni apresenta-se como uma doenÃa parasitÃria de importÃncia para a saÃde pÃblica, nÃo sà por sua ampla distribuiÃÃo no mundo, mas tambÃm pelos impactos causados por ela nas atividades da populaÃÃo infectada. A esquistossomose deve ser analisada como um processo dependente da interaÃÃo de vÃrios fatores, como fatores ambientais, sociais e econÃmicos, importantes para reduzir a transmissÃo da doenÃa bem como para interromper o ciclo do parasito. O objetivo do estudo foi avaliar a influÃncia de fatores ambientais e socioculturais na transmissÃo da esquistossomose em Ãrea de baixa endemicidade no Estado do CearÃ, na localidade do Planalto do Cajueiro, atravÃs da anÃlise de questionÃrios aplicados no ano de 2009 e em 2012. O estudo foi desenvolvido em duas etapas. A primeira consiste em um estudo transversal, onde foram analisados 167 questionÃrios dos pacientes que forneceram material sorolÃgico para a realizaÃÃo do mÃtodo ELISA, que serviu como triagem. A segunda etapa consiste em um estudo de caso controle, onde foram aplicados e analisados questionÃrios em 54 indivÃduos ELISA reativo e nÃo reativo que entregaram amostra fecal para anÃlise. As anÃlises dos questionÃrios das 167 pessoas mostraram que a maioria delas eram adultos jovens (19,76% na faixa etÃria de 15 a 25anos e 29,94% entre 26 a 46 anos), do sexo feminino (67,66%) e que 29% nÃo eram naturais de Maranguape. Em torno de 52,5% dos pacientes que afirmaram utilizar Ãgua do rio, tiveram resultado Elisa reativo para esquistossomose. Na segunda etapa, observou-se que a diferenÃa entre os sexos masculinos e femininos era insignificante, nos casos positivos para esquistossomose. Com relaÃÃo à escolaridade, a maioria (68,32%) possuÃa apenas o ensino fundamental incompleto. Nas associaÃÃes entre variÃveis ambientais e resultado positivo para a doenÃa, observou-se que 34,2% dos indivÃduos responderam nÃo ter contato com coleÃÃes hÃdricas e 37,5% disseram que tiveram contato. Este ponto ainda està em anÃlise mais aprofundada. A comunidade do Planalto do Cajueiro em Maranguape-CE mantÃm caracterÃsticas ambientais semelhantes à de comunidades rurais (mesmo sendo peri-urbana) e a transmissÃo da esquistossomose sofre grande influencia dos fatores comportamentais. / Schistosomiasis mansoni is presented as a parasitic disease of public health importance, not only for its wide distribution in the world, but also the impacts caused by it in the activities of the infected population. Schistosomiasis should be analyzed as a process dependent on the interaction of various factors, such as environmental, social and economic importance to reduce transmission of the disease and to stop the cycle of the parasite. The aim of the study was to evaluate the influence of environmental and sociocultural factors in the transmission of schistosomiasis in low endemic area in the state of CearÃ, in the locality of the Planalto do Cajueiro- Maranguape-Ce, through the analysis of questionnaires applied in 2009 and 2012. The study was conducted in two stages. The first consists of a cross-sectional study, which analyzed 167 questionnaires from patients who provided material for the realization of the serological ELISA, which served as a screen. The second stage consists of a case-control study where questionnaires were applied and analyzed in 54 individuals ELISA reactive and nonreactive who delivered fecal sample for analysis. The analysis of the questionnaires of 167 people showed that most of them were young adults (19.76% in the age group of 15 to 25years and 29.94% between 26-46 years), female (67.66%) and 29% were not natives of Maranguape. Around 52.5% of patients reported using water from the river, had reactive ELISA result for schistosomiasis. In the second stage, it was observed that the difference between male and female sexes was negligible in cases positive for schistosomiasis. With regard to education, the majority (68.32%) had only elementary education. Associations between environmental variables and positive for the disease, it was observed that 34.2% of subjects reported not to have contact with water collections and 37.5% said they had contact. This point is still under further investigation. The community of Planalto do Cajueiro, Maranguape-Ce maintains environmental characteristics similar to rural communities (even as peri-urban) and schistosomiasis transmission is greatly influences behavioral factors.

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Como a maioria das pesquisas realizadas neste estado se concentra em áreas de alta endemicidade, o objetivo deste estudo foi investigar a epidemiologia da esquistossomose no município de São João Nepomuceno, que é considerada uma área de baixa endemicidade da doença e onde casos de neuroesquistossomose foram relatados. Um estudo transversal foi realizado de julho a dezembro de 2011, incluindo todos os indivíduos inscritos no Programa de Saúde da Família (PSF) do distrito de Carlos Alves, São João Nepomuceno, MG. O levantamento parasitológico da população foi realizado em ambas áreas urbanas e rurais, da seguinte forma: uma amostra de fezes foi coletada de cada indivíduo e, em seguida, processadas utilizando duas técnicas, o método Kato-Katz (KK), duas lâminas, e o método formol-éter (FE), três lâminas. 30% dos indivíduos com diagnóstico negativo KK foram aleatoriamente selecionados e convidados a fornecer uma segunda e uma terceira amostra de fezes, as quais foram processadas apenas pelo método KK (duas lâminas/amostra). Um questionário também foi aplicado à população do estudo. O levantamento malacológico foi realizado nas principais coleções hídricas e foi feita a identificação das espécies de Biomphalaria. Do total de 688 indivíduos inscritos no PSF, 503 participaram da pesquisa (73,11%). Apesar da detecção de outras infecções, S. mansoni foi o parasito mais frequente, com uma prevalência de 1,6%. Esta doença foi observada somente na primeira amostra de fezes e apenas pelo método de KK. A análise univariada mostrou que a prevalência da esquistossomose foi maior no sexo masculino, com 17,45 (1C95% = 1,09-304,21) vezes mais chances de adquirir a doença (p = 0,003), e também que o contato com a coleção hídrica aumentou 43,35 (1C95% = 2,48-756,81) vezes a chance de adquirir a doença. B. glabrata foi encontrada na região, mas nenhuma estava infectada pelo S. mansoni. Ensaios de suscetibilidade mostraram que B. glabrata do distrito foi altamente sensível á infecção com miracídios de S. mansoni. Através da técnica de Kernel foi verificado aglomerados de Biomphalaria próximos aos dos pacientes infectados. A ocorrência de B. glabrata, bem como de indivíduos com esquistossomose aumenta a necessidade de uma monitorização constante da doença na região. / In Brazil, schistosomiasis is a disease of major socio-economic impact in several states, including Minas Gerais. As most of the surveys carried out in this state have focused on areas of high endemicity, the objective of this study was to investigate the epidemiology of schistosomiasis in the municipality of Sao Joao Nepomuceno, which is considered a low-endemic area of the disease and where neuroschistosomiasis has been reported. A cross-sectional study was conducted from July to December 2011, including all individuals enrolled in the Family Health Program ("Programa de Sande da Familia" - PSF) of the District of Carlos Alves, Sao Joao Nepomuceno, MG. The parasitological survey of the sample population was performed in both urban and rural areas, as follows: one stool sample was collected from each individual and then processed using two techniques - the Kato-Katz (KK) method (two slides), and the formol-ether (FE) method (three slides). 30% of the individuals with negative KK diagnosis were randomly selected and invited to provide a second and a third stool sample. These samples were then examined using the KK method. A questionnaire was also applied to the study population. The malacological survey was carried out in the main hydric collections and the identification of the Biomphalaria species was done. Of the total 688 individuals registered in the PSF, 503 participated in the survey (73.11%). Despite the detection of some other infections, S. mansoni was the parasite most frequently found, with a prevalence of 1.6%. This disease was observed through the KK method only in the first sample of feces. The univariate analysis showed that the prevalence of schistosomiasis was higher in males, with a 17.45 (CI95% = 1.09-304.21) times greater chance of acquiring the disease (p=0.003), and also that the contact with the hydric collection increased by 43.35 (CI95%=2.48-756.81) times the chance of acquiring the disease. B. glabrata was found in the region, but none were infected with S. mansoni. Susceptibility tests have shown that B. glabrata district was highly sensitive to infection with miracidia of S. mansoni. With the techniques of kernel was observed near clusters of the Biomphalaria of infected patients. The occurrence of B. glabrata, as well as of individuals with schistosomiasis increases the need for constant monitoring of this disease in the region.