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Monitoramento da média e da variabilidade ponderadas exponencialmente por gráficos de controle univariados / Monitoring of media and variability exponentially weighted by univariate control chartsBarbosa, Rafael Botelho 15 December 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-12-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Gráficos de controle são métodos utilizados no controle estatístico de processos (CEP), implantados nas situações em que o processo já se encontra sob controle estatístico e há necessidade de fazer com que a situação de estabilidade seja mantida. O presente trabalho analisou o desempenho de cinco tipos de gráficos de controle da ponderação exponencial, através da imposição de situações de deslocamento da média e, ou, do aumento da variabilidade, que são: média móvel ponderada exponencialmente (EWMA), erro quadrático médio móvel ponderado exponencialmente (EWMASD), amplitude móvel média móvel ponderada exponencialmente (EWMAMR), quadrado médio ponderado exponencialmente (EWMS) e variância amostral móvel ponderada exponencialmente (EWMSV). Foram geradas 1000 simulações, com 50 subgrupos racionais de tamanho n =], para cada combinação de média e variabilidade adotadas neste estudo. Cada gráfico de controle estudado possuiu dois fatores {A (λ) e B [k (EWMA), c (EWMASD), α (EWMAMR e EWMS) ou h * (EWMSV)]}, e foram escolhidos dois diferentes níveis para cada um deles. Os resultados foram interpretados através da utilização de diagramas de dispersão, de gráficos de Pareto para analisar os efeitos de cada fator e de testes de Tukey para comparação dos gráficos de controle. Para as situações em que o processo estava sob controle estatístico, foi adotado que os gráficos com bons desempenhos foram aqueles que apresentaram as probabilidades dos alarmes falsos inferiores ao valor 0,05, ou seja, α ≤ 0,05. Já para as situações de descontrole, foi considerado que os gráficos que possuíram probabilidades dos alarmes verdadeiros superiores a 0,90, ou seja, Pd ≥ 0,90, obtiveram desempenho satisfatório. Para o alarme falso, os gráficos de controle que atenderam a exigência foram: EWMA, EWMASD, EWMAMR e EWMS. No caso em que somente a média encontrava-se fora de controle, os gráficos de controle que satisfizeram a condição imposta para o alarme verdadeiro foram: EWMA, EWMASD, EWMS e EWMSV. Quando a variabilidade estava fora de controle, os gráficos que atenderam a exigência foram: EWMASD, EWMAMR, EWMS e EWMSV. Quando média e variabilidade estavam fora de controle, os gráficos que satisfizeram a exigência foram: EWMA, EWMASD, EWMAMR, EWMS e EWMSV. Como o gráfico de controle EWMSV não atendeu a exigência para a probabilidade do alarme falso, não foi recomendada a sua utilização. No entanto, alguns desses gráficos possuíram desempenhos superiores aos outros, logo, a recomendação para utilização dos gráficos foi que: para o monitoramento somente da média, os gráficos adequados foram EWMA, EWMASD e EWMS; para o monitoramento somente da variabilidade, recomenda- se a utilização dos gráficos EWMASD, EWMAMR e EWMS; e para o monitoramento da média e variabilidade, os gráficos sugeridos são EWMA, EWMASD, EWMAMR e EWMS. Quanto a análise do efeito dos fatores pelo diagrama de Pareto, concluiu-se que, na grande maioria das situações analisadas, o fator B foi o único responsável por acarretar mudanças significativas na probabilidade do alarme falso ou verdadeiro, de acordo com as combinações dos termos que foram utilizadas. / Control charts are methods used in statistical process control (SPC), deployed in situations Where the process is already under statistical control and no need to make the situation of stability is maintained. This study examined the performance of five types of exponential smoothing control charts, by imposing the average displacement situations and, or, the increased variability, Which are weighted moving average exponentially (EWMA), exponentially weighted moving average squared deviation (EWMASD), exponentially weighted moving average moving range (EWMAMR), exponentially weighted mean squared (EWMS) and exponentially weighted moving sample variance (EWMSV). 1000 simulations were run With 50 rational subgroup of size n = 1, for each combination of mean and variability adopted in this study. Each control chart possessed studied two factors {A ( λ) and B [k (EWMA), c (EWMASD), α (EWMAMR and EWMS) or h* (EWMSV)]}, and we chose two different levels for each of them. The results were interpreted using the dispersion diagrams, Pareto charts to analyze the effects of each factor and Tukey test for comparison of control charts. For situations Where the process was in statistical control, was adopted the charts With good performances were those showing the probabilities of false alarms below the value 0,05, or α ≤ 0,05. As for the uncontrolled situations, it was considered that the graphs of true alarms probabilities possessed higher than 0,90, or Pd ≥ 0,90, achieved satisfactory performance. For the false alarm, control charts that met the requirement were: EWMA, EWMASD, EWMAMR and EWMS. In the event that only the average found himself out of control, control charts that satisfy the condition imposed for the true alarm were: EWMA, EWMASD, EWMS and EWMSV. When the variability was out of control, the graphics that met the requirement were EWMASD, EWMAMR, EWMS and EWMSV. When average and variability were out of control, the graphics that met the requirement were: EWMA, EWMASD, EWMAMR, EWMS and EWMSV. As the EWMSV control chart did not meet the requirement for the probability of false alarm, it was not recommended for use. However, some of these performance graphs possessed superior to others, so the recommendation is to use graphics that: for monitoring only the average, the recommended graphics are EWMA, EWMASD and EWMS; for monitoring only the variability, it is recommended to use EWMASD, EWMAMR and EWMS graphics; and to monitor the average and variability, the graphics are suggested EWMA, EWMASD, EWMAMR and EWMS. The analysis of the effect of the factors by Pareto diagram, it was concluded that, in most situations analyzed, the factor B was solely responsible for cause significant changes in the probability of true or false alarm, according to the combinations of terms were used.
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Métodos estatísticos e sistema neuro-fuzzy aplicados na avaliação de impactos ambientais / Statistical methods and neuro-fuzzy system applied in the environmental impact assessmentValdetaro, Erlon Barbosa 30 November 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-11-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O objetivo geral do trabalho foi avaliar a aplicabilidade do teste de qui-quadrado (χ2) e da lógica neuro-fuzzy na avaliação de impactos ambientais. Avaliou-se o uso dos métodos para reduzir a gama de dados de matrizes de interação e, assim, facilitar a exposição de seus resultados em audiências públicas e, também, calcular o grau de impacto a partir das características qualitativas do impacto ambiental. O estudo foi realizado com dados extraídos de matrizes de interação de avaliação quali-quantitativa de impactos ambientais de um programa de fomento florestal. O trabalho foi dividido em dois capítulos. No primeiro capítulo, por meio da estatística do qui-quadrado, foi investigado se a avaliação qualitativa das matrizes de interação exerce alguma influência nos resultados da avaliação quantitativa (grau de impacto) e também se os quadros de contingência, preparados para o teste, podem sintetizar as informações das matrizes de interação. Foi mostrado que existe uma associação entre as variáveis qualitativas e quantitativas e que os quadros de contingência são adequados para sintetizar os resultados das matrizes de interação de impactos ambientais, podendo ser utilizados em audiências públicas como forma de exposição dos resultados. No segundo capítulo foi avaliada a aplicabilidade de um sistema neuro-fuzzy para cálculo do grau de impacto ambiental a partir dos dados de avaliação qualitativa dos mesmos e, ainda, a capacidade dos gráficos de superfície, gerados pelo sistema, sintetizarem os resultados de matrizes de interação. Com os dados obtidos, foram criadas 87 regras e, após treinamento e teste, estimou-se 87 graus de impacto, um para cada regra, evidenciando que é possível a estimativa do grau de impacto por meio de sistema neuro-fuzzy. Os gráficos de superfície gerados pelo sistema se mostraram eficientes na síntese de resultados de matrizes de interação. Os dois métodos testados são capazes de reduzir a gama de dados de matrizes de interação e facilitam a exposição de resultados em audiências públicas. / The overall objective of this study was to evaluate the applicability of the chi- square test (χ2) and neuro-fuzzy logic in the evaluation of environmental impacts. Evaluated the use of methods to reduce the range of data interaction matrices and thus facilitate the display of results in public audiences and also calculate the degree impact from the qualitative characteristics of environmental impact. The study was conducted with data extracted from interaction matrices of qualitative and quantitative of the environmental impacts assessment of a forest development program. The work was divided into two chapters. In the first chapter, by statistical chi-square, was investigated whether the qualitative assessment of the interaction matrices have some effect on the results of quantitative assessment (degree impact) and also if tables of contingency, prepared for the test, can synthesize interaction matrices’ information. It was shown that there is an association between qualitative and quantitative variables and contingency tables are suitable to synthesize the interaction matrices’ results and can be used at public hearings as a way to exposure these results. The second chapter was evaluated the applicability of a neuro-fuzzy system to calculate the degree impact from the qualitative evaluation and also the ability of the surface charts, generated by the system, to synthesize the of interaction matrices’ results. With the data obtained, 87 rules have been created, and after training and testing, it was estimated 87degrees impact, one for each rule, showing that the estimate of degree impact by neuro-fuzzy system is possible. Surface charts generated by the system proved to be efficient in the synthesis of interaction matrices’ results. Both methods tested are able to reduce the range of interaction matrices’ data and facilitate exposure results in public hearings.
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Distribuição de probabilidades do valor extremo e tamanho amostral para o melhoramento genético do quantil máximo em plantas / Probability distributions of extreme value and sample size for the genetic improvement of maximum quantile in plantsEscobar, José Alfredo Diaz 29 February 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-04-27T16:55:17Z
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Previous issue date: 2016-02-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Dentre os objetivos dos programas de melhoramento genético de plantas de propagação assexuada (como a cana-de-açúcar e o eucalipto) e autógamas encontra-se o de selecionar indivíduos extremos ou segregantes transgressivos. Assim, é conveniente encontrar progênies com distribuições de caudas longas ou mesmo assimétricas, já que elas têm uma maior tendência de gerar indivíduos excepcionais. Os métodos de seleção comumente utilizados no melhoramento dessas espécies enquadram-se na classe BLUP sob os conceitos de média aritmética e média harmônica, os quais não levam em consideração a ocorrência de valores extremos dentro das famílias. Diante do exposto, este trabalho teve como objetivo propor e avaliar uma metodologia estatística para o melhoramento do máximo ou valor extremo das distribuições, e não necessariamente das médias das distribuições. Essa abordagem baseia-se nos quantis superiores da GEV (Distribuição de Valores Extremos Generalizada) dos BLUP ́s genotípicos individuais entre e dentro de famílias, como forma de prever o aumento da ocorrência de valores extremos em função do aumento do tamanho da família (seleção de indivíduos extremos dentro de família) e também do número de famílias utilizado para representar uma população (seleção de indivíduos extremos em toda a população). A metodologia consistiu em usar dados simulados e reais, típicos das variáveis consideradas no melhoramento genético (por exemplo, distribuição normal com ampla variabilidade e presença de valores extremos). A partir dessa base de dados, distribuições de valores extremos generalizadas são ajustadas aos máximos de cada família, visando verificar qual a distribuição mais adequada (Gumbel, Fréchet, ou Weibull). Os resultados revelaram que a distribuição Weibull se ajusta melhor à bases de dados com 100 ou mais famílias e mais de 20 indivíduos por família e a distribuição Gumbel se ajusta melhor à bases de dados menores. Uma base de dados experimentais referentes à avaliação de famílias, mediante o uso de uma distribuição de valor extremo para predição do máximo das distribuições dos indivíduos, permite a previsão do comportamento da eficiência seletiva para os máximos associados a vários tamanhos de famílias e de populações experimentais. Isso possibilita ao melhorista a otimização da experimentação no melhoramento visando a seleção de indivíduos extremos. Para essas previsões, emprega-se o período de retorno associado à ocorrência de um evento raro (nível de retorno) típico da distribuição ajustada. No caso, o período de retorno é interpretado como o tamanho amostral necessário para a ocorrência do nível de retorno do evento raro, interpretado como a magnitude do valor extremo. Simulações estocásticas e reamostragens de dados experimentais indicaram consistentemente que a avaliação de 200 famílias em cada ciclo seletivo maximiza a eficiência do melhoramento visando a seleção de indivíduos extremos. Uma boa opção prática seria a avaliação de 200 famílias com 100 indivíduos, perfazendo um total de 20000 indivíduos. Segundo a distribuição Weibull, o aumento da eficiência seletiva com o aumento do tamanho de família é em torno de 1,10 quando se passa de 20 para 100 indivíduos por família e de 1,12 quando se passa de 100 para 200 indivíduos e esses números são aproximadamente constantes independentemente do número de famílias avaliadas. Os modelos Gumbel e Weibull mostraram-se adequados para analisar as variáveis massa média de colmos (MMC em kg) e teor de Brix (B em %), sendo que a Gumbel mostrou-se adequada apenas nos casos de números de famílias muito pequenos. Assim, recomenda-se a Weibull para inferências práticas. A metodologia é adequada também para classificar as famílias ou progênies pela capacidade de geração de indivíduos superiores ou excepcionais e informar os tamanhos amostrais a serem praticados em cada família para capturar esses indivíduos. / Among the objectives of programs of genetic improvement of asexual propagation of plants (such as sugarcane and eucalyptus) and autogamous is to select extreme or segregating individuals transgressive. It is therefore appropriate to find progenies distributions of long or asymmetrical tails, as they are more likely to generate exceptional individuals. Selective methods commonly used in the improvement of these species fall under the BLUP (Best Linear Unbiased Predictor) class under the concepts of arithmetic mean and harmonic mean, which do not take into account the occurrence of extreme values within families. Given the above, this study aimed to propose and evaluate a statistical methodology to improve the maximum or extreme value distributions, and not necessarily the means of distribution. This approach is based on the upper quantiles of GEV a (Generalized Extremes Values Distribution) of BLUP's individual genotypic between and within families, as a way to predict the increased occurrence of extreme values due to the increase in family size (selection of extreme individuals within family), and also the number of families used to represent a population (selection of extreme individuals in the population). The methodology consisted of using simulated and real data, typical of the variables considered in genetic improvement (eg, normal distribution with wide variability and the presence of extreme values). From this database, generalized extreme value distributions are adjusted to the maximum of each family, in order to ascertain the most appropriate distribution (Gumbel, Fréchet, or Weibull). The results showed that the Weibull distribution best fits the data bases with 100 or more families and more than 20 individuals per family and the Gumbel distribution fits better at smaller databases. A basis of experimental data relating to the evaluation of families, through the use of an extreme value distribution for predicting the maximum of the distribution of individuals, allows a prediction of the selection efficiency behavior to the maximum associated with various families and sizes of experimental populations. This enables the breeder to optimize the experiment in breeding for the selection of extreme individuals. To these predictions, is employed the return period associated with the occurrence of a rare event (return level) typical of the fitted distribution. In this case, the return period is interpreted as the sample size required for the occurrence of the level of return the rare event, interpreted as the magnitude of the extreme value. Stochastic simulations and experimental data resampling consistently indicated that the evaluation of 200 families in each selection cycle to maximize efficiency improvement in order to select extreme individuals. A good practical option would be the evaluation of 200 families with 100 individuals, a total of 20,000 individuals. According to the Weibull distribution, the increase in selection efficiency with increasing family size is about 1.10 when going from 20 to 100 individuals per family and 1.12 when going from 100 to 200 individuals and these numbers they are approximately constant regardless of the number of families evaluated. The Gumbel and Weibull models have shown to be adequate to analyze the average mass variable stem (MMC kg) and Brix content (B %), and the Gumbel was adequate only in the case of very small families numbers. Thus, it is recommended to Weibull for practical inferences. The methodology is also suitable to classify the families or the progenies ability to generate superior or exceptional individuals and inform the sample sizes to be practiced in every family to capture these individuals.
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Adaptabilidade e estabilidade de híbridos comerciais de milho pelos métodos de Eberhart & Russell, centróide, AMMI e Modelos Mistos / Adaptability and stability of commercial hybrids of maize by Eberhart & Russell (1966), centroid, AMMI and Mixed Models REM/BLUP MethodsFaria, Sirlene Viana de 22 February 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-06-17T16:13:59Z
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Previous issue date: 2016-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O objetivo deste trabalho foi avaliar a adaptabilidade e estabilidade de híbridos comerciais de milho, pelos métodos Eberhart & Russell (1966), centróide, AMMI e modelos mistos-REM/BLUP; e comparar os resultados obtidos por meio das quatro metodologias. Para tal, vinte e nove híbridos comerciais de milho foram avaliados para produtividade de grãos em cinco ambientes de Minas Gerais. Utilizou-se o delineamento de blocos ao acaso com duas repetições. Cada parcela foi constituída de duas linhas de cinco metros de comprimento, espaçadas em 0,80 m. Houve diferença significativa (P<0,01) para os efeitos de híbridos, ambientes e interação híbridos x ambientes. A maioria dos híbridos avaliados apresentou ampla adaptabilidade e boa estabilidade. O híbrido 30A16PW comportou-se mais adequadamente em ambientes superiores e é indicado para agricultores que adotam elevados padrões tecnológicos de manejo. Entretanto, o híbrido CARGO é recomendado para regiões com o emprego de baixa tecnologia e insumos. As metodologias de Eberhart & Russell, centróide, AMMI e modelos mistos apresentaram resultados semelhantes na classificação e recomendação de híbridos com ampla adaptabilidade. Contudo, ocorreu divergência na indicação de híbridos com adaptabilidade específica a ambientes favoráveis e desfavoráveis, o que justifica a utilização de mais de um método de avaliação para uma maior confiabilidade na recomendação de híbridos comerciais de milho. / The objective of this study was to evaluate the adaptability and stability of commercial maize hybrids by Eberhart & Russell (1966), centroid, AMMI and mixed models REM/BLUP methods; and compare the results obtained by the four methodologies. For such, twelve-nine commercial maize hybrids were evaluated for grain yield in five environments of Minas Gerais. We used the randomized complete block design with two replicates. Each plot consisted of two 5 m long rows spaced 0.8 m. There was significant difference (P<0.01) for the hybrids, environments and genotype-by- environment interactions. Most of hybrids showed good adaptability and stability. The 30A16PW hybrid behaved better in the superior environments and it is indicated for farmers who adopt the highest technological standards for crop management. However, CARGO hybrid is recommended for regions with the use of low agriculture input. The Eberhart & Russell, centroid, AMMI and mixed models methods, presented similar results in the classification and recommendation hybrid with wide adaptability. However, there was divergence in the statement of hybrids with specific adaptability to favorable and unfavorable environments, which justifies the use of more than one assessment method for reliability on the recommendation of commercial maize hybrids.
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Inferência bayesiana na análise de resultados de pesquisa para determinação da proteína bruta em dietas de suínos da raça naturalizada brasileira Piau / Bayesian inference in analysis of results of crude protein determination study in pigs diets of brazilian naturalized breed PiauSilva, Hugo Teixeira 24 February 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-20T15:08:15Z
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Previous issue date: 2016-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Objetivou-se, com este estudo, contribuir para a implementação da metodologia bayesiana na avaliação nutricional animal e analisar resultados de pesquisas para determinação da proteína bruta em dietas de suínos da raça naturalizada brasileira Piau. Para tanto, foi utilizado um banco de dados originado de um experimento realizado no ano de 2012, em que foi avaliada a exigência de proteína bruta de suínos da raça naturalizada brasileira Piau. O experimento foi conduzido por meio de em um delineamento inteiramente casulizado, sendo considerado um esquema fatorial 4 x 2 (quatro níveis de proteína bruta e dois sexos) com 24 repetições. Os tratamentos consistiram em níveis de proteína, sendo considerados 10,2%, 12,6%, 15% e 17,4% na fase inicial; 9,6%, 12,0%, 14,4% e 16,8% na fase de crescimento; e 9,0%, 10,6%, 12,2% e 13,8% na fase de terminação. Durante estas três fases de desempenho foram avaliados o consumo total de ração, consumo diário de ração, ganho de peso total, ganho de peso diário, espessura de toucinho, ganho em espessura de toucinho e conversão alimentar. Após as avaliações na fase de terminação, os animais foram abatidos e avaliados os principais cortes e medidas das carcaças. As análises estatísticas foram realizadas seguindo três modelos bayesianos, caracterizados por: Modelo I) ausência do efeito aleatório de animal; Modelo II) inclusão do efeito aleatório de animal, mas desconsiderando o parentesco entre os animais; e o Modelo III) inclusão do efeito aleatório de animal, mas considerando a matriz de parentesco entre os animais. Considerando o valor do DIC (Critério de Informação da “Deviance”), o modelo III apresentou o melhor ajuste para todas características de desempenho e carcaça, sendo utilizado para a realização das inferências sobre todos efeitos do modelo. O efeito de sexo foi significativo apenas na fase de crescimento, evidenciando diferença de desempenho entre os animais machos castrados e fêmeas nesta fase. O efeito de interação entre os níveis de proteína bruta e o sexo não foi significativo nas características avaliadas, sendo este resultado encontrado em todas fases e nas avaliações das características de carcaças, demonstrando que o desempenho das duas classes de sexo foram semelhantes dentro de cada tratamento. Os níveis de proteína bruta não influenciaram significativamente as características de desempenho avaliadas durante as fases inicial, de crescimento e terminação. Para as avaliações das características de carcaça, foi encontrado efeito significativo dos níveis de proteína bruta apenas na medida do peso da paleta, que variou de forma quadrática reduzindo até o nível de 12,07%. A metodologia bayesiana mostrou-se eficiente e de fácil interpretação, sendo indicada para avaliações nutricionais animal. A inclusão da informação de parentesco nas análises, foi de grande importância na estimação e interpretação dos efeitos incluídos no modelo. A partir dos resultados obtidos, os níveis de 10,2%, 9,6% e 9,0% de proteína bruta foram os indicados para suínos da raça naturalizada brasileira Piau nas fases inicial, de crescimento e terminação, respectivamente. / For this, we used a database originated from an experiment conducted in 2012, in which was evaluated the requirement of crude protein in pig diets of local breed Piau. Animals were assigned to treatments in completely randomized design, in a factorial system 4x2 (four levels of crude protein and both sexes) with 24 replications. Treatments were crude protein levels considering 10.2%, 12.6%, 15% and 17.4% during the initial phase; 9.6%, 12.0%, 14.4% and 16.8% during the growing phase; and 9.0%, 10.6%, 12.2% and 13.8% during the finishing phase. Were evaluated the total feed intake, daily feed intake, total weight gain, average daily gain, backfat thickness, backfat thickness gain and feed conversion. After the finishing phase, animals were slaughtered to evaluate major cuts and carcasses measures. Statistical analyzes were performed following three bayesian models, in which they were characterized by: Model I) absence of random effect of animal; Model II) inclusion of random effect of animal but without using the relationship between the animals; and the Model III) including the random effect of animal, but considering the relationship matrix. Considering the DIC (Deviance Information Criterion), Model III presented the best data fit for all performance and carcass traits; therefore, it was used to make the inferences about all model effects. The sex effect was significant only in the growing phase, showing difference on performance of barrows and gilts. The interaction effect between crude protein levels and sex was not significant in the evaluated traits, and this result was observed in all phases and carcass traits, showing that barrows and gilts performance were similar in each treatment. There were no significant influences of crude protein levels on performance of evaluated traits during the initial, growing and finishing phases. Considering the carcass traits evaluation, significant effect of crude protein levels was detected only on shoulder weight, which exponentially changed up to the level of 12.07%. The Bayesian methodology was efficient and easy of interpretation, therefore being indicated for nutritional animal evaluation. Based on these results, the 10.2%, 9.6% and 9.0% of crude protein levels were indicated for local breed Piau pigs during the initial, growing and finishing phases, respectively.
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Estudo de medidas de conformação e suas relações com características produtivas e reprodutivas em vacas da raça Gir leiteiro / Study of conformation measures and its relations with productive and reproductive traits in lactating Gir cowsWenceslau, Amauri Arias 25 July 1997 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-06-23T09:16:08Z
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Previous issue date: 1997-07-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Foram utilizados 573 registros zootécnicos de vacas primíparas da raça Gir Leiteiro para estimar os componentes de covariância das características de conformação, produção de leite em até 305 dias de lactação (PLEI), duração da lactação (DURLAC) e idade ao primeiro parto (IPP) pelo Método da Máxima Verossimilhança Restrita (REML). Esses componentes foram utilizados no cálculo dos coeficientes de herdabilidade e nas correlações genéticas, fenotípicas e residuais. Para análise dos efeitos de meio sobre as características estudadas, foi empregado o Método Henderson III. As medidas de conformação, circunferência torácica (CTOR), altura na garupa (AG), comprimento corporal (CC), comprimento de garupa (CG), largura nos ísqueos (LIS) e nos íleos (LIL), comprimento de tetas (CT), diâmetro de tetas (DT) e altura de úbere (AU) foram realizadas em vacas à primeira lactação, com idade média de 4,05 anos. As médias de mínimos quadrados e as respectivas herdabilidades foram 2.865,43±62,49 kg e 0,28 para PLEI, 289,45±3,99 dias e 0,19 para DURLAC, 1.382,22±15,95 dias e 0,56 para IPP. Com relação às características de conformação as estimativas foram as seguintes: 171,04±0,44 cm e 0,23 para CTOR, 134,95±0,24 cm e 0,37 para AG, 97,20±0,33 cm e 0,11 para CC, 39,67±0,12 cm e 0,32 para CG, 17,00±0,12 cm e 0,48 para LIS, 45,46±0,17 cm e 0,24 para LIL, 6,90±0,09 cm e 0,46 para CT, 3,31±0,03 cm e 0,07 para DT e 63,07±0,23 cm e 0,35 para AU. As estimativas de herdabilidades, com exceção daquelas obtidas para CC e DT, indicam que é possível obter resposta à seleção $ $ para estas características. As correlações genéticas ( rg ) e fenotípicas ( r P ) entre $ $ $ PLEI e DURLAC foram ( rg = 0,84, r P = 0,68), entre PLEI e IPP ( rg = 0,49, $ $ $ $ $ r P = 0,18) e entre DURLAC e IPP ( rg = 0,66, r P = 0,31). As rg e r P entre as características de tamanho corporal foram: CTOR-AG (0,68; 0,43), CTOR-CC (0,49; 0,15), CTOR-CG (0,68; 0,43), CTOR-LIS (0,13; 0,17), CTOR-LIL (0,63; 0,51), AG-CC (0,60; 0,29), AG-CG (0,53; 0,46), AG-LIS (0,34; 0,22), AG-LIL (0,63; 0,33), CC-CG (0,09; 0,16), CC-LIS (0,27; 0,16), CC-LIL (0,42; 0,20), $ $ CG-LIS (-0,13; 0,11), CG-LIL (0,26; 0,31) e LIS-LIL (0,36; 0,14). As rg e r P entre as características de sistema mamário foram: CT-DT (0,66, 0,55), CT-AU $ $ (0,08; 0,06) e DT-AU (0,24; -0,05). As rg e r P entre PLEI e as características de conformação foram: PLEI-CTOR (-0,37; 0), PLEI-AG (-0,62; 0,02), PLEI- CC (-0,52; -0,02), PLEI-CG (-0,33; 0,07), PLEI-LIS (-0,26; -0,01), PLEI-LIL (- 0,15; 0,09), PLEI-CT (-0,08; 0,06), PLEI-DT(-0,12; 0,16) e PLEI-AU (-0,69; - $ $ 0,25). As rg e r P entre IPP e as características de tamanho corporal foram: IPP- CTOR (-0,05; 0,04), IPP-AG (-0,37; -0,07), IPP-CC (0,25; 0,10), IPP-CG (- 0,06; 0,09), IPP-LIS (-0,45; -0,10) e IPP-LIL (-0,06; -0,07). Os resultados do $ estudo mostraram que as rg entre produção de leite e características de $ conformação foram moderadas e negativas; enquanto que as rg entre idade ao primeiro parto e características de tamanho corporal variaram muito, limitando as conclusões a respeito. / Data from 573 primiparous lactating Gir cows were used to estimate the (co)variance components of conformation, milk production, milk production up to 305 days of lactation (PLEI), lactation length (DURLAC) and age at first calving (AFC) traits by REML method. These components were used to calculate heritability coefficients and genetic, phenotypic and residual correlations. For the analysis of environment effects on the studied traits, Henderson III method was used. The conformation, heart girth (HG), croup height (CH), body length (BL), croup length (CL), width in the isqueo (WIS) and ileum (WIL), teats length (TL), teats diameter (TD) and udder heigth (UH) measures were realized in the cows at first lactation, averaging 4.05 years. The least square means and respective heritabilities were the following: 2,865.43±62.49 kg and 0.28 for PLEI, 289.45±3.99 days and 0.19 for DURLAC, 1,382.22±15.95 days and 0.56 for AFC. For the conformation traits, the estimates were 171.04±0.44 cm and 0,23 for TORC, 134.95±0.24 cm and 0.37 for CH, 97.20±0.33 cm and 0.11 for BL, 39.67±0.12 cm and 0.32 for CL, 17.00±0.12 cm and 0.48 for WIS, 45.46±0.17 cm and 0.24 for LIL, 6.90±0.09 cm and 0.46 for TL, 3.31±0.03 cm and 0.07 for TD and 63.07±0.23cm and 0.35 for UH. The heritability estimates, except for those obtained for BL and TD, indicate that it is possible to obtain $ $ response to selection for these traits. The genetic ( rg ) and phenotypic ( r P ) $ $ correlations between PLEI and DURLAC were ( rg =0.84, r P =0.68) between $ $ $ PLEI and AFC ( rg =0.49, r P =0.18) and between DURLAC and SFC ( rg =0.66, $ $ $ r P =0.31). The rg and r P among body length traits were: HG-CH (0.68, 0.43), HG-BL (0.49, 0.15), HG-CL (0.68, 0.43), HG-WIS (0.13, 0.17), HG-WIL (0.63, 0.51), CH-BL (0.60, 0.29), CH-CL (0.53, 0.46), CH-WIS (0.34, 0.22), CH-WIL (0.63, 0.33), BL-CL (0.09, 0.16), BL-WIS (0.27, 0.16), BL-WIL (0.42, 0.20), $ CL-WIS (-0.13, 0.11), CL-WIL (0.26, 0.31) and WIS-WIL (0.36, 0.14). The rg $ and r P among mammary system traits were: TL-TD (0.66, 0.55), TL-UH (0.08, $ $ 0.06) and TD-UH (0.24, -0.05). The rg and r P between PLEI and conformation traits were: PLEI-HG (-0.37, 0), PLEI-CH (-0.62, 0.02), PLEI-BL (-0.52, -0.02), PLEI-CL (-0.33, 0.07), PLEI-WIS (-0.26, -0.01), PLEI-WIL (-0.15, 0.09), PLEI- $ TL (-0.08, 0.06), PLEI-TD (-0.12, 0.16) and PLEI-UH (-0.69, -0.25). The rg and $ r P between AFC and body length traits were: AFC-HG (-0.05, 0.04), AFC-CH (-0.37, -0.07), AFC-BL (0.25, 0.10), AFC -CL (-0.06, 0.09), AFC -WIS (-0.45, $ -0.10) and AFC-WIL (-0.06, -0.07). Results of this study showed that the rg between milk production and conformation traits were moderate and negative, $ whereas the rg between age at first calving and body length varied, showing restrict conclusions for these one.
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Predição fenotípica em cana-de-açúcar via modelos multivariados com dados de espectroscopia no infravermelho próximo / Phenotypic prediction in sugarcane using multivariate models with data from near infrared spectroscopyFernandes, Jaqueline Gonçalves 24 February 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-07-27T15:17:42Z
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Previous issue date: 2016-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A produção da cana-de-açúcar desempenha papel fundamental na economia do país. Para o desenvolvimento de variedades que atendam as necessidades atuais e também as necessidades futuras é essencial buscar métodos de fenotipagem que proporcionem maior facilidade de utilização, além de rapidez, exatidão e consistência. Visando contribuir para o desenvolvimento de novas estratégias de fenotipagem, esse trabalho teve como objetivo principal construir modelos de predição fenotípica utilizando calibração multivariada. Foram construídos modelos empregando regressão por quadrados mínimos parciais (PLS), regressão por componentes principais (PCR), Ridge Regression (RR- BLUP) e Lasso bayesiano (BLASSO) a partir de dados obtidos com espectroscopia na região infravermelho próximo (NIR) em diferentes tipos de amostras de cana-de-açúcar. Esses modelos foram construídos com o objetivo de predizer o teor de fibra (FIB), o teor de sacarose aparente (PC) e o teor de lignina (LIG). O conjunto de calibração foi composto por 166 clones e o de previsão por 20 clones. Os valores de FIB, PC e LIG variaram respectivamente de 8,36% a 22,53%, 1,78% a 16,89% e 13,79% a 21,08%. Os modelos RR- BLUP e BLASSO apresentaram coeficientes de correlação entre 0,70 e 0,91, valores superiores ou iguais aos dos modelos PLS, que por sua vez foram superiores aos dos modelos obtidos por PCR. Para predição de PC e FIB é aconselhável utilizar amostras de colmo devido ao maior poder preditivo além de ser mais viável devido à maior praticidade quando comparado com as amostras de bagaço. Foi possível construir um modelo eficiente para predizer LIG utilizando amostras de bagaço seco. Todos os modelos escolhidos apresentaram bom desempenho para ranquear os melhores clones de acordo com os caracteres em estudo, apresentando medidas elevadas de acurácia, medidas pequenas da taxa de falso positivo e boa precisão. / Sugar cane production plays an important role in the economy of a country. In order to develop varieties that meet the current and the future needs, it is essential to find phenotyping methods that are fast, exact, consistent and easy to be used. Aiming at contributing to the development of new phenotyping strategies, the objective of this study was to build models for phenotypic predictions using multivariate calibration. Models using regression by partial least squares (PLS), principal component regression (PCR), Ridge Regression (RR-BLUP) and Bayesian Lasso (BLASSO) were built, using data obtained with Near-Infrared Spectroscopy (NIRS) from different types of sugarcane samples. These models were constructed in order to predict the fiber (FIB), the apparent sucrose (PC) and lignin (LIG) contents. The calibration group was composed of 166 clones, and the prediction group was composed of 20 clones. The amounts of FIB ranged from 8.36% to 22.53%, from 1.78% to 16.89% for PC and from 13.79% to 21.08% for LIG. The RR-BLUP and BLASSO models showed correlation coefficients between 0.70 and 0.91. Those values are higher than or equal to the PLS models, which in turn were higher than those of the models obtained by PCR. For PC and FIB predictions, it is recommended to use cane stalk samples due to its greater predictive power and feasibility when compared to the bagasse samples. It was possible to build an efficient model to predict LIG using dry sugar cane bagasse samples. All selected models showed good performance when ranking the best clones according to the characters studied. Furthermore, the models presented high accuracy measurements, small false positive rate measurements and good accuracy.
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Análise biométrica de acessos de Capsicum chinense Jacq. com ênfase na diversidade genética / Biometric analysis of Capsicum chinense Jacq access with emphasis on genetic diversityOliveira, Ana Carolina Ribeiro de 23 February 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os estudos de divergência genética são fundamentais para subsidiar ações de conservação, de utilização dos recursos genéticos e posterior aplicação em programas de melhoramento, visando à obtenção de genótipos superiores. Sendo assim, este trabalho teve por objetivo avaliar a diversidade genética de acessos de pimenta, Capsicum chinense Jacq., por meio de técnicas multivariadas de agrupamentos utilizando os métodos hierárquicos (UPGMA e Ward) e de otimização (Tocher e Tocher modificado). O experimento foi conduzido na área experimental do setor de olericultura do Departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa (UFV), sob delineamento inteiramente casualizado, com quatro repetições e uma planta por parcela. Foram avaliados 11 acessos de C. chinense registrados no Banco de Germoplasma de Hortaliças (BGH/UFV), com base em 11 caracteres. Os resultados indicaram pelos métodos hierárquicos a formação de dois grupos, sendo que 72,73% dos acessos pertenciam ao grupo I e 27,27% ao grupo II; e ambas as estruturas de agrupamento foram validadas pelo coeficiente de correlação cofenética (r). Os métodos de otimização, Tocher e Tocher modificado, reuniram os acessos em seis e quatro grupos, respectivamente, revelando maior diversidade dos acessos em relação aos métodos anteriores. Assim, independente do método utilizado foi possível identificar os acessos mais divergentes e, consequentemente, contribuir para futuras pesquisas de cruzamento buscando híbridos com maior efeito heterótico. / Studies of genetic diversity are essential to subsidize conservation actions, utilization of genetic resources and subsequent application in breeding programs aimed at obtaining superior genotypes. Thus, this study aimed to evaluate the genetic diversity of pepper accessions, Capsicum chinense Jacq., through multivariate clustering techniques using hierarchical methods (UPGMA and Ward) and optimization (Tocher and modified Tocher). The experiment was conducted in the experimental area of the horticulture sector of the Department of Plant Science at the Universidade Federal de Viçosa (UFV), under completely randomized design with four replications and one plant per plot. They evaluated 11 accessions of C. chinense recorded at the Germplasm Bank (BGH/UFV), based on 11 characters. The results indicated by hierarchical methods the formation of two groups, with 72.73% of the accessions belonging to the group I and 27.27% in group II; both grouping structures were validated by cophenetic correlation coefficient (r). The optimization methods, Tocher and modified Tocher, gathered the accessions in six and four groups, respectively, revealing greater diversity of accessions compared to the previous methods. Thus, regardless of the method used it was possible to identify the most divergent access and, consequently, contribute to future researches seeking cross hybrids with greater heterotic effect.
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Avaliação da concordância dos principais testes utilizados para comparação de curvas de sobrevivência por meio de simulações / Evaluation of main tests concordance used for comparison of survival curves through simulationsPereira, Geraldo Magela da Cruz 24 February 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-02-24 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / O objetivo inicial deste estudo, foi aplicar métodos tradicionais em análise de sobrevivência para analisar a mortalidade de peixes (alevinos), quando submetidos a 5 dietas com diferentes fontes de lipídios. O estudo incluiu o uso de métodos paramétricos e não paramétricos. Pelo método Kaplan-Meier, foram obtidas estimativas de sobrevivência, e em seguida foram traçadas as curvas de sobrevivência para cada um dos tratamentos. O teste Logrank foi utilizado para comparar as curvas, com intuito de verificar a existência de diferenças significativas entre elas. Paralelamente, foi realizado estudo de simulação para avaliar a concordância dos principais testes utilizados para comparação de curvas de sobrevivência, além disso, avaliou-se também a concordância destes testes com o teste Tukey. Os dados foram simulados com base nos modelos paramétricos ajustados aos dados reais. Os resultados mostraram que a porcentagem de concordância entre os testes logrank, Wilcoxon (Gehan) e Tarone-Ware, foi próxima de 97% para diferentes cenários avaliados. A avaliação do teste Tukey resultou em uma baixa concordância, assim, o mesmo não deve ser utilizado para comparação dos efeitos de tratamentos, pois ele não leva em conta a presença de dados censurados. / Initially, the aim of this study was to apply traditional methods of survival analysis to analyze fry mortality when exposed to 5 diets from different sources of lipids. The study included the use of parametric and non-parametric methods. Survival estimation was obtained through Kaplan-Meier method, thereafter, the survival curves were drawn to each treatment. Logrank test was used to compare the curves in order to verify the existence of significant differences between the curves. In parallel, a simulation study was conducted to evaluate the concordance of the main tests used to compare survival curves. Moreover, the concordance of these tests with Tukey test was also evaluated. The data was simulated on the basis of parametric models adjusted to real data. The results have shown that the percentage of concordance between logrank tests, Wilcoxon (Gehan) and Tarone-Ware was close to 97% to different evaluated groups. Tukey test evaluation resulted in low concordance, therefore, this test should not be used to compare the treatment effects as it does not take into account the presence of censored data.
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Seleção de variáveis no estudo da diversidade genética via análise de procrustes / Variables selection in the study of genetic diversity by procrustes analysisPontes, Daiana Salles 24 February 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-08-04T16:12:51Z
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Previous issue date: 2016-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Para o sucesso de um programa de melhoramento é indispensável que população de trabalho disponha de variabilidade genética de forma que a prática de seleção seja viável. Nesse sentido, a avaliação da divergência genética têm sido de grande importância por fornecerem parâmetros para a identificação de combinações híbridas cujo cruzamento proporcione maior efeito heterótico e maior probabilidade de recuperar genótipos superiores nas gerações segregantes. O estudo sobre diversidade genética elucida relações genéticas, quantifica ou prediz o nível de variabilidade total existente e sua distribuição entre indivíduos, acessos de bancos de germoplasma, linhagens e cultivares ou dentro de populações e espécies. Conhecimento que tem proporcionado, dentre outras coisas, importantes contribuições ao melhoramento genético, ao gerenciamento de bancos de germoplasma e à conservação de recursos genéticos. Assim, o interesse maior, em estudos de caracterização da diversidade genética das espécies vegetais, animais e de microrganismos consiste na identificação de grupos de genótipos similares de forma que a maior diferença entre os grupos formados seja realçada. Para isso, algumas técnicas multivariadas, como análise discriminante, componentes principais, análise de coordenadas e de agrupamento podem ser utilizadas nesse tipo de estudo. Contudo, de modo geral, tais técnicas ainda exigem a utilização de todas as variáveis para a avaliação dos indivíduos/acessos, o que nem sempre é possível devido ao alto custo ou mesmo o grau de dificuldade envolvido na obtenção de determinadas variáveis. É necessária, portanto, a aplicação de algum método de seleção de variáveis ou de um critério de seleção baseado em alguma técnica analítica, como é o caso do critério apresentado por Jolliffe (1972). Baseado na técnica de componentes principais, esse critério é usualmente utilizado na determinação da importância relativa de caracteres no estudo da diversidade de modo que caracteres de menor importância serão desconsiderados do estudo. Há também outra metodologia baseada em Análise de Procrustes ainda pouco utilizada em estudos de diversidade genética, sobretudo para este fim, por meio da qual é possível selecionar variáveis com base no padrão de dissimilaridade ou similaridade entre acessos. Desta forma, este trabalho tem por objetivo propor um critério baseado em Análise de Procrustes como nova possibilidade para a seleção de variáveis no estudo da diversidade genética. Em seguida, comparar o critério apresentado com o critério proposto por Jolliffe (1972) - ambos os critérios estabelecidos por meio do uso de componentes principais. Para elucidar a teoria apresentada, foram consideradas informações de 40 acessos de café Conilon avaliados em Sooretama/ES no ano 2000 segundo 16 caracteres agronômicos. As técnicas apresentadas neste trabalho demonstram ser vantajosas na seleção (ou descarte) de variáveis proporcionando relevante contribuição para os estudos sobre diversidade genética. A técnica apresentada, baseada em análise de Procrustes, torna-se uma alternativa mais eficaz do que o uso do critério de Jolliffe (1972) para fins de estudo da diversidade genética. / For the success of a breeding program, it is essential the existence of genetic variability in the base population so that selection practice can be feasible. In this context, the evaluation of genetic diversity have been very important because gives parameters to identify hybrid combinations whose cross provides the greatest heterotic effect and the highest probability of recovering superior genotypes in segregating generations. The study about genetic diversity aims to elucidate genetic relationships, quantify or predict the level of total variability existing and its distribution among genotypes, accessions of germplasm banks, landraces and cultivars or within populations and species. This knowledge have provided, among other things, important contributions to genetic breeding, the management of germplasm banks and the conservation of genetic resources. So, the main interest in characterization studies of genetic diversity of vegetable, animals and microorganisms species consists of identifying groups of similar genotypes, so that the largest difference between groups formed is highlighted. Some multivariate techniques such as discriminant analysis, principal component analysis, coordinate analysis and cluster analysis can be used in these studies. However, in general, these techniques still require the use of all variables for evaluation of genotypes - accessions, which is not always possible due to high cost or even the degree of difficulty involved in obtaining some variables. Thus, it is required the application of a variables selection method or a selection criterion based in an analytical technique, such as the criterion presented by Jolliffe (1972). Based on principal component technique, this criterion is commonly used to determine the relative importance of traits in diversity study, so that less important traits will be eliminated of the study. There is also another methodology based on Procrustes analysis still little used in genetic diversity studies, particularly for this purpose. By this methodology is possible to select variables based on the pattern of dissimilarity or similarity among accessions. Thus, this work aims to propose a criterion based on Procrustes analysis as a new possibility to select variables in genetic diversity study. Then, compare the criterion proposed with the criterion presented by Jolliffe (1972) - both criteria established through the use of principal components. To elucidate the theory presented, it was used the information from 40 accessions of Conilon coffee evaluated in Sooretama/ ES in the year 2000 regarding to 16 agronomic traits. The techniques presented in this work demonstrated to be advantageous in the selection (or discarding) of variables and consequently providing relevant contributions for genetic diversity study. The technique presented, based on Procrustes analysis, it becomes an alternative more effective than the criterion of Jolliffe (1972) for genetic diversity study.
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