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v, 137 leaves : ill., (part col.) ; 26 cm. / Title page, contents and abstract only. The complete thesis in print form is available from the University Library. / Thesis (Ph.D.1974) from the Dept. of Zoology, University of Adelaide

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Thesis (doctoral)--Universität Bremen, 2006. / Includes bibliographical references.

Memoria para optar al título de Periodista / Reportaje de investigación sobre la situación actual y el rol de Estado en la conservación de una especie animal simbólica a nivel nacional, el huemul (Hippocamelus Bisulcus), centrada particularmente en la última población de huemules de Chile central, ubicada en los faldeos cordilleranos de la Provincia de Ñuble. La especie está en peligro de extinción según la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN), fue calificada en riesgo de desaparición por Chile el año 1976, y en 2006 fue catalogada como Monumento Natural de Chile. Pese a ello, una actual legislación ambiental débil, la presión por usar su hábitat para proyectos energéticos, turísticos y de riego, unido al progresivo poblamiento del territorio, tiene a la especie, y su hábitat, en estado crítico. La investigación también aborda un análisis de la actual legislación ambiental, en su relación con los proyectos económicos que debe evaluar para preservar los territorios de impactos ambientales negativos. El ejemplo de la situación que vive el huemul en particular en la Provincia de Ñuble permite dimensionar las falencias de la normativa a nivel global, y de cómo los proyectos, dentro de la institucionalidad existente, ocultan o minimizan impactos que en la mayoría de los casos son mayores a los que declaran. Además, reflexiona sobre la escasa importancia que hasta la fecha se le da a la protección de la biodiversidad en Chile, tarea que ha estado en manos de muy pocas personas e instituciones. Una deuda pendiente del Estado con su territorio natural, con escasa prioridad y sentido de urgencia.

Made available in DSpace on 2015-10-21T12:19:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 maria_azevedo_ioc_mest_2012.pdf: 3920589 bytes, checksum: 4c33d4d2ace8f5e6b7d0c7c657da00d3 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-05-21 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Nematóides da família Anisakidae tem como principais representantes espécies dos gêneros AnisakisDujardin, 1845, PseudoterranovaKrabbe, 1878 e Contracaecum Railliet e Henry, 1913. Apresentam um ciclo de vida indireto em ecossistemas aquáticos, tendo mamíferos marinhos como hospedeiros definitivos e peixes e crustáceos como hospedeiros intermediários, estando relacionado a quadros patológicos em ambos. O homem pode infectar-se ao ingerir o pescado de forma crua ou mal-cozida, e desenvolver uma patologia gastrointestinal denominada anisaquidose. A identificação acurada de anisaquídeos em qualquer estágio do ciclo de vida é crucial para o melhor entendimento da ecologia e epidemiologia destes nematódeos, assim como para o diagnóstico e controle da anisaquíase humana e monitoramento da qualidade do pescado. A identificação em nível de espécie baseado na morfologia é difícil, devido aos limitados caracteres de importância taxonômica. Abordagens moleculares e genéticas são capazes de fornecer uma identificação precisa dos anisaquídeos, possibilitando um melhor entendimento de sua sistemática. O objetivo deste trabalho é identificar, através da taxonomia integrada com base em análises morfológica e genética, as espécies de nematódeos da família Anisakidae parasitos de mamíferos marinhos provenientes do litoral do nordeste brasileiro. Os parasitos (n=195) foram coletados de 54 cetáceos encalhados ao longo do litoral de seis estados do nordeste do Brasil A análise morfológica revelou 60 espécimes como sendo Anisakis sp. clado I, 24 Anisakissp. clado II e 4 como Pseudoterranovasp. A espécie A. paggiaefoi identificada em Kogiabreviceps, constituindo a pimeira descrição austral da espécie. O gênero Pseudoterranova é identificado pela primeira vez infectando o golfinho-rotator, Stenella longirostris.Devido à natureza do material, fixado em formalina, etanol, ou AFA, diferentes métodos e kits de extração de DNA foram empregados, e a metodologia de pré-tratamento com CTAB e extração com o kit comercial QIAamp® DNA Investigator(Qiagen) apresentou o melhor desempenho. Para amplificação do DNA, a técnica de Polimerização Reconstrutora se mostrou eficaz na optimização da PCR. O gene mtDNA cox2 foi avaliado comobarcodeda família Anisakidae e se mostrou eficiente. Dezesseis espécimes, de hospedeiros distintos, foram geneticamente identificados como A. typica, confirmando esta espécie como a mais circulante no Brasil. Em Stenella frontalis, Lagenodelphis hosei e Globicephala macrorhyncus, a espécie é relatada pela primeira vez em águas do litoral brasileiro. A espécie A. nascettiifoi identificada em um hospedeiro ainda não relatado, Mesoplodon europaus, a baleia bicuda de Gervais, e sua distribuição também expandida para águas do Atlântico sudoeste / Anisakids are mainly represented by species of the genus Anisakis Dujardin, 1845, Pseudoterranova Krabbe, 1878 e Contracaecum Railliet and Henry, 1913. They display indirect life cycles in aquatic ecosystems. Marine mammals act as definitive hosts and fishes as intermediate hosts, being anisakids associated to pathological conditions on both. Human can become infected when ingesting raw or undercooked seafood, acquiring anisakidosis. The accurate identification of anisakids at any life cycle stage is crucial for better understanding the ecology and epidemiology of these nematodes, as well for diagnosis and control of human anisakidosis and monitoring the seafood quality. Identification at species level based on morphology is difficulty, due to limited characters of taxonomic importance. Molecular and genetic approaches are able to provide a precise identification of anisakids, enabling a better knowledge about their systematics. The objective of the present study was to identify, through the integrated taxonomy based on morphological and genetic data, the nematodes species of the Anisakidae family, parasites of marine mammals caught on the northeastern coast off Brazil. Parasites (n=195) were collected from 57 cetaceans stranded along the coast of six states of the Northeastern of Brazil. Morphological analysis revealed 60 specimens as Anisakis sp. clade I , 24 as Anisakis sp. clade II e 4 as Pseudoterranova sp. The species A. paggiae was identified in K. breviceps , constituting the first austral description of the species. The genera Pseudoterranova was identified for the first time infecting the spinner-dolphin, Stenella longirostris. Due to material conditions, fixed in formalin, ethanol or AFA, different methods and extractions kits were applied, and the pre-treatment with CTAB solution and posterior extraction with the commercial kit comercial QIAamp® DNA Investigator (Qiagen) , showed the best performance. For DNA amplification, the Reconstructive Polymerization method was efficient in PCR optimization. The gene mtDNA cox 2 was evaluated as barcode to Anisakidae and it was effective. Sixteen specimens, from different hosts, were genetically identified as A. typica , confirming this species as the most circulating in Brazil. In Stenella frontalis , Lagenodelphis hosei and Globicephala macrorhyncus, the species was reported for the first time in Brazilian waters. The species A. nascettii was identified in an unreported host, Mesoplodon europaus, the Gervais beaked whale, expanding its distribution to Southwest Atlantic waters

O conhecimento sobre a microbiota de animais marinhos fornece uma base que pode ser usada para comparação em virtude de mudanças futuras, apesar disso pouco se sabe sobre a natureza das bactérias associadas com o intestino desses animais. Esse estudo visou a obtenção de um panorama sobre a microbiota de animais marinhos selvagens recolhidos no litoral do Rio Grande do Sul através de ferramentas independentes de cultivo, como o sequenciamento de última geração e PCR quantitativa em tempo real (qPCR), que permitem a inferência sobre as bactérias pertencentes a microbiota intestinal a partir do DNA genômico total obtido diretamente da amostra. A partir do sequenciamento parcial do gene de 16S rRNA utilizando a plataforma de alta desempenho Ion Torrent PGM, seis amostras fecais de lobo-marinho-sul-americano (Arctocephalus australis) e quatro lobo-marinho- subantártico (Arctocephalus tropicalis) foram avaliadas. Verificou-se que o filo Firmicutes (86,28%) foi mais frequente nas fezes de ambas as espécies, seguido por Actinobacteria(6,74%) e Proteobacteria (3,34%), sendo Bacteroidetes e Fusobacteria os filos menos frequente. A qPCR foi empregada para quantificar as espécies de enterococos, mais frequentemente isoladas de fezes de animais (Enterocococcus faecalis, E. hirae, E. mundtti, E. faecium, E. gallinarum e E. casseliflavus), em amostras fecais de animais marinhos selvagens. A partir de DNAs totais isolados de 24 amostras fecais de lobos marinhos, tartarugas-verdes e aves marinhas, verificou-se que E. faecalis (1,82x1012 cópias/ng) foi a espécie mais frequente em todas as amostras analisadas e E. hirae (5,89x1010), E. mundtti (7,57x1010 cópias/ng), E. faecium (4,94x1009 cópias/ng), E. casseliflavus (1,22x1009 cópias/ng) e E. gallinarum (3,84x1010 cópias/ng) também demonstraram estar presentes na microbiota desses animais. / Knowledge about the marine animals microbiota provides a base that can be used for comparison due to future changes, nevertheless little is known about the nature of the bacteria associated with the animal gut. This study aimed to obtain an overview of the microbiota of wild marine animals collected in the Rio Grande do Sul coast using cultive independent methods, as the next-generation sequencing and quantitative real-time PCR ( qPCR ), which allow the inference about the bacteria belonging to the intestinal microbiota from total genomic DNA obtained directly from the sample. Using the high performance Ion Torrent PGM platform six fecal samples of South American fur seal (Arctocephalus australis) and four Subantartic fur seals (Arctocephalus tropicalis) were evaluated. It was found that the phylum Firmicutes (86.28%) was more common in faeces of both species, followed by Actinobacteria (6.74%) and Proteobacteria (3.34%), Fusobacteria and Bacteroidetes were the least frequent. The qPCR was used to quantify the Enterococci species commonly isolated from faecal samples of animal (Enterocococcus faecalis, E. hirae, E. mundtti, E. faecium, E. gallinarum e E. casseliflavus) in faecal samples or cloacal swabs / rectal wild marine animals. From total DNA isolated of 24 fecal samples from sea lions, green turtles , sea birds, it was observed that E. faecalis (1.82x1012 copy/ng) was the most common species in all samples analyzed and E. hirae (5.89x1010), E. mundtti (7.57x1010), E. faecium (4.94x1009), E. casseliflavus (1.22x1009) and E. gallinarum (3.84x1010) also shown to be present in the microflora of these animals.

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